DNA FINGERPRINT

-Sidik jari (1930)----- Sidik DNA (1989)

-- Sidik jari dapat diubah dengan di operasi
-Sidik DNA: - Ada pada semua jaringan
-- Tidak dapat diubah

Struktur DNA:
1. Struktur molekul: C (cytosin)
G (guanin)
A (adenin)
T (thymin)

2. Bangunan dasar nukleotida:

- gula/sugar
- desoksiribosa
- kelompok phosphat
- 4 nitrogen dasar berpasangan:

A-T; C-G; G-C; T-A;

 Determinasi

@ Segmen DNA dideterminasi dari pasangan gula phosphat

@ DNA membedakan :
- Karakter
- Organisme
- Individu
Nucleotida (asam amino)
Chromosome
Chromosome
Kromosom

Lengan pendek
(p)

Lengan panjang
(q)
 Analisis DNA
1. Isolasi DNA: darah, rambut, kulit, sperma dsb

2. Memotong mengukur dan mensortir (restriksi):

dengan enzim restriksi asal bakteri:
mis Eco RIpada sequen GAATTC

3.- Elektroforesis gel

- Transfer DNA ke nylon

4. Probing: -dengan radioaktif- DNA.FP

- Pewarna probDNA.FP

5. DNA. FP dengan pewarna prob lagi

Sidik DNA

Setelah proses elektroporesis, kemudian

Diwarnai:
Dengan methylen blue untuk pewarnaan gel
Konvensional

Pewarnaan khusus untuk

peningkatan penampilan
Dan memudahkan pembacaan,
dapat diwarnai :
Dengan: - Carolina blue, atau
- Quikviem DNA

Kedua jenis pewarnaan ini

dapat mengurangi
Back ground dan meningkatkan sensitiviti
POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)

Reaksi penggandaan DNA:

Diperlukan: - DNA original

- dua molekul primer nukleotida utuh
- larutan buffer
- Taq DNA polimerases (enzim):

Fungsi/kegunaanya: - Melipatgandakan DNA dengan cara

mengkopi(copy)
- Diagnosis untuk mengkonformasi DNA
Proses PCR

Denaturasi annealing primer Replikasi DNA

Denaturasi (suhu 94-96oC)
Dobel helix strand dipisah
Annealing Primer (suhu 50-65oC)
annealing/primer melekat pada masing-masing strand
Replikasi DNA (suhu 72oC)
masing-masing strand digandakan
Aplikasi DNA FP

1. Mendiagnosis Kelainan keturunan (genetik)

- pada janin yang belum dilahirkan
- Bayi yang baru dilahirkan

2. Penelitian mengenai kelainan genetik

Normalbandingkan --Kelainan

3. Bukti biologik: untuk laboratorium forensik

Penyakit Genetik

Gen Ling-
makhluk kungan
hidup
Klasifikasi penyakit genetik

Penyakit
Genetik

Autosomal Autosomal Multi-

X-Y-link Mitokondri
dominan resesif factorial
a

*Cystic – X-link
*Achondro- X-link *Autisme
fibrosis Dominant:
plasia Resesif: *Leber *Hipertensi
*Sickle cel – *Aicardi Y-link:
*Huntington *Hemophilia hereditary *Cancer
anemia *Klinefelter *Infertility
-disease *Buta warna optic *Mental –
*Spinal- *Hipo- pria
*Marfan – *Muscular neurophaty dis.
muscular phospatemi
disease destrofi dsb
atrophy a
Achondroplasia
 ENZIM UNTUK RESTRIKSI

• Enzim Organisme sequen yang

dikenal
• -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
• EcoRI Escherichia coli GAATTC
• BamHI Bacillus amyloliquefaciens GGATCC
• Bgl/II bacillus globigii AGATCT
• PvuII proteus vulgaris CGATCG
• PvuIII Proteus vulgaris CAGCTG
• HindIII haemophilus influenzaeRd AAGCTT
• HinfI Haemophilus influenzaeRf GANTC
• Sau3A Staphylococcus aureus GATC
• AluI Arthrobacter luteus AGCT
• TaqI Thermus aquatus TCGA
• HaeIII haemophilus aegyptius GGCC
• NotI Nocardia otitidis-caviarum GCGGCCGC
Mutasi DNA
Kelainan keturunan
Kasus perselingkuhan (hal. 51)
Kasus perkosaan (hal 52)
Kasus perkosaan (hal. 53)
MINI-SATELIT
Variable Number Tandem Repeat (VNTR)
-Pada kromosom manusia ada sequens pendek yang diulang

-Ulangan : dari 1-30 ulangan

-Dapat dipotong pada variasi jumlah tandem repeat: dengan cara

- hibridisasi dan probe spesifik

“TAAGGGCCATAAGGGCCATAAGGGCCA”
VNTR
 VNTR

Ayah

Ibu

Ayah ---------------Anak------------------ Ibu

VNTR

Single locus:
-memperlihatkan locus-tunggal probe VNTR sangat mudah
diinterpretasikan untuk setiap individu dengan band yang tidak
lebih dari dua

-Digunakan di Amerika untuk penyidikan forensik dan jejak

keturunan

Multi locus:
-Memperlihatkan locus-multi probe VNTR, banyak informasi
yang dapat dibaca secara simultan dengan band antara 10-30
Tetapi agak susah interpretasinya

-Digunakan di Eropa untuk penyidikan forensik dan jejak

keturunan