(​LEMBAR KERJA) 

Nama Lengkap  : Setya Aresti Febriani    

NIM  : B1A020075   
Tanggal  : 18 November 2020   
Praktikum 
Dosen  : Dra. Elly Tuti Winarni, M.Si   
 

LAB 5. MEKANISME EVOLUSI 

 
EVOLUSI AKIBAT SELEKSI ALAM 
Sebuah cerita tentang seleksi alam pada populasi ​deer mice​ ​https://youtu.be/sjeSEngKGrg  
TUGAS 1. Adaptasi Lingkungan 
Dalam  tugas  ini,  anda  akan  mengidentifikasi  variasi  fisik  yang  terdapat  dalam  suatu 
populasi.  Bagaimana  dan  mengapa  variasi  tersebut  mampu  mempengaruhi  kelangsungan 
hidup  (​survival)​ ?  Untuk  membuat  suatu  hipotesis  yang  logis,  pelajari  keadaan  lingkungan 
yang dihuni oleh masing-masing spesies.  

 
Deer mice ​(​Peromyscus maniculatus​) 
 
1. Variasi fisik apakah yang terdapat pada ​Peromyscus maniculatus​?  
Jawab :​ Variasi fisik yang terdapat pada ​Peromyscus maniculatus ​yaitu terdapat pada 
warna bulu, ukuran tubuh, dan keadaan lingkungan. 
 
 
2. Susunlah suatu hipotesis untuk mendeskripsikan bagaimana variasi tersebut mampu 
mempengaruhi kelangsungan hidup (​survival​). Berikan penjelasan rasional anda.  
 Jawab : ​Hipotesis yang mendeskripsikan bagaimana variasi tersebut mampu 
mempengaruhi kelangsungan hidup (​survival​) yaitu terdapat 2 hipotesis yang saya 
berikan  
hipotesis 1 yaitu ​Peromyscus maniculatus ​berwarna terang akan lebih lama bertahan 
hidup. 
hipotesis 2 yaitu ​Peromyscus maniculatus ​berwarna gelap akan lebih pendek bertahan 
hidup. 
 
3. Bagaimana cara menguji hipotesis anda pada nomor 2? 
Jawab : Cara menguji hipotesis saya pada nomor 2 yaitu dengan meletakan 
masing-masing 5 ​Peromyscus maniculatus ​warna terang dan gelap di kandang 
tertutup di lingkungan bertanah terang bersama predator, kemudian biarkan dengan 
selang waktu beberapa menit, ternyata ​Peromyscus maniculatus ​berwarna gelap 
berkurang karena tidak bisa beradaptasi dengan lingkungan yang bertanah terang 
sehingga terlihat oleh predator dan dimangsa oleh predator. 
 
4. Perubahan lingkungan apakah yang dapat mengubah prediksi anda (lihat nomor 2)? 
Jawab : Perubahan lingkungan yang dapat mengubah prediksi saya pada hipotesis 
yang saya buat yaitu perubahan pada tanah yang berubah karena terjadi banjir 
bandang sehingga warna tanah maupun ​Peromyscus maniculatus ​menjadi gelap. 
 
Catatan​: Gunakan kalimat lengkap dalam menjelaskan jawaban anda. 
 

POHON FILOGENI 
Constructing phylogenetic tree with UPGMA ​https://youtu.be/09eD4A_HxVQ  
TUGAS 2. Membuat Pohon Filogenetik 
1. Tabel  5.1  menunjukkan  jumlah  perbedaan  asam  amino  enzim  A  yang  ada  dalam 
sekelompok spesies ikan.  
Tabel 5.1. Perbedaan asam amino enzim A dalam empat spesies ikan 
Species    Species   
A  B  C 
B  32  -  - 
C  30  15  - 
D  34  13  2 

a. Susun  pohon  filogenetik  yang  menunjukkan hubungan kekerabatan organisme A, B, 

C dan D dengan metode UPGMA. 
Jawab : 
Yang mempunyai perbedaan terkecil adalah C dan D 
dCD = 2, titik cabang dCD/2 = 1 
 Apakah C dan D lebih dekat ke A atau B 
d(CD)A = (dCA + dDA)/2 = (30+34)/2 = 32 
d(CD)B = (dCB + dDB)/2 = (15+13)/2 = 14 
CD lebih dekat B 
panjang cabang d(CD)A = 14/2 = 7 
d(BDC)A = (dBA + dDA + dCA)/3 = (32+30+34)/3 = 32 
 
b. Jika  terdapat  data  fosil  yang  mengungkapkan  bahwa  spesies  C  dan  D  memiliki 
nenek  moyang  yang  sama  10  juta  tahun  yang  lalu,  buatlah  estimasi  kapan  keempat 
spesies  (A,  B,  C,  dan  D)  memiliki  nenek  moyang  yang  sama  (​Catatan:  ​Gunakan 
kalimat lengkap dalam menjelaskan jawaban anda). 
Jawab : 
Spesies  C  dan  D  memiliki  nenek  moyang  yang  sama  10  juta  tahun  yang  lalu,  maka 
keempat spesies memiliki nenek moyang yang sama sekitar: 
1 unit jarak AB = 10 juta tahun yang lalu 
Nenek moyang sama dari keempat 16 x 10 = 160 juta tahun yang lalu. 
Gambar pohon filogenetik 

(masukkan gambar pohon filogenetik dan perhitungan anda di sini) 

 
 
2. Tabel 5.2 menunjukkan jumlah perbedaan asam amino pada empat spesies. 
a. Susun pohon filogenetik untuk spesies A, B, C, dan D dengan metode UPGMA.  
b. Jika  keempat  spesies  tersebut  memiliki  nenek moyang yang sama 64 juta tahun yang 
lalu,  kapankah  spesies  C  dan  D  memiliki  nenek  moyang  yang  sama?  (​Catatan: 
Gunakan kalimat lengkap dalam menjelaskan jawaban anda). 
Tabel 5.2. Perbedaan asam amino pada empat spesies 
Spesies    Spesies   
A  B  C 
B  22  -  - 
C  8  34  - 
D  20  30  40 
 
Gambar pohon filogenetik 

Jawab : 
a. Pohon filogenik untuk spesies A, B, C, dan D dengan metode UPGMA  
Yang memiliki perbedaan terkecil adalah A dan C 
dAB = 8, titik cabang dAC/2 = 4 
 Apakah A dan C lebih dekat ke B atau D 
d(AC)B = (dAB + dCB)/2 = (22+0 )/2 = 11 
d(AC)D = (dAD + dCD)/2 = (20+40)/2 = 30 
AC lebih dekat ke B 
Panjang cabang d(AC)B = 11/2