SEMINAR PROPOSAL PENELITIAN

FILOGENI BURUNG KUTILANG EMAS (Pynonotus melanicterus)

BERDASARKAN GEN DLOOP DNA MITOKONDRIA

Aqilah Fasha Adnindia

F1D019035
Dosen Pembimbing Utama Dosen Pembimbing Pendamping
Dr. Jarulis, S.Si., M.Si Drs. Hery Haryanto, M.Sc

Dosen Penguji 1 Dosen Penguji 2

Santi Nurul Kamilah, S.Si., M.Si Dian Fita Lestari, S.Pd., M.Sc

PROGRAM STUDI S1 BIOLOGI

JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS BENGKULU
2023
 LATAR BELAKANG

DLOOP

Pycnonotus melanicterus.
Sumber : Grewal,2002 DNA MITOKONDRIA
Sumber : (Taylor dan
Turnbull, 2005).
RUMUSAN MASALAH

Pynonotus melanicterus memiliki status konservasi

resiko rendah dan penurunan populasi dikarenakan
adanya eksploitasi berlebihan, penebangan hutan untuk
pembukaan lahan akibatnya tempat tinggal dan habitat
mereka hilang , maka dari itu dilakukan penelitian ini
untuk mengetahui data genetik dengan mengetahui
variasi genetik kutilang emas (Pycnonotus melanicterus)
berdasarkan gen D-loop yang berasal dari Bengkulu.
TUJUAN DAN MANFAAT
TUJUAN
Tujuan penelitian ini yaitu untuk
mengetahui filogeni burung
kutilang emas (Pycnonotus
melanicterus) berdasarkan gen
D-loop (Displacement Loop)
pada DNA mitokondria dan
mengetahui hubungan
kekerabatan antar individu
burung Kutilang Emas
(Pycnonotus melanicterus)
dengan spesies pembanding yang
lainnya.
MANFAAT
Penelitian ini dapat memberi informasi
mengenai filogeni burung kutilang
emas (Pycnonotus melanicterus)
berdasarkan gen D-loop
(Displacement Loop) pada DNA
mitokondria yang dimana akan
menjadi data genetik untuk
kutilang emas (Pycnonotus
melanicterus) di Bengkulu.
 METODELOGI PENELITIAN

- WAKTU - TEMPAT

AKAN DILAKSANAKAN
PADA BULAN APRIL – JUNI
2023

Laboratorium Zoologi dan Laboratorium Bioteknologi dan

Genetika, Jurusan Biologi, Basic Science, Fakultas
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas
Bengkulu
 ALAT

FREEZER MIKROPIPET MIKROTUBE

ELEKTROFORESIS HOT PLATE INKUBATOR

TIMBANGAN
SPIN COLUMN STOPWATCH ANALITIK
MESIN PCR MIKROTIP PISTIL CENTRIFUGE

TUBE JARUM SUNTIK

UV TRANSLUMINATOR
VORTEX
 BAHAN

AL ATL AW 1 AW 2 AE EDTA ETOH

EtBr

GEL AGAROSE Kit Go-taq Green LARUTAN GULA MASKER Nuclease-free water PROTEINASE K PRIMER GEN
master mix DLOOP

SARUNG TANGAN MEDIS SAMPEL DARAH TAE TISSUE

PROSEDUR KERJA

TAHAP LISIS

• SAMPEL DARAH 25 µl,

1

• Ditambah ATL 200 µl,

2

• Digerus
3

• Ditambahkan proteinase K 20µl

4

• Divorteks
5

• Di inkubasi 56˚C (2 jam)

6
PROSEDUR KERJA

PENGIKATAN DNA

• Ditambahkan AL 200µl,
1

• Divorteks 30 detik,
2

• Diinkubasi 10 menit
3

• Ditambah ETOH 200µl

4

• Didinginkan dalam lemari es

5
PROSEDUR KERJA

PENCUCIAN DNA

• Supernatan dimasukkan ke dalam spin column,

1

• Disentrifuge 8000 rpm (1 menit),

2

• Ditambah 500 µl AW 1
3

• Disentrifuge 8000 rpm (1 menit),

4

• Ditambah 500 µl AW 2
5

• Disentrifuge 13000 rpm (3 menit),

6
PROSEDUR KERJA

TAHAP ELUSI

1 • Ditambah 50 µl AE,

2 • Didiamkan 10 menit,

• Disentrifuge 8000 rpm (1

3
menit),

• DNA hasil elusi siap

4
diamplikasi
AMPLIKASI DNA

Primer
Forward 0,2-
2,5 µl

Kit Gotaq Green Primer Reverse

Master Mix 0,2- 2,5 µl

DNA Template Nuclease- Free

1-5 µl Water 25 µl
SUHU PCR

- - -

PREDENAT DENATURA ANNEALIN DNA Hasil PCR divisualisasi

URASI SI G pada gel agarose 1,2%
(95˚C) 5 (91˚C) 1 (56˚C) 45
MENIT MENIT MENIT menggunakan mesin
elektroforesis

PAST COOLING
ELONGASI ELONGASI (4˚C) 4
(72˚C) 1 (72˚C) 6 MENIT
MENIT MENIT
VISUALISASI PITA DNA

Visualisasi dengan UV transluminator

menggunakan Gel document system

Pita yang terang dan jelas akan di kirim ke PT.

Genetika Science Indonesia

Hasil Sekuansing menggunakan MEGA XI dan

BIOEDIT 7.2
DAFTAR PUSTAKA
TERIMA KASIH