Keuntungan menggunakan sistem Gateway adalah kita hanya perlu mengkloning sekuens DNA
1 kali untuk membuat seluruh klon. Jika 1 kali klone sudah terverifikasi maka kita dapat
memindahkan fragment ke semua sistem ekspresi hanya dengan 1 step yakni dengan reaksi
rekombinasi tanpa menggunakan enzim restriksi, ligase, subkloning ataupun membaca dan
screening multiple clones.