Nama: Farhan Ramadhan

NIM : 225040207111072

Kelas : Agroekoteknologi P

1. Isolasi DNA, purifikasi DNA, dan ekstraksi DNA adalah tiga tahap yang berbeda dalam proses
manipulasi DNA. Berikut adalah perbedaan antara ketiganya:

Isolasi DNA

Isolasi DNA adalah proses pertama dalam memperoleh DNA dari sel atau jaringan biologis.

- Tujuan: Menghasilkan sampel murni DNA dari kontaminan seluler dan molekuler lainnya.

- Proses: Melibatkan pemecahan sel atau jaringan untuk melepaskan DNA, diikuti dengan
pemisahan DNA dari komponen seluler lainnya menggunakan teknik tertentu.

2. Purifikasi DNA

Purifikasi DNA adalah langkah yang dilakukan untuk membersihkan sampel DNA yang telah
diisolasi dari kontaminan atau senyawa lain yang mungkin hadir.

- Tujuan: Menghilangkan senyawa seperti protein, RNA, atau senyawa kimia lain yang mungkin
terdapat dalam sampel DNA.

- Proses: Melibatkan penggunaan metode khusus atau teknologi, seperti kromatografi,

elektroforesis, atau penggunaan reagen tertentu untuk membersihkan dan memurnikan DNA.

3. Ekstraksi DNA

Ekstraksi DNA adalah proses umum yang mencakup isolasi dan/atau purifikasi DNA dari berbagai
sumber biologis.

- Tujuan: Memperoleh DNA dalam jumlah yang cukup untuk analisis atau eksperimen tertentu.

- Proses: Melibatkan langkah-langkah seperti lisis sel, pengendapan protein dan debris sel, dan
isolasi/pemurnian DNA menggunakan metode tertentu, seperti kloroform-isoamyl alcohol, kolom
filtrasi, atau metode magnetik.

2. Metode Ekstraksi Secara Fisik:

1. Metode Pemecahan Sel (Mekanis):

-Contoh: Homogenisasi mekanis menggunakan blender atau homogenizer.

- Penjelasan: Sampel biologis, seperti jaringan atau sel, dihancurkan secara fisik untuk melepaskan
kontennya, termasuk DNA. Metode ini biasanya digunakan sebelum langkah isolasi DNA.
2. Ekstraksi dengan Penggunaan Alat Mekanis:

-Contoh: Penggunaan alat seperti bead beater yang menggunakan bola logam kecil untuk
menghancurkan sel.

- Penjelasan: Bola-bola logam bergerak dengan cepat dalam sampel biologis, memecahkan sel dan
melepaskan konten intraseluler, termasuk DNA.

Metode Ekstraksi Secara Kimia:

1. Metode Ekstraksi dengan Fenol-Kloroform:

- Contoh: Ekstraksi DNA dengan larutan fenol-kloroform.

- Penjelasan: Fenol dan kloroform digunakan untuk menghilangkan protein dan komponen seluler
lainnya, memungkinkan pemisahan DNA dari bahan-bahan tersebut. Larutan fenol-kloroform sering
digunakan bersamaan dengan pengendapan etanol untuk mengendapkan dan memurnikan DNA.

2. Ekstraksi dengan Kolom Filtrasi

- Contoh: Penggunaan kolom filtrasi komersial untuk ekstraksi DNA.

-Penjelasan: Sampel DNA dimasukkan ke dalam kolom yang berisi media filtrasi khusus. DNA
melekat pada media, sementara kontaminan lain terbuang. Setelah beberapa langkah pencucian,
DNA dapat dielusi dari kolom dengan menggunakan buffer tertentu.

3. Ekstraksi dengan Metode Elektroforesis:

- Contoh: Pemisahan DNA menggunakan elektroforesis gel agarosa.

- Penjelasan: DNA dipisahkan berdasarkan ukuran melalui gel agarosa yang dikenakan arus listrik.
Setelah elektroforesis, DNA dapat diekstraksi dari gel agarosa menggunakan metode seperti
elektroelusi atau digunakan sebagai target dalam teknik transfer Southern blot.

Setiap metode ekstraksi memiliki kelebihan dan kelemahan tertentu tergantung pada tujuan spesifik
dan jenis sampel yang digunakan. Pemilihan metode yang tepat dapat memastikan kualitas dan
kuantitas DNA yang memadai untuk analisis selanjutnya.