ARCHAEBACTERIA

Arkea atau archaea (bahasa Yunani: αρχαία— "yang tua", tunggal archaeon), juga disebut arkeobakteri,
merupakan satu domain organisme hidup yang utama. Meskipun filogeni yang tepat masih tidak dapat
dipastikan untuk kumpulan-kumpulan ini, Archaea, Eukaryota, dan Bacteria merupakan domain yang
termasuk sistem tiga domain. Sama dengan bakteria, arkea merupakan organisme yang tidak
memiliki nukleus, oleh sebab itu, arkea termasuk prokariota.

Arkea awalnya diklasifikasikan sebagai bakteri, dengan nama archaebacteria (di kingodm
Archaebacteria), tetapi klasifikasi ini sudah usang.[2] Sel arkea memiliki sifat unik yang memisahkan
mereka dari dua domain lain dari kehidupan, Bacteria dan Eukaryota. Arkea dibagi lagi menjadi
empat filum yang diakui. Klasifikasi sulit karena mayoritas belum diteliti di laboratorium dan hanya
terdeteksi oleh analisis asam nukleat mereka dalam sampel dari lingkungan mereka.

Arkea dan bakteri umumnya serupa dalam ukuran dan bentuk, meskipun beberapa arkea memiliki bentuk
yang sangat aneh, seperti sel-sel datar dan berbentuk persegi dari Haloquadratum walsbyi.[3] Meskipun
kesamaan visual mereka dengan bakteri, arkaea memiliki gen dan beberapa jalur metabolisme yang lebih
menyerupai dengan yang dimiliki eukariota, terutama enzim yang terlibat dalam transkripsi dan translasi.
Aspek lain dari biokimia archaea yang unik, seperti ketergantungan mereka pada lipid eter dimembran
sel mereka. Archaea menggunakan sumber energi lebih dari eukariota: ini berkisar dari senyawa organik,
seperti gula,amonia, ion logam atau bahkan gas hidrogen. Archaea toleran-garam (Haloarchaea)
menggunakan sinar matahari sebagai sumber energi, dan spesies lain dari archaea memfiksasi karbon;
namun, tidak seperti tanaman dan cyanobacteria, tidak ada archaea yang melakukan semuanya.
Archaea bereproduksi secara aseksual dengan pembelahan biner, fragmentasi, atau tunas; tidak seperti
bakteri dan eukariota, tidak ada spesies yang dikenal membentuk spora.

Archaea awalnya dipandang sebagai ekstremofil yang tinggal di lingkungan yang keras, seperti mata air
panas dan danau garam, tetapi mereka telah ditemukan di berbagai habitat, termasuk tanah,
lautan, rawa dan usus besar manusia, rongga mulut, dan kulit.[4]Archaea sangat banyak di lautan, dan
archaea di plankton mungkin salah satu kelompok organisme yang paling banyak di planet ini. Archaea
adalah bagian utama dari kehidupan bumi dan mungkin memainkan peran dalam siklus karbon dan siklus
nitrogen. Tidak ada contoh yang jelas dari patogen archaea atau parasit yang dikenal, tetapi mereka sering
mutualis atau komensal. Salah satu contoh adalah metanogen yang mendiami saluran pencernaan manusia
dan ruminansia, di mana jumlah mereka yang besar membantu pencernaan. Metanogen digunakan dalam
produksi biogas dan pengolahan limbah, dan enzim dari archaea ekstremofil yang dapat bertahan suhu
tinggi dan pelarut organik dimanfaatkan dalam bioteknologi.

KLASIFIKASI
 Domain baru
Untuk sebagian besar abad ke-20, prokariota dianggap sebagai satu kelompok organisme dan
diklasifikasikan berdasarkan biokimia mereka, morfologi dan metabolisme. Misalnya, mikrobiologi
mencoba mengklasifikasikan mikroorganisme berdasarkan struktur dinding sel mereka, bentuk mereka,
dan zat-zat yang mereka konsumsi.[5] Pada tahun 1965, Linus Pauling dan Emile
Zuckerland[6] mengusulkan untuk menggunakan urutan gen dalam berbagai prokariota untuk mengetahui
bagaimana mereka berhubungan satu sama lain. Pendekatan ini, yang dikenal sebagai filogenetik, adalah
metode utama yang digunakan saat ini.

Archaea pertama kali ditemukan di lingkungan yang ekstrim, seperti mata air panas gunung berapi.
Digambarkan di sini adalah Grand Prismatic Spring dari Taman Nasional Yellowstone.
Archaea pertama kali diklasifikasikan sebagai kelompok yang terpisah dari prokariota pada tahun 1977
oleh Carl Woese dan George E. Fox di pohon filogenetik berdasarkan urutan dari gen RNA
ribosom (rRNA). Kedua kelompok awalnya bernama Archaebacteria dan Eubacteria dan diperlakukan
sebagai kerajaan atau upakerajaan, yang oleh Woese dan Fox disebut Urkingdoms. Woese berpendapat
bahwa kelompok ini adalah semacam prokariota yang secara fundamental berbeda dari kehidupan yang
lain. Untuk menekankan perbedaan ini, Woese kemudian mengusulkan sistem alami baru organisme
dengan tiga Domain terpisah: Eukarya,Bacteria dan Archaea, dalam apa yang sekarang dikenal sebagai
"Revolusi Woesian".

Kata archaea berasal dari Bahasa Yunani Kuno ἀρχαῖα, yang berarti "hal-hal kuno", karena wakil pertama
dari domain Archaea adalah metanogen dan diasumsikan bahwa metabolisme mereka mencerminkan
suasana primitif bumi dan organisme kuno. Untuk waktu yang lama, archaea terlihat sebagai ekstremofil
yang hanya ada di habitat ekstrim seperti mata air panas dan danau garam. Namun, sebagai habitat baru
dipelajari, organisme yang lebih ditemukan. Halofilik ekstrim dan hipertermofilik mikroba juga termasuk
dalam Archaea. Pada akhir abad ke-20, archaea telah diidentifikasi dalam lingkungan non-ekstrim juga.
Hari ini, mereka dikenal sebagai kelompok besar dan beragam organisme yang tersebar luas di alam dan
yang umum di semua habitat.[ Apresiasi baru tentang pentingnya dan keberadaan archaea berasal dari
penggunaan reaksi berantai polimerase (PCR) untuk mendeteksi prokariota dari sampel lingkungan
(seperti air atau tanah) dengan melipatgandakan gen ribosom mereka. Hal ini memungkinkan deteksi dan
identifikasi organisme yang belum dibudidayakan di laboratorium.

 Klasifikasi saat ini

Klasifikasi archaea, dan prokariota pada umumnya, adalah bidang yang bergerak cepat dan
diperdebatkan. Sistem klasifikasi saat ini bertujuan untuk mengatur archaea ke dalam kelompok
organisme yang berbagi fitur struktural dan nenek moyang yang sama.Klasifikasi ini sangat bergantung
pada penggunaan urutan gen RNA ribosom untuk mengungkapkan hubungan antara organisme
(filogenetik molekuler). Sebagian besar spesies yang dapat dikultur dan diteliti dengan baik dari archaea
adalah anggota dari dua filum utama, Euryarchaeota dan Crenarchaeota. Kelompok-kelompok lain telah
dibuat secara tentatif. Misalnya, spesies aneh Nanoarchaeum equitans, yang ditemukan pada tahun 2003,
telah diberikan filum sendiri, Nanoarchaeota. Sebuah filum baru Korarchaeota juga telah diusulkan. Ini
berisi sekelompok kecil spesies termofilik biasa yang berbagi fitur dari kedua filum utama, tetapi yang
paling erat terkait dengan crenarchaeota. Spesies baru terdeteksi lain dari archaea hanya jauh terkait
dengan salah satu kelompok ini, seperti Archaeal Richmond Mine acidophilic nanoorganisms (ARMAN),
yang ditemukan pada tahun 2006,dan beberapa organisme terkecil.

Sebuah superfilum - TACK - telah diusulkan yang mencakup Thaumarchaeota, Aigarchaeota,

Crenarchaeota, dan Korarchaeota. Superfilum ini mungkin terkait dengan asal-usul eukariota.

 Spesies
Klasifikasi archaea menjadi spesies juga kontroversial. Biologi mendefinisikan spesies sebagai kelompok
organisme terkait. Kriteria pembiakan eksklusif yang familiar (organisme yang dapat berkembang biak
dengan satu sama lain tetapi tidak dengan yang lain) tidak membantu di sini karena archaea bereproduksi
secara aseksual.

Archaea menunjukkan transfer gen horizontal yang tinggi antara garis keturunan. Beberapa peneliti
menyarankan bahwa individu dapat dikelompokkan menjadi populasi seperti-spesies dengan genom yang
sangat mirip dan jarang mentransfer gen ke/dari sel dengan genom kurang terkait, seperti dalam
genus Ferroplasma Di sisi lain, studi di Halorubrum ditemukan transfer genetik signifikan ke/dari
populasi yang kurang terkait, membatasi penerapan kriteria ini. Kekhawatiran kedua adalah sejauh mana
spesies seperti sebutan memiliki arti praktis.
Pengetahuan terkini tentang keragaman genetik adalah fragmentaris dan jumlah spesies archaea tidak
dapat diperkirakan dengan akurat. Perkiraan jumlah filum berkisar antara 18-23, yang hanya 8 memiliki
perwakilan yang telah dibudidayakan dan dipelajari secara langsung. Banyak dari kelompok-kelompok
hipotesis dikenal dari urutan rRNA tunggal, menunjukkan bahwa perbedaan di antara organisme ini tetap
tidak jelas. Bakteri juga mengandung banyak mikroba yang belum dikultur dengan implikasi yang sama
untuk karakterisasi.
 Asal-usul dan evolusi
Pohon filogenetik yang menunjukkan hubungan antara Archaea dan domain lain dari
kehidupan. Eukariota yang berwarna merah, archaea hijau dan bakteri biru. Diadaptasi dari Ciccarelli et
al. (2006)

Bukti ilmiah menunjukkan bahwa kehidupan dimulai di Bumi setidaknya 3,5 miliar tahun yang
lalu. Bukti-bukti awal untuk kehidupan di Bumi adalah grafit ditemukan biogenik di batuan
metasedimentary 3,7 miliar tahun ditemukan di Greenland Barat dan fosil tikar mikroba yang ditemukan
di batu pasir setua 3,48 miliar tahun ditemukan di Australia Barat.

Meskipun fosil sel prokariotik kemungkinan setua hampir 3,5 miliar tahun yang lalu, sebagian besar
prokariota tidak memiliki morfologi dan bentuk fosil khas tidak dapat digunakan untuk mengidentifikasi
mereka sebagai archaea. Sebaliknya, fosil kimia lipid yang unik lebih informatif karena senyawa tersebut
tidak ada pada organisme lain. Beberapa publikasi menyatakan bahwa sisa-sisa lipid archaea atau
eukariota yang hadir dalam serpih berasal dari 2,7 miliar tahun yang lalu, data tersebut dipertanyakan.
Lipid tersebut juga telah terdeteksi di batuan yang bahkan lebih tua dari Greenland barat. Jejak tertua
berasal dari distrik Isua, termasuk sedimen tertua yang dikenal di bumi, terbentuk 3,8 miliar tahun yang
lalu. Silsilah archaea mungkin yang paling kuno yang ada di Bumi.

Woese berpendapat bahwa bakteri, archaea, dan eukariota merupakan baris yang terpisah dari keturunan
yang menyimpang awal dari koloni leluhur organisme. Salah satu kemungkinan adalah bahwa ini terjadi
sebelum evolusi sel, saat tidak adanya membran sel memperbolehkan transfer gen lateral yang tak
terbatas, dan bahwa nenek moyang dari tiga domain muncul dengan fiksasi subset spesifik gen. Ada
kemungkinan bahwa nenek moyang terakhir dari bakteri dan archaea adalahtermofil, yang meningkatkan
kemungkinan bahwa suhu yang lebih rendah adalah "lingkungan yang ekstrim" dalam hal archaea, dan
organisme yang hidup di lingkungan dingin muncul hanya setelah itu. Karena Archaea dan Bacteria tidak
lebih terkait satu sama lain daripada mereka dengan eukariota, arti yang selamat dari
istilah prokariota adalah "bukan eukariota", membatasi nilai.

 Perbandingan dengan domain lain

Tabel berikut membandingkan beberapa karakteristik utama dari tiga domain, untuk menggambarkan
persamaan dan perbedaan mereka. Banyak dari karakteristik ini juga dibahas di bawah.

Properti Archaea Bacteria Eukarya

Lipid dengan ikatan
Lipid dengan ikatan eter, Lipid dengan
Membran sel ester, struktur
pseudopeptidoglikan ikatan ester, peptidoglikan
bermacam-macam
Kromosom melingkar, translasi Kromosom melingkar, translasi Kromosom linear
Struktur gen
dan transkripsi hampir sama and transkripsi unik yang jumlahnya
 dengan Eukarya lebih dari satu,
translasi dan
transkripsi hampir
sama dengan
Archaea
Organel dibatasi
Struktur Tidak ada organel dibatasi Tidak ada organel dibatasi
membran dan
internal sel membran atau nukleus membran atau nukleus
nukleus
Bermacam-macam, termasuk
Bermacam-macam,
fotosintesis, respirasi aerobik dan Fotosintesis dan
Metabolisme denganmetanogenesis unik
anaerobik, fermentasi, dan respirasi selular
untuk Archaea
autotrofi

Reproduksi aseksual, transfer Reproduksi aseksual, transfer Reproduksi seksual

Reproduksi
gen horizontal gen horizontal dan aseksual

Archaea dipisahkan sebagai domain ketiga karena perbedaan besar dalam struktur RNA ribosom mereka.
Molekul RNA yang telah disekuensing, yang dikenal sebagai 16s rRNA, hadir di semua organisme dan
selalu memiliki fungsi penting yang sama, produksi protein. Karena fungsi ini jadi pusat kehidupan,
organisme dengan mutasi dari 16s rRNA yang tidak mungkin untuk bertahan hidup, menyebabkan
stabilitas besar dalam struktur nukleotida ini selama beberapa generasi. 16s rRNA juga cukup besar untuk
menyimpan informasi organisme tertentu, tetapi cukup kecil untuk diurutkan dalam jumlah dikelola
waktu. Pada tahun 1977, Carl Woese, seorang ahli mikrobiologi mempelajari urutan genetik organisme,
mengembangkan metode sequencing baru yang melibatkan membelah RNA menjadi fragmen yang bisa
diurutkan dan dibandingkan dengan fragmen lain dari organisme lain. Semakin mirip pola antara spesies-
spesies, organisme-organismenya adalah lebih dekat.

Woese menggunakan metode perbandingan RNA barunya untuk mengkategorikan dan kontras organisme
yang berbeda. Dia mensekuensing berbagai spesies yang berbeda dan terjadi pada kelompok metanogen
yang memiliki pola yang sangat berbeda daripada prokariota atau eukariota yang dikenal. Metanogen ini
jauh lebih mirip satu sama lain daripada mereka dengan organisme lain yang disekuensing, yang
mengarah Woese untuk mengusulkan domain baru Archaea. Salah satu hasil yang menarik dari
eksperimen adalah bahwa Archaea lebih mirip dengan eukariota daripada prokariota, meskipun mereka
lebih mirip dengan prokariota dalam struktur. Hal ini menyebabkan kesimpulan bahwa Archaea dan
Eukarya berbagi nenek moyang yang sama lebih baru daripada Eukarya dan Bacteria pada
umumnya. Perkembangan inti terjadi setelah perpecahan antara Bakteri dan nenek moyang yang sama
ini. Meskipun Archaea prokariotik, mereka lebih erat terkait dengan Eukarya dan dengan demikian tidak
dapat ditempatkan dalam salah satu domain, Bacteria atau Eukarya.

Salah satu properti yang unik untuk Archaea adalah penggunaan berlimpah lipid dengan ikatan eter di
membran sel mereka. Ikatan eter lebih stabil secara kimiawi dari ikatan ester ditemukan dalam bakteri dan
Eukarya, yang mungkin menjadi faktor yang berkontribusi terhadap kemampuan banyak Archaea untuk
bertahan di lingkungan ekstrem yang menempatkan stres berat pada membran sel, seperti panas ekstrim
dan salinitas. Fitur lain yang unik dari Archaea adalah bahwa tidak ada organisme lain yang dikenal
mampu melakukan metanogenesis (produksi metabolis metana). Archaea metanogen memainkan peran
penting dalam ekosistem dengan organisme yang memperoleh energi dari oksidasi metana, kebanyakan
dari mereka bakteri, karena mereka sering menjadi sumber utama metana di lingkungan tersebut dan
dapat berperan sebagai produsen primer.Metanogen juga memainkan peran penting dalam siklus karbon,
memecah karbon organik menjadi metana, yang juga merupakan gas rumah kaca utama.

 Hubungan dengan prokariota lainnya

Hubungan antara tiga domain adalah sangat penting untuk memahami asal usul kehidupan. Sebagian
besar jalur metabolik, yang mencakup sebagian besar gen suatu organisme, yang umum antara Archaea
dan Bakteri, sementara sebagian besar gen yang terlibat dalam ekspresi genom yang umum antara
Archaea dan Eukarya. Di prokariota, struktur sel archaea yang paling mirip dengan bakteri gram positif,
terutama karena keduanya memiliki lipid bilayer tunggal dan biasanya mengandung sakulus tebal dari
berbagai komposisi kimia. Dalam beberapa pohon filogenetik berdasarkan urutan gen/protein yang
berbeda dari homolognya prokariotik, yang homolog archaea yang lebih erat terkait dengan homolog dari
bakteri gram positif. Archaea dan bakteri gram positif juga berbagi indels dilestarikan dalam sejumlah
protein penting, seperti Hsp70 dan glutamin sintetase namun, filogeni dari gen ini ditafsirkan untuk
mengungkapkan transfer gen interdomain, dan mungkin tidak mencerminkan hubungan organisme.
Telah diusulkan bahwa archaea berevolusi dari bakteri gram positif dalam menanggapi tekanan seleksi
antibiotik. Ini disarankan oleh pengamatan bahwa archaea tahan terhadap berbagai antibiotik yang
terutama dihasilkan oleh bakteri gram positif, dan bahwa antibiotik terutama bekerja pada gen yang
membedakan archaea dari bakteri. Proposal adalah bahwa tekanan selektif terhadap resistensi yang
dihasilkan oleh antibiotik gram positif akhirnya cukup untuk menyebabkan perubahan yang luas dalam
banyak gen target antibiotik, dan bahwa strain ini mewakili nenek moyang masa kini Archaea. Evolusi
Archaea dalam menanggapi pemilihan antibiotik, atau tekanan selektif kompetitif lain, juga bisa
menjelaskan adaptasi mereka untuk lingkungan yang ekstrim (seperti suhu tinggi atau keasaman) sebagai
hasil dari pencarian ceruk kosong untuk melarikan diri dari organisme yang memproduksi
antibiotik; Cavalier-Smith telah membuat usulan yang sama. Usulan ini juga didukung oleh kerja lainnya
menyelidiki hubungan protein struktural dan studi yang menunjukkan bahwa bakteri gram positif
mungkin merupakan awal garis keturunan bercabang dalam prokariota.

 Hubungan dengan eukariota

Hubungan evolusi antara archaea dan eukariota masih belum jelas. Selain dari kesamaan dalam struktur
sel dan fungsi yang dibahas di bawah, banyak pohon genetik mengelompokkan keduanya.

Faktor rumit termasuk klaim bahwa hubungan antara eukariota dan filum archaea Crenarchaeota lebih
dekat daripada hubungan antara Euryarchaeota dan filum Crenarchaeota dan adanya gen seperti-archaea
pada bakteri tertentu, seperti Thermotoga maritima, dari transfer gen horizontal. Hipotesis standar
menyatakan bahwa nenek moyang eukariota menyimpang awal dari Archaea,[65][66] dan bahwa eukariota
muncul melalui fusi dari archaea dan eubacterium, yang menjadi inti dan sitoplasma; ini menjelaskan
berbagai kesamaan genetik tapi berjalan ke dalam kesulitan menjelaskan struktur sel. Sebuah hipotesis
alternatif, hipotesis eocyte, berpendapat bahwa Eukaryota muncul relatif terlambat dari Archaea.

Sebuah garis keturunan baru ditemukan dari archaea, Lokiarchaeum, dinamakan untuk ventilasi
hidrotermal yang disebut Kastil Loki di Samudra Arktik, telah ditemukan paling erat kaitannya dengan
eukariota. Ini telah disebut organisme peralihan antara prokariota dan eukariota.
Morfologi

Berbagai archaea individu dari 0,1 mikrometer (μm) sampai lebih dari 15 μm dengan diameter, dan terjadi
dalam berbagai bentuk, umumnya sebagai bola, batang, spiral atau piring.[71] Morfologi lain
di Crenarchaeota termasuk sel berlobus yang bentuknya tidak teratur di Sulfolobus, filamen seperti-jarum
yang kurang dari setengah mikrometer diameter di Thermofilum, dan batang hampir sempurna persegi
panjang di Thermoproteus dan Pyrobaculum. Haloquadratum walsbyi adalah archaea persegi yang datar,
yang hidup di kolam hypersaline. Bentuk yang tidak biasa ini mungkin dipertahankan baik oleh dinding
sel mereka dan sitoskeleton prokariotik. Protein yang terkait dengan komponen sitoskeleton organisme
lain ada di archaea, dan filamen terbentuk dalam sel mereka, tetapi berbeda dengan organisme lain,
struktur selular ini kurang dipahami. Dalam Thermoplasma dan Ferroplasma ketiadaan dinding sel berarti
bahwa sel memiliki bentuk yang tidak teratur, dan dapat menyerupai amuba.

Beberapa spesies membentuk agregat atau filamen sel hingga panjang 200 μm. Organisme ini bisa
menonjol dalam biofilm. Khususnya, agregat sel Thermococcuscoalescens menyatu bersama dalam
kultur, membentuk sel-sel raksasa tunggal. Archaea di genus Pyrodictium menghasilkan koloni multisel
rumit yang melibatkan jajaran panjang, tabung berongga tipis yang disebut kanula yang menonjol dari
permukaan sel dan menghubungkan mereka ke dalam aglomerasi padat seperti-semak. Fungsi dari kanula
ini tidak diselesaikan, tapi mereka dapat memungkinkan komunikasi atau pertukaran nutrisi dengan
tetangga. Koloni multi-spesies yang ada, seperti komunitas "string-of-pearls" yang ditemukan pada tahun
2001 di sebuah rawa Jerman. Koloni putaran keputihan dari novel spesies Euryarchaeota spasi sepanjang
filamen tipis yang dapat berkisar hingga 15 sentimeter (5,9 in) panjang; filamen ini terbuat dari spesies
bakteri tertentu.

 Struktur, perkembangan komposisi, operasi

Archaea dan bakteri memiliki struktur sel umumnya sama, tetapi komposisi sel dan organisasi mengatur
archaea terpisah. Seperti bakteri, archaea kekurangan membran interior dan organel. Seperti
bakteri, membran sel archaea biasanya dibatasi oleh dinding sel dan mereka berenang menggunakan satu
atau lebih flagela. Secara struktural, archaea paling mirip dengan bakteri gram-positif. Kebanyakan
memiliki membran plasma dan dinding sel tunggal, dan tidak ada ruang periplasmik; pengecualian untuk
aturan umum ini adalah Ignicoccus, yang memiliki sebuah periplasma sangat besar yang
berisi vesikel membran-terikat dan tertutup oleh membran luar.

Ekstremofil
Arkea ekstremofil adalah golongan arkea yang tahan terhadap kondisi lingkungan yang ekstrim
seperti suhu, ketersediaan air, pH, dan tekanan ekstrim. Pemahaman mengenai kondisi hidup yang
ekstrim ini berguna untuk mencari metode untuk mengontrol aktivitas mikroorganisme ini.

Termoasidofil
Berdasarkan sifatnya terhadap suhu, arkea terbagi menjadi psikrofilik, mesofilik, termofilik, dan
hipertermofilik. Arkea psikrofilik dapat hidup optimal pada suhu 15 °C dan dapat bertahan pada suhu
dibawah 0 °C, contoh arkea jenis ini adalah Polaromonas vacuolata. Arkea mesofilik dapat hidup pada
kisaran suhu 15-45 °C. Sebagian besar arkea tumbuh baik pada suhu ini. Habitatnya pada hewan berdarah
panas, lingkungan terestrial, dan akuatik. Arkea termofilik hidup pada kisaran suhu 40-70 °C, contoh
arkea jenis ini adalah Thermus thermophilus, Thermoanaerobacter ethanolicus, dan Bacillus
thermoproteolyticus. Arkrea hipertemofilik merupakan yang arkea yang paling tahan panas karena dapat
hidup pada suhu lebih dari 65 °C, contohnya adalah Thermococcus celler dan Pyrolobus fumarii.
Untuk dapat hidup pada suhu yang ekstrim, arkea perlu melakukan adaptasi. Arkea psikrofilik melakukan
adaptasi dengan cara memproduksi enzim yang berfungsi optimal pada suhu rendah dan terdenaturasi
pada suhu sedang. Pada struktur proteinnya, arkea ini memiliki lebih banyak ikatan alfa heliks yang lebih
fleksibel daripada beta sheet yang lebih rigid. Selain itu arkea ini memiliki lebih banyak asam amino
polar dibandingkan hidrofobik sehingga lebih fleksibel. Membran sel arkea psikrofilik memiliki
kandungan asam lemak tak jenuh yang lebih banyak sehingga transport dapat terjadi lebih leluasa.
Sedangkan arkea yang hidup pada suhu tinggi melakukan adaptasi dengan cara mengeluarkan beberapa
solut untuk membantu stabilisasi protein pada suhu tinggi. Arkea ini memiliki membran yang kaya akan
asam lemak jenuh sehingga tetap stabil pada suhu tinggi.