BIOKIMIA
4 Karbohidrat ika
Amphipatik adalah suatu senyawa yang mengandung gugus hidrofil dan hidrofob
Interaksi molekul air dengan molekul amphipatik
Molekul-molekul
air memaksa lipida
untuk berasosiasi
dan meletakan
ujung polar ke
bagian luar
Pembentukan misel
Motivasi pembentukan misel adalah
untuk menaikan kembali entropi air
yang terkekang disekitar bagian lipid
yang nonpolar.
Alasan ini pula yang mendasari
terbentuknya interaksi hidrofobik.
Disosiasi air
pH
Menentukan konsentrasi H+ dan OH-
dr. Sudarno, M.Kes.
BIOENERGETIKA
39
PADA ILMU KIMIA TELAH DIKENAL ADANYA:
REAKSI ENDOTERMIS: REAKSI YG MEMERLUKAN
PANAS
REAKSI EKSOTERMIS: REAKSI YG MENGHASILKAN
PANAS
40
PADA SISTEM BIOLOGIS:
MANUSIA BERSIFAT ISOTERMIS (SUHU TUBUH
KONSTAN).
MANUSIA MENGGUNAKAN PANAS YANG
TERBENTUK PADA SUATU REAKSI ANTARA LAIN
UNTUK MEMPERTAHANKAN SUHU TUBUH TETAPI
TIDAK DAPAT MENGUBAHNYA MENJADI ENERGI
MEKANIK ATAU ENERGI LISTRIK, SISA PANAS AKAN
DIBUANG KE LUAR. OLEH KARENA ITU YANG LEBIH
PENTING DIPERHITUNGKAN ADALAH BENTUK
ENERGI KIMIA (ATP DLL)
41
PADA SISTEM BIOLOGIS PROSES YG MEMERLUKAN
ENERGI MENDAPATKANNYA DENGAN CARA MENGAITKAN
REAKSI YG PERLU ENERGI (REAKSI ENDERGONIK)
DENGAN DENGAN REAKSI YANG MENGHASILKAN ENERGI
(REAKSI EKSERGONIK)
42
Panas
Eksergonik
G Energi E
kimia
Eks End
~E
Endergonik
43
MEKANISME PENGAITAN:
1. MELALUI PEMBENTUKAN SENYAWA ANTARA:
A + C | SA | B + D
2. MELALUI PEMBENTUKAN SENYAWA KAYA ENERGI (~ E )
AD2:
CARA: SUATU SENYAWA (E) AKAN MENANGKAP ENERGI YG
DIHASILKAN OLEH REAKSI EKSERGONIK ~E, DAN KEMUDIAN ~E
AKAN MEMBERIKAN ENERGINYA UNTUK REAKSI ENDERGONIK
~ ADALAH SIMBOL UNTUK MENUNJUKKAN IKATAN BERENERGI
TINGGI
45
SENYAWA KAYA ENERGI (~ E ) LAINNYA
MISALNYA FOSFOENOLPIRUVAT,
KREATINFOSFAT ( ADA SIMBOL IKATAN
BERTENAGA TINGGI (~)
46
47
PERUBAHAN ENERGI BEBAS
48
REAKSI BIOKIMIA DI DALAM SEL UMUMNYA TAK
DAPAT BERLANGSUNG DGN SENDIRINYA OLEH
KARENA ADANYA HAMBATAN ENERGI (ENERGY
BARRIER) JADI PERLU ENZIM UNTUK MENGATASI
HAMBATAN ENERGI INI ( ENZIM MENURUNKAN
ENERGI AKTIVASI , TETAPI TIDAK MENGUBAH HARGA Δ
G)
49
SKEMA
kead. transisi
G tanpa katalisator
E. level
Ea
=
Ea''
kead. awal G = Perubahan
E. bebas
kead. akhir
Perjalanan
reaksi
50
OKSIDASI BIOLOGIS
ENZIM DAN KOENZIM REAKSI REDOKS
1. OKSIDASE
MENGKATALISIS PEMBEBASAN HIDROGEN DARI SUBSTRAT DAN
SECARA ALAMI MENGGUNAKAN O2 SEBAGAI AKSEPTORNYA.
MENGHASILKAN H2O ATAU H2O2
AH2 + ½ O2 === A + H2O AH2 + O2 === A + H2O2
OKSIDASE OKSIDASE
SEBAGIAN MENGANDUNG FAD/FMN SEBAGAI GUGUS PROSTETIK
JADI MERUPAKAN FLAVOPROTEIN
CONTOH: L-ASAM AMINO OKSIDASE, GLUKOSA OKSIDASE,
ALDEHID DEHIDROGENASE
REAKSI : FP + AH2 === FPH2 + A LALU FPH2 +O2 === FP + H 2O2
BILA JUGA MENGANDUNG LOGAM DISEBUT METALLOFLAVOPROTEIN
SEBAGIAN TIDAK MENGANDUNG FLAVIN
CONTOH: SITOKROM OKSIDASE (MENGANDUNG Cu)
51
2. DEHIDROGENASE
TIDAK DAPAT MENGGUNAKAN O2 SEBAGAI AKSEPTOR
HIDROGEN YANG DIBEBASKAN DARI SUBSTRAT.
MACAM :
1. YANG TERKAIT RANTAI RESPIRASI
A. DEHIDROGENASE NAD PADA RANTAI RESPIRASI
B. DEHIDROGENASE YG PERLU RIBOFLAVIN (FMN / FAD)
YG TERKAIT RANTAI RESPIRASI
C. SITOKROM2 KECUALI SITOKROM OKSIDASE
R.R. : S NAD+ Fp Q SISTEM SITOKROM O2
53
3. HIDROPEROKSIDASE: SUBSTRATNYA H2O2
1. PEROKSIDASE :
H2O2 + AH2 2 H2O + A
2. KATALASE
H2O2 + H2O2 2 H2O + O2
4. OKSIGENASE :
1. MONOOKSIGENASE (HIDROKSILASE)
AH2 + O2 + ZH2 AOH + H2O + Z
CONTOH: ENZIM2 PADA SINTESIS STEROID
ENZIM2 HIDROKSILASI OBAT2-AN
2. DIOKSIGENASE (OKSIGEN TRANSFERASE) : A + O2 AO2
54
PEMBENTUKAN ATP
3 FOSFOGLISERAT + ATP
55
RANTAI RESPIRASI
56
• Sitoplasma
• 2 molekul
asam
piruvat
• 2 molekul
ATP
• 2 molekul
NADH
Dekarboksilasi oksidatif
• Matriks mitokondria
• 2 molekul Asetil CoA
• 2 molekul NADH
• Matriks
mitokondria
• 2 molekul
ATP
• 6 molekul
NADH
• 2 molekul
FADH
• Membra
n dalam
mitokon
dria
• 34
molekul
ATP
RANTAI RESPIRASI
MITOKONDRIA
TEMPAT PEMBENTUKAN ATP PALING UTAMA DALAM SEL, SEBAB
A. MENGANDUNG JALUR/ DAUR YG BANYAK MENGHASILKAN
ENERGI:
1. SIKLUS ASAM SITRAT
2. OKSIDASI BETA ASAM LEMAK MENGHASILKAN ASETIL KO-A
MASUK SIKLUS ASAM SITRAT
B. TEMPAT BERLANGSUNGNYA RANTAI RESPIRASI
Fp(FAD)
ATP ATP ATP
SUKSINAT
Fp (FAD)
67
TITIK TANGKAP:
1. SITE I : PIERICIDIN A, AMOBARBITAL, ROTENON
2. SITE II: BAL, ANTIMYCIN A
3. SITE III: H2S, CO, CN-
69
OKSIDASI NADH DARI LUAR
MITOKONDRIA
NADH TIDAK DAPAT MENEMBUS MEMBRAN MITOKONDRIA
OKSIDASI DITERUSKAN SECARA TAK LANGSUNG :
1. LEWAT MALAT SHUTTLE: 1 MOL NADH + H+ 3 MOL ATP
70
2. LEWAT α-GLISEROFOSFAT SHUTTLE
SITOSOL
MEMBRAN MITOKONDRIA
71
1 MOL NADH + H+ 2 MOL ATP
HIPOTESIS KIMIA OSMOTIK
R H+ H+
I NAD+ + H2O
RUANG X ADP + Pi
INTERMEMBRAN
M H+ H+
I ATP ATP SINTASE
T H+ H+
72 2,4 DINITROFENOL (UNCOUPLER)
MITCHELL MENYEBUTKAN BAHWA OKSIDASI DAN
FOSFORILASI DIKAITKAN OLEH GRADIEN PROTON.
GRADIEN ELEKTROKIMIA (GRADIEN PROTON) DIBENTUK
OLEH POMPA PROTON PADA MEMBRAN-DALAM
MITOKONDRIA.
POMPA PROTON TSB DIOPERASIKAN OLEH ALIRAN
ELEKTRON DAN MENGAKIBATKAN PROTON DILEMPAR KE
LUAR DARI RUANG MATRIX (MELALUI MEMBRAN ).
PROTON AKAN BERGERAK KEMBALI MENUJU KE DALAM
MATRIX SESUAI GRADIEN ELEKTROKIMIA, DAN ENERGI YG
DILEPASKAN AKAN DIGUNAKAN UNTUK SINTESIS ATP
DARI ADP DAN Pi OLEH ATP SINTASE .
73