Mutasi

DNA
• MUTASI : perubahan susunan basa gen (DNA)
atau kromosom.
• Mutasi menyebabkan perubahan fenotip
mikroorganisme.
• Mutasi tingkat kromosom & gen (DNA)
• Morphological mutations mengubah
morfologi sel atau koloni mikroorganisme.
• Lethal mutations menyebabkan kematian
mikroorganisme.
• Conditional mutations adalah mutasi yang
terekspresi hanya pada kondisi lingkungan
tertentu.
• conditional lethal mutation pada E. coli tidak
terekspresi pada kondisi yang permisif seperti
temperatur yang rendah, tetapi akan
terekspresi pada kondisi restriktif seperti
temperatur tinggi.
• mikroorganisme mutan akan berkembang
normal pada suhu rendah tapi akan mati
pada suhu tinggi.
• Biochemical mutations adalah mutasi yang
menyebabkan perubahan biokimia sel.
• Terjadi inaktivasi biosynthetic pathway pada
mikroorganisme mutan sehingga tidak dapat
berkembang pada medium minimal dan
memerlukan suplemen nutrient.
• Mutan ini disebut dengan auxotrophs, sedang
strain microbial yang dapat berkembang di
medium minimal disebut dengan prototrophs.
Berdasarkan sifatnya mutasi dibagi menjadi :
• Hereditary mutations atau germline mutations
Mutasi yang diturunkan oleh orang tua. Terjadi
pada sel germinal (sel telur & sel sperma)
• Acquired atau sporadic mutations
Mutasi yang didapat dan terjadi pada sel
somatik yang disebabkan oleh mutagen seperti
radiasi sinar UV, 5-bromouracil, methyl-
nitrosoguanidine dan proflavin atau terjadi
kesalahan pada waktu pembelahan sel.
Mutasi berdasarkan proses terjadinya, terdiri dari :
• Spontaneous mutations
Mutasi yang terjadi karena proses natural sel
tanpa adanya mutagen,
contoh : DNA replication errors.
• Induced mutations
Mutasi yang terjadi karena adanya paparan
mutagen (fisik atau kimia)
• Mutasi gen → perubahan instruksi genetik
 protein (-)
 fungsi berubah/tdk berfungsi dgn benar
→ kelainan genetik
Mutasi → efek positif
 jenis protein baru
 adaptasi organisme dpt lebih beradaptasi
terhadap perubahan lingkungan
Contoh : protein baru yg menyebabkan individu &
generasi selanjutnya resisten terhadap strain
bakteri yang baru
• Achondroplasia → mutasi pada gen FGFR3
(fibroblast growth factor receptor).
• Data menunjukkan bahwa kejadian
achondroplasia adalah 7 diantara 242.257
kelahiran.
• Mutations rate sebesar 1,4x10-5 (medium
mutations rates).
• Mutations rates tertinggi adalah pada NF1
(Neurofibromatosis type 1) dan DMD
(Duchenne muscular dystrophy) yaitu 1x10-4
• Mutation rates rendah contohnya adalah
Huntington’s disease (1x10-6).
• Perbedaan mutation rates :
→ target size & hot spots
 MUTASI GEN
A. Point mutation : perubahan satu pasangan
basa (substitusi)
• Transisi : pergantian basa purin oleh
purin, atau pirimidin oleh pirimidin
• Transversi : pergantian purin oleh
pirimidin, atau pirimidin oleh purin
 Transition and Transversion Mutations

• Errors in replication due to base

tautomerization
• Normally AT and GC pairs are formed when
keto groups participate in hydrogen bonds. In
contrast, tautomers produce AC and GT base
pairs
• Mutation as a consequence of tautomerization
during DNA replication.
• The temporary enolization of guanine leads to
the formation of an AT base pair mutant, and a
GC to AT transition mutation occurs.
• The process requires two replication cycles
• The mutation only occurs if the abnormal first-
generation GT base pair is missed by repair
mechanism
 Point mutation
• Silent mutation
Mutasi dimana terjadi perubahan pada 1
pasangan basa yang tidak menyebabkan
perubahan asam amino pada sekuens protein.
Contoh : AGG → CGG (keduanya mengkode
asam amino arginine)
• Missense mutation
Mutasi dimana terjadi perubahan pada 1
pasangan basa yang menyebabkan substitusi
asam amino pada sekuens protein.
• Nonsense mutation
Mutasi dimana terjadi perubahan pada 1
pasangan basa yang menyebabkan substitusi
asam amino menjadi stop codon
 Mutasi frameshift

• Penyisipan atau pengurangan satu pasangan

basa DNA yang menyebabkan perubahan pada
reading frame.
• Terdiri dari insersi, delesi dan duplikasi.
• Insersi
Penambahan basa yang menyebabkan
perubahan jumlah basa pada sekuens DNA.
• Delesi
Pengurangan basa yang menyebabkan
perubahan jumlah basa pada sekuens DNA.
• Duplikasi
Penggandaan basa satu kali atau lebih yang
menyebabkan perubahan sekuens DNA.
 Repeat expansion mutation
• Mutasi yang menyebabkan pengulangan short
DNA sequence beberapa kali.
• Trinucleotide repeat merupakan pengulangan
sekuens DNA yang terdiri dari 3 pasangan basa
• Tetranucleotide repeat terdiri dari 4 pasangan
basa.
• Contoh :
- Huntington’s disease (CAG repeats ≥ 40 pada
HD gene)
- Fragile-X syndrome (CGG repeats ≥ 200 pada
FMR1 gene)
 Induced Mutation
• Base analogs : struktur sama dgn basa
nitrogen & dpt menggabungkan diri pada
rantai polinukleotida yg sdg dibentuk pd
proses replikasi
• Menghambat terbentuknya pasangan basa yg
benar → mutasi
• Contoh : 5-bromouracil (5-BU)
→ analog dari Thymine
• Mengalami tautomeric shift → normal keto
form menjadi enol form
• Enol form hydrogen bonds like cytosine
• Berpasangan basa dgn Guanin
• → ≠ Adenin
If the keto form of 5-BU is incorporated in place
of thymine, its occasional tautomerization to
the enol form (Bue ) will produce an AT to GC
transition mutation
 Specific mispairing
• Specific mispairing is caused when a mutagen
changes a base’s structure and therefore alters
its base pairing characteristics
• Some mutagens in this category are fairly
selective; they preferentially react with some
bases and produce a specific kind of DNA
damage
• Example : methyl-nitrosoguanidine
• Methyl-nitrosoguanidine : an alkylating agent
that adds methyl groups to guanine, causing it
to mispair with thymine
• A subsequent round of replication could then
result in a GC-AT transition
• Other examples : ethylmethanesulfonate &
hydroxylamine
• Hydroxylamine → hydroxylates the C-4
nitrogen of cytosine, causing it to base pair
like thymine
Mutagenesis
oleh Methyl-
nitrosoguanidine
yg menyebabkan
Metilasi guanin
 Intercalating agents
• Intercalating agents distort DNA to induce
single nucleotide pair insertions and deletions
• These mutagens are planar and insert
themselves (intercalate) between the stacked
bases of the helix
• This result in a mutation, possibly through the
formation of a loop in DNA
• Intercalating agents include acridines
such as proflavin and acridine orange
 By pass of replication
Beberapa mutagen & karsinogen, secara
langsung merusak Ikatan hidrogen pasangan basa
sehingga DNA tidak bisa berfungsi sebagai
cetakan/template
contoh : radiasi UV → thymine dimers
Kerusakan DNA → repair mechanism, yang
memperbaiki materi genetik yang rusak
Jika replikasi DNA/siklus sel selesai sblm
pasangan basa yg rusak diperbaiki, maka mutasi
akan menetap & diturunkan
Thymine Dimer terbentuk krn radiasi ultraviolet
 Single gene disorders
• Galactosemia
• Cystic fibrosis
• Alpha-1 antitrypsin deficiency
• Adenosine deaminase (ADA) deficiency
• Huntington’s disease
• Maple syrup urine disease (MSUD)
• Neurofibromatosis 1 (NF1)
• Phenylketonuria (PKU)
 Cont’d …
• Severe combined immunodeficiency
syndrome (SCID)
• Sickle cell disease
• Smith-lemli-opitz syndrome (SLOS)
• Pachyonychia congenital
 Chromosome Abnormalities
• Turner syndrome
• Down syndrome
• Klinefelter syndrome
 Multifactorial diseases
• Colon cancer
• Breast/ovarian cancer
• Alzheimer’s disease
 Achondroplasia
• Mutations in the FGFR3 gene cause achondroplasia.
• The FGFR3 gene provides instructions for making a
protein that is involved in the development and
maintenance of bone and brain tissue.
• Two specific mutations in the FGFR3 gene are
responsible for almost all cases of achondroplasia.
Researchers believe that these mutations cause the
FGFR3 protein to be overly active, which interferes
with skeletal development and leads to the
disturbances in bone growth seen with this disorder
• Autosomal dominant pattern of inheritance
• More than 97% of achondroplasia cases are
caused by one of two mutations (G1138A and
G1138C) in the fibroblast growth factor
receptor 3 (FGFR3) gene, which results in a
specific amino acid substitution, G380R.
• Sporadic cases of achondroplasia have been
associated with advanced paternal age,
suggesting that these mutations occur
preferentially during spermatogenesis.
 Neurofibromatosis type 1
• The NF1 gene provides instructions for
making a protein called neurofibromin.
• This protein is produced in many cells,
including nerve cells and specialized cells
surrounding nerves (oligodendrocytes
and Schwann cells).
• Neurofibromin acts as a tumor suppressor,
which means that it keeps cells from growing
and dividing too rapidly or in an uncontrolled
way. Mutations in the NF1 gene lead to the
production of a nonfunctional version of
neurofibromin that cannot regulate cell
growth and division. As a result, tumors such
as neurofibromas can form along nerves
throughout the body.
• Autosomal dominant pattern of inheritance