Tugas1KimiaKomputasi

Buatlahjawabandengantulistangan
Pertanyaan
1. IsilahtabelberikutdenganmenggunakandatabasePubchemBetaatauChemspider.

Rumus
Rumus Struktur Nama Sistematik SMILES InChI CAS RN
Molekul
CC(=C)C=C

Amonium Asetat

C6H6O

105-53-3

2. Kunjungi database Pubchem (gunakan Pubchem Beta) dan carilah senyawa omeprazole dan
esomeprazole.Isitabeldibawahinidanjawablahpertanyaanberikut:
a. Apakahperbedaanstrukturantaraomeprazoledanesomeprazole?
b. ApakahomeprazoledanesomeprazolememilikinotasiInChIdanInChIKeysyangsamasatu
samalain?
c. Apakah omeprazole dan esomeprazole memiliki notasi canonical SMILES yang sama?
Jelaskanmengapa.

Omeprazole (dari PubChem)

CID
IUPAC name
Canonical SMILES
Isomeric SMILES
InChI
InChIKey
Esomeprazole (dari PubChem)
CID
IUPAC name
Canonical SMILES
Isomeric SMILES
InChI
InChIKey
3. Kunjungi ChemSpider dan carilah senyawa omeprazole dan esomeprazole. Isi tabel di bawah ini
danjawablahpertanyaanberikut:
(1) ApakahnamasistematikdariChemSpidersamadengannamasistematikdariPubChem?
(2) ApakahnotasicanonicalSMILESdariChemSpidersamadengannotasidariPubChem?
(3) ApakahnotasiInChIdanInChIKeysdariChemSpidersamadengannotasidariPubChem?

Omeprazole (dari ChemSpider)

ChemSpider ID
IUPAC name
Canonical SMILES
Isomeric SMILES
InChI
InChIKey
Esomeprazole (dari ChemSpider)
ChemSpider ID
IUPAC name
Canonical SMILES
Isomeric SMILES
InChI
InChIKey

4. BandingkannotasiSMILESdariPubChemdandariChemSpideruntuksenyawaberikut.Jelaskan
bagaimanakeduadatabaseinimenanganimasalaharomatisitasdarimolekul.Jelaskankelebihan
ataukekurangandarimasingmasingpendekatandatabase.

SMILES from PubChem SMILES from ChemSpider

Benzene
pyridine
Pyrrole
Furan
Thiophene
Selenophene
Tellurophene

5. Representasisuatusenyawakimiajugasecaradigitaldapatdiwakiliolehdatatabelkoneksi(CT).
SalahsatustandarCTadalahMdlMol.KunjungiChemSpiderdandownloadMdlMolFiledari
senyawaasamaminoLProline(bukadengannotepad).
(a) TuliskanCTdariLProlinedanjelaskanblokblokyangtersedia
(b) AdakahblokstandarMolfilesyangtidakterisi?Tetapiapakahinformasinyamasihdapat
ditemukandalamfileChemSpider?