Subscribe to DeepL Pro to edit this document.

Visit www.DeepL.com/pro for more information.

KARBOHIDRAT,
LIPID DAN
PROTEIN
Departemen Biokimia 2019
Masalah
pembelajaran
• 1. Klasifikasi karbohidrat, lipid, dan senyawa
yang mengandung nitrogen
• 2. Karakteristik dan Klasifikasi protein dan
asam amino

Fakultas Kedokteran UMSU

STRUKTUR KARBOHIDRAT
Monosakarida
Nomenklatur
■ Monosakarida yang paling sederhana memiliki rumus (CH2O)n.
Monosakarida yang memiliki tiga karbon disebut triosa; empat,
tetrosa; lima, pentosa; dan enam, heksosa.
■ Mereka disebut aldosis atau ketosis, tergantung pada apakah gugus
fungsi yang paling teroksidasi adalah aldehida atau keton
■ Gula D dan L
■ Konfigurasi atom karbon asimetris yang paling jauh dari gugus
aldehida atau keton menentukan apakah suatu monosakarida
termasuk dalam seri D atau L. Dalam bentuk D, gugus hidroksil
berada di sebelah kanan; dalam bentuk L, gugus hidroksil berada di
sebelah kiri
■ Atom karbon asimetris memiliki empat gugus kimia yang
berbeda yang melekat padanya.
■ Gula seri D, yang terkait dengan D-gliseraldehida, adalah
paling umum di alam
Stereoisomer, enantiomer, dan epimer
■ Stereoisomer memiliki rumus kimia yang sama tetapi berbeda dalam posisi
gugus hidroksil pada satu atau lebih karbon asimetrisnya.
■ Enantiomer adalah stereoisomer yang merupakan bayangan cermin satu
sama lain.
■ Epimer adalah stereoisomer yang berbeda dalam posisi gugus hidroksil
hanya pada satu karbon asimetris. Sebagai contoh, D-glukosa dan D-
galaktosa adalah epimer yang berbeda pada karbon 4
Struktur cincin karbohidrat
■ Meskipun monosakarida sering digambarkan sebagai rantai lurus (proyeksi
Fischer), monosakarida ada terutama sebagai struktur cincin di mana gugus
aldehida atau keton telah bereaksi dengan gugus hidroksil dalam molekul yang
sama (Gambar I-6).
■ Cincin furanosa dan piranosa masing-masing mengandung lima dan enam
anggota, dan biasanya digambar sebagai proyeksi Haworth (Gambar I-6).
■ Gugus hidroksil pada karbon anomerik dapat berada dalam konfigurasi a atau b.
■ (1) Dalam konfigurasi a, gugus hidroksil pada karbon anomerik berada di
sebelah kanan
dalam proyeksi Fischer dan di bawah bidang cincin dalam proyeksi Haworth.
■ (2) Pada konfigurasi b, berada di sebelah kiri dalam proyeksi Fischer dan di atas
bidang dalam proyeksi Haworth (Gambar I-7).
■ Dalam larutan, terjadi mutarotasi. Bentuk a dan b berimbang melalui rantai
lurus
bentuk aldehida
Glikosida
Pembentukan glikosida
■ Ikatan glikosidik terbentuk ketika gugus hidroksil pada karbon
anomerik monosakarida bereaksi dengan gugus OH atau NH dari
senyawa lain.
■ a-Glikosida atau b-glikosida diproduksi tergantung pada posisi atom
yang melekat pada karbon anomerik gula.
■ Glikosida digitalis dan turunannya memiliki signifikansi klinis
karena menghambat Na+-K+ ATPase pada membran sel. Obat-
obatan tersebut digunakan dalam pengobatan gagal jantung
kongestif
O-Glikosida
■ Monosakarida dapat dihubungkan melalui ikatan O-glikosidik ke
monosakarida lain, membentuk O-glikosida.
■ Disakarida mengandung dua monosakarida. Sukrosa, laktosa, dan
maltosa adalah disakarida yang umum
■ Oligosakarida mengandung hingga sekitar 12 monosakarida.
■ Polisakarida mengandung lebih dari 12 monosakarida, misalnya
glikogen, pati, dan glikosaminoglikan.
N-Glikosida
■ Monosakarida dapat dihubungkan melalui ikatan N-
glikosidik ke senyawa yang bukan karbohidrat. Nukleotida
mengandung ikatan N-glikosidik.
Turunan dari karbohidrat
■ Gugus fosfat dapat melekat pada karbohidrat.
■ a. Glukosa dan fruktosa dapat difosforilasi pada karbon 1
dan 6.
■ b. Gugus fosfat dapat menghubungkan gula dengan
nukleotida, seperti pada UDP-glukosa.
■ Gugus amino, yang sering diasetilasi, dapat dihubungkan
dengan gula (misalnya, glukosamin dan galaktosamin).
■ Gugus sulfat sering ditemukan pada gula (misalnya,
kondroitin sulfat dan glikosaminoglikan lainnya)
Oksidasi karbohidrat
■ Bentuk teroksidasi
■ a. Karbon anomerik dari aldosa (C1) dapat dioksidasi menjadi
asam.
■ Glukosa membentuk asam glukonat (glukonat). 6-
Phosphogluconate adalah
perantara dalam jalur pentosa fosfat.

■ Karbon 6 dari heksosa dapat dioksidasi menjadi asam uronat.

■ (1) Asam uronat ditemukan dalam glikosaminoglikan dari
proteoglikan.
■ (2) Glukosa membentuk asam glukuronat. Konjugasi dengan asam
glukuronat membuat senyawa lipid menjadi lebih mudah larut
dalam air (misalnya, bilirubin diglukuronida).
■ Oksidasi glukosa oleh glukosa oksidase (tes yang sangat spesifik
untuk glukosa) digunakan oleh laboratorium klinis dan laboratorium
lain untuk mengukur jumlah glukosa dalam urin menggunakan
dipstick.
■ Bayi memiliki kemampuan yang menurun untuk mengkonjugasikan
asam glukuronat ke dalam obat seperti kloramfenikol. Pemberian
antibiotik ini selama periode neonatal dapat menyebabkan
peningkatan kadar obat dalam plasma dan sindrom mirip syok janin
yang disebut sebagai sindrom bayi abu-abu.
■ Karena dipstick hanya mendeteksi glukosa, banyak laboratorium
klinis menggunakan tes kimia untuk gula pereduksi, yaitu tes
Benedict yang dimodifikasi untuk gula pereduksi, yang juga akan
mendeteksi keberadaan sukrosa, galaktosa, dan fruktosa. Sebagian
besar urin bayi baru lahir dan bayi secara rutin diskrining untuk gula
pereduksi untuk mendeteksi kesalahan bawaan dalam
metabolisme.
Uji gula pereduksi
■ Gula pereduksi mengandung karbon anomerik bebas yang dapat
dioksidasi.
■ a. Ketika karbon anomerik dioksidasi, senyawa lain akan
tereduksi. Jika produk tereduksi dari reaksi ini diwarnai,
intensitas warnanya dapat digunakan untuk menentukan jumlah
gula pereduksi yang telah teroksidasi.
■ b. Reaksi ini merupakan dasar dari tes gula pereduksi, yang
digunakan oleh laboratorium klinis. Tes ini tidak spesifik. Aldosa
seperti glukosa memberikan hasil tes yang positif. Ketosa seperti
fruktosa juga merupakan gula pereduksi karena membentuk
aldosa dalam kondisi pengujian.
Pengurangan karbohidrat
■ 1. Gugus aldehida atau keton dari gula dapat direduksi menjadi
gugus hidroksil, membentuk poliol (polialkohol).
■ 2. Glukosa direduksi menjadi sorbitol, dan galaktosa menjadi
galaktitol.

Glikosilasi protein
■ Penambahan gugus gula pada protein dapat mengubah protein
dengan berbagai cara, termasuk memodifikasi fungsinya,
melindunginya dari proteolisis, dan mengarahkan lalu lintas
intraseluler, serta mengarahkan pergerakan sel.
■ Sorbitol tidak mudah berdifusi keluar dari sel. Saat terakumulasi
dalam sel, sorbitol menyebabkan kerusakan osmotik pada sel-sel
sistem saraf, yang mengakibatkan katarak dan neuropati.
■ Pasien dengan defisiensi adhesi leukosit (LAD) II memiliki defisiensi
bawaan dalam kemampuan glikosilasi ligan untuk selektin
permukaan sel, yang memediasi migrasi sel imun. Pasien seperti ini
rentan terhadap infeksi yang mengancam jiwa yang berulang.
PROTEOGLIKAN, GLIKOPROTEIN,
DAN GLIKOLIPID
■ Proteoglikan ditemukan dalam matriks ekstraseluler atau substansi
dasar jaringan ikat, cairan sinovial sendi, humor vitreous mata,
sekresi sel penghasil lendir, dan tulang rawan.
■ 1. Proteoglikan terdiri dari protein inti dengan rantai polisakarida
panjang yang tidak bercabang (glikosaminoglikan). Struktur
keseluruhannya menyerupai sikat botol.
■ 2. Rantai ini terdiri dari unit disakarida yang berulang, yang biasanya
mengandung asam uronat dan heksosamin. Asam uronat umumnya
adalah asam D-glukuronat atau L-iduronat.
■ 3. Gugus amino dari heksosamin biasanya diasetilasi, dan
gugus sulfat sering terdapat pada karbon 4 dan 6.
■ 4. Sebuah xilosa dan dua residu galaktosa menghubungkan rantai
disakarida yang berulang ke protein inti.
■ Glikoprotein berfungsi sebagai enzim, hormon, antibodi, dan protein struktural.
Mereka ditemukan dalam cairan ekstraseluler dan dalam lisosom dan melekat
pada membran sel. Mereka terlibat dalam interaksi sel-sel.
■ 1. Bagian karbohidrat dari glikoprotein berbeda dengan proteoglikan dalam
yang lebih pendek dan sering bercabang (Gambar I-11).
■ a. Glikoprotein mengandung manosa, L-fukosa, dan asam N-asetilneuraminat
(NANA) selain glukosa, galaktosa, dan turunan aminonya. NANA adalah anggota
kelas asam sialat.
■ b. Penentu antigenik dari zat golongan darah ABO dan Lewis adalah
gula di ujung cabang karbohidrat ini.
■ 2. Karbohidrat melekat pada protein melalui gugus hidroksil dari residu serin dan
treonin atau amida N dari asparagin.
Glikolipid
■ 1. Glikolipid (atau sfingolipid) berasal dari lipid ceramide. Kelas
senyawa ini mencakup cerebrosida dan gangliosida.
■ a. Cerebrosida disintesis dari ceramide dan gula UDP.
■ b. Gangliosida memiliki residu NANA (berasal dari CMP-NANA)
yang bercabang dari rantai oligosakarida linier.
■ 2. Glikolipid ditemukan dalam membran sel dengan bagian
karbohidrat yang memanjang ke ruang ekstraseluler.
ASAM AMINO
Struktur asam amino
1. Sebagian besar asam amino mengandung gugus karboksil, gugus amino, dan
rantai samping (R
kelompok), semuanya melekat pada a-karbon. Pengecualian adalah:
■ a. Glisin, yang tidak memiliki rantai samping. Karbon a-nya mengandung dua
hidrogen.
■ b. Prolin, yang nitrogennya merupakan bagian dari sebuah cincin, adalah asam
imino.
2.Semua dari 20 asam amino, kecuali glisin, memiliki konfigurasi L. Karena glisin
tidak mengandung atom karbon asimetris, maka glisin tidak aktif secara optik, dan
dengan demikian, glisin bukanlah D maupun L.
3. Klasifikasi asam amino didasarkan pada kimiawi rantai sampingnya.
■ a. Asam amino hidrofobik memiliki rantai samping yang mengandung gugus
alifatik (valin, leusin, dan isoleusin) atau gugus aromatik (fenilalanin, tirosin, dan
triptofan) b. Gugus hidroksil yang terdapat pada serin dan treonin
■ b. Gugus hidroksil yang ditemukan pada serin dan treonin dapat
membentuk hidrogen
obligasi.
■ c. Belerang terdapat dalam sistein dan metionin.
■ Oksidasi gugus sulfhidril dari dua sistein dapat membentuk
ikatan disulfida, menghasilkan sistin.
■ d. Gugus yang dapat terionisasi terdapat pada rantai samping tujuh
asam amino. Mereka dapat membawa muatan, tergantung pada
pH. Ketika diisi, mereka dapat membentuk interaksi elektrostatik.
■ e. Amida hadir pada rantai samping asparagin dan
glutamin.
■ f. Rantai samping prolin membentuk cincin dengan nitrogen yang
melekat pada a-karbon.
B. Muatan pada asam amino
■ 1. Muatan pada gugus a-amino dan a-karboksil
■ Pada pH fisiologis, gugus a-amino terprotonasi (pKa 9) dan membawa muatan
positif, dan gugus karboksil terdisosiasi (pKa 2) dan membawa muatan negatif.
■ 2. Muatan pada rantai samping
■ a. Muatan positif terdapat pada rantai samping asam amino dasar arginin,
lisin, dan histidin pada pH 7.
■ b. Muatan negatif terdapat pada rantai samping asam amino aspartat dan
glutamat pada pH 7.
■ c. Titik isoelektrik (pI) adalah pH di mana jumlah muatan positif sama dengan
jumlah muatan negatif sehingga molekul tidak memiliki muatan bersih.
C. Titrasi asam amino
■ Gugus yang dapat terionisasi pada asam amino membawa proton pada pH rendah
(tinggi [H+]) yang terdisosiasi saat pH meningkat.
■ 1. Untuk asam amino yang tidak memiliki rantai samping yang dapat
diionisasi, dua pKa diamati selama titrasi (Gambar I-14).
■ a. Yang pertama (pKa1) berhubungan dengan gugus a-karboksil (pKa2).
Sebagai proton
terdisosiasi, gugus karboksil berubah dari muatan nol menjadi muatan
minus.
■ b. Yang kedua (pKa2) berhubungan dengan gugus a-amino (pKa2 9). Sebagai
proton
terdisosiasi, gugus amino berubah dari muatan positif menjadi nol.
■ 2. Untuk asam amino dengan rantai samping yang dapat terionisasi, tiga pKa
diamati selama
titrasi
■ a. Gugus a-karboksil dan a-amino masing-masing memiliki pKas sekitar 2
dan 9.
■ b. pKa ketiga bervariasi dengan asam amino dan tergantung pada pKa rantai
D. Ikatan peptida
■ Ikatan peptida secara kovalen bergabung dengan gugus a-karboksil dari setiap
asam amino ke a-
gugus amino dari asam amino berikutnya dalam rantai protein (Gambar I-16).
■ 1. Karakteristik
■ a. Atom-atom yang terlibat dalam ikatan peptida membentuk unit planar yang
kaku.
■ b. Karena karakter ikatan rangkap parsialnya, ikatan peptida planar itu sendiri
memiliki
tidak ada kebebasan rotasi.
■ c. Namun, ikatan yang melibatkan a-karbon dapat berputar dengan bebas.
■ 2. Ikatan peptida sangat stabil. Pembelahan umumnya melibatkan hidrolitik
aksi enzim proteolitik.
LIPIDS
■ A. Asam lemak ada yang "bebas" atau teresterifikasi menjadi gliserol.
■ 1. Pada manusia, asam lemak biasanya memiliki jumlah atom karbon yang genap,
panjangnya 16 hingga 20 atom karbon, dan dapat bersifat jenuh atau tidak jenuh
(mengandung ikatan rangkap). Asam lemak digambarkan dengan jumlah karbon
dan posisi ikatan rangkap (misalnya, asam arakidonat, yang memiliki 20 karbon
dan 4 ikatan rangkap, adalah 20:4, D5,8,11,14).
■ 2. Asam lemak tak jenuh ganda sering diklasifikasikan menurut posisi ikatan
rangkap pertama dari ujung o (karbon terjauh dari gugus karboksil; misalnya, o-3
atau o-6).
■ B. Monoasilgliserol (monogliserida), diasilgliserol (digliserida), dan
triasilgliserol (trigliserida) masing-masing mengandung satu, dua,
dan tiga asam lemak yang diesterifikasi menjadi gliserol.
■ C. Fosfogliserida mengandung asam lemak yang diesterifikasi pada
posisi 1 dan 2 dari gugus gliserol dan gugus fosforil pada posisi 3
(misalnya fosfokolin).
■ D. Sphingolipid mengandung ceramide dengan berbagai gugus yang
melekat.
■ 1. Sfingomielin mengandung fosfokolin.
■ 2. Cerebrosida mengandung residu gula.
■ 3. Gangliosida mengandung sejumlah residu gula.
■ E. Kolesterol mengandung empat cincin dan rantai samping alifatik.
■ Garam empedu dan hormon steroid berasal dari kolesterol.
■ F. Prostaglandin dan leukotrien berasal dari asam lemak tak jenuh
ganda seperti asam arakidonat.
■ G. Vitamin yang larut dalam lemak termasuk vitamin A, D, E, dan K.