1
Minggu Yang Lalu
• Kontrak Pembelajaran
• Kehadiran Perkuliahan minimal 75%
• Kehadiran Praktikum 100%
• Tugas terstruktur 100%
• Proporsi penilaian
• Yang mengikuti kuliah wajib Hp dimatikan/disilent
• Tidak terlambat masuk kelas
• Arti kata BIOKIMIA
• Ruang lingkup
2
CAPAIAN PEMBELAJARAN
• PROTEIN
• Setelah mengikuti kuliah diharapkan mahasiswa
1. Mampu menyebutkan kembali fungsi protein
2. Mampu memahami struktur protein
3. Mampu memahami struktur asam amino
4. Mampu mengenal 20 asam amino
5. Mampu menyebutkan 10 asam amino esensial
6. Mampu menyebutkan kembali lambang huruf asam
amino
3
PROTEIN
❑Kata protein → Yunani proteios, yang berarti pertama atau
utama, maka sesuai dengan arti kata tersebut, protein sering
dikatakan sebagai komponen utama dalam semua sel hidup
5
Makanan
Monosakarida
Asam amino
D-glukosa gliserol Asam
+ lemak
NH3 piruvat
Asam
Asetil KoA
Siklus α-keto
urea
Siklus
H2O Krebs [H]
Urea energi
CO2 sbg ATP
ATP H2O 6
Ringkasan
Metabolisme
Protein
7
ASAM AMINO
• Asam amino terdiri dari rantai karbon (R), atom hidrogen, gugus
karboksilat (COOH), gugus amino (NH2), kadang-kadang gugus
hidroksil (OH), serta belerang (S).
8
ASAM AMINO - PROTEIN
9
Nama Lambang 3 huruf Lambang 1 huruf
Glisin Gly G
Alanin Ala A
Valin Val V
Leusin Leu L
Isoleusin Ile I
Serin Ser S
Treonin Thr T
Tirosin Tyr Y
Sistein Cys C
Metionin Met M
Asam aspartat Asp D
Asparagin Asn N 10
Nama Lambang 3 huruf Lambang 1 huruf
Asam glutamat Glu E
Glutamin Gln O
Arginin Arg R
Lisin Lys K
Histidin His H
Fenilalanin Phe F
Triptofan Trp W
Prolin Pro P
11
H O
+ _
H3 N C C O
Glisin
H
H O
+ _
H3 N C C O Alanin
CH3
wardhana suryapratama 12
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH CH2
H3C CH3 CH
H3C CH3
Valin
Leusin
13
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH CH2
H2C CH3 CH2
CH3 S
Isoleusin CH3
Metionin
14
H O H O
_ + _
C C O H3 N C C O
H2+N CH2
CH2
H2C CH2
Prolin
Phenilalanin
15
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 CH2
OH H
Tyrosin Tryptofan
16
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 CH OH
OH CH3
Threonin
Serin
17
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 CH2
SH O C
NH2
Sistein
Asparagin
18
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 CH2
CH2
N NH
O C
Histidin NH2
Glutamin
19
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 CH2
_
CH2 O C O
_
O C O
Asam
Asam Aspartat
Glutamat
20
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 CH2
CH2 CH2
CH2 CH2
CH2 NH
NH3 + C NH2+
NH2
Lisin
Arginin 21
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 SH HS CH2
Sistein Sistein
H O H O
+ _ + _
H3 N C C O H3 N C C O
CH2 S S CH2
23
ASAM AMINO
• Asam amino non esensial dan asam amino esensial
• Asam amino esensial adalah asam amino yang tidak dapat
disintesis di dalam tubuh hewan sehingga harus tersedia di
dalam pakan → indispensable
• Pada manusia dan hewan mamalia ada 10 jenis asam amino
esensial yaitu MATT HILL VP (Met Arg Thr Trp His Ile Leu Lys
Val Phe)
• Pada unggas terdapat 13 asam amino esensial yaitu selain
MATT HILL VP di tambah Gly Cys Tyr
24
Asam amino
• Adanya ion plus dan minus pada asam amino → bersifat dipolar
• Gugus karboksil (-COOH) → bersifat asam
• Gugus amin (-NH2) → bersifat basa
• Asam amino dapat bersifat asam dan basa → disebut AMFOTERIK
• Dalam larutan asam keras (pH asam) → asam amino bermuatan positif
(bentuk kation)
• Dalam larutan basa keras (pH basa) → asam amino bermuatan negatif
(bentuk anion)
• Pada pH tertentu asam amino dalam keadaan netral disebut titik
isoelektrik
25
26
27
Struktur
sekunder
protein
α-heliks β-sheet
28
• Struktur protein primer adalah suatu urutan linier asam amino
yang bergabung melalui ikatan peptida
• Secara umum ada dua bentuk umum dari struktur sekunder
yaitu α-helix dan β-sheet (konformasi β). Bentuk α-helix
adalah silindris, terjadi karena adanya ikatan hidrogen yang
parallel sepanjang sumbu helixnya.
• Pada tipe konformasi β, ikatan hidrogen terbentuk diantara
rantai polipeptida yang berdekatan atau berdampingan secara
parallel atau anti parallel.
• Struktur tersier protein adalah bentuk atau susunan tiga
dimensi dari semua asam amino di dalam polipeptida.
29
Struktur tertier protein 30
Struktur kwaterner protein 31
32
33
Both marine bloodworm hemoglobin (left) and E. coli
cytochrome B562 (right) are composed of mostly alpha helicies.
The 4 helix bundle of the cytochrome is a common motif. 34
The green alga plastocyanin (left) and sea snake
neurotoxin (right) are mostly beta sheets. 35
many proteins are a mix of alpha helicies and
beta sheets 36
Two simple proteins with a mix of 2o components:
ribonuclease T1 (left) and pancreatic trypsin inhibitor (right)
37
Some proteins are
composed of non-
identical subunits
(chains). A simple
example is insulin
which is made up
of two chains, the
alpha chain and
the beta chain,
linked by two
disulfide bridges
38
Kesimpulan
• Definisi protein
• Fungsi protein
• Struktur protein
• Ikatan peptida
• Terdapat 20 jenis asam amino
• Terdapat 10 asam amino esensial
• Klasifikasi asam amino
39
Kuliah minggu depan
• Klasifikasi protein
• Metabolisme protein
40