1. Berbuah sedikit
Dibandingkan dari tanaman hasil pertumbuhan biji, tanaman hasil sambung pucuk
menghasilkan buah relatif lebih rendah. Biasanya tanaman yang dihasilkan memiliki
ranting yang lebih sedikit sehingga buah yang dihasilkan akan sedikit pula. Makin
banyak percabangan, kemungkinan besar makin banyak buah yang dihasilkan.
2. Tidak berhasil jika batang atas dan bawah tidak kompatibel atau tidak cocok
Dua tanaman yang dikombinasikan haruslah memiliki kedekatan yang sama
misalnya satu spesies namun hanya berbeda varietas dan atau satu genus. Belum
ada yang melaporkan keberhasilan antara tanaman yang berbeda genus tapi masih
dalam satu famili.
Beberapa tanaman kehutanan yang berasal dari metode ini kemungkinan pohonnya
mudah patah akibat ditiup angin. Walaupun mempunyai perakaran yang kuat, tidak
menjamin bagian batang atas tanaman itu kuat.