Struktur Mitokondria
Pada tahun 1981 review sejarah mitokondria dalam Journal of Cell Biology, penulis Lars Ernster
dan Gottfried Schatz mencatat bahwa pengamatan pertama tentang mitokondria adalah oleh
Richard Altmann pada tahun 1890. Sementara Altmann memanggil mereka bioblasts, saat
mereka mendeskripsikan tampilan yang mereka lihat. Nama itu diberikan oleh Carl Benda pada
Fungsi Mitokondria
Fungsi utama mitokondria adalah untuk memetabolisme atau memecah karbohidrat dan asam
lemak untuk menghasilkan energi. Sel eukariotik menggunakan energi dalam bentuk molekul
kimia yang disebut ATP (adenosin trifosfat).
Generasi ATP terjadi dalam matriks mitokondria, meskipun langkah-langkah awal dari
metabolisme karbohidrat (glukosa) terjadi di luar organel. Menurut Geoffrey Cooper di Sel:
Sebuah Pendekatan Molekuler edisi ke 2 (Sinauer Associates, 2000), glukosa pertama diubah
menjadi piruvat dan kemudian diangkut ke dalam matriks.
ATP dihasilkan melalui program tiga langkah terkait. Pertama, menggunakan enzim yang
terdapat di dalam matriks, piruvat dan asam lemak diubah menjadi molekul yang dikenal sebagai
asetil-CoA. Hal ini kemudian menjadi bahan awal untuk reaksi kimia kedua dikenal sebagai
siklus asam sitrat atau siklus Krebs. Langkah ini menghasilkan banyak karbon dioksida dan dua
molekul tambahan, NADH dan FADH2, yang kaya elektron. Dua molekul bergerak ke membran
mitokondria bagian dalam dan mulai langkah ketiga: fosforilasi oksidatif. Dalam reaksi kimia
terakhir ini, NADH dan FADH2 menyumbangkan elektron mereka untuk oksigen, yang
mengarah ke kondisi yang cocok untuk pembentukan ATP.
Sebuah fungsi sekunder mitokondria adalah untuk mensintesis protein untuk mereka gunakan
sendiri. Mereka bekerja secara independen, dan melaksanakan transkripsi DNA ke RNA, dan
translasi dari RNA menjadi asam amino (bahan penyusun protein), tanpa menggunakan
komponen sel. Namun, di sini juga, ada perbedaan dalam eukariota. Urutan tiga nukleotida DNA
UAG (urasil-adenin-guanin) adalah instruksi untuk translasi untuk berhenti di inti eukariotik.
Menurut penulis dari Biologi Sel Molekuler edisi ke 4 (WH Freeman, 2000), sedangkan
urutan ini juga menhentikan translasi dalam mitokondria tanaman, itu mengkodekan asam amino
triptofan dalam mitokondria mamalia, lalat buah dan ragi. Selain itu, transkrip RNA yang muncul
dari gen mitokondria diproses secara berbeda dalam tanaman dari pada hewan. Banyak
modifikasi harus terjadi pada mitokondria tanaman untuk gen-gen supaya menjadi fungsional,
kata Sloan. Misalnya, pada tanaman, nukleotida individu mentranskrip RNA yang diedit sebelum
translasi atau sintesis protein berlangsung. Juga, intron, atau bagian dari RNA mitokondria yang
tidak membawa instruksi untuk sintesis protein, yang disambung keluar.
Bahkan pada waktu itu Margulis mengusulakan itu, versi teori endosimbion yang sudah ada,
sekitar tahun 1910 dan 1915. Meskipun ide-ide ini tidak baru, dalam makalah ini mereka telah
disintesis sedemikian rupa untuk konsisten dengan data baru pada biokimia dan sitologi organel
subselular, tulisnya dalam makalahnya. Menurut sebuah artikel 2012 tentang evolusi
mitokondria oleh Michael Gray dalam jurnal Cold Spring Harbor Perspektif Biologi, Margulis
berdasarkan hipotesis nya pada dua bukti kunci. Pertama, mitokondria memiliki DNA sendiri.
Kedua, organel mampu menerjemahkan pesan yang dikodekan dalam gen mereka menjadi
protein, tanpa menggunakan sumber daya dari sel eukariotik.
Sekuensing genom dan analisis DNA mitokondria telah menetapkan bahwa Margulis benar
tentang asal-usul mitokondria. Silsilah organel telah ditelusuri kembali ke nenek moyang bakteri
primitif yang dikenal sebagai alphaproteobacteria (-Proteobacteria).
Meskipun konfirmasi warisan bakteri mitokondria itu, teori endosimbion terus diteliti. Salah
satu pertanyaan terbesar sekarang adalah, Siapakah sel inang?'. Seperti Gray mencatat dalam
artikelnya, pertanyaan-pertanyaan seperti, apakah mitokondria berasal setelah sel eukariotik
muncul (seperti hipotesis dalam teori endosimbion) atau apakah mitokondria dan sel inang
muncul bersama-sama, pada waktu yang sama.
MITOKONDRIA
Mitokondria adalah organel tempat berlangsungnya fungsi respirasi sel makhluk hidup selain
fungsi selular lain, seperti metabolisme asam lemak, biosintesis pirimidina, homeostatis kalsium
dan sebagainya.
Struktur Mitokondria:
1. Ukuran dan bentuk mitokondria, seperti halnya jumlahnya di dalam sel, bervariasi
menurut jaringannya dan menurut keadaan fisiologik sel.
2. Kebanyakan mitokondria berbentuk jorong, dengan diameter antara 0,5 dan 1,0 m dan
panjang 7 m.
3. Biasanya makin kecil jumlah mitokondria dalam suatu sel, makin besar ukuran organel
tersebut.
4. Pada banyak mikrograf elektron, mitokondria kelihatan berbentuk halter atau raket.
Bentuk semacam ini mungkin menunjukkan proses pembelahannya.
Mitokondria memiliki DNA tersendiri, yang dikenal sebagai mtDNA.
MtDNA berpilin ganda, sirkular, dan tidak terlindungi membran (prokariotik). Karena memiliki
ciri seperti DNA bakteri, berkembang teori yang cukup luas dianut, yang menyatakan bahwa
mitokondria dulunya merupakan makhluk hidup independen yang kemudian
bersimbiosis dengan organisme eukariotik. Teori ini dikenal dengan teori endosimbion. Pada
makhluk tingkat tinggi, DNA mitokondria yang diturunkan kepada anaknya hanya berasal dari
betinanya saja (mitokondria sel telur). Mitokondria jantan tidak ikut masuk ke dalam sel telur
karena letaknya yang berada di ekor sperma. Ekor sperma tidak ikut masuk ke dalam sel telur
sehingga DNA mitokondria jantan tidak diturunkan.
Mitokondria dapat melakukan replikasi secara mandiri (self replicating) seperti sel bakteri.
Replikasi terjadi apabila mitokondria ini menjadi terlalu besar sehingga melakukan pemecahan
(fission). Pada awalnya sebelum mitokondria bereplikasi, terlebih dahulu dilakukan replikasi
DNA mitokondria. Proses ini dimulai dari pembelahan pada bagian dalam yang kemudian diikuti
pembelahan pada bagian luar. Proses ini melibatkan pengkerutan bagian dalam dan kemudian
bagian luar membran seperti ada yang menjepit mitokondria. Kemudian akan terjadi pemisahan
dua bagian mitokondria [Childs, 1998].
Membran Dalam
Terdiri dari 20% lipid dan 80% protein yang terlibat dalam reaksi fosforilasi oksidatif, ATP
sintase yang berfungsi membentuk ATP pada matriks mitokondria, serta protein transpor yang
mengatur keluar masuknya metabolit dari matriks melewati membran dalam.
Tempat utama pembentukan ATP
Mengandung 5 kelompok protein integral membran, yaitu :
1. NADH dehidrogenase,
2. suksinat dehidrogenase,
3. sitokrom c reduktase (juga dikenal sebagai kompleks
sitokrom b-c1),
4. sitokrom c oksidase,
5. ATP sintase
Membran dalam
Membran luar
Kaya cardiolipid
Ruang antar membran yang terletak di antara membran luar dan membran dalam
merupakan tempat berlangsungnya reaksi-reaksi yang penting bagi sel, seperti siklus
Krebs, reaksi oksidasi asam amino, dan reaksi -oksidasi asam lemak.
Membran luar:
Membran luar terdiri dari protein dan lipid dengan perbandingan yang sama serta mengandung
protein porin yang menyebabkan membran ini bersifat permeabel terhadap molekul-molekul
kecil.
Membran luar juga mengandung enzim yang terlibat dalam biosintesis lipid dan enzim yang
berperan dalam proses transpor lipid ke matriks untuk menjalani -oksidasi menghasilkan asetilKoA.
Matriks mitokondria: Di dalam matriks mitokondria juga terdapat materi genetik, yang dikenal
dengan DNA mitkondria (mtDNA), ribosom, ATP, ADP, fosfat inorganik serta ion-ion seperti
magnesium, kalsium dan kalium
Siklus hidup mitokondria: Mitokondria dapat melakukan replikasi secara mandiri (self
replicating) seperti sel bakteri. Replikasi terjadi apabila mitokondria ini menjadi terlalu besar
sehingga melakukan pemecahan (fission). Pada awalnya sebelum mitokondria bereplikasi,
terlebih dahulu dilakukan replikasi DNA mitokondria.
Fungsi mitokondria terjadi:
1. Sebagai tempat sintesis ATP
ti.com
Mitokondria adalah organel terbesar kedua dalam sel. Mari kita memahami fungsi mitokondria
melalui artikel ini. Sebuah entitas hidup bertahan dengan respirasi. Oksigen dihirup
ditransmisikan sepanjang tubuh untuk mempertahankan fungsi normal dari semua organ dalam.
Tapi apakah Anda pernah bertanya-tanya, bagaimana proses ini respirasi terjadi pada tingkat sel.
Sebelum memahami itu, kita harus tahu mana organel sel yang bertanggung jawab untuk
respirasi sel. Ini adalah mitokondria, yang juga disebut sebagai pusat kekuatan sel. Setiap sel
tubuh kita mengandung organel ini.
Bagian mitokondria
Seperti semua organel sel lainnya, mitokondria juga merupakan membran tertutup organel sel,
yang terkandung dalam sitosol (cairan intraseluler) sel eukariotik (sel yang mengandung inti).
Struktur ini tersusun dari bagian-bagian berikut:
Membran luar: ini didasari dari semi permeabel fosfolipid bilayer, terbuat dari porins
(struktur protein). Lapisan ini adalah permeabel terhadap ion, ATP (adenosine
triphosphate), ADP (adenosin difosfat) dan molekul nutrisi.
Membran dalam: Ini adalah membran yang kompleks tapi permeabel terbuat dari
molekul kompleks dari sistem transpor elektron, ATP sintetase kompleks dan protein
transpor. Lapisan ini memungkinkan oksigen, air dan karbon dioksida.
Krista: krista adalah rak seperti lipatan pada membran batin. Mereka membantu dalam
perluasan struktur membran sel dalam ketika ada kebutuhan untuk lebih banyak ruang
untuk mengakomodasi lebih banyak molekul DNA mitokondria.
Ruang antarmembran: ini adalah ruang antara membran luar dan membran dalam.
Ruang antarmembran terutama bertanggung jawab untuk fosforilasi oksidatif.
Fungsi Mitokondria
Sekarang kita tahu bagian-bagian dari mitokondria, mari kita memahami fungsi penting dari
organel ini. Salah satu fungsi utama dalam mitokondria sel adalah respirasi selular. Jadi apa
respirasi seluler setelah semua? Ini adalah proses kimia melepaskan energi yang tersimpan dalam
glukosa.
Energi yang digunakan dalam pemecahan glukosa disediakan oleh molekul ATP. Dan molekul
ATP diproduksi oleh sel ini organel. Seluruh proses respirasi selular aerobik adalah 3 langkah
proses. Langkah-langkah adalah sebagai berikut:
Glikolisis: Istilah glikolisis sendiri berarti Memisahkan gula. Ini adalah tahap pertama
dari respirasi selular. Glukosa adalah gula enam karbon. Enzim-enzim dalam matriks
sitoplasma memulai glikolisis di mana molekul glukosa dioksidasi menjadi 2 molekul
gula tiga karbon. Produk glikolisis adalah dua molekul ATP, dua molekul asam piruvat
dan dua NADH (Nicotinamide adenine dinucleotide) molekul (molekul yang membawa
elektron)
Siklus Asam Sitrat: ini adalah fase kedua dari respirasi selular. Siklus Asam Sitrat juga
dikenal sebagai Siklus Krebs. Tiga molekul karbon yang telah diproduksi sebagai hasil
dari glikolisis diubah menjadi senyawa asetil. Namun, reaksi perantara dari proses ini
menghasilkan molekul ATP energi dan NAD dan FAD (flavin adenin dinukleotida)
molekul juga. NAD dan molekul FAD yang jauh berkurang dalam siklus Kerb untuk
elektron energi tinggi.
mengelola apoptosis
Subyek fungsi seluler, seperti fungsi dan struktur mitokondria cukup menarik sebagai salah satu
semakin untuk memahami seluk-beluk di dalam tubuh kita dan bagaimana fungsi tubuh pada
tingkat sel.
MITOKONDRIA
Mitokondria, kondriosom (bahasa Inggris: chondriosome, mitochondrion, plural:mitochondria)
adalah organel tempat berlangsungnya fungsi respirasi sel makhluk hidup, selain fungsi selular
lain, seperti metabolisme asam lemak, biosintesis pirimidina, homeostasis kalsium, transduksi
sinyal selular dan penghasil energi[1] berupa adenosina trifosfat pada lintasan katabolisme.
Mitokondria mempunyai dua lapisan membran, yaitu lapisan membran luar dan lapisan membran
dalam. Lapisan membran dalam ada dalam bentuk lipatan-lipatan yang sering disebut dengan
cristae. Di dalam Mitokondria terdapat 'ruangan' yang disebut matriks, dimana beberapa mineral
dapat ditemukan. Sel yang mempunyai banyak Mitokondria dapat dijumpai di jantung, hati, dan
otot.
Terdapat hipotesis bahwa mitokondria merupakan organel hasil evolusi dari sel -proteobacteria
prokariota yang ber-endosimbiosis dengan sel eukariota.[2] Hipotesis ini didukung oleh beberapa
fakta antara lain,
adanya DNA di dalam mitokondria menunjukkan bahwa dahulu mitokondria merupakan entitas
yang terpisah dari sel inangnya,
beberapa kemiripan antara mitokondria dan bakteri, baik ukuran maupun cara reproduksi dengan
membelah diri, juga struktur DNA yang berbentuk lingkaran.
Oleh karena itu, mitokondria memiliki sistem genetik sendiri yang berbeda dengan sistem
genetik inti. Selain itu, ribosom dan rRNA mitokondria lebih mirip dengan yang dimiliki bakteri
dibandingkan dengan yang dikode oleh inti sel eukariot [Cooper, 2000].
Secara garis besar, tahap respirasi pada tumbuhan dan hewan melewati jalur yang sama, yang
dikenal sebagai daur atau siklus Krebs.
STRUKTUR
Ukuran :
diameter 0.2 1.0 m
panjang 1- 4 m
mitokondria dalam bervariasi sesuai
dengan fungsi dari sel tersebut
Contoh:
Sel hati mitokondria 15 20% volume sel
Pada sel tumbuhan mitokondria sumber
ATP untuk sel yang tidak fotosintesis
Memiliki membran lipid bilayer
ganda
membran luar
sistem membran dalam yang
kompleks invaginasi krista
Diantara kedua membran terdapat
ruang antar/inter membran
Matriks berisi protein terlarut,
berbentuk seperti gel
Matriks mitokondria
Mengandung ribosom, enzim, DNA
sirkular
Mengandung enzim untuk
pengubahan piruvat asetil CoA
Mitokondria dinamis :
Berpindah tempat dalam sitosol
Struktur dapat berubah
Fusi dan fisi
Mitokondria banyak terdapat pada sel yang memilki aktivitas metabolisme tinggi dan
memerlukan banyak ATP dalam jumlah banyak, misalnya sel otot jantung. Jumlah dan bentuk
mitokondria bisa berbeda-beda untuk setiap sel. Mitokondria berbentuk elips dengan diameter
0,5 m dan panjang 0,5 1,0 m. Struktur mitokondria terdiri dari empat bagian utama, yaitu
membran luar, membran dalam, ruang antar membran, dan matriks yang terletak di bagian dalam
membran [Cooper, 2000].
1. Membran luar
mengelilingi struktur mitokondria secara keseluruhan
makromolekul subunit
sederhana oleh enzim-enzim
pencernaan :
Protein asam amino
Polisakarida gula
Lemak asam lemak & gliserol
b) Stadium 2:
subunit sederhana asetil CoA
Subunit sederhana piruvat
sitoplasma sel
t Piruvat asetil CoA
mitokondria
hasilkan sejumlah kecil ATP
dan NADH
c) Stadium 3 :
Oksidasi asetil CoA menjadi H2O dan CO2
mitokondria Menghasilkan sejumlah besar ATP
fosforilasi oksidatif
Respirasi seluler merupakan proses
oksidasi molekul makanan, mis. glukosa, menjadi CO2 dan H2O
E dalam bentuk ATP
menunjang aktivitas sel yang memerlukan energi
Respirasi berlangsung dalam dua tahap :
glikolisis, pemecahan glukosa
asam piruvat
berlangsung di dalam sitosol
oksidasi asam piruvat
CO2 + H2O
berlangsung di dalam mitokondria
siklus Krebs
Persamaan umum respirasi
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O + E
Glikolisis
Glikolisis merupakan proses katabolisme glukosa terjadi pada setiap jenis sel
Berlangsung di dalam sitosol
Degradasi 1 molekul gula menjadi 2 molekul piruvat melalui suatu urutan reaksi &
menggunakan enzim-enzim
Persamaan reaksi :
o sitokrom c oksidase,
o ATP sintase
Mitokondria dapat melakukan replikasi secara mandiri (self replicating) seperti sel bakteri.
Replikasi terjadi apabila mitokondria ini menjadi terlalu besar sehingga melakukan pemecahan
(fission). Pada awalnya sebelum mitokondria bereplikasi, terlebih dahulu dilakukan replikasi
DNA mitokondria. Proses ini dimulai dari pembelahan pada bagian dalam yang kemudian diikuti
pembelahan pada bagian luar. Proses ini melibatkan pengkerutan bagian dalam dan kemudian
bagian luar membran seperti ada yang menjepit mitokondria. Kemudian akan terjadi pemisahan
dua bagian mitokondria [Childs, 1998].
DNA mitokondria
Mitokondria memiliki DNA tersendiri, yang dikenal sebagai mtDNA (Ing. mitochondrial DNA).
MtDNA berpilin ganda, sirkular, dan tidak terlindungi membran (prokariotik). Karena memiliki
ciri seperti DNA bakteri, berkembang teori yang cukup luas dianut, yang menyatakan bahwa
mitokondria dulunya merupakan makhluk hidup independen yang kemudian bersimbiosis
dengan organisme eukariotik. Teori ini dikenal dengan teori endosimbion. Pada makhluk tingkat
tinggi, DNA mitokondria yang diturunkan kepada anaknya hanya berasal dari betinanya saja
(mitokondria sel telur). Mitokondria jantan tidak ikut masuk ke dalam sel telur karena letaknya
yang berada di ekor sperma. Ekor sperma tidak ikut masuk ke dalam sel telur sehingga DNA
mitokondria jantan tidak diturunkan.
Mitokondria adalah badan energi sel yang berisi protein dan benar-benar merupakan "gardu
tenaga". "Gardu tenaga" ini mengoksidasi makanan dan mengubah energi menjadi adenosin
trifosfat atau ATP. ATP menjadi agen dalam berbagai reaksi termasuk sistesis enzim. Mitokondria
penuh selaput dalam yang tersusun seperti akordion dan meluaskan permukaan tempat terjadinya
reaksi. (Sumber: Time Life, 1984)
Wikipedia Indonesia, (ensiklopedia bebas berbahasa Indonesia; diakses pada 22 Agustus 2007)
memberi pengertian mitokondria sebagai tempat di mana fungsi respirasi pada makhluk hidup
berlangsung. Respirasi merupakan proses perombakan atau katabolisme untuk menghasilkan
energi atau tenaga bagi berlangsungnya proses hidup. Dengan demikian, mitokondria adalah
"pembangkit tenaga" bagi sel. Oleh karena itu mito kondria sering disebut sebagai The Power
House.
Mitokondria merupakan penghasil (ATP) karena berfungsi untuk respirasi. Bentuk mitokondria
beraneka ragam, ada yang bulat, oval, silindris, seperti gada, seperti raket dan ada pula yang
tidak beraturan. Namun secara umum dpat dikatakan bahwa mitokondria berbentuk butiran atau
benang. Mitokondria mempunyai sifat plastis, artinya bentuknya mudah berubah. Ukuran seperti
bakteri dengan diameter 0,5 1 m. Mitokondria baru terbentuk dari pertumbuhan serta
pembelahan mitokondria yang telah ada sebelumnya (seperti pembelahan bakteri). Penyebaran
dan jumlah mitokondria di dalam tiap sel tidak sama dari hanya satu hingga beberapa ribu. Pada
sel sperma, mitokondria tampak berderet-deret pada bagian ekor yang digunakan untuk bergerak.
Manfaat Mitokondria. Berita terbaru, Upaya manusia untuk memperoleh kualitas hidup lebih
baik dan usia yang panjang tidak akan pernah ada habisnya. Para ilmuwan di Eropa bahkan telah
menemukan sebuah ramuan untuk memperpanjang usia. Setidaknya, ramuan itu diklaim sukses
diujicobakan pada tikus di laboratorium.
Meski baru tahap sukses ujicoba pada tikus, para ilmuwan itu yakin ramuan tersebut akan
bermanfaat bagi manusia, terutama mereka yang menderita sakit dan berusia lanjut.
Seperti dilansir Telegraph, para ilmuwan dari University Of Milan Italia, menggunakan
campuran tertentu asam amino yang dilarutkan ke dalam air dan kemudian diberikan kepada
seekor tikus berusia menengah. Umur tikus itu kemudian bertambah panjang secara signifikan
dari pada tikus lain yang tidak meminum cairan itu.
Tikus yang diberikan campuran dari tiga asam amino, yakni leusin, isoleusin, dan valin,
mencapai titik tengah usianya pada 869 hari sementara yang tidak mengkonsumsi ramuan titik
tengah usianya hanya 774 hari.
Bertambah panjangnya umur juga diikuti dengan perubahan biologis yang mendorong
ketersediaan energi ke dalam sel dan mengurangi kerusakan oksidatif yang disebabkan oleh
molekul-molekul destruktif yang dikenal dengan nama radikal bebas. Alhasil, tikus yang diberi
campuran asam amino itu memiliki stamina lebih dan kordinasi otot yang lebih baik.
Ini adalah pembuktian pertama bahwa campuran asam amino bisa memperpanjang umur tikus,
kata Dr Enzo Nisoli, pemimpin penelitian itu.
Setahun lalu, para ilmuwan telah menunjukan bahwa campuran asam animo yang sama bisa
memperpanjang usia dari mahluk bersel satu.
Para peneliti itu juga menekankan, seperti yang dirilis dalam Jurnal Cell Metabolism, bahwa
eksperimen menggunakan tikus itu tidak saja berhubungan dengan memperpanjang usia tetapi
juga meningkatkan kesehatan.
Para ilmuwan itu percaya bahwa campuran asam amino bisa membantu orang-orang lanjut usia
dan penderita sakit, khususnya yang menderita penyakit hati dan paru-paru akut serta mereka
yang menderita penyakit yang ditandai oleh berkurangnya energi.
Leusin, Isoleusin, dan valin merupakan bagian dari asam amino yang tampaknya mempunyai
bahan anti-penuaan.
Tikus yang diberikan tiga campuran asam amino itu terbukti memproduksi lebih banyak
mitokondria, bagian sel yang berfungsi menghasilkan energi, terutama di organ hati dan otot
rangka.
Menurut para peneliti, mengkonsumsi asam amino cenderung lebih efisien dari pada
mengkonsumsi protein yang mengandung asam amino yang sama. Berbeda dari protein, asam
amino tidak perlu dicerna dan bisa langsung masuk ke dalam aliran darah. Asam amino itu tidak
menghabiskan energi, pungkas Dr Nisoli.
DNA mitokondria, Berbeda dengan organel sel lainnya, mitokondria memiliki materi genetik
sendiri yang karakteristiknya berbeda dengan materi genetik di inti sel. Mitokondria, sesuai
dengan namanya, merupakan rantai DNA yang terletak di bagian sel yang bernama mitokondria.
DNA mitokondria memiliki ciri-ciri yang berbeda dari DNA nukleus ditinjau dari ukuran, jumlah
gen, dan bentuk. Di antaranya adalah memiliki laju mutasi yang lebih tinggi, yaitu sekitar 10-17
kali DNA inti [Wallace et al., 1997]. Selain itu DNA mitokondria terdapat dalam jumlah banyak
(lebih dari 1000 kopi) dalam tiap sel, sedangkan DNA inti hanya berjumlah dua kopi. DNA inti
merupakan hasil rekombinasi DNA kedua orang tua sementara DNA mitokondria hanya
diwariskan dari ibu (maternally inherited) [Browning, et al., 1979, Giles et al.,1980].
Besar genom pada DNA mitokondria relatif kecil apabila dibandingkan dengan genom DNA
pada nukleus. Ukuran genom DNA mitokondria pada tiap tiap organisme sangatlah bervariasi.
Pada manusia ukuran DNA mitokondria adalah 16,6 kb, sedangkan pada Drosophila
melanogaster kurang lebih 18,4 kb. Pada khamir, ukuran genom relatif lebih besar yaitu 84 kb.
Tidak seperti DNA nukleus yang berbentuk linear, mtDNa berbentuk lingkaran. Sebagian besar
mtDNA membawa gene yang berfungsi dalam proses respirasi sel. Eksperimen yang dilakukan
dengan menghilangkan mtDNA pada S. cerevisceae menunjukan penurunan tingkat pertumbuhan
yang signifikan yang ditandai dengan mengecilnya ukuran sel.
Struktur DNA Mitokondria
DNA mitokondria (mtDNA) berukuran 16.569 pasang basa dan terdapat dalam matriks
mitokondria, berbentuk sirkuler serta memiliki untai ganda yang terdiri dari untai heavy (H) dan
light (L). Dinamakan seperti ini karena untai H memiliki berat molekul yang lebih besar dari
untai L, disebabkan oleh banyaknya kandungan basa purin [Anderson et al., 1981].
MtDNA terdiri dari daerah pengode (coding region)dan daerah yang tidak mengode (non-coding
region). MtDNA mengandung 37 gen pengode untuk 2 rRNA, 22 tRNA, dan 13 polipeptida yang
merupakan subunit kompleks enzim yang terlibat dalam fosforilasi oksidatif, yaitu: subunit 1, 2,
3, 4, 4L, 5, dan 6 dari kompleks I, subunit b (sitokrom b) dari kompleks III, subunit I, II, dan III
dari kompleks IV (sitokrom oksidase) serta subunit 6 dan 8 dari kompleks V. Kebanyakan gen ini
ditranskripsi dari untai H, yaitu 2 rRNA,14 dari 22 tRNA dan 12 polipeptida. MtDNA tidak
memiliki intron dan semua gen pengode terletak berdampingan [Anderson et al., 1981, Wallace
et al., 1992, Zeviani et al., 1998]. Sedangkan protein lainnya yang juga berfungsi dalam
fosforilasi oksidatif seperti enzim-enzim metabolisme, DNA dan RNA polimerase, protein
ribosom dan mtDNA regulatory factors semuanya dikode oleh gen inti, disintesis dalam sitosol
dan kemudian diimpor ke organel [Wallace et al., 1997].
Daerah yang tidak mengode dari mtDNA berukuran 1122 pb, dimulai dari nukleotida 16024
hingga 576 dan terletak di antara gen tRNApro dan tRNAphe. Daerah ini mengandung daerah
yang memiliki variasi tinggi yang disebut displacement loop (D-loop). D-loop merupakan daerah
beruntai tiga (tripple stranded) untai ketiga lebih dikenal sebagai 7S DNA. D-loop memiliki dua
daerah dengan laju polymorphism yang tinggi sehingga urutannya sangat bervariasi antar
individu, yaitu Hypervariable I (HVSI) dan Hypervariable II (HVSII). Daerah non-coding juga
mengandung daerah pengontrol karena mempunyai origin of replication untuk untai H (OH) dan
promoter transkripsi untuk untai H dan L (PL dan PH) [Anderson et al., 1981]. Selain itu, daerah
non-coding juga mengandung tiga daerah lestari yang disebut dengan conserved sequence block
(CSB) I, II, III. Daerah yang lestari ini diduga memiliki peranan penting dalam replikasi mtDNA.
Daerah Hipervariabel DNA Mitokondria
Daerah kontrol memiliki tingkat mutasi dan polymorphism yang paling tinggi di dalam genom
DNA mitokondria. Pada daerah D-loop terdapat hipervariabel 1 (HV1) dan hipervariabel 2
(HV2). Hypervariable I (HVSI) pada urutan nukleotida 16024-16383 dan Hypervariable II
(HVSII) yang terletak pada nukleotida 57-372. Dua daerah ini memiliki laju mutasi yang lebih
tinggi dari daerah pengode [Howell et al., 1996]. Oleh karena sifatnya yang polimorfik, daerah
ini sangat beragam antar individu tetapi sama untuk kerabat yang satu garis keturunan ibu. Laju
mutasi sejauh ini diketahui 1:33 generasi, jadi perubahan urutan nukleotida hanya akan terjadi
setiap 33 generasi [Hall, 1998]. Oleh karena itu, daerah ini sering dianalisis dan sangat penting
untuk digunakan dalam proses identifikasi individu.
Sifat-sifat DNA Mitokondria
MtDNA diwariskan secara maternal [Browning, et al., 1979, Giles et al.,1980]. Sel telur
memiliki jumlah mitokondria yang lebih banyak dibandingkan sel sperma, yaitu sekitar 100.000
molekul sedangkan sel sperma hanya memiliki sekitar 100-1500 mtDNA [Chen, et al., 1995b,
Manfredi, et al., 1997]. Dalam sel sperma mitokondria banyak terkandung dalam bagian ekor
karena bagian ini yang sangat aktif bergerak sehingga membutuhkan banyak ATP.
Pada saat terjadi pembuahan sel telur, bagian ekor sperma dilepaskan sehingga hanya sedikit atau
hampir tidak ada mtDNA yang masuk ke dalam sel telur. Hal ini berarti bahwa sumbangan secara
paternal hanya berjumlah 100 mitokondria. Apalagi dalam proses pertumbuhan sel, jumlah
mtDNA secara paternal semakin berkurang. Maka jika dibandingkan dengan sumbangan secara
maternal yaitu 100.000, maka sumbangan secara paternal hanya 0,01%. Oleh karena itu dapat
dianggap tidak terjadi rekombinasi sehingga dapat dikatakan bahwa mtDNA bersifat haploid,
diturunkan dari ibu ke seluruh keturunannya [Cann et al., 1987, Giles et al., 1980, Wallace,
1997].
DNA mitokondria juga memiliki sifat unik lainnya yaitu laju mutasinya yang sangat tinggi
sekitar 10-17 kali DNA inti [Wallace et al., 1997]. Hal ini dikarenakan mtDNA tidak memiliki
mekanisme reparasi yang efisien [Bogenhagen, 1999], tidak memiliki protein histon, dan terletak
berdekatan dengan membran dalam mitokondria tempat berlangsungnya reaksi fosforilasi
oksidatif yang menghasilkan radikal oksigen sebagai produk samping [Richter, 1988]. Selain itu,
DNA polimerase yang dimiliki oleh mitokondria adalah DNA polimerase yang tidak
mempunyai aktivitas proofreading (suatu proses perbaikan dan pengakuratan dalam replikasi
DNA). Tidak adanya aktivitas ini menyebabkan mtDNA tidak memiliki sistem perbaikan yang
dapat menghilangkan kesalahan replikasi. Replikasi mtDNA yang tidak akurat ini akan
menyebabkan mutasi mudah terjadi.
Salah satu bentuk keunikan lainnya dari mitokondria adalah perbedaan kode genetik mitokondria
menunjukkan perbedaan dalam hal pengenalan kodon universal. UGA tidak dibaca sebagai
berhenti (stop) melainkan sebagai tryptofan, AGA dan AGG tidak dibaca sebagai arginin
melainkan sebagai berhenti, AUA dibaca sebagai methionin [Anderson et al., 1981].
Posted by Retno Kusumawardani at 6/02/2013 08:53:00 PM
Reactions:
Email ThisBlogThis!Share to TwitterShare to FacebookShare to Pinterest
Labels: Biologi
Post a Comment
Newer Post Older Post Home
Subscribe to: Post Comments (Atom)