Nama : Riga Abdul Aziz NRP : 142019015

1. (Tugas Individu) Jelaskan secara singkat apa perbedaan dari bidang-bidang keilmuan yang dicetak
miring dalam textbook karangan Shuler & Kargi, (2002) hal 1 s.d. 3.
Penyelesaian :
1. Biomoleculer engineering
Penerapan prinsip prinsip dan praktik praktik rekayasa pada manipulasi molekul molekul yang
berasal dari biologi dengan tujuan tertentu. Insinyur biomolekuler mengintegrasikan
pengetahuan tentang proses biologis dengan pengetahuan inti teknik kimia untuk fokus pada
solusi tingkat molekuler untuk masalah dalam ilmu kehidupan yang terkait dengan
lingkungan,pertanian,energi,industri,produksi pangan ,bioteknologi, dan obat-obatan
2. Bioprocess engineering
Cabang ilmu teknik yang menggarap proses proses konversi biomassa tumbuhan,hewan,
mikroorganisme,melalui reaksi biokimia dengan memanfaatkan biokatalis atau
enzim,menjadi bahan lain yang dipandang lebih bernilai. Seperti makanan,pakan ternak,obat
obatan,polimer,bahan kimia,dan bioenergi yang dilaksanakan pada skala industri.
3. Biomedical engineering
Pengaplikasian teknik dan prinsip teknik dalam bidang medis. Bidang ini menggabungkan
kemampuan desain dan pemecahan masalah seorang insinyur ddenga ilmu medis dan ilmu
biologi di bidang kedokteran ,seperti diagnosa,pengawasan dan terapi.
4. Biological engineering
Aplikasi dari konsep dan metode biologi ,fisika,kimia dan ilmu computer untuk memecahkan
masalah terkait makhluk hidup dengan menggunakan aplikasi dan analisis teknik. Dengan kata
lain, ketika ilmu teknik biasanya mengaplikasikan ilmu matematia dan fisika untuk
mengananlisis,mendesain , dan membuat alat ,struktur, dan prose terkait benda mati,Teknik
biologis menambhakan ilmu biologi molekuler untuk mempelajari dan mengaplikasikan lenih
lanjut makhluk biologis
5. Biochemical engineering
Ilmu yang mempelajari raksi kimia yang terjadi sel atau organisme hidup. Ilmu ini erat
kaitannya dengan kehidupan setiap makhluk hidup.Adanya reaksi biokimia yang harmonis di
dalam tubuh menyebabkan kondisi yang baik untuk setiap makhluk hidup.
2. (Tugas Individu) Tuliskan definisi berdasarkan dokumen OECD: biomimikri, bioteknologi industri,
bioproses, bioproduk, rekayasa metabolik, permukaan biokatalitik, ekologi industri, biosafety,
bio-leaching, dan bio-bleaching.
Penyelesaian :
 Biomimikri
Nama yang diciptakan untuk pendekatan dimana sistem produksi indutri meniru alam.
 Bioteknologi industry
Seperangkat teknologi yang berasal dari mengadaptasi dan memodifikasi organisme
biologis.Bioteknologi telah berkembang selama 25-30 tahun terakhir menjadi
seperangkat alat yang kuat untuk mengembangkan dan mengoptimalkan efisiensi
hioproses dan karakteristik spesifik dari bioproduk. peningkatan ini dalam efisiensi dan
spesifisitas memiliki potensi besar untuk menggerakkan industri di sepanjang jalan
 menuju keberlanjutan.Peningkatan efisiensi memungkinkan penggunaan sumber daya
terbarukan yang lebih besar tanpa menyebabkan penipisannya.degradasi lingkungan dan
dampak negatif pada kualitas hidup. Bioteknologi dapat menjadialat penting untuk
memisahkan pertumbuhan ekonomi dari degradasi lingkungan dan kualitas kehidupan.
Bioteknologi juga dapat memungkinkan desain proses dan produk yang kinerjanya tidak
dapat dicapai dengan menggunakan kimia konvensional atau minyak bumi sebagai bahan.
 Bioproses
Cabang ilmu teknik yang menggarap proses proses konversi biomassa tumbuhan,hewan,
mikroorganisme,melalui reaksi biokimia dengan memanfaatkan biokatalis atau
enzim,menjadi bahan lain yang dipandang lebih bernilai. Seperti makanan,pakan
ternak,obat obatan,polimer,bahan kimia,dan bioenergi yang dilaksanakan pada skala
industri.
 Bioproduk

Biomassa tanaman dapat diproses dan diubah melalui fermentasi dan proses lainnya
menjadi bahan kimia, bahan bakar dan bahan yang terbarukan dan tidak menghasilkan
emisi bersih gas rumah kaca. Juga, produk-produk yang diturunkan secara biologis ini
("bioproduk") umumnya kurang beracun dan kurang persisten daripada rekan-rekan
petrokimia mereka.

 Rekayasa metabolic
metabolisme mikroorganisme juga dapat dimodifikasi dengan rekayasa genetika.
Tujuannya adalah untuk mengubah setiap sel menjadi "reaktor mini" yang sangat efisien
yang menghasilkan dalam satu langkah dan dengan hasil tinggi apa yang dibutuhkan ahli
kimia organik sejumlah langkah dengan hasil yang jauh lebih rendah (teknik ini disebut
"rekayasa metabolisme").
 Permukaan biokatalitik
Perbaikan lebih lanjut pada rekayasa metabolisme melibatkan rekayasa enzim dalam
konfigurasi optimal ke membran sel dan ketika sel pecah membran sel menjadi
permukaan bio-katalitik yang memberikan efisiensi tinggi rekayasa metabolisme tanpa
penalti energi menjaga organisme hidup.
 Ekologi industry
Proses ekosistem alami dengan mengelompokkan sekitar pengolahan bahan baku seperti
biomassa sehingga produk sampingan dari satu bahan awal untuk yang lain. Selain itu,
energi, seperti limbah panas, dapat digunakan secara efisien. Pendekatan ini disebut
"ekologi industri"
 Biosafety
Mikroorganisme yang digunakan untuk pemrosesan bio industri atau untuk produksi
enzim industri dipilih untuk menghindari penggunaan organisme patogen. Mereka
tunduk pada peraturan lingkungan yang ketat di negara-negara OECD. Peraturan
kesehatan kerja juga memberlakukan aturan tentang penanganannya di tempat kerja
dan, setelah digunakan, tidak diaktifkan dengan sterilisasi. Bahan organik yang dihasilkan
biasanya dikomposkan. Ini memecah komponen DNA dan protein dan kompos dapat
digunakan sebagai pupuk untuk mempertahankan tingkat bahan organik di dalam tanah.
 Bio-leaching
 Billeton (Afrika Selatan) telah mengembangkan bioproses ("bio-leaching") untuk
membebaskan tembaga dari bijih sulfida. Bioproses menggunakan bakteri alami untuk
mengoksidasi belerang dan besi yang ada dalam bijih pada suhu kamar. Proses
konvensional untuk mengisolasi tembaga dari bijih melibatkan pengangkutan bijih yang
ditambang ke peleburan di mana kotoran dikeluarkan pada suhu tinggi. Proses bio
leaching dilakukan di lokasi tambang. Ini menghemat biaya dan energi yang diperlukan
untuk mengangkut bijih dan juga menghilangkan emisi sejumlah besar oksida belerang,
arsenik, dan logam beracun lainnya ke atmosfer melalui proses pemanggangan suhu
tinggi. Setelah tembaga diekstraksi dari air pelindian asam, air limbah dinetralkan dan zat
beracun seperti arsenik diimobilisasi dalam bentuk stabil yang disimpan di lokasi
tambang. Proses bio-leaching dapat digunakan untuk mengolah bijih berkadar rendah
dan bijih yang mengandung arsenik yang tidak dapat diproses secara efektif dengan
peleburan suhu tinggi. Persyaratan biaya modal dari proses bio-leaching adalah 25% lebih
rendah daripada untuk membangun smelter. Bio-leaching saat ini menyumbang 20-25%
dari produksi tembaga dunia.
 Bio-bleaching
Domtar (Kanada) telah mulai menggunakan enzim xilanase, yang dipasok oleh logen
Corporation (Kanada) sebagai bahan pencerah tambahan (proses ini disebut "hio-
bleaching") untuk pulp kayu dalam pembuatan kertas. Enzim membuka struktur lignin
dari pulp kayu sehingga dibutuhkan 10-15% lebih sedikit klorin dioksida untuk mencapai
tingkat kecerahan yang diinginkan. logen telah mengurangi biaya produksi dan
meningkatkan kinerja xilanase dengan rekayasa genetika jamur dari mana ia diekstraksi.
Penggunaan xilanase telah membantu Domtar mengurangi jumlah klorin yang terikat
secara organik dalam air limbah sebesar 60% dan biaya bahan kimia pemutihan sebesar
10-15%. Oji Paper (Jepang) juga telah menggunakan xilanase untuk mencapai
pengurangan serupa dalam persyaratan bahan kimia pemutihan dan kadar klorin yang
terikat secara organik dalam air limbahnya. Selain itu, ia menghasilkan xilanase sendiri di
tempat melalui fermentasi sehingga biaya inputnya semakin berkurang.
3. (Tugas Individu) Dalam dokumen OECD terdapat aplikasi bioproses pada bidang: (a) bahan kimia
(fine / intermediet), (b) polimer, (c) pengolahan pangan, (d) pengolahan serat / fiber, (e)
pertambangan, dan (f) energi. Setiap kelompok memilih salah satu bidang aplikasi bioproses yang
ada, kemudian mendaftar contoh perusahaan yang disebutkan pada bidang tersebut. Lakukan
analisis komponen-komponen filosofi bioproses pada setiap perusahan tersebut dan sajikan
dalam format tabel seperti tabel berikut ini.
Bidang Nama Perusahaan Biokatalis Substrat / Kondisi Bioreaktor Tujuan
Nutrisi Lingkungan bioproses yang
dicapai
(a) s.d. (f) tuliskan spesies
mikroba / jenis enzim
jika ada
(a) Fine Tanabe Seiyaku (Jepang) Enzim yang berasal - - - untuk
chemical dari mikro organisme menghasilkan
asam amino.
Melumpuhkan
enzim pada
suatu
permukaan
sehingga dapat
 digunakan
kembali dan
lagi
menyebabkan
40%
penghematan
biaya.
Meningkatkan
sistem
imobilisasi
mikroorganisme
ini untuk
mengoptimalkan
kinerja enzim
menghasilkan
peningkatan
produktivitas 15
kali lipat lebih
lanjut (yaitu,
rasio produk)
menghasilkan
bahan awal yang
digunakan),
menghasilkan
pengurangan
biaya dan
pemborosan
yang besar.
Biochemie Enzim - - Sel untuk
pembuatan
(Germany/Austria) antibiotik
sefalosporin.
Efisiensi enzim
dioptimalkan
dengan
memodifikasi
secara genetik
mikro-organisme
yang
menghasilkan
enzim. Ketika
dibandingkan
untuk proses
kimia
konvensional,
proses enzimatik
menghasilkan
100 kali lebih
sedikit limbah
pelarut menjadi
dibakar dan,
sebagai
akibatnya, biaya
produksi dan
potensi dampak
lingkungan dari
proses tersebut
keduanya
berkurang.
Hoffmann La- mikroorganisme yang - - - untuk
direkayasa menghasilkan
Roche (Jerman) vitamin B2. Hal
ini
memungkinkan
perusahaan
untuk
mengurangi
proses kimia
enam langkah
menjadi
satu langkah.
Akibatnya,
penggunaan
bahan baku yang
tidak terbarukan
mengalami
penurunan
sebesar 75%,
emisi volatil
senyawa organik
ke udara dan air
telah menurun
sebesar 50% dan
biaya operasi
telah menurun
sebesar 50%.
Demikian pula,
DSM (Belanda)
telah
menggunakan
mikroorganisme
yang direkayasa
secara metabolik
untuk
mengurangi
limbah
diproduksi
dalam
pembuatan
sefaleksin 3
sampai 7 kali
lipat. Ini telah
memungkinkan
perusahaan
untuk
mengurangi
produksi
biaya sehingga
dapat bersaing
secara efektif di
pasar
internasional.
No.1

No Genus Deskripsi Genus Spesies yang mungkin dari Database (LPSN) Referensi
Teridentifikasi (Bergey’s)
(LPSN)
1 Sulfurospirillu  Sebagian besar 1. "Candidatus Sulfurospirillum The genus
m Sulfurospirillu acididehalogenans" sulfurospirillu
m yang diisolasi 2. Sulfurospirillum alkalitolerans m
sejauh ini 3. Sulfurospirillum arcachonense
bersifat 4. Sulfurospirillum arsenophilum
mesofilik 5. Sulfurospirillum barnesii
6. "Sulfurospirillum carboxydovorans
(pertumbuhan
"
optimum
7. Sulfurospirillum cavolei
antara 26 dan 8. Sulfurospirillum deleyianum
33°C) 9. "Candidatus Sulfurospirillum
 neutrofilik (pH diekertiae"
7 hingga 7,5), 10. Sulfurospirillum halorespirans
sedikit 11. Sulfurospirillum multivorans
melengkung,
tipis, batang
berukuran
sedang
(diameter 0,3
hingga 0,5 m
 panjangnya 2
sampai 5 m),
yang bergerak
melalui flagel
kutub tunggal
 nitrat sebagai
substrat energi
 1% NaCl),
tetapi tumbuh
paling baik
dengan
konsentrasi
garam rendah
(<0,2%)
 sebagian besar
ditemukan di
sedimen
 tumbuh
dengan 1
sampai 5%
oksigen di
headspace
sebagai
akseptor
electron
  Akseptor
elektron untuk
respirasi
anaerob
digunakan oleh
semua
Sulfurospirillu
m
 tumbuh secara
organotrofik
dan litotrofik;
asetat
diperlukan
sebagai sumber
karbon dalam
yang terakhir
2 Rhodobacter  Suhu untuk 1. Rhodobacter adriaticus Bergey's
pertumbuhan 2. Rhodobacter aestuarii Manual of
25 – 30 oC untuk3. Rhodobacter alkalitolerans Systematic
suhu optimum 4. Rhodobacter amnigenus Bacteriology,
nya 30 oC 5. Rhodobacter azollae 2nd edn, vol. 2
6. Rhodobacter azotoformans
 Untuk PH 7. Rhodobacter blastica
pertumbuhan 8. Rhodobacter blasticus
optimum nya 9. Rhodobacter capsulatus
sekitar 7 10. Rhodobacter changlensis
11. Rhodobacter euryhalinus
 Kadar garam 12. Rhodobacter flagellatus
optimum 0,5 - 13. Rhodobacter johrii
7,5 % 14. "Rhodobacter kunshanensis"
15. Rhodobacter lacus
 Warna coloni 16. "Candidatus Rhodobacter lobularis"
merah atau pink 17. "Rhodobacter marinus"
18. Rhodobacter maris
 Bentuk sell 19. Rhodobacter massiliensis
batang 20. Rhodobacter megalophilus
21. "Candidatus Rhodobacter
 Diameter cell oscarellae"
0,6 – 1,5 22. Rhodobacter ovatus
23. Rhodobacter ruber
 Mol% GC of the 24. Rhodobacter sediminicola
DNA 56 -60 25. Rhodobacter sediminis
26. Rhodobacter sphaeroides
 Near IR peak of 27. Rhodobacter sulfidophilus
BChl a (nm) 868 28. Rhodobacter tardus
–873 29. Rhodobacter thermarum
30. Rhodobacter veldkampii
31. Rhodobacter vinaykumarii
 32. Rhodobacter viridis
33. "Rhodobacter xinxiangensis"
34. Actirhodobacter atriluteus
35. Albirhodobacter confluentis
36. Albirhodobacter marinus
37. Pararhodobacter aggregans
38. Pararhodobacter marinus
39. Pararhodobacter marinus
40. Pararhodobacter oceanensis
41. Pararhodobacter zhoushanensis
42. "Sinirhodobacter enshiensis"
43. Sinirhodobacter ferrireducens
44. Sinirhodobacter hankyongi
45. Sinirhodobacter huangdaonensis
46. Sinirhodobacter populi
47. Sinorhodobacter ferrireducens
48. Sinorhodobacter huangdaonensis
49. Sinorhodobacter populi
50. Solirhodobacter olei
51. Falsirhodobacter deserti
52. Falsirhodobacter halotolerans
53. Paenirhodobacter enshiensis
54. "Plastorhodobacter daqingensis"
55. Pseudorhodobacter antarcticus
56. Pseudorhodobacter aquaticus
57. Pseudorhodobacter aquimaris
58. Pseudorhodobacter collinsensis
59. Pseudorhodobacter ferrugineus
60. Pseudorhodobacter ponti
61. Pseudorhodobacter
psychrotolerans
62. Pseudorhodobacter sinensis
63. Pseudorhodobacter turbinis
64. Pseudorhodobacter wandonensis

No.2
Phylum (filum)

Genus (marga)
Family (famili)

(spesies / jenis)
Superkingdom
Teridentifikasi

Strain (galur)
Order (ordo)
Class (kelas)
(imperium)/

(kerajaan)
Kingdom
/ empire

Species
domain
Genus

N
o.

1 rhodoba proka Bac Proteobacter Alphaproteob Rhodobacter Rhodobacter Plastorho 146

. cterales ryota teri ia acteria(33) ales(1) aceae(146) dobacter(
a (4) 19) Y1RS19

2 Sulfuros proka Bac Campyloba Campylobact Campylobac Sulfurospirilla Sulfurospi 11 HTRB-

. pirillum ryota teri cterota(2) eria(2) terales(15) ceae.(1) rillum(176 L1 l[T]
a 8) r[T] s[T]
No.3

prokaryota

Bacteria

Proteobacte
ria Campylobacter
otaria

Alphaproteobacteriaria Campylobacteria

Rhodobacterales Campylobacteralesria
ria

Rhodobacteraceaeria Sulfurospirillaceae

Plastorhodobacterria Sulfurospirillumria
No.4

Enzim glutaminase
EC number : EC.3.5.1.2
3 = hydrolases
E.C. number and E.C. tree 3.5 = acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds
3.5.1 = in linear amides
3.5.1.2 = glutaminase

Reaksi yang dijalankan

Struktur kimia enzim

Mangrove
Mikroba yang memproduksi
Sonneratia Alba
Kondisi optimum penggunaan enzim pH 8,6 dengan suhu 37 derajat Celsius (optimal)
Nilai aktivitas enzim