OLEH:
KELOMPOK VIII
Metode produksi senyawa aktif melalui teknik kultur jaringan dipandang lebih efisien
jika dibandingkan dengan cara konvensional. Bahan yang diperoleh dengan teknik kultur
jaringan dalam keadaan seragam sehingga tidak ada masalah dalam standarisasi. Dengan teknik
kultur jaringan juga dapat dilakukan perekayasaan sehingga diperoleh senyawa aktif dengan
kualitas yang lebih baik dibandingkan dengan cara konvensional. Salah satu teknik kultur
jaringan untuk produksi metabolit sekunder adalah kultur akar rambut (Hairy Root Culture).
Kultur akar rambut adalah induksi pembentukan struktur akar rambut dengan menginfeksikan
Agrobacterium rhizogenes pada tanaman yang akan dikultur. Agrobacterium mempunyai
kemampuan untuk mentransfer sebagian bahan DNA nya pada sel tanaman melalui pelukaan.
DNA yang ditransfer disebut dengan T-DNA merupakan potongan beberapa ratus kilo basa dari
plasmid yang dikenal dengan Ri plasmid (root inducing plasmid) (Wahyuni dkk., 2015).
Kelebihan teknik kultur akar rambut dibandingkan dengan teknik yang lain adalah relatif
seragam, memiliki kestabilan genetik yang tinggi, dan dapat menggunakan medium tanpa
penambahan zat pengatur tumbuh,di samping itu mudah dimanipulasi untuk meningkatkan
produktivitasnya (Toruan-Mathius dkk., 2006). Pada makalah ini akan dibahas mengenai kultur
akar rambut pada Atropa belladonna untuk memproduksi alkaloid tropan berdasarkan dua
jurnal acuan. Jurnal acuan pertama dilakukan manipulasi untuk meningkatkan produktivitasnya
dengan cara elisitasi menggunakan elisitor nitrat. Sedangkan jurnal acuan dua dilakukan
peningkatan produksi alkaloid tropan dengan menggunakan ekspresi gen pmt dan h6h. Berikut
adalah pemaparan mengenai metode dan hasil masing-masing jurnal.
3.1 Jurnal Acuan I
A. Metode Kultur Jaringan
Pada penelitian yang dilakukan oleh Chashmi et al (2010) dilakukan penelitian
mengenai pengaruh konsentrasi nitrat pada produksi dua alkaloid tropan yaitu scopolamine dan
atropine. Metode ini disebut dengan elisitasi. Elisitasi merupakan teknik untuk menginduksi
secara simultan pembentukan metabolit sekunder. Elisitasi dapat dilakukan dengan
menambahkan elisitor. Elisitor merupakan suatu senyawa biologis dan non biologis yang dapat
menyebabkan peningkatan produksi metabolit sekunder bila ditambahkan pada tumbuhan atau
kultur (Buitelaar et al., 1991). Adapun tahap-tahap yang dilakukan adalah yaitu biji Atropa
belladonna direndam dengan alkohol 70% selama 70 detik dan natrium hipoklorit selama 20
menit, kemudian dibilas dengan air suling steril lebih dari lima kali. Biji yang telah disterilkan
ditanam ke dalam media MS untuk perkecambahan. Planlet yang diperoleh disubkultur pada
media MS yang ditambahkan dengan 3% sukrosa; 0,1 mg/L IAA, dan 1 mg/L BA. Kultur
tersebut diinkubasi pada suhu 28oC dengan pencahayaan 16 jam selama sehari. Hasil tunas yang
diperoleh lalu dikultur pada media MS yang telah ditambahkan 0,2 mg/L IAA dan dengan
konsentrasi KNO3 yang berbeda (0, 15, 35, dan 95 mM). Kultur tersebut diinkubasi pada suhu
28oC dengan pencahayaan 16 jam/hari selama 28 hari. Seluruh tanaman dipisahkan dari
medium, kemudian berat tunas dan akar, tinggi dan panjang akar tanaman diukur (Chashmi et
al, 2010).
a. Transformasi Tanaman
Eksplan daun yang diinfeksi dengan Agrobacterium rhizogenes AR15834 ditanam
dalam media MS tanpa hormon dan mengandung sefotaksin 200 mg/L. Eksplan daun yang tidak
terinfeksi ditanam juga dalam media sebagai kontrol. Pertumbuhan akar rambut dimulai dua
minggu inokulasi. Akar yang muncul pada eksplan dipindahkan ke media. Transgenik akar
rambut dikonfirmasi dengan menggunakan teknik PCR dan menggunakan spesifik primer rolB.
Tingkat perumbuhan akar rambut dan kontrol diukur sampai 14 hari pada media MS tanpa
hormon. Akar rambut diberikan nitrat dengan konsentrasi yang berbeda (0, 15, 35, dan 95 mM)
dalam 100 mL labu yang mengandung 30 mL medium MS tanpa hormon. Kultur diinkubasi
dalam ruang gelap pada suhu 27oC pada pengocok orbital dengan kecepatan 110 rpm selama
dua minggu. Setelah itu, akar ditimbang dan disimpan untuk ekstraksi alkaloid tropan (Chashmi
et al, 2010).
b. Ekstraksi dan Analisis Kandungan Alkaloid Tropan
Ekstraksi alkaloid tropan dilakukan dengan cara refluks menggunakan etanol 96% yang
kemudian diuapkan. Residu kering dilarutkan dengan H2SO4 5% dan dietil eter (1:1). Kemudian
fase air tidak berwarna dikumpulkan dan nilai pH nya disesuaikan hingga 10 dengan
menggunakan NaOH 10 mM. Kemudian ditambahkan CHCl3 dan digoyangkan. Fase CHCl3
dikumpulkan dan diuapkan. Residu kering kemudian dianalisis. Analisis kuantitatif atropine
dan skopolamin menggunakan HPLC (Chashmi et al, 2010).
c. Uji Klorofil dan Antosianin
Klorofil diekstraksi dengan 80% aseton dari sampel daun (Arnon, 1949). Ekstraknya
disaring dan kandungan klorofil a dan b ditentukan dengan spektrofotometri pada panjang
gelombang 645 dan 663 nm. Kandungan klorofil dinyatakan sebagai mg/g FW. Kemudian
dilakukan ekstraksi antosianin. Sampel daun dihomogenkan dalam mortir menggunakan
stamper dengan tambahan 3 mL 1% HCl:metanol (1:99, v / v). Sampel yang telah homogen
disentrifugasi pada 15000 × g selama 30 menit pada suhu 4oC, kemudian supernatan tersebut
disaring melalui kertas Whatman No.1 untuk menghilangkan partikel dan disimpan dalam
kondisi gelap pada suhu 3°C selama semalam. Jumlah antosianin ditentukan dari absorbansi
pada panjang gelombang 550 nm dengan menggunakan koefisien ekstingsi antosianin (ε=33000
cm-2 mol-1) (Chashmi et al, 2010).
d. Analisis Statistik
Semua data dianalisis dengan menggunakan perangkat lunak MSTAT-C. Duncan’s
multiple range test digunakan untuk mengukur perbedaan secara statistik antara kelompok
perlakuan dan kontrol dimana nilai P ≤ 0,05 atau P ≤ 0,01 dianggap berbeda secara signifikan
(Chashmi et al, 2010).
B. Hasil
a. Pertumbuhan Akar Rambut
Tingkat pertumbuhan akar rambut pada media MS cair diukur sampai 14 hari. Pada
periode ini tingkat pertumbuhan akar transgenik adalah 0,68 g/hari, sedangkan 0,09 g/hari untuk
kontrol (akar tanaman planlet). Disimpulkan bahwa akar tanaman yang terinfeksi tumbuh 7,6
kali lebih cepat daripada kontrol yang tidak terinfeksi (Chashmi et al, 2010).
C. Pembahasan
Pertumbuhan dan akumulasi alkaloid dipengaruhi oleh konsentrasi nitrat. Penerapan
konsentrasi rendah nitrat dalam media kultur menyebabkan meningkatnya kandungan alkaloid
pada akar rambut A. belladonna. Rasio atropin/skopolamin juga dipengaruhi oleh komposisi
media kultur. Ketika konsentrasi nitrat dinaikkan rasio atropin/skopolamin pada akar meningkat
1,1-1,5 kali dibandingkan dengan kontrol.
Ketika akumulasi skopolamin dan atropin dianalisis di berbagai organ tanaman Atropa
belladonna dari Vaz, dapat dilihat peningkatan rasio skopolamin/atropin secara bertahap dari
akar ke daun. Hasilnya menunjukkan bahwa ada peningkatan akumulasi skopolamin dan
atropin pada konsentrasi nitrat rendah, dan ini mungkin disebabkan oleh meningkatnya aktivitas
dalam jalur biosintesis senyawa ini, atau penurunan laju degradasi. Pada tanaman Garmestan,
kandungan dua alkaloid lebih tinggi daripada tanaman Vaz; Di sisi lain, kandungan klorofil
tanaman Garmestan lebih tinggi daripada tanaman Vaz. Mendoza dan Terdapat penelitian yang
melaporkan bahwa mungkin ini adalah korelasi antara produksi skopolamin dan aktivitas
fotosintesis dan dikatakan bahwa produksi skopolamin sesuai dengan peningkatan kadar
klorofil dan rasio klorofil a/klorofil b. Di seluruh tanaman, alkaloid tropane dibiosintesis di sel
akar dan ditranslokasi ke daun untuk penyimpanan (Rothe et al, 2003). Tampaknya hilangnya
rasio skopolamin/hyoscyamine pada akar dan peningkatan pada daun berdasarkan perlakuan
nitrat disebabkan oleh pengangkutan komponen ini dari akar ke daun. Kandungan skopolamin
di sisi lain tampaknya lebih dipengaruhi oleh perkembangan tanaman (Demeyer dan Dejaegere,
1992). Pertumbuhan tertinggi selalu dikaitkan dengan produktivitas alkaloid tertinggi. Sebagai
kesimpulan, perubahan kuantitatif dan kualitatif pada hasil alkaloid FW dan tropan pada
tanaman A. belladonna dan akar rambut disebabkan oleh modifikasi konsentrasi nitrat dalam
media. Secara umum, jumlah alkaloid pada tanaman sangat kecil dibandingkan dengan laju
transformasinya sedangkan akar rambut memiliki pertumbuhan yang cepat dibandingkan
dengan kultur umum tanaman ini. Jadi dapat dikatakan bahwa nitrat memiliki pengaruh yang
jelas terhadap kandungan alkaloid dan rasio atropin/skopolamin.
B. Hasil
1. Pembentukan budaya akar rambut dengan / tanpa penambahan berlebihan pada PMT dan
H6H
Daun muda dari A. belladonna yang telah diplanlet sebanyak 4-5 daun (Gambar. 1A)
menunjukkan sensitivitas tinggi pada galur C58C1 (pRiA4 dan PXI) dan A4, akar berubah
muncul dari semua daun yang mengalami pelukaan pada hari ke-10 setelah
terinfeksi strain Agrobacterium (Gambar. 1B dan 1C). Transformasi akar yang diperoleh dari
C58C1 (pRiA4 dan pXI) atau A4 tidak menunjukkan perbedaan morfologi. Akar yang memiliki
banyak percabangan lateral, tumbuh sangat pesat pada media MS tanpa hormon (Gambar.
1D). Berdasarkan morfologi khas akar rambut, akar subkultur diubah oleh Ri plasmid, tapi
yang seharusnya dikonfirmasi pada tingkat molekuler. Sembilan independen berubah (dengan
berlebih dari PMT dan H6H) berbulu klon akar dan dua klon dari akar rambut non-transgenik
dikonfirmasi oleh genom PCR, kemudian masing-masing kultur menggunakan media MS cair
tanpa zat pengatur tumbuh (Gambar. 1E-H). Semua akar dikultur pada media MS cair
maksimum 35 hari setelah inokulasi dalam labu. Berikut ini merupakan hasil dari kultur akar
A. belladonna:
Gambar 3.1. Pembentukan kultur akar rambut dari A. belladonna. A: daun
muda A. belladonna diplantlet dan bebas dari bakteri; B: Akar yang berubah muncul dari
lokasi yang terluka setalah 10 hari terinfeksi Agrobacterium; C: akar yang berubah
tumbuh lagi setalah 20 hari terinfeksi dengan Agrobacterium; D: monoklon akar
berbulu; E&H: kultur akar berbulu dengan media MS cair tanpa penambahan zat
pengatur tumbuh tanaman (E: 10 hari kultur; F: 20 hari kultur; G: 30 hari kultur; H: 35
hari kultur)
C. Pembahasan
Kultur akar rambut dipandang sebagai alat produksi biomassa yang efisien karena akar
rambut yang tumbuh dengan cepat dalam stabilitas genetik dan biosintesisnya (Carvalho dan
Curtis, 1998). Kultur akar rambut memiliki keuntungan untuk produksi metabolit sekunder
dalam jumlah yang banyak dibandingkan dengan tanaman aslinya. Lima gen fungsional yang
terlibat dalam biosintesis TAs masing-masing mengkodekan putresin N-methyltransferase
(PMT), tropinone reduktase I (TR I) dan II (TR II), CYP80F1 dan hyoscyamine 6 β-
hydroxylase (H6H). Hal ini memungkinkan untuk merancang jalur biosintesis TAs pada spesies
tanaman yang diinginkan. Beberapa gen telah digunakan secara genetik untuk memodifikasi
jalur biosintesis TAs dengan spesies tanaman yang berbeda , salah satunya
seperti hyocyamus niger (Zhang et al., 2004), dan spesies Atropa (Rothe et al. ,2003). Di
antara lima gen, PMT dan H6H umumnya dianggap sebagai gen yang digunakan sebagai
enzim. PMT adalah enzim utama pada alkaloid khususnya untuk biosintesis TAs, yang
mengkatalisis N-metilasi untuk membentuk N-methylputrescine
(Hibi et al., 1992). Ekspresi gen PMT telah terbukti sangat penting untuk meningkatkan
produksi alkaloid dalam kultur akar rambut dari Datura metel dan Hyocyamus
muticus (Moyano et al., 2003). Namun, dalam beberapa penelitian, PMT berlebih dalam
kondisi yang sama tidak dapat meningkatkan produksi alkaloid seperti yang
diharapkan. Ditemukan bahwa peningkatan ekspresi PMT saja tidak cukup untuk
meningkatkan produksi alkaloid di tanaman
A. belladonna (Rothe et al., 2003). Overekspresi gen PMT dan gen H6H pada akar
rambut A. belladonna bertujuan untuk meningkatkan produksi hiosiamin dan skopolamin. Pada
tahun 2004, Zhang et al melaporkan bahwa PXI berlebih di akar rambut dari H. niger
meningkatkan produksi hyoscyamine dan skopolamin, dan menemukan bahwa kultur
transgenik akar rambut penambahan kombinasi PMT dan H6H lebih efisien daripada hanya
menggunakan salah satu dari dua gen tersebut (Zhang et al., 2004). Dapat disimpulkan bahwa
ada sinergi antara PMT dan H6H. Misalnya ketika gen H6H saja diekspresikan melalui kultur
transgenik pada tanaman A. belladonna, kandungan alkaloid tropan dari daun maupun batang
hampir secara keseluruhan dapat meningkatkan skopolamin (Yun et al., 1992). Secara teknis,
overekspresi baik itu PMT dan H6H adalah metode alternatif, yang telah terbukti dalam
peningkatan TAs yaitu hyoscyamine dan scopolamine. Sebagai contoh garis akar transgenik T3
dan T13 dapat menghasilkan hyoscyamine dan scopolamine pada tingkat yang lebih
tinggi. Jadi, strategi transformasi double gen akan menjadi hal yang baik dari rekayasa
metabolisme TA biosintesis jalur A. belladonna .
Gambar 3.4. Kandungan TAs di garis akar rambut yang berbeda dan di
akar A. belladonna. T: transgenik garis akar rambut dengan berlebih
dari h6h PMT dan; H: non-transgenik garis akar rambut tanpa
ekspresi h6h PMT dan; WT: akar tipe A liar. tanaman belladonna
Kultur akar rambut transgenik adalah sistem ideal untuk penelitian. Dalam penelitian
pada jurnal ini, dilakukan kultur transgenik akar rambut A. belladonna dengan penambahan
berlebih PMT dan H6H. kultur transgenik akar rambut menunjukkan peningkatan produksi
dari TAs. Dalam penelitian tersebut, transformasi gen ganda yang
mengekspresikan PMT dan H6H berhasil digunakan secara genetik untuk memodifikasi TAs
melalui jalur biosintesis A. belladonna. Kultur transgenik akar rambut
dari A. belladonna diperoleh dalam penelitian ini dapat digunakan sebagai bioreactor untuk
menghasilkan hiosiamin dan skopolamin.
BAB IV
KESIMPULAN
4.1 Kesimpulan
1. Overexpression gen pmt dan h6h menghasilkan kadar alkaloid tropan yang lebih
tinggi daripada perlakuan dengan nitrat. Kadar alkaloid tropan pada kultur sel transgenik
sebesar 3,21 mg/g (2,00 mg/g hyosiamin dan 1 mg/g skopolamin). Kadar alkaloid tropan pada
perlakuan dengan nitrat menghasilkan kadar atropin tertinggi sebesar 0,23 mg/g pada
konsentrasi 35 mM. Kadar skopolamin tertinggi pada kedua kelompok tumbuhan (daun dan
akar) diperoleh dengan konsentrasi nitrat sebesar 15 mM.
2. Konsentrasi nitrat pada kultur akar akan mempengaruhi kadar alkaloid tropan di
dalamnya. Kadar skopolamin menurun dengan meningkatnya konsentrasi nitrat. Kadar atropin
meningkat dengan meningkatnya kadar nitrat, namun pada konsentrasi nitrat sebesar 95 mM,
kadar atropin menurun.
DAFTAR PUSTAKA
Angelova, Z., S. Gorgiev, dan W. Roos. 2006. Elicitation of Plants. Biotechnol & Biotechnol.
20(2):72-83.
Buitelaar, R.M., and Tramper, J.1991. Strategies to improve the production of secondary
metabolite with plants cell culture a literature review. In : Production and exretion of
secondary metabolites by plant cell cultures of Tagetes. p. 6-45
Carvalho EB, Curtis WR. 1998. Characterization of fluid flow resistance in root cultures with
a convective flow tubular bioreactor. Biotechnology and Bioengineering.60:375-384.
Demeyer K. and Dejaegere R. 1992. Effect of The Nitrogen Form Used in The Growth Medium
(NO3–,NH4+) on Alkaloid Production in Datura stramonium L. Plant Soil 147:79-86.
EFSA. 2008. Scientific Opinion of the Panel on Food Additives, Flavourings, Processing Aids
and Food Contact Materials on a request from the Commission on the results of the
study by McCann et al. (2007) on the effect of some colours and sodium benzoate on
children’s behaviour. The EFSA Journal 660, 1-5.
Fu, T. J. 1999. Plant Cell and Tissue Culture for the Production of Food Ingredient. New York:
Kluwer Academic/Plenum Publishers.
Gunawan. L. W. 1988. Teknik Kultur Jaringan. IPB: Laboratorium Kultur Jaringan Tanaman.
Hendaryono dan Wijayani. 1994. Teknik Kultur Jaringan Pengenaan dan Petunjuk
Perbanyakan Tanaman secara Vegetatif Modern. Yogyakarta: Kanisius.
Kramer MS et al, 2009. Health and development outcomes in 6.5 y-old children breastfed
exclusively for 3 or 6 mo. Am J Clin Nutr. vol. 90(4): 1070-1074.
Lambert, E., Ahmad Faizal and Danny Geelen. 2011. Modulation of Triterpene Saponin
Production: In Vitro Cultures, Elicitation, and Metabolic Engineering. Appl Biochem
Biotechnology.
Leliqia N.P., Astuti K.W., Susanti N.M.P., Arisanti C.I.S. 2006. Buku Ajar Farmakognosi.
Jurusan Farmasi Universitas Udayana : Jimbaran. Pp. 2-3.
Mattjik, N. A. 2005. Peran kultur Jaringan Dalam Perbaikan Tanaman. Bogor: IPB.
Moyano E, Jouhikainen K, Tammela P, Palazón J, Cusidó RM, Piñol MT, Teeri TH, Oksman-
Caldentey KM .2003. Effect of pmt gene overexpression on tropane alkaloid
production in transformed root cultures of Datura metel and Hyoscyamus muticus.
Journal of Experimental Botany 54: 203-211
Namdeo, A. G. 2007. Plant Cell Elicitation for Production of Secondary Metabolites: A Review.
Pharmacognosy Reviews. 1(1):69-79.
Nillsson, O., and O. Olsson. 1997. Getting to the root: the role of the Agrobacterium
rhizogenesrol genes in the formation of hairy roots. Physiol Plant 100:463-473.
Pandiangan, D. 2011. Peningkatan Produksi Katarantin Melalui Teknik Elisitasi Pada Kultur
Agregat Sel Catharanthus roseus. Jurnal Ilmiah Sains. 11(2):1-8.
Patel, K., dan D. K. Patel. 2013. Medicine Importance, Pharmacological Actvivites, and
Analytical Aspects of Aloin: A Concise Report. Journal of Acute Disease. 262-269
Payne, G. F., V. Bringi, C. L. Prince, and M. L. Shuler. 1992. Plant Cell and Tissue Culture in
Liquid Systems. New York: John Wiley and Sons.
Rahardja, P. C., dan Wahyu, W. 2003. Aneka Cara Memperbanyak Tanaman. Jakarta:
Agromedia Pustaka.
Rajput, H. 2013. Effects of Atropa belladonna as an Anti-Cholinergic. Nat Prod Chem Res.
1(1): 1-2.
Rothe G, Hachiya A, Yamada Y, Hashimoto T, Dräger B .2003. Alkaloids in plants and root
cultures of Atropa belladonna overexpressing putrescine N‐methyltransferase.
Journal of Experimental Botany 54:2065-2070
Sukma, D. 2004. Karakter Pertumbuhan Akar Rambut (Hairy Root) dari Paria Belut
(Trichosanthes cucumerina var. Anguina) pada Perlakuan Sukrosa dan Kasein
Hidrosilat dalam Media Kultur Jaringan, Sekolah Pasca sarjana IPB, Bogor
Toppi, L.S.D., P. Gorini, G. Properzi, L. Barbieri, and L. Spano. 1996. Production of ribosome
inactivating protein from hairy root cultures of Luffa cyllindrica (L) Roem. Plant Cell
Reports. 15:910-913
Toruan-Mathius, N., dkk. 2004. Kultur Akar Rambut Cinchona ledgeriana dan C. succirubra
dalam Kultur in Vitro. Menara Perkebunan 72(2):72-78.
Ulbricht, C; Basch, E; Hammerness, P; Vora, M; Wylie Jr, J; Woods, J. 2004. An evidence-
based systematic review of belladonna by the natural standard research collaboration.
Journal of herbal pharmacotherapy. 4(4): 61–90.
Wahyuni, D. K., dkk. 2015. Induksi Akar Rambut Gandarusa (Justicia gendarussa Burm. f.)
dengan Perlakuan Perbedaan Lama Waktu Infeksi Agrobacterium rhizogenes strain
YM072001 dan A4T. Jurnal Bioslogos 5(2):38-45.
Yang, C., M. Chen, L. Zeng, L. Zhang, X. Liu, X. Lan, K. Tang dan Z. Liao. 2011. Improvement
of tropane alkaloids production in hairy root cultures of Atropa belladonna by
overexpressing pmt and h6h genes. Plants Omics Journal. 4(1):29-33
Zhang L, Ding RX, Chai YR, Bonfill M, Moyano E, Oksman-Caldentey KM, Xu TF, Wang
ZN Zhang HM, Kai GY, Liao ZH, Sun XF, Tang KX .2004. Engineeringtropane
biosynthetic pathway in Hyoscyamus niger hairy root cultures. Proceedings of the
National Academy of Sciences 17:6786-6791.