MAKALAH MIKROBIOLOGI

GENETIKA Measles morbilivirus

Ditujukan untuk Memenuhi Tugas Mata Kuliah Mikrobiologi

Semester 4 (Empat) Tahun Ajaran 2019/2020
Universitas Tadulako

Disusun Oleh:

(Kelompok 11 Kelas C)

1. Meliana Muliadi (G 701 17 108)

2. Christin Lumeling (G 701 17 178)
3. Widia (G 701 17 053)

PROGRAM STUDI FARMASI

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS TADULAKO
2019/ 2020
 BAB I
PENDAHULUAN

A. Latar Belakang
Genus Morbillivirus milik keluarga virus Paramyxoviridae , sekelompok virus
yang diselimuti dengan genom RNA untai negatif yang tidak tersegmentasi. Ini
mengandung virus yang sangat menular, menyebar melalui jalur pernapasan,
menyebabkan penekanan kekebalan tubuh yang dalam, dan memiliki
kecendrungan untuk menyebabkan wabah besar yang terkait dengan morbiditas
dan mortalitas yang tinggi pada populasi yang sebelumnya tidak terpajan. Pada
populasi dengan sirkulasi virus endemik, epidemiologi berubah menjadi penyakit
anak-anak, sebagai inang yang selamat dari infeksi biasanya mengembangkan
kekebalan seumur hidup (Vries, 2015)

Virus campak (MV) adalah prototype morbillivirus dan menyebabkan penyakit

pada primate, Virus Rinderpest (RPV) terkait erat dengan MV dan digunakan
untuk menyebabkan penyakit parah pada sapi. Virus lain dalam genus
Morbillivirus termasuk virus ruminans peste des petits (PPRV), yang
menyebabkan penyakit pada ruminansia kecil, seperti kambing dan domba;
canine distemper virus (CDV), yang menyebabkan distemper pada anjing dan
besar jumlah spesies karnivora lainnya; virus phocine distemper (PDV), yang
mengarah ke distemper dalam beberapa menyegel spesies dan cetacean
morbilliviruses (CeMV), yang menyebabkan penyakit pada lumba-lumba dan
paus (Vries, 2015)

Genetika merupakan suatu cabang ilmu yang dinamis dan berkembang dengan
cepat. Penelaahnya dilakukan oleh beribu-ribu ilmuwan diseluruh dunia.
Rekayasa genetika adalah suatu segi baru studi genetika yang menjanjikan
padamasyarakat baik perkembangan yang menguntungkan maupun
 kemungkinantimbulnya akibat-akibat yang membawa bencana. Kita harus
menerungkan bagaimana cara untuk menaklukan semua penyakit menurun dan
kemungkinanterubahnya suatu mikroba yang umum dan tidak berbahaya menjadi
bentuk patogenik.

Konsep Genetika berkembang dari ilmu yang membahas tentang bagaimana sifat
diturunkan mdenjadi lebih luas lagi yakni ilmu yang mempelajari tentang materi
genetika membahas : 1) struktur materi genetik, meliputi: gen, kromosom, DNA,
RNA, plasmid, episom, dan elemen transposable, 2) reproduksi materi genetik,
meliputi : reproduksi sel, replikasi DNA, reverse transcription, rolling circle
replication, cytoplasma inheritance, dan Mendelian inheritance, 3) kerja materi
genetik meliputi: ruang lingkup materi genetic , transkripsi, modifikasi pasca
transkripsi, kode genetik, translasi, konsep one gen one enzyme, interaksi kerja
gen, control kerja gen pada prokariotik, kontrol kerja gen pada eukariotik,
kontrol genetic terhadap respon imun, control genetik terhadap pembelahan sel,
ekspresi kelamin, perubahan materi genetik, 4) perubahan materi genetik,
meliputi: mutasi, dan rekombinasi, 5) genetika dalam populasi dan 6) perekayasa
materi genetic.

B. Rumusan Masalah
1. Pengertian gen dan prinsip dogma sentral
2. Replikasi, transkripsi dan translasi Measles morbilivirus
3. Transformasi genetic Measles morbilivirus dan rekombinan

C. Tujuan
1. Untuk Mengetahui Pengertian gen dan prinsip dogma sentral
2. Untuk Mengetahui Replikasi, transkripsi dan translasi Measles morbilivirus
3. Transformasi genetic Measles morbilivirus dan rekombinan
 BAB II
PENDAHULUAN

A. Pengertian Gen

Jelas bawah arti genetika seperti diatas masih terikat kuat pada sejarah tumbuh
dan berkembangnya genetika yang bermula dari era J.G. Mendel. Dalam hal ini
memang benar bahwa substansi kajian yang dilaporkan J.G. Mendel adalah
seputar pewarisan sifat.

Virion dari MeV adalah partikel pleomorfik atau bola dengan diameter mulai dari 120
sampai 1000 nm dan memiliki komponen struktural ganda: satu adalah inti
ribonucleoprotein (RNP) heliks yang dibentuk oleh asosiasi nukleoprotein (N),
fosfoprotein (P) dan protein besar (L) dengan genom virus, yang lainnya adalah amplop
yang berasal dari membran sel yang mengelilingi inti RNP. Kompleks RNP aktif
bertanggung jawab untuk memulai transkripsi primer setelah masuk sel serta menangkal
jalur pensinyalan host interferon (IFN). MeV RNP terikat oleh protein matriks (M), dan
kemudian ditutupi oleh amplop lipid yang mengandung dua glikoprotein lonjakan,
protein F dan H, yang masing-masing bertanggung jawab atas fusi membran dan
perlekatan reseptor, masing-masing.
Untuk campak, gejala biasanya timbul setelah masa inkubasi 7-14 hari dan 7-10 hari
terakhir. Mereka biasanya termasuk demam, batuk, coryza, konjungtivitis, enanthema
(bintik Koplik) pada mukosa mulut, dan ruam makulopapular. Terlepas dari gejala yang
khas, fitur spesifik campak adalah imunosupresi jangka panjang karena hilangnya
imunememori B dan sel T. Sebagai akibatnya, pasien dapat mengalami komplikasi,
terutama dalam pengaturan malnutrisi di negara-negara berkembang, mulai dari
superinfeksi bakteri, pneumonia, dan diare hingga ensefalomielitis postinfectious (PIE),
atau panencephalitis sklerosis sub-akut (SSPE), yang dapat bermanifestasi bahkan
beberapa tahun setelah pemulihan.

Menurut (Kumar, 2016) Struktur virion. Vrion PPRV terdiri dari genom RNA untai
negatif dan enam protein struktural, yaitu H, HN, M, P, N, dan L. Lapisan terluar,
amplop, terdiri dari dua glikoprotein amplop, protein H dan HN yang merupakan
tertanam dalam bilayer lipid yang diturunkan inang. Protein M bertindak sebagai
penghubung antara glikoprotein amplop dan kompleks RNP. Komponen utama RNP
adalah RNA dan protein N yang mengelilinginya. Protein L dan P juga dikaitkan dengan
RNP.
B. Prinsip dogma sentral

Dogma sentral biologi menjelaskan mengenai proses perubahan gen dari

DNA menjadi RNA, dan RNA menjadi protein. Dogma ini menjelaskan
bagaimana proses pembacaan materi genetik menjadi protein yang berperan di
setiap tahap metabolisme di dalam tubuh suatu organisme (Bettelheim et al,
1984) Sebagai pernbawa informasi genetika, DNA rnempunyai dua fungsi
utama: 1) rnembuat kopi yang tepat dari pada dirinya sendiri pada waktu proses
repllkasi atau duplikasi dan 2) rneneruskan koda-koda informasi yang dimiliki
ke.nRNA (tnessenger RNA) pada waktu proses transkripsi. Dengan demikian
mRNA kelaknya dapat menterjemahkan (mengtranslasikan) informasi-
informasi "bahasa dalam 4 huruf" dari pada asam nukleat ke dalam "bahasa
dalam 24 huruf" darl pada protein. Konsep ini (gambar 1) merupakan dasar
yang terkenal sebagai Dogma Sentral yang dlkemukakan oleh Crick (2) pada
tahun 1958.
Dogma yang berlaku universal ini menyatakan bahwa sekali informasi
telah diteruskan menjadi protein, maka tidak dapat dikembalikan menjadi
bentuk asalnya (DNA). Aliran informasi dari asam nukleat ke asam nukleat
memang memungkinkan, tetapi aliran informasi dari protein ke asam nukleat
atau dari protein ke protein tidak memungkinkan. Dogma sentral terdiri dari tiga
tahap yaitu replikasi, transkripsi dan translasi. Tahap replikasi dilakukan untuk
memasok DNA pada setiap organisme, sedangkan tahap transkripsi bertujuan
untuk menulis ulang DNA dalam bentuk mRNA (messenger RNA).

C. Genom Measles morbilivirus

Saat ini, 24 MeV genotipe yang dikompilasi dalam delapan clades (A – H) telah
dikenali dengan mengurutkan 450 nukleotida (nt) yang mengkode C-terminal
150 asam amino dari gen N. Namun, netralisasi silang dengan antisera spesifik-
regangan hanya mengungkapkan satu serotipe. Mengikuti aturan enam, genom
RNA dari MeV adalah 15.894 bp panjangnya dan dienkapsulasi dengan ketat
oleh protein N yang tersusun secara heliks untuk membentuk nukleokapsid
heliks (NC) yang mengandung N-RNA yang juga diamati pada anggota
Paramyxoviridae lainnya. Genom dimulai dengan daerah non-coding 52 nt
dikenal sebagai pemimpin dan berakhir dengan daerah non-coding 37 nt dikenal
sebagai trailer, yang keduanya penting untuk transkripsi dan replikasi genom
Organisasi genom MeV mirip dengan kebanyakan anggota Paramyxoviridae
lainnya: ada enam gen yang mengkode delapan protein virus yang diatur
sebagai 30-N, P, V, C, M, F, H, L-50, masing-masing diapit oleh akhir gen dan
urutan mulai gen.

Kode gen pertama untuk protein N. Inti N-terminal N yang terlestarikan (sekitar
400 asam amino) merupakan wilayah inti N protein sedangkan ekor C-terminal
N yang tersisa (sekitar 100 asam amino) pada dasarnya tidak teratur dan
berinteraksi dengan protein matriks dan domain terminal-C dari fosfoprotein.
Selain itu, fleksibilitas struktural dari ekor N yang tidak teratur penting untuk
interaksi antara ekor N dan beberapa protein seluler, termasuk 70 protein heat
shock (Hsp72) KDa, faktor inisiasi terjemahan eukariotik faktor 3 (eIF3-p40)
dan faktor pengaturan interferon 3 ( IRF-3).

Kode gen kedua untuk tiga protein-P, V, dan C-melalui proses penyuntingan
RNA dan kerangka bacaan alternatif [28]. Protein P berikatan dengan N yang
baru disintesis untuk membentuk kompleks N0-P yang dapat larut, sehingga
mencegah N dari pengikatan pada RNA seluler, dan kompleks N0-P digunakan
sebagai substrat untuk enkapsulasi spesifik RNA virus. Selain itu, protein P
menambat polimerase ke dan berkembang di sepanjang template N-RNA
dengan mengikat ke NC.

Fungsi utama protein V dan C adalah untuk menekan inang respon imun
bawaan dengan mengganggu jalur pensinyalan IFN. Protein ini juga berfungsi
sebagai faktor virulensi karena sangat diperlukan untuk infeksi virus in vivo.
Untuk virus Sendai terkait, protein C bahkan meningkatkan pelepasan protein
M dengan cara yang tergantung pada kompleks penyortiran endosom yang
diperlukan untuk jalur transportasi (ESCRT)

Kode gen ketiga untuk protein M, yang merupakan protein hidrofobik.

Meskipun M bukan protein membran, ia berasosiasi dengan membran, mungkin
melalui permukaan hidrofobiknya. Ini juga mengikat RNP, terkait dengan ekor
sitoplasma dari protein F dan H dan memodulasi fusi sel. Selain itu, ia bertindak
sebagai penghambat aktivitas polimerase virus, mempengaruhi transkripsi
mRNA dan replikasi genom. Dengan demikian, protein M memainkan peran
penting dalam banyak tahap siklus hidup virus.

Kode gen keempat dan kelima untuk glikoprotein lonjakan terkait-amplop yang
diindikasikan dalam fusi membran dan pengakuan reseptor, yang dibahas di
bawah ini dalam subbagian “Assembly and Egress” nanti dalam artikel ini.
Kode gen terakhir untuk RNA-dependent RNA polimerase (RdRP), yang
diyakini memiliki semua fungsi katalitik yang diperlukan untuk sintesis RNA,
termasuk polimerisasi ribonucleotide, capping dan metilasi, dan
polyadenylation. Protein L, N, dan P berhubungan dengan RNA virus untuk
membentuk kompleks RNP aktif yang memulai transkripsi primer setelah
pemasukan sel.

Berdasarkan (Kumar, 2016), Organisasi genom PPRV. PPRV memiliki genom

RNA negativestranded yang mengandung 15.948 nt. Genom terdiri dari enam
gen yang mengkodekan delapan protein dalam urutan 3 ′ -NP / C / V-M-F-H-L-
5 ′. 3 ′ ujung (52 nt) dan 5 ′ ujung (37 nt) dari genom masing-masing memiliki
UTR yang disebut daerah pemimpin dan trailer. Selain protein P, gen P juga
menghasilkan dua protein nonstruktural, yaitu V dan C, dengan menggunakan
mekanisme seperti pengeditan mRNA dan kerangka bacaan alternatif
(pemindaian bocor), masing-masing. Angka-angka menunjukkan panjang gen
individu.

Morbillivirus memiliki genom RNA linear, beruntai tunggal, perasaan negatif,

tidak terikat. Panjang yang tepat dari berbagai genom morbili bervariasi karena
ukuran variabel persimpangan antara matriks (M) dan gen protein fusi (F).
Vrion PPRV adalah partikel pleomorfik dengan lipid yang membungkus
nukleokapsid heliks yang memperlihatkan penampilan tulang herring yang
khas. Genom PPRV terdiri dari 15.948 nukleotida (nt) yang mengkodekan enam
protein struktural dan dua nonstruktural dalam urutan 3 ′ -NP / C / VMF-HN-L-
5 protein Protein hemagglutinin (H) dari PPRV juga menunjukkan aktivitas
neuraminidase dan, karenanya, dinamai protein hemagglutinin-neuraminidase
(HN).
D. Sel Entri
Ikatan awal MeV ke permukaan sel dimediasi oleh protein H tetramerik melalui
interaksi dengan reseptor permukaan sel, yang memicu perubahan konformasi
protein F trimerik dan kemudian, fusi membran dan pengiriman inti RNP virus
ke dalam sitoplasma. Mirip dengan protein H dari Morbillivirus, protein H dari
MeV tidak dapat mengikat asam sialic dan tidak memiliki aktivitas
neuraminidase; dengan demikian, itu dinamai H bukan HN. Reseptor utama
untuk tipe MeV tipe liar adalah CD150 / SLAM dan nectin-4 / PVRL4 dan
beberapa strain yang diadaptasi di laboratorium dan vaksin juga terikat pada
CD46. Selain itu, protein F sangat penting untuk penggabungan sel yang
terinfeksi dengan sel tetangga, yang akhirnya menghasilkan pembentukan sel
berinti banyak, disebut "syncytia", yang merupakan ciri khas MeV dan banyak
paramyxovirus lainnya.

E. Transkripsi dan Replikasi

MeV berbagi urutan gen dan strategi transkripsi yang merupakan karakteristik
mendasar dari semua paramyxovirus lainnya. Setelah entri sel, RNP genom
dilepaskan ke dalam sitosol dan RNA viral yang dienkapsulasi berfungsi
sebagai templat kompleks RdRP untuk transkripsi dan replikasi. Transkripsi
dimulai pada ujung 30 genom dan gen virus ditranskripsi dalam arah 30 sampai
50 dengan mekanisme “stop-start” berurutan. MeV berbagi urutan gen dan
strategi transkripsi yang merupakan karakteristik mendasar dari semua
paramyxovirus lainnya. MRNA virus yang baru disintesis diterjemahkan ke
protein virus dengan menggunakan mesin terjemahan inang. Genom untai
negatif juga digunakan untuk mensintesis anti-genom untai positif, yang
merupakan salinan komplementer dari seluruh genom yang menghasilkan lebih
banyak genom melalui viral RNA polimerase yang sama. Selama replikasi,
RNA genomik yang baru disintesis erat dibungkus dengan protein N untuk
memberikan template heliks untuk transkripsi dan replikasi virus. Meskipun
mekanisme beralih dari transkripsi ke replikasi masih belum jelas, bukti
menunjukkan bahwa akumulasi protein N sangat penting untuk itu.

Menurut Kumar 2016 Seperti morbillivirus lainnya, transkripsi dan replikasi

PPRV dikendalikan oleh daerah yang tidak diterjemahkan (UTR) pada 3 ′ dan 5
′ ujung genom, yang dikenal sebagai promotor genom (GP) dan promotor
antigenom (AGP) dan diwakili oleh nt 1–107 dan 15840–15948 masing-masing
dalam genom PPRV. Ujung 3 ′ dan 5 ′ dari genom PPRV masing-masing terdiri
dari daerah trailer 52-nt-long dan 37-nt-long. Urutan pemimpin yang
panjangnya lima puluh dua nt bersama dengan 3 ′ UTR dari nukleoprotein (N)
gen dan melestarikan daerah intergenik 3-nt-panjang (IG) di antara mereka
berfungsi sebagai dokter untuk sintesis mRNA dan pelengkap / RNA
antigenomik. AGP terdiri dari daerah trailer, UTR 5 of dari protein (L) besar
(setelah kodon stop) dan wilayah IG di antara mereka. AGP hanya terlibat
dalam sintesis RNA genomik. Rentang 23-31 nt pada terminal 3 both dari kedua
dokter dan AGP dilestarikan di antara strain PPRV dan diyakini bertindak
sebagai domain penting untuk aktivitas promotor. Jenis PPRV di lapangan dan
vaksin berbeda sebesar 6 nt di dokter umum (di posisi 5, 12, 26, 36, 42 dan 81)
dan 1 nt di AGPs (di posisi 15842)

Mutasi pada GP di posisi 26 terkait dengan fenotip yang dilemahkan pada

morbillivirus. Mutasi pada GP pada posisi 5 dan 12 hanya ada pada strain
vaksin PPRV dan RPV, dan empat mutasi lainnya pada posisi 36, 42, 81 dan
15842 hanya ada pada strain vaksin PPRV. Menariknya, dibandingkan dengan
morbili virus lain dan galur vaksin PPRV, galur PPRV mengandung U bukan
residu C pada posisi 36. Beberapa mutasi yang dijelaskan di atas di wilayah GP
/ AGP saja atau dalam kombinasi mungkin terlibat dalam pelemahan / virulensi
PPRV, dan karenanya menyajikan wilayah lain di samping gen protein F dan
nukleokapsid] dalam genom PPRV untuk analisis filogenetik
 Viral polimerase mensintesis mRNA dalam arah 3 to hingga 5 ′ pada templat
RNA genomik. Wilayah terminator dari masing-masing gen diikuti oleh
wilayah IG 3-nt-panjang. Wilayah IG juga ditemukan di persimpangan gen N
dan urutan pemimpin, dan antara gen L dan wilayah trailer. Wilayah IG terdiri
dari semi-konservasi sinyal polyadenylation, sekuens GAA yang sangat
terkonservasi, sebuah sinyal awal semi-kekal untuk gen berikutnya dan panjang
variabel 5 of dan 3 ′ UTR. Di PPRV, di persimpangan gen L dan daerah trailer,
GAA digantikan oleh GAU. Pada beberapa strain PPRV, persimpangan dari gen
H dan L dapat digantikan oleh GCA. Setiap gen dimulai dengan urutan UCCU /
C yang dikonservasi. Untuk menghasilkan protein virus individu, unit
transkripsi terdiri dari urutan pengkodean, wilayah IG dan sinyal start dan stop
yang dikonservasi yang mengapitnya. Semua paramyxovirus mengandung
urutan trinucleotide (AGG) yang diawetkan pada awal setiap spesies mRNA.
UTR, meskipun dengan panjang yang bervariasi, juga hadir sebelum dan
sesudah kerangka pembacaan terbuka (ORF) dari masing-masing gen. Sebuah
traktat poli U yang terletak 52 pangkalan hilir dari kodon frame berhenti
membaca terbuka N sangat dikonservasi di antara morbillivirus dan bertindak
sebagai sinyal poligadenilasi untuk transkrip indra positif yang dihasilkan oleh
viral RNA polimerase. Protein N, M, F, dan L nampaknya merupakan protein
morbili virus yang paling terkonservasi

F. Replikasi Virus
a. Attachment
Langkah pertama infeksi, pengikatan virus ke sel inang dan pengiriman
nukleokapsid ke dalam sitoplasma sel inang, tentu memainkan peran
penting dalam patogenesis virus dan kerentanan terhadap inang. Interaksi
pertama PPRV dengan inang dimediasi melalui pengikatan pada reseptor
seluler melalui protein perlekatannya, protein HN. Morbillivirus awalnya
menargetkan organ limfoid dan bereplikasi secara efisien dalam limfosit.
 Molekul aktivasi limfosit pensinyalan (SLAM), juga disebut CD150, adalah
reseptor seluler utama untuk virus morbili. Ini secara eksklusif
diekspresikan pada sel-sel kekebalan dan, oleh karena itu, virus-virus
tersebut memiliki tropisme sel limfoid yang kuat.
b. Signaling Molekul Aktivasi Limfosit
SLAM pertama kali diidentifikasi dengan menyaring perpustakaan cDNA
yang berasal dari sel B95a yang sangat permisif untuk MV. Transfeksi klon
tunggal cDNA dari sel marmoset B (B95a) membuat sel 293T rentan (yang
sebaliknya tidak rentan) terhadap pseudotipe virus stomatitis vesikular yang
mengandung protein H MV. Klon cDNA tunggal yang mampu membuat
sel 293T yang ditransfeksi rentan terhadap protein MV-H diidentifikasi
sebagai SLAM. Lebih lanjut, MV, yang hanya diamplifikasi dari sel-sel
SLAM-positif, mampu menghasilkan tanda-tanda klinis pada hewan yang
terinfeksi, oleh karena itu SLAM bertindak sebagai reseptor seluler utama
untuk MV in vivo. SLAM pada prinsipnya diekspresikan pada limfosit,
monosit, sel dendritik dan makrofag. SLAM memiliki keterlibatan luas
dalam modulasi respon imun bawaan dan didapat saat mereka mengatur
aktivasi sel T dan memiliki kemampuan untuk mengatur fungsi pembunuh
alami dan sel dendritik.

Semua morbillivirus terikat ke domain V SLAM. Protein yang terkait

dengan SLAM (SAP) atau transkrip diaktifkan 2 EWS / FLI-1 adalah
molekul adaptor yang terkait dengan ekor sitoplasma SLAM. Itu
domain ekstraseluler SLAM dapat berhubungan dengan molekul SLAM
lain yang ada pada sel yang berdekatan. Keterlibatan SLAM menginduksi
ikatannya dengan SAP, dan memicu pensinyalan hilir untuk peningkatan
regulasi sitokin T helper 2. Residu protein MV-H yang berinteraksi dengan
SLAM adalah I194, D505, D507, Y529, D530, T531, R533, H536, Y553
dan P554. Entri sel yang dimediasi SLAM sangat penting untuk
pengembangan patogenisitas lengkap dari morbillivirus. Strain lapinized
SLAM-blind SLAM rekombinan sangat virulen pada kelinci dan
mereproduksi patogenisitas yang serupa dengan RPV virulen pada sapi, dan
karenanya berfungsi sebagai model yang berguna untuk menggambarkan
patogenisitas RPV in vivo dari RPV.

Reseptor seluler menentukan kisaran inang dan tropisme jaringan virus.

SLAM dari masing-masing spesies inang (manusia, anjing, sapi, dan
kambing) bertindak sebagai reseptor umum untuk MV, CDV, RPV, dan
PPRV. Untuk isolasi PPRV dari spesimen klinis, sel monyet yang
mengekspresikan SLAM kambing lebih sensitif daripada yang
mengekspresikan SLAM ternak. Sel B95a mengekspresikan tingkat SLAM
yang tinggi pada permukaan sel dan karenanya berfungsi sebagai garis sel
umum untuk isolasi MV, CDV, RPV, dan PPRV.

CYTOPLASMIC
1. Virus menempel pada reseptor permukaan sel inang melalui H
glycoprotein.
2. Fusion dengan membran plasma; ribonucleocapsid dilepaskan di
sitoplasma.
3. Transkripsi berurutan, mRNA virus ditutup dan dipoladenilasi dalam
sitoplasma.
4. Replikasi mungkin dimulai ketika cukup nukleoprotein hadir untuk
merangkum antigenom dan genom yang disintesis neo.
5. Ribonucleocapsid berinteraksi dengan protein matriks di bawah
membran plasma dan tunas melalui kompleks ESCRT, melepaskan
virion.
G. Sistem Virologi dan Interaksi Host-Patogen
Peran protein virus individu dalam replikasi virus dan patogenesis penyakit
telah membuka jalan bagi pengembangan obat antivirus yang menargetkan
komponen virus. Namun, karena mutasi yang sering pada genom virus,
pendekatan virus-sentris untuk pengembangan obat telah menghasilkan
resistensi obat. Beberapa penelitian yang terisolasi telah mengidentifikasi
beberapa agen antivirus penargetan inang yang unik yang cenderung tidak
mengembangkan resistansi terhadap obat. Namun, informasi yang tepat tentang
semua protein seluler yang diperlukan untuk replikasi virus yang efektif tidak
dapat diprediksi dengan menganalisis jalur individu / protein dan, karenanya,
tidak cocok untuk menggambarkan interaksi host-virus yang kompleks dan
beragam.

Biologi sistem berkaitan dengan pemahaman komprehensif sistem biologi

melalui penggunaan gabungan biologi, matematika, dan ilmu komputer.
Analisis tingkat sistem menggunakan teknologi throughput tinggi untuk
mengevaluasi perubahan seluruh sistem dalam komponen biologis, seperti RNA
/ DNA (genomik), protein (proteomik), metabolit (metabolomik), lipid
(lipidomik) dan karbohidrat (glikomik). Sistem biologis untuk virologi sistem
dapat berkisar dari sel yang terinfeksi, hingga jaringan, hingga seluruh
organisme. Munculnya sequencing generasi berikutnya telah menciptakan
kemungkinan besar untuk menghasilkan informasi seluruh sistem, termasuk: (i)
untuk melaporkan perbedaan kuantitatif dan kualitatif dalam individu dari
spesies yang sama; (ii) untuk mengkarakterisasi spektrum interaksi protein
pengikat DNA, dan (iii) untuk membuat profil genom modifikasi epigenetik.
Data throughput tinggi diintegrasikan dan dianalisis menggunakan algoritma
komputer / matematika untuk menghasilkan model prediksi sistem, yang pada
akhirnya memungkinkan gangguan eksperimental sistem. Alih-alih berfokus
pada set molekul kecil yang telah ditentukan (gen, protein atau metabolit),
virologi sistem bukannya pendekatan yang tidak bias untuk menangani
perubahan sistem secara luas pada host setelah infeksi virus dan, karenanya,
mewakili pandangan tingkat sistem yang komprehensif dari interaksi host-virus.

a. Perubahan Genom-Lebar pada Gen Host setelah Infeksi Virus

Profil transkripsi gen host-lebar setelah infeksi berbagai virus telah
 mengumpulkan sejumlah besar data ke bank data DNA. Namun demikian,
analisis transkriptom dari sel mononuklear darah perifer (PBMC) setelah
infeksi morbillivirus, termasuk PPRV, juga telah dianalisis. Analisis
transkriptome sel dendritik sapi setelah infeksi RPV (bovine patogen) dan
tipe liar (human pathogen) menunjukkan bahwa, dibandingkan dengan RPV,
MV menginduksi respons interferon yang kuat dan cepat. RPV patogen dan
nonpatogenik juga menginduksi perbedaan yang signifikan, dengan yang
terakhir menginduksi respons interferon yang sedikit lebih tinggi serta efek
signifikan pada transkripsi gen yang terlibat dalam regulasi siklus sel.
Infeksi PPRV ke PBMC mengarah pada ekspresi diferensial dari setidaknya
985 gen yang terlibat dalam mengatur jalur pengaturan imun, spliceosomal,
dan apoptosis. Sebelumnya, dengan pendekatan reduksionis tradisional,
hanya segelintir gen ini yang diketahui. Gen-gen inang baru yang
diidentifikasi cenderung memberikan wawasan baru dalam memahami
replikasi virus, patogenesis, dan respons imun.
b. Host-Proteome Signatures setelah Infeksi Virus
Untuk menyebarkan dan menghindari respon imun inang secara efektif,
virus menyebabkan perubahan fungsi metabolisme banyak sel inang.
Penelitian sebelumnya telah mengidentifikasi banyak protein inang yang
mengatur replikasi virus, meskipun informasi komprehensif tentang
perubahan semua protein inang tidak dapat dipastikan menggunakan
pendekatan reduksionis semacam itu. Profil proteome kuantitatif global
telah dipelajari dengan menggunakan teknologi seperti gel elektroforesis
dua dimensi ditambah dengan identifikasi MALDI-TOF, spektrometri
massa, teknologi chip protein desorpsi / ionisasi protein chip yang
ditingkatkan permukaan, teknologi susunan protein fase-balik dan pelabelan
isotop stabil oleh amino asam dalam kultur sel dikombinasikan dengan LC-
MS / MS. Bidang yang berkembang pesat ini telah mengidentifikasi profil
proteome kuantitatif dari berbagai virus, termasuk MV, di mana infeksi pada
 sel A549 / hSLAM ditemukan untuk menginduksi ekspresi diferensial dari
38 protein, 18 di antaranya secara unik terkait dengan infeksi MV. Dengan
analisis bioinformatika, kelompok protein seperti sitoskeleton, transkripsi /
translasi, metabolisme, respon imun dan protein mitokondria diidentifikasi
yang terlibat dalam mengatur kematian sel dan apoptosis. Pendekatan ini
juga dapat digunakan untuk mengidentifikasi peran kinase sel inang dalam
infeksi virus, dan perbandingan dapat dibuat antara dua virus yang berbeda.
Pendekatan-pendekatan ini dan analisis tingkat sistemnya harus
meningkatkan pemahaman kita tentang berbagai aspek patogenesis
penyakit, serta mengungkap biomarker baru.
c. Virus-Host Interactomes
Layar siRNA atau shRNA di seluruh sistem telah mengidentifikasi sejumlah
faktor host yang diperlukan untuk replikasi virus yang efisien. Analisis
komputasional telah digunakan untuk membangun dan mendeskripsikan
interaksi virus-host yang pada gilirannya telah mengidentifikasi target
seluler untuk intervensi terapeutik. Interaksi virus inang semacam itu telah
dihasilkan untuk berbagai macam virus, termasuk PPRV, dan telah
menyoroti faktor seluler yang mungkin penting dalam replikasi virus,
virulensi, patogenesis, dan respons imun. Sebuah metaanalisis dari interaksi
host virus yang diidentifikasi baik target host yang umum maupun spesifik
virus, menunjukkan bahwa target obat umum untuk beberapa virus dapat
dikembangkan.
d. Glycomics
Interaksi karbohidrat protein (glikokonjugat) tidak hanya terjadi di dalam sel
untuk berbagai proses biologis, tetapi juga terjadi di permukaan sel inang
dalam inisiasi infeksi oleh virus. Di era postgenomik, glikomik (studi
fungsional karbohidrat pada organisme hidup) telah muncul sebagai salah
satu bidang penting dalam penelitian virus. Pola glikosilasi protein dapat
bervariasi dalam jenis sel yang berbeda. Masing-masing garis sel bervariasi
 dalam sekuens (tiga persyaratan sekuens asam amino lokal untuk
penggunaan N-glikosilasi) dan karenanya memiliki struktur glika yang
berbeda yang dapat mempersulit presentasi antigen. Sebagai contoh, sel-sel
serangga lebih cenderung menggunakan sekuens tertentu daripada platform
sel telur atau mamalia dan karenanya komposisi, pola percabangan, ukuran
dan muatan elektrostatik dari N-glycans HA-linked sangat bervariasi sesuai
dengan jenis sel. Perbedaan-perbedaan ini dapat memengaruhi sifat-sifat
vaksin di mana sekumpulan reagen terstandar dibuat dari satu sumber (mis.
Telur ayam betina), dan karenanya secara tidak sengaja memengaruhi hasil
pengujian potensi vaksin. Metode yang tersedia untuk profil permetilasi
nanoLC / MS E glycan MALDI-TOF MS untuk menganalisis dan
memantau glikosilasi HA dalam vaksin influenza untuk perbandingan
banyak-ke-banyak. Implikasi dari metodologi tersebut dalam penelitian
morbillivirus akan meningkatkan pemahaman kita tentang patogenesis
penyakit dan pengembangan produk.
e. RNA nonkoding
Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) adalah konsorsium kolaboratif
kelompok-kelompok penelitian dengan tujuan membangun daftar lengkap
unsur-unsur fungsional dalam genom manusia. Itu didirikan pada tahun
2003 (fase percontohan) dan berisi semua data yang dihasilkan oleh
penyelidik ENCODE. Selain berisi data tentang gen pengkode protein, juga
berisi informasi tentang gen nonkode, seperti RNA nonkode yang panjang
dan microRNA yang diketahui berperan dalam regulasi gen transkripsi dan
epigenetik.

Analisis RNA-seq dari respon host terhadap infeksi virus telah

mengungkapkan ekspresi diferensial dari berbagai RNA non-coding lama
host dalam sel yang terinfeksi yang mungkin berpotensi terlibat dalam
mengatur respon imun bawaan untuk berbagai virus.
 Lebih jauh lagi, pengurutan RNA kecil dalam sel yang terinfeksi virus
mengungkapkan ekspresi diferensial lebih dari 200 RNA kecil, yang
meliputi RNA nuklir kecil, RNA kecil terkait-piwi, dan host microRNAs
(mi-RNA) yang memainkan peran penting dalam transkripsi, aktivasi
kekebalan dan regulasi siklus sel. MiRNA penting dalam interaksi virus
inang di mana inang membatasi infeksi virus dengan mengekspresikan
miRNA berbeda yang menargetkan gen virus esensial. Di sisi lain, virus,
terutama virus DNA, juga telah mengembangkan kemampuan untuk
menurunkan regulasi atau meningkatkan ekspresi RNA seluler spesifik
untuk mengatur replikasi mereka. Untuk mendeteksi dan mengukur ekspresi
miRNA, sejumlah metodologi telah dikembangkan, termasuk Northern blot,
reaksi rantai polimerase waktu-nyata, microarray, pengurutan dalam,
susunan infeksi balik virus terkait aeno (AAV) dan susunan infeksi terbalik
AAV berbasis susunan infeksi AAV sistem dualreporter yang ditunjuk
sebagai array Asensor miRNA. Menyusul munculnya metode penentuan
profil miRNA yang tinggi ini, telah terjadi akumulasi data yang cepat pada
host yang terkait virus mi-RNA. Semakin banyak bukti juga menunjukkan
peran mi-RNA dalam replikasi morbillivirus. Informasi tersebut cenderung
memberikan wawasan untuk pemahaman yang lebih baik tentang interaksi
morbillivirus-host.
f. Tanda tangan yang diasosiasikan dengan Host untuk Viren dan Virren Viral
Tanda tangan molekuler dari inang dapat menjelaskan keparahan penyakit
yang tergantung pada jenis virus (jenis virulen / avirulen). Sebagai contoh,
sel-sel epitel paru-paru yang terinfeksi virus A (A549) mengungkapkan
perbedaan halus dalam kemampuan untuk menginduksi respons inang
spesifik, membuat virus influenza H5N1 lebih ganas daripada H1N1.
Terbukti dari penelitian semacam itu bahwa virus yang sangat patogen
meningkatkan atau menurunkan pengaturan gen yang hampir sama dengan
virus patogen yang lebih rendah, meskipun yang pertama dengan kekuatan
 yang lebih besar dan dengan kinetika yang berbeda. Oleh karena itu, hanya
memperoleh informasi kualitatif dari gen yang diekspresikan secara berbeda
dalam menanggapi infeksi hanya dapat memberikan bagian dari informasi
yang diperlukan untuk memprediksi patogenisitas. Kinetika dan besarnya
respon host adalah penentu penting dari hasil penyakit, dan ini mungkin
memiliki implikasi penting untuk terapi antivirus. Meskipun agen
penargetan inang memiliki kecenderungan lebih sedikit untuk
mengembangkan resistansi terhadap obat, bukti yang muncul menunjukkan
bahwa ini tidak cukup berhasil. Ada kemungkinan bahwa alih-alih hanya
bergantung pada target, terapi yang diarahkan langsung oleh tuan rumah
juga akan tergantung pada waktu di mana unsur-unsur respons host ditekan
atau ditingkatkan. Aplikasi virologi sistem di masa depan dalam PPRV dan
morbillivirus lainnya kemungkinan akan menjelaskan mekanisme penyakit
dari avirulent (galur vaksin), galur yang ganas dan sangat ganas.
g. Perlawanan dan Kerentanan Inang terhadap Infeksi Virus
Setelah infeksi akut, tingkat pemulihan pada kambing yang terkena PPRV
relatif lebih rendah daripada pada domba. Demikian pula, RPV memiliki
afinitas tinggi untuk sapi Asia dibandingkan dengan sapi Afrika. Efek breed
pada kerentanan / resistensi terhadap PPRV juga telah dilaporkan. Meskipun
informasi yang komprehensif tentang semua faktor tuan rumah kurang,
salah satu elemen yang telah diidentifikasi dan yang membuat kerbau tahan
terhadap PPR (dibandingkan dengan kambing) adalah tingkat ekspresi basal
yang lebih tinggi dari reseptor seperti Toll 3/7. Sistem virologi dapat
mengungkap semua faktor tuan rumah yang mungkin bertanggung jawab
untuk resistensi penyakit, seperti yang diidentifikasi untuk kawanan ayam,
berbeda rentan terhadap enteritis nekrotik.
 BAB III
PENUTUP

A. Kesimpulan

Genus Morbillivirus milik keluarga virus Paramyxoviridae , sekelompok virus

yang diselimuti dengan genom RNA untai negatif yang tidak tersegmentasi. Ini
mengandung virus yang sangat menular, menyebar melalui jalur pernapasan,
menyebabkan penekanan kekebalan tubuh yang dalam, dan memiliki
kecendrungan untuk menyebabkan wabah besar yang terkait dengan morbiditas
dan mortalitas yang tinggi pada populasi yang sebelumnya tidak terpajan. Pada
populasi dengan sirkulasi virus endemik, epidemiologi berubah menjadi penyakit
anak-anak, sebagai inang yang selamat dari infeksi biasanya mengembangkan
kekebalan seumur hidup. Morbillivirus memiliki genom RNA linear, beruntai tunggal,
perasaan negatif, tidak terikat. Panjang yang tepat dari berbagai genom morbili
bervariasi karena ukuran variabel persimpangan antara matriks (M) dan gen protein fusi
(F).

B. Saran

Untuk mengetahui serta memahami lebih jauh bahkan lebih lengkap mengenai
Mikroba khususnya pada pembahasan sekaitar metabolisme dan fisiologi
mikroorganisme. Pembaca dapat membaca dan mempelajari buku–buku yang
berhubungan dengan Mikroba khususnya pada pembahasan sekaitan dengan
Genetika Measles morbilivirus. Disini penulis menyadari bahwa dalam penulisan
makalah ini masih jauh dari sempurna, sehingga kritik dan saran yang bersifat
membangun dan menyempurnakan penulisan makalah–makalah selanjutnya
sangat diharapkan.
 DAFTAR PUSTAKA

Jiang, Yanliang., Yali Qin., dan Mingzhou Chen. 2016. Host-Pathogen Interactions
in Measles Virus replication and Anti-Viral Immunity.

Kumar, Naveen., et al. 2016. Systems Perspective of Morbillivius Replication.

Soedigdo, P. 1973. Tinjauan Ulang Mengenai Biokimia DNA Dan RNA Serta
Biosintesa Protein. Proceedings ITB Vol. 7, No. 2. ITB. Bandung.

Vries, Roty. D., W.Paul Duprex. and Rik L. de Swart. 2015. Morbillivirus
Infections: An Introduction.