com
Bab 53
Ekologi Mikroba Molekuler Rhizosfer, Volume 2, Edisi pertama. Diedit oleh Frans J. de Bruijn.
561
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman2
misalnya, pendirian tanaman dan meningkatkan kekuatan akar tanaman dapat membentuk jaringan bawah tanah yang
tanaman. Ini dibahas di bagian ini. Mikroba lain memiliki sangat besar. Karena eksudat dari hifa jamur melarutkan
efek yang lebih spesifik untuk nutrisi tertentu. Ini dibahas lebih banyak P daripada eksudat akar saja, disarankan
dalam Bagian 53.3. bahwa mikoriza berkontribusi terhadap peningkatan
serapan P melalui pelarutan P. FMA dapat meningkatkan
53.2.1 Mikoriza pembentukan tanaman dan meningkatkan penyerapan air
arbuskularJamur (AMF) dan hara, terutama P, Zn, dan Cu (Clark dan Zeto, 2000;
lihat Gambar 53.1; Tabel 53.1a). FMA juga melindungi
Sekitar 90% tanaman darat hidup bersimbiosis dengan tanaman dari cekaman biotik dan abiotik serta dapat
FMA (lihat Bab 43; lihat Gambar 53.1 dan Tabel 53.1a). memperbaiki struktur tanah (Smith dan Read, 2008).
AMF tidak spesifik untuk host. Kombinasi AMF dan Karena AMF melakukan fungsi yang sama seperti root,
mereka secara fungsional memperluas sistem root. Karena
itu,
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman3
53.3.1 Fiksasi nitrogen (Weir, 2011; lihat Bab 44) dan masih terus berkembang.
Rhizobia yang paling terkenal adalah subkelas dari
N2 berlimpah di atmosfer, tetapi tidak tersedia bagi
Proteobacteria (Allorhizobium, Azorhizobium, Rhizobium,
tanaman. Tumbuhan menerima nitrogen dalam bentuk
Mesorhizobium, Ensifer [mantan Sinorhizobium] dan
amonium (NH4+) dan nitrat (NO3 – ). Penyerapan NO3 –
Bradyrhizobium; lihat juga Bab 94). Selain itu, beberapa -
terjadi bersamaan dengan masuknya proton, sedangkan
proteobacteria milik Burkholderia dan Cupriavidus telah
penyerapan NH4+ terjadi bersamaan dengan pelepasan
terbukti membuat tanaman bernodul.(Moulin et al., 2001).
proton. Proses ini karena itu menyebabkan alkalinisasi dan
Rhizobia dan bakteri pengikat N lainnya berbagi gen
pengasaman rizosfer, masing-masing, dan secara
anggukan dan nif esensial yang masing-masing mengkode
substansial mempengaruhi proses rizosfer.
fungsi nodulasi dan fiksasi nitrogen(Zehr dan Turner,
Konversi N2 atmosfer menjadi amonium dikenal
2001). Gen-gen ini sering dibawa pada plasmid simbiosis
sebagai proses fiksasi nitrogen biologis atau diazotrofi.
yang sangat mudah dipindahkan (Brom et al., 2004). Selain
Kemampuan untuk memperbaiki nitrogen tersebar luas di
itu, bakteri penerima dapat memperoleh fungsi simbiosis
antara prokariota dengan perwakilan di bakteri dan archaea
setelah ditransformasikan dengan plasmid ini(Rogel et al.,
(Dekas et al., 2009). Reaksi ini dikatalisis oleh kompleks
2001). Karena hal ini dapat terjadi baik di bawah kondisi
enzim nitrogenase yang pada sebagian besar bakteri
laboratorium maupun di lapangan, hal ini mungkin dapat
mengandung molibdenum – besi (Mo – Fe) sebagai
menjelaskan sebagian keragaman bakteri pembentuk akar
kofaktor. Beberapa bakteri memiliki nitrogenase tambahan
(lihat Bab 44).
yang mengandung vanadium (Robson et al., 1986) atau
Simbiosis ini diawali oleh senyawa eksudat akar
hanya besi (Chisnell et al., 1988). Namun, nitrogenase
senyawa, flavonoid, atau isoflavonoid, yang, setelah
alternatif memiliki efisiensi fiksasi nitrogen yang lebih
diserap oleh bakteri, mengaktifkan gen anggukan dalam
rendah dibandingkan dengan yang konvensional(Joerger
bakteri (Lihat Gambar 53.2; lihat Bab 51). Jawaban bakteri
dan Bishop, 1988).
dalam dialog molekuler ini adalah sekresi produk yang
Banyak bakteri diazotrofik mampu membangun
dikodekan oleh gen anggukan, faktor NOD. Faktor NOD
hubungan simbiosis dengan tanaman. Diazotrof simbiosis
adalah oligosakarida lipo-kitin yang berbeda satu sama lain
yang paling banyak dipelajari termasuk dalam rhizobia
gram negatif yang menginduksi bintil pada tanaman dalam panjang fragmen kitin, dalam ketidakjenuhan rantai
polong-polongan (Fabales; lihat Gambar 53.2). Satu- asil lemaknya, dan adanya beberapa dekorasi molekul. Hal
satunya pengecualian adalah genus Parasponia yang ini membuat faktor NOD menjadi penentu utama
termasuk dalam Rosales tetapi bernodul oleh spesifisitas simbiosis inang (Spanyol et al., 1998; lihat juga
rhizobia(Markmann dan Parniske, 2009). Bab 45; Gambar 53.2). Persepsi spesifik faktor NOD oleh
Simbiosis rhizobium - legum dianggap sebagai sumber tanaman menghasilkan aktivasi satu set gen tanaman yang
utama nitrogen tetap. Diperkirakan bahwa simbiosis ini mengarah pada pembentukan bintil akar dan masuknya
menyumbang lebih dari 45 juta metrik ton N per tahun bakteri.(Geurts dan Bisseling, 2002;lihat Bab 45). Namun,
untuk ekosistem terestrial (Vance, 2001). Taksonomi bradyrhizobia fotosintesis tertentu tidak memiliki gen
rhizobia saat ini mencakup 12 genera dengan lebih dari 90 anggukan
spesies
N2 N2
Bintil PGP
pembentukandi bawah N-keterbatasan
LCO
Sintesis dan
sekresidari LCO Rhizobium
Bradyrhizobium
LCOFlavonoid Iso-flavonoid
Langsung
PGP Gambar 53.2Kontribusi mikroba terhadap
nutrisi N tanaman. Untuk penjelasan, lihat
teks. Warna: hijau, tanaman; merah, mikroba;
biru, proses
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman5
mengandalkan strategi yang berbeda, belum ditandai untuk (Rodriguez dan Frago, 1999; Igual et al., 2001; Smyth,
sinyal tanaman (Giraud et al., 2007). anggukan Gen belum 2011).
terdeteksi dalam genom Frankia, bakteri gram positif dari Tanaman bereaksi terhadap pembatasan P dengan
famili Actinobacteria yang membuat nodul pada tanaman pengasaman rizosfer, dengan meningkatkan pertumbuhan
non-legum milik Rosales, Fagales, dan Cucurbitales. akar menuju zona tanah yang tidak tereksploitasi, dengan
Temuan menarik ini merupakan sumber yang menjanjikan meningkatkan jumlah rambut akar, dan dengan mensekresi
untuk mengembangkan sereal pengikat nitrogen. fosfatase. Pengasaman adalah hasil sekresi anion organik
Rhizobia dapat berinteraksi dengan bakteri lain yang bersama dengan proton. Anion organik, dengan sitrat dan
berasosiasi dengan tumbuhan di rizosfer. Kerja sama oksalat yang lebih efektif daripada yang lain, dapat secara
seperti itu dapat memiliki efek menguntungkan pada langsung memfasilitasi mobilisasi fosfat (Richardson et al.,
pertumbuhan tanaman. Misalnya, Egamberdieva et al. 2009; Lihat Gambar 53.3).
(2010) baru-baru ini menunjukkan bahwa co-inokulasi Fosfor banyak digunakan sebagai pupuk kimia, dan
galega pakan ternak dengan Rhizobium dan pseudomonad aplikasi fosfor yang berlebihan dan tidak dikelola dapat
biokontrol meningkatkan bahan kering pucuk dan akar berdampak negatif terhadap lingkungan, termasuk
tanaman. Salah satu strain ini, Pseudomonas trivialis eutrofikasi dan hipoksia danau dan muara laut (Smyth,
penghasil selulase 3Re27(Scherwinski et al., 2008), secara 2011).
signifikan meningkatkan jumlah bintil dan kandungan Beberapa bakteri, disebut sebagai bakteri pelarut fosfat
nitrogen dari tanaman yang diinokulasi. Para penulis (Igual et al., 2001; Kim et al., 1998), mampu melarutkan
menciptakan istilah “bakteri penolong Rhizobium” untuk fosfor yang terikat dari molekul organik atau anorganik,
galur biokontrol ini (Lihat Gambar 53.2). sehingga membuatnya tersedia untuk tanaman (Lipton
Selain simbion, ada juga diazotrof yang hidup bebas dkk., 1987; Lihat Gambar 53.3). Bakteri pelarut fosfat ada
dan asosiatif; ini termasuk bakteri dari sejumlah genera: di mana-mana dan Bacillus (Tabel 53.1c), Enterobacter,
Erwinia, dan Pseudomonas spp. (Tabel 53.1d; lihat juga
Acetobacter, Azoarcus, Azospirillum, Azotobacter,
Bab 58) termasuk di antara spesies yang paling kuat.
Bacillus (Tabel 53.1c), Beijerincka, Burkholderia,
Produksi asam organik seperti asam glukonat merupakan
Enterobacter, Herbaspirillum, Klebsiella, Paenibacillus,
faktor utama dalam pelepasan fosfor dari mineral
Pseudomonas (Tabel 53.1d), dan Stenotrophomonas
fosfat(Rodriguez et al., 2006). Juga, pelepasan berbagai
(Dobbelaere et al., 2003; lihat Gambar 53.2).
enzim menghasilkan pembentukan bentuk fosfat yang
Menggunakan mutan yang tidak mampu memfiksasi
dapat diambil oleh tanaman (Lihat Gambar 53.3). Ini
nitrogen,Hurek dkk. (2002) menunjukkan bahwa efek
termasuk fosfatase nonspesifik yang mendefosforilasi
menguntungkan dari bakteri diazotrofik endofit Azoarcus
ikatan fosfor – ester dan/atau fosfoanhidrida dalam bahan
sp. pada rumput Kaller berhubungan langsung dengan organik, fitase yang melepaskan fosfor dari asam
kemampuan mengikat nitrogennya dan hal ini juga berlaku fitat(Idriss et al., 2002), fosfonatase, dan liase C–P yang
untuk Acetobacter diazotrophicus pada tebu (Sevilla et al., memisahkan ikatan C–P dalam organofofonat(Rodriguez et
2001). al., 2006). Vyas dan Gulati (2009) menunjukkan bahwa
Klebsiella pneumoniaedan Azospirillum bebas Pseudomonas spp. mampu meningkatkan pertumbuhan dan
bakteri rizosfer pengikat nitrogen hidup. Di masa lalu, sifat kandungan fosfor
pemacu pertumbuhan tanaman Azospirillum adalah
dianggap karena properti pengikat N2 tetapi perkembangan
terakhir menunjukkan bahwa properti ini terutama karena Enzim
kemampuannya untuk menghasilkan arsitektur akar yang fosfatase
mempengaruhi
hormon, auksin (Lihat Bagian 53.4.1; lihat Bab 27, 29).
Batasan-P
pensinyalan seluler (Vance et al., 2003). Asam Sitrat,
Tanaman dapat menyerap fosfor hanya sebagai ion glukon oksalat
at
H2PO4 – dan HPO42–. Sebagian besar tanah mengandung
jumlah fosfat yang pada prinsipnya cukup untuk LarutP serapan PGP
mendukung pertumbuhan tanaman. Namun, banyak dari
bentuk organik dan anorganik ini
tidak dapat diakses oleh tanaman. Juga fosfor yang Gambar 53.3Kontribusi mikroba terhadap nutrisi P tanaman.
ditambahkan ke tanah sebagai pupuk kimia yang larut Untuk penjelasan, lihat teks. Warna: hijau, tanaman; merah,
dapat dengan cepat difiksasi menjadi bentuk yang tidak mikroba; biru, proses
larut dan dengan demikian menjadi tidak tersedia bagi
tanaman
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman6
Kemampuan memproduksi auksin dan sitokinin Tingkat ABA di planta telah meningkat di Arabidopsis
merupakan faktor virulensi patogen Agrobacterium thaliana oleh A. brasilense Sp25 (Cohen et al., 2008).
tumefaciens, yang menghasilkan crown galls. Bakteri ini Pengaruh inokulasi dengan bakteri penghasil ABA
dapat mentransfer gen untuk produksi auksin dan sitokinin pada pertumbuhan tanaman secara eksperimental kurang
ke tanaman dan memasukkan gen ini ke dalam DNA didukung. Sejak ABA menghambat sintesis sitokinin
tanaman (lihat Spaink et al., 1998). Bakteri lain dari genus (Miernyk, 1979), itu berspekulasi bahwa ABA
ini, A. rhizogenes, memodifikasi metabolisme sitokinin, meningkatkan pertumbuhan tanaman dengan mengganggu
menghasilkan munculnya massa akar – bukan kalus – dari kumpulan sitokinin (Spaepen et al., 2009). Itu juga bisa
tempat infeksi (Hamill et al., 1993). mengurangi stres tanaman dengan meningkatkan rasio akar
/ pucuk (Boiero et al., 2007).
53.4.3 Gas
Hormon-hormon ini terdiri dari sekelompok terpenoid 53.4.5 ET dan ACC Deaminase
dengan 20 atom karbon, tetapi GA aktif hanya memiliki 19 ET adalah hormon gas yang paling dikenal karena
atom karbon. Kelompok senyawa ini terdiri dari lebih dari kemampuannya untuk menginduksi pematangan buah dan
130 molekul yang berbeda (Dodd et al., 2010; lihat Bab penuaan bunga. ET mempengaruhi banyak proses
31). GAs terutama terlibat dalam pembelahan sel dan perkembangan tanaman termasuk pertumbuhan akar,
pemanjangan sel dalam meristem subapikal, dengan pembentukan rambut akar, pembungaan, pematangan buah,
demikian, memainkan peran kunci dalam pemanjangan dan absisi, dan penuaan dan absisi daun dan kelopak
ruas. Proses lain yang dipengaruhi oleh hormon ini adalah (Dugardeyn dan van der Straeten, 2008). ET biasanya
perkecambahan biji, pertumbuhan tabung polen, dan menghambat pemanjangan akar primer dan pembentukan
pembungaan pada tanaman roset. Mirip dengan auksin dan akar lateral tetapi juga dapat mendorong pembentukan
sitokinin, GAs terutama bertindak dalam kombinasi dengan rambut akar (Dodd et al., 2010). Ini umumnya menghambat
hormon lain. pemanjangan batang di sebagian besar dikotil mendukung
Bakteri yang menghasilkan GAs, seperti ekspansi sel lateral dan menyebabkan pembengkakan
Acinetobacter, Agrobacterium, Arthrobacter, A. brasilense, hipokotil. ET juga mematahkan dormansi benih dan tunas.
Azospirillum lipoferum, Azotobacter, Bacillus, Produksi ET biasanya diregulasi pada tanaman sebagai
Bradyrhizobium japonicum, Clostridium, Flavobacterium, respons terhadap serangan patogen, cekaman panas dan
Micrococcus, Pseudomonas, Rhizobium, dan Xanthomonas dingin, genangan air, kekeringan, kelebihan logam berat,
di the rhizosphere, mensekresikannya Frankenberger dan salinitas tanah yang tinggi, dan pemadatan tanah (Dodd et
Arshad, 1995; Gutie´rrez Manero dkk., 2001; Rademacher, al., 2010; Glick, 2005).
1994; Tsavkelova dkk., 2006). Hampir tidak ada yang ET disintesis dalam kondisi cekaman biotik setelah
diketahui tentang sintesis GA pada bakteri rizosfer. infeksi oleh patogen, serta kondisi cekaman abiotik seperti
Kang dkk. (2009) menunjukkan bahwa suspensi kultur kekeringan. Oleh karena itu, ia juga dikenal sebagai
Acinetobacter calcoaceticus penghasil GA mampu hormon stres. Di pabrik, ET dihasilkan dari S-
meningkatkan pertumbuhan mentimun, sawi putih, dan adenosylmethionine (SAM) yang secara enzimatis
mahkota aster. Mekanisme stimulasi pertumbuhan tanaman diubah menjadi ACC dan 5′-deoxy-5′methylthioadenosine
oleh GAs masih agak kabur. Diperkirakan bahwa bakteri (MTA) oleh ACC synthase (Giovanelli et al., 1980; Lihat
dapat meningkatkan kadar GA di planta dengan Gambar 53.6).
memproduksi GAs, mendekonjugasi GAs dari eksudat Enzim ACC deaminase terdapat pada banyak bakteri
akar, atau menghidroksilasi GA tidak aktif menjadi bentuk rizosfer, seperti Achromobacter, Pseudomonas, dan
aktif (Bottini et al., 2004; lihat Bab 31). Fulchieri dkk. Variovorax, dan pada jamur Trichoderma. Mikroba
(1993) berspekulasi bahwa GAs meningkatkan kepadatan tersebut dapat mengambil ACC yang disekresikan oleh
rambut akar di zona akar yang terlibat dalam penyerapan akar tanaman dan mengubahnya menjadi -ketobutirat dan
nutrisi dan air. amonia (Glick et al., 2007a; Gambar 53.6). Hal ini
menyebabkan penurunan tingkat ACC, dan karena itu juga
tingkat ET, pada tanaman dan penurunan stres tanaman.
53.4.4 ABA
Inokulasi tanaman dengan bakteri penghasil ACC
ABA adalah senyawa 15-karbon, yang mirip dengan ET, deaminase dapat melindungi tanaman dari stres akibat
terlibat dalam respons tanaman terhadap cekaman biotik banjir, salinasi, kekeringan, genangan air, logam berat,
dan abiotik. Ini menghambat perkecambahan biji dan senyawa organik beracun, dan patogen (Berg, 2009; Glick,
pembungaan. Ini terlibat dalam perlindungan terhadap 2005; Glick et al., 2007a,2007b). ; Belimov et al., 2005).
kekeringan, stres garam, dan logam beracun. Ini juga Aktivitas ACC deaminase telah ditemukan pada jamur
menginduksi penutupan stomata (Smyth, 2011). seperti Trichoderma (Viterbo et al., 2010) dan pada bakteri
ABA dapat diproduksi dalam media kultur oleh tanah yang hidup bebas, endofit,
beberapa bakteri seperti A. brasilense (Cohen et al., 2008;
Perrig et al., 2007) dan B. japonicum (Boiero et al., 2007).
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman9
auksin HAI
ACC deaminase
dari mikroba PGP
Stimulasidari ACC
perpaduan MENDEKUTNH
4
2-Oxobutanoate
MENDEKUT
N H3
2e 2H
1-Amino-siklopropana Etilen
-1-karboksilat (ACC) H2CCH2BERSAMA2HCN
ACC oksidase Hormon stres
Gambar 53.6Peran mikroba ACC deaminase dalam pengendalian stres tanaman. Untuk penjelasan, lihat teks. Angka tersebut terutama
didasarkan pada makalah oleh kelompok B. Glick. Menurut hipotesisnya (Glick et al., 1998), auksin bakteri mengaktifkan sintase ACC tanaman.
ACC yang dihasilkan dapat digunakan oleh beberapa mikroba sebagai sumber N, sehingga menurunkan kadar etilen. Untuk menjelaskan
bagaimana ACC yang dihasilkan oleh tanaman diubah oleh ACC deaminase dari sitoplasma bakteri, Glick et al. (1998) mengasumsikan bahwa
sebagian besar ACC dikeluarkan dari akar dan biji tanaman dan kemudian diserap oleh mikroba. Kami ingin menyarankan penjelasan alternatif
berikut, yaitu bahwa mikroba menggunakan sistem sekresi tipe tiga (TTSS) untuk tujuan ini seperti yang telah diusulkan sebelumnya bahwa
bakteri menguntungkan menggunakan jarum TTSS untuk menyedot nutrisi dari akar tanaman (De Weert et al., 2007). Kemungkinan lain adalah
bahwa bakteri menggunakan TTSS untuk mengirimkan enzim ke dalam tanaman. Dalam kasus Trichoderma, dapat dibayangkan bahwa lokalisasi
endofitnya memfasilitasi kontak antara enzim dan substrat. Warna: hijau, tanaman; merah, mikroba; biru, proses
misalnya gandum (Zahir et al., 2009), jagung (Shaharoona dari kondisi ini, masing-masing strain menunjukkan
et al., 2006), dan tomat (Grichko dan Glick, 2001; Mayak modulasi pertumbuhan tanaman yang dimediasi volatil
et al., 2004a,2004b). yang signifikan. Hanya satu galur, Burkholderia pyrrocinia,
Selain berperan langsung ET pada pertumbuhan yang menunjukkan PGP signifikan pada keempat media.
tanaman, hormon ini juga dapat berperan sebagai faktor Indol volatil, 1-heksanol, dan pentadekana menunjukkan
virulensi dan molekul pemberi sinyal dalam perlindungan PGP tetapi hasilnya menunjukkan bahwa ini hanya terjadi
tanaman terhadap serangan patogen. Produksi ET pada kondisi stres.
dilaporkan bertindak sebagai faktor virulensi untuk bakteri
patogen, misalnya, Pseudomonas syringae (Weingart dan
Volksch, 1997; Weingart et al., 2001). Selanjutnya, ET 53.4.7 AHL
bertindak sebagai senyawa pensinyalan dalam menginduksi AHL adalah molekul sinyal yang disekresikan oleh banyak
resistensi sistemik yang disebabkan oleh beberapa bakteri. Ketika konsentrasi ekstraseluler mereka mencapai
rhizobakteri (Van Loon, 2007). nilai tertentu, kuorum, mereka memainkan peran dalam
banyak proses seperti sekresi antibiotik dan exo-enzim
53.4.6 mudah menguap (lihat Bab 71). Untuk diskusi lebih rinci tentang AHL dan
tindakannya (lihat Bab 70 – 78). Dalam hal promosi
Bakteri dapat menghasilkan berbagai volatil. Sementara pertumbuhan, baru-baru ini ditunjukkan bahwa 10 m C6-
fungsi biologis sebagian besar volatil ini tidak sepenuhnya AHL dan C8-AHL meningkatkan pertumbuhan akar pada
dipahami, diasumsikan bahwa mereka terlibat dalam A. thaliana (Lihat Gambar 53.5; lihat juga Bab 73). Hal ini
sejumlah proses termasuk pensinyalan sel-sel, pensinyalan disertai dengan peningkatan rasio auksin/sitokinin dan
antarspesies, dan kemungkinan katup pelepasan karbon; peningkatan ekspresi lebih dari 700 gen di akar dan jumlah
senyawa ini dapat mendorong pertumbuhan tanaman dan yang lebih rendah di batang (von Rad et al., 2008).
bertindak sebagai agen penghambat mikroba (Wheatley,
2002; Vesperman et al., 2007; Kai et al., 2009; lihat juga
Bab 63). 53.4.8 anggukanPenginduksi
Volatil bakteri, yang diproduksi oleh Bacillus spp., Gen danLCO (Faktor
telah terbukti mendorong pertumbuhan tanaman di A. Mengangguk)
thaliana. Tingkat tertinggi dari promosi pertumbuhan Gen anggukan (Brady)Rhizobium diinduksi oleh flavonoid
diamati dengan 2,3-butanediol dan prekursor acetoin (Ryu atau isoflavonoid (lihat Bab 51). Molekul sinyal LCO
et al., 2003). adalah produk dari gen anggukan. Mereka memulai
Farag dkk. (2006) mengidentifikasi 38 senyawa volatil pengeritingan rambut akar dan langkah selanjutnya dalam
dari rhizobakteri. Blom dkk. (2011) menyaring 42 galur pembentukan nodul pada tanaman polong-polongan oleh
yang tumbuh di empat media pertumbuhan yang berbeda bakteri (Brady)rhizobium (lihat Bagian 53.3.1).
pada respon pertumbuhan A. thaliana. Di bawah setidaknya
satu
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman10
Menariknya, penginduksi serta produknya berke D, Fabbri C, Connor EC, Schiestl KB Klauser dr,
mban ,
g
gen anggukan mendorong pertumbuhan tanaman dan efek Boller T, Eberl L, Weisskopf L. Produksi volatil pengatur
ini tidak terbatas pada tanaman polong-polongan (Lihat pertumbuhan tanaman tersebar luas di antara bakteri rizosfer dan
sangat bergantung pada kondisi kultur. lingkungan. Mikrobiol.
Gambar 53.2). 2011;13:3047 –3058.
Melihathttp://www.bioag.novozymes.com.Misalnya, satu Boiero L, Perrig D, Masciarelli O, Penna C, Cassan F, Luna V.
produk didasarkan pada isoflavonoid dan diklaim dapat Produksi fitohormon oleh tiga galur Bradyrhizobium japon-air
mengaktifkan mikoriza sebelum tanaman melakukannya, matadan kemungkinan implikasi fisiologis dan teknologi. aplikasi
sehingga meningkatkan penyerapan nutrisi, yang pada Mikrobiol. Bioteknologi. 2007;74:874 – 880.
Borriss R. Penggunaan strain Bacillus terkait tanaman sebagai pupuk
gilirannya mengarah pada perkembangan akar lateral dan hayati dan agen biokontrol di bidang pertanian. Dalam: Maheshwari
toleransi stres. Formulasi untuk kedelai, kacang tanah, DK, editor. Bakteri dalam Agrobiologi: Respons Pertumbuhan
alfalfa, dan pea/lentil, yang menggabungkan masing- Tanaman. Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag; 2011. hal 41 – 76.
masing LCO dan rhizobia, juga telah dikomersialkan. Bottini R, Cassan F, Piccoli P. Giberellin produksi oleh bakteri dan
Ketika LCO diterapkan pada benih non-kacang-kacangan, keterlibatannya dalam promosi pertumbuhan tanaman dan peningkatan
hasil. aplikasi Mikrobiol. Bioteknologi. 2004;65:497 – 503.
jagung, kapas, dan gandum, peningkatan pertumbuhan dan
Brom S, Girard L, Tun-Garrido C, Garcia-de-los Santos A, Bustos P, dkk.
hasil tanaman diamati di lapangan. Aplikasi alur dan Transfer plasmid simbiosis Rhizobium etli CFN42 membutuhkan
semprotan daun memiliki efek yang sama. Penjelasan yang kointegrasi dengan p42a, yang dapat dimediasi oleh rekombinasi
mungkin diberikan adalah peningkatan perkecambahan, spesifik lokasi. J. Bakteri. 2004;186:7538 – 7548.
pertumbuhan bibit awal, peningkatan fotosintesis, Chisnell JR, Premakumar R, Uskup PE. Pemurnian nitrogenase
peningkatan penyerapan nutrisi, dan peningkatan alternatif kedua dari strain penghapusan nifHDK dari Azotobacter
vinelandii. J. Bakteri. 1988;170:27 – 33.
kolonisasi akar mikoriza yang distimulasi LCO (Smith et
Choi O, Kim J, Kim J, Jeong Y, Moon J, Seuk Park C, Hwang
al., 2011). I.Pyrroloquinoline quinone merupakan faktor pemacu pertumbuhan
tanaman yang diproduksi oleh Pseudomonas fluorescens B16. Fisiol
Tumbuhan. 2008;146:657 –668.
Clark RB, Zeto SK. Akuisisi mineral oleh tanaman mikoriza
53.5 KESIMPULAN arbuskular. J. Nutrisi Tanaman. 2000;23:867 – 902.
Cohen AC, Bottini R, Piccoli PN. Azospirillum brasilense Sp 245
Nitrogen dan fosfor adalah pupuk kimia utama yang menghasilkan ABA dalam media kultur yang ditentukan secara kimia
dan meningkatkan kandungan ABA pada tanaman Arabidopsis.
digunakan untuk meningkatkan hasil panen. Hal ini
Regulasi Pertumbuhan Tanaman. 2008;54:97 – 103.
menimbulkan sejumlah kekhawatiran seperti pencemaran Contreras-CornejoHA, Macias-RodriguezL, Corte´s-PenagosC, Lo´pez-
air yang menyebabkan eutrofikasi dan risiko kesehatan BucioJ. Trichoderma virens, jamur menguntungkan tanaman,
bagi manusia. Selain itu, hal itu mengakibatkan degradasi meningkatkan produksi biomassa dan mendorong pertumbuhan akar
tanah dan hilangnya keanekaragaman hayati. Saat ini, biaya lateral melalui mekanisme yang bergantung pada auksin di Arabidopsis.
pupuk nitrogen meningkat tajam sebagai akibat dari Fisiol Tumbuhan 2009;149:1579 –1592.
Costacurta A, Vanderleyden J. Sintesis fitohormon olehbakteri yang
kenaikan harga energi. Jumlah kalium yang tersedia
berasosiasi dengan tumbuhan. Kritis. Pdt. Mikrobiol. 1995;21:1 – 18.
terbatas. Untuk alasan ini, minat pada pemupukan de Freitas JR, Banerjee MR, Germida JJ. Rhizobakteri pelarut fosfat
berkelanjutan, menggunakan mikroba, sangat meningkat. meningkatkan pertumbuhan dan hasil tetapi tidak meningkatkan
Dalam bab ini, kita telah membahas banyak mikroba yang penyerapan fosfor kanola (Brassica rapus L.). Biol. Fert. Tanah
dapat diterapkan untuk pertanian yang lebih ramah 1997;24:358 – 364.
lingkungan. Dekas AD, Poretsky RS, Yatim VJ. Archaea laut dalam memperbaiki dan
berbagi nitrogen dalam konsorsium mikroba pemakan metana. Sains
2009;326:422 –426.
Deveau A, Palin B, Delaruelle C, Peter M, Kohler A, Pierrat JC, dkk.
Penolong mikoriza Pseudomonas fluorescens BBc6R8 memiliki
PENGAKUAN efek priming spesifik pada pertumbuhan, morfologi dan ekspresi
gen jamur ektomikoriza Laccaria bicolor S238N. Fitol Baru.
Penulis berterima kasih kepada Dr. Doreen Schachtschabel 2007;175:743 –755.
untuk diskusi tentang strigolakton dan bantuannya dengan De Weert S, Kuiper I, Kamilova F, Mulders IHM, Bloemberg GV,
Gambar 53.6. Kravchenko L, dkk. Peran kolonisasi ujung akar kompetitif dalam
pengendalian biologis kaki tomat dan busuk akar. Dalam: Chincolkar
SB, Mukerji KG, editor. Pengendalian hayati penyakit tanaman. New
York, London, Oxford: The Haworth Press, Inc.; 2007. hal 103 – 122.
REFERENSI
Barea JM, Navarra E, Montoya E. Produksi pertumbuhan Dobbelaere S, Croonenborghs A, Thys A, van de Broek A, Van-
tanaman
regulator oleh bakteri pelarut fosfat rizosfer. J. Aplikasi Bakteri. derleyden J. Phytostimulatory efek jenis liar Azospirillum brasilense
1976;40:129 – 134. dan strain mutan diubah dalam produksi IAA pada gandum. Tanah
Tanaman
Belimov AA, Hontzeas N, Safronova VI, Demchinskaya SV, 1999;212:153 -162.
Piluzza G, Bullita S, Glick BR. Bakteri pemacu pertumbuhan Dobbelaere S, Vanderleyden J, Okon Y. Pertumbuhan tanaman
tanaman toleran kadmium yang berasosiasi dengan akar mustard mempromosikan efek diazotrof di rizosfer. Kritis. Pdt. Tanaman Sci.
India (Bras-sica junceaL.Czem.). Biola Tanah. Biokimia. 2005;37:241 2003;22:107 – 149.
– 250.
Berg G. Interaksi tanaman-mikroba yang mendorong pertumbuhan dan Dodd IC, Zinovkina NY, Safronova VI, Belimov A A. Rhi-
kesehatan tanaman:
perspektif untuk mengendalikan penggunaan mikroorganisme di mediasi zobakteri status hormon tanaman. Ann. aplikasi Biol.
bidang pertanian. aplikasi Mikrobiol. Bioteknologi. 2009;84:11 – 2010;157:361 –379.
18.
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman11
Referensi 571
Referensi 573
weingart
H, Volksch B. Produksi etilen oleh Pseudomonas Zahir ZA, Arshad M, Frankenberger WT. Pemacu pertumbuhan tanaman-
jarum suntikpatovar in vitro dan in planta. aplikasi Mengepung. ing rhizobacteria: Aplikasi dan perspektif dalam pertanian. Adv.
Mikrobiol. 1997;63:156 – 161. Agro. 2003;81:97 – 168.
Weingart H, Ulrich H, Geider K, Volksch B. Peran produksi etilen Zahir ZA, Ghani U, Naveed M, Nadeem SM, Asghar HN. Efektivitas
dalam virulensi Pseudomonas syringae pvs. glisin dan faseolicola. komparatif Pseudomonas dan Serratia sp. mengandung ACC-
Fitopatologi 2001; 91:511 – 518. deaminase untuk meningkatkan pertumbuhan dan hasil gandum
Bendung BS. 2011. Taksonomi rhizobia saat ini. Situs web rhizobia (Triticum aestivum L.) di bawah kondisi tekanan garam.
Selandia Baru.http://www.rhizobia.co.nz/taxonomy/rhizobia.html. Lengkungan. Mikrobiol. 2009;191:415 –424.
Terakhir diperbarui: 14 September 2011. Zehr JP, Turner PJ. Fiksasi nitrogen: Gen dan gen nitrogenaseekspresi.
Gandum RE. Konsekuensi dari organik yang mudah menguapinteraksi Dalam: Paul JH, editor. Metode dalam Mikrobiologi. New York: Pers
bakteri dan jamur yang dimediasi senyawa. Antonie Van Akademik; 2001. hal 271 – 285.
Leeuwenhoek 2002;81:357 – 364. Zhang H, Sun Y, Xie X, Kim MS, Dowd SE, Pare PW. Sebuah bakteri
Wu SC, Cao ZH, Li ZG, Cheung KC, Wong MH. Pengaruh pupuk hayati tanah mengatur akuisisi tanaman besi melalui mekanisme defisiensi-
yang mengandung pemfiksasi N, pelarut P dan K dan jamur AM diinduksi. Pabrik J. 2008;58:568 – 577.
terhadap pertumbuhan jagung: percobaan rumah kaca. Geoderma
2005;125:155 – 166.
de Bruijn c53.tex V3 - 18/02/2013 22:35 Halaman14