Anda di halaman 1dari 13

Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

TARGET KERJA OBAT ANTIVIRUS COVID-19: REVIEW

DRUG TARGET OF ANTIVIRUS COVID-19: REVIEW

Purwaniati1*, Aiyi Asnawi1


1
Fakultas Farmasi, Universitas Bhakti Kencana
*Corresponding Author Email: purwaniati@bku.ac.id
DOI: http://dx.doi.org/10.47653/farm.v7i2.172

ABSTRAK
Corona Virus Disease 2019 (COVID-19) yang disebabkan Severe Acute Respiratory Syndrome Corona
Virus 2 (SARS-CoV-2) telah menjadi wabah global. Hingga saat belum ada obat atau vaksin untuk
terapi COVID-19 ini. Upaya penemuan obat baru atau pengujian terhadap obat yang telah ada
mendesak untuk dilakukan. Penentuan target kerja obat antivirus COVID-19 yang tepat menjadi
tantangan tersendiri, karena sebagai virus baru strukturnya belum diketahui secara jelas. Sistematik
review ini dilakukan untuk dapat mengidentifikasi molekul-molekul yang dapat menjadi target kerja obat
antivirus COVID-19. Review ini diawali dengan penelusuran pustaka pada database PubMed dengan
PHQJJXQDNDQ NDWD NXQFL ³6$56-CoV-2 drug target´ 3URWHLQ WDUJHW \DQJ SDOLQJ VHULQJ GLJXQDNDQ GDODP
penelitian, yaitu: Main protease (Mpro) dan angiotensin converting enzyme 2 (ACE2).
Kata Kunci: Target Kerja SARS-CoV-2, COVID-19, Virus Corona

ABSTRACT
Corona Virus Disease 2019 (COVID-19) caused by Severe Acute Respiratory Syndrome Corona Virus
2 (SARS-CoV-2) has become a global pandemic. Until now there is no drug or vaccine for this COVID-
19 therapy. Efforts to find new drugs or test existing drugs are urgent to do. Determining the right target
of COVID-19 antivirus drugs is a challenge because as a new virus the structure is not yet clearly
known. This systematic review was conducted to be able to identify molecules that could be targeted
by COVID-19 antivirus drugs. This review begins with a library search on the PubMed database using
the keyword "SARS-CoV-2 drug target". The target proteins most frequently used in research are main
protease (Mpro) and angiotensin converting enzyme 2 (ACE2).
Keywords: SARS-CoV-2 Drug Target, COVID-19, Coronavirus

PENDAHULUAN
Akhir tahun 2019 hingga batas waktu yang Virus RNA ini dapat menginfeksi unggas,
belum pasti, dunia dilanda wabah virus Corona mamalia dan manusia, kemudian
strain baru. Corona Virus Disease 2019 menyebabkan penyakit akut hingga kronis
(COVID-19) yang disebabkan oleh Severe (Weiss and Leibowitz, 2011)(Yang, Bartlam and
Acute Respiratory Syndrome Corona Virus 2 Rao, 2006). Famili Coronaviridae terdiri dari 4
(SARS-CoV-2). Virus Corona ditemukan pada genus, yaitu: alphacoronavirus,
tahun 1930an (Hudson and Beaudette, 1932) betacoronavirus, gammacoronavirus dan
dan menimbulkan wabah severe acute deltacoronavirus. SARS-CoV-2 seperti halnya
respiratory syndrome (SARS) yang mendunia SARS-CoV termasuk dalam genus
pertama kali pada tahun 2002-2003. Virus betacoronavirus (Belouzard et al., 2012).
Corona memiliki bentuk spherical atau SARS-CoV merupakan betacoronavirus yang
pleomorphic dan merupakan genom RNA mempunyai posisi filogenetik yang unik yang
terbesar diantara virus RNA lainnya (Yang, kemudian dimasukan dalam subgenus
Bartlam and Rao, 2006) (Belouzard et al., Sarbecovirus (Luk et al., 2019). Genus, spesies
2012). dan reseptor inang yang digunakan untuk
SARS-CoV-2 sebagaimana virus Corona berinteraksi dengan virus corona dapat dilihat
yang telah ada sebelumnya merupakan virus pada Tabel 1.
yang termasuk dalam famili Coronaviridae.

Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 30


Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

Kemunculan SARS-CoV-2 pertama kali pada sejumlah agen proinflamasi tersebut disebut
akhir Desember 2019 di Wuhan, Cina. badai sitokin (cytokin storm) (Huang et al.,
Ditemukan sejumlah pasien dengan gejala 2020) (Williams and Chambers, 2014)
batuk, demam, dispnea (kesulitan bernafas) (Channappanavar and Perlman, 2017). Cytokin
yang disertai sindrom distres pernafasan akut storm kemudian menyebabkan ARDS dan
(acute respiratory distress syndrome (ARDS)) kegagalan fungsi sejumlah organ (Xu et al.,
dengan penyebab infeksi yang tidak diketahui. 2020). Sekuensing genom virus dari pasien
ARDS merupakan penyebab utama kematian tersebut, diketahui bahwa infeksi disebabkan
pasien yang terinfesi SARS-CoV-2 (Gao et al., oleh betacoronavirus -CoV) dengan strain
2020). ARDS pada dasarnya adalah respon yang berbeda dari yang telah ada.
imunopatologis yang umum terjadi pada kasus Betacoronavirus baru tersebut menunjukkan
infeksi SARS-CoV-2, SARS-CoV dan MERS- 88% kemiripan terhadap severe acute
CoV (Xu et al., 2020). Hal ini terjadi karena respiratory syndrome (SARS)-like coronavirus;
adanya pelepasan proinflamasi sitokin (IFN-. bat-SL-CoVZC45 dan bat-SL-CoVZC21 dan
IFN- ,/- ,/-6, IL-12, IL-18, IL-33, TNF-. 50% kemiripan terhadap MERS-CoV (Li et al.,
TGF- GOO GDQ NHPRNLQ &&/ &&/ &&/ 2020)(Lu et al., 2020).
CXCL8, CXCL9, CXC10). Peristiwa pelepasan

Tabel 1. Genus, Spesies dan Reseptor yang Digunakan oleh Virus Corona
Genus Spesies Reseptor inang Referensi
Alphacoronavirus 1) Alphacoronavirus 1: (Belouzard et
a) Feline Coronavirus (FCoV) Aminopeptidase al., 2012)
serotype 2 N
b) Canine Coronavirus
(CCoV) serotype 2 Aminopeptidase
c) Transmissible N
gastroenteritis virus
(TGEV) Aminopeptidase
2) Human coronavirus 229E N
3) Human coronavirus NL63
4) Porcine Epidemic Diarrhea
Coronavirus (PEDV) Aminopepidase N
5) Rhinolophus bat coronavirus ACE2
HKU2 Aminopeptidase
6) Scotophilus bat coronavirus N
512/05
7) Miniopterus bat coronavirus 1
8) Miniopterus bat coronavirus
KHU8
Betacoronavirus 1) Betacoronavirus 1 Neu 5,9 Ac2 (Belouzard et
2) Murine coronavirus CEACAMI al., 2012)
3) Human coronavirus HKU9 (Prajapat et al.,
4) Rousettus bat coronavirus 2020)
HKU4
5) Tylonycteris bat coronavirus
HKU5
6) SARS-COV:
a) Human SARS-COV ACE2
b) SARS COV-2
c) Rhinolophu bat viruses
Gammacoronavirus 1) Avian coronavirus (Belouzard et
2) Beluga Whale coronavirus SW1 al., 2012)
Deltacoronavirus 1) Bulbul coronavirus HKU11 (Belouzard et
2) Thrush coronavirus HKU12 al., 2012)
3) Munia coronavirus HKU13

Sebagian besar ilmuwan sepakat bahwa memasuki sel inang melalui interaksinya
SARS-CoV-2 seperti halnya SARS-CoV dengan reseptor angiotensin converting
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 31
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

enzyme 2 (ACE2). Pengikatan virus pada sel peptidase 4 (DPP4). Pengikatan virus pada
inang ini sangat menentukan pathogenesis reseptor ACE2 terjadi melalui protein spike (S)
infeksinya (Zhou et al., 2020). Zhou dan (De Wit et al., 2016). Masuknya virus ke dalam
koleganya juga membuktikan bahwa SARS- sel menyebabkan fusi membran (Simmons et
CoV-2 tidak berinteraksi dengan reseptor al., 2004).
aminopeptidase N (APN) atau dipeptydil

Gambar 1. Struktur Virus Corona. RNA virus membentuk kompleks dengan protein N (Nucleocapsid).
S adalah spike, E, envelope, HE, hemagglutinin esterase, dan M, membrane.
(Sumber gambar: Weiss dan Leibowitz 2011)

SAR-CoV-2 memiliki 2 kelompok protein;


protein struktural dan protein non struktural (non METODE PENELITIAN
structural protein (NSP)). Protein struktural Penulisan review diawali dengan
terdiri dari: spike (S), membrane (M), envelop pengumpulan jurnal yang akan direview. Jurnal
(E) dan nucleocapside (N) serta hemagglutinin yang digunakan adalah jurnal yang berasal dari
esterase (HE) glycoprotein. HE hanya terdapat database PubMed dengan tahun terbit 2015-
pada beberapa jenis Coronavirus (Hilgenfeld, 2020. Kata kunci yang digunakan dalam
2014). Genom CoV terdiri dari 7 gen yaitu: SHQFDULDQ LQL DGDODK ³6$56-CoV-2 drug target´
ORF1a, ORF1b, S, OEF3, E, M dan N (Prajapat Jurnal-jurnal tersebut kemudian diskrining
et al., 2020). Genom virus Corona terdiri dari 6- berdasarkan judul dan abstrak, diikuti dengan
10 open reading frames (ORFs). ORF1a/b pengkajian abstrak, dan terakhir pengkajian
menghasilkan polyprotein pp1a dan pp1b jurnal secara utuh. Review jurnal ini ditulis
(McBride, van Zyl and Fielding, 2014). ORF1a/b berdasarkan semua jurnal yang dikaji secara
mengandung dua per tiga dari seluruh genom utuh.
yang mengkode replikasi protein dan sepertiga
sisanya mengandung gen-gen protein dalam HASIL DAN PEMBAHASAN
urutan tetap; HE-S-E-M-N. Selaput virus Penelusuran pustaka dengan kata kunci
setidaknya mengandung 3 jenis protein yaitu; ³6$56-CoV-2 drug target´ dalam database
protein spike (S), protein membrane (M) dan PubMed menghasilkan 130 jurnal. Proses
protein envelop ( E ). Virus Corona kadang juga skrining terhadap judul dan abstrak tersebut
mengandung hemagglutinin esterase (HE). menyisakan 83 artikel, dan setelah dilakukan
Protein M dan E berperan dalam membentuk kajian terhadap abstrak, maka diperoleh 80
struktur virus. Sedangkan protein S berperan jurnal yang dinilai relevan untuk direview.
sebagai mediator dalam berinteraksi dengan Saat ini telah diketahui setidaknya ada 21
sel inang (host) dan menentukan jenis-jenis target yang potensial sebagai target kerja obat
inang tersebut (Belouzard et al., 2012). Struktur COVID-19. Dua target diantaranya terdapat
SARS-CoV-2 dapat dilihat pada Gambar 1. pada manusia. Dan saat ini terdapat sekurang-
Saat ini belum tersedia vaksin atau kurangnya 78 molekul yang sedang diuji secara
antivirus SARS-COV-2 tersebut. Penelitian klinis sebagai antivirus COVID-19 (Wu et al.,
untuk menemukan agen antivirus atau vaksin ini 2020). Wu dkk (2020) melakukan prediksi
pun terus dilakukan. Berbagai protein struktural struktur dan pemodelan homologi terhadap
maupun nonstruktural dijadikan target kerja semua protein yang dikode oleh SARS-CoV-2.
calon antivirus ini. Target kerja obat antivirus COVID-19 dapat
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 32
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

dilihat pada Tabel 2.

Tabel 2. Target Kerja Obat COVID-19


Protein Sifat/Peran Terdapat pada Referensi
NSP1 (nonstructural Faktor virulensi, dan agen SARS-CoV-2 (Emameh, Nosrati
protein 1) persebaran and Taheri,
2020)(Wu et al.,
2020)
NSP3 (nonstructural Replikasi virus SARS-CoV-2 (Wu et al.,
protein 3): 2020)(Rut et al.,
- NSP3b 2020)
- NSP3c
- PLpro (papain like
cysteine protease)
- NSP3e
Kompleks NSP7-NSP8 Kofaktor pada RdRp SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
(Subissi et al.,
2014)
NSP9-NSP10 SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
NSP14-NSP16 SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
3CLpro atau Mpro Replikasi virus SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
E-channel (E protein) Morfogenesis virus SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
(Venkatagopalan
et al., 2015)
ORF7a Protein transmembran tipe 1 SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
yang belum diketahui
fungsinya
Protein M Mempertahankan struktur SARS-CoV-2 (Schoeman and
virus Fielding, 2019)
Protein spike Berikatan dengan resseptor SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
ACE2 pada manusia
ACE2 (angiotensin Terikatnya protein S SARS- Manusia (Wu et al., 2020)
converting enzyme 2) CoV-2

Pada manusia berfungsi


dalam pengaturan tekanan
darah
C-terminal RNA binding SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
domain (CRBD)
N-terminal RNA binding SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
domain (NRBD)
Helicase Replikai virus SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
RdRp (NSP12 atau Replikasi virus SARS-CoV-2 (Wu et al., 2020)
polymerase)
TMPRSSS2 Peran pada manusia belum Manusia (Fujii and Hitomi,
diketahui. Terhadap SARS- 1981)(Hoffmann,
CoV-2 protein ini Kleine-Weber, et
mengaktivasi Protein S al., 2020)

Protein Spike (S) sama dengan SARS-CoV. Protein ini memiliki 2


Protein S SARS-CoV-2 sebagaimana pada subunit fungsional, yaitu: S1 dan S2. S1
SARS-CoV merupakan bagian struktur yang berperan membentuk ikatan dengan reseptor
memperantarai masuknya virus tersebut ACE2 pada sel inang, S2 kemudian
kedalam tubuh manusia (inang). Virus ini menggabungkan virus dengan membran sel
memasuki sel manusia dengan cara inang. Pada umumnya, S membelah diantara
membentuk ikatan antara protein S dengan subunit S1 dan S2 (Walls et al., 2020).
angiotensin converting enzyme 2 (ACE2). Diperkirakan SARS-CoV-2 berinteraksi dengan
Afinitas ikatan SARS-CoV-2 pada ACE2 hampir ACE2 lebih lemah dibanding SARS-CoV
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 33
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

(Morse et al., 2020). Namun, SARS-CoV-2 kekurangan protein E merupakan kandidat


dapat mengenali ACE2 secara lebih efisien vaksin yang menjanjikan (Schoeman and
(Wan et al., 2020). Glu394 protein S SARS- Fielding, 2019).
CoV-2 sesuai dengan residu479 protein S
SARS-CoV yang dapat berinteraksi dengan Protein Membrane (M)
Lys31 pada ACE2 (Wu et al., 2012). S Protein M (membrane) merupakan protein
disisipkan ke dalam E dan memediasi yang paling melimpah pada CoV, berfungsi
masuknya virus ke dalam sel. Protein S ini mempertahankan struktur virus (Schoeman and
sangat tergantung pada enzim tranmembrane Fielding, 2019) dan mensensitisasi inang
protease serine 2 (TMPRSS2) yang membelah (Wang and Liu, 2016). Tikus yang divaksinasi
dan mengaktivasi S (Hoffmann, Schroeder, et dengan protein M SARS-CoV menunjukan
al., 2020)(Hoffmann, Kleine-Weber, et al., adanya respon imun (Okada et al., 2005).
2020).
Karena protein S merupakan bagian CoV Main Protease
yang berperan menghantarkan masuknya virus Main protease (Mpro) disebut juga 3C-like
ke dalam tubuh inang, maka protein ini dapat protease (3CLpro) (Zhang, Lin, Sun, Curth, et
menjadi target utama dalam netralisasi antibodi al., 2020), dikenal juga sebagai NSP5 (Wu et
(Abs) infeksi, terapi dan desain vaksin. Protein al., 2020). Enzim ini merupakan salah satu
S merupakan trimer yang dilengkapi sejumlah enzim yang penting dalam menentukan
glikan yang terhubung pada ±N yang berperan kelangsungan hidup CoV,dengan memediasi
dalam pelipatan protein (Wan et al., replikasi dan transkripsi protein-protein pada
2020)(Wrapp et al., 2020). Vaksin sebaiknya virus. Pentingnya peran Mpro ini menjadikannya
didesain berbasis protein S pada subunit S1 salah satu target penting dalam mendesain
(Zhang, Lin, Sun, Curth, et al., 2020). antivirus COVID-19. Enzim ini teridentifikasi
Basit dkk (2020) membuktikan bahwa memiliki bobot molekul 33,797 kDa yang
potongan enzim ACE2 manusia (truncated ditetapkan melalui spektroskopi massa.
human ACE2 (tACE2)) merupakan inhibitor Efisiensi katalitiknya (Kcat/Km) pada SARS-
kompetitif yang potensial pada protein S SARS- CoV-2 sebesar 28.500 M-1S-1 (Jin, Du, et al.,
CoV-2. tACE2 terdiri dari asam amino 21-119 2020) sedikit lebih besar dibandingkan pada
ACE2 manusia. tACE2 ini merupakan bagian SARS-CoV yaitu 26.500 M-1S-1(Xue et al.,
yang terlibat dalam pengikatan dengan receptor 2007), namun jauh lebih besar dibandingkan
binding domain (RBD) SAR-CoV-2. Studi human rhinovirus 3C Protease yang hanya
penambatan dan dinamika molekul protein- sebesar 920 M-1S-1 (Wang et al., 1997)(Jin, Du,
protein menunjukkan bahwa tACE2 memiliki et al., 2020). Mpro memiliki lebih dari 11 situs
afinitas lebih tinggi terhadap RBD dibanding pembelahan. Inhibisi aktivitas enzim ini akan
ACE2. Kompleks tACE2-RBD juga lebih stabil menyebabkan terhambatnya replikasi virus.
daripada ACE2-RBD (Basit, Ali and Rehman, Manusia tidak memiliki enzim protease yang
2020). sama dengan Mpro virus ini, maka inhibitor Mpro
Struktur kristal protein S SARS-CoV-2 tidak akan menghasilkan efek toksik pada
dapat diunduh pada website Protein Data Bank manusia (Zhang, Lin, Sun, Curth, et al., 2020).
(PDB) dengan ID: 6VSB (Wrapp et al., 2020), Berbagai studi in silico telah dilakukan
6VXX (Walls et al., 2020), 6X6P (Chen et al., untuk menemukan calon molekul yang efektif
2011), 7BYR (Cao et al., 2020), 6WPT dan menginhibisi main protease SARS-CoV-2 ini.
6WPS (Pinto et al., 2020). Struktur protein S Inhibisi main protease akan menyebabkan
dapat dilihat pada Gambar 2. terganggunya replikasi dan transkripsi protein
non struktural virus, sehingga mengakibatkan
Protein Envelop (E) kematian virus. Jin dkk, membuktikan bahwa
Protein E berperan dalam morfogenesis N3 merupakan salah inhibitor iireversibel Mpro
virus (Venkatagopalan et al., 2015). Kurangnya tersebut. Model protein enzim diperoleh melalui
protein E menyebabkan titer virus yang rendah, homology modelling (Jin, Du, et al., 2020).
immatur dan progeni yang tidak efisien (Kuo, Umesh dkk juga melakukan studi
Hurst and Masters, 2007)(Schoeman and penambatan molekul terhadap target Mpro. Studi
Fielding, 2019). Protein E juga merupakan ini dilakukan dengan menskrining senyawa-
faktor virulensi virus. Strukturnya sangat senyawa yang terdapat dalam rempah-rempah
beragam di antara semua famili virus Corona di India melalui penambatan molekul. Struktur
(Venkatagopalan et al., 2015). CoV yang kristal Mpro diunduh dari PDB dengan ID 6Y84.
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 34
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

Dalam studinya diketahui bahwa carnosol dan sehingga memungkinkan untuk mendesain
arjunglucoside-l menunjukkan aktivitas molekul blokernya. Bloker ACE2 dapat berupa
penghambatan Mpro yang cukup kuat (Umesh et antibodi maupun molekul kecil (Zhang and
al., 2020). Data molekul-molekul yang telah Baker, 2017).
teruji menginhibisi Mpro dapat dilihat pada Tabel Dalam kasus infeksi virus ini, ACE2 dapat
3. berperan sebagai target kerja sekaligus
Protein Data Bank ID untuk Mpro antara lain: sebagai obat itu sendiri. SARS-CoV
6Y84 (Mirza and Froeyen, 2020), 6Y2G (Zhang, menurunkan regulasi protein ACE2 dengan
Lin, Sun, Rox, et al., 2020), 6LU7 (Jin, Zhao, et cara berikatan dengan protein S sehingga
al., 2020), 7BUY (Huang et al., 2020). menyebabkan cedera paru-paru. Pemberian
ACE2 terlarut, akan menyebabkan konsentrasi
Angiotensin Converting Enzyme 2 (ACE2) ACE2 berlebih, sehingga terjadi kompetisi
ACE2 setidaknya memiliki 3 fungsi pengikatan dengan protein S dari SARS-CoV-2.
fisiologis, yaitu negative regulator pada sistem ACE2 akan memberikan efek antiatropi,
renin-angiotensin, fasilitator transport asam antifibrosis, antiinflamasi, antioksidan dan
amino dan reseptor tempat terikatnya SARS- vasodilatasi, sehingga memberikan
CoV maupun SARS-CoV-2 (Gheblawi et al., perlindungan terhadap jaringan (Imai et al.,
2020). ACE2 tersebar luas dalam paru-paru, 2005)(Yu et al., 2016). Dan kini telah tersedia
sistem kardiovaskuler, usus, ginjal, sistem saraf ACE2 rekombinan manusia (rhACE2; APN01,
pusat dan jaringan adipose (Gheblawi et al., GSK2586881). Produk ACE2 tersebut tidak
2020). Dalam sebuah studinya, Zhou dkk, menghasilkan efek hemodinamik negatif baik
menunjukkan bahwa overekspresi sel HeLa pada sukarelawan maupun pada pasien
dengan ACE2 manusia, babi dan musang dengan ARDS (Haschke et al., 2013)(Khan et
menyebabkan terjadinya infeksi SARS-CoV-2. al., 2017)(Zhang and Baker, 2017).
Hal ini membuktikan bahwa ACE2 merupakan Infeksi SARS-CoV-2 dapat memicu
target masuknya SARS-CoV-2 ke dalam sel kerusakan berbagai organ, seperti: jantung,
(Zhou et al., 2020). Situs pengikatan antara paru-paru dan ginjal (Oudit et al., 2009)(Ferrario
ACE2 dan SARS-CoV-2 telah teridentifikasi and Mullick, 2017)(Antoniak et al., 2017).

Tabel 3. Calon molekul obat yang teruji memberikan aktivitas sebagai


anti SARS-CoV-2 yang bekerja sebagai inhibitor Mpro
Senyawa Metode pengujian Referensi
Atazanavir, remdesivir, efavirenz, Drug-target interaction deep (Lu et al., 2020)
ritonavir, dolutegravir learning model
Lopinavir, ritonavir Simulasi dinamika molekul (Nutho et al., 2020)
Montelukast Virtual screening (Wu et al., 2020)
64 obat dari 1,485.144 obat yang Virtual screening dari (Tsuji, 2020)
diskrining terbukti mampu menginhibisi database ChEMBL
Mpro, diantaranya:Lobendazole,
Betamissin, Benaxibine
17 senyawa dari database Marine Virtual screening dan (Davies et al.,
Natural Products dapat menginhibisi molecular modelling 2004)
Mpro, antara lain: heftaludanol A,
phlorethopentafuhalol B,
pseudopentafuhalol C, dll
Glecaprevir dan maraviroc Molecular docking (Shamsi et al.,
2020)
Andrographolide Molecular docking (Enmozhi et al.,
2020)
/-viniferin, myricitrin, taiwanhomoflavone phylogenetic and Sequence (Joshi et al., 2020)
A, lactucopicrin 15-oxalate, nympholide Similarity Network analysis
A, afzelin, biorobin, hesperidin and
phyllaemblicin B
Perampanel, Carprofen, Celecoxib, Virtual screening (Gimeno et al.,
Alprazolam, Trovafloxacin, Sarafloxacin 2020)
and ethyl biscoumacetate

Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 35


Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

Carprofen dan celecoxib In vitro (Gimeno et al.,


2020)
Bonducellpin D Virtual screening (Gurung et al.,
2020)
Statin: pitavastatin, rosuvastatin, Molecular docking (Reiner et al.,
lovastatin dan rosuvastatin 2020)
(-)-taxifolin dan rhamnetin Virtual screening (Cicerale et al.,
2009)
Rubitecan, loprazolam, Virtual screening (Elmezayen et al.,
ZINC000015988935 dan 2020)
ZINC000103558522
2-methyl-2,4-pentanediol Virtual screening (Plewczynski et al.,
2007)
Carnosol dan arjungglucoside-l Molecular docking (Umesh et al.,
2020)

Protein Transmembrane Protease Serin 2 2018)(Holshue et al., 2020)(Gao et al., 2020).


(TMPRSS2) Remdesivir telah teruji cukup efektif untuk terapi
TMPRSS2 berperan mengaktivasi protein COVID-19 (Wang et al., 2020)(Holshue et al.,
S, sehingga virus dapat memasuki sel inang 2020). Beberapa obat yang telah ada seperti
(Hoffmann, Schroeder, et al., 2020). Protein ini antijamur itrakonazol dan antibakteri novobiosin
juga sangat penting dalam proses persebaran juga menunjukkan aktivitas penghambatan
SARS-CoV dan MERS-CoV pada rodent terhadap RdRp (Wu et al., 2020).
(Iwata-Yoshikawa et al., 2019)(Zhou et al.,
2010). Hal ini menjadikan TMPRSS2 sebagai Helicase (NSP13)
target yang potensial obat antivirus COVID-19 Helicase atau NSP13 merupakan protein
(Hoffmann, Schroeder, et al., 2020). TMPRSS2 multifungi yang terdiri dari N-terminal metal
merupakan protein pada manusia yang belum binding domain (NMBD) dan helicase domain
diketahui dengan jelas fungsinya (Hel) (Ivanov and Ziebuhr, 2004). NSP13
(Kupferschmidt, 2020). merupakan komponen penting dalam replikasi
Camostat mesilat yang merupakan sebuah virus, sehingga dapat menjadi target yang
inhibitor serin protease yang juga menunjukkan potensial obat antivirus COVID-19 (Shum and
aktivitasnya terhadap TMPRSS2 (Hoffmann, Tanner, 2008).
Kleine-Weber, et al., 2020). Molekul ini sedang
diuji klinis sebagai antivirus SARS-CoV-2 Papain-like proteinase (PLpro)
(Kupferschmidt, 2020). Selain camostat PLpro berperan dalam pembelahan
mesilat, diuji pula gabexat mesilat dan terminal N polyprotein (pp) untuk melepas
nafamostat mesilat (Fujii and Hitomi, 1981). NSP1, NSP2 dan NSP3 yang penting dalam
Ketiga senyawa tersebut telah diijinkan proses replikasi virus (Harcourt et al., 2004).
penggunaannya di Jepang (Yamamoto et al., PLpro juga secara signifikan mengantagonis
2016). imunitas bawaan inang (Chen et al.,
2014)(Yuan et al., 2015)(Li et al., 2016)(Wu et
RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) al., 2020).
Proses replikasi SARS-CoV-2 sangat Setelah menentukan struktur protein dalam
tergantung pada enzim RNA-dependent RNA SARS-CoV-2, Canrong dkk (2020) juga
polymerase (RdRp). Remdesivir merupakan melakukan virtual screening terhadap sejumlah
contoh antivirus yang bekerja pada target database senyawa obat yang telah ada
tersebut (Gordon et al., 2020). RdRp disebut terhadap PLpro ini. Molekul obat yang potensial
juga NSP12 (non structural protein 12) (Gao et sebagai inhibitor PLpro dapat dilihat pada Tabel
al., 2020). RdRp mengkatalisis sintesis RNA 4. Beberapa molekul calon obat diantaranya
yang kemudian berperan dalam proses juga menunjukkan aktivitas pada berbagai
transkripsi dan replikasi virus. NSP7 dan NSP8 target kerja, sebagaimana dapat dilihat pada
diduga berperan sebagai kofaktor dalam proses Tabel 5.
tersebut (Subissi et al., 2014). Sehingga, RdRp Berdasarkan target kerja yang tersedia,
merupakan target utama inhibitor analog obat antivirus COVID-19 dapat didesain dengan
nukleosida, seperti remdesivir (Wang et al., mekanisme kerja sebagai berikut:
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 36
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

a. Menghambat aktivitas protein fungsional c. Menghasilkan faktor virulensi untuk


atau enzim dari virus, sehingga proses mengembalikan imunitas bawaan inang
sintesis dan replikasi RNA virus terhambat d. Bekerja pada enzim atau reseptor spesifik
b. Bekerja pada protein S virus, sehingga pada inang untuk mencegah masuknya
memblok pengikatan antara virus dan virus ke dalam sel inang (Wu et al., 2020).
reseptor sel manusia

Gambar 2. Struktur kristal Protein S SARS-CoV-2


dengan PDB ID: 6VSB (Wrapp et al., 2020)

Tabel 4. Molekul Obat Yang Aktif Sebagai Inhibibitor PLpro


Golongan Molekul obat Metode pengujian Referensi
obat
Antivirus Ribavirin Virtual screening, (Wu et al.,
Valgaciclovir molecular docking 2020)
Thymidine
Antibakteri Kloramfenikol Virtual screening, (Wu et al.,
Cefamandole molecular docking 2020)
Tigecycline
Relaksan otot Klorfenesin karbamat Virtual screening, (Wu et al.,
molecular docking 2020)
Antitusiv Levodropizine Virtual screening, (Wu et al.,
molecular docking 2020)
VIR250 Penentuan struktur kristal (Rut et al.,
VIR251 kompleks molekul uji 2020)
dengan PLpro

Tabel 5. Molekul Calon Obat Yang Teridenifikasi Berinteraksi


Dengan Beberapa Target Pada SARS-CoV-2
Senyawa Metode Target Kerja Referensi
Pengujian
x Alkaloid furniquinazoline: Molecular papain-like protease (Quimque et al.,
scedapin C (15), quinadoline B docking, (PLpro), chymotrypsin-like 2020)
(19), norquinadoline A (20) molecular protease (3CLpro), RNA-
x polyketide isochaetochromin D1 dynamic directed RNA polymerase
x terpenoid 11a- simulation (RdRp), non-structural
dehydroxyisoterreulactone A protein 15 (nsp15), dan
spike binding domain
pada GRP78
Elbasvir Virtual screening RdRp, PLpro, helicase (Meenakshisundaram
and Robert, 2020)

Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 37


Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

Berdasarkan studi ini, penulis dapat like protease inhibits the type I interferon
menyimpulkan bahwa main protease (Mpro) dan signaling pathway through interaction with
ACE2 merupakan target kerja yang sangat the STING-TRAF3-TBK1 complex. Protein
prospektif. Penghambatan Mpro berpotensi and Cell. doi: 10.1007/s13238-014-0026-3.
efektif sebagai obat COVID-19 karena akan Chen, Y. et al. 2011. µ%LRFhemical and structural
menyebabkan hilangnya kemampuan replikasi insights into the mechanisms of sars
dan transkripsi virus, sehingga virus tersebut FRURQDYLUXV 51$ ULERVH •-O-methylation
tidak mampu bertahan hidup. ACE2 juga sangat by nsp16/nsp10 protein complex. PLoS
menarik, tidak hanya sebagai target kerja Pathogens. doi:
namun dapat juga menjadi bagian dari obat itu 10.1371/journal.ppat.1002294.
sendiri. Namun karena ACE2 merupakan Cicerale, S. et al. 2009. Chemistry and health of
protein fisiologis pada manusia, maka olive oil phenolics. Critical Reviews in Food
menjadikannya sebagai target kerja berpeluang Science and Nutrition. doi:
menghasilkan efek yang mungkin tidak 10.1080/10408390701856223.
diharapkan pada manusia, sehingga penulis Davies, J. et al. 2004. Quantitative structure-
lebih tertarik pada Mpro untuk dijadikan target activity relationship modeling of acute
kerja obat COVID-19 ini. toxicity of quaternary alkylammonium
sulfobetaines to Daphnia magna.
KESIMPULAN Environmental Toxicology and Chemistry,
Seluruh protein struktural dan nonstruktural 23(9), pp. 2111±2115. doi: 10.1897/03-
dalam virus SARS-CoV-2 sangat potensial 312.
untuk dijadikan target kerja obat COVID-19. Elmezayen, A. D. et al. 2020. Drug repurposing
Mpro dan ACE2 merupakan protein yang lebih for coronavirus (COVID-19): in silico
prospektif dibandingkan protein-protein lainnya. screening of known drugs against
coronavirus 3CL hydrolase and protease
DAFTAR PUSTAKA enzymes. Journal of biomolecular structure
Antoniak, S. et al. 2017. Protease-Activated & dynamics. doi:
Receptor 1 Contributes to Angiotensin II- 10.1080/07391102.2020.1758791.
Induced Cardiovascular Remodeling and Emameh, R. Z., Nosrati, H. and Taheri, R. A.
Inflammation. Cardiology (Switzerland). 2020. Combination of biodata mining and
doi: 10.1159/000452269. computational modelling in identification
Basit, A., Ali, T. and Rehman, S. U. 2020. and characterization of ORF1ab
Truncated human Angiotensin Converting polyprotein of SARS-CoV-2 isolated from
Enzyme 2; a potential inhibitor of SARS- oronasopharynx of an Iranian patient.
CoV-2 spike glycoprotein and potent Biological Procedures Online. doi:
COVID-19 therapeutic agent. Journal of 10.1186/s12575-020-00121-9.
Biomolecular Structure and Dynamics. doi: Enmozhi, S. K. et al. 2020. Andrographolide As
10.1080/07391102.2020.1768150. a Potential Inhibitor of SARS-CoV-2 Main
Belouzard, S. et al. 2012. Mechanisms of Protease: An In Silico Approach. Journal of
coronavirus cell entry mediated by the viral biomolecular structure & dynamics. doi:
spike protein. Viruses. doi: 10.1080/07391102.2020.1760136.
10.3390/v4061011. Ferrario, C. M. and Mullick, A. E. 2017. Renin
Cao, Y. et al. 2020. Potent neutralizing angiotensin aldosterone inhibition in the
antibodies against SARS-CoV-2 identified treatment of cardiovascular disease.
by high-throughput single-cell sequencing Pharmacological Research. doi:
of convalescent patients B cells. Cell. doi: 10.1016/j.phrs.2017.05.020.
10.1016/j.cell.2020.05.025. Fujii, S. and Hitomi, Y. 1981. 1HZ V\QWKHWLF
Channappanavar, R. and Perlman, S. 2017. LQKLELWRUV RI & UC & HVWHUDVH WKURPELQ
Pathogenic human coronavirus infections: plasmin, kallikrein and trypsin. BBA -
causes and consequences of cytokine Enzymology. doi: 10.1016/0005-
storm and immunopathology. Seminars in 2744(81)90023-1.
Immunopathology. doi: 10.1007/s00281- Gao, Y. et al. 2020. Structure of the RNA-
017-0629-x. dependent RNA polymerase from COVID-
Chen, X. et al. 2014. SARS coronavirus papain- 19 virus. Science. doi:

Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 38


Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

10.1126/science.abb7498. 10.1056/NEJMoa2001191.
Gheblawi, M. et al. 2020. Angiotensin- Huang, C. et al. 2020. Clinical features of
Converting Enzyme 2: SARS-CoV-2 patients infected with 2019 novel
Receptor and Regulator of the Renin- coronavirus in Wuhan, China. The Lancet.
Angiotensin System: Celebrating the 20th doi: 10.1016/S0140-6736(20)30183-5.
Anniversary of the Discovery of ACE2. Hudson, C. B. and Beaudette, F. R. 1932.
Circulation research. doi: Infection of the cloaca with the virus of
10.1161/CIRCRESAHA.120.317015. infectious bronchitis. Science. doi:
Gimeno, A. et al. µ3UHGLFWLRQ RI 1RYHO 10.1126/science.76.1958.34-a.
Inhibitors of the Main Protease (M-pro) of Imai, Y. et al. 2005. Angiotensin-converting
SARS-CoV-2 through Consensus Docking enzyme 2 protects from severe acute lung
DQG 'UXJ 5HSRVLWLRQ ¶ International journal failure. Nature. doi: 10.1038/nature03712.
of molecular sciences, 21(11). doi: Ivanov, K. A. and Ziebuhr, J. 2004. Human
10.3390/ijms21113793. Coronavirus 229E Nonstructural Protein
Gordon, C. J. et al. 2020. Remdesivir is a direct- 13: Characterization of Duplex-Unwinding,
acting antiviral that inhibits RNA-dependent Nucleoside Triphosphatase, and RN$ •-
RNA polymerase from severe acute Triphosphatase Activities. Journal of
respiratory syndrome coronavirus 2 with Virology. doi: 10.1128/jvi.78.14.7833-
high potency. Journal of Biological 7838.2004.
Chemistry. doi: 10.1074/jbc.ra120.013679. Iwata-Yoshikawa, N. et al. 2019. TMPRSS2
Gurung, A. B. et al. 2020. Unravelling lead Contributes to Virus Spread and
antiviral phytochemicals for the inhibition of Immunopathology in the Airways of Murine
SARS-CoV-2 Mpro enzyme through in Models after Coronavirus Infection. Journal
silico approach. Life Sciences. Elsevier, of Virology. doi: 10.1128/jvi.01815-18.
255(May), p. 117831. doi: Jin, Z., Zhao, Y., et al. 2020. Structural basis for
10.1016/j.lfs.2020.117831. the inhibition of SARS-CoV-2 main
Harcourt, B. H. et al. 2004. Identification of protease by antineoplastic drug carmofur.
Severe Acute Respiratory Syndrome Nature structural & molecular biology. doi:
Coronavirus Replicase Products and 10.1038/s41594-020-0440-6.
Characterization of Papain-Like Protease Jin, Z., Du, X., et al. 2020. Structure of Mpro
Activity. Journal of Virology. doi: from COVID-19 virus and discovery of its
10.1128/jvi.78.24.13600-13612.2004. inhibitors. Nature. Springer US. doi:
Haschke, M. et al. 2013. Pharmacokinetics and 10.1038/s41586-020-2223-y.
pharmacodynamics of recombinant human Joshi, R. S. et al. 2020. Discovery of Potential
angiotensin-converting enzyme 2 in healthy Multi-Target-Directed Ligands by Targeting
human subjects. Clinical Host-specific SARS-CoV-2 Structurally
Pharmacokinetics. doi: 10.1007/s40262- Conserved Main Protease$. Journal of
013-0072-7. biomolecular structure & dynamics. doi:
Hilgenfeld, R. 2014. From SARS to MERS: 10.1080/07391102.2020.1760137.
crystallographic studies on coronaviral Khan, A. et al. 2017. A pilot clinical trial of
proteases enable antiviral drug design. The recombinant human angiotensin-
FEBS journal. doi: 10.1111/febs.12936. converting enzyme 2 in acute respiratory
Hoffmann, M., Schroeder, S., et al. 2020. distress syndrome. Critical Care. doi:
Nafamostat mesylate blocks activation of 10.1186/s13054-017-1823-x.
SARS-CoV-2: New treatment option for Kuo, L., Hurst, K. R. and Masters, P. S. 2007.
COVID-19. Antimicrobial agents and Exceptional Flexibility in the Sequence
chemotherapy. doi: 10.1128/AAC.00754- Requirements for Coronavirus Small
20. Envelope Protein Function. Journal of
Hoffmann, M., Kleine-Weber, H., et al. 2020. Virology. doi: 10.1128/jvi.01577-06.
SARS-CoV-2 Cell Entry Depends on ACE2 Kupferschmidt, K. 2020. 7KHVH GUXJV GRQ¶W
and TMPRSS2 and Is Blocked by a target the coronavirus²they target us.
Clinically Proven Protease Inhibitor. Cell. Science. doi: 10.1126/science.abc0405.
doi: 10.1016/j.cell.2020.02.052. Li, S. W. et al. 2016. SARS coronavirus papain-
Holshue, M. L. et al. 2020. First case of 2019 like protease inhibits the TLR7 signaling
novel coronavirus in the United States. New pathway through removing Lys63-linked
England Journal of Medicine. doi: polyubiquitination of TRAF3 and TRAF6.
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 39
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

International Journal of Molecular Pinto, D. et al. 2020. Structural and functional


Sciences. doi: 10.3390/ijms17050678. analysis of a potent sarbecovirus
Li, X. et al. 2020. Molecular immune neutralizing antibody. bioRxiv. doi:
pathogenesis and diagnosis of COVID-19. 10.1101/2020.04.07.023903.
Journal of Pharmaceutical Analysis. Plewczynski, D. et al. 2007. In silico prediction
Elsevier Ltd, 10(2), pp. 102±108. doi: of SARS protease inhibitors by virtual high
10.1016/j.jpha.2020.03.001. throughput screening. Chemical Biology
Lu, R. et al. 2020. Genomic characterisation and Drug Design. doi: 10.1111/j.1747-
and epidemiology of 2019 novel 0285.2007.00475.x.
coronavirus: implications for virus origins Prajapat, M. et al. 2020. Drug targets for corona
and receptor binding. The Lancet. doi: virus: A systematic review. Indian Journal of
10.1016/S0140-6736(20)30251-8. Pharmacology. doi:
Luk, H. K. H. et al. 2019. Molecular 10.4103/ijp.IJP_115_20.
epidemiology, evolution and phylogeny of Quimque, M. T. J. et al. 2020. Not One, But
SARS coronavirus. Infection, Genetics and Five: Virtual Screening-Driven Drug
Evolution. doi: Discovery of SARS-CoV2 Enzyme Inhibitors
10.1016/j.meegid.2019.03.001. Targeting Viral Attachment, Replication and
McBride, R., van Zyl, M. and Fielding, B. C. Post-Translational Infection Mechanisms.
2014. The coronavirus nucleocapsid is a ChemRxiv. doi:
multifunctional protein. Viruses. doi: 10.26434/chemrxiv.12170424.v1.
10.3390/v6082991. 5HLQHU ä et al. 2020. Statins and the COVID-
Meenakshisundaram, B. and Robert, S. R. 19 main protease: in silico evidence on
2020. Computational Target-Based Drug direct interaction. Archives of Medical
Repurposing of Elbasvir, an Antiviral Drug Science. doi: 10.5114/aoms.2020.94655.
Predicted to Bind Multiple SARS-CoV-2 Rut, W. et al. 2020. Activity profiling of SARS-
Proteins. chemRxiv. doi: CoV-2-PLpro protease provides structural
10.26434/chemrxiv.12084822.v1. framework for anti-COVID-19 drug design.
Mirza, M. U. and Froeyen, M. 2020. Structural bioRxiv. doi: 10.1101/2020.04.29.068890.
elucidation of SARS-CoV-2 vital proteins: Schoeman, D. and Fielding, B. C. 2019.
Computational methods reveal potential Coronavirus envelope protein: Current
drug candidates against main protease, knowledge. Virology Journal. doi:
Nsp12 polymerase and Nsp13 helicase. 10.1186/s12985-019-1182-0.
Journal of Pharmaceutical Analysis. doi: Shamsi, A. et al. 2020. Glecaprevir and
10.1016/j.jpha.2020.04.008. Maraviroc are high-affinity inhibitors of
Morse, J. S. et al. 2020. Learning from the Past: SARS-CoV-2 main protease: Possible
Possible Urgent Prevention and Treatment therapeutic implication in COVID-19.
Options for Severe Acute Respiratory Bioscience reports, 0(June), pp. 1±8. doi:
Infections Caused by 2019-nCoV. 10.1042/BSR20201256.
ChemBioChem. doi: Shum, K. T. and Tanner, J. A. 2008 Differential
10.1002/cbic.202000047. inhibitory activities and stabilisation of DNA
Nutho, B. et al. 2020. Why are lopinavir and aptamers against the SARS coronavirus
ritonavir effective against the newly helicase. &KHPELRFKHPï D (XURSHDQ
emerged coronavirus 2019? Atomistic journal of chemical biology. doi:
insights into the inhibitory mechanisms. 10.1002/cbic.200800491.
Biochemistry. doi: Simmons, G. et al. 2004. Characterization of
10.1021/acs.biochem.0c00160. severe acute respiratory syndrome-
Okada, M. et al. 2005. The development of associated coronavirus (SARS-CoV) spike
vaccines against SARS corona virus in mice glycoprotein-mediated viral entry.
and SCID-PBL/hu mice. Vaccine, 23(17± Proceedings of the National Academy of
18), pp. 2269±2272. doi: Sciences of the United States of America.
10.1016/j.vaccine.2005.01.036. doi: 10.1073/pnas.0306446101.
Oudit, G. Y. et al. 2009. SARS-coronavirus Subissi, L. et al. 2014. One severe acute
modulation of myocardial ACE2 expression respiratory syndrome coronavirus protein
and inflammation in patients with SARS. complex integrates processive RNA
European Journal of Clinical Investigation. polymerase and exonuclease activities.
doi: 10.1111/j.1365-2362.2009.02153.x. Proceedings of the National Academy of
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 40
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

Sciences of the United States of America. Williams, A. E. and Chambers, R. C. 2014. The
doi: 10.1073/pnas.1323705111. mercurial nature of neutrophils: Still an
Tsuji, M. 2020. Potential anti-SARS-CoV-2 drug enigma in ARDS?. American Journal of
candidates identified through virtual Physiology - Lung Cellular and Molecular
screening of the ChEMBL database for Physiology. doi:
compounds that target the main coronavirus 10.1152/ajplung.00311.2013.
protease. FEBS open bio. doi: De Wit, E. et al. 2016. SARS and MERS:
10.1002/2211-5463.12875. Recent insights into emerging
Umesh et al. 2020. Identification of new anti- coronaviruses. Nature Reviews
nCoV drug chemical compounds from Microbiology. doi:
Indian spices exploiting SARS-CoV-2 main 10.1038/nrmicro.2016.81.
protease as target. Journal of Biomolecular Wrapp, D. et al. 2020. Cryo-EM structure of the
Structure and Dynamics. Taylor & Francis, 2019-nCoV spike in the prefusion
0(0), pp. 1±9. doi: conformation. Science. doi:
10.1080/07391102.2020.1763202. 10.1126/science.aax0902.
Venkatagopalan, P. et al. 2015. Coronavirus Wu, C. et al. .2020. Analysis of therapeutic
envelope (E) protein remains at the site of targets for SARS-CoV-2 and discovery of
assembly. Virology. doi: potential drugs by computational methods.
10.1016/j.virol.2015.02.005. Acta Pharmaceutica Sinica B. doi:
Walls, A. C. et al. 2020. Structure, Function, and 10.1016/j.apsb.2020.02.008.
Antigenicity of the SARS-CoV-2 Spike Wu, K. et al. 2012. Mechanisms of host receptor
Glycoprotein. Cell. doi: adaptation by severe acute respiratory
10.1016/j.cell.2020.02.058. syndrome coronavirus. Journal of Biological
Wan, Y. et al. 2020 Receptor Recognition by the Chemistry. doi: 10.1074/jbc.M111.325803.
Novel Coronavirus from Wuhan: an Analysis Xu, Z. et al. 2020. Pathological findings of
Based on Decade-Long Structural Studies COVID-19 associated with acute respiratory
of SARS Coronavirus. Journal of Virology. distress syndrome. The Lancet Respiratory
doi: 10.1128/jvi.00127-20. Medicine. doi: 10.1016/S2213-
Wang, M. et al. 2020. Remdesivir and 2600(20)30076-X.
chloroquine effectively inhibit the recently Xue, X. et al. 2007. Production of Authentic
emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in SARS-CoV Mpro with Enhanced Activity:
vitro. Cell Research. doi: 10.1038/s41422- Application as a Novel Tag-cleavage
020-0282-0. Endopeptidase for Protein Overproduction.
Wang, M. Y. et al. 2018. A comprehensive in Journal of Molecular Biology. doi:
silico method to study the QSTR of the 10.1016/j.jmb.2006.11.073.
aconitine alkaloids for designing novel Yamamoto, M. et al. 2016. Identification of
drugs. Molecules. doi: nafamostat as a potent inhibitor of middle
10.3390/molecules23092385. east respiratory syndrome Coronavirus s
Wang, Q. M. et al. 1997 A continuous protein-mediated membrane fusion using
colorimetric assay for rhinovirus-14 3C the split-protein-based cell-cell fusion
protease using peptide p-nitroanilides as assay. Antimicrobial Agents and
substrates. Analytical Biochemistry. doi: Chemotherapy. doi: 10.1128/AAC.01043-
10.1006/abio.1997.2315. 16.
Wang, Y. and Liu, L. 2016. The membrane Yang, H., Bartlam, M. and Rao, Z. 2006. Drug
protein of severe acute respiratory Design Targeting the Main Protease, the
syndrome coronavirus functions as a novel $FKLOOHV +HHO RI &RURQDYLUXVHV¶ Current
cytosolic pathogen-associated molecular Pharmaceutical Design. doi:
pattern to promote beta interferon induction 10.2174/138161206779010369.
via a toll-like-receptor-related TRAF3- Yu, L. et al. 2016. Angiotensin-(1-5), an active
independent mechanism. mBio. doi: mediator of renin-angiotensin system,
10.1128/mBio.01872-15. stimulates ANP secretion via Mas receptor.
Weiss, S. R. and Leibowitz, J. L. 2011. Peptides. doi:
Coronavirus pathogenesis. 1st edn, 10.1016/j.peptides.2016.09.009.
Advances in Virus Research. 1st edn. Yuan, L. et al. 2015. P53 degradation by a
Elsevier Inc. doi: 10.1016/B978-0-12- coronavirus papain-like protease
385885-6.00009-2. suppresses type I interferon signaling.
Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 41
Purwaniati, Aiyi Asnawi 2020

Journal of Biological Chemistry. doi: doi: 10.1101/2020.02.17.952879.


10.1074/jbc.M114.619890. Zhou, P. et al. 2020. A pneumonia outbreak
Zhang, H. and Baker, A. 2017. Recombinant associated with a new coronavirus of
human ACE2: Acing out angiotensin II in probable bat origin. Nature. Springer US,
ARDS therapy. Critical Care. doi: 579(7798), pp. 270±273. doi:
10.1186/s13054-017-1882-z. 10.1038/s41586-020-2012-7.
Zhang, L., Lin, D., Sun, X., Curth, U., et al. 2020. Zhou, Y. et al. 2010. A Single Asparagine-
Crystal structure of SARS-CoV-2 main Linked Glycosylation Site of the Severe
protease provides a basis for design of Acute Respiratory Syndrome Coronavirus
improved a-ketoamide inhibitors. Science. Spike Glycoprotein Facilitates Inhibition by
doi: 10.1126/science.abb3405. Mannose-Binding Lectin through Multiple
Zhang, L., Lin, D., Sun, X., Rox, K., et al. 2020. Mechanisms. Journal of Virology. doi:
X-ray Structure of Main Protease of the 10.1128/jvi.00554-10.
Novel Coronavirus SARS-CoV-2 Enables
DeVLJQ RI .-Ketoamide Inhibitors. bioRxiv.

Jurnal Farmagazine Vol. VII No.2 Agustus 2020 42

Anda mungkin juga menyukai