Artikel asli
Antibiotik produksi yang ditingkatkan menggunakan media kulit gram hijau oleh
Streptomyces sp. SD1 menggunakan metodologi permukaan respons
Mani Kalaiyarasi a, Parvaiz Ahmad b, Ponnuswamy Vijayaraghavan a,⇑
Divisi Teknik Bioprosesing, Smykon Biotech Pvt. LtD, Nagercoil, Distrik Kanyakumari, Tamilnadu, India b Departemen Botani dan
Mikrobiologi, Sekolah Tinggi Sains, Universitas King Saud, Riyadh 11451, Arab Saudi
article info Farmakologis. Streptomyces sp. menghasilkan berbagai antibiotik untuk mengobati berbagai penyakit.
Kemampuan Streptomyces sp. SD1 untuk mensintesis antibiotik menggunakan berbagai limbah agroindustri
sebagai substrat padat dievaluasi. Limbah agro yang digunakan adalah kulit nanas, dedak gandum, pomace
Sejarah artikel:
Diterima 20 November 2019 apel, dedak padi, bubuk tapioka, kulit jeruk dan sekam gram hijau untuk produksi antibiotik. Media kultur
Direvisi 25 Januari 2020 dioptimalkan dengan menggunakan berbagai karbon, nitrogen, ion, dan mineral. Untuk meningkatkan produksi
Diterima 8 Februari 2020 Tersedia metabolit maksimum, fermentasi Streptomyces sp. SD1 dioptimalkan melalui metodologi permukaan respons.
online 19 Februari 2020 RSM juga digunakan untuk menganalisis interaksi di antara faktor-faktor dan menyaring komponen medium
kultur. Streptomyces sp. SD1 memiliki kemampuan untuk menghasilkan antibiotik pada tingkat tertinggi dengan
sekam gram hijau sebagai substrat. Di antara sumber karbon, pati, dan maltosa meningkatkan produksi
Kata kunci: antibiotik. Namun, sumber yang dipilih seperti, sukrosa dan glukosa dipengaruhi secara negatif pada produksi
Streptomices sp.
antibiotik. Ekstrak daging sapi, pepton dan ekstrak ragi dipengaruhi secara positif pada produksi antibiotik.
Agro-residu
Namun, penambahan kasein dan tepung gandum menghambat produksi antibiotik. Di antara ion divalen,
Fermentasi solid state
kalsium klorida, magnesium sulfat dan mangan klorida meningkatkan produksi antibiotik, namun suplementasi
Metodologi permukaan respons
kobalt klorida dan merkuri klorida mempengaruhi produksi antibiotik. Semua sumber mineral yang dipilih
abstract
meningkatkan produksi antibiotik dan hasilnya lebih tinggi daripada kontrol. Grafik permukaan respons 3D
menunjukkan hasil maksimum antibiotik pada konsentrasi sumber nutrisi yang dipilih lebih tinggi. Produksi
antibiotik ditingkatkan 2,9 kali lipat oleh Streptomyces sp. SD1 dalam media yang dioptimalkan daripada media
yang tidak optimal. Di antara isolat, Streptomyces sp. SD1 menunjukkan aktivitas antimikroba yang tinggi.
Penemuan berbagai antibiotik
Actinomycetes yang dipilih menggunakan sekam gram hijau untuk produksi antibiotik. Juga penambahan
dari genus Streptomyces
sumber nutrisi merangsang produksi antibiotik. Sekam gram hijau sangat berguna untuk produksi antibiotik
mendapatkan perhatian yang
dalam skala besar.
baik dari Industrialis dan
2020 Para Penulis. Diterbitkan oleh Elsevier B.V. atas nama King Saud University. Ini adalah artikel akses
terbuka di bawah lisensi CC BY-NC-ND (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).
1. Pendahuluan dua jenis substrat padat yang digunakan dalam
SSF, ini adalah substrat padat lembam yang
Fermentasi solid-state (SSF) menjelaskan kepada
dilengkapi dengan berbagai sumber nutrisi dan
substrat padat fermentasi menggunakan
substrat padat yang tersedia secara alami seperti,
mikroorganisme dengan air lebih sedikit atau
limbah agroindustri. Ini termasuk, residu tanaman
tanpa air bebas (Al-Dhabi dkk., 2016). Dalam SSF,
seperti, gandum dan beras, limbah pengolahan
⇑
buah, termasuk, nanas, anggur, wortel dll. (Al-
Penulis yang sesuai. Dhabi dkk., 2019a). Substrat ini bertindak
Alamat e-mail: venzymes@gmail.com (P. Vijayaraghavan).
Tinjauan sejawat di bawah tanggung jawab Universitas King Saud.
sebagai sumber nutrisi penting dan
mikroorganisme mengeluarkan enzim
ekstraseluler untuk memodifikasi dan memecah
substrat padat ini. Dalam kasus bahan padat
1018-3647/ 2020 Penulis. Diterbitkan oleh Elsevier B.V. atas nama King Saud University.
https://doi.org/10.1016/j.jksus.2020.02.014
Ini adalah artikel akses terbuka di bawah lisensi CC BY-NC-ND (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 2
lembam sintetis diperlukan sumber nutrisi diganti terutama tergantung pada kondisi kultur dan
dengan pertumbuhan dan pembentukan produk konsentrasi nutrisi (Kirk et al., 2000). Oleh karena
mikroorganisme (Al-Dhabi dkk., 2019b). Dalam itu, pemilihan dan studi komposisi medium kultur
SSF, limbah agroindustri tidak hanya memberikan yang sesuai sangat berguna untuk memastikan
nutrisi yang dibutuhkan untuk organisme, tetapi biaya rendah dan produktivitas tinggi dari proses
juga menambatkan pertumbuhan dan produksi produksi metabolit sekunder.
biomolekul (Vijayaraghavan dan Vincent, 2012; Al-
Streptomyces memanfaatkan molekul
Dhabi dkk., 2020). Umumnya, antibiotik telah
kompleks dan sederhana sebagai sumber energi
sering diproduksi oleh kultur cair dan dalam
dan nutrisi (Al-Dhabi et al., 2019d) Genus
beberapa tahun terakhir, SSF digunakan untuk
Streptomyces menghasilkan berbagai metabolit
produksi antibiotik. SSF memiliki banyak
sekunder bioaktif (Arasu et al., 2013a; Al-Dhabi
keunggulan dibandingkan fermentasi terendam.
dkk., 2014; Arasu et al., 2017). Organisme ini
SSF sangat mudah dilakukan, memiliki
memiliki banyak potensi biosintesis yang tetap
produktivitas tinggi, membutuhkan investasi
tak tertandingi tanpa pesaing yang valid di
modal yang sangat minim, membutuhkan energi
antara kelompok organisme lainnya. Banyak
yang sangat rendah, media kultur sederhana, dan
spesies Streptomyces disaring untuk produksi
aplikasi air yang lebih sedikit dan menghasilkan
metabolit sekunder dari berbagai sumber (Liu
lebih sedikit air limbah dan pengolahan hilir yang
et al., 2015; Manivasagan et al., 2013; Arasu
sederhana (Vijayaraghavan dan Vincent, 2014; Al-
dkk., 2019; Arasu et al., 2015). Sebanyak 500
Dhabi dkk., 2019c). Dalam bioproses,
strain Streptomyces berkontribusi sekitar 70-
pembentukan produk dipengaruhi oleh media
80% dari total produksi antibiotik (Arasu et al.,
kultur dan kondisi kultur yang diterapkan.
2013b). Genera lain seperti Actinoplanes,
Hubungan yang baik antara sekresi metabolit dan
Micromonospora, Amycolatopsis dan
komposisi media kultur telah diselidiki
Saccharopolyspora berkontribusi sangat sedikit
sebelumnya. Di Streptomices sp. sekresi metabolit
(Azman et al., 2015; Arokiyaraj dkk., 2015;
terutama didasarkan pada komponen media dan
Balachandran et al., 2015). Alasan penting
kondisi kultur. Konsentrasi dan komponen nutrisi
untuk penemuan antibiotik baru adalah untuk
dalam media kultur dipengaruhi pada produksi
memecahkan masalah kebal penyakit, yang
metabolit (Elibol, 2004; Al-Dhabi dkk., 2018a).
tidak lagi efektif melawan beberapa organisme
Dalam SSF, kebutuhan nutrisi bervariasi dari
patogen. Penemuan berbagai antibiotik dari
organisme ke organisme, oleh karena itu, variabel
genus ini mendapat perhatian yang baik dari
fermentasi penting, media kultur yang sesuai dan
Industrialis dan Farmakologis. SSF juga berguna
komponennya dan berbagai parameter proses
untuk produksi agen antimikroba (Rajkumaria
lainnya diperlukan untuk mengidentifikasi dan
et al., 2019; Valsalam dkk., 2019a). S.
mengoptimalkan (Singh dkk., 2017; Al-Dhabi dkk.,
clavuligerus telah dikultur di bawah kondisi
2018b). Di Streptomices sp. berbagai metabolit
kultur SSF dalam media yang dioptimalkan
sekunder dapat disintesis oleh organisme yang
untuk meningkatkan produksi sefalosporin C.
sama di berbagai lingkungan pH dan optimalisasi
Dalam penelitian lain, S. rimosus dipekerjakan
faktor sangat penting untuk mencapai antibiotik
untuk produksi oxytetracycline di bawah SSF
yang diinginkan. Streptomices adalah organisme
(Yang dan Swei, 1996). Agen antimikroba,
serbaguna, menghasilkan berbagai tingkat
polieterin A, juga disebut Nigericin, adalah
produksi metabolit sekunder. Dalam organisme
polieteriklik yang disekresikan oleh berbagai
ini, mekanisme intraseluler secara efektif
strain dari genus Streptomyces. Ini
mengontrol akumulasi metabolisme, yang
menunjukkan aktivitas yang sangat kuat sebagai
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 3
aktivitas antijamur, antibakteri dan antimalaria yang dikumpulkan disimpan dalam kotak es dan
(Taechowisan et al., 2013; Gumila et al., 1997; dipindahkan ke laboratorium. Dalam penelitian
Valsalam dkk., 2019b). Industri termasuk ini, sifat fisiko-kimia sampel tanah dari tiga lokasi
sayuran, buah-buahan, daging, susu, unggas, pengambilan sampel dianalisis untuk mempelajari
tempat pembuatan bir, pengolahan laut dan sifat tanah. Sifat-sifat seperti, tekstur, warna,
biji-bijian yang menghasilkan sejumlah besar salinitas, nitrogen, kandungan fosfor, pH,
residu limbah. Industri-industri ini membuang magnesium, klorida dan kandungan kalsium
sumber nutrisi yang tersedia secara alami ini dianalisis. Actinomycetes awalnya diisolasi dari
sebagai bahan limbah. Organisasi Pangan dan sampel menggunakan metode pelat sebar
Pertanian memperkirakan bahwa, dalam setiap menggunakan actinomycetes isolation agar (g/ L)
tahun lebih dari 1,3 miliar ton bahan pangan (natrium kaseinat-2, L-Asparagine-0.1, natrium
terbuang percuma. Limbah ini termasuk, 35% propionat-4, dipotassium fosfat-0.5, magnesium
makanan laut, 20% produk susu, 30% sereal sulfat-0.001 dan agar15) dan pati kasein agar (g/L)
dan 20% daging. Residu agro banyak digunakan pati larut -10, kasein-0.3, kalium nitrat-2,
sebagai substrat untuk produksi berbagai novel magnesium sulfat- 0,05, di-kalium hidrogenfosfat-
2, natrium klorida-2, besi sulfat-0,01 dan agar-18),
Antibiotik
dan diinkubasi selama 14 hingga 21 hari pada 28
Dedak padi mengandung kaya protein, serat C. Media kultur dilengkapi dengan nistatin (50
dan minyak nabati dan telah sering digunakan mg/ml) dan gentamycin sulfat (25 mg/ml) untuk
untuk produksi berbagai biomolekul (Zhang et mengurangi kontaminasi jamur dan bakteri,
al., 2012). Dalam SSF, komponen media pada masing-masing. Setelah 28 hari inkubasi, budaya
awalnya disaring untuk produksi produk dan dimurnikan dengan metode standar (Hayakawa
dioptimalkan lebih lanjut untuk meningkatkan dan Nonomura, 1987; Crawford et al., 1993; Yu
hasil produk dengan pendekatan statistik. dkk., 2013).
Dalam produksi antibiotik, komponen nutrisi
dan kondisi fisik adalah faktor pembatas. 2.2. Skrining utama actinomycetes untuk produksi antibiotik
2.3. Penyaringan sekunder 2.6. Produksi antibiotik dengan fermentasi solid-state (SSF)
Actinomycetes terisolasi yang menunjukkan Sekitar 5 g substrat (kulit nanas, dedak gandum,
aktivitas ampuh terhadap B. subtilis MTCC 441 pomace apel, dedak padi, bubuk tapioka, sekam
diinokulasi ke dalam media budaya Actinomycetes gram hijau dan kulit jeruk) diambil dan kadar air
dan diinkubasi selama 2 minggu pada 175 rpm disesuaikan hingga 65%. Labu disterilkan dan
(Madigan et al., 1997). Setelah 2 minggu, inokulum 0,5 ml diperkenalkan. Budaya ini sering
metabolit sekunder diekstraksi menggunakan dicampur dan diinkubasi selama 8 hari pada 30 ±
pelarut seperti, metanol, etanol, etil asetat, 2 C. Setelah 8 hari, metabolit sekunder kasar
heksana dan aseton. Pelarut diuapkan dan uji diekstraksi, disaring, disentrifugasi dan digunakan
antibakteri dilakukan dengan metode Kirby-Bauer. sebagai antibiotik kasar.
Fraksi etil asetat dimuat pada cakram 6 mm steril,
2.7. Penyaringan variabel dengan metode tradisional
dikeringkan dan ditempatkan pada pelat kultur B.
subtilis MTCC 441. Untuk disk kontrol, etil asetat Produksi antibiotik dilakukan dengan
dimuat dan dikeringkan. Zona diameter diperoleh menggunakan sekam gram hijau sebagai substrat
dan ukuran zona penghambatan dianggap sebagai padat sampai dinyatakan lain. Parameter proses
titer antibiotik seperti yang dijelaskan oleh seperti, sumber karbon, sumber nitrogen, ion
Maxwell et al. (1994). divalen dan mineral dievaluasi. Komponen
2.4. Karakterisasi morfologis dan pengurutan 16S rDNA medium yang dipilih dimasukkan ke dalam labu
Erlenmeyer yang mengandung sekam gram hijau
Antibiotik maksimum yang menghasilkan strain sebagai media nutrisi utama. Setelah sterilisasi,
Streptomyces ditanam pada media ISP dan kultur mendinginkan media kultur, 0,5 ml inokulum
diidentifikasi berdasarkan karakter morfologis, (10%, v / w) diinokulasi dalam labu Erlenmeyer.
termasuk produksi pigmen, morfologi spora dan Produksi antibiotik Streptomyces sp.
hifa udara. Actinomycete ampuh yang terisolasi
diukur setelah 8 hari inkubasi pada 28 ± 2 C.
ditanam actinomycetes isolasi agar medium.
Pengurutan gen 16S rDNA dilakukan dengan 2.8. Optimalisasi komponen sedang
metode standar. DNA genomik dari Streptomyces
sp. yang kuat dilakukan dengan menggunakan kit CCD dan Response Surface Methodology (RSM)
pemurnian DNA (Qiagen, USA). Gen 16S rRNA digunakan untuk menyaring maltosa, CaCl 2 dan
diperkuat dengan menggunakan forward (5 0- NaH2PO4 untuk meningkatkan produksi antibiotik
GTTGGATCCAGAGTTTGATCMTGGCT-3 0) dan berdasarkan kegiatan yang diperoleh dari metode
reverse (50- GTTGGATCCACGGYTACCTTGTTA CG- optimasi tradisional. Komponen medium yang
30), primer (Sambrook et al., 1989). dipilih dipelajari untuk menentukan nilai optimal.
Percobaan ini dilakukan dalam 20 uji coba
2.5. Limbah agroindustri untuk produksi antibiotik percobaan yang berbeda dengan analisis
eksperimen rangkap tiga. Untuk perhitungan
Kulit nanas, dedak gandum, pomace apel, dedak
model statistik, matriks dirancang berdasarkan
padi, bubuk tapioka, sekam gram hijau dan kulit
persamaan berikut 1.
jeruk dikeringkan pada suhu 60 C untuk
semalaman. Semua residu agro digiling dengan
X0
baik dan dilewatkan menggunakan mesh standar xdan 1/4 Xdan ; dan 1/40; 1;
(saringan 30 mesh). Semua substrat langsung 2; 3;...; n; dXdan
digunakan tanpa pretreatment. di mana xi – menunjukkan variabel independen
yang dipilih untuk nilai yang dikodekan, Xi –
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 5
nilai asli dari variabel yang dipilih, X0 – nilai titik dipilih terhadap Staphylococcus aureus
tengah dari nilai aktual variabel independen, MTCC96, Bacillus subtilis MTCC 441 dan
dan –nilai perubahan langkah Xi. Escherichia MTCC 64. Sekitar 59% dari isolat
menunjukkan sifat antimikroba dan sebagian
Central compositedesigndan responsesurface
besar sampel ditemukan efektif terhadap
methodologywas digunakan untuk Bacillus subtilis MTCC 441. Di antara
mengoptimalkan variabel proses. Persamaan actinomycetes, Streptomyces sp. SD1
model kuadrat berguna untuk menganalisis menunjukkan produksi hiper; oleh karena itu ini
dipertahankan untuk meningkatkan produksi
perilaku persamaan kuadrat. Y 1/4b0 þRbiXi þRbijXi X
agen antimikroba. Karakter morfologis
iXj þRbiiX2i
mengungkapkan bahwa ia berada di bawah
di mana Y = prediksi respons, b0 = istilah Streptomyces sp. Isolat yang dipilih
intersep, bi = koefisien linier, bij = koefisien diidentifikasi dengan pendekatan molekuler.
kuadrat, b = koefisien interaksi, XiXi = variabel Karakteristik pertumbuhan Streptomyces sp.
independen. yang dipilih dilakukan pada berbagai tingkat pH
dan suhu. Temuan saat ini mengungkapkan
Analisis varians (ANOVA) digunakan untuk bahwa isolat ini mampu tumbuh dengan baik
memverifikasi model yang dirancang. antara 22 dan 37 C dan pada pH berkisar antara
Signifikansi model yang dirancang ditentukan 6,5 hingga 8,0. Pertumbuhan maksimum
menggunakan uji-F dan nilai-p < 0,05 dianggap diperoleh pada 28 C dan pH 7,2. Isolat ini positif
sebagai model CCD yang dirancang signifikan. untuk tes kitinase, katalase dan oksidase,
Dalam percobaan ini, respons yang diprediksi hidrolisis pati, dan menunjukkan hasil negatif
divalidasi oleh eksperimen rangkap tiga. untuk tes indole dan positif untuk
3. Hasil dan diskusi Tabel 1
Parameter fisiko-kimia sampel tanah dikumpulkan dari tiga lokasi pengambilan
3.1. Antibiotik yang memproduksi actinomycete sampel yang berbeda di hutan mangrove Manakudy .
Gambar 1. Stasiun pengambilan sampel tanah hutan mangrove Manakudy. Sampel dikumpulkan dari ketiga stasiun ini di 10 tempat. Warna tanahnya hitam dan dikumpulkan
menggunakan spatula steril.
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 6
Klorida (mg/kg) 1.3 0.93 1.42 3.2. Residu dan antibiotik agroindustri
Kalsium (mg/kg) 1.6 0.91 2.2
Ara. 3a. Aktivitas antibakteri Streptomyces sp. SD1 terhadap B. subtilis MTCC 441.
Strain ini dikultur dalam media sekam gram hijau yang mengandung berbagai
sumber karbon dalam SSF dan aktivitas antibakteri diuji (ST – Pati; MA – Maltosa; GL
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 7
– Glukosa; XY – Xylose dan SU – Sukrosa). Sekitar 20 ml sampel dimuat dan zona penghambatan diukur.
Ara. 2b. Efek residu agroindustri untuk produksi antibiotik. Streptomyces sp. SD1 ditanam pada limbah ini dan aktivitas antibiotik diuji.
Ara. 3b. Pengaruh sumber karbon (1%) terhadap produksi antibiotik dari sekam gram hijau dengan menggunakan Streptomyces sp. SD1 pada SSF.
3.3. Skrining faktor nutrisi dengan pendekatan satu variabel pada satu
waktu
Ara. 5a. Aktivitas antibakteri Streptomyces sp. SD1 terhadap B. subtilis MTCC 441.
Strain ini dikultur dalam media sekam gram hijau yang mengandung berbagai
sumber ionik dalam SSF dan aktivitas antibakteri diuji. Ion divalen, Co2+, Ca2+, Mg2+,
Hg2+ dan Mn2+ digabungkan dengan media kultur. Sekitar 20 ml sampel dimuat dan
zona penghambatan diukur.
Tabel 2b desain
eksperimental.
Analisis varians untuk produksi antibiotik menggunakan komposit Sentral
Sumber Jumlah dari Df Berarti Nilai-F p-nilai
Kotak Lapangan
Desain komposit pusat untuk produksi antibiotik dalam fermentasi solid state menggunakan Streptomyces sp. SD1.
Ara. 5b. Pengaruh sumber ionik (1%) untuk produksi antibiotik dari sekam gram hijau dengan menggunakan Streptomyces sp. SD1 dalam SSF.
Ara. 5c. Aktivitas antibakteri Streptomyces sp. SD1 terhadap B. subtilis MTCC 441. Strain ini dikultur dalam media sekam gram hijau yang mengandung berbagai sumber mineral
(Na2H – disodium hidrogen fosfat; K2H – dipotassium hidrogen fosfat; KH2P – kalium dihidrogen fosfat; NaH – natrium dihidrogen fosfat; C – kontrol). Sekitar 20 ml sampel
dimuat dan zona penghambatan diukur.
media kulit gram hijau dilengkapi dengan ion dan mineral divalen, secara individual untuk mengevaluasi
efek stimulasi pada produksi antibiotik. Efek suplementasi berbagai ion divalen pada konsentrasi 0,1%
(b/b) diuji dan zona
Ara. 5d. Pengaruh mineral (1%) untuk produksi antibiotik menggunakan sekam gram hijau oleh Streptomyces sp. SD1 pada SSF.
Gambar 6. a–c. Plot permukaan respons yang menjelaskan efek individu dan interaktif dari faktor-faktor pada aktivitas antimikroba Streptomyces sp. SD1.
kue minyak kacang (Vastrad dan Neelagund, 2014). Juga, natrium nitrat dan amonium klorida secara
positif dipengaruhi pada produksi neomisin, namun, sumber karbon, glukosa, sukrosa, maltosa, pati,
besi sulfat menunjukkan dampak yang lebih kecil pada produksi neomisin. Dalam S. aureofaciens,
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 11
produksi tetrasiklin dipengaruhi secara kritis ketika 10% pati larut diperkaya dengan residu ubi jalar
(Yang dan Ling, 1989). Dalam Streptomyces rimosus, suplementasi 1% (b/b) CaCO 3, meningkatkan
produksi tracycline di SSF ketika tongkol jagung digunakan sebagai media padat (Yang dan Swei,
1996).
3.4. Desain komposit pusat dan metodologi permukaan respons
Faktor nutrisi yang dipilih meningkatkan produksi antibiotik dan hasilnya bervariasi dari 246 U/g
hingga 1459 U/g. Matriks yang dirancang dan respons CCD ditabulasikan (Tabel 2a). Fvalue dari
desain kuadrat yang dipasang adalah 167,79 menyiratkan model kuadrat yang dirancang signifikan
secara statistik. Dalam model yang dirancang ini semua faktor dan efek interaktif secara statistik
signifikan. Nilai R 2 yang diprediksi adalah 0,9663 dan nilai R2 yang disesuaikan adalah 0,987.
Kurangnya nilai fit adalah 0,3654 dan secara statistik tidak signifikan (Tabel 2b). Seperti yang
dijelaskan dalam hasil, RSM adalah alat utama untuk mengidentifikasi dan menentukan konsentrasi
nutrisi untuk produksi antibiotik. Grafik 3D menggambarkan interaksi antara Maltosa dan CaCl 2,
Maltosa dan NaH2PO4, Maltosa dan NaH2PO4. Ketiga grafik permukaan respons 3D menunjukkan
hasil maksimum antibiotik pada konsentrasi sumber nutrisi yang lebih tinggi (Gbr. 6a–c). Respons
yang diprediksi adalah 1468 U/g dan ini hampir mirip dengan nilai eksperimental (1473 U/g)
memvalidasi model yang dirancang. Dalam penelitian ini, produksi antibiotik meningkat 2,9 kali lipat
oleh Streptomyces sp. SD1 dalam media yang dioptimalkan daripada media yang tidak dioptimalkan.
Dalam beberapa tahun terakhir, RSM telah banyak digunakan untuk produksi berbagai antibiotik.
RSM digunakan untuk sintesis neomisin (Vastrad dan Neelagund, 2014), enzim fibrinolitik
(Vijayaraghavan et al., 2016) dan streptomisin (Saval et al., 1993).
4. Kesimpulan
Tiga puluh enam strain actinomycete yang berbeda secara morfologis diisolasi dari sedimen tanah
bakau. Di antara isolat, Streptomyces sp. SD1 menunjukkan aktivitas antimikroba yang tinggi
terhadap patogen bakteri Gram positif. Streptomyces sp. SD1 yang dipilih menggunakan sekam
gram hijau sebagai substrat murah untuk produksi antibiotik. Juga penambahan sumber karbon,
nitrogen dan ionik merangsang produksi antibiotik. RSM dioptimalkan sedang meningkatkan
produksi antibiotik 2,9 kali lipat.
Deklarasi Kepentingan bersaing
Para penulis menyatakan bahwa mereka tidak memiliki kepentingan keuangan yang bersaing atau
hubungan pribadi yang dapat tampaknya mempengaruhi pekerjaan yang dilaporkan dalam makalah
ini.
Pengakuan
Para penulis menyampaikan apresiasinya kepada The Researchers Supporting Project Number (RSP-
2019/116) King Saud University, Riyadh, Arab Saudi.
Referensi Gumila, C., Ancelin, M.L., Delort, A.M., Jeminet, G., Vialj, H., 1997. Karakterisasi
aktivitas in vitro yang ampuh dan antimalaria in vivo dari senyawa
ionofor.
Antimikrob. Agen Kemoterapi. 41, 523–529.
Al-Dhabi, N.A., Duraipandiyan, V., Arasu, M.V., Ponmurugan, K., Ignacimuthu, S.,
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 12
Hamers, R.L., Kityo, C., Lange, J.M.A., Rinke-deWit, T.F., Mugyenyi, P., 2012.
Global 2014. Metabolit antijamur dari spons terkait Streptomyces sp laut. ancaman dari HIV resisten obat di Afrika sub Sahara. Med Inggris. J. J. 344, e4159.
strain (ERIMA-01). J. Murni Appl. Microbiol. 8 (2), 115–128.
Hayakawa, M., Nonomura, H., 1987. Agar-agar asam-vitamin humat,
media baru untuk
Al-Dhabi, N.A., Esmail, G.A., Duraipandiyan, V., Valan Arasu, M., Salem-Bekhit, M.M., isolasi selektif aktinomiceta tanah. J. Ferment. Technol. 65 (5), 501– 2016. Isolasi,
identifikasi, dan skrining termofilik antimikroba
509.
Streptomyces sp. Al-Dhabi-1 terisolasi dari pemandian air panas Tharban, Arab Saudi.
Kirk, S., Avogmpme-Rossa, C.A., Bushell, M.E., 2000. Pertumbuhan
membatasi substrat Extremophiles 20, 79–90. mempengaruhi produksi antibiotik dan cerobong metabolisme terkait di Streptomyces
Al-Dhabi, N.A., Esmail, G.A., Ghilan, A.K.M., Arasu, M.V., Duraipandiyan, V. , clavuligerus. Bioteknologi. Lett. 22, 1803–1809.
Ponmurugan, K., 2020. Optimalisasi karakterisasi dan fermentasi
Liu, D., Lin, H., Proksch, P., Tang, X., Shao, Z., Lin, W., 2015. Mikrobakteri A
dan B,
protease alkali stabil termo baru dari Streptomyces sp. Al-Dhabi-82 dari peptaibol baru dari laut dalam actinomycete Microbacterium sediminis sp.
lingkungan Arab Saudi untuk aplikasi ramah lingkungan dan industri. J. november. YLB-01(T). Org. Lett. 17, 1220–1223.
Raja Saud Univ. – Sci. 32 (1), 1258–1264.
Madigan,M.T.,Martiko,J.M., Parker,J ., 1997. Antibiotik:
isolasi dan
Al-Dhabi, N.A., Ghilan, A.K.M., Esmail, G.A., Arasu, M.V., Duraipandiyan, V., karakterisasi, dalam Brock Biology of Microorganisms, 8th Edn., ed M. T.
Ponmurugan, K., 2019. Penilaian bioaktivitas Laut Arab Saudi
Madigan (New Jersey: Prentice-Hall International Inc., 440–442.
Streptomyces sp. Al-Dhabi-90, profiling metabolik dan penghambatan in vitro-nya
Mahalaxmi, Y., Sathish, T., Subba Rao, C.H., Prakasham, R.S., 2010. Kulit
jagung sebagai
properti terhadap substrat novel beta-laktamase yang tahan multidrug dan spektrum luas untuk produksi rifamycin B oleh Amycolatopsis sp yang terisolasi.
patogen bakteri klinis, J. Infeksi Kesehatan Masyarakat 549–556.
RSP 3 di bawah SSF. Proses Biokimia 45, 47–53.
Al-Dhabi, N.A., Ghilan, A.-K.M., Arasu, M.V., 2018b. Karakterisasi perak
Manivasagan,P ., Venkatesan,J ., Sivakumar,K ., Kim,S.K .,
2013. Marine
nanomaterial yang berasal dari Streptomyces sp laut. Al-Dhabi-87 dan metabolit aktininobacterialnya: status saat ini dan perspektif masa depan. Mikrobiol.
aplikasi in vitro terhadap beta multidrug resistant dan extended-spectrum-
Tidak ada. 168, 311–332.
laktamase. Clin. Patogen. Nanomater. 8 (5).
Maxwell, P.W., Chen, G., Webster, J.M., Dunphy, G.B., 1994. Stabilitas dan
kegiatan
Al-Dhabi, N.A., Ghilan, A.K.M., Arasu, M.V., Duraipandiyan, V., 2018a. Green antibiotik yang diproduksi selama infeksi serangga Galleria mellonella oleh dua
biosintesis nanopartikel perak yang dihasilkan dari Streptomyces sp laut. isolat Xenorhabdus nematophilus. Mikrobiol. 60, 715–721.
Al-Dhabi-89 dan aplikasi potensial mereka terhadap infeksi luka dan obat-obatan
Pandey, A., 1991. Pengaruh ukuran partikel substrat terhadap produksi
enzim padatan-
patogen klinis resisten. J. Photochem. Fotobiol., B 189, 176–184. fermentasi negara. Bioresour( dalam bahasa Inggris). Teknol. 37, 169–172.
Al-Dhabi, N.A., Esmail, G.A., Duraipandiyan, V., Valan Arasu, M., 2019a. Kimia
Rajkumaria, J., Magdalane, M., Siddhardh, B., Madhavan, J., Ramalingam,
G., Al-
Saval, S., Pablos, L., Sanchez, S., 1993. Optimalisasi media kultur untuk
wilayah laut Arab untuk sifat antimikroba dan antioksidan. J. J. produksi streptomisin menggunakan metodologi response-surface. Bioresour( dalam bahasa Inggris).
Fotokimia. Fotobiol., B: Biol. 197, 111529.
2017. J., 2013a. Bioaktivitas antifeedan, larvicidal dan penghambatan pertumbuhan novel
Strategi untuk optimasi media fermentasi : tinjauan mendalam.
Depan.
poliketida metabolitdiisolasi dari m Streptomices sp.AP-123 lagit
Mikrobiol. 7, 2087.
Helicoverpa armigera dan Spodoptera litura. BMC Mikrobiol. 13 (1), 105.
Taechowisan, T., Chanaphat, S., Ruensamran, W., Phutdhawong, W.S.,
2013. Arasu, M.V., Duraipandiyan, V., Ignacimuthu, S., 2013b. Antibakteri dan antijamur
padat Photochem. Fotobiol., B 190, 154–162. Fermentasi. Bioteknologi. Res. Int., 11 ID Artikel 674286.
Arokiyaraj,S ., Saravanan,M ., Badathala,V ., 2015. Sintesis hijausilve r
Vijayaraghavan,P ., Prakash Vincent,S.G ., 2014. Optimalisasi
statistik
nanopartikel menggunakan ekstrak berair Taraxacum officinale dan itus produksi enzim fibrinolitik oleh Pseudoalteromonas sp. IND11 menggunakan sapi
aktivitas antimikroba. India Selatan J. Bio. Sci. 2, 115–118. substrat kotoran dengan metodologi permukaan respons. SpringerPlus, 2014, 3, 60.
Asagbra, A., Sanni, A., Oyewole, O., 2005. Produksi fermentasi solid-state
Vijayaraghavan, P., Vincent, S.G.P., 2012. Kotoran sapi sebagai novel,
murah
tetrasiklin by Streptomices strain menggunakan beberapa limbah pertanian substrat s untuk produksi protease alkali yang toleran terhadap halo by
Substrat. Dunia J. Microbiol. Bioteknologi. 21, 107–114.
Halomonas sp. PV1 untuk aplikasi ramah lingkungan. Biokimia. Eng. J.
69, 57–60.
Azman, A.S., Othman, I., Velu, S.S., Cha, K.G., Lee, L.H., 2015. Mangrove langka
Vijayaraghavan, P., Arun, A., Vincent, S.G.P., Arasu, M.V., Al-Dhabi, N.A.,
2016. Sapi
actinobacteria: taksonomi, senyawa alami, dan penemuan bioaktivitas. kotoran adalah bahan baku baru untuk produksi enzim fibrinolitik dari Front baru. Mikrobiol. 6. 856.
terisolasi Bacillus sp. IND7 dan penerapannya dalam lisis gumpalan In Vitro. Depan.
Balachandran, C., Duraipandiyan, V., Emi, N., Ignacimuthu, S., 2015. Antimikroba
Mikrobiol. 7. 361.
dan sifat sitotoksik dari Streptomyces sp. (ERINLG-51) terisolasi dari m
Wu, R.Y., 1984. Studi tentang Streptomyces SC4. II Taksonomi dan biologis
Ghats Barat Selatan. India Selatan J. Biol. Sci. 1, 7–14. karakteristik Streptomyces strain SC4. Bot. Sapi. Acad. Sin. 25, 111–123.
Bruntner, C., Binder, T., Pathom-aree, W., Goodfellow, M., Banteng, A.T., Potterat, O.,
Yang, S.S., Ling, M.Y., 1989. Produksi tetrasiklin dengan residu ubi jalar oleh
dkk., 2005. Frigocyclinone, antibiotik angucyclinone baru yang diproduksi oleh fermentasi solid-state. Bioteknologi. Bioeng. 33, 1021–1028.
Streptomyces griseus strain dari Antartika J. Antibiot. 58, 346–349.
Yang, S.S., Swei, WJ, 1996. Kondisi budaya dan produksi oxytetracycline
oleh Crawford, D.L., Lynch, J.M., Whipps, J.M., Ousley, M.A., 1993. Isolasi and
Streptomyces rimosus dalam keadaan padat fermentasi tongkol
jagung. Dunia J. Microbiol.
M. Kalaiyarasi dkk. / Jurnal Universitas King Saud – Sains 32 (2020) 2134–2141 14
karakterisasi antagonis actinomycete dari patogen akar jamur. Appl( dalam bahasa Inggris).
Bioteknologi. 12, 43–46.
Kira-kira. Mikrobiol 59 (11), 3899–3905.
Yu, X., Doroghazi, J.R., Janga, S.C., dkk., 2013. Keberagaman dan
kelimpahan
Elibol, M., 2004. Optimalisasi komposisi sedang untuk produksi aktinorhodin gen biosintesis fosfatat di alam.
oleh Streptomyces coelicolor A3(2) dengan metodologi permukaan respons. Proses
20759–20764.
Biokimia 39, 1057–1062.
Zhang, HJ, Zhang, H., Wang, L., Guo, X.N., 2012. Persiapan dan fungsional
El-Naggar, Moustafa, Y., El-Assar, S.A., Abdul-Gawad, S.A., 2009. Sifat solid-state protein dedak padi dari dedak padi defatted yang distabilkan dengan panas. Makanan
fermentasi untuk produksi meroparamycin oleh Streptomyces sp. strain
Res. Int. 47,
359–363. MARET01. J. Mikrobiol. Bioteknologi 19, 468–473.