METABOLISME

MIKROBIA

Semua reaksi kimia yang terjadi di

dalam sel mikrobia, yang mencakup
reaksi pembentukan (anabolisme)
dan pembongkaran (katabolisme)
METABOLISME

MOLEKUL BESAR MOLEKUL KECIL

+ E
Reaksi Katabolik
 Melibatkan transfer elektron, yang
memungkinkan energi ditangkap dalam
bentuk ikatan kimia berenergi tinggi dalam
molekul ATP (Adenosin Triphosphate)
Transfer Elektron

 Secara langsung berhubungan dengan

reaksi oksidasi dan reduksi
Cara Mikroba Memperoleh Energi

Cara Memperoleh Energi

Autotrof Heterotrof
 Semua mikroorganisme

CO2 anorganik = sumber karbon Senyawa organik = sumber karbon

AUTOTROF HETEROTROF
(membuat makanan sendiri) (makanan dari luar)
membuat makanan sendiri dengan mereduksi menggunakan molekul organik yang siap
CO2 pakai untuk makanan
 Perbandingan
SUMBER KARBON SUMBER ENERGII

CAHAYA ZAT KIMIA

KARBONDIOKSIDA FOTOLITOTROF KEMOAUTROF

ZAT ORGANIK FOTOORGANOTROF KEMOORGANOTROF

2H2 + O2 2 H 2O
Hidrogen Oksigen Air

Hidrogen adalah donor elektron atau

agen pereduksi

Hidrigen dilepaskan dan digunakan untuk

merekdusi oksigen untuk membentuk air.
ADENOSIN TRI PHOSPHATE
Perbandingan Oksidasi & Reduksi
OKSIDASI REDUKSI
Kehilangan elektron Penambahan elektron

Penambahan oksigen Kehilangan oksigen

Kehilangan hidrogen Penambahan hidrogen

Pembebasan energi Penyimpanan energi dalam bentuk

senyawa tereduksi

Eksothermik, exergonik, Endothermik, endergonik,

memberi energi panas membutuhkan energi, misalnya panas
REAKSI OKSIDASI & REDUKSI
OKSIDASI

TEREDUKSI
TEROKSIDASI

e-
e-
+ +

A B A B
REDUKSI
Enzim: Biokatalisator
Energi

Energi aktivasi tanpa enzim

Energi aktivasi tdengan enzim

Reaktan

Produk

Jalannya reaksi
Enzim: Biokatalisator
NAMA SISTEMATIK AKTIVITAS
Oksidoreduktase Mengkatalisis reaksi oksidasi-reduksi
Transferase Mengkatalisis pemindahan gugus atom dari
satu senyawa ke yang lain
Hidrolase Mengkatalisis hirolisis ikatan peptida, ester, dan
glikosidik

Lyase Mengkatalisis penambahan air, amoniak, dan

CO2 ke senyawa dan juga menghilangkannya

Isomerase Mengkatalisis reaksi isomeri

Ligase Mengkatalisis pembentukan ikatan kovalen
Kerja Enzim

PRODUK

+
SUBSTRAT KOMPLEKS
ENZIM
SUBSTRAT
ENZIM
Struktur Protein
Struktur Protein
Faktor yang mempengaruhi kerja
enzim
 Temperatur
 pH
 Konsentrasi substrat
Hubungan Konsentrasi dengan
Kecepatan kerja Enzim
V (kecepatan)

Vmax
konstan

C (konsentrasi
 LEMAK POLISAKARIDA PROTEIN I

AS.LEMAK & GULA ASAM

GLISEROL SEDERHANA AMINO

II

ATP
Asam piruvat III

CO2
Asetil Co A

SIKLUS
IV
KREB

O2 ETS e-
CO2 ATP
Pengangkutan Nutrien:
Transpor Pasif:Difusi Sederhana

Mula-2 Sesudah
Difusi:Proses perpindahan molekul zat (biasa
zat terlarut) dari konsentrasi tinggi ke
konsentrasi rendah
Osmosis:Perpindahan molekul zat (pelarut) dari
konsentrasi tinggi ke konsentrasi rendah melalui
selaput semipermeabel
Difusi dipermudah
Substances that cannot pass directly through the
plasma membrane diffuse into or out of cells with
the aid of hollow, channel-like proteins in a process
known as facilitated diffusion.
© 1993-2003 Microsoft Corporation. All rights
reserved.

Carier
DIFUSI DIPERMUDAH
Transpor aktif
Transpor aktif
 Pengangkutan berlangsung dari
konsentrasi rendah ke tinggi
 Memerlukan energi
 Enzim Carier &energi
Membran sel
Bioenergetik
 lapangan studi tentang bagaimana energi
diproduksi dan digunakan oleh makhluk
hidup
 Energi yang digunakan oleh makhluk hidup
mungkin dalam bentuk gelombang
elektromagnetik atau tersimpan dalam
bentuk ikatan kimia----ATP atau yang lain
Cara ATP disintesis:
 Fosforilasi tingkat substrat: sintesis ATP
dengan cara Substrat yang mengandung
fosfor memberikan gugus fosfatnya ke ADP

OC
CH2

CHOOH
+ C=O

O Fosfogliserat
ADP ATP
Cara ATP dibuat:
 Fosforilasi oksidatif: Sintesis ATP dengan
cara menggunakan elektron dari substrat
yang teroksidasi
H+
NADH
tereduksi e- ADP+ Pi

H+
e-
NAD+
teroksidasi ATP
Cara ATP dibuat
 Fotofosforilasi: ATP dibuat dengan
menggunakan elektron dari klorofil (zat
hijau daun)
Fotofosforilasi
2e-
ATP

2e-

KLOROFIL
Organisme Chemotroph
 Memperoleh energi dengan mengoksidasi
molekul zat kimia
 Chemoorganotroph: Mikroorganisme yang
menggunakan molekul organik sebagai
donor elektron dalam menghasilkan energi
 Chemolithotroph: menggunakan zat
anorganik (amoniak, hidrogen dan H2S
sebagai donor elektron
Metabolisme: Chemoorganotroph
 Terdapat pada semua sel eukariotik dan
sejumlah besar bakteri
 Menggunakan zat organik sebagai bahan
untuk dioksidasi
 Energi dibebaskan biasanya dalam bentuk
ATP
Mengapa menggunakan karbohidrat?
 Tersedia dapat mudah diperoleh di alam
 Mengandung banyak energi potential
 Contoh oksidasi 1 mol glukosa menjadi
karbondioksida dan air mengeluarkan 688
kcal (Kilocalori) atau 38 mol ATP
Oksidasi glukosa dilakukan dalam 3
tahap
 Tahap I: oksidasi glukosa menjadi 2 asam
piruvat-----hasilnya 2ATP dan 2 NADH (disebut
Jalur Embden Meyerhof atau glikolisis)
 Tahap II: oksidasi asam piruvat menjadi
karbondioksida ----8 NADH, 8H+, 2 FADH2, 2
GTP. Tahap ini disebut siklus Kreb
 Tahap III: oksidasi NADH dan FADH2 dalam
sistem transpor elektron---- 38 ATP
 Ketiga tahap ini disebut RESPIRASI
Jalur Embden-Meyerhof
GLUKOSA

GLUKOSA-6 FOSFAT

FRUKTOSA-6-FOSFAT

FRUKTOSA-1, 6-DIFOSFAT

DIHIDROKSIASETON GLISERALDEHIDA-
FOSFAT 3-FOSFAT
 GLUKOSA

ATP ADP + Pi
P GLUKOSA-6-FOSFAT

P FRUKTOSA-6-FOSFAT
ATP ADP + Pi
P P FRUKTOSA-1,6-DIFOSFAT

P P

DIHIDROKSIASETON GLISERALDEHIDA-
FOSFAT 3-FOSFAT
GLISERALDEHIDA- P
3-FOSFAT NAD+
P
NAD+ & H+

ASAM 1,3
DIFOSFOGLISERAT
P P
ADP + Pi

ATP
ASAM 3
FOSFOGLISERAT P ADP + Pi
ATP
H2O O O
ASAM
FOSFOENOLPIRUVAT H3 OH
P ASAM PIRUVAT
 GLUKOSA

ASAM PIRUVAT
Fermentasi
Clostridium Enterobacter Escherichia Lactobacillus Saccharomyces

Asam Butirat Ethanol Ethanol Asam laktat Ethanol

+ + +
Butanol 2,3 Butanediol Asam laktat CO2
+ + +
Isopropanol Asam format As. suksinat
+ + +
Aceton CO2 + H2 Asam asetat
+
CO2 + H2
CO2
 As.piruvat
NAD
As. Cis Akonitat
CO2
As. Isositrat
NADH + H+ As. Sitrat
NAD+
Asetil Co A
NADH + H2
Co A SIKLUS KREB
As. Oksalosuksinat
As. Oksaloasetat
CO2
As. Malat As. Alpha Ketoglutarat
Co A NAD+
NAD
NADH + H+ CO2 NADH + H2
CoA
As. Fumarat Suksinil Co A
FAD GDP + Pi
FADH2 As. Suksinat GTP
 BAGAN PROSES RESPIRASI
4 e-
4 e-
4 e-

4 e-

10 NADH

FMN
1/2O2 2 FADH2
Fe-S
Cyt.a3 Cyt.C Cyt.b Fe-S CoC
Cyt.C
H2O
Empat elektron (4e-) melewati ETS
 Berasal dari NADPH 3 ATP dihasilkan
 Berasal dari FADH2 2 ATP dihasilkan
 Elektron kemudian lewat melalui ETS yang
menggunakan FAD (Flavin Adenin
Dinukleotida)
Rekapitulasi:
REAKSI ATP/ ENERGI EFISIENSI
GLUKOSA DLM ATP
Fermentasi
Glukosa-As.piruvat-laktat 2 15 kkal 2,2%

Respirasi
Glukosa- 2 as.piruvat 2
2 NADH 6
2 piruvat- 2 AcCoA +2 NADH 6
2 AcCoA- CO2 + 6 H20 24 277 kkal 40,3%
Metabolisme Chemolithotroph
 Prosesnya sama dengan mikroorganisme
chemoorganotroph, hanya mereka
mengoksidasi dan mereduksi senyawa
anorganik
 Contoh Nitrosomonas, menggunakan
amoniak
 Selama oksidasi, amoniak dioksidasi
menjadi ion nitrit
Metabolisme Phototrophic
 Photophosphorilasi cyclic: terjadi pada
bakteri fotosintetik anaerobik bakteri hijau
dan ungu
 Photophosphorilasi noncyclic: terjadi pada
alga, cyanobacteria, dan tumbuhan
 Cahaya diserap

e-

O2 e- Transpor elektron

NADH ATP

C02 Transpor elektron

KARBOHIDRAT
Fotofosforilasi siklik
 Berlangsung dalam membran plasma
(intracytoplasmic membrane) yang
mengandung pigmen bacteriochlorophyl
atau bacteriopurpurin
Fotofosforilasi
2e-
ATP

REAKSI
2e- SINTESIS

KLOROFIL
Sintesis NADPH dengan oksidasi
Sulfida
e- NADP+

e-
NADH + H+

e- REAKSI
SINTESIS
S
H+
FOTOSISTEM

KLOROFIL e-
H2S
Fotosintesis Nonsiklik
 Berlangsung di dalam intracytoplasmic
membrane yang disebut tylakoid
 Memerlukan pigmen
 2e- ADP + P

ATP
ATP NADP+

2e- 2e-
NADH + H+
PS 2
2e-
KLOROFIL
PS 1 1/2O2
2H+
KLOROFIL
FOTOLISIS
2e-
H2O
Biosintesis
 Asimilasi karbon
 Jalur Amphibolik
Asimilasi karbon
 Adalah salah satu aspek penting di dalam
metabolisme mikrobia, karena diperlukan
pada semua reaksi sintesis molekul organik
yang menyusun sel
 Pada mikrobia autotroph senyawa organik
dibangun melalui fiksasi karbondioksida
atau siklus Calvin
 6CO2 3-fosfogliserat
12 ATP
12 mol 12ADP + 12Pi
Difosfogliserat
Ribulose 1,5-difosfat 12 mol
6 mol dengan 5C 12NADPH2
12 NADP
6 ATP
SIKLUS CALVIN
6ADP + 6Pi
Gliseraldehida 3 fosfat
Gliseraldehida 3 fosfat 12 mol

10 mol dengan 3C
2 mol
Gliseraldehida 3 fosfat
Asetil CoA Asam sitrat

Isositrat
Oksaloasetat JALUR AMFIBOLIK

Asetat

Alpha ketoglutarat
Malat Glioxilat

Fumarat
Suksinat
 Cystein Glukosa

Serin 3-Fosfogliserat

Alanin
Glisin Piruvat
Leusin

Purin Asetil CoA Asam lemak

Oksaloasetat Asam sitrat

Suksinat Aspartat Pyrimidin Alpha ketoglutarat

Porfirin Threonin As.glutamat

Cytokrom/klorofil Isoleusin Glutamin