BIOKIMIA

Buku Acuan
• J. More and R. Langley. 2008. Biochemistry for
Dummies
• D.L. Nelson and M.M.Cox.2004. Lehninger Principles
of Biochemistry. W.H.Freeman&Co.(Softcopy)
• J.M.Berg, J.L.Tymoczko, and L.Stryer. 2002.
Biochemistry. W.H.Freeman&Co.(Softcopy available).
 Apa itu Biokimia?
• Definisi:
– Webster’s dictionary: Biokimia
(Yunani)=, artinya “Kimia mahluk hidup;
Kimia yang menjadi ciri kehidupan.”
– WebNet dictionary: “Biokimia adalah
ilmu yg mempelajari bahan-bahan dan
proses-proses yang terjadi dalam tubuh
mahluk hidup; sebagai upaya untuk
memahami proses kehidupan dari sisi
kimia.“
Tujuan mempelajari biokimia?
Untuk memahami interaksi
molekul-molekul tak hidup yang
menghasilkan fenomena yang
menjadi ciri-ciri kehidupan dan
menjelaskan keseragaman kimia
dari kehidupan yang beragam.
Characteristics of Living Systems
Characteristics of Living Systems
Characteristics of Living Systems
 Sejarah Biokimia
 Pertama, identifikasi unsur kimia penyusun mahluk hidup.

Enam unsur utama penyusun

sel hidup adalah: C, H, O, N,
P, dan S.

99% penyusun sel adalah C, H, O, N

Elektron
Unsur Jumlah Fraksi
bebas
H 1 2/3
O 2 1/4
N 3 1/70
C 4 1/10
 Sejarah Biokimia (Lanjutan)
• Kedua, identifikasi molekul penyusun (monomer)
yang ditemukan dalam mahluk hidup

• Asam Amino

• Nukleotida

• Monosakarida

• Lipida
 Sejarah Biokimia (Lanjutan)
 Selanjutnya memahami mekanisme sintesis biomolekul ,
sehingga membuat mahluk hidup menjadi hidup
Katabolisme merupakan proses penguraian atau
pemecahan senyawa organik kompleks menjadi
senyawa-senyawa yang lebih sederhana

Contoh Respirasi : C6H12O6 + O2 ——————>

6CO2 + 6H2O + 688KKal.
(glukosa)

Fermentasi : C6H1206 ——————> 2C2H5OH +

2CO2 + Energi. (glukosa) (etanol)
Anabolisme adalah suatu peristiwa perubahan
senyawa sederhana menjadi senyawa kompleks,
nama lain dari anabolisme adalah peristiwa sintesis
atau penyusunan.

Contoh : Fotosintesis
 Biomolekul – Struktur
Anabolic
• Senyawa
Pembangun Makromolekul
• Monosakarida • Polisakarida
• Asam amino • Protein (peptida)
• Nukleotida • RNA or DNA
• Asam lemak • Lipid
Catabolic
Biosintesis
Membutuhkan
molekul
sederhana
untuk
dirangkai
melalui
berbagai
kombinasi
Biomolecules
• Carbohydrates
• Lipids
• Proteins
• Nucleic acid
 Carbohydrates

• Composed of carbon, hydrogen, and oxygen.

• Sugars
• Monosaccharides
– Ex. Glucose
• Disaccharides
– Ex. Sucrose
• Polysaccharides
– Ex. Cellulose
 Lipids
• Fatty Acids
– The building
blocks of
lipids.

biology.clc.uc.edu

courses.cm.utexas.edu
 Proteins

• Made up of
polymers of amino
acids.
• 20 primary amino
acids exist.
• A polymer of 3 or
more amino acids
forms a
polypeptide.
Enzymes
• Are proteins.
• Are considered
biological
catalysts.
– Speed up a chemical
reaction without
being altered.
• Proteins, including
enzymes, can be
denatured.
 Nucleic Acids

• DNA and RNA.

– (DNA - deoxyribonucleic acid,
RNA - ribonucleic acid).
• Is the “hereditary molecule.”
• Contains genes that code for
a certain product.
• DNA is translated into RNA
which is used to produce a
protein or other product.
3 hal yang dibutuhkan sel
(1) ENERGI
hal yang perlu
diketahui adalah
cara:
- Memperolehnya
- Mengubahnya
- Memanfaatkannya
3 hal yang dibutuhkan sel (lanjutn)

(2) MOLEKUL SEDERHANA ,

hal yang perlu diketahui
adalah cara:
• Mengubahnya
• Mempolimerisasikannya
• Mendegradasinya
 3 hal yang dibutuhkan sel

(3) MEKANISME KIMIA, untuk:

• Menjalankan reaksi kimia secara berurutan
• Mensintesis & mendegradasi makromolekul
• Mempertahankan suatu keadaan steady
state yang dinamis
• Perakitan kembali struktur yang kompleks
• Menggandakan diri secara akurat dan
efisien
• Mempertahankan keteraturan proses
biokimia
Strategi sel #1: mahluk hidup
menggunakan sistem reaksi kimia
berpasangan untuk mendorong reaksi
yang sulit terjadi.
Strategi sel #2: mahluk hidup
menggunakan enzim untuk
mempercepat reaksi yang
semestinya lambat
Bagaimana enzim bisa
mempercepat reaksi?
 Biochemistry is a Research Discipline
Applicable to the Real World
Medicine/Clinical
- diagnose and monitor disease
- design drugs (new antibiotics, chemotherapy agents)
- protein diseases (Mad Cow, Alzheimer’s)
Agriculture
- new herbicides and pesticides
- transgenic crops
Industry
- synthesis
- detoxification
 Cakupan (scope) :
 Struktur kimia dalam biologi (biomolecule)
 Interaksi antar biomolekul
 Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel
 Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel
 Mekanisme pengorganisasian biomolekul
dan pengkoordinasian aktivitasnya
 Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi
informasi genetika
 TERIMA KASIH
DAN
SAMPAI JUMPA LAGI
 Hubungan antara Biokimia
dan ilmu lainnya
 Kimia Organik yang mempelajari sifat-sifat
biomolekul.
 Nutrisi, yang memanfaatkan pengetahuan tentang
metabolisme untuk menjelaskan kebutuhan
makanan bagi mahluk hidup guna
mempertahankan kehidupan normalnya.
 Kesehatan, yang mencari pemahaman tentang
keadaan sakit dari sudut pandang molekular.
 Hubungan antara Biokimia
dan ilmu lainnya
• Mikrobiologi, yang menunjukkan bahwa
mikroorganisme sangat cocok untuk digunakan
sebagai sarana mempelajari jalur-jalur
metabolisme dan mekanisme pengendaliannya.
• Fisiologi, yang mempelajari proses kehidupan
pada tingkat jaringan dan organisme.
• Biologi sel, yang mempelajari pembagian kerja
biokimia dalam sel.
• Genetika, yang mempelajari mekanisme
penyusunan identitas biokimia sel.
Life begins with Cell

• A cell is a smallest structural unit of an

organism that is capable of independent
functioning
• All cells have some common features
 Cells
• Fundamental working units of every living system.
• Every organism is composed of one of two
radically different types of cells:
prokaryotic cells or eukaryotic cells.
• Prokaryotes and Eukaryotes are descended from the
same primitive cell.
– All extant prokaryotic and eukaryotic cells are the result
of a total of 3.5 billion years of evolution.
 SIFAT BENDA HIDUP

• Kompleks, terorganisasi, dinamis

• Mempunyai fungsi dan tujuan
• Mampu mengekstraksi, mengubah,
dan menggunakan energi
• Menggandakan diri (Reproduction)
Sebagian besar unsur penyusun bahan hidup memiliki berat
atom yang rendah; H, O, N dan C adalah unsur dengan berat
atom relatif paling kecil yang masing-masing mampu
membentuk ikatan tunggal, rangkap 2 dan 3.

Unsur dengan berat atom lebih ringan

membentuk ikatan lebih kuat