ASAM AMINO DAN

PEPTIDA

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 TUJUAN INSTRUKSIONAL UMUM

Setelah mempelajari mata kuliah ini mahasiswa dapat

menjelaskan struktur dan fungsi biomolekul-
biomolekul (meliputi asam nukleat, protein, lipid dan
karbohidrat), enzim, mekanisme dan kinetika enzim,
serta komunikasi selular.

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 TUJUAN INSTRUKSIONAL KHUSUS

Setelah mempelajari mata kuliah ini mahasiswa

dapat menjelaskan struktur asam amino dan
polipeptida.

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 MATERI BAHASAN

 Struktur asam amino

 Klasifikasi asam amino
 Titrasi asam amino
 Ikatan peptida
 Polipeptida

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 ASAM AMINO

 Protein adalah polimer asam-

asam amino.
 Ada 20 asam amino penyusun
protein.
 Semua asam amino adalah
asam -amino, kecuali
proline.
 -karbon berikatan dengan
amina primer, gugus
karboksilat dan gugus rantai
samping

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 C-KIRAL ASAM AMINO

Kecuali pada asam amino glicine, -karbon mengikat 4 gugus yang

berbeda.

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 ZWITTERION

 Asam amino memiliki gugus asam dan basa sekaligus, sehingga dapat
bermuatan (+) atau (–).
 Sifat ini disebut dengan zwitterion.
 Bentuk (+) atau (–) sangat tergantung pada pH dan tipe asam amino.

zwitterion

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 KLASIFIKASI ASAM AMINO

Asam amino dikelompokkan berdasarkan sifat gugus

rantai samping.
Kelompok I. Rantai samping non-polar
Kelompok II. Rantai samping polar
Kelompok III. Rantai samping bersifat asam
Kelompok IV. Rantai samping bersifat basa

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Rantai samping non-polar (1)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Rantai samping non-polar (2)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Rantai samping polar (1)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Rantai samping polar (2)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Rantai samping bersifat asam (pada pH 7)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Rantai samping bersifat basa (pada pH 7)

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 STEREOKIMIA ASAM AMINO

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 MUATAN ASAM AMINO

 Asam amino memiliki gugus amina, karboksilat dan

rantai samping yang dapat terprotonasi/
terdeprotonasi.
 Ini menyebabkan asam amino memiliki muatan yang
berbeda pada pH yang berbeda-beda.

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Kurva Titrasi Asam Asetat, Phosphate dan
Ammonia

2-15.html

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Kurva Titrasi Asam Poliprotik

2-16.html

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Kurva Titrasi Glycine

4-8.html

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 KURVA TITRASI ASAM AMINO

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Asam amino adalah hasil translasi gen

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 PEPTIDA

 Protein merupakan polimer yang memiliki asam

amino sebagai monomernya.
 Ikatan Peptida: Ikatan kovalen yang
menghubungkan asam-asam amino untuk
membentuk protein.

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 PEPTIDA

Animation
virtual protein

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 PEPTIDA

Contoh urutan asam amino dalam protein, ditunjukkan

dengan singkatan 3 huruf.

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Istilah-istilah

Residu – istilah yang digunakan untuk menyebutkan

asam amino yang berada dalam protein.
Polipeptida – memiliki 10-100 residu.
Protein – mengandung >100 residu.
 Peptida dan protein yang diisolasi dari sel memiliki ukuran 2-
1000 residu.
 Massa protein biasanya dinyatakan dalam dalton. 1 dalton =
1 atomic mass unit.
 Asam amino memiliki berat rata-rata 110, jadi berat molekul
protein berkisar antara 220 – 110000 (sebagian protein
memiliki berat molekul yang lebih besar lagi).

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 Ukuran Beberapa Protein

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 % dalam
ASAM AMINO BM pI
protein
GLY 75.1 5.97 7.3%
ALA 89.1 6.00 8.4%
ILE 131.2 5.94 5.7%
LEU 131.2 5.98 9.1%
MET 149.2 5.74 2.0%
PHE 165.2 5.48 3.9%
PRO 115.1 6.30 4.6%
VAL 117.2 5.69 7.1%
ASP 133.1 2.77 5.8%
GLU 147.1 3.22 6.8%
ARG 174.2 11.15 5.1%
LYS 146.2 9.59 6.0%
ASN 132.1 5.41 4.3%
CYS 121.2 5.02 1.4%
GLN 146.2 5.65 3.8%
TRP 204.2 5.89 1.4%
SER 105.1 5.68 5.9%
THR 119.1 5.64 5.6%
TYR 181.2 5.66 3.4%
HIS 155.2 7.47 2.2%
Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala
 POLIPEPTIDA BERSIFAT AMPHOLYTES

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 RINGKASAN

 Protein adalah polimer asam-asam amino.

 Asam amino dapat bermuatan + atau – → zwitterion.
 Asam amino dikelompokkan berdasarkan sifat gugus rantai
samping.
 Asam amino memiliki gugus amina, karboksilat dan rantai
samping yang dapat terprotonasi/ terdeprotonasi sehingga
memiliki muatan yang berbeda pada pH yang berbeda-
beda.
 Protein merupakan polimer yang memiliki asam amino
sebagai monomernya yang dihubungkan oleh ikatan
peptida.

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala

 TUGAS

 Buat skema kurva titrasi polipeptida dengan urutan

EKAKD
 Hitung berat molekul rata-rata asam amino penyusun
protein.
 Berapa berat molekul protein yang terdiri dari 100
asam amino, 200 asam amino dan 750 asam amino?

Jurusan Kimia FMIPA Universitas Syiah Kuala