Katabolisme Rangka Karbon dari Asam Amino

MAKALAH

Disusun Untuk Memenuhi Salah Satu Tugas dalam Mata Kuliah

Biosintesis Metabolik Primer dan Sekunder yang Diampu Oleh:

Dr. Anak Agung Istri Ratnadewi, S.Si, M.Si

Disusun Oleh

Mimma Amalia (212520101002)

UNIVERSITAS NEGERI JEMBER

FAKULTAS PROGRAM PASCASARJANA STUDI MAGISTER
BIOTEKNOLOGI

NOVEMBER 2021
 KATA PENGANTAR

Ucapan syukur saya ucapkan

kepada Tuhan yang Maha Esa yang
telah memberikan kelancaran dalam
menyelesaikan makalah ini. Ucapan
terima kasih saya haturkan kepada Dr.
Anak Agung Istri Ratnadewi, S.Si,
M.Si selaku dosen mata kuliah
biosintesis metabolik primer dan
sekunder yang telah membimbing saya
dalam perkuliahan, sehingga makalah
ini selesai tepat pada waktunya.
Makalah ini membahasa tentang katabolisme rangka
karbon dari asam amino. Saya yakin bahwa dalam penulisan
makalah ini terdapat banyak kekurangan. Namun demikian,
semoga makalah ini memberi manfaat bagi kita semua.

Jember, 22
November 2021

i
 ( Mimma Amalia )

ii
ii
 BAB I
PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Protein merupakan
molekul terbanyak dan
mempunyai fungsi yang
berbeda dalam suatu sistem
kehidupan. Protein adalah
makromolekul yang terdiri dari
dua atau lebih polipeptida.
Asam amino merupakan hasil
hidrolisis dari suatu protein
yang menghasilkan kurang
lebih 20 macam asam amino
dengan konfigurasinya berupa
L-alfa. Semua asam amino
yang terdapat dalam molekul
protein berkonfigurasi L,
sedangkan gugus aminnya
(NH2) dan gugus karboksilnya
(COOH) terikat pada atom C-
alfa (Ferrier, D. R, 2014).
Asam Amino terdiri dari asam
amino esensial dan non
esensial. Asam amino essensial
adalah asam amino yang tidak
dapat disintesis oleh tubuh
sehingga diperoleh dari
makanan yang dikonsumsi.

1
Sedangkan asam amino non
esensial adalah asam amino
yang dapat disintesis oleh tubuh
sintase (Nelson, D & Cox, M,
2012).
Sumber-sumber asam
amino di dalam tubuh manusia
berasal dari protein makanan,
sintesis asam amino esensial
dan non esensial,serta
pemecahan protein jaringan
(degradasi). Asam amino yang
telah terbentuk mengalami
degradasi oksidativ berupa
transaminasi yang akan
membentuk urea, asetil KoA,
TCA intermedier dan glukosa
dala jalur katabolisme. Jalur
katabolisme asam amino,
secara bersama-sama, biasanya
hanya menyumbang 10%
sampai 15% dari produksi
energi tubuh manusia. Fluks
melalui jalur katabolik ini juga
sangat bervariasi, tergantung
pada keseimbangan antara
kebutuhan untuk proses
biosintetik dan ketersediaan
asam amino tertentu (Nelson, D
& Cox, M, 2012). Oleh karena

2
 itu dalam makalah ini akan
dibahas mengenai degredasi
oksidativ berupa transaminasi
yang akan membentuk asetil
KoA dan intermediet TCA atau
proses katabolisme rangka
karbon dari asam amino.

1.2 Rumusan Masalah

1.2.1 Apakah yang dimaksud dengan asam amino
glukogenik dan ketogenik?
1.2.2 Bagaimana asam amino triptofan, lisin, fenilalanin,
tirosin, leusin, isoleusin, dan treonin dapat
menghasilkan asetil-KoA atau asetoasetil-KoA ?
1.2.3 Bagaimana asam amino alanin, triptofan, sistein,
serin, glisin, dan treonin dapat diubah menjadi
piruvat?
1.2.4 Bagaimana asam amino prolin, glutamat, glutamin,
arginin, dan histidin memasuki siklus asam sitrat
sebagai α -ketoglutarat?
1.2.5 Bagaimana asam amino metionin, isoleusin, treonin,
dan valin didegradasi hingga menghasilkan
suksinil-KoA?
1.2.6 Bagaimana asam amino asparagin dan aspartat
didegradasi hingga menjadi oksaloasetat?

1.3 Tujuan Penulisan

1.3.1 Untuk mengetahui pengertian asam amino

3
glukogenik dan ketogenik.
1.3.2 Untuk mengetahui tahapan-tahapan asam amino
triptofan, lisin, fenilalanin, tirosin, leusin, isoleusin,
dan treonin dapat menghasilkan asetil-KoA atau
asetoasetil-KoA.
1.3.3 Untuk mengetahui tahapan-taapan asam amino
alanin, triptofan, sistein, serin, glisin, dan treonin
dapat diubah menjadi piruvat.
1.3.4 Untuk megetahui tahapan-tahapan asam amino
prolin, glutamat, glutamin, arginin, dan histidin
memasuki siklus asam sitrat sebagai α –ketoglutarat
1.3.5 Untuk megetahui tahapan-tahapan asam amino
metionin, isoleusin, treonin, dan valin didegradasi
hingga menghasilkan suksinil-KoA.
1.3.6 Untuk megetahui tahapan-tahapan asam amino
asparagin dan aspartat didegradasi hingga menjadi
oksaloasetat.

BAB II
PEMBAHASAN

2.1 Asam Amino Glukogenik dan Ketogenik

Tujuh asam amino berupa fenilalanin, tirosin,
isoleusin, leusin, triptofan, treonin, dan lisin yang
didegradasi menjadi asetoasetil KoA atau asetil-Koa
dapat menghasilkan badan keton di hati, di mana
asetoasetil-KoA diubah menjadi asetoasetat dan kemudian

4
menjadi aseton. Ini adalah asam amino ketogenik.
Kemampuan mereka untuk membentuk badan keton
sangat jelas pada diabetes mellitus yang tidak terkontrol,
di mana hati menghasilkan sejumlah besar badan keton
dari asam lemak dan asam amino ketogenik. Asam amino
ketogenik tidak dapat menghasilkan glukosa. Karena,
tubuh keton yang mereka hasilkan terdegradasi menjadi
karbon dioksida dalam siklus asam sitrat pada akhirnya.

Gambar 1. Asam amino glukogenik dan ketogenik

Asam amino yang

terdegradasi menjadi piruvat, α-
ketoglutarat, suksinil-KoA,
fumarat, dan oksaloasetat dapat
diubah menjadi glukosa dan

5
 glikogen. Mereka adalah asam
amino glukogenik. Asam amino
triptofan, fenilalanin, tirosin,
treonin, dan isoleusin keduanya
bersifat ketogenik dan
glukogenik sedangkan sisanya
bersifat glukogenik.
Katabolisme asam amino
sangat penting untuk
kelangsungan hidup hewan
dengan diet protein tinggi atau
selama kelaparan. Leusin
adalah asam amino ketogenik
eksklusif yang sangat umum
dalam protein. Degradasinya
memberikan kontribusi besar
terhadap ketosis dalam kondisi
kelaparan.

2.2 Asam Amino Triptofan, Lisin, Fenilalanin, Tirosin,

Leusin, Isoleusin, dan Treonin Menghasilkan Asetil-
KoA atau Asetoasetil-KoA

6
Gambar 2. Asam Amino Triptofan, Lisin, Fenilalanin, Tirosin, Leusin, Isoleusin, dan
Treonin Menghasilkan Asetil-KoA atau Aseto asetil-KoA.

Bagian kerangka karbon

dari tujuh asam amino seperti
triptofan, lisin, fenilalanin,
tirosin, leusin, isoleusin, dan
treonin dapat menghasilkan
asetil-KoA dan asetoasetil-
KoA. Beberapa langkah
terakhir dalam jalur degradatif
untuk leusin, lisin, dan triptofan
menyerupai langkah-langkah
dalam oksidasi asam lemak.
Triptofan diubah menjadi
alanin dengan melepaskan dua
molekul CO2. Alanin diubah
menjadi piruvat dengan
melepaskan ion NH3+. Triptofan
diubah menjadi α -ketoadipat
dalam 9 steps dan lisin juga
diubah menjadi α -ketoadipat

7
 dalam 4 steps. Setelah itu α –
ketoadipat diubah menjadi
Glutaryl-KoA dengan
menambahkan gugus S-CoA
disertai dengan proses reduksi
NAD+ menjadi NADH.
Fenilalanin diubah menjadi
tirosin dengan penambahan
gugus OH. Tirosin bereaksi
dengan fumarat dalam 5 steps
menghasilkan asetoasetat.
Asetoasetat bereaksi dengan
CoA-SH membentuk
Asetoasetil CoA. Leusin
bereaksi dengan CoA-SH
melepaskan CO2 asetyl CoA
dalam 6 steps. Isoleusin
melepaskan CO2 dan ion NH3+
membentuk propionil CoA dan
diubah menjadi suksinil CoA
dalam 3 steps.

2.3 Asam Amino Alanin, Triptofan, Sistein, Serin, Glisin,

dan Treonin Diubah Menjadi Piruvat
Kerangka karbon dari
enam asam amino diubah
seluruhnya atau sebagian
menjadi piruvat. Piruvat
kemudian dapat diubah menjadi
asetil KoA dan akhirnya

8
dioksidasi melalui siklus asam
sitrat, atau menjadi oksaloasetat
dan didorong ke dalam
glukoneogenesis. Keenam asam
amino tersebut adalah alanin,
triptofan, sistein, serin, glisin,
dan treonin. Alanin
menghasilkan piruvat langsung
pada transaminasi dengan
-ketoglutarat, dan rantai
samping triptofan dibelah untuk
menghasilkan alanin dan
piruvat. Sistein diubah menjadi
piruvat dalam dua langkah
yaitu satu menghilangkan atom
belerang, yang lain adalah
proses transaminasi. Serin
diubah menjadi piruvat oleh
serin dehidratase. Gugus
hidroksil dan amino dari serin
dihilangkan dalam reaksi
tunggal yang bergantung pada
fosfat piridoksal.
Glisin terdegradasi melalui
tiga jalur, hanya satu yang
mengarah ke piruvat. Glisin
diubah menjadi serin dengan
penambahan enzimatik dari
gugus hidroksimetil. Reaksi ini,
dikatalisis oleh serin

9
hidroksimetiltransferase,
membutuhkan koenzim
tetrahidrofolat dan piridoksal
fosfat. Serin diubah menjadi
piruvat. Pada jalur kedua, yang
mendominasi pada hewan,
glisin mengalami pembelahan
oksidatif menjadi CO2, NH4+,
dan gugus metilen Reaksi yang
mudah dibalik ini, dikatalisis
oleh enzim pembelahan glisin
(juga disebut glisin sintase),
juga membutuhkan
tetrahidrofolat, yang menerima
gugus metilen. Dalam jalur
pembelahan oksidatif ini, dua
atom karbon glisin tidak
memasuki siklus asam sitrat.
Satu karbon hilang sebagai CO2
dan yang lainnya menjadi
gugus metilen dari N5,N10-
metilenatetrahidrofolat dan
donor gugus satu karbon dalam
jalur biosintetik tertentu.

10
Gambar 3. Alanin, Triptofan, Sistein, Serin, Glisin, dan Treonin Diubah Menjadi Piruvat

Pada jalur ketiga dan terakhir dari degradasi glisin, molekul glisin akiral merupakan
substrat untuk enzim D-asam amino oksidase. Glisin diubah menjadi glioksilat,
substrat alternatif untuk dehidrogenase laktat hepatik. Glioksilat dioksidasi dalam
reaksi yang bergantung pada NAD menjadi oksalat:

Gambar 4. Glisin Diubah Menjadi Oksalat

2.4 Asam Amino Alanin, Triptofan, Sistein, Serin, Glisin,

dan Treonin Diubah Menjadi Piruvat.

11
Gambar 5. Alanin, Triptofan, Sistein, Serin, Glisin, dan Treonin Diubah Menjadi Piruvat

Kerangka karbon dari

lima asam amino (prolin,
glutamat, glutamin, arginin, dan
histidin) memasuki siklus asam
sitrat sebagai α -ketoglutarat.
Prolin, glutamat, dan glutamin
memiliki kerangka lima karbon.
Struktur siklik prolin dibuka
dengan oksidasi karbon yang
paling jauh dari gugus
karboksil untuk membuat basa
Schiff, kemudian hidrolisis
basa Schiff menjadi

12
semialdehid linier, glutamat
semialdehida. Zat antara ini
selanjutnya dioksidasi pada
karbon yang sama untuk
menghasilkan glutamat. Aksi
dari enzim glutaminase atau
salah satu dari beberapa reaksi
enzim di mana glutamin
menyumbangkan nitrogen
amidanya ke akseptor,
mengubah glutamin menjadi
glutamat. Transaminasi atau
deaminasi glutamat
menghasilkan α-ketoglutarat.
Arginin dan histidin
mengandung lima karbon yang
berdekatan dan karbon keenam
yang terikat melalui atom
nitrogen. Oleh karena itu,
konversi katabolik asam amino
ini menjadi glutamat sedikit
lebih kompleks daripada jalur
dari prolin atau glutamin.
Arginin diubah menjadi
kerangka lima karbon ornitin
dalam siklus urea dan ornitin
ditransaminasi menjadi
glutamat semialdehida.
Konversi histidin ke glutamat
lima karbon terjadi dalam jalur

13
 multistep.

2.5 Asam Amino Metionin, Isoleusin, Treonin, dan Valin

Didegradasi Hingga Menghasilkan Suksinil-KoA.
Kerangka karbon
metionin, isoleusin, treonin,
dan valin didegradasi oleh jalur
yang menghasilkan suksinil-
KoA yang merupakan zat
antara dari siklus asam sitrat.
Metionin menyumbangkan
gugus metilnya ke salah satu
dari beberapa akseptor yang
mungkin melalui S
adenosilmetionin, dan tiga dari
empat atom karbon yang tersisa
diubah menjadi propionat
propionil-KoA, prekursor
suksinil-KoA. Isoleusin
mengalami transaminasi,
diikuti oleh dekarboksilasi
oksidatif dari asam keto yang
dihasilkan. Kerangka lima
karbon yang tersisa dioksidasi
lebih lanjut menjadi asetil-KoA
dan propionil-KoA. Valin
mengalami transaminasi dan
dekarboksilasi, kemudian
serangkaian reaksi oksidasi
yang mengubah empat karbon

14
yang tersisa menjadi propionil-
KoA. Beberapa bagian dari
jalur degradatif valin dan
isoleusin sangat mirip dengan
langkah-langkah dalam
degradasi asam lemak. Dalam
jaringan manusia, treonin juga
diubah dalam dua langkah
menjadi propionil-KoA. Ini
adalah jalur utama untuk
degradasi treonin pada
manusia. Mekanisme langkah
pertama analog dengan yang
dikatalisis oleh serin
dehidratase, dan serin dan
treonin dehidratase sebenarnya
adalah enzim yang sama.
Propionil-KoA yang diturunkan
dari ketiga asam amino ini
diubah menjadi suksinil-KoA
yang mana terjadi reaksi
karboksilasi menjadi
metilmalonil-KoA, epimerisasi
metilmalonil-KoA, dan
konversi menjadi suksinil-KoA
oleh metilmalonil yang
bergantung pada koenzim B12-
CoA mutase.

15
Gambar 6. Metionin, Isoleusin, Treonin, dan Valin Didegradasi Hingga Menghasilkan
Suksinil-KoA

2.6 Asam Amino Asparagin dan Aspartat Didegradasi Hingga Menjadi Oksaloasetat
Kerangka karbon
asparagin dan aspartat akhirnya
memasuki siklus asam sitrat
sebagai malat pada mamalia
atau oksaloasetat pada bakteri.
Enzim asparaginase
mengkatalisis hidrolisis
asparagin menjadi aspartat,
yang mengalami transaminasi

16
 dengan ketoglutarat untuk
menghasilkan glutamat dan
oksaloasetat. Oksaloasetat
diubah menjadi malat di sitosol
dan kemudian diangkut ke
dalam matriks mitokondria
melalui transporter malat-
ketoglutarat. Pada bakteri,
oksaloasetat yang dihasilkan
pada reaksi transaminasi dapat
digunakan secara langsung
dalam siklus asam sitrat.

Gambar 7. Asam Amino Asparagin dan Aspartat Didegradasi Hingga Menjadi Oksaloasetat

17
 BAB III
PENUTUP

3.1 Kesimpulan
Katabolisme rangka karbon
dari asam amino glukogenik
dan ketogenik atau proses
degradasi oksidatif asam amino
hingga membentuk asetil KoA
dan intermediet TCA
melibatkan beberapa degradasi
asam amino untuk membentuk
asam amino yang lain
diantaranya adalah sebagai
berikut:
a. Asam amino triptofan, lisin, fenilalanin, tirosin, leusin, isoleusin, dan
treonin menghasilkan asetil-koa atau asetoasetil-koa
b. Asam amino alanin, triptofan, sistein, serin, glisin, dan treonin diubah
menjadi piruvat
c. Asam amino alanin, triptofan, sistein, serin, glisin, dan treonin diubah
menjadi piruvat
d. Asam amino metionin, isoleusin, treonin, dan valin didegradasi hingga
menghasilkan suksinil-koa
e. asam amino asparagin dan aspartat didegradasi hingga menjadi
oksaloasetat

3.2 Saran

18
 Harapannya makalah ini dapat diperbaiki lagi dan
bermanfaat bagi pembaca.

19
 DAFTAR PUSTAKA

Nelson, D. L., & Cox, M. M. 2012. Lehninger Principles Of Biochemistry (6 ed.).

USA: Macmillan Learning.
Ferrier, D. R. 2014. Lippincotts's Illustrated Reviewers
Biokimia Edisi ke-6, Jilid 1.Binarupa Aksara:
Tanggerang
Wahjuni, Sri. 2013. Metabolisme Biokimia. Udayana
University Press: Bali.

20