IDENTIFIKASI TUMBUHAN

Identifikasi adalah suatu proses untuk

menentukan nama takson yang sudah ada
dari suatu organisme.
Identifikasi tumbuhan untuk mendapatkan
nama ilmiah (atau kode) didasarkan pada
karakter tumbuhan misalnya bentuk, warna,
pola dot, atau penanda molekuler
Contoh yang umum dari identifikasi
tumbuhan adalah untuk:
• mengetahui nama umum misalnya
“klewek") atau
• nama ilmiah (misalnya, “Pangium edule").
 Jenis Karakter
• Karakter morfologis
• Karakter anatomis
• Karakter fisiologis
• Karakter molekular
 Determinasi
• Determinasi umumnya dianggap sebagai
sinonim dari identifikasi
 Metode identifikasi
• bisa manual atau computerized
• Menggunakan kunci identifikasi
• Dengan field guide yang terdiri atas
ilustrasi
• Membandingkan dengan spesimen
herbarium
• Bertanya kepada ahlinya
 IDENTIFIKASI TUMBUHAN
2 kemungkinan
• Tumbh belum dikenal dlm dunia ilmu
pengeth  belum mempy nama ilmiah dan
blm dimasukkan dlm kategori yg mana
(klasifikasinya)

• Tumbh tsb sudah dikenal dlm dunia ilmu

pengeth  sudah mempy nama ilmiah dan
dimasukkan dlm kategori tertentu (sistem
klasifikasinya tepat)
 Cara mengidentifikasi tumbuhan yang
belum ada namanya:
1. Memberi nama
• Harus dibuat candra/ deskripsinya, gambar
rinci bagian tumbh yg memuat ciri
diagnostiknya
• Penentuan nama jenis dan takson di atasnya
(marga, suku, dstnya) harus sesuai dengan
ICN (International Code of Nomenclatrure for
algae, fungi, and plants)
• Nama takson harus dipublikasikan melalui
cara sesuai ICN (dlm Jurnal, Flora, Monograf)
2. Mengidentifikasi tumbuhan yang sudah
ada namanya
• Menanyakan kepada ahlinya
• Mencocokkan dg spesimen herbarium yg telah
diidentifikasi
• Mencocokkan dg candra/ deskripsi dan gambar
yg terdpt dlm buku-buku (Flora dan Monografi)
• Menggunakan kunci identifikasi/ determinasi
• Menggunakan lembar identifikasi jenis 
gambar suatu jenis tumbh beserta nama dan
klasifikasinya
 2. Identifikasi = determinasi
Identifikasi berarti mengungkapkan/
menentukan identitas/ jati diri  yaitu
menentukan namanya yg benar dan
tempatnya yg tepat dlm sistem klasifikasi

Determinasi  determinatie (Belanda) artinya

penentuan.
Determinasi berarti menentukan/ memastikan
dg cara dibandingkan/ dicocokkan.
Jika suatu tumbh dibandingkan tumbh yg sudah
dikenal ternyata sama  berarti tumbh sudah
dideterminasi

• Tujuan akhir identifikasi/ determinasi adl mendapatkan

nama  identitas harus jelas
• Hal ini tdk mudah tergantung:
kecekatan, ketekunan dan faktor lain spt
keberuntungan.
• Caranya:
1. mempelajari semua sifat tumbh
2. membandingkan/ mempersamakan dg tumbh
yg sudah dikenal.
KUNCI DETERMINASI  alat yg sengaja
diciptakan untuk memperlancar proses
determinasi

• Pelaksanaannya dpt bertahap dari tingkat

ordo, tingkat familia, genus, species, dll

• Susunan kunci:
1. selangkah demi selangkah
2. pemakai harus memilih 1 diantara 2
pilihan sifat yg bertentangan  sampai
diperoleh identitas tumbh
 MACAM-MACAM KUNCI DETERMINASI

1. Kunci perbandingan
Semua takson tumbh yg tercakup dan
segala ciri utamanya dicantumkan
bersama-sama
 jadi dpt utk membandingkan semua takson
tumbh yg tercakup, oleh krn itu berguna dlm
menyusun kunci analisis
ada 2 macam:
btk tabel
btk kartu berlubang
2. Kunci analisis (kunci dikotom)
bentuk kunci yg paling umum dipakai dlm
pustaka.
• Disebut kunci dikotom krn pd dasarnya terdr dr
sederet bait/ kuplet. Tiap bait terdr dr 2 atau lebih
baris yg disebut penuntun, yg berisi ciri-ciri yg
bertentangan satu sama lain.

• Dua btk umum : kunci paralel

kunci bertakik

• Dibedakan satu dg lain pd cara penempatan bait-

baitnya.
 Kunci genus  bertakik

1. a. daun letaknya berhadapan

2.a. Stigma 1 ………………..…. Alternanthera
2.b. Stigma 2 …………………….. Gomphrena
1.b. daun letaknya tersebar
3.a. buah dg banyak biji ……………... Celosia
3.b. buah dg 1 biji
4.a. bunga biseksual …………... Allmania
4.b. bunga uniseksual …….. Amaranthus
 Kunci genus  paralel
1.a. daun letaknya berhadapan ……………2
b. daun letaknya tersebar ………………..3
2.a. stigma 1 …………….…… Alternanthera
b. stigma 2 …………………… Gomphrena
3.a. buah banyak biji ……………….. Celosia
b. buah dg biji 1 …………………………..4
4.a. bunga biseksual ………….….. Almania
b. bunga uniseksual ………... Amaranthus
3. Kunci sinopsis (kunci padat)

• Pd dasarnya kunci ini merpk daftar ciri-ciri.

Di belakang masing-masing ciri
dicantumkan nomor-nomor takson tumbh
yg mempy ciri tadi.

• Merpk kesimpulan suatu sistem

penggolongan yg penyajiannya secara
tertulis (sekerabat  dikelompokkan)
ciri utama tercantum
 Identifikasi Molekuler
Menentukan tempat Eugenia boerlagei Merr.
(Myrtaceae) berdasarkan sekuen antar gen
atpB-rbcL.

Eugenia boerlagei – unplaced (2007)

Buktikan dengan morfologi dan molekuler

Eugenia Eugenia boerlagei Syzygium

Syzygium
Hasil PCR
 Hasil Sekuen E/S. boerlagei?
AATTTTTTGCGAAATTGTCGAATCCAAAAAAAATGTTCGATAGCAAGTTGAT
CGGTTAATTCAATAAGAAATGGTAATTAGCACTCGATTTCATTGGTACCAT
CCAACCGAATCCAATTCCATTTTGTTTACTTATTCAATTTCAATGAGTGAAT
TCTCAAGTTCAACCAACCTATTTTTAAAATATCAAGTGGATGAATAAAAATC
TTGAGCTTGAGAAAGTCCTTAATTTGATTTGTCTATCATTATAAACAATAAC
TTCCATATTATCTATGGAATTCGAACCTGAACTCTATTTACAATTCATTATTT
TTATCTCCTTATTTTTTCTTTTTTCAGCAGAGCCTTCTATGCCTAGTCTATTC
TTTTTTTTATACCTATACCCTTTCTTTTTTAATGGATAGAAATTCCTCCTATT
TTCACATCTAGGATTTACATATACAACATAGATCACTGTCAAGAGTAAATTT
CTTATTATTTCAATATGATATTTTTGATTCAAAAAAAAGTGAGGGATTCCAA
ATTTTCGAAAAACAAGAATTGGGTTGCGCCATACATATGAAAAGAAGTTTA
CAATAATTGATGTATTTTTGCCGAATCAAATACCCATGGGTATAATAAAAGA
AACCATTATGATTAGTTGATAATAATTCGTTGAATGGATTTTGTGAGAAGAT
TTCTGGTGAAAAGCTTTCATTAAACTCCGAATTTTCTGGTCGAGTAGAACC
TTGGTTGGTTGTGATAATTCTTAATTCAATGAGGTTGTAGGGGAGGGACTT
AATGTCACCCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGT
GTTAAAGATTATAAACTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATA
CTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCTCCTG
AGGAAGCAG
 GC-content (%)
B.
ov
a

3,1
3,2
3,3
3,4
3,5
3,6
3,7
3,8
3,9

3
4
B.
tu lifo
be li
rc a
S_ ula
S_ line ta
a a
S_ str tum
sa oni
m o
ar ide
an s
ge
S_ S_a nse
po qu
ly
ce eum
p
E_ hal
py um
rif
or
E _ mi
un s
i
S_ flor
S_ litt a
po or a
ly
an le
E_ thu
b m
S_ oe
ar rlag
o
S _ ma e i
m ti
al cum
ac
ce
n
in Baeckea, Eugenia and Syzygium

S_ se
cu
m
in
i
GC content of atpB-rbcL spacer sequences
 Syzygium samarangense
0.00059
0.00268Syzygium aqueum
0.00391 0.00059
Eugenia boerlagei?
0.00076 0.00328
Syzygium littoralis
0.00198 0.00719
Syzygium polycephalum
0.00795
0.00960 Syzygium aromaticum
0.00719
0.00198 0.00274 Syzygium astronioides
0.00719
Syzygium polyanthum
0.01285 0.01953
Syzygium malaccense
0.01734
0.00417 Syzygium cumini
0.00904
0.00830 Syzygium lineatum
0.00904
Eugenia uniflora
0.00840
0.02596 Eugenia pyriforme
0.00840

0.030 0.025 0.020 0.015 0.010 0.005 0.000

 Identifikasi dengan DNA
barcoding
Metode taksonomi dengan menggunakan
marker genetik pendek dalam suatu DNA
organisme untuk mengidentifikasi species
yang tak diketahui namanya.

Berbeda dengan filogeni molekuler yang

bertujuan untuk menglasifikasikan
organisme
 Manfaat DNA Barcoding
1. Mengidentifikasi daun tanpa bunga atau
buah
2. Mengidentifikasi produk suplemen herbal
atau kayu dalam perdagangan
 Pemilihan lokus
1. Harus standar
2. Dapat disekuen tanpa primer spesifik
3. Cukup pendek untuk disekuen
4. Menunjukkan variasi yang tinggi antar
species dan sedikit variasi dalam species
Pilihan
Hewan: gen CO1 pada mitokondria
Tumbuhan darat: gen kloroplas rbcL dan
matK
2005 diusulkan gen pada inti yi region ITS
IGS dari plastida trnH-psbA
matK

2009 diusulkan gen kloroplas

rbcL, matK,
 Hebert 2003
• Kompilasi perpustakaan umum barcode
DNA dihubungkan dengan nama species
• Perpustakaan ini merupakan kunci untuk
identifikasi species
 Hasil Sekuen E/S. boerlagei?
AATTTTTTGCGAAATTGTCGAATCCAAAAAAAATGTTCGATAGCAAGTTGAT
CGGTTAATTCAATAAGAAATGGTAATTAGCACTCGATTTCATTGGTACCAT
CCAACCGAATCCAATTCCATTTTGTTTACTTATTCAATTTCAATGAGTGAAT
TCTCAAGTTCAACCAACCTATTTTTAAAATATCAAGTGGATGAATAAAAATC
TTGAGCTTGAGAAAGTCCTTAATTTGATTTGTCTATCATTATAAACAATAAC
TTCCATATTATCTATGGAATTCGAACCTGAACTCTATTTACAATTCATTATTT
TTATCTCCTTATTTTTTCTTTTTTCAGCAGAGCCTTCTATGCCTAGTCTATTC
TTTTTTTTATACCTATACCCTTTCTTTTTTAATGGATAGAAATTCCTCCTATT
TTCACATCTAGGATTTACATATACAACATAGATCACTGTCAAGAGTAAATTT
CTTATTATTTCAATATGATATTTTTGATTCAAAAAAAAGTGAGGGATTCCAA
ATTTTCGAAAAACAAGAATTGGGTTGCGCCATACATATGAAAAGAAGTTTA
CAATAATTGATGTATTTTTGCCGAATCAAATACCCATGGGTATAATAAAAGA
AACCATTATGATTAGTTGATAATAATTCGTTGAATGGATTTTGTGAGAAGAT
TTCTGGTGAAAAGCTTTCATTAAACTCCGAATTTTCTGGTCGAGTAGAACC
TTGGTTGGTTGTGATAATTCTTAATTCAATGAGGTTGTAGGGGAGGGACTT
AATGTCACCCACAAACAGAGACTAAAGCAAGTGTTGGATTCAAAGCTGGT
GTTAAAGATTATAAACTGACTTATTATACTCCTGACTATGAAACCAAAGATA
CTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCTCCTG
AGGAAGCAG
BLAST (Basic Local Alignment Search
Tool)
HASIL
 SIMPULAN
Eugenia boerlagei Merr., Philipp. J.
Sci., C 11: 296 (1916).

Yang benar
Syzygium boerlagei (Merr.) Govaerts
in R.H.A.Govaerts & al., World
Checklist Myrtaceae: 377 (2008).
 Identification Softwares
• Régine Vignes LebbeTotaxacom@mailman.nhm.ku.edu

• available free software are:

- Xper3 (collaborative editor and
identification keys)
http://www.xper3.fr/?language=en
- Ikey+ to compute single access
keys http://www.identificationkey.fr/

- Xper2 (editor and identification keys,

software available on Windows.

Regards
Régine Vignes Lebbe, Professeur UPMC
Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité
UMR 7205, MNHN, UPMC, CNRS, EPHE
Laboratoire Informatique & Systématique (http://www.infosyslab.fr )
http://www.infosyslab.fr
http://isyeb.mnhn.fr/