Profil DNA

Garis Besar Topik

• Apa itu Profil DNA?

• Tentukan proses pembuatan profil DNA

• Aplikasi Pengeboran DNA

 Definisi

• adalah proses di mana pola DNA tertentu (profil) diperoleh dari seseorang (jaringan
sampel)

• 99,9% DNA antara dua manusia adalah sama

• 0,1% unik (berbeda kecuali kembar identik) → tiga juta bp
• dapat dibandingkan dan digunakan untuk membantu membedakan Anda dari orang lain.
 Prinsip Profil DNA

• Semua kromosom manusia memiliki bagian DNA tanpa fungsi yang diketahui

• Bagian ini memiliki urutan dasar yang pendek

• Urutan ini berulang terus menerus

• Mereka diwarisi dari orang tua

• Panjang dan posisinya unik untuk setiap orang

 Cara Penggunaan?

• Temukan wilayah tertentu sangat bervariasi antar orang (polimorfisme)

• Dimana: pengulangan tandem pendek (atau STR) → adalah daerah DNA tanpa kode yang mengandung
pengulangan urutan nukleotida yang sama.

• Contoh, GATACATAGATACATAGATACATA → adalah STR dimana urutan nukleotida

GATACATA diulang sebanyak 3 kali.

• STR → ditemukan di tempat berbeda atau lokus genetik dalam DNA seseorang

• Minisatelit → urutan pendek ( 10-60 pasang basa panjang) dari polimorfisme tinggi DNA berulang
 Sidik jari DNA

• adalah teknik yang secara bersamaan mendeteksi banyak satelit mini dalam genom untuk
menghasilkan pola yang unik bagi seorang individu

• ditemukan pada tahun 1984 oleh Profesor Sir Alec Jeffreys

• Setiap orang terlahir dengan sidik jari DNA yang unik (pola / profil)
 Sidik jari DNA

1. Ekstraksi DNA

2. Potong DNA untuk menghasilkan variasi dengan panjang

berbeda

3. Fragmen DNA kemudian dipisahkan sesuai

ukurannya dengan elektroforesis

4. Pita DNA dipindahkan dari agarosa ke membran nilon

dan dibuka ritsleting

5. Selanjutnya membran nilon diinkubasi dengan probe

radioaktif (fragmen kecil DNA minisatelit)

Hai Probe hanya menempel pada potongan DNA

yang melengkapi minisatelit dalam genom
sampel.

6. Minisatelit yang dipasang probe kemudian

divisualisasikan dengan memaparkan membran nilon
ke film sinar-X.

Kredit gambar: Genome Research Limited https://www.yourgenome.org/facts/what-is-a-dna-fingerprint

 Elektroforesis gel

• Metode pemisahan DNA dalam bahan seperti gelatin

menggunakan medan listrik

• ketika berada di medan listrik, ia bergerak ke sisi

positif

baik
DNA →→→→→→→

- “Berenang melalui Jello”

+
 Elektroforesis gel

• DNA bergerak di medan listrik ...

• jadi bagaimana itu membantu Anda membandingkan fragmen DNA?

• ukuran fragmen DNA mempengaruhi seberapa jauh ia bergerak

• potongan-potongan kecil bergerak lebih jauh

• potongan besar berjalan lebih lambat & tertinggal

baik DNA →→→→→→

- “Berenang melalui Jello”

+
 DNA &
Elektroforesis Gel
enzim restriksi

sumur fragmen yang lebih panjang

kekuasaan
sumber

gel
fragmen yang lebih pendek

+ gel selesai
 fragmen DNA
Menjalankan gel berbasis terpisah
pada ukuran

memotong DNA dengan enzim restriksi

1 2 3

Noda DNA

• etidium bromida
mengikat DNA

• berpendar di bawah UV
cahaya
 Pembuatan profil DNA zaman modern

• bergantung pada mikrosatelit daripada minisatelit yang digunakan dalam sidik jari DNA.

• Mikrosatelit → adalah kerabat pendek dari minisatelit; biasanya 2-5 bp.

• Seperti minisatelit, mereka diulang berkali-kali di seluruh genom manusia,

misalnya 'TATATATATA' → dinukleotida berulang
 Mikrosatelit DNA:

1. Ekstraksi DNA

2. PCR dengan primer STR berlabel (tag

fluorescent berwarna)

3. Fragmen DNA yang memperkuat STR kemudian

dipisahkan menurut ukurannya dengan
elektroforesis

4. Visualiasi: setiap fragmen melewati laser →

bersinar dengan warna tertentu.

Hasil → serangkaian puncak berwarna (seperti

yang ditunjukkan pada gambar di bawah)
menyoroti warna dan panjang setiap urutan
STR

Kredit gambar: Genome Research Limited https://www.yourgenome.org/facts/what-is-a-dna-fingerprint

 Aplikasi

• menetapkan ayah dan orang tua.

• mengidentifikasi korban perang dan bencana skala besar.

• mempelajari keanekaragaman hayati spesies / realtioship evolusioner

• Diagnosis penyakit

• forensik
HUBUNGAN KELUARGA
 Kegunaan: Hubungan evolusioner
• Membandingkan sampel DNA dari organisme berbeda untuk mengukur
hubungan evolusi

penyu ular tikus tupai fruitfly

1 2 3 4 5
- 1 2 3 4 5
DNA

+
 Kegunaan: Diagnostik medis
• Membandingkan alel normal dengan alel penyakit

kromosom dengan
-
kromosom DNA
penyebab penyakit
dengan normal
alel 1 alel 2 •

Contoh: tes penyakit Huntington

+
 Kegunaan: Forensik

• Membandingkan sampel DNA dari TKP dengan tersangka & korban

tersangka kejahatan

-
tempat kejadian
S1 S2 S3 Sampel V.

DNA
•

+
 P. roblem dengan DNA dari sidik jari

• Biasanya, ditemukan di DNA inti (nuDNA) → yang memberikan hampir semua hal lain tentang
diri kita (warna mata, warna rambut, dll)

• nuDNA setiap orang berbeda (kecuali mungkin kembar identik).

• Tapi untuk sidik jari DNA mitokondria (mtDNA) → banyak kerabat, bahkan yang jauh,
berbagi mtDNA yang sama.

• Artinya, Anda tidak dapat secara unik mengidentifikasi seseorang sebagai penjahat.
 mengapa bahkan menggunakan mtDNA?

• Salinan mtDNA dalam sel jauh lebih banyak daripada nuDNA

• Di dalam sel → 2 salinan nuDNA, satu dari ibu dan satu dari ayah, tetapi ada
ratusan atau ribuan salinan mtDNA di setiap sel.

• Selain itu, mtDNA bukanlah campuran DNA kedua orang tua. Sebaliknya, Anda mendapatkan
semua mtDNA dari ibu Anda, yang mendapatkannya dari ibunya, dan seterusnya seperti:
 mtDNA

• Itu masih bisa memberikan bukti bahwa seseorang bisa jadi penjahat. →
Jika mtDNA TKP cocok dengan tersangka, maka kemungkinan itu berasal dari tersangka.
Tetapi mungkin juga berasal dari salah satu dari banyak orang yang berbagi mtDNA-nya.

• Tetapi jika mtDNA yang ditemukan di TKP tidak cocok dengan mtDNA tersangka, maka
kita tahu bahwa DNA TKP tidak berasal dari tersangka tersebut.

• Berguna untuk mengidentifikasi korban kecelakaan pesawat ketika hanya sebagian dari tubuh yang ditemukan
Forensik menggunakan mtDNA
Terima kasih