Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.
com
Blot Barat blotting Barat
• Western blot adalah teknik analitik yang digunakan untuk
mendeteksi protein spesifik dalam sampel homogenat atau ekstrak jaringan tertentu. • Immunoblotting: karena antibodi digunakan untuk mendeteksi antigennya secara spesifik • Western blot untuk Protein Dikembangkan oleh George Stark menggunakan antibodi untuk menemukan Protein blotting Barat • Western blotting didasarkan pada pembangunan kompleks antibodi- protein melalui pengikatan spesifik antibodi terhadap protein yang diimobilisasi pada membran.
• Kemudian mendeteksi antibodi yang terikat melalui beberapa metode
deteksi Alur kerja Western blotting • Sampelpersiapan • elektroforesis gel • Transfer • Pemblokiran & pemeriksaan Antibodi • Deteksi • Analisis Persiapan sampel • Protein dari semua sumber dapat digunakan untuk western blotting seperti dari sel tunggal, seluruh jaringan, matriks ekstraseluler, cairan biologis. • Protein dapat diekstraksi dari sampel dalam tiga langkah berbeda: • Lisis sel:Metode fisik (ultra sonikasi, homogenisasi, dll.) Metode kimia (penggunaan deterjen) Metode biologis (pencernaan enzimatik) • Isolasi protein dari komponen seluler lainnya: Sentrifugasi, DNase, dan buffer lisis lainnya digunakan untuk menghilangkan organel sel, asam nukleat, polisakarida, dll. • Pemurnian protein: Elektroforesis Gel • SDS-HALAMAN, elektroforesis gel natrium dodesil sulfat poliakrilamida Elektroforesis Gel • PAGE (Polyacrylamide gel electrophoresis) terutama digunakan untuk pemisahan partikel protein. • SDS ditambahkan ke gel dan running buffer untuk mendenaturasi molekul protein yang akan memastikan bahwa protein Anda dipisahkan hanya berdasarkan ukuran dan bukan pada struktur tiga dimensi. • Penanda berat molekul digunakan untuk menentukan ukuran protein yang dijalankan dalam gel. Penanda terdiri dari berbagai protein dengan ukuran yang diketahui. • Karena protein tidak langsung terlihat dalam gel, gel harus diwarnai. Protein biasanya diwarnai dengan pewarna seperti Blue, Silver stain, atau Deep Purple. LDK(sodium dodecyl sulfate) adalah detergen (sabun) yang dapat melarutkan molekul hidrofobik tetapi juga bermuatan negatif (sulfatMAKAN) melekat padanya. Elektroforesis SDS-PAGE Proses Pemuatan Sampel Pemindahan Protein • Protein dipindahkan dari gel ke membran pendukung padat seperti nitroselulosa atau polivinilidena difluorida (PVDF). • Protein yang ditransfer dari gel diimobilisasi yang memungkinkan untuk mendeteksi protein pada membran menggunakan antibodi spesifik. • Electro-blotting terutama digunakan yang menggunakan medan listrik untuk menarik protein dari gel ke membran PVDF atau nitroselulosa. • Protein bergerak dari dalam gel ke membran sambil mempertahankan organisasi yang mereka miliki di dalam gel Pemblokiran & Probing Antibodi • Western blotting melibatkan imobilisasi biomolekul pada membran dan memblokir ruang yang belum ditempati oleh protein.
• Karena pengikatan antibodi non-spesifik ke membran mengurangi
spesifisitas dan sensitivitas pengujian.
• Dua kelas utama bahan penghambat (protein dan deterjen non-ionik)
biasanya digunakan untuk western blotting. Pemeriksaan Antibodi • Protokol western blotting biasanya menggunakan antibodi primer yang tidak berlabel yang diarahkan pada protein target dan antibodi sekunder yang diberi label yang diarahkan pada wilayah konstan dari antibodi primer.
• Antibodi sekunder berfungsi tidak hanya sebagai pembawa label
tetapi juga merupakan mekanisme untuk memperkuat sinyal yang dipancarkan karena antibodi sekunder paling sering bersifat poliklonal dan dapat mengikat antibodi primer pada epitop yang berbeda secara bersamaan. Pemeriksaan Antibodi • Alkaline phosphatase (AP) dan horseradish peroxidase (HRP) adalah dua enzim yang paling umum digunakan untuk deteksi protein menggunakan substrat kromogenik. • Probe antibodi lain yang digunakan untuk deteksi protein adalah: • Fluorofor • Antibodi sekunder terbiotinilasi • Radioisotop. Deteksi • Sistem deteksi yang berbeda digunakan dalam western blotting berdasarkan deteksi fluoresensi, kromogenik, atau radio-isotop.
• Metode deteksi enzimatik membutuhkan penambahan substrat yang
memancarkan cahaya saat bereaksi dengan enzim yang terkonjugasi ke antibodi sekunder.
• Deteksi berbasis fluoresensi membutuhkan eksitasi fluorofor
menggunakan sumber cahaya dengan panjang gelombang tertentu yang menyebabkan emisi cahaya. Chemiluminescence Deteksi berbasis fluoresensi Analisis • Deteksi sinyal, baik menggunakan film sinar-X, pemindai, atau pencitra berbasis kamera charge-coupled device (CCD), menghasilkan gambar yang mengandung pita protein yang terlihat. • keberadaan dan jumlah protein yang diinginkan diperkirakan dengan analisis visual, dan ukurannya dapat ditentukan dengan membandingkan penanda berat molekul yang diketahui Protein Penanda
Hasil Analisa Western Blot Visualisasi Hasil
dengan UV-Transiluminator Aplikasi Western Blotting • Diagnosis HIV dengan ELISA melibatkan teknik western blotting. • Teknik western blotting juga digunakan untuk mendeteksi beberapa bentuk Penyakit Lyme. • Teknik western blotting digunakan dalam tes definitif untuk BSE. • Tes konfirmasi untuk Hepatitis-B melibatkan teknik western blotting. • Tes western blotting digunakan dalam analisis Biomarker seperti hormon, faktor pertumbuhan dan sitokin. • Teknik ini juga digunakan dalam studi ekspresi gen. Keterbatasan Western Blotting • Proses yang sangat halus dan memakan waktu. Ketidakseimbangan satu menit di setiap tingkat prosedur dapat merusak hasil seluruh proses. • Menyebabkan kesalahan dalam band atau tidak ada band karena transfer tidak mencukupi. • Teknik terlatih diperlukan untuk teknik ini. • Ketersediaan antibodi primer sangat penting. • Itu hanya tes Semi-Kuantitatif. Hanya perkiraan dan tidak tepat • pengukuran berat molekul protein dimungkinkan.