10/19/2020

Biosintesis Nukleotida

• Biosintesis nukleotida purin

• Biosintesis nukleotida pirimidin

• Ribonukleotida adalah prekursor

Deoksiribonukleotida

Biosintesis Nukleotida
• Organisme perlu mensintesis basa purin
dan pirimidin utk digab.kan ke dlm as
nukleat RNA dan DNA.
• Adenosin juga dijumpai sbgi bgn dari ATP,
AMP siklik, koenzim A, NAD+ dan FAD.
• Atom2 penyusun sistem cincin purin dan
pirimidin berasal dari as amino, amonia dan
CO2 .

1
10/19/2020

2
 10/19/2020

Asal usul atom2 pembentuk cincin purin

Asal usul atom2 pembentuk cincin purin

3
 10/19/2020

Asal usul atom2 pembentuk cincin pirimidin

1. Biosintesis Nukleotida Purin

adenin guanin

4
 10/19/2020

Tahap2 Biosintesis Nukleotida Purin :

Tahap2 Biosintesis Nukleotida Purin :

• Biosintesis nukleotida purin dimulai dg

ribosa 5-fosfat (PRPP)
• Selanjutnya cincin purin dibangun pd
struktur ini setahap demi setahap
• Thp pertama menghslkan ribonukleotida
yg berantai terbuka
• Thp selanjutnya mengalami penutupan
struktur cincin membtk nukleotida purin

5
 10/19/2020

• Senyawa antara pertama yg memiliki

cincin purin adalah as inosinat
• Selanjutnya as inosinat diubah mjd as
adenilat (AMP) dan as guanilat (GMP)
• Produk utama lintas de novo ini
menghslkan AMP dan GMP (Adenilat dan
Guanilat) yg mrpk unit pembtk
polinukleotida

Biosintesis PRPP :

Dikatalisis oleh ribose phosphate pyrophosphokinase,

menghasilkan :

5-phosphoribosyl-1-pyrophosphate (PRPP)

6
10/19/2020

7
10/19/2020

8
10/19/2020

9
10/19/2020

10
10/19/2020

11
 10/19/2020

• Senyawa antara pertama yg

memiliki cincin purin adalah asam
inosinat (IMP)
• Selanjutnya as inosinat diubah mjd
asam adenilat (AMP) dan asam
guanilat (GMP)

12
 10/19/2020

• as inosinat (IMP) diubah mjd as adenilat (AMP) dan as guanilat

(GMP) yg mrpk unit pembtk polinukleotida

13
 10/19/2020

2. Biosintesis Nukleotida Pirimidin

sitosin urasil

timin

Tahap2 Biosintesis Nukleotida Pirimidin :

14
 10/19/2020

Tahap2 Biosintesis Nukleotida Pirimidin :

• Nukleotida pirimidin dibuat dari aspartat

dan karbamoil fosfat.
• Berbeda dg nukleotida purin, nukleotida
pirimidin diawali dg pembtkkan cincin
pirimidin terlebih dulu, kmdn baru
dilekatkan ke ribosa fosfat.
• Nukleotida pirimidin :
Uridilat (UTP)
Sitidilat (CTP)

15
10/19/2020

16
10/19/2020

17
 10/19/2020

Berbeda dg nukleotida purin, nukleotida

pirimidin diawali dg pembtkkan cincin
pirimidin terlebih dulu, kmdn baru
dilekatkan ke ribosa fosfat.

18
10/19/2020

19
 10/19/2020

Nukleotida pirimidin :
Uridilat (UTP)
Sitidilat (CTP)

3. Ribonukleotida

adalah prekursor

Deoksiribonukleotida

20
 10/19/2020

reduksi

Ribosa Deoksiribosa

21
 10/19/2020

• Deoksiribonukleotida (unit pembangun DNA)

diturunkan dari ribonukleotida terkait melalui
reaksi yg melibatkan reduksi langsung atom C-2’
dari bgn D-ribosa membtk turunan 2’-deoksinya.

• ADP dADP

• Reduksi memerlukan sepasang atom H, yg diberikan

oleh NADPH, melalui protein pembawa hidrogen,
tioredoksin.

• Btk teroksidasi (disulfida) tioredoksin, akan

direduksi oleh NADPH mjd btk sulfihidril (-SH) dg
bantuan enzim tioredoksin reduktase.

FIGURE 22–41
Proposed mechanism for
ribonucleotide reductase.

In the enzyme of E. coli and

most eukaryotes, the
active thiol groups are on the
R1 subunit; the active-site
radical (–X•) is on the R2
subunit and in E. coli is
probably a thiyl radical of
Cys439 (see Fig. 22–40). Steps 1
through 6 are described in the
text.

22
 10/19/2020

Tioredoksin tereduksi
akan mereduksi
NDP dNDP
dlm reaksi yg
dikatalisis oleh
enzim
ribonukleotida
reduktase

FIGURE 22–39
Reduction of
ribonucleotides to
deoxyribonucleotides by
ribonucleotide reductase.
Electrons are transmitted
(blue arrows) to the enzyme
from NADPH by
(a) glutaredoxin or
(b) thioredoxin.
The sulfide groups in
glutaredoxin reductase are
contributed by two molecules
of bound glutathione (GSH;
GSSG indicates oxidized
glutathione).
Note that thioredoxin
reductase is a flavoenzyme,
with FAD as prosthetic group.

23
 10/19/2020

• DNA mengandung timidilat (TMP), sbgi

pengganti uridilat (UMP) pd RNA

• Utk membuat dTMP :

mk dUMP yg dibuat dari UDP dimetilasi dg
N5,N10-metilentetrahidrofolat menjadi dTMP

1. dUDP + H2O dUMP + Pi

2. dUMP + N5,N10-metilentetrahidrofolat
dTMP + dihidrofolat

??????

metilasi

urasil timin

24
 10/19/2020

FIGURE 22–44 Conversion of dUMP

to dTMP by thymidylate synthase and
dihydrofolate reductase.
Serine hydroxymethyltransferase is
required for regeneration of the N5,N10-
methylene form of tetrahydrofolate. In the
synthesis of dTMP, all three hydrogens of
the added methyl group are derived from
N5,N10-methylenetetrahydrofolate (pink
and gray).

25