By : Group 3 & 4
Member :
• Apriliyan Eko B
• Nila Arum Sari
• Mochamad Iqbal G
• Deni Setiawan
• Rizwansyah
• M Yahya
Clostridium
Kingdom : Bakteri
Filum : Firmicutes
Class : Clostridium
Ordo : Clostridiumles
Famili : Clostridiumceae
Genus : Clostridium
Spesies : C.perfringens, C.difficele,
C.batulinum dan C.tetani.
www.depts.washington.edu.
Spesies Patogen
Spesies bakteri yang bersifat • Sedangkan yang bersifat
patogen nonpatogen
C. perfringens
•
• C. sporogenes,
• C. septicum
• C. ramosum.
• C. novyii type A
• C. sordelli
• C. innocuum,
• C. tetani • C. paraputrificum,
• C. difficile • C. cadaveris,
• C. botulinum • C. bifermentans,
• C. butyricum • C. fallax,
• C. baratii • C. Clostridioforme
• C. tertium
• C. histolyticum.
Spesies Patogen
Clostridium perfringens
A + − − −
B + + + −
C + + − −
D + − + −
E + − − +
Penyakit
Uji Biokimia
Matrix-Assisted Laser Desorpi
Nucleid Acid Amplification (NAATs)
LANJUT
Uji Biokimia
Nagler Uji TP 22 – Uji Nagler
Tes Nagler menentukan kemampuan mikroorganisme
untuk menghasilkan enzim lecithinase. Lecithinase
organisme memproduksi diidentifikasi oleh zona
opalescence sekitar koloni individu pada kuning telur
agar. C. perfringens lecithinase dihambat oleh
antitoksin C. perfringens tipe A. Clostridium baratii,
Clostridium absonum, Clostridium bifermentans,
Clostridium sordelli dan Clostridium novyi juga
memproduksi lecithinase. C. sordelli dan C.
bifermentans menghasilkan enzim yang juga terkait
erat dengan C. perfringens alpha toksin (lecithinase)
dan dapat menghasilkan parsial lintas reaction (Collee
1996). Hasil positif Nagler ditandai dengan produksi
lecithinase dan penghambatan karena antitoksin.
Catatan: Dalam beberapa tahun terakhir, popularitas
tes Nagler telah menurun karena antitoksin yang
belum banyak tersedia. Sebuah alternatif untuk tes
Nagler digunakan di beberapa laboratorium adalah tes
CAMP terbalik.
Uji CAMP terbalik
Uji CAMP terbalik dapat digunakan untuk diferensiasi
C. perfringens dari Spesies Clostridium lainnya. Racun
Alpha diproduksi oleh C. perfringens dan kelompok B,
β-hemolitik streptococci tumbuh dalam pola
karakteristik pada agar darah; Namun perawatan harus
diambil untuk memastikan kultur murni dapat
digunakan (Buchanan 1982). Indole tes TP 19 - Uji
indol Tes indole menentukan kemampuan suatu
organisme untuk menghasilkan indole dari degradasi
asam amino triptofan. Anaerob, khususnya spesies
Clostridium, membentuk indole tapi dapat cepat
memecahnya seperti yang diproduksi; Oleh karena itu,
reaksi negatif palsu dapat terjadi (Reed 1942). C.
novyi strain A memberikan variabel hasil tes indole
tapi biasanya indole negatif.
Urease uji TP 36 – Uji Urease
Tes urease digunakan untuk menentukan kemampuan
suatu organisme untuk membagi urea, melalui
produksi enzim urease. C. sordellii yang urease positif
sedangkan C. Bifermentans menunjukkan urease
negatif.
Uji Lipase
Tes lipase menentukan kemampuan mikroorganisme
untuk menghasilkan enzim lipase yang mengkatalisis
hidrolisis trigliserida dan digliserida asam lemak dan
gliserol. Hal ini ditunjukkan dengan kemilau warna-
warni dan sekitarnya koloni di piring menengah. Hal
ini membantu dalam diferensiasi spesies Clostridium.
C. botulinum, C. sporogenes, C. novyi A, C. ghonii dan
C. cochlearium menghasilkan lipase. C. leptum
memberikan variabel reaksi lipase tapi biasanya lipase
negatif.
BACK
Matrix-Assisted Laser Desorpi
Matrix-dibantu laser yang desorpsi ionisasi waktu-of-
flight spektrometri massa (MALDITOF MS), yang dapat
digunakan untuk menganalisis komposisi protein dari sel
bakteri, telah muncul sebagai teknologi baru untuk
identifikasi spesies. Ini telah terbukti menjadi alat
cepat dan kuat karena reproduktifitas, kecepatan dan
sensitivitas analisis. Keuntungan dari MALDI-TOF
dibandingkan dengan metode identifikasi lain adalah
bahwa hasil analisis yang tersedia dalam beberapa jam
daripada beberapa hari. Kecepatan dan kesederhanaan
persiapan sampel dan hasilnya akuisisi terkait dengan
biaya konsumsi minimal membuat metode ini cocok
untuk digunakan (Barbuddhe 2008).
Ini telah digunakan untuk identifikasi spesies
Clostridium terutama untuk membedakan ribotypes
berbeda antara isolat C. difficile. Namun, database
yang luas adalah penting untuk mengidentifikasi spesies
dan strain terkait erat andal dan tersedia database
perlu dioptimalkan (Veloo 2011). Keterbatasan lain
untuk penggunaan teknik ini adalah adanya spora
Clostridium spesies dan budaya sehingga muda sekarang
digunakan untuk meminimalkan spektral interference .
Nucleid Acid Amplification
(NAATs)
PCR biasanya dianggap sebagai metode yang baik untuk
deteksi bakteri karena sederhana, cepat, sensitif dan
spesifik. Dasar untuk aplikasi diagnostik PCR dalam
mikrobiologi adalah deteksi agen infeksi dan
diskriminasi non-patogenik dari strain patogen
berdasarkan gen tertentu. Namun, itu memang memiliki
keterbatasan. Meskipun gen 16S rRNA umumnya
ditargetkan untuk desain spesies-spesifik PCR primer
untuk identifikasi, merancang primer sulit ketika urutan
dari gen homolog memiliki kesamaan yang tinggi. Ini
telah berhasil digunakan dalam identifikasi spesies
Clostridium misalnya C. perfringens, C. botulinum, C.
baratii dan C. butyricum, C. novyi, C. Difficile 40-44.
Identifikasi Lanjut
Metode cepat
Neon Amplified Fragment Length Polymorphism
(AFLP)
SEKIAN