Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com

20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh Lisensi Creative Commons yang berlaku
Artikel Penelitian Institut Pembuatan Bir & Penyulingan

Diterima: 18 April 2015 Revisi: 10 Agustus 2015 Diterima: 10 Agustus 2015 Diterbitkan secara online di Wiley Online Library: 16 September 2015

(wileyonlinelibrary.com) DOI 10.1002/jib.272

Karakterisasi komunitas mikroba dalam tiga jenis

starter fermentasi yang digunakan untuk produksi
minuman keras Cina
Min Gou,1HuiZhong Wang,1HuaWei Yuan,2Wen Xue Zhang,2Yue Qin Tang1* dan
Kenji Kida1

Studi ini meneliti dan membandingkan komunitas mikroba dalam tiga starter fermentasi yang khas (disebut sebagaiDaqu, Xiaoqu,
dan Fuqudi Cina) digunakan untuk produksi minuman keras dengan menganalisis perpustakaan klon gen 16S dan 18S rRNA. Hasil
penelitian menunjukkan bahwa keragaman mikroba pada ketiga jenis starter fermentasi (JiuQu)berbeda secara signifikan. Spesies
bakteri diDaqudanFuquterutama termofilik atau termotoleran. DiDaq,spesies bakteri yang dominan adalahThermoactinomyces
sanguinis (53,85%) dan aglomeran Pantoea (19,23%), diikuti oleh bakteri yang tidak dikultur (15,39%). Bakteri asam laktatWeissella
cibaria (50%) dan anggota Enterobacteriaceae,Enterobacter ludwigii (10%), adalah spesies bakteri yang dominan diXiaoqu.
Kelimpahan rendah dari bakteri lain, termasukDeinococcus radiodurans, Corynebacterium variabiledanAcinetobacter baumannii,
dilaporkan untuk Xiaoqu. Enterococcus faecium, Clostridium beijerinckiidanBacillus cereusdiamati diFuqudan masing-masing
menyumbang 46,67, 23,33 dan 16,67% dari total bakteri yang diidentifikasi. Keanekaragaman jamur tinggiDaqudan secara eksklusif
terdiri dari cetakan termofilik, sepertiAspergillus glaucus (62,5%),Thermomyces lanuginosus (12,5%) danTermoascus crustaceus (
12,5%). Hanya dua spesies jamur yang dilaporkanFuqudanXiaoqudan keduanya berisi cetakanRhizopus oryzae. Saccharomyces
cerevisiae dan non-Saccharomycesragi (Saccharomycopsis fibuligera)juga diidentifikasi diFuqudanXiaoqu,masing-masing. Temuan ini
menunjukkan bahwa struktur komunitas mikroba diJiuQupermulaan adalah faktor kunci untuk menentukan variasi rasa. Hak Cipta ©
2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan

Kata kunci:starter fermentasi;JiuQu;komunitas bakteri; komunitas eukariotik; perpustakaan klon

pengantar tambahan,Fuqutelah berhasil digunakan untuk produksi saus- (7),

lampu- (8)dan rasa wijen (9)minuman keras Cina. Minuman keras
Minuman keras Cina terkenal di seluruh dunia sebagai minuman
rasa wijen adalah rasa baru yang dihasilkan dengan menggunakan
keras yang disuling dengan total produksi tahunan diperkirakan
Fuqusebagai starter fermentasi utama ditambah denganDaqu;itu
sekitar 5 juta ton per tahun dan 12,26 juta liter pada tahun 2013 (
adalah perkembangan terbaru berdasarkan teknologi produksi
1,2).Minuman keras Cina sering diproduksi dari sereal dengan
minuman keras tiga rasa yang disebutkan di atas (9).Minuman keras
fermentasi keadaan padat menggunakan starter fermentasi, yang
Cina rasa wijen semakin menarik perhatian karena rasa wijennya
disebutJiuQuDi Tiongkok.JiuQubertindak sebagai agen sakarifikasi
yang unik. Namun, sebagian besar penelitian berfokus terutama
dan fermentasi yang terdiri dari campuran bahan baku, mikrobiota,
pada produksi, teknologi, dan mikrobiotaDaqukarena hasil yang
enzim dan prekursor aroma, yang berdampak signifikan pada rasa
tinggi.
produk minuman keras (3). JiuQudapat diklasifikasikan menjadi tiga
Inokulasi bakteri, jamur dan ragi yang berasal dari bahan mentah dan
kategori umum berdasarkan bahan dan penerapan teknologinya:
habitat alami memainkan peran kunci dalamJiuQuperkembangan.
Daqu, XiaoqudanFuqu (3).
Komunitas mikroba dariDaqutelah dikarakterisasi dalam laporan
Daquadalah tipe biji-bijianJiuQuterdiri dari gandum, jewawut dan/
sebelumnya menggunakan pendekatan kultur-independen, seperti
atau kacang polong (4).PalingDaqudisiapkan dengan serangkaian
elektroforesis gel gradien denaturasi reaksi berantai polimerase yang
langkah penggilingan dan pencampuran, pembentukan, inkubasi
banyak digunakan (PCR-DGGE) (2,10–12)dan perpustakaan klon gen
dan pematangan (4,5).Saat ini, 70% minuman keras Tiongkok dibuat
subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) kecil (13).Banyak faktor yang
denganDaqustarter fermentasi, termasuk sebagian besar minuman
mempengaruhi keanekaragaman dan kelimpahan komunitas mikroba di
keras terkenal di Cina, sepertiMaotai, LuzhoudanRawa,yang masing-
IndonesiaDaq, termasuk konstituen bahan baku, suhu produksi,
masing mewakili minuman keras Cina rasa saus, kuat, dan ringan (
4).Dua starter fermentasi lainnya,XiaoqudanFuku,terdiri dari sorgum
dan dedak, masing-masing (4).Keduanya disiapkan terutama dengan * Korespondensi ke: YueQin Tang, Sekolah Tinggi Arsitektur dan Lingkungan,
mengukus bahan mentah diikuti dengan inokulasi dengan jamur Universitas Sichuan, Chengdu 610065, Tiongkok. Email: tangyq@scu.edu.cn
biakan murni dan strain ragi dan inkubasi pada suhu dan kondisi
1Sekolah Tinggi Arsitektur dan Lingkungan, Universitas Sichuan, Chengdu
kelembaban yang sesuai (6,7).SichuanXiaoquminuman keras,
610065, Cina
terhitung sepertiga dari hasil tahunan minuman keras Sichuan,
semakin populer secara global karena rasa dan penerapannya yang 2Sekolah Tinggi Industri Ringan, Teknik Tekstil dan Makanan, Universitas Sichuan,
ringan dan populer dalam produksi anggur kesehatan (6).Di Chengdu 610065, Tiongkok
620

J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627 Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
 20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh ap
Komunitas mikroba dalam tiga jenis starter fermentasi
Institut Pembuatan Bir & Penyulingan

kelembaban dan mikrohabitat. Pengetahuan tentang mikrobiota di
Daqu masih jauh dari selesai. Selain itu, informasi terbatas tersedia
mengenai komposisi dan fungsi mikroba diXiaoqu dan terutama di
Fuqu.Beberapa penelitian telah mencoba membandingkan
komunitas mikroba dari ketiganyaJiuQu.Dalam penelitian ini, kami
menyelidiki dan membandingkan komunitas mikroba dalam tiga
starter fermentasi minuman keras khas Cina (Daqu, XiaoqudanFuqu)
menggunakan perpustakaan klon gen 16S dan 18S rRNA. Informasi
yang diperoleh mengenai starter fermentasi dapat membantu
dalam memahami komposisi mikrobaJiuQu dan meningkatkan
kontrol kualitas untuk produk minuman keras.
Bahan dan metode
Pengumpulan sampel
TigaJiuQuuntuk produksi minuman keras (Daqu, XiaoqudanFuqu)
dikumpulkan dari pabrik starter fermentasi yang berbeda yang masing-
masing terletak di Kota Qionglai, Kabupaten Luojiang dan Kabupaten Lu
di provinsi Sichuan Cina. Semua sampel disimpan pada suhu 4 ° C
sebelum analisis komunitas mikroba.
plasmid kemudian diubah menjadiEscherichia coliSel DH5a (TaKaRa,
Jepang) dan disepuh pada pelat agar Luria–Bertani yang
mengandung 100 μg/mL ampisilin, 40 μg/mL X-gal (TaKaRa, Jepang)
dan 24 μg/mL Isopropil β-D-1-thiogalactopyranoside (TaKaRa,
Jepang). Klon putih dipilih secara acak untuk ekstraksi plasmid.
Kehadiran gen SSU rDNA diverifikasi oleh PCR.
Sequencing dan analisis filogenetik dari SSU rRNA
Klon positif dari setiap perpustakaan dipilih secara acak dan diurutkan
menggunakan Sistem Analisis Genetik CEQ8000 (Beckman Coulter, USA).
Setelah melakukan Pemeriksaan Chimera menggunakan layanan web
Bellerophon (http://comp-bio.anu.edu.au/bellerophon/bellerophon.pl)
seperti yang dijelaskan oleh Huber et al.
(15),urutan yang menunjukkan kesamaan urutan> 97%
dikelompokkan dalam satu unit taksonomi operasional (OTU).
Urutan OTU kemudian diselaraskan menggunakan program
Clustal_X (16) dan pohon filogenetik dibangun berdasarkan metode
penggabungan tetangga menggunakan perangkat lunak Molecular
Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) (17).

Analisis statistik perpustakaan klon

ekstraksi DNA
Setelah digiling, 2 g dari masing-masing sampel disuspensikan kembali
dalam 30 mL phosphate buffered saline (PBS) (pH 7,4) dan divorteks
selama 5 menit pada suhu sekitar. Suspensi disaring melalui satu lapisan
kasa dan filtrat dipindahkan ke tabung sentrifus 50 mL untuk sentrifugasi
(10.000 rpm, 4°C) selama 10 menit. Pelet yang dihasilkan dicuci dua kali
dengan 30 mL buffer PBS dan disuspensikan kembali dalam 2 mL buffer
PBS untuk ekstraksi DNA. DNA genom diekstraksi menggunakan metode
CTAB seperti yang dijelaskan oleh Griffiths et al. (14).DNA yang
diekstraksi disimpan pada suhu -20°C sebelum mengkloning
perpustakaan.
Konstruksi perpustakaan klon gen SSU rRNA
SSU rDNA prokariotik (bakteri) dan eukariotik (jamur) diamplifikasi oleh
PCR menggunakan set primer spesifik (Eu27F, 5′-AGAGTTTGAT
CCTGGCTCAG-3′;dan 518R, 5′-GTATTACCGCGCTGCTGG-3′untuk bakteri
16S rDNA; nu-ssu-0817-5′F, 5′-TTAGCATGGAATAATRRAA TAGGA-3′;dan nu-
ssu-1536-3′R, 5′-ATTGCAATGCYCTATCCCCA-3′ untuk jamur 18S rDNA).
Reaksi dilakukan dengan Sistem PCR GeneAmp 2400 (Perkin Elmer, USA)
di bawah kondisi PCR berikut: 95°C selama 9 menit diikuti oleh 20 siklus
95°C selama 1 menit, 50°C selama 1 menit, dan 72° C selama 1 menit.
Fragmen 16S rDNA dan 18S rDNA yang diamplifikasi kemudian diklon ke
dalam plasmid pT7 Blue Tvector (TaKaRa, Jepang) menggunakan Kit Ligasi
DNA (TaKaRa, Jepang) sesuai dengan protokol pabrikan. Yang
digabungkan kembali
Analisis statistik masing-masing perpustakaan dilakukan dengan
program Mothur (18).Estimator Chao 1 dan ACE untuk estimasi
kekayaan spesies dan indeks Shannon dan Simpson untuk estimasi
keanekaragaman dihitung dengan interval kepercayaan 95%, dan
batas kesamaan urutan ditetapkan sebesar 3%. Indeks cakupan
Good dari perpustakaan klon tertentu menjelaskan sejauh mana
urutan sampel dalam perpustakaan mewakili total populasi. Indeks
Boneh dihitung ketika ukuran sampel ditetapkan sebesar 50.
Nomor aksesi urutan nukleotida
Nomor aksesi GenBank untuk urutan OTU bakteri dan jamur yang
diperoleh dalam penelitian ini masing-masing adalah KP659364 hingga
KP659383, dan KP659384 hingga KP659393.
Hasil
Keanekaragaman komunitas bakteri pada tiga starter
fermentasi
Untuk starter fermentasi dariDaqu, XiaoqudanFuku,perpustakaan 16S rRNA
bakteri (DQ-P, XQ-P dan FQ-P, masing-masing) dibangun. Semua cakupan >
80% untuk ketiga perpustakaan menunjukkan bahwa urutan yang diperoleh di
perpustakaan mewakili seluruh populasi dengan baik (Tabel 1). Perpustakaan
DQ-P memiliki kekayaan dan keragaman bakteri yang jauh lebih besar
daripada perpustakaan lain, seperti yang ditunjukkan oleh

Tabel 1.Kekayaan dan keragaman urutan gen SSU rRNA di perpustakaan klon

Perpustakaan Jumlah klon Jumlah OTU Chao-1 KARTU AS Shannon simpson Cakupan (%) Boneh

DQ-P 26 8 13 33.81 1.47 0,31 81 1.85

XQ-P 30 7 10 13.24 1.09 0,51 87 1.5
FQ-P 28 5 6 7.04 1.24 0,32 92.8 0,66
DQ-E 24 6 9 9.62 1.21 0,4 87.5 1.14
Kreativitas yang dapat ditiru

XQ-E 31 2 2 2 0,49 0,67 100 0

FQ-E 26 2 2 2 0,58 0,59 100 0
e
6Com
21 Lisensi ons

J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627 Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan wileyonlinelibrary.com/journal/jib
 20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh Lisensi Creative Commons yang berlaku
M. Gou et al.
Institut Pembuatan Bir & Penyulingan

Indeks Shannon, nilai Chao1 dan Ace. Distribusi klon bakteri dari
ketiga perpustakaan ditunjukkan pada Tabel 2. Hampir semua klon
memiliki kesamaan urutan yang tinggi (≥97%) dengan urutan bakteri
biakan murni yang tersedia dari basis data GenBank. Klon bakteri ini
dapat dibagi menjadi delapan OTU untukDaq,tujuh OTU untuk
Xiaoqudan lima OTU untukFuqu.Ada sangat sedikit genera bakteri
yang umum di antara ketiga starter, selainWeissella dan
Enterobacterhadir diDaqudanXiaoqudanEnterococcus ditemukan di
XiaoqudanFuqu.Namun, kelimpahan genera umum sangat
bervariasi pada permulaan yang berbeda. Hasil ini menunjukkan
bahwa ketiga starter fermentasi masing-masing memiliki komunitas
bakteri yang unik.
Berdasarkan analisis filogenetik pada Gambar. 1, klon bakteri di
Daqusampel berafiliasi dengan tiga ordo: Bacillales,
Enterobacteriales dan Lactobacillales. Sebagian besar klon (53,85%)
diidentifikasi sebagaiThermoactinomyces sanguinis,yang termasuk
dalam ordoBacillalesdan hanya ada diDaqu.Enterobakteri termasuk
Enterobacter cloacaedan aglomeran Pantoeaadalah bakteri
terbanyak kedua (23,08%) diDaqu.Kelimpahan rendah bakteri asam
laktat (BAL) dilaporkan; dua genera LAB (Leuconostoc mesenteroides
dan Weissella cibaria)menyumbang 7,7% dari semua bakteri yang
diidentifikasi. Selain itu, sejumlah klon bakteri yang tidak dikultur
terdeteksi pada tingkat tinggi (15,39%) diDaqu.Tiga OTU (DQ-P-5,
DQ-P-6, dan DQ-P-8) berbagi kesamaan urutan tertinggi dengan
klon LJQX-14 yang tidak berbudaya (KF984325), klon 7s11
(DQ068858) dan klon 1- 1B-19 ( JF417910), masing-masing. Klon
LJQX-14 diperoleh dari suhu sangat tinggi tertentuDaq (19),
sedangkan klon 1-1B-19 ditemukan di digester metanogenik
termofilik kering (20).OTU DQ-P-8 khususnya, memiliki kemiripan
urutan yang rendah dengan bakteri kultur murni (83%; tertinggi
denganNatronoanaerobium salstagnum).Analisis filogenetik yang
ditunjukkan pada Gambar. 1 menunjukkan bahwa OTU ini harus
diklasifikasikan dalam filum Firmicutes. Hasil ini menunjukkan
bahwa beberapa bakteri yang tidak diketahui masukDaquterlibat
dalam produksi minuman keras Cina.
Bakteri yang ada diXiaoquberafiliasi dengan beberapa ordo,
termasuk Lactobacillales, Enterobacteriales, Pseudomonadales,
Actinomycetales dan Deinococcales (Gbr. 1). Tabel 2 menunjukkan
bahwa BAL merupakan bakteri yang paling melimpah diXiaoqu.Tiga
spesies LAB diidentifikasi:W. cibaria (70%),Streptococcus lutetiensis
(3,33%) danEnterococcus casseliflavus (3,33%). Enterobakteri
(Enterobacter ludwigii)terdiri dari 10% dari klon. Sebagai tambahan,
Deinococcus radiodurans, Corynebacterium variabiledan
Acinetobacter baumaniikurang berlimpah dan diidentifikasi hanya di
Xiaoqu.
Bakteri diFuqudikaitkan dengan ordo Bacillales, Lactobacillales
dan Clostridiales (Gbr. 1).Enterococcus fecium (LABORATORIUM),
Clostridium beijerinckiidanBacillus cereusadalah bakteri utama yang
terdeteksi dan menyumbang masing-masing 46,67, 23,33 dan
16,67% dari semua bakteri yang teridentifikasi. GeneraClostridium
dan Basilhanya hadir diFuqu.Selain itu, kelimpahan LAB lain yang
rendah,Pediococcus pentosaceus,terdeteksi diFuqu.
Keanekaragaman komunitas eukariotik pada tiga starter
fermentasi
Pustaka 18S rRNA eukariotik (masing-masing DQ-E, XQ-E dan FQ-E)
dibangun untuk masing-masing starter fermentasi. Tabel 1 menunjukkan
bahwa perpustakaan DQ-E memiliki kekayaan dan keragaman eukariotik
yang jauh lebih besar. Cakupan 100% untuk perpustakaan XQ-E dan FQ-E
dikaitkan dengan identifikasi OTU yang lebih sedikit. Distribusi klon
eukariotik dari tiga perpustakaan ditunjukkan pada Tabel 3. Semua klon
berbagi kesamaan urutan 99 atau 100% dengan mikroorganisme
eukariotik kultur murni. Hasil analisis OTU menunjukkan bahwa spesies
jamur lebih sedikit daripada spesies bakteri yang terlibat dalam produksi
minuman keras Cina. Klon eukariotik yang teridentifikasi dikaitkan
dengan empat ordo: Sacch aromycetales, Eurotiales, Wallemiales, dan
Mucorales (Gbr. 2).
Keanekaragaman jamur yang lebih besar diamati diDaqu.Semua spesies
jamur yang teridentifikasi adalah jamur yang hanya ada diDaquSampel. Itu

Meja 2.Distribusi klon bakteri diperoleh dari ketiga starter fermentasi

Sampel OTU Perpustakaan Rasio (%) Kerabat terdekat (nomor aksesi) Identitas (%)
(klon)

Daqu DQ-P-1 (14) 53.85 Thermoactinomyces sanguinis (AJ251778) 99

DQ-P-2 (5) 19.23 aglomeran Pantoea (FJ971873) Weissella 99
DQ-P-3 (1) 3.85 cibaria (AB593341) Leuconostoc 97
DQ-P-4 (1) 3.85 mesenteroides (CP003101) Klon tidak 99
DQ-P-5 (2) 7.69 berbudaya LJQX-14 (KF984325) Klon tidak 97
DQ-P-6 (1) 3.85 berbudaya 7s11 (DQ068858) Enterobacter 99
DQ-P-7 (1) 3.85 cloacae (KJ126907) Klon tidak berbudaya 99
DQ-P-8 (1) 3.85 1-1B-19 ( JF417910) Deinococcus radioduran ( 98
Xiaoqu XQ-P-1 (1) 3.33 AE000513) Weissella cibaria (AB593341) 99
XQ-P-2 (21) 70 Streptococcus lutetiensis (NR_121743) 99
XQ-P-3 (1) 3.33 Enterococcus casseliflavus (NR_102793) 99
XQ-P-4 (1) 3.33 Variabilitas Corynebacterium (NR_102874) 99
XQ-P-5 (2) 6.67 Enterobacter ludwigii (KM077046) 99
XQ-P-6 (3) 10 Acinetobacter baumannii (LC014137) Bacillus 99
XQ-P-7 (1) 3.33 cereus (CP008712) Clostridium beijerinckii ( 99
Fuqu FQ-P-1 (5) 16.67 CP006777) Enterococcus faecium (GU968165) 99
FQ-P-2 (7) 23.33 Bacillus subtilis (JF346887) Pediococcus 99
FQ-P-3 (14) 46.67 pentosaceus (AB598980) 99
FQ-P-4 (1) 3.33 99
FQ-P-5 (1) 3.33 100
622

wileyonlinelibrary.com/journal/jib Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627
 20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh ap
Komunitas mikroba dalam tiga jenis starter fermentasi
Institut Pembuatan Bir & Penyulingan

Gambar 1.Pohon filogenetik menunjukkan hubungan genetik di antara klon bakteri dari tiga starter fermentasi yang digunakan untuk produksi minuman keras Cina. Pohon tersebut dibangun
dengan metode neighbour-joining dengan model dua parameter Kimura menggunakan sekuens parsial gen 16S rRNA. Analisis bootstrap (1000 replikasi) dilakukan untuk menguji kepercayaan
node. Bar mewakili lima substitusi per 100 posisi nukleotida. Pohon di-root menggunakanBacteroides ovatussebagai kelompok luar. DQ, XQ, FQ mengacu pada klon yang berasal dariDaqu,
XiaoqudanFuqusampel, masing-masing. Jumlah klon dengan urutan identik dalam penelitian ini dan nomor aksesi dengan semua urutan ditunjukkan dalam tanda kurung.

Tabel 3.Distribusi klon eukariotik diperoleh dari tiga starter fermentasi

Sederhana OTU Perpustakaan (kloning) Rasio (%) Kerabat terdekat (nomor aksesi) Identitas (%)

Daqu DQ-E-1 (15) 62.5 Aspergillus glaucus (AY083218) Rhizomucor 100

DQ-E-2 (1) 4.17 pusillus (HQ845298) Lichtheimia 99
DQ-E-3 (1) 4.17 corymbifera (JQ004931) Thermomyces 99
DQ-E-4 (3) 12.5 lanuginosus (AY706335) Termoascus 99
DQ-E-5 (3) 12.5 crustaceus (AY526486) Wallemia sebi ( 99
DQ-E-6 (1) 4.17 AF548108) Rhizopus oryzae (AB250174) 99
Xiaoqu XQ-E-1 (25) 80,65 Saccharomycopsis fibuligera (KJ123706) 99
99
Kreativitas yang dapat ditiru

XQ-E-2 (6) 19.35 Rhizopus oryzae (AB250174)

Fuqu FQ-E-1 (7) 26.92 Saccharomyces cerevisiae (GQ458028) 99
FQ-E-2 (19) 73.08 99
e
6Com
23 Lisensi ons

J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627 Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan wileyonlinelibrary.com/journal/jib

Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
Gambar 2.Pohon filogenetik menunjukkan hubungan genetik di antara klon eukariotik dari tiga starter fermentasi yang digunakan untuk produksi minuman keras Cina. Pohon
itu dibangun menggunakan sekuens parsial gen 18S rRNA. Bilah mewakili dua substitusi per 100 posisi nukleotida. Pohon itu berakar dengan menggunakanCoelomyces
stegomyiaesebagai kelompok luar. Uraian lainnya sama dengan Gambar 1.
mayoritas klon diidentifikasi sebagai jamur Eurotiales, termasuk
Aspergillus glaucus (62,5%),Thermomyces lanuginosus (12,5%),
dan Termoascus crustaceus (12,5%). Selain itu, satu klon
Wallemiales dan dua klon Mucorales berafiliasi dengannya
Wallemia sebi, Lichtheimia corymbiferadanRhizomucor pusillus,
masing-masing. Keragaman jamur serupa ditemukan diXiaoqu
danFuku,keduanya mengandung klon jamur dan ragi. Namun,
jamur yang paling melimpah diXiaoqudanFuquadalah
cetakannyaRhizopus oryzae (80,65%) dan ragiSaccharomyces
cerevisiae (73,08%), masing-masingR. oryzaeterdeteksi pada
kedua sampel. Saccharomycopsis fibuligera,non-Saccharomyces
ragi, diamati hanya diXiaoqu.
Diskusi
Meskipun mikroba yang ada diDaqudigunakan untuk produksi minuman
keras telah diamati dalam sejumlah penelitian, pengetahuan kami
tentang komposisi mikroba dalam starter fermentasi (JiuQu)masih sangat
terbatas, terutama untukXiaoqudanFuqu.Oleh karena itu, penelitian ini
menyelidiki dan membandingkan komunitas mikroba dalam tiga jenis
JiuQu (Daqu, XiaoqudanFuqu)berdasarkan analisis pustaka klon gen 16S
dan 18S rRNA.
Analisis perpustakaan klon menunjukkan bahwa spesies bakteri
lebih banyak daripada spesies jamurJiuQudan bahwa struktur
komunitas bakteri itu unik untuk ketiga starter fermentasi. Bacillales
termofilik atau termotoleran yang khas, seperti Thermoactinomyces
danBasil,diamati diDaqudanFuku, menunjukkan bahwa keduaJiuQu
diproduksi pada suhu yang lebih tinggi dariXiaoqu.Beberapa
penelitian telah melaporkan bahwa suhu sangat mempengaruhi
struktur komunitas mikrobaDaq (11,13). Oleh karena itu, suhu dapat
menjadi salah satu faktor utama yang berkontribusi terhadap
perbedaan komunitas bakteri dalam tiga starter fermentasi.
T.sanguinisadalah spesies bakteri utama diDaqu.Itu menunjukkan
Actinomycete-seperti karakteristik tetapi lebih erat terkait denganBasil
spp. berdasarkan analisis hubungan filogenetik (21). T.sanguinis
diidentifikasi sebagai bakteri dominan hanya di tinggi dan
624
wileyonlinelibrary.com/journal/jib Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh Lisensi Creative Commons yang berlaku
M. Gou et al.
suhu sangat tinggiDaq (13,19,22,23)dan dapat membantu dalam
membentuk senyawa rasa dengan mensekresi alkali fosfatase, esterase,
lipase dan hidrolase fosfat (24).Enterobakteri, khususnya aglomeran
Pantoea,merupakan spesies terbanyak kedua diDaqu. Pantoeaspp. telah
dilaporkan ada di suhu rendah, sedang dan tinggiDaqupada kelimpahan
rendah dan fungsinya dalam produksi minuman keras masih belum
diketahui (13,22).Maifreni et al. (25) mengidentifikasi aktivitas
dekarboksilase asam amino dari sejumlah spesies Enterobacteriaceae
dalam keju Montasio, termasukP. agglomerans.Selain itu, tingginya rasio
klon yang tidak dikultur (15,39%) terdeteksiDaqu.Klon Firmicutes yang
tidak berbudaya (DQ-P-8) hanya memiliki kesamaan urutan 83% dengan
bakteri kultur murni (N.salstagnum),menunjukkan bahwa itu mungkin
spesies baru. Hasil ini menunjukkan bahwa bakteri yang tidak dikultur
memainkan peran penting dan tidak diketahui dalam produksi minuman
keras dan kebutuhan untuk menganalisis komunitas mikroba di
dalamnyaJiuQumenggunakan metode budaya-independen.
Banyak penelitian telah menunjukkan kelimpahan dan pentingnya LAB
diJiuQu;LAB dapat mengubah glukosa atau pati menjadi asam laktat dan
menyediakan substrat bagi ragi untuk membentuk etil laktat, salah satu
komponen rasa utama dalam cairan Cina (11).Dalam studi saat ini,
berbagai genera BAL diidentifikasi dalam tiga jenisJiuQu,termasuk
Weissella, Enterococcus, Leuconostoc, StreptococcusdanPediococcus.
Meskipun BAL merupakan bakteri yang paling melimpah diXiaoqudan
Fuku,spesies bakteri LAB tidak teridentifikasi.W. cibariadanE. faecium
mewakili populasi LAB terbesar diXiaoqudanFuku,masing-masing.W.
cibariamerupakan jenis BAL heterofermentatif yang banyak terdeteksi
selamaShochufermentasi (26).Liu dkk. (10)disimpulkan bahwaW. cibaria
dapat mempengaruhi sifat tekstur dan machinabilityMaotai-minuman
kerasDaquselama periode pembentukanDaqupersiapan. Beberapa
penelitian telah menunjukkan bahwa genus termo-toleranEnterococcus
memainkan peran penting dalam produksi rasa makanan fermentasi
tradisional seperti keju dan sosis dengan proteolisis, lipolisis, dan
pemecahan sitrat (27).Namun, hanya Zheng et al. (13)telah mendeteksi
jumlah yang rendahEnterococcusklon dalam dua jenisDaqusampel. Peran
yang melimpahE. faeciumdiFuqumemerlukan penyelidikan lebih lanjut.
Soria dan Audisio (28)memverifikasi bahwa keberadaane.
J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627

Komunitas mikroba dalam tiga jenis starter fermentasi
tinjadapat menghambat pertumbuhanB. cereusstrain oleh metabolit
antimikroba. Ini mungkin menghasilkan kelimpahan yang lebih tinggiE.
faeciumdibandingkanB. cereusdiFuqu.Sejumlah laporan juga
menunjukkan hal ituBasilspp. dapat dihambat oleh spesies lain, seperti
Lactobacillusspp. (29).Oleh karena itu, interaksi mikroba juga dapat
mempengaruhi komunitas mikroba di dalamJiuQu.LAB lain ditemukan di
Fuqu, P. pentosaceus,terdeteksi sebelumnya diRawa-minuman keras
Daqu digunakan untuk pengembangan rasa melalui metode yang
bergantung pada budaya (5).LAB adalah bakteri dominan di banyakDaqu
sampel. Namun, hanya dua genus BAL dengan kelimpahan rendah (L.
mesenteroidesdanW. cibaria)diidentifikasi dalamDaqusampel dalam
penelitian ini.L. mesenteroidestelah dilaporkan memiliki potensi tinggi
untuk memproduksi tiramin atau histamin dalam anggur (30).Meskipun
sebagian besar penelitian mengungkapkan adanyaLactobacillus.spp di
lainDaq,TidakLactobacillusklon terdeteksi diDaqusampel penelitian ini.
Hasil ini mirip dengan yang dilaporkan oleh Zheng et al. (13)dan Zhang
dkk. (22),di mana mereka menemukanLactobacillusspp. hanya
diidentifikasi pada suhu sedang atau rendah Daqumelalui analisis
perpustakaan klon. Selain itu, Lei (31)menemukan kelimpahan BAL yang
tinggi hanya pada awal jenis tertentu Daquproduksi, yang dapat
dikaitkan dengan peningkatan suhu yang menghasilkan pertumbuhan
bakteri termofilik yang cepat dibandingkan dengan BAL mesofilik dan
mungkin menjelaskan rendahnya kelimpahan BAL di akhirDaquproduk.
Dalam studi ini,C.beijerinckiimerupakan bakteri terbanyak kedua di
FuquSampel; sebelumnya telah dilaporkan mampu menghasilkan
butanol dari jagung (32). Clostridium,kontributor penting untuk produksi
asam organik untuk pembentukan rasa minuman keras, telah
diidentifikasi dalam lumpur pitLuzhou-rasa minuman keras (33). B. cereus
menyumbang 16,67% dari semua bakteri yang diidentifikasi diFuqu. Basil
spesies dapat menghasilkan berbagai hidrolase, seperti protease,
selulase dan amilase, untuk pencairan dan sakarifikasi karbohidrat (34).
Selain itu, mereka dapat menghasilkan pirazina bernitrogen, yang
merupakan salah satu rasa terpenting dalam minuman rasa saus dan
wijen (4,9).Namun,Basilspesies sering terdeteksi pada suhu tinggiDaqu
karena pembentukan spora tahan panas, yang memfasilitasi
kelangsungan hidup mereka di bawah kondisi suhu tinggi (60-62 ° C) dan
kelembaban rendah (13-14%) (2).Selain LAB yang melimpah dan
Enterobactersp. (10%),C. variabel, A. baumanniidanD.radioduranshadir
dengan jumlah klon rendah hanya diXiaoqu. C.variabelsering terdeteksi
pada permukaan keju dan berkontribusi pada pengembangan rasa dan
sifat tekstur selama pematangan keju (35).SEBUAHCorynebacteriumclone
ditemukan di low-mediumDaquoleh Zheng et al. (13). Actinobacteria telah
terdeteksi dalam lumpur pit yang digunakan untuk memproduksi
komponen rasaLuzhouminuman keras termasuk ester, asam, aldehida
dan keton (36).Sejauh pengetahuan kami, ini adalah laporan pertama dari
D.radiodurans,salah satu mikroorganisme paling tahan radiasi yang
pernah ditemukan, terdeteksi diJiuQu (37);sumber dan fungsinya di
Xiaoqutidak diketahui.
Lebih banyak spesies jamur yang terdeteksi diDaq,semuanya
adalah cetakan termofilik. Tiga spesies Eurotiales (A. glaucus, T.
lanuginosusdanT. crustaceus)ditemukan diDaqudengan
A.glaucusmerupakan jamur utama. BerserabutAspergillus spp. telah
dilaporkan sebagai jamur yang umum dan dominan pada suhu
rendah, sedang dan tinggiDaq,berkontribusi pada produksi
berbagai enzim hidrolitik untuk sakarifikasi pati (11,38,39).Pati tidak
dapat dimanfaatkan secara langsung oleh sebagian besar ragi dan
bakteri dan perlu diubah menjadi gula oleh jamur berfilamen (39).Xu
dkk. (40)mengungkapkan bahwa generaAspergillusdan Rhizopus
adalah dua jamur dominan dalam varietas gandum yang berbeda.
Oleh karena itu, keberadaan spesies ini melimpah diDaqumungkin
J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627 Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh ap
Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
berasal dari gandum; suhu paling tinggiDaquterbuat dari gandum
murni dengan konsentrasi pati yang tinggi (40–60% bahan kering) (
4).Telah disarankan bahwa bahan baku yang digunakan untukJiuQu
produksi dapat mempengaruhi komunitas jamur.Termoskusspp.
sering ditemukan pada suhu tinggiDaqu;namun fungsinya dalam
starter fermentasi masih belum diketahui (10). T. lanuginosus,jamur
termofilik lain yang mampu bertahan hidup pada suhu lebih tinggi
dari 60°C, telah dilaporkan sebagai penghasil xilanase yang efisien
(41).Jamur lain sepertiR. pusillus, L. corymbiferadanW.sebiterdeteksi di
Daqudengan jumlah klon rendah.R.pusil,jamur termofilik, dapat
memengaruhi rasa minuman keras dengan memproduksi asam laktat,
proteinase asam, glukanase, dan alkohol dehidrogenase secara cepat (
42). L. corymbiferadapat tumbuh pada suhu setinggi 48–52°C dan
terdeteksi selama tiga tahap terakhirRawa-minuman kerasDaqu
fermentasi (43). Wallemiaadalah genus jamur halofilik (44);namun, peran
potensialnya dalam starter fermentasi belum diketahui.
Secara luas ditetapkan bahwa sakarifikasi dan fermentasi alkohol dari
minuman keras Cina dilakukan dengan aktivitas gabungan dari jamur
dan ragi. Namun, tidak ada spesies ragi yang ditemukan di perpustakaan
klon iniDaquSampel. Xiong et al. (2)juga ditemukan melalui analisis DGGE
bahwa jamur dominan terdapat pada tiga jenis suhu tinggiDaquadalah
kapang dan bukan ragi. Hasil ini menunjukkan bahwa jumlah ragi
mungkin lebih sedikit daripada jamur pada suhu tinggiDaq,meskipun ada
beberapa perbedaan antara komunitas mikroba yang diperoleh dengan
metode kultur-independen yang berbeda. Umumnya, ragi lebih sensitif
terhadap panas dan kelembapan dibandingkan jamur. Selama produksi
suhu tinggiDaq,suhu mencapai >60°C dengan penurunan kelembaban
yang cepat, yang dapat membatasi pertumbuhan dan kelangsungan
hidup khamir. Mohanty dkk. (48)mengamati bahwa suhu yang lebih
tinggi dan kelembaban yang lebih rendah menurunS.cerevisiae aktivitas.
Oleh karena itu, ini mungkin menjelaskan tidak adanya spesies ragi
dalamDaqusampel yang digunakan dalam penelitian ini.
Keanekaragaman jamur padaXiaoqudanFuqusampel serupa dan
spesies jamur terbatas yang diamati (satu jamur dan ragi). Hal ini
mungkin disebabkan oleh teknologi produksi serupa yang digunakan
untuk kedua starter - inokulasi buatan dari kultur murni (seringkali strain
kapang dan ragi) ke dalamJiuQu,yang sangat berbeda dari inokulasi
spontan yang digunakan selamaDaquproduksi (6,7). R. oryzaeadalah
cetakan yang paling banyak terdeteksi di Xiaoqusampel, konsisten
dengan hasil sebelumnya yang dilaporkan oleh Wang et al. (46). R. oryzae
bertanggung jawab untuk sakarifikasi dan proteolisis dengan
mengeluarkan berbagai jenis enzim ekstraseluler, menghasilkan senyawa
volatil yang melimpah dari biji-bijian, seperti etanol, 2- metil-1-butanol
dan 3 metil-1-butanol (47).RagiS.fibuligeradanS.cerevisiaediamati di
XiaoqudanFuqu sampel, masing-masing. Telah dilaporkan bahwa,
meskipun tingkatnya rendahS.cerevisiaeterakumulasi selama tahap
produksi Daq,itu secara bertahap bisa menjadi mikroba dominan dan
memiliki efek signifikan pada produksi etanol selanjutnya (48).Oleh
karena itu, penambahan langsung dariS.cerevisiaediFuqudapat
memberikan inokulasi yang efektif untuk produksi minuman keras. Tidak
adanyaS.cerevisiae dalamXiaoqusampel mungkin karena levelnya yang
rendah dan oleh karena itu tidak dapat dideteksi oleh analisis
perpustakaan klon. Non-Saccharomycesragi (sepertiS.fibuligeradanPichia
anomali)terdeteksi di beberapa sampel starter.S.fibuligera memiliki
kemampuan sakarifikasi yang kuat dan menghasilkan α-amilase dan
glukoamilase dalam jumlah besar untuk konversi pati asli selama tahap
awal fermentasi minuman keras (49).Meskipun efek dari non-
Saccharomycesragi pada rasa minuman keras telah menarik minat para
Kreativitas yang dapat ditiru
peneliti pembuat minuman keras, fungsinya dalam produksi minuman
keras masih kurang dipahami.
e
6Com
25 Lisensi ons
wileyonlinelibrary.com/journal/jib

Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
Komunitas mikroba dalam tiga jenisJiuQuberbeda secara
signifikan. Beberapa peneliti telah menemukan bahwa komunitas
mikroba diDaqusangat dipengaruhi oleh suhu, kelembaban, bahan
baku, mikrohabitat dan lokasi geografis (2,10,11,39).Zheng dkk. (13)
menunjukkan bahwa keragaman jamur diDaqusangat dipengaruhi
oleh suhu produksi dan bahan baku, sedangkan keragaman bakteri
dipengaruhi oleh suhu produksi dan letak geografis. Hasil serupa
diamati dalam penelitian ini. Selain itu, interaksi mikroba dan
teknologi produksi dapat menjadi faktor lain yang mempengaruhi
komunitas mikroba dalam penelitian ini. Bakteri dan jamur yang
representatif di setiap starter fermentasi dapat dianggap sebagai
biomarker untuk membedakan ketiga jenis tersebutJiuQu.
Kesimpulannya, sepengetahuan kami, ini adalah laporan pertama
yang membandingkan komunitas mikroba dalam tiga jenisJiuQu (Daqu,
XiaoqudanFuqu).Komunitas mikroba dalam tiga jenis JiuQuberbeda
secara signifikan satu sama lain. Terutama bakteri termofilik atau
termotoleran diidentifikasi diDaqudanFuqu. T. sanguinis, W. cibariadanE.
faeciummerupakan bakteri yang paling melimpah diDaqu, Xiaoqudan
Fuku,masing-masing. Hanya jamur termofilik yang terdeteksiDaqudan
A.glaucusmerupakan jamur yang dominan. Keragaman jamur serupa
ditemukan diXiaoqudanFuqu;keduanya mengandung jamur dan ragi.
Mayoritas jamur yang terdeteksi adalah
R. oryzaedanS.cerevisiaediFuqudanR. oryzaedanS.fibuligeradi
Xiaoqu.Perbedaan ini mungkin disebabkan oleh suhu produksi yang
berbeda, bahan baku, kelembaban, interaksi mikroba dan teknologi
produksi yang digunakan selamaJiuQuproduksi. Hasil ini mungkin
berguna untuk perbaikan produksi minuman keras dan proses
fermentasi. Penelitian lebih lanjut diperlukan untuk menetapkan
fungsi mikrobiota dalam berbagai jenisJiuQu.
Terima kasih
Karya tersebut didukung oleh National Natural Science Foundation
of China (no. 31200068).
Referensi
1. Anonim (2008) Laporan tahunan komite program minuman keras China nasional,Ilmu
pembuatan minuman keras. Technol. 35,118 (dalam bahasa Cina).
2. Xiong, X., Hu, Y., Yan, N., Huang, Y., Peng, N., Liang, Y., dan Zhao, S. (2014)
Analisis PCR-DGGE dari komunitas mikroba di tiga starter fermentasi
minuman keras Cina 'Baiyunbian' yang berbeda,J. Mikrobiol. Bioteknologi.
24,1088–1095.
3. Hong, GZ (2001)Sejarah Teknik Pembuatan Minuman Keras Cina,Pers Industri
Ringan China, Beijing.
4. Zheng, XW, Tabrizi, MR, Nout, MJR, dan Han, BZ (2011) Daqu – starter
fermentasi minuman keras Tiongkok tradisional,J.Inst. Buatan. 117,82–90.
5. Zheng, XW, Yan, Z., Han, BZ, Zwietering, MH, Samson, RA, Boekhout, T., dan
Robert Nout, MJ (2012) Mikrobiota kompleks dari starter fermentasi minuman
keras 'Fen' Cina (Fen- Daqu), diungkapkan dengan metode yang bergantung
pada budaya dan tidak bergantung pada budaya,Mikrobiol Pangan. 31,293–300.
6. Wu, HC, Ma, YY, Yang, JG, Lin, Y., and Lin, Q. (2014) Analisis situasi
pengembangan dan masalah kemacetan minuman keras Sichuan Xiaoqu,
J.Anhui. Pertanian. Sains. 42,11850–11853, 11856 (dalam bahasa Cina).
7. Ma, RS, dan Yu, Y. (2010) Menyeduh minuman keras rasa saus dengan dedak koji,
Minuman Cina. 1,138–140 (dalam bahasa Cina).
8. Lai, DY, dan Lin, D. (2007) Penelitian fitur teknologi dan karakteristik rasa enam minuman
keras penyulingan terkenal dunia,Pembuatan Minuman Keras 34, 106–110 (dalam
bahasa Cina).
9. Lao, AG, Zhao, DY, and Cao, JQ (2009) Sejarah, status dan tren
perkembangan spirit Cina rasa Zhima,Pembuatan Minuman Keras 36,91–
93 (dalam bahasa Cina).
10. Liu, X., Guo, KL, dan Zhang, HX (2012) Penentuan keragaman mikroba
di Daqu, kultur starter fermentasi cairan Maotai, menggunakan
626
wileyonlinelibrary.com/journal/jib Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh Lisensi Creative Commons yang berlaku
M. Gou et al.
elektroforesis gel gradien denaturasi PCR bersarang,Dunia J. Mikrobiol.
Bioteknologi. 28,2375–2381.
11. Wang, HY, Gao, YB, Fan, QW, dan Xu, Y. (2011) Karakterisasi dan
perbandingan komunitas mikroba dari Daqus cairan khas Cina yang
berbeda oleh PCR-DGGE,Lett. Aplikasi Mikrobiol. 53,134–140.
12. Zhang, L., Wu, C., Ding, X., Zheng, J., and Zhou, R. (2014) Karakterisasi
komunitas mikroba pada starter fermentasi minuman keras Cina Daqu
menggunakan nested PCR-DGGE,Dunia J. Mikrobiol. Bioteknologi. 30,
3055–3063.
13. Zheng, XW, Yan, Z., Nout, MJ, Boekhout, T., Han, BZ, Zwietering, M.
H., dan Smid, EJ (2015) Karakterisasi komunitas mikroba dalam berbagai
jenis sampel Daqu seperti yang diungkapkan oleh perpustakaan klon gen
16S rRNA dan 26S rRNA,Dunia J. Mikrobiol. Bioteknologi. 31,199–208.
14. Griffiths, RI, Whiteley, AS, O'Donnell, AG, dan Bailey, MJ (2000) Metode cepat
untuk koekstraksi DNA dan RNA dari lingkungan alami untuk analisis
komposisi komunitas mikroba berbasis DNA dan rRNA ribosom,Aplikasi
Mengepung. Mikrobiol. 66,5488–5491.
15. Huber, T., Faulkner, G., dan Hugenholtz, P. (2004) Bellerophon: Sebuah program
untuk mendeteksi sekuens chimeric dalam beberapa penjajaran sekuens,
Bioinformatika 20,2317–2319.
16. Thompson, JD, Gibson, TJ, Plewniak, F., Jeanmougin, F., dan Higgins,
DG (1997) Antarmuka jendela CLUSTAL_X: Strategi fleksibel untuk
penyelarasan urutan ganda dibantu oleh alat analisis kualitas,Nukl. Asam
Res. 25,4876–4882.
17. Tamura, K., Dudley, J., Nei, M., dan Kumar, S. (2007) MEGA4: perangkat
lunak Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) versi 4.0,Mol. Biol.
Evol. 24,1596–1599.
18. Schloss, PD, Westcott, SL, Ryabin, T., Hall, JR, Hartmann, M., Hollister,
EB, Lesniewski, RA, Oakley, BB, Parks, DH, Robinson, CJ, Sahl, JW, Stres, B.,
Thallinger, GG, Van Horn, DJ, dan Weber, CF (2009) Memperkenalkan mothur:
Open-source, platform-independen, perangkat lunak yang didukung komunitas
untuk menggambarkan dan membandingkan komunitas mikroba,Aplikasi
Mengepung. Mikrobiol. 75,7537–7541.
19. Ye, GB, Wang, CH, Qiao, XY, Luo, HB, Zhuo, YC, dan Bian, MH (2014)
Studi tentang struktur komunitas bakteri Daqu suhu sangat tinggi,
Ilmu pembuatan minuman keras. Technol. 4,5–8 (dalam bahasa
Cina).
20. Tang, YQ, Ji, P., Hayashi, J., Koike, Y., Wu, XL, dan Kida, K. (2011) Karakteristik
komunitas mikroba dari digester metanogenik termofilik kering: Stabilitas dan
perubahan jangka panjangnya dengan memberi makan,Aplikasi Mikrobiol.
Bioteknologi. 91,1447–1461.
21. Yoon, JH, dan Park, YH (2000) Analisis filogenetik genus
Thermoactinomycesberdasarkan urutan 16S rDNA,Int. J.Syst.
Evol. Mikrobiol. 50,1081–1086.
22. Zhang, HM, Shu, Y., Zhou, QW, Li, AJ, He, HK, and Zhang, ZZ (2014) Analisis
struktur komunitas mikroba starter minuman keras Gujinggong melalui
pendekatan bebas kultur,Ilmu Makanan Modern. Technol. 30, 44–49
(dalam bahasa Cina).
23. Gao, YB, Wang, HY, dan Xu, Y. (2010) Analisis PCR-DGGE komunitas bakteri
dari minuman keras Cina Daqu suhu tinggi dan sedang, Mikrobiol. Cina
37,999–1004 (dalam bahasa Cina).
24. Liu, Y., Zhao, T., Yao, S., Ge, YY, Xin, CH, Xu, L., and Cheng, C. (2012)
Identifikasi padaThermoactinomycessp. dipisahkan dari suhu tinggi Daqu
minuman keras rasa wijen,Bioteknologi. Banteng. 10,210–216 (dalam
bahasa Cina).
25. Maifreni, M., Frigo, F., Bartolomeoli, I., Innocente, N., Biasutti, M., and
Marino, M. (2013) IdentifikasiEnterobacteriaceaedalam keju Montasio
dan penilaian aktivitas asam amino dekarboksilase mereka,
J. Susu Res. 80,122–127.
26. Endo, A., dan Okada, S. (2005) Memantau keragaman bakteri asam laktat
selama fermentasi shochu dengan elektroforesis gel gradien denaturasi
PCR,J. Biosci. Bioeng. 99,216–221.
27. Foulquie, Moreno, MR, Sarantinopoulos, P., Tsakalidou, E., and De, Vuyst, L.
(2006) Peran dan penerapanenterokokusdalam makanan dan kesehatan,
Int. J. Makanan Mikrobiol. 106,1–24.
28. Soria, MC, dan Audisio, MC (2014) PenghambatanBacillus cereus
strain oleh metabolit antimikroba dariLactobacillus johnsonii
CRL1647 danEnterococcus feciumSM21,Probiotik Antimikroba.
Protein 6,208–216.
29. Meira, SM, Helfer, VE, Velho, RV, Lopes, FC, dan Brandelli, A. (2012)
Potensi probiotik dariLactobacillusspp. diisolasi dari keju ovine
regional Brasil,J. Susu Res. 79,119–127.
30. Landete, JM, Pardo, I., dan Ferrer, S. (2007) Produksi tyramine dan
phenylethylamine antara bakteri asam laktat yang diisolasi dari anggur,
Int. J. Makanan Mikrobiol. 115,364–368.
J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627

Komunitas mikroba dalam tiga jenis starter fermentasi
31. Lei, ZH (2011) Analisis awal perubahan mikroba pada proses fermentasi
fenjiu Daqu,Ilmu Pembuatan Minuman Keras. Technol. 6, 65–68 (dalam
bahasa Cina).
32. Campos, EJ, Qureshi, N., dan Blaschek, HP (2002) Produksi etanol butanol
aseton dari jagung degermed menggunakanClostridium beijerinckii
BA101,Aplikasi Biokimia. Bioteknologi. 98–100,553–561.
33. Liu, C., Huang, D., Liu, L., Zhang, J., Deng, Y., Chen, L., Zhang, W., Wu, Z.,
Fan, A., Lai, D ., dan Dai, L. (2014)Clostridium swellfunianumsp. nov.,
bakteri anaerobik baru yang diisolasi dari lubang lumpur produksi
minuman keras rasa Luzhou Cina,Semut. mobil van. Leeuw. 106,817–825.
34. Yan, Z., Zheng, XW, Han, BZ, Han, JS, Nout, MJ, and Chen, JY (2013)
Pemantauan ekologiBasilselama inkubasi Daqu, starter fermentasi,
menggunakan metode yang bergantung pada kultur dan tidak
bergantung pada kultur,J. Mikrobiol. Bioteknologi. 23,614–622.
35. Schroder, J., Maus, I., Trost, E., dan Tauch, A. (2011) Urutan genom lengkap
darivariabel CorynebacteriumDSM 44702 diisolasi dari permukaan keju
yang dihaluskan dan pemahaman tentang pematangan keju dan
pembentukan rasa,BMC Genomics 12,545.
36. Ding, XF, Wu, CD, Zhang, LQ, Zheng, J., dan Zhou, RQ (2014) Karakterisasi
keragaman komunitas eubakteri dan archaeal dalam lumpur lubang
minuman keras rasa Luzhou Cina oleh PCR-DGGE bersarang,Dunia J.
Mikrobiol. Bioteknologi. 30,605–612.
37. Brooks, BW, dan Murray, RGE (1981) Nomenklatur untuk 'Micrococcus
radiodurans'dan kokus tahan radiasi lainnya:Deinococcaceaekeluarga november
danDeinococcusgen. November, termasuk lima spesies,Int. J.Syst. Evol.
Mikrobiol. 31,353.
38. Zhang, WX, Qiao, ZW, Tang, YQ, Hu, C., Sun, Q., Morimura, S., and
Kida, K. (2007) Analisis komunitas jamur di Zaopei selama
produksi Chinese Luzhou -minuman rasa,J.Inst. Buatan. 113, 21–
27.
39. Wang, CL, Shi, DJ, dan Gong, GL (2008) Mikroorganisme di Daqu:
Budaya starter minuman keras rasa Maotai Cina,Dunia J. Mikrobiol.
Bioteknologi. 24,2183–2190.
J.Inst. Buatan.2015;121: 620–627 Hak Cipta © 2015 Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
20500416, 2015, 4, Diunduh dari https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jib.272 oleh INASP/HINARI - INDONESIA, Wiley Online Library pada [27/11/2022]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Daring Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh ap
Institut Pembuatan Bir & Penyulingan
40. Xu, SX, Jin, S., Wu, K., and Jia, XC (2004) Studi keragaman mikroorganisme
pada permukaan gandum,Penyimpanan Makanan 32,41–43 (dalam
bahasa Cina).
41. Singh, S., Madlala, AM, dan Sebelumnya, BA (2003)Termomyces
lanuginosus: Sifat-sifat galur dan hemiselulasenya,Mikrobiol FEM. Wahyu
27, 3–16.
42. Prasad, GS, Girisham, S., and Reddy, SM (2011) Potensi jamur termofilik
Rhizomucor pusillusNRRL 28626 dalam biotransformasi obat antihelmintik
albendazol,Aplikasi Biokimia. Bioteknologi. 165,1120–1128.
43. Zheng, XW, Yan, Z., Nout, MJ, Smid, EJ, Zwietering, MH, Boekhout,
T., Han, JS, dan Han, BZ (2014) Dinamika mikrobiota terkait
dengan kondisi lingkungan selama produksi fermentasi Fen-
Daqu, starter fermentasi industri Cina,Int. J. Makanan Mikrobiol.
182–183,57–62.
44. Kralj, Kuncic, M., Kogej, T., Drobne, D., and Gunde-Cimerman, N.
(2010) Respon morfologi genus jamur halofilikWallemiasalinitas
tinggi,Aplikasi Mengepung. Mikrobiol. 76,329–337.
45. Mohanty, SK, Behera, S., Swain, MR, dan Ray, RC (2009) Produksi Bioethanol
dari Mahula (Latifolia MadhucaL.) bunga dengan fermentasi keadaan
padat,Aplikasi Energi. 86,640–644.
46. Wang, HY, Tang, J., Xu, Y., Liu, YC, Yang, Q., Wang, Z., Yang, SZ, Li,
YQ, Li, RL, dan Guan, Y. (2012) Analisis struktur komunitas mikroba dan mikroba
fungsional dalam minuman keras Xiaoqu rasa Fen,Ilmu Pembuatan Minuman
Keras. Technol. 12,48–52 (dalam bahasa Cina).
47. Christen, P., Bramorski, A., Revah, S., and Soccol, CR (2000) Karakterisasi
senyawa volatil yang dihasilkan olehRhizopusstrain tumbuh pada limbah
padat agro-industri,Bioresour. Technol. 71,211–215.
48. Wu, Q., Chen, L., dan Xu, Y. (2013) Komunitas ragi yang terkait dengan fermentasi
keadaan padat dari minuman keras tradisional rasa Maotai Cina,Int. J. Makanan
Mikrobiol. 166,323–330.
49. Chi, Z., Chi, Z., Liu, G., Wang, F., Ju, L., dan Zhang, T. (2009)
Saccharomycopsis fibuligeradan penerapannya dalam bioteknologi,
Bioteknologi. Lanjut 27,423–431.
Kreativitas yang dapat ditiru
e
6Com
27 Lisensi ons
wileyonlinelibrary.com/journal/jib