BIOLOGI
Oleh :
CHRISTINA NATALYA
NIM : 08.70.0036
Kelompok A5
1. PENDAHULUAN
1.1. TUJUAN PRAKTIKUM
Tujuan dilakukannya praktikum ini adalah untuk memahami oksidasi pada siklus krebs.
16
Respirasi sel terjadi akibat oksidasi dari sebuah substrat menjadi energi kimia (ATP).
Komponen organik yang digunakan sebagai substrat dalam respirasi dapat berupa
karbohidrat, lemak, dan protein. Karbohidrat merupakan salah satu komponen yang
dipilih oleh kebanyakan sel. Polisakarida akan terhidrolisis menjadi monosakarida
sebelum memasuki proses respirasi. Lemak akan digunakan sebagai substrat respirasi
jika karohidrat telah habis. Protein hanya akan digunakan sebagai substrat dalam
respirasi jika selluruh karbohidrat dan lemak di dalam sel telah habis digunakan (N. P.
O. Green et al., 1988).
Pada respirasi anaerob, glukosa teroksidasi melalui beberapa jenis dehidrasi. Pada tiap
dehidrasi, hydrogen dipindahkan dan digunakan untuk mereduksi koenzim.
dehidrogenasi
AH1 + B
(Substrat (Koenzim
respirasi
(akseptor
tereduksi) hydrogen))
A + BH2
(Substrat respirasi(Konzim
teroksidasi) tereduksi)
16
Terdapat 10 langkah perubahan mulai dari glukosa sampai terbentuknya Asam Piruvat.
Perubahan tersebut adalah sebagai berikut Glukosa Glukosa-6-fosfat Fruktosa-6
-fosfat
Fruktosa-6-fosfat
Fruktosa-1,6-difosfat
2 - fosfogliseraldehid 1,3-difosfogliserat 3-fosfogliserat 2-fosfogliserat 3fosfoenol piruvat (PEP) Asam piruvat (Diah Aryulina et al., 2007).
Secara sistematis dan lebih ringkasnya, reaksi yang terjadi dalam glikolisis adalah :
C6H12O6 2C3H4O3 + 4H + 2 ATP.
(glukosa) (asam piruvat)
Pada
dekarboksilasi oksidatif asam piruvat, akan ada perpindahan carbon dioksida dengan
oksigen melalui dehidrogenasi. Dalam reaksi ini, asam piruvat akan berikatan dengan
substansi yang disebut dengan Koenzim A (CoAS-H) untuk membentuk asetil Ko-A,
dengan reaksi sebagai berikut :
CH3COCOOH + CoAS-H + NAD CH3CO-S-CoA + CO2 + NADH2
(asetil KoA)
NADH2 terbentuk sebagai hasil dari asetil KoA akan disimpan dan digunakan untuk
proses respirasi selanjutnya di mitokondria (N. P. O. Green et al., 1988).
16
Daur krebs (daur trikarboksilat) atau daur asam sitrat merupakan pembongkaran asam
piruvat secara aerob (memerlukan oksigen) menjadi CO 2 dan H2O serta energi kimia.
Daur yang ditemukan Hans Kreb ini merupakan reaksi antara Asetil Ko-A (2C) dengan
Oksaloasetat (4C) yang menghasilkan Daur Asam Sitrat (6C), berlangsung secara aerob
di mitokondria dan menghasilkan dua molekul ATP, dua molekul FADH2, enam
molekul NADH2, dan empat molekul CO2 (Suhel Jasuni, 2008).
Reaksi yang terjadi dalam siklus krebs adalah
C6H12O6 + 6 H2O 6 CO2 + 4 ATP + 12 H2 (akseptor hydrogen)
(N. P. O. Green et al., 1988).
Mitokondria adalah tempat di mana fungsi respirasi pada makhluk hidup berlangsung.
Respirasi merupakan proses perombakan atau katabolisme untuk menghasilkan energi
atau tenaga bagi berlangsungnya proses hidup. Dengan demikian, mitokondria adalah
"pembangkit tenaga" bagi sel (www.perpustakaanonline.com).
Mitokondria memiliki dua lapis membran. Membran luar membatasi bagian dalam
dengan matriks sel. Membran dalam berlekuk-lekuk. Proses respirasi terjadi di dalam
membran dalam. Mitokondria memiliki DNA tersendiri, yang dikenal sebagai mtDNA
(Ing. mitochondrial DNA). MtDNA berpilin ganda, sirkular, dan tidak terlindungi
membran (prokariotik). Karena memiliki ciri seperti DNA bakteri, berkembang teori
yang cukup luas dianut, yang menyatakan bahwa mitokondria dulunya merupakan
makhluk hidup independen yang kemudian bersimbiosis dengan organisme eukariotik.
Walaupun telah diketahui bahwa mitokondria merubah materi organik menjadi energi
sel yang berupa ATP, mitokondria memerankan peranan penting pada proses metaboik,
yaitu apoptosis (proses kematian sel), glutamate (memediasi exitotoxic neuronal injury),
proliferasi
sel,
regulasi
sel,
sintesis
heme,
dan
juga
sintesis
steroid
Adapun fungsi mitokondria hanya untuk tipe sel yang spesifik. Mutasi pada regulasi gen
menghasilkan kerusakan mitokondria( Ratna Ristianti, 2008).
16
16
satu pasang atom hydrogen diterima, satu atom hydrogen akan berdisosiasi dengan
electron dan protonnya. H H+ + e-. sedangkan atom hydrogen yang lain akan
berikatan dengan NAD(P), NAD(P)+ + H [H+ + e-] NAD(P)H + H+, atau secara
singkat dapat ditulis NAD(P) + H2 NAD(P)H2 (N. P. O. Green et al., 1988).
Dari transport electron dihasilkan 12 molekul H 2O, 34 molekul ATP yang diperoleh dari
perombakan dua NADH2 dari Glikolisis = 2 x 3 ATP = 6 ATP, dua NADH 2 dari
Dekarboksilasi Oksidatif = 2 x 3 ATP = 6 ATP, enam NADH 2 dari Siklus Krebs = 6 x 3
ATP = 18 ATP, dan dua FADH2 dari Siklus Krebs = 2 x 2 ATP = 4 ATP. Total ATP yang
terbentuk pada proses respirasi adalah 38 ATP (2 ATP dari Glikolisis, 2 ATP dari Siklus
Krebs, dan 34 ATP dari Transpor Elektron) (Suhel Jasuni, 2008).
Koenzim Q merupakan komponen non-protein yang membantu aktivitas, berupa ion
anorganik, enzim yang terdiri dari enam atom karbon (C). Koenzim Q ini yang
memerima hydrogen dari flavoprotein dan membawanya ke dalam sitokrom b (N. P. O.
Green et al., 1988).
Proses respirasi tersebut dapat ditulis dalam reaksi berikut :
glikolisis
6 CO2 + 12 H2 + 4 ATP
siklus krebs
respirasi
(2) 12 H2 + 6 O2
12 H2O + 34 ATP
16
2.1.2. BAHAN
Bahan-bahan yang digunakan dalam percobaan ini adalah kecambah kacang hijau,
kecambah kacang tanah, kecambah kedelai, es batu, garam, larutan buffer/sukrosa,
larutan buffer/sukrosa + asam suksinat, 0,1% DCPIP (2,6-dichlorophenolindophenol),
air destilata.
2.2. METODE
Kecambah sebanyak tiga buah dihilangkan akar dan daunnya lalu dimasukkan ke dalam
tabung sentrifuge. Kemudian ditambahkan 1 ml buffer sukrosa (untuk kelompok 1, 2,
dan 3), atau 1 ml buffer sukrosa + asam suksinat ( untuk kelompok 4, 5, dan 6). Lalu
kecambah di dalam larutan buffer tersebut dihancurkan di dalam sebuah beaker glass
berisi es batu. Setelah hancur, 10 ml buffer sukrosa (untuk kelompok 1, 2, dan 3) atau
10 ml buffer sukrosa + asam suksinat (untuk kelompok 4, 5, dan 6) ditambahkan ke
dalamnya dan campuran tersebut disentrifuge. Sementara itu, diambil 15 ml aquades
dan dimasukkan ke dalam tabung reaksi dengan 0,5 ml DCPIP yang juga dimasukkan
ke dalam sebuah tabung reaksi. Sesudah disentrifuge, supernatant dari campuran
tersebut dibuang dan endapannya dipindahkan ke dalam tabung reaksi berisi aquades.
Lalu ditambahkan DCPIP ke dalamnya, tabung reaksi ditutup dengan ibu jari lalu
dibalik agar larutan tercampur, kemudian diamati dan dibandingkan perubahan warna
yang terjadi pada menit ke-0, menit ke-10, dan menit ke-20.
16
3. HASIL PENGAMATAN
Tabel 1. di bawah ini menunjukkan perubahan warna yang terjadi pada oksidasi siklus
krebs yang terjadi pada oksidasi berbagai macam kecambah (kecambah kacang hijau,
kecambah kacang tanah, dan kecambah jagung).
Tabel 1. Perubahan Warna pada Oksidasi Siklus Krebs dengan Kecambah dan Buffer
yang Berbeda
kelompok
warna
menit
ke-0
++++
+++++
+
perlakuan
1
2
3
warna
menit
ke-10
++++
+++++
+
warna
menit
ke-20
++++
+++++
+
Pada Tabel 1 tersebut ditunjukkan bahwa kecambah kacang hijau yang ditambahkan
dengan larutan buffer sukrosa dan DCPIP tidak mengalami perubahan warna, warna
campuran tetap, yaitu biru tua, demikian pula pada kacang tanah yang dicampur dengan
buffer sukrosa dan DCPIP memiliki warna biru sangat tua pada menit ke-0, menit ke-10,
dan menit ke-20, sedang pada kecambah jagung juga tidak ada perubahan warna,
warnanya tetap biru sangat muda dari menit ke-0 hingga menit ke-20. Pada penambahan
buffer sukrosa dan asam suksinat serta DCPIP juga tidak terjadi perubahan warna,
dimana secara berturut-turut warna yang terbentuk dari kecambah kacang hijau,
kecambah kacang tanah, dan kecambah jagung adalah biru muda, biru, dan biru tua.
16
4. PEMBAHASAN
Pada praktikum oksidasi siklus krebs ini, kelompok pertama dan keempat
mempergunakan kecambah kacang hijau, kelompok kedua dan kelima mempergunakan
kecambah kacang tanah, sedang untuk kelompok ketiga dan keenam dipergunakan
kecambah jagung. Pertama-tama kecambah dari masing-masing kelompok dibersihkan;
dihilangkan akar dan daunnya. Setelah itu, sebanyak tiga buah kecambah dimasukkan
ke dalam tabung sentrifuge. Kemudian, kelompok 1, 2, dan 3 menambahkan 1 ml buffer
sukrosa dan untuk kelompok 4, 5, dan 6 ditambahkan 1 ml buffer sukrosa + asam
suksinat. Kecambah tersebut lalu dihancurkan dengan menggunakan pengaduk kaca,
tabung sentrifuge berisi kecambah dan buffer tersebut dimasukkan ke dalam sebuah
beaker glass berisi es batu. Setelah hancur, ditambahkan lagi sebanyak 10 ml buffer
yang sama ke dalamnya lalu disentrifuge selama 15 menit agar dapat tercampur rata.
Sementara tiu, disiapkan 15 ml aquades dan 0,5 ml DCPIP di dalam tabung reaksi.
Sesudah disentrifuge, supernatant (larutan yang terbentuk akibat sentrifuge) dibuang;
disisakan endapannya saja. Endapan tersebut lalu dipindahkan ke dalam tabung reaksi
berisi aquades lalu ditambahkan DCPIP ke dalamnya. Tabung reaksi berisi endapan,
aquades, dan DCPIP tersebut ditutup dengan ibu jari lalu dibalik, kemudian amati
perubahan warna yang terjadi pada menit ke-0, 10, dan 20.
Dari percobaan kelompok pertama, diperoleh bahwa warna kecambah kacang tanah
yang telah disentrifuge dengan buffer sukrosa dan dicampur dengan aquades dan DCPIP
pada menit ke-0 adalah biru tua, demikian pula terbentuk warna yang sama pada menit
ke-10 dan menit ke-20. Kelompok kedua yang menggunakan kecambah kacang tanah
dan buffer sukrosa setelah dicampur dengan aquades dan DCPIP memberikan warna
yang sama pada menit ke-0, menit ke-10, dan menit ke-20 yaitu berwarna biru sangat
tua. Sedangkan kelompok ketiga yang mempergunakan kecambah jagung dan buffer
sukrosa memperoleh hasil pengamatan dengan warna campuran yang sama, yaitu biru
sangat muda pada menit ke-0, menit ke-10, dan menit ke-20.
Percobaan pada kelompok keempat, kelima, dan keenam dengan menggunakan buffer
sukrosa + asam laktat tidak menunjukkan perubahan warna pada menit ke-0 hingga
16
menit ke-20. Akan tetapi, jika dibandingkan dengan percobaan kelompok pertama,
kedua, dan ketiga ada perbedaan warna yang muncul pada kelompok yang
menambahkan asam suksinat tersebut. Pada kelompok keempat yang menggunakan
kecambah kacang kedelai, warna campuran pada menit ke-0 hingga menit ke-20 adalah
warna biru muda. Pada kelompok kelima (dengan menggunakan kecambah kacang
tanah), warna yang muncul dari menit ke-0 hingga menit ke-20 adalah warna biru,
sedangkan pada kelompok keenam (yang menggunakan kecambah jagung), warna yang
muncul adalah warna biru tua.
Dari hasil percobaan tersebut dapat dilihat bahwa adanya perbedaan warna pada
kecambah yang sama yang ditimbulkan dari perbedaan buffer yang digunakan dalam
percobaan. Pada percobaan ini digunakan alat sentrifuge (pemusing) untuk memusing
(mencampur) zat. Pencampuran ini bertujuan agar ekstrak kecambah dapat tersebar
merata di dalam larutan sehingga memudahkan pengamatan. Larutan buffer yang
merupakan larutan yang dapat menahan nilai pH tertentu dipergunakan dalam
percobaaan ini agar tidak menyebabkan adanya perubahan pH yang dapat
mempengaruhi hasil percobaan ini. Dengan adanya larutan buffer, yang sering disebut
juga dengan larutan penyangga/dapar, pH larutan tidak akan berubah dengan
penambahan asam, penambahan basa, maupun pengenceran. Penambahan buffer
sukrosa selain bertujuan untuk menjaga pH campuran, buffer ini juga berguna sebagai
penyedia bahan respirasi untuk membentuk energy. Sedangkan asam suksinat digunakan
dalam siklus krebs, dimana pada siklus krebs terjadi enam tahap, yaitu :
1) Asam oksaloasetat + Asetil KoA ---> Asam Sitrat + KoA
2) Asam sitrat + NAD ---> Asam ketoglutarat + NADH2 + CO2
3) Asam ketoglutarat + NAD + H2O ---> Asam suksinat + NADH2 + CO2
4) Asam suksinat + FAD + H2O ---> Fumarat + FADH2
5) Fumarat + H2O ---> Malat
6) Malat + NAD ---> Asam oksaloasetat +NADH2.
Dari tahapan reaksi dalam siklus krebs tersebut, diketahui bahwa asam suksinat akan
bereaksi dengan FAD dan air membentuk Fumarat dan FADH2. Dengan penambahan
asam suksinat, maka FADH2 yang terbentuk akan semakin banyak dan hal ini berarti
bahwa energy yang terbentuk untuk proses di dalam sel juga semakin banyak.
16
Selain
buffer,
dalam
percobaan
ini
juga
ditambahkan
DCPIP
(2,6-
Dari percobaan tersebut, pada selang waktu selama 10 menit itu terjadi metabolism dari
sel-sel yang terdapat di dalam kecambah untuk menghasilkan energy yang dapat
digunakan untuk aktivitas di dalam sel. Kecambah yang dihancurkan (membantu proses
katabolisme, pemecahan molekul yang kompleks menjadi molekul yang lebih kecil)
memiliki sel-sel yang masih dapat melakukan metabolism. Pada percobaan ini,
ditunjukkan bahwa kecambah mengalami proses katabolisme dimana glukosa yang
terkandung di dalam kecambah akan dipecah menjadi molekul-molekul yang lebih
sederhana berupa karbon dioksida, air, serta energy dalam bentuk ATP. Proses
katabolisme dalam kecambah (respirasi) melewati tiga tahap utama, yakni glikolisis,
siklus krebs, serta transport electron. Tahapan-tahapan respirasi ini dapat kita ketahui
dengan adanya perubahan warna yang ditunjukkan dengan adanya indicator berupa
DCPIP dan larutan buffer.
Reaksi respirasi tersebut secara skematis dapat ditulis sebagai berikut :
C6H12O6 + 6 O2
Pemecahan molekul glukosa ini berlangsung dengan bantuan oksigen dan menghasilkan
energy sehingga disebut reaksi eksergonik/eksotermis. Pada glikolisis terjadi reaksi
berikut C6H12O6 2C3H4O3 + 4H + 2 ATP. Di sini, glukosa akan dirubah menjadi asam
piruvat. Saru molekul glukosa atau molekul monosakarida yang lain (terdiri dari enam
atom karbon) akan dipecah menjadi dua molekul asam piruvat (terdiri dari tiga atom
karbon) di dalam sitosol, sitoplasma. Pada glikolisis terjadi dua langkah reaksi, yaitu
reaksi yang memerlukan energy dan reaksi yang melepaskan energy. Reaksi yang
memerlukan energy adalah reaksi
sehingga glukosa memiliki simpanan energy yang lebih tinggi. Energy yang diperlukan
dalam mentransfer energy ini sebanyak dua ATP. Sedangkan energy yang terbentuk
akibat transfer energy ini akan dilanjutkan untuk reaksi selanjutnya (reaksi pelepasan
energy).
Tahap setelah glikolisis adalah tahap siklus krebs. Tahap ini diawali dengan dua molekul
asam piruvat yang meninggalkan sitoplasma dan memasuki mitokondria. Dimana
nantinya akan terjadi oksidasi sehingga dilepaskan tiga molekul carbon dioksida. Reaksi
ini terjadi dua kali akibat dari terbentuknya dua asam piruvat dari peristiwa glikolisis.
16
Pada reaksi berikut ini ditunjukkan dua reaksi oksidasi yang terjadi dalam siklus krebs
C6H12O6 + 6 H2O 6 CO2 + 4 ATP + 12 H2.
Dimana :
Asetil-KoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2 H2O KoA-SH + 3 NADH + H+ + FADH2
+ GTP + 2 CO2 + 3 H+.
Transport electron merupakan tahapan terakhir dari respirasi aerob ketika electron dari
reaksi intermediet (siklus krebs) dilairkan secara berturut-turut pada enzim dan kofaktor
membrane dalam mitokondria dan menyebabkan terjadinya gradient electron yang
mendorong dintesis ATP. Gradient electron ini akibat dari electron yang bergerak dari
system transport. H+ akan dipompa keluar dari dalam membrane mitokondria,
konsentrasi H+ yang berbeda antara di luar dan di dalam mitokondria inilah yang
menyebabkan adanya gerakan electron.
16
5. KESIMPULAN
Respirasi aerob merupakan peristiwa pembakaran zat yang melibatkan oksigen dari
pernapasan.
Respirasi aerob terjadi dalam tiga tahap yaitu glikolisis, siklus krebs, dan transport
electron.
Di antara tahap glikolisis dan siklus krebs, terdapat reaksi antara yaitu dekarboksilasi
oksidatif.
Pada tahap siklus krebs terjadi reaksi : Asetil-KoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2
H2O KoA-SH + 3 NADH + H+ + FADH2 + GTP + 2 CO2 + 3 H+.
Secara skematis, reaksi yang terjadi pada respirasi aerob dapat ditulis sebagai berikut:
C6H12O6 + 6 O2
Asisten Dosen:
- Oeij Ling Shia
- Stephanie
- Arya Widinatha
Christina Natalya
16
NIM : 08.70.0036
6. DAFTAR PUSTAKA
16
7. LAMPIRAN
7.1. LAPORAN SEMENTARA
16