(2 Indris) Describe repair systems

Perbaikan DNA dapat dibagi menjadi satu set mekanisme yang mengidentifikasi dan
memperbaiki kerusakan pada molekul DNA. Ada dua kelas umum perbaikan DNA; pembalikan
langsung dari proses kimia yang menghasilkan kerusakan dan penggantian basa nukleotida
yang rusak.

DNA mengkodekan genom sel dan oleh karena itu merupakan salinan permanen dari struktur
yang diperlukan untuk berfungsinya sel dengan benar. Perubahan struktur DNA dapat
menyebabkan mutasi dan ketidakstabilan genom, yang mengarah ke kanker. Kerusakan DNA
disebabkan oleh penggabungan basa nukleotida yang salah selama replikasi DNA dan
perubahan kimia yang disebabkan oleh mutasi spontan atau paparan faktor lingkungan seperti
radiasi.

The Direct Reversal DNA Repair Mechanism

Mekanisme perbaikan DNA pembalikan langsung
Pembalikan langsung kerusakan DNA adalah mekanisme perbaikan yang tidak memerlukan
template dan diterapkan pada dua jenis kerusakan utama. Sinar UV menginduksi pembentukan
dimer pirimidin yang dapat mendistorsi struktur rantai DNA, menghalangi transkripsi di luar area
kerusakan.

Pembalikan langsung melalui fotoreaktivasi dapat membalikkan reaksi dimerisasi ini dengan
memanfaatkan energi cahaya untuk menghancurkan ikatan kovalen abnormal antara basa
pirimidin yang berdekatan. Jenis fotoreaktivasi ini tidak terjadi pada manusia.

Kerusakan yang disebabkan oleh agen alkilasi yang bereaksi dengan DNA juga dapat
diperbaiki melalui pembalikan langsung. Metilasi basa guanin menghasilkan perubahan struktur
DNA dengan membentuk produk yang melengkapi timin daripada sitosin. Protein metil guanin
metil transferase (MGMT) dapat mengembalikan guanin asli dengan mentransfer produk
metilasi ke situs aktifnya.

DNA Repair by Excision

Eksisi adalah mekanisme umum dimana perbaikan dilakukan ketika salah satu untai heliks
ganda rusak. Untai yang tidak rusak digunakan sebagai cetakan dengan DNA yang rusak pada
untai lain dihilangkan dan diganti dengan sintesis nukleotida baru. Ada tiga jenis perbaikan
eksisi:
1. Perbaikan eksisi dasar.
Perbaikan eksisi dasar melibatkan pengenalan dan pemindahan satu pangkalan yang
rusak. Mekanismenya membutuhkan keluarga enzim yang disebut glikosilase. Enzim
menghilangkan basa yang rusak membentuk situs AP yang diperbaiki oleh AP
endonuklease sebelum celah nukleotida dalam untai DNA diisi oleh DNA polimerase.
2. Perbaikan eksisi nukleotida.
Perbaikan eksisi nukleotida adalah mekanisme yang tersebar luas untuk memperbaiki
kerusakan DNA dan mengenali beberapa basa yang rusak. Mekanisme ini digunakan
untuk memperbaiki pembentukan dimer pirimidin dari sinar UV pada manusia.
Prosesnya melibatkan pengenalan kerusakan yang kemudian dibelah di kedua sisi oleh
endonuklease sebelum disintesis ulang oleh DNA polimerase.
 3. Perbaikan ketidaksesuaian.
Mekanisme eksisi ketiga disebut perbaikan ketidakcocokan dan terjadi ketika basa yang
tidak cocok dimasukkan ke dalam untai DNA selama replikasi dan tidak dihilangkan
dengan proofreading DNA polimerase. Dalam perbaikan ketidakcocokan, kesalahan
yang terlewatkan kemudian dikoreksi oleh enzim yang mengenali dan mengeluarkan
basis yang tidak cocok untuk mengembalikan urutan aslinya.

DNA Double Strand Break Repair

Perbaikan kerusakan untai ganda DNA
Perbaikan kerusakan pada kedua untai DNA sangat penting dalam menjaga integritas genomik.
Ada dua mekanisme utama untuk memperbaiki pemutusan untai ganda: rekombinasi homolog
dan penyambungan akhir nonhomolog klasik.

Rekombinasi homolog melibatkan pertukaran urutan nukleotida untuk memperbaiki basa yang
rusak pada kedua untai DNA melalui pemanfaatan kromatid saudara. Penggabungan ujung
nonhomolog klasik menghubungkan ujung putus tanpa templat homolog melalui penggunaan
sekuens DNA pendek yang disebut mikrohomologi. Mekanisme ini rentan terhadap kesalahan
tetapi melindungi integritas genom dari kemungkinan translokasi kromosom yang dapat terjadi
melalui rekombinasi homolog.

Studi juga menemukan bahwa putusnya untai ganda dapat diperbaiki melalui mekanisme
alternatif seperti anil untai tunggal dan penyambungan alternatif selama kondisi tertentu.
Mekanisme ini bersifat mutagenik dan dapat menyebabkan hilangnya informasi genetik.

Anil untai tunggal menyediakan penggabungan akhir antara pengulangan nukleotida yang
diselingi dalam genom yang mengarah ke satu salinan pengulangan dan urutan intervensi
dihapus dalam proses. Penggabungan alternatif memiliki mekanisme yang tidak terdefinisi
untuk memperbaiki pemutusan untai ganda tetapi diketahui berisiko terhadap integritas genomik
dengan menggabungkan pemutusan ujung pada kromosom yang berbeda.

Sumber : https://www.news-medical.net/life-sciences/Mechanisms-of-DNA-Repair.aspx