Kerugian:
1. Rancangan dan pelaksanaannya kompleks sehingga mahal.
2. Representativenessnya kurang karena subjek yang secara sukarela masuk ke dalam
penelitian mungkin berbeda dengan populasi ke mana penelitian ditujukan.
3. RCT dihadapkan pada masalah etika.
4. Tidak jarang penelitian memerlukan waktu yang cukup lama untuk memperoleh hasil
yang diharapkan.
5. Membutuhkan sumber daya yang sedang berlangsung yang sangat besar