Ringkasan

Prinsip Klasifikasi dan Taksonomi Bakteri

Bakteri dapat diklasifikasikan berdasarkan penampakan makroskopis dan
mikroskopisnya, berdasarkan karakteristik pertumbuhan dan sifat metaboliknya,
berdasarkan antigenisitasnya, dan terakhir berdasarkan genotipenya.
Perbedaan awal antar bakteri dapat dilakukan berdasarkan karakteristik
pertumbuhan pada media nutrisi dan selektif yang berbeda. Bakteri tumbuh dalam
koloni; setiap koloni seperti kota yang dihuni oleh jutaan organisme atau lebih.
Keseluruhan ciri-ciri tersebut memberi koloni ciri-ciri pembeda seperti warna, ukuran,
bentuk, dan bau. Kemampuan bakteri untuk melawan antibiotik tertentu,
memfermentasi gula tertentu (misalnya laktosa, untuk membedakan E. coli dari
Salmonella), untuk melisiskan eritrosit (sifat hemolitik streptokokus), atau untuk
menghidrolisis lipid (misalnya lipase klostridial) dapat ditentukan dengan
menggunakan metode yang sesuai. media pertumbuhan.
Kenampakan mikroskopis, termasuk ukuran, bentuk, dan konfigurasi
organisme (kokus, batang, melengkung, atau spiral), dan kemampuannya
mempertahankan pewarnaan Gram (gram positif atau gram negatif) merupakan cara
utama untuk membedakan bakteri. Bakteri berbentuk bola seperti Staphylococcus
adalah kokus, bakteri berbentuk batang seperti E. coli adalah basil, dan treponema
yang mirip ular adalah spirillum. Selain itu, spesies Nocardia dan Actinomyces
memiliki penampakan filamen bercabang yang mirip dengan jamur. Beberapa bakteri
membentuk agregat, seperti kelompok Staphylococcus aureus yang mirip anggur atau
rantai, seperti Streptococcus pyogenes, atau diplococcus (dua sel bersama-sama)
seperti pada spesies S. pneumoniae dan Neisseria.
 Tingkat klasifikasi berikutnya didasarkan pada ciri struktural dan metabolik
bakteri, termasuk kerentanan terhadap deterjen (misalnya asam empedu), kebutuhan
akan lingkungan anaerobik atau aerobik, kebutuhan nutrisi spesifik (misalnya
kemampuan memfermentasi karbohidrat tertentu atau menggunakan bahan-bahan
lain). senyawa sebagai sumber karbon untuk pertumbuhan), dan produksi produk
metabolisme yang khas (asam, alkohol) dan enzim spesifik (misalnya katalase
stafilokokus). Prosedur otomatis untuk membedakan bakteri enterik dan bakteri lain
telah dikembangkan; mereka menganalisis pertumbuhan di berbagai media dan
produk mikrobanya dan memberikan biotipe numerik untuk masing-masing bakteri.
Strain bakteri tertentu dapat dibedakan menggunakan antibodi untuk
mendeteksi antigen karakteristik pada bakteri (serotipe). Tes serologi ini juga dapat
digunakan untuk mengidentifikasi organisme yang sulit (misalnya Treponema
pallidum, organisme penyebab sifilis) atau terlalu berbahaya (misalnya Francisella,
organisme penyebab tularemia), tidak tumbuh di laboratorium, berhubungan dengan
sindrom penyakit tertentu (misalnya, E. coli serotipe O157:H7, yang menyebabkan
kolitis hemoragik), atau perlu diidentifikasi dengan cepat (misalnya, S. pyogenes,
yang menyebabkan faringitis streptokokus). Serotipe juga digunakan untuk membagi
bakteri di bawah tingkat spesies untuk tujuan epidemiologi.
Metode paling tepat untuk mengklasifikasikan bakteri adalah dengan
menganalisis materi genetik atau proteinnya. Profil protein karakteristik bakteri juga
dapat dianalisis secara cepat dengan spektrometri massa (MALDI-TOF). Teknik-
teknik ini tidak memerlukan bakteri hidup atau tumbuh dan dapat digunakan untuk
deteksi cepat dan identifikasi organisme yang tumbuh lambat (misalnya mikobakteri,
jamur) atau analisis sampel patologi bahkan bakteri yang sangat mematikan. Urutan
DNA ribosom dapat ditentukan untuk mengidentifikasi suatu famili atau genus dan
membedakan suatu spesies atau subspesies. Dalam beberapa tahun terakhir, aspek
teknis dari metode ini telah disederhanakan dan menjadi cukup hemat biaya sehingga
sebagian besar laboratorium klinis menggunakan variasi metode ini dalam praktik
sehari-hari.
Struktur (Morfologi Sel dan Koloni, Komponen Sel, dan Fungsi) Bakteri
Sitoplasma bakteri terbungkus oleh membran sitoplasma yang dikelilingi oleh
dinding sel yang terdiri dari peptidoglikan yang tebal untuk bakteri gram positif dan
tipis untuk bakteri gram negatif. Ruang periplasma dan membran luar mengelilingi
peptidoglikan bakteri gram negatif. Untuk beberapa bakteri, kapsul mengelilingi
seluruh bakteri.
Sitoplasma sel bakteri mengandung kromosom DNA, messenger ribonucleic
acid (mRNA), ribosom, protein, dan metabolit. Plasmid, yang lebih kecil, melingkar
dan meskipun biasanya tidak penting untuk kelangsungan hidup sel, sering kali
memberikan keuntungan selektif; banyak dari mereka menimbulkan resistensi
terhadap satu atau lebih antibiotik.
Ribosom bakteri terdiri dari subunit 30S + 50S, membentuk ribosom 70S. Ini
tidak seperti ribosom eukariotik 80S (40S + 60S). Protein dan RNA ribosom bakteri
berbeda secara signifikan dari ribosom eukariotik dan merupakan target utama obat
antibakteri.
Membran sitoplasma memiliki struktur bilayer lipid yang mirip dengan
struktur membran eukariotik, tetapi tidak mengandung steroid (misalnya kolesterol);
mikoplasma adalah pengecualian dari aturan ini. Membran sitoplasma bertanggung
jawab atas banyak fungsi yang dimiliki organel pada eukariota. Tugas-tugas ini
meliputi transpor elektron dan produksi energi, yang biasanya dicapai di mitokondria.
Selain itu, membran mengandung protein transpor yang memungkinkan penyerapan
metabolit dan pelepasan zat lain, pompa ion untuk mempertahankan potensi
membran, dan enzim. Bagian dalam membran dilapisi dengan filamen protein mirip
aktin yang membantu menentukan bentuk bakteri dan tempat pembentukan septum
untuk pembelahan sel. Filamen ini menentukan bentuk spiral treponema.
Komponen dinding sel juga unik pada bakteri, dan struktur berulangnya
berikatan dengan reseptor pola patogen pada sel manusia untuk memperoleh respons
perlindungan bawaan. Kapsul tidak diperlukan untuk pertumbuhan bakteri, namun
sangat penting untuk kelangsungan hidup inang. Kapsulnya mempunyai antigenik dan
antifagositik yang buruk dan merupakan faktor virulensi utama (misalnya, S.
pneumoniae). Kapsul juga dapat bertindak sebagai penghalang terhadap molekul
hidrofobik beracun, seperti deterjen, dan dapat meningkatkan perlekatan pada bakteri
lain atau permukaan jaringan inang.
 Flagela adalah baling-baling mirip tali yang terdiri dari subunit protein
melingkar heliks (flagellin) yang berlabuh di membran bakteri melalui struktur kait
dan tubuh basal dan digerakkan oleh potensial membran.
Fimbriae (pili) (bahasa Latin untuk “pinggiran”) adalah struktur mirip rambut
di bagian luar bakteri, dan tersusun dari subunit protein (pilin). Fimbriae secara
morfologis dapat dibedakan dari flagela karena diameternya lebih kecil (3 sampai 8
nm versus 15 sampai 20 nm) dan biasanya strukturnya tidak melingkar. Fimbriae
meningkatkan kepatuhan terhadap bakteri lain atau inang (nama alternatifnya adalah
adhesin, lektin, evasin, dan agresin).
Pertanyaan
1. Apa fungsi mengetahui perbedaan struktur bakteri bagi kesehatan manusia?
2. Bagaimana cara bakteri tumbuh dan bertahan pada lingkungan yang kurang
bersahabat?
3. Mengapa pada pewarnaan gram, bakteri gram negatif menjadi berwarna merah?
4. Apa yang terjadi saat membran inti bakteri tidak ada?
5. Beberapa bakteri tidak memiliki plasmid, apa keuntungan dari adanya plasmid?

Jawaban
1. Perbedaan struktural antara bakteri dan eukariota memicu perlindungan inang pada
manusia dan memberikan dasar bagi sebagian besar terapi antimikroba. Penunjukan
bakteri sebagai pewarnaan gram positif, gram negatif atau tahan asam menunjukkan
dasar perbedaan cara penularan, gambaran penyakit, dan sensitivitas antibiotik.
Bakteri diklasifikasikan dan diidentifikasi untuk membedakan satu organisme dari
organisme lain dan untuk mengelompokkan organisme serupa berdasarkan kriteria
yang menarik bagi ahli mikrobiologi atau ilmuwan lain. Tingkat terpenting dari
klasifikasi jenis ini adalah tingkat spesies. Nama spesies harus memiliki arti yang
sama bagi semua orang. Dalam satu spesies, strain dan subkelompok dapat berbeda
berdasarkan penyakit yang ditimbulkannya, habitat lingkungannya, dan banyak
karakteristik lainnya. Sebelumnya, spesies diciptakan berdasarkan kriteria tersebut,
yang mungkin sangat penting bagi ahli mikrobiologi klinis dan dokter namun tidak
merupakan dasar yang cukup untuk menetapkan suatu spesies.
2. Bakteri dapat bertahan hidup dan, dalam beberapa kasus, tumbuh di lingkungan
yang tidak bersahabat dimana tekanan osmotik di luar sel sangat rendah sehingga
sebagian besar sel eukariotik akan lisis, pada suhu ekstrem (panas dan dingin), dengan
kekeringan, dan dengan sangat encer dan beragam. sumber energi. Bakteri telah
mengembangkan struktur dan fungsinya untuk beradaptasi dengan kondisi ini.
Peptidoglikan sangat penting untuk struktur, replikasi, dan kelangsungan hidup dalam
kondisi yang biasanya tidak bersahabat di mana bakteri tumbuh.
3. Bakteri gram negatif memiliki lapisan peptidoglikan tipis dan membran luar yang
mengandung lipopolisakarida, fosfolipid, dan protein yang tidak mempertahankan
pewarna kristal violet, sehingga sel harus diwarnai dengan safranin dan diubah
menjadi merah. Ruang periplasma antara sitoplasma dan membran luar mengandung
protein transpor, degradatif, dan sintetik dinding sel. Membran luar bergabung dengan
membran sitoplasma pada titik adhesi dan melekat pada peptidoglikan melalui ikatan
lipoprotein. Dinding sel mikobakteri memberikan pewarnaan tahan asam pada bakteri.
Mereka memiliki struktur kompleks dengan lapisan luar asam mikolat yang kaya lipid
dan porin yang menembus lapisan itu.
4. Kurangnya membran inti menyederhanakan persyaratan dan mekanisme kontrol
untuk sintesis protein. Tanpa membran inti, transkripsi dan translasi digabungkan;
dengan kata lain, ribosom dapat berikatan dengan mRNA, dan protein dapat dibuat
saat mRNA disintesis dan masih melekat pada DNA.
5. Plasmid adalah “kendaraan” penting untuk komunikasi informasi genetik antar
bakteri. Pertukaran plasmid menularkan sifat-sifat yang relevan secara patogenik dan
lingkungan ke bakteri inang, mendorong evolusi dan adaptasi yang cepat terhadap
berbagai lingkungan. Plasmid, meskipun biasanya tidak penting untuk kelangsungan
hidup sel, sering kali memberikan keuntungan selektif; banyak dari mereka
menimbulkan resistensi terhadap satu atau lebih antibiotik.