Nama : ARLIN NUSI

Nim : 431418065

Kelas : B /pendidikan Biologi

Jawaban UTS

1. Jelaskan bagaimana pendekatan molekuler dapat mengungkap perkembangan

evolusi makhluk hidup?
Jawaban:
Pengkajian teori evolusi pada masa modern ini dilihat dari beberapa pendekatan antara
lain melalui pendekatan genetika populasi, evolusi ekologi, evolusi molekuler, sistematik,
dan paleontology (Stearn & Hoekstra, 2003). Dengan demikian dapat disimpulkan bahwa
untuk mengkaji proses evolusi biologi dapat dilakukan melalui berbagai pendekatan,
sehingga masalah evolusi dapat dikaji secara lebih komprehensif dan proporsional.
Pendekatan evolusi molekuler (molecular evolution) sebagai salah satu pendekatan yang
digunakan dalam mengkaji evolusi biologi pada saat ini (masa evolusi modern) sangat
banyak digunakan (Waluyo, 2005). Pendekatan molekuler ini mengkaji dan memandang
evolusi dari sejarah rekaman urutan DNA dan protein (Stearn & Hoekstra, 2003).
Seperti diketahui bahwa pengkajian evolusi pada masa evolusi modern saat ini dilihat
dari berbagai aspek dan pendekatan sesuai dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan
teknologi itu sendiri. Pada masa sekarang ini masalah evolusi dikaji dari pendekatan
genetika populasi, evolusi ekologi, sistematik, evolusi molekuler dan paleontologi (Stearn
& Hoekstra, 2003). Berbagai pendekatan dalam mengkaji masalah evolusi ini
diprediksikan akan terus berkembang sesuai dengan dinamika perkembangan ilmu.
Dewasa ini pendekatan dari aspek evolusi molekuler banyak dilakukan untuk mengkaji
evolusi biologi. Seperti dinyatakan Waluyo (2005) bahwa pada masa lalu, para ahli
bekerja dengan data morfologi, anatomi, dan penurunan genetika, maka masa sekarang
para ahli beranjak pada pendekatan molekuler, fisiologi, model matematika, dan lain
sebagainya.
Evolusi molekuler (molecular evolution) pada dasarnya menjelaskan dinamika daripada
perubahan evolusi pada tingkat molekuler, disamping itu untuk mendukung pemahaman
tentang proses evolusi dan efek-efek berbagai macam mekanisme molekuler, termasuk di
dalamnya adalah evolusi genom, gen-gen, dan produk- produknya (Graur & Hsiung Li,
2000). Lebih lanjut dikatakan bahwa studi tentang evolusi molekuler berakar pada dua
disiplin ilmu yang berbeda yaitu “genetika populasi “ dan “ biologi molekuler “. Genetika
populasi melengkapi tentang dasar teori untuk proses-proses evolusi, sementara biologi
molekuler melengkapi tentang data empirik. Jadi untuk memahami evolusi molekuler
 tersebut sangat diperlukan pengetahuan dasar keduanya yaitu genetika populasi dan
biologi molekuler praktis.
Selanjutnya lingkup pembahasan evolusi molekuler seperti yang disampaikan Graur &
Hsiung Li (2000) sebagai berikut.
“ Molecular evolution encompasses two areas of study: the evolution of macromolecules,
and the reconstruction of the evolutionary history of genes and organism. By the
evolution of macromolecules we refer to the characterization of the changes in the
genetic material (DNA or RNA sequences) and its products (proteins or RNA molecules)
during evolutionary time, and to the rates and patterns with which such changes occur.
This area of study also attempts to unravel the mechanisms responsible for such changes.
The second area, also known as molecular phylogenetics deals with the evolutionary
history of organism and macromolecules as inferred from molecular data and
methodology of tree reconstruction “
Berdasarkan kutipan di atas kita dapat mengetahui bahwa pembahasan, lingkup, atau area
evolusi molekuler meliputi dua area yaitu: (1) evolusi makromolekul, dan (2)
rekonstruksi sejarah evolusi gen dan organisme. Area evolusi makromolekul
menunjukkan karakteristik perubahan dalam materi genetik (urutan DNA atau RNA) dan
produk-produknya (protein atau molekul RNA) serta terhadap rata-rata dan pola
perubahan yang tampak. Sedangkan area kedua filogeni molekuler menjelaskan sejarah
evolusi organisme dan makromolekul seperti adanya keterlibatan data-data molekuler dan
metodologi pohon rekonstruksi.
Senada dengan pendapat di atas Stearn dan Hoekstra (2003) secara lebih sederhana
menyatakan bahwa evolusi molekuler mengkaji dan memandang evolusi dari rekaman
sejarah dalam urutan DNA dan protein. Berdasarkan beberapa rujukan dan pendapat ahli
di atas dapat disimpulkan pengertian dan lingkup dari evolusi molekuler adalah suatu
pendekatan pengkajian masalah evolusi yang berpijak pada populasi genetika dan biologi
molekuler dengan area atau lingkup pengkajian pada perubahan materi genetik (urutan
DNA atau RNA) dan produknya (protein atau molekul RNA) serta rata-rata dan pola
perubahannya serta mengkaji pula sejarah evolusi organisme dan makromolekul yang
didukung data-data molekuler (filogeni molekuler)
2. Jelaskan perkembangan alam semesta dan bumi serta isinya berdasarkan
pendekatan molekuler?
Jawaban:
Bumi adalah planet tempat tinggal seluruh makhluk hidup beserta isinya.Sebagai tempat
tinggal makhluk hidup, bumi tersusun atas beberapa lapisan bumi, bahan-bahan material
pembentuk bumi, dan seluruh kekayaan alam yang terkandung di dalamnya.Bentuk
permukaan bumi berbeda-beda, mulai dari daratan, lautan, pegunungan, perbukitan,
danau, lembah, dan sebagainya. Bumi sebagai salah satu planet yang termasuk dalam
sistem tata surya di alam semesta ini tidak diam seperti apa yang kita perkirakan selama
ini, melainkan bumi melakukan perputaran pada porosnya (rotasi) dan bergerak
mengelilingi matahari (revolusi) sebagai pusat sistem tata surya. Hal inilah yang
 menyebabkan terjadinya siang malam dan pasang surut air laut. Oleh karena itu, proses
terbentuknya bumi tidak terlepas dari proses terbentuknya tata surya kita.
Teori “Big-bang” diperkirakan terjadi sekitar 20 milyar tahun yang lalu. Sekitar 15
milyar tahun kemudian, kumpulan debu dan gas luar angkasa menyatu dan berkondensasi
akibat gravitasi, menjadi gumpalan gas raksasa yang kita kenal sebagai matahari.
Matahari ini dikelilingi oleh beberapa bentukan yang lebih kecil dengan komposisi yang
bervariasi, yang dikenal sebagai planet. Jagad raya sebagian besar tersusun oleh gas
dengan berat molekular ringan, yaitu hidrogen dan helium, dimana unsur2 tersebut
merupakan penyusun utama suatu bintang. Unsur dengan berat molekul yang lebih berat
menyusun hanya sekitar 0,1 persen dari suatu planet.
Ketika bumi terbentuk, panas dilepaskan yang disebabkan oleh keruntuhan karena
gravitasi (collapse due to gravity) dan adanya elemen radioaktif pada kumpulan debu.
Selama ratusan miliar tahun pertama, bumi terlalu panas sehingga air tidak dapat
berbentuk cair dan hanya dalam bentuk uap. Setelah suhu bumi menurun, uap tersebut
mengalami kondensasi dan membentuk lautan dan danau. Kehidupan diperkirakan
berasal dari reaksi kimia yang terjadi pada atmosfer, diikuti dengan reaksi lanjut pada
lautan dan danau purba (hidrosphere).
3. Jelaskan alat pelacak evolusi molekuler yang dapat digunakan untuk mengungkap
hubungan kekerabatan antar makhluk hidup?
Jawaban:
Setiap organisme yang memiliki kecepatan yang berbeda dalam pembentukan protein
pembentukan yang hubungannya belum dapat diketahui. Sebaliknya, protein yang
terbentuk dengan sangat lambat akan menunjukkan sedikit bahkan tidak ada perbedaan
antara dua organism. Oleh karena itu, kita perlu menggunakan sequens yang berubah
secara perlahan untuk mengetahui hubungan evolusioner dan sequens yang terbentuk
dengan cepat pada organisme yang kekerabatannya dekat.
Manusia dan simpanse memiliki sekuens protein yang hampir sama. Bahkan jika kita
memeriksa pembentukan fibrinopeptida yang cepat, manusia dan simpanse bertemu pada
percabangan yang sama pada pohon evolusioner. Lalu bagaimana kita membedakan
manusia dari simpanse? Mutasi yang tidak mempengaruhi sekuens protein berlangsung
lebih cepat selama evolusi, karena mutasi tersebut tidak merusak, sehingga lebih baik jika
kita melihat sequens DNA daripada protein sequens dari organisme yang dekat hubungan
kekerabatannya tersebut, baru dapat terlihat banyak perbedaan.
4. Jelaskan bukti bahwa evolusi berjalan sangat bersesuaian dengan mutasi pada
rangkaian materi genetik.
Jawaban:
Peristiwa mutasi (secara molekuler) sangat erat kaitannya dengan perubahan evolusi
berbasis urutan nukleotida. Mutasi itu sendiri menurut Lehninger (1982) dapat diartikan
sebagai perubahan permanen yang akan bersifat menurun pada genom (gen- gen atau
urutan nukleotida) suatu organisme. Lebih lanjut dikatakan bahwa mutasi dapat
mempengaruhi sebuah nukleotida (point mutations) atau beberapa nukleotida yang saling
 berdekatan (segmental mutations). Mutasi gen disebut juga mutasi titik, yaitu perubahan
materi genetik pada gen akibat urutan basa nitrogen pada rantai DNA yang berubah.
Perubahan urutan basa nitrogen dapat menyebabkan perubahan urutan asam amino yang
juga berdampak pada perubahan genotip dan fenotip suatu individu.
Mutasi gen yang mengubah urutan basa nitrogen tetapi tidak menyebabkan perubahan
urutan asam amino disebut mutasi tak bermakna (nonsense mutation). Misalnya triplet
AGA pada DNA berubah menjadi AGG sehingga kodon yang seharusnya UCU menjadi
UCC. Namun, baik UCU atau UCC sama-sama mengkode asam amino serin sehingga
tidak terjadi perubahan asam amino.
5. Uraikan bagaimana asal usul perkembangan manusia yang saat ini memdiami bumi
berdasarkan temuan pelacakan secara molekuler?
Jawaban:
Senyawa kompleks yang mula-mula terbentuk diperkirakan senyawa seperti Alkohol
(H2H5OH), dan senyawa asam amino yang paling sederhana. Selama berjuta-juta tahun,
senyawa sederhana tersebut bereaksi membentuk senyawa yang lebih kompleks, Gliserin,
Asam organik, Purin dan Pirimidin. Senyawa kompleks tersebut merupakan bahan
pembentuk sel.
Menurut Oparin senyawa kompleks tersebut sangat berlimpah dilautan maupun di
permukaan daratan. Adanya energi yang berlimpah, misalnya sinar Ultraviolet, dalam
jangka waktu yang amat panjang memungkinkan lautan menjadi timbunan senyawa
organik yang merupakan sop purba atau Sop Primordial. Senyawa kompleks yang
tertimbun membentuk sop purba di lautan tersebut selanjutnya berkembang sehingga
memiliki kemampuan dan sifat sebagai berikut :
1). Memiliki sejenis membran yang mampu memisahkan ikatan-ikatan kompleks yang
terbentuk dengan molekul-molekul organik yang terdapat disekelilingnya;
2). Memiliki kemampuan untuk menyerap dan mengeluarkan molekul-molekul dari dan
ke sekelilingnya;
3). Memiliki kemampuan untuk memanfaatkan molekul-molekul yang diserap sesuai
dengan pola-pola ikatan didalamnya;
4). Mempunyai kemampuan untuk memisahkan bagian-bagian dari ikatan-ikatannya.
Kemampuan semacam ini oleh para ahli dianggap sebagai kemampuan untuk
berkembang biak yang pertama kali.Senyawa kompleks dengan sifat-sifat tersebut diduga
sebagai kehidupan yang pertamakali terbentuk. Jadi senyawa kompleks yang merupakan
perkembangan dari sop purba tersebut telah memiliki sifat-sifat hidup seperti nutrisi,
ekskresi, mampu mengadakan metabolisme, dan mempunayi kemampuan memperbanyak
diri atau reproduksi.