BIOSINTESIS PROTEIN

12/12/2017 supartono 1
 PROTEIN
MRP MAKROMOLEKUL DARI ASAM-2
AMINO
ADA 20 MACAM ASAM AMINO:
10 AS. AMINO ESSENSIAL
10 AS. AMINO NON ESSENSIAL

12/12/2017 supartono 2
 ASAM AMINO
A
R ARGININ
ALANIN
N
H HISTIDIN ASPARAGIN
I AS.ASPARTAT D
ISOLEUSIN
L LEUSIN SISTEIN C
K LISIN GLUTAMAT E
M METIONIN
GLUTAMIN Q
F FENILALANIN
GLISIN G
T TREONIN
PROLIN P
W TRIPTOFAN
SERIN S
V VALIN
12/12/2017 supartono
TIROSIN Y 3
 SEKUEN ASAM-2 AMINO
TATA URUTAN ASAM-2
AMINO DALAM POLIPEPTIDA
PROTEIN
CONTOH: S-A-P-I-G-I-L-A

SERIN-ALANIN-PROLIN-ISOLEUSIN-GLISIN-
ISOLEUSIN-LEUSIN-ALANIN

12/12/2017 supartono 4
 BIOSINTESIS PROTEIN
1. DNA PEMBAWA INFORMASI
GENETIKA
2. GEN DITRANSKRIPSIKAN KE mRNA
3. mRNA DITRANSLASIKAN KE DLM
ASAM-2 AMINO MEMBENTUK
POLIPEPTIDA PROTEIN

12/12/2017 supartono 5
 ADA 64 KODON
1. 3 KODON BERFUNGSI SBG STOP KODON:
UAA, UAG DAN UGA
2. 1 KODON BERFUNGSI SBG START KODON:
AUG MENGKODE METIONIN/
N-FORMILMETIONIN
3. ASAM-2 AMINO DIKODE OLEH URUTAN 3
BASA PADA mRNA (DR UJUNG 5 MENUJU 3)

12/12/2017 supartono 6
 KODON-KODON
Basa Basa kedua Basa ketiga
pertama U aa C aa A aa G aa Keterangan

UUU F UCU S UAU Y UGU C U

UUC F UCC S UAC Y UGC C C
U
UUA L UCA S UAA * UGA * A * stop kodon
UUG L UCG S UAG * UGG W G
CUU L CCU P CAU H CGU R U
CUC L CCC P CAC H CGC R C
C
CUA L CCA P CAA Q CGA R A
CUG L CCG P CAG Q CGG R G
AUU I ACU T AAU N AGU S U
AUC I ACC T AAC N AGC S C
A
AUA I ACA T AAA K AGA R A
AUG # ACG T AAG K AGG R G # start kodon
GUU V GCU A GAU D GGU G U
GUC V GCC A GAC D GGC G C
G
GUA V GCA A GAA E GGA G A
GUG V GCG A GAG E GGG G G
12/12/2017 supartono 7
 CAC/CCA/UGG/UGA
___________/___________/___________/____________
Histidine Proline Tryptophan Stop

12/12/2017 supartono 8
 CONTOH
1. LISIN-ISOLEUSIN-TREONIN-ALANIN
(K-I-T-A)
2. KODON:? mRNA
3. GEN? DNA

12/12/2017 supartono 9
 DNA DOUBLE HELIX

12/12/2017 supartono 10
 Terdapat 2 bentuk double helix yaitu :
Bentuk A
Bentuk B

bentuk A terjadi jika DNA dalam

suasana kering

bentuk B terjadi jika DNA dalam

suasana basah / lembab

12/12/2017 supartono 11
 Bedanya :
Pada B basa
terletak berdekatan
Pada B dapat
dibedakan major
groove

Ternyata DNA
sesungguhnya
tidak seideal yang
digambarkan

DNA menekuk
nekuk

12/12/2017 supartono 12
 UKURAN GENOME

12/12/2017 supartono 13
 DNA sebagai pembawa informasi
genetik
Pada manusia tersimpan dalam kromosom

DNA dapat
diturunkan
ke generasi
berikutnya
karena
dapat
bereplikasi

12/12/2017 supartono 14
 Replikasi
Butuh bantuan enzim DNA Setiap 100 juta
polimerase, yang fungsinya hanya ada 1
membuka untaian DNA dan kesalahan
membantu pemasangan dNTP

Pasangannya
merupakan
komplementer
dari DNA

12/12/2017 supartono 15
 SETELAH REPLIKASI

12/12/2017 supartono 16
 SKEMA BIOSINTESIS
PROTEIN

12/12/2017 supartono 17
 How are proteins synthesized from DNA?
Protein synthesis involves the production of a chain of amino acids that
forms the primary structure of a protein.
The sequence of amino acids are coded for by a gene.

The stages of protein synthesis include:

1. Transcription of the gene in the
nucleus an mRNA strand is transcription
formed. translation

2. Processing of the mRNA.

3. Translation of the mRNA

in a ribosome a polypeptide chain
is formed.

4. Modification of the protein.

Transcription of DNA
 Translation

12/12/2017 supartono 20
 Translation - animation

12/12/2017 supartono 21
mRNA
attaches to
small
ribosomal
subunit

12/12/2017 supartono 22
 Translation - outline

12/12/2017 supartono 23
 Translation.
mRNA used to make polypeptide chain
(protein)

12/12/2017 supartono 24
 1.

First the mRNA attaches itself to a ribosome (to the small subunit).
Six bases of the mRNA are exposed.
A complementary tRNA molecule with its attached amino acid (methionine)
base pairs via its anticodon UAC with the AUG on the mRNA in the first position
P.
Another tRNA base pairs with the other three mRNA bases in the ribosome at
position A.
The enzyme peptidyl transferase forms
12/12/2017
a peptide bond between the two amino
supartono 25
acids.
 Translation 2

The ribosome moves along the mRNA to the next codon (three bases).
The second tRNA molecule moves into position P.
Another tRNA molecule pairs with the mRNA in position A bringing its
amino acid.
A 12/12/2017
growing polypeptide is formed in this way until a stop codon is reached. 26
supartono
 End of Translation

A stop codon on the mRNA is reached and this signals the ribosome to leave
the mRNA. A newly synthesised protein is now complete!
12/12/2017 supartono 27
 Translation
mRNA to Polypeptide

12/12/2017 supartono 28
 Translasi
Yang dibutuhkan adalah tRNA dan ribosom
Setiap 3 basa (kodon) mentranslate 1 asam amino

Ada 4 jenis
basa dan ada
20 jenis asam
amino, maka
tidak mungkin
ikatannya 1
banding 1.

12/12/2017 supartono 29
 RIBOSOM
SUB UNIT BESAR SUB UNIT KECIL

12/12/2017 supartono 30
MEKANISME BIOSINTESIS PROTEIN

12/12/2017 supartono 31
12/12/2017 supartono 32
 PENGOLAHAN PASCATRANSLASI

1. BBP POLIPEPTIDA PROTEIN PERLU

MEMBENTUK STRUKTUR 3 DIMENSI AGAR
DAPAT BERFUNGSI
2. AGAR MEMILIKI STRUKTUR 3 DIMENSI YG
BENAR POLIPEPTIDA PROTEIN PERLU
DIMODIFIKASI: PEMOTONGAN,
PELIPATAN DAN PEMBENTUKAN IKATAN-
2 LAIN.

12/12/2017 supartono 33
 HORMON INSULIN
1. DIPRODUKSI OLEH PANKREAS SEBAGAI
POLIPEPTIDA TUNGGAL PREPROINSULIN.
2. TERDIRI ATAS 2 SUB UNIT YG SAMA: DAN .
3. a. Preproinsulin disintesis
b. Preproinsulin ditransport menembus membran
c. Peptida signal dipotong oleh protease menghasilkan
proinsulin, dan melipat membentuk konformasi
mantap
d. Ikatan-2 disulfida dan lainnya dibentuk, lalu spacer
dibuang menghasilkan insulin yg aktif.

12/12/2017 supartono 34
 PERTANYAAN

APA FUNGSI DARI LEADER SEQUENCE?

APA FUNGSI DARI SPACER?
IKATAN APA SAJA YG ADA DLM INSULIN?
BGMN KADAR PREPROINSULIN,
PROINSULIN, DAN INSULIN DLM TUBUH?
MENGAPA DEMIKIAN?
BGMN STRUKTUR, PRIMER, SEKUNDER
DAN TERTIER PROTEIN?

12/12/2017 supartono 35
 BGMN PROSES PENGOLAHAN PASCA
TRANSLASI DR ENZIM PGA DR BAKTERI?

PENGOLAHAN PASCATRANSLASINYA SAMA.

PGA TERDIRI ATAS POLIPEPTIDA
HETERODIMER: SUBUNIT KECIL= , SUBUNIT
BESAR=
PGA DARI ESCHERICHIA COLI, BACILLUS
MEGATERIUM, BACILLUS SUBTILIS, DAN
PROTIUS RETTGERI.

12/12/2017 supartono 36
 STRUKTUR 3 DIMENSI
HAEMOGLOBIN

12/12/2017 supartono 37
 STRUKTUR 3 DIMENSI

12/12/2017 supartono 38
 PROTEASE HIV

12/12/2017 supartono 39
 PROTEIN-44

12/12/2017 supartono 40
 MIOGLOBIN BAKTERI

12/12/2017 supartono 41
 MUTASI
KERUSAKAN PADA GEN YANG
DITURUNKAN KEPADA ANAKNYA
DAPAT TERJADI KARENA:
FISIS: SINAR UV
KIMIA: ADANYA ZAT-ZAT YG
MUTAGENIK
12/12/2017 supartono 42
 BEBERAPA PEREAKSI MUTAGENIK
SENYAWA EFEK
Benzo[a]pyrene dan Berinterkelasi dlm DNA,
acridine orange menyebabkan pergeseran
dlm reading frame
Asam nitrit Deaminasi C menjadi U,
menyebabkan kesalahan
kodon (missense)
Dimetil nitrosamin Metilasi basa,
menyebabkan kesalahan
kodon (missense)
Aflatoksin Alkilasi basa guanin,
menyebabkan kesalahan
kodon (missense)
12/12/2017 supartono 43
 AKIBAT MUTASI

1. ADA YG MENGUNTUNGKAN
2. ADA YG MERUGIKAN

12/12/2017 supartono 44
 TIPE MUTASI

1. MISSENSE MUTATION
PENGGANTIAN ASAM AMINO

2. NONSENSE MUTATION
PENGGANTIAN CODON ASAM AMINO OLEH
STOP CODON

3. FRAMESHIFT MUTATION
PENGHAPUSAN ATAU PENYISIPAN
NUKLEOTIDA

12/12/2017 supartono 45
 MISSENSE MUTATION

GEN NORMAL: GTGCACCTGACTCCTGAGGAGAAGTCTGCC

Val His Leu Thr Pro Glu Glu Lys Ser Ala

MISSENSE : GTGCACCTGACTCCTGTGGAGAAGTCTGCC
Val His Leu Thr Pro Val Glu Lys Ser Ala

TERJADI PENGGANTIAN BASA DNA

12/12/2017 supartono 46
 NONSENSE MUTATION

GEN NORMAL: GTGCACCTGACTCCTGAGGAGAAGTCTGCC

Val His Leu Thr Pro Glu Glu Lys Ser Ala

NONSENSE : GTGCACCTGACTCCTGAGGAGUAGTCTGCC
Val His Leu Thr Pro Glu Glu STOP

KODON BAGI SUATU ASAM AMINO DIGANTI

DG STOP CODON.

12/12/2017 supartono 47
 FRAMESHIFT MUTATIONS
GEN NORMAL: GTGCACCTGACTCCTGAGGAGAAGTCTGCC
Val His Leu Thr Pro Glu Glu Lys Ser Ala

FRAMESHIFT
MUTATION : GTGCACCTGACCCTGAGGAGAAGTCTGCC
Val His Leu Thr Leu Arg Arg Ser Leu

TERJADI PERGESERAN DLM READING FRAME

SELAMA TRANSLASI
SENYAWA MUTAGENIK:
BENZO[A]PYRENE DAN ACRIDINE ORANGE

12/12/2017 supartono 48
 APA AKIBAT MUTASI

1. MISSENSE MUTATION?
PROTEIN MUNGKIN BERFUNGSI, MUNGKIN JUGA
TIDAK BERFUNGSI.

2. NONSENSE MUTATION?
PROTEIN PREMATUR (RUSAK).

3. FRAMESHIFT MUTATION?
MUNGKIN FUNGSI DR PROTEIN RUSAK,
MUNGKIN JUGA JUSTRU LEBIH FUNGSIONAL.
12/12/2017 supartono 49
 BUAYA MUTAN

12/12/2017 supartono 50
 ULAR MUTAN

12/12/2017 supartono 51
 ORANG MUTAN

12/12/2017 supartono 52
 IBU MUTAN

12/12/2017 supartono 53
 BAPAK MUTAN

12/12/2017 supartono 54
 GURU MUTAN?

SEDANG DICARI?

12/12/2017 supartono 55
 INI MUTAN APA?

12/12/2017 supartono 56