Berkat penelitian yang dilakukan oleh laboratorium Thomas Hunt Morgan selama dekade pertama abad
kedua puluh, kita mengetahui lebih banyak tentang genetika Drosophila dibandingkan organisme multiseluler
lainnya. Alasannya berkaitan dengan lalat dan orang yang pertama kali mempelajarinya. Drosophila mudah
berkembang biak, kuat, produktif, toleran terhadap beragam kondisi, dan kromosom sopan pada larvanya mudah
diidentifikasi (lihat Bab 4). Teknik pembiakan dan identifikasi mutan mudah dipelajari. Apalagi kemajuan Drosophila
genetika dibantu oleh akses yang relatif bebas dari setiap ilmuwan terhadap mutan dan teknik dari setiap peneliti
lainnya. Mutan dianggap milik seluruh komunitas ilmiah, dan laboratorium Morgan membuat database dan jaringan
pertukaran sehingga siapa pun dapat memperolehnya.
Mahasiswa sarjana (dimulai dengan Calvin Bridges dan Alfred Sturtevant) memainkan peran penting
dalam penelitian Drosophila , yang mencapai popularitas aslinya sebagai sumber proyek penelitian sarjana.
Sebagaimana dicatat oleh sejarawan Robert Kohler (1994), "Jurusan biologi miskin akan uang namun kaya akan
satu sumber daya: tenaga kerja mahasiswa yang murah, bersemangat, dan terbarukan." Program genetika
Drosophila "dirancang oleh generasi muda untuk menjadi permainan anak muda", dan para siswa menetapkan
aturan untuk penelitian Drosophila : "Tidak ada rahasia dagang, tidak ada monopoli, tidak ada perburuan liar, tidak ada penyergapan."
Namun Drosophila adalah organisme yang sulit dipelajari embriologinya. Meskipun Jack Schultz dan yang
lainnya berusaha menghubungkan genetika Drosophila dengan perkembangannya, embrio lalat terbukti terlalu
rumit dan sulit dipelajari, tidak cukup besar untuk dimanipulasi secara eksperimental dan tidak cukup transparan
untuk diamati. Baru setelah teknik biologi molekuler memungkinkan para peneliti untuk mengidentifikasi dan
memanipulasi gen dan RNA serangga, genetikanya dapat dikaitkan dengan perkembangannya. Dan ketika hal itu
terjadi, terjadilah revolusi di bidang biologi. Penggabungan pengetahuan kita tentang aspek molekuler genetika
Drosophila dengan pengetahuan kita tentang perkembangannya membangun fondasi yang menjadi dasar ilmu
genetika perkembangan dan biologi perkembangan evolusioner saat ini.
Pada bab terakhir, kita membahas spesifikasi sel embrio awal melalui perolehan berbagai determinan
sitoplasma yang telah disimpan dalam oosit. Membran sel membentuk wilayah sitoplasma yang dimasukkan ke
dalam setiap blastomer baru, dan diperkirakan bahwa faktor penentu morfogenetik kemudian mengarahkan
ekspresi gen diferensial dalam blastomer tersebut. Namun, selama perkembangan Drosophila , membran sel baru
terbentuk setelah pembelahan inti ketigabelas. Sebelumnya, semua inti mempunyai sitoplasma yang sama,
Machine Translated by Google
dan materi dapat berdifusi ke seluruh embrio. Pada embrio ini, spesifikasi tipe sel sepanjang sumbu
anterior-posterior dan dorsal-ventral dicapai melalui interaksi bahan sitoplasma dalam sel tunggal berinti
banyak. Selain itu, permulaan perbedaan anterior-posterior dan dorsal-ventral dikendalikan oleh posisi sel
telur di dalam ovarium ibu. Meskipun tempat masuknya sperma dapat menentukan sumbu pada ascidia
dan nematoda, sumbu anterior-posterior dan dorsal-ventral lalat ditentukan oleh interaksi antara sel telur
dan sel-sel folikel di sekitarnya.
Pembelahan
Sebagian besar telur serangga mengalami pembelahan superfisial, dimana sejumlah besar
kuning telur yang terletak di tengah membatasi pembelahan pada tepi sitoplasma telur. Salah satu ciri
menarik dari tipe pembelahan ini adalah bahwa sel tidak terbentuk sampai inti selnya membelah.
Pembelahan telur Drosophila ditunjukkan pada Gambar 9.1. Inti zigot mengalami beberapa pembelahan
mitosis di bagian tengah sel telur. Di Drosophila, 256 inti dihasilkan oleh serangkaian delapan divisi nuklir
yang masing-masing berdurasi rata-rata 8 menit. Inti kemudian bermigrasi ke pinggiran sel telur, tempat
mitosis berlanjut, meskipun dengan
kecepatan yang semakin lambat.
Selama siklus pembelahan
kesembilan, sekitar lima inti
mencapai permukaan kutub posterior
embrio. Inti ini tertutup oleh membran
sel dan menghasilkan sel kutub
yang menghasilkan gamet dewasa.
Selama tahap pembelahan inti ini, embrio disebut blastoderm syncytial, artinya semua inti
pembelahan terkandung dalam sitoplasma yang sama. Tidak ada membran sel selain sel telur itu sendiri.
Meskipun inti membelah dalam sitoplasma yang sama, hal ini tidak berarti bahwa sitoplasma itu
sendiri seragam. Karr dan Alberts (1986) telah menunjukkan bahwa setiap nukleus dalam blastoderm
syncytial terkandung dalam wilayah kecil protein sitoskeletalnya. Ketika inti mencapai pinggiran sel telur
selama siklus pembelahan kesepuluh, setiap inti dikelilingi oleh mikrotubulus dan mikrofilamen. Inti dan
pulau-pulau sitoplasma yang terkait disebut energid. Gambar 9.2 menunjukkan inti dan domain
mikrofilamen dan mikrotubulus esensialnya dalam profase pembelahan mitosis kedua belas.
Machine Translated by Google
Setelah siklus 13, membran plasma oosit terlipat ke dalam di antara inti, yang akhirnya memisahkan
setiap inti somatik menjadi satu sel (Gambar 9.3). Proses ini menciptakan blastoderm seluler, yang seluruh
selnya tersusun dalam satu lapisan di sekitar inti kuning telur (Turner dan Mahowald 1977; Foe dan Alberts
1983). Seperti pembentukan sel lainnya, pembentukan blastoderm seluler melibatkan interaksi yang rumit antara
mikrotubulus dan mikrofilamen. Fase pertama selulerisasi blastoderm ditandai dengan invaginasi membran sel
dan jaringan mikrofilamen aktin yang mendasarinya ke dalam daerah antar inti untuk membentuk saluran alur.
Transisi midblastula
Transkripsi dari inti (yang dimulai sekitar siklus kesebelas) sangat ditingkatkan pada
tahap ini. Perlambatan pembelahan inti dan peningkatan transkripsi RNA yang terjadi secara
bersamaan sering disebut sebagai transisi midblastula (lihat Bab 8). Transisi seperti itu juga
terlihat pada embrio berbagai filum vertebrata dan invertebrata. Pengendalian perlambatan
mitosis ini (pada embrio Xenopus, bulu babi, bintang laut, dan Drosophila ) tampaknya dipengaruhi
oleh rasio kromatin terhadap sitoplasma (Newport dan Kirschner 1982; Edgar et al. 1986a). Edgar
dan rekan-rekannya membandingkan perkembangan awal Drosophila tipe liar
embrio dengan mutan haploid. Embrio Drosophila haploid ini memiliki setengah jumlah kromatin
tipe liar pada setiap pembelahan sel. Oleh karena itu, embrio haploid pada siklus sel kedelapan
memiliki jumlah kromatin yang sama dengan embrio tipe liar pada siklus sel 7. Para peneliti
menemukan bahwa embrio tipe liar membentuk blastoderm seluler segera setelah pembelahan
ketigabelas, sedangkan embrio haploid mengalami pembelahan sel kedelapan belas. divisi
ekstra, keempat belas, sebelum selularisasi. Selain itu, panjang siklus 11 14 pada embrio tipe liar
berhubungan dengan siklus 12 15 pada embrio haploid. Jadi, embrio haploid mengikuti pola yang
mirip dengan embrio tipe liar, hanya saja mereka tertinggal satu pembelahan sel.
Gastrulasi
Jadi, pada akhir pembentukan pita germinal, sel-sel yang ditakdirkan untuk membentuk struktur
larva paling posterior terletak tepat di belakang daerah kepala di masa depan. Pada saat ini, segmen
tubuh mulai muncul, membagi ektoderm dan mesoderm. Pita germinal kemudian ditarik kembali,
menempatkan dugaan segmen posterior ke dalam ujung posterior embrio (Gambar 9.5E).
Bentuk tubuh umum Drosophila adalah sama pada embrio, larva, dan dewasa, masing-
masing mempunyai ujung kepala dan ujung ekor yang berbeda, di antaranya terdapat unit segmental
yang berulang (Gambar 9.7). Tiga segmen ini membentuk dada, sedangkan delapan segmen lainnya
membentuk perut. Setiap segmen lalat dewasa mempunyai identitas tersendiri. Segmen toraks
pertama, misalnya, hanya mempunyai kaki; segmen toraks kedua memiliki kaki dan sayap; dan
segmen toraks ketiga mempunyai kaki dan halter (penyeimbang). Segmen toraks dan perut juga
dapat dibedakan satu sama lain melalui
perbedaan kutikula. Bagaimana pola ini muncul?
Sumbu anterior-posterior dan dorsal-ventral Drosophila terbentuk tegak lurus satu sama
lain, dan keduanya ditentukan oleh posisi oosit di dalam sel folikel ovarium. Sisa bab ini dibagi
menjadi tiga bagian utama. Bagian pertama membahas bagaimana sumbu anterior-posterior
ditentukan dan bagaimana sumbu tersebut menentukan identitas setiap segmen. Bagian kedua
membahas bagaimana sumbu dorsal-ventral ditentukan oleh interaksi antara oosit dan sel-sel folikel
di sekitarnya. Bagian ketiga membahas bagaimana jaringan embrio dispesifikasikan menjadi organ
tertentu melalui penempatannya di sepanjang dua sumbu ini.
Machine Translated by Google
*Cakram imajinasi adalah sel-sel yang disisihkan untuk menghasilkan struktur dewasa. Detil diferensiasi cakram imajinal akan
dibahas pada Bab 18. Untuk informasi lebih lanjut mengenai anatomi perkembangan Drosophila , lihat Bate dan Martinez-
Arias 1993; Tyler dan Schetzer 1996; dan Schwalm 1997.
Pada akhir tahun 1980-an, hipotesis gradien disatukan dengan pendekatan genetik untuk
mempelajari embriogenesis Drosophila . Jika ada gradien, morfogen apa yang konsentrasinya
berubah dalam ruang? Gen apa yang membentuk gradien ini? Dan apakah morfogen ini bertindak
dengan mengaktifkan atau menghambat gen tertentu di wilayah tempat mereka berada
Machine Translated by Google
pekat? Christiane Nüsslein-Volhard memimpin program penelitian yang menjawab pertanyaan-pertanyaan ini.
Para peneliti menemukan bahwa satu set gen mengkode morfogen gradien untuk bagian anterior embrio, set
gen lain mengkode morfogen yang bertanggung jawab untuk mengatur wilayah posterior embrio, dan set gen
ketiga mengkode protein yang menghasilkan wilayah terminal di kedua ujung embrio (Gambar 9.10; Tabel
9.1). Karya ini menghasilkan Hadiah Nobel untuk Nüsslein-Volhard dan rekannya, Eric Wieschaus, pada
tahun 1995.
Tabel 9.1. Gen efek ibu yang mempengaruhi polaritas anterior-posterior Drosophila
embrio
Bikoid
AnteriroGroup (bcd) Kepala dan dada dihilangkan, diganti dengan Morfogen anterior bertingkat; berisi homeodomain; telson terbalik
menekan ekor
PosteriroGroup
oskar (osk) Tidak ada perut, tidak ada sel kutub Lokalisasi Nano
vasa (vas) Tidak ada perut, tidak ada sel kutub; oogenesis Lokalisasi Nano rusak
valois (val) Tidak ada perut, tidak ada sel kutub; Stabilisasi selularisasi kompleks lokalisasi Nanos rusak
pumilio (pum) Tidak ada perut Membantu protein Nanos mengikat pesan si bungkuk
TerminalGroup (tor) batang (trk) fs(1)Nasrat[fs(1)N] Tanpa Mengirimkan sinyal Torsolike ke Torso
terminal; telur roboh fs(1)lubang tiang[fs(1)ph] Tidak ada ujung; telur yang robohMengirimkan sinyal Torsolike ke Torso
Sumbu anterior-posterior embrio Drosophila tampaknya sudah terpola bahkan sebelum inti mulai
berfungsi. Sel perawat ovarium menyimpan mRNA dalam oosit yang sedang berkembang, dan mRNA ini
didistribusikan ke berbagai wilayah sel. Secara khusus, empat RNA pembawa pesan ibu sangat penting untuk
pembentukan sumbu anterior-posterior:
mRNA bicoid dan bungkuk , yang produk proteinnya sangat penting untuk pembentukan kepala dan dada
nanos dan mRNA ekor , yang produk proteinnya sangat penting untuk pembentukan
segmen perut
MRNA bikoid terletak di bagian anterior sel telur yang tidak dibuahi, dan terikat pada mikrotubulus
anterior . Pesan nano terikat pada sitoskeleton di
Machine Translated by Google
daerah posterior sel telur yang tidak dibuahi. mRNA bungkuk dan ekor didistribusikan ke
seluruh oosit. Setelah pembuahan, mRNA ini dapat diterjemahkan menjadi protein. Pada
kutub anterior, RNA bikoid diterjemahkan menjadi protein Bikoid, yang membentuk gradien
tertinggi di anterior. Di kutub posterior, pesan nanos diterjemahkan menjadi protein Nanos,
yang membentuk gradien tertinggi di posterior. Protein bicoid menghambat translasi ekor
RNA, memungkinkan protein Caudal disintesis hanya di bagian posterior sel. Sebaliknya,
protein Nanos, bersama dengan protein Pumilio, berikatan dengan RNA si bungkuk ,
mencegah translasinya di bagian posterior embrio. Bicoid juga meningkatkan kadar protein
Bungkuk di anterior embrio dengan mengikat peningkat gen Bungkuk dan menstimulasi
transkripsinya. Hasil dari interaksi ini adalah terciptanya empat gradien protein pada embrio
awal (Gambar 9.11):
Machine Translated by Google
Protein Bicoid, Hunchback, dan Caudal adalah faktor transkripsi yang konsentrasi relatifnya
dapat mengaktifkan atau menekan gen zigotik tertentu. Tahapan sekarang telah ditetapkan untuk
aktivasi gen zigotik dalam inti yang sibuk membelah ketika gradien ini ditetapkan.
Tampaknya embrio-embrio ini kekurangan zat apa pun yang diperlukan untuk pembentukan
struktur anterior. Selain itu, orang dapat berhipotesis bahwa zat yang tidak dimiliki oleh mutan-mutan
ini adalah zat yang dipostulatkan oleh Sander dan Kalthoff untuk mengaktifkan gen untuk struktur
anterior dan mematikan gen untuk struktur telson (bandingkan Gambar 9.9 dan 9.12 ).
Machine Translated by Google
RNA bikoid terlokalisasi secara ketat di bagian anterior oosit (Gambar 9.13B), di mana sitoskeleton
anterior mengaitkannya melalui wilayah 3´ pesan yang belum diterjemahkan (Ferrandon et al .
1997; Macdonald dan Kerr 1998). MRNA ini tidak aktif sampai pembuahan, pada saat itu ia menerima
ekor poliadenilat yang lebih panjang dan dapat diterjemahkan. Driever dan Nüsslein-Volhard (1988b)
telah menunjukkan bahwa ketika protein Bicoid diterjemahkan dari RNA ini selama pembelahan awal,
ia membentuk gradien, dengan konsentrasi tertinggi di bagian anterior sel telur dan terendah di
sepertiga bagian belakang sel telur. Selain itu, protein ini segera terkonsentrasi pada inti embrio di
bagian anterior embrio (Gambar 9.13CD; lihat juga Gambar 5.35).
Bukti lebih lanjut bahwa protein Bicoid adalah morfogen anterior berasal dari eksperimen
yang mengubah kecuraman gradien. Dua gen, exuperantia dan walet, bertanggung jawab menjaga
pesan bikoid di kutub anterior sel telur. Jika mereka tidak ada, bicoid
pesan berdifusi lebih jauh ke bagian posterior telur, dan gradien protein Bicoid tidak terlalu curam
(Driever dan Nüsslein-Volhard 1988a). Fenotipe yang dihasilkan oleh kedua mutan ini mirip dengan
embrio yang kekurangan bikoid, tetapi tidak terlalu parah. Embrio ini tidak memiliki struktur paling
anterior dan memiliki mulut dan daerah dada yang memanjang. Jadi, dengan mengubah gradien
protein Bicoid, nasib daerah embrio juga akan berubah.
Machine Translated by Google
Konfirmasi bahwa protein Bicoid sangat penting untuk memulai pembentukan kepala dan dada
berasal dari percobaan di mana RNA bicoid yang dimurnikan disuntikkan ke dalam embrio pembelahan
awal (Gambar 9.14; Driever et al. 1990). Ketika disuntikkan ke bagian anterior embrio yang kekurangan
bikoid (yang ibunya tidak memiliki gen bikoid ), RNA bikoid menyelamatkan embrio dan menyebabkan
embrio memiliki polaritas anterior-posterior yang normal. Apalagi setiap lokasi di embrio tempat bikoid
pesan disuntikkan menjadi kepala. Jika RNA bikoid disuntikkan ke bagian tengah embrio, wilayah
tengah tersebut menjadi kepala, dan wilayah di kedua sisinya menjadi struktur dada.
Jika sejumlah besar RNA bikoid disuntikkan ke ujung posterior embrio tipe liar (dengan pesan bikoid
endogennya sendiri di kutub anteriornya), dua kepala akan muncul, satu di kedua ujungnya.
Kedua, protein Bicoid berfungsi sebagai faktor transkripsi. Protein bicoid memasuki inti embrio
pembelahan awal, di mana ia mengaktifkan gen si bungkuk . Transkripsi si bungkuk hanya terlihat di
bagian anterior embrio, wilayah di mana protein Bicoid ditemukan. Mutan yang kekurangan protein ibu
dan zigotik Bungkuk tidak memiliki bagian mulut dan struktur dada. Pada akhir tahun 1980an, dua
laboratorium secara independen menunjukkan bahwa protein Bicoid berikatan dan mengaktifkan gen
si bungkuk (Driever dan Nüsslein-Volhard 1989; Struhl et al.
1989). Protein Bungkuk yang berasal dari sintesis mRNA si Bungkuk baru bergabung dengan protein
Bungkuk yang disintesis melalui penerjemahan pesan ibu di bagian anterior embrio. Protein si Bungkuk,
yang juga merupakan faktor transkripsi, menekan gen spesifik perut, sehingga memungkinkan wilayah
ekspresi si bungkuk membentuk kepala dan dada.
Machine Translated by Google
Protein Bongkok juga bekerja dengan Bicoid dalam menghasilkan pola anterior embrio. Berdasarkan
dua bukti, Driever dan rekan kerja (1989) memperkirakan bahwa setidaknya satu gen anterior selain si
bungkuk harus diaktivasi oleh Bicoid. Pertama, penghapusan si bungkuk hanya menghasilkan beberapa
cacat yang terlihat pada fenotip mutan bikoid. Kedua, seperti yang kita lihat dalam percobaan menelan dan
exuperantia , hanya protein Bicoid tingkat sedang yang diperlukan untuk mengaktifkan pembentukan dada
(yaitu, ekspresi gen bungkuk ), namun pembentukan kepala memerlukan konsentrasi yang lebih tinggi.
Driever dan rekan kerja (1989) memperkirakan bahwa promotor gen celah spesifik kepala tersebut akan
memiliki situs pengikatan afinitas rendah untuk protein Bicoid. Gen ini akan diaktifkan hanya pada
konsentrasi protein Bicoid yang sangat tinggi, yaitu di dekat ujung anterior embrio. Sejak itu, tiga gen celah
kepala telah ditemukan yang bergantung pada konsentrasi protein Bicoid yang sangat tinggi untuk
ekspresinya (Cohen dan Jürgens 1990; Finkelstein dan Perrimon 1990; Grossniklaus et al. 1994). Kepala
kancing, spirakel kosong,
dan gen ortodentikel diperlukan untuk menentukan daerah kepala yang semakin anterior. Selain
membutuhkan tingkat Bicoid yang tinggi untuk aktivasi, gen-gen ini juga memerlukan keberadaan protein
Hunchback untuk ditranskripsi (Simpson-Brose et al. 1994; Reinitz et al. 1995). Protein Bicoid dan Bongkok
bertindak secara sinergis pada peningkat "gen kepala" ini untuk mendorong transkripsinya.
Pusat pengorganisasian posterior ditentukan oleh aktivitas gen nanos (Lehmann dan Nüsslein-
Volhard 1991; Wang dan Lehmann 1991; Wharton dan Struhl 1991). nano _
RNA diproduksi oleh sel perawat ovarium dan diangkut ke daerah posterior sel telur (yang paling jauh dari
sel perawat). Pesan nanos terikat pada sitoskeleton di daerah posterior sel telur melalui 3´ UTR dan
hubungannya dengan produk beberapa gen lain (oskar, valois, vasa, staufen, dan tudor).* Jika nanos atau
yang lainnya gen efek ibu ini tidak ada pada ibu, tidak ada bentuk perut embrio (Lehmann dan Nüsslein
Volhard 1986; Schüpbach dan Wieschaus 1986).
Selain morfogen anterior dan posterior, terdapat set ketiga gen ibu yang proteinnya
menghasilkan sumbu anterior-posterior yang ekstrem. Mutasi pada gen terminal ini mengakibatkan
hilangnya ekstremitas organisme yang tidak tersegmentasi: akron dan segmen kepala paling
anterior serta telson (ekor) dan segmen perut paling posterior (Degelmann dkk. 1986; Klingler
dkk. 1988) . Gen penting di sini tampaknya adalah batang tubuh, gen yang mengkode reseptor
tirosin kinase. Embrio ibu yang mengalami mutasi pada gen batang tubuh tidak memiliki akron
maupun telson, sehingga menunjukkan bahwa kedua ujung embrio terbentuk melalui jalur yang
sama. RNA batang tubuh disintesis oleh sel ovarium, disimpan dalam oosit, dan diterjemahkan
setelah pembuahan. Protein Torso transmembran tidak terbatas secara spasial pada ujung sel
telur, namun didistribusikan secara merata ke seluruh membran plasma (Casanova dan Struhl
1989). Memang benar, mutasi dominan pada batang tubuh, yang memberikan aktivitas konstitutif
pada reseptor, mengubah seluruh separuh anterior embrio menjadi akron dan seluruh separuh
posterior menjadi telson. Jadi, Torso biasanya harus diaktifkan hanya di ujung telur.
Kinase ini diperkirakan menonaktifkan inhibitor transkripsional gen celah tak berekor dan
gen Huckebein (Paroush dkk. 1997). Kedua gen ini kemudian menentukan ujung embrio.
Perbedaan antara ujung anterior dan posterior bergantung pada keberadaan Bicoid. Jika gen
terminal bertindak sendiri, daerah terminal berdiferensiasi menjadi telson. Namun, jika Bicoid
juga terdapat, wilayah tersebut akan membentuk akron (Pignoni dkk. 1992).
Oleh karena itu, sumbu anterior-posterior embrio ditentukan oleh tiga set gen: gen yang
menentukan pusat pengorganisasian anterior, gen yang menentukan pusat pengorganisasian
posterior, dan gen yang menentukan wilayah batas terminal. Pusat pengorganisasian anterior
terletak di ujung anterior embrio dan bertindak melalui gradien protein Bicoid yang berfungsi sebagai a
Machine Translated by Google
faktor transkripsi untuk mengaktifkan gen celah spesifik anterior dan sebagai penekan translasi
untuk menekan gen celah spesifik posterior. Pusat pengorganisasian posterior terletak di kutub
posterior dan bertindak secara translasi melalui protein Nanos untuk menghambat pembentukan
anterior dan secara transkripsi melalui protein Caudal untuk mengaktifkan gen-gen yang
membentuk perut. Batas-batas akron dan telson ditentukan oleh produk gen batang tubuh, yang
diaktifkan di ujung embrio. Aktivasi gen-gen yang bertanggung jawab untuk membangun bagian
posterior dilakukan oleh Caudal, suatu protein yang sintesisnya (seperti telah kita lihat di atas)
dihambat di bagian anterior embrio. Langkah pengembangan selanjutnya adalah menggunakan
gradien faktor transkripsi ini untuk mengaktifkan gen spesifik di sepanjang sumbu anterior-posterior.
Gen Segmentasi
Proses penentuan nasib sel pada Drosophila tampaknya memiliki dua langkah:
spesifikasi dan determinasi (Slack 1983). Pada awal perkembangannya, nasib sel bergantung
pada isyarat lingkungan, seperti yang diberikan oleh gradien protein yang disebutkan di atas.
Spesifikasi nasib sel ini bersifat fleksibel dan masih dapat diubah sebagai respons terhadap sinyal dari sel lain.
Akhirnya, sel-sel mengalami transisi dari komitmen yang longgar ini ke tekad yang tidak dapat diubah. Pada titik ini,
nasib sel menjadi intrinsik sel. Transisi dari spesifikasi ke determinasi pada Drosophila dimediasi oleh gen segmentasi.
Gen-gen ini membagi embrio awal menjadi serangkaian primordia segmental yang berulang di sepanjang sumbu
anterior-posterior. Mutasi pada gen segmentasi menyebabkan embrio kekurangan segmen atau bagian segmen
tertentu. Seringkali mutasi ini mempengaruhi parasegmen, bagian embrio yang dipisahkan oleh penebalan
mesodermal dan alur ektodermal. Gen segmentasi membagi embrio menjadi 14 parasegmen (Martinez-Arias dan
Lawrence 1985). Parasegmen embrio tidak menjadi segmen larva atau dewasa; melainkan mencakup bagian posterior
segmen anterior dan bagian anterior segmen di belakangnya (Gambar 9.18). Meskipun segmen adalah bagian
anatomi utama dari bentuk tubuh larva dan dewasa, segmen tersebut dibangun menurut aturan yang menggunakan
parasegmen sebagai unit dasar konstruksi.
Gen Krüppel , misalnya, diekspresikan terutama dalam parasegmen 4 6, di tengah embrio Drosophila
(Gambar 9.19A; 9.8B); tidak adanya protein Krüppel menyebabkan embrio kekurangan wilayah ini. Produk protein
dari gen gap berinteraksi dengan protein gen gap yang berdekatan untuk mengaktifkan transkripsi gen aturan
berpasangan.
Machine Translated by Google
Kesenjangan gen
Gen raksasa mempunyai dua metode untuk aktivasinya, satu untuk pita ekspresi anterior dan satu lagi
untuk pita ekspresi posterior (Rivera-Pomar 1995; Schulz dan Tautz 1995).
Machine Translated by Google
Setelah pembentukan pola-pola ini oleh gen efek ibu dan si Bungkuk, ekspresi masing-masing
gen kesenjangan menjadi stabil dan dipertahankan oleh interaksi antara produk gen kesenjangan yang
berbeda itu sendiri (Gambar 9.21B). Misalnya, ekspresi gen Krüppel diatur secara negatif pada batas
anteriornya oleh protein Hunchback dan Giant dan pada batas posteriornya oleh protein Knirps dan Tailless
(Jäckle dkk. 1986; Harding dan Levine 1988; Hoch dkk. 1992). Jika aktivitas si Bungkuk kurang, domain
ekspresi Krüppel meluas ke anterior. Jika aktivitas Knirps kurang, ekspresi gen Krüppel meluas lebih ke
posterior. Batasan antara wilayah transkripsi gen kesenjangan mungkin diciptakan oleh saling represi.
Sama seperti protein Raksasa dan Bungkuk yang dapat mengontrol batas anterior transkripsi Krüppel ,
demikian pula protein Krüppel dapat menentukan batas posterior transkripsi raksasa dan Bungkuk . Jika
embrio kekurangan gen Krüppel , transkripsi si bungkuk berlanjut ke area yang biasanya diberikan kepada
Krüppel (Jäckle dkk. 1986; Kraut dan Levine 1991). Penghambatan pembentuk batas ini diperkirakan
dimediasi langsung oleh produk gen gap, karena keempat gen gap utama (bungkuk, raksasa, Krüppel, dan
knirps) mengkode protein pengikat DNA yang dapat mengaktifkan atau menekan transkripsi gen gap
lainnya ( Knipple dkk. 1985; Gaul dan Jäckle 1990; Capovilla dkk. 1992).
(sel baru mulai terbentuk) mengekspresikan gen aturan berpasangan, kemudian pita inti lainnya tidak
mengekspresikannya, dan kemudian pita inti lainnya mengekspresikannya lagi. Hasilnya adalah pola "garis
zebra" di sepanjang sumbu anterior-posterior, yang membagi embrio menjadi 15 subunit (Hafen et al. 1984).
Delapan gen saat ini diketahui mampu membagi embrio awal dengan cara ini; mereka tercantum pada
Tabel 9.2. Penting untuk dicatat bahwa tidak semua inti mengekspresikan gen aturan berpasangan yang sama.
Faktanya, dalam setiap parasegmen, setiap baris inti memiliki konstelasi ekspresi gen aturan berpasangan
yang membedakannya dari baris lainnya.
Bagaimana beberapa inti embrio Drosophila diperintahkan untuk menyalin gen tertentu sementara
tetangganya diberitahu untuk tidak menyalinnya? Jawabannya tampaknya datang dari distribusi produk
protein dari gen kesenjangan. Meskipun RNA dari masing-masing gen celah memiliki distribusi yang sangat
berbeda yang menentukan wilayah ekspresi yang berdekatan atau sedikit tumpang tindih, produk protein
dari gen-gen ini meluas lebih luas.
Machine Translated by Google
Tabel 9.2. Gen utama yang mempengaruhi pola segmentasi pada Drosophila
Kategori Kategori
Gen kesenjangan Krüppel (Kr) Gen aturan berpasangan Fushi tarazu sekunder (ftz)
(hh)
gooseberry (gsb)
trenggiling (pan)
Faktanya, mereka tumpang tindih oleh setidaknya 8 · 10 inti (yang pada tahap ini mencakup sekitar
dua hingga tiga primordia segmen). Hal ini ditunjukkan secara mencolok oleh tanojevíc dan rekan kerjanya
(1989). Mereka memperbaiki blastoderm yang berselularisasi (yaitu tahap ketika sel-sel mulai terbentuk di tepi
embrio syncytial), mewarnai protein Hunchback dengan antibodi yang membawa pewarna merah, dan secara
bersamaan mewarnai protein Krüppel dengan antibodi yang membawa pewarna hijau. Daerah selularisasi
yang mengandung kedua protein mengikat kedua antibodi dan berwarna kuning cerah (lihat Gambar 9.8B).
Protein Krüppel tumpang tindih dengan protein Knirps dengan cara yang sama di daerah posterior embrio
(Pankratz et al. 1990).
Tiga gen diketahui sebagai gen aturan berpasangan utama. Gen-gen yang berbulu, bahkan dilewati,
dan kerdil ini penting untuk pembentukan pola periodik, dan gen-gen ini dikontrol langsung oleh protein gen
gap. Peningkat gen aturan berpasangan primer dikenali oleh protein gen celah, dan diperkirakan bahwa
perbedaan konsentrasi protein gen aturan pasangan menentukan apakah gen aturan berpasangan ditranskripsi
atau tidak. Peningkat gen aturan pasangan primer seringkali bersifat modular: kontrol atas setiap garis terletak
di wilayah DNA yang terpisah.
Salah satu peningkat yang paling banyak dipelajari adalah untuk gen yang dilewati genap .
Jejak kaki DNase I (lihat Bab 5) menunjukkan bahwa wilayah penambah untuk garis ini berisi enam situs
pengikatan untuk protein Krüppel, tiga untuk protein Hunchback, tiga untuk protein Giant, dan lima untuk protein
Bicoid. Demikian pula, garis genap yang dilewati 5 diatur secara negatif oleh protein Krüppel (pada batas anteriornya)
dan oleh protein Giant (pada batas posteriornya) (Small et al.
1996; Fujioka 1999).
Pentingnya bahan peningkat ini dapat ditunjukkan melalui cara genetik dan biokimia.
Pertama, mutasi pada penambah tertentu dapat menghapus garis tertentu dan tidak menghapus garis lainnya.
Kedua, jika gen reporter seperti lacZ (pengkode ÿ-galaktosidase) digabungkan dengan salah satu elemen penambah
ini, gen lacZ hanya diekspresikan pada garis tertentu (lihat Gambar 9.22; Fujioka dkk. 1999).
Ketiga, penempatan garis-garis tersebut dapat diubah dengan menghapus gen celah yang mengaturnya.
Dengan demikian, penempatan garis-garis ekspresi gen aturan berpasangan adalah hasil dari (1) elemen penambah
regulasi cis modular dari gen aturan berpasangan dan (2) protein gen celah trans-regulasi yang berikatan dengan
situs penambah ini.
Sejauh ini, diskusi kita telah menjelaskan interaksi antar molekul dalam embrio syncytial. Tapi begitu sel
terbentuk, interaksi terjadi antar sel. Interaksi antar sel ini dimediasi oleh gen polaritas segmen, dan mereka
menyelesaikan dua tugas penting. Pertama, mereka memperkuat periodisitas parasegmental yang dibentuk oleh
faktor transkripsi sebelumnya. Kedua, melalui pensinyalan sel-ke-sel ini, nasib sel ditentukan dalam setiap parasegmen.
Gen polaritas segmen mengkode protein yang merupakan konstituen jalur transduksi sinyal Tanpa Sayap
dan Landak (lihat Bab 6). Mutasi pada gen-gen ini menyebabkan cacat pada segmentasi dan pola ekspresi gen di
setiap parasegmen.
Machine Translated by Google
Perkembangan pola normal bergantung pada fakta hanya satu baris sel di setiap baris
parasegmen diizinkan untuk mengekspresikan protein Landak, dan hanya satu baris sel di setiap .
parasegmen diizinkan untuk mengekspresikan .
Protein tanpa sayap.
Setelah ekspresi tak bersayap dan berukir terbentuk di sel yang berdekatan, pola ini harus dipertahankan
untuk mempertahankan periodisitas parasegmental dari bentuk tubuh yang dibentuk oleh gen aturan berpasangan.
Harus diingat bahwa mRNA dan protein yang terlibat dalam memulai pola-pola ini berumur pendek, dan bahwa
pola-pola tersebut harus dipertahankan setelah inisiatornya tidak lagi aktif.
Machine Translated by Google
disintesis. Pemeliharaan pola-pola ini diatur oleh interaksi antara sel-sel yang berekspresi tidak bersayap dan sel-sel
yang berekspresi terukir. Protein tak bersayap, yang disekresikan dari sel-sel yang tidak bersayap, berdifusi ke sel-sel di
dekatnya. Sel-sel yang mengekspresikan enrailed dapat mengikat protein ini karena mengandung protein reseptor
membran Drosophila untuk Wingless, D Frizzled-2 (lihat Gambar 6.23; Bhanot et al. 1996). Reseptor ini mengaktifkan
jalur transduksi sinyal Wnt, menghasilkan ekspresi lanjutan dari engraled (Siegfried et al. 1994).
Selain itu, aktivasi ini memulai bagian lain dari jalur timbal balik ini. Protein yang terukir mengaktifkan transkripsi
gen landak dalam sel yang mengekspresikan terukir. Protein Hedgehog dapat berikatan dengan reseptor Hedgehog
(protein Patched) pada sel tetangga.
Ketika ia berikatan dengan sel posterior yang berdekatan, ia merangsang ekspresi gen tak bersayap .
Hasilnya adalah sebuah lingkaran timbal balik dimana sel-sel yang mensintesis Engrailed mensekresikan protein
Hedgehog, yang mempertahankan ekspresi gen tak bersayap pada sel-sel tetangganya, sementara sel-sel yang
mensekresi tak bersayap mempertahankan ekspresi gen- gen terukir dan gen landak pada tetangganya pada gilirannya.
(Heemskerk dkk. 1991; Ingham dkk. 1991; Mohler dan Vani 1992). Dengan cara ini, pola transkripsi kedua jenis sel ini
menjadi stabil. Interaksi ini menciptakan batas yang stabil, serta pusat sinyal tempat protein Hedgehog dan Tak Bersayap
berdifusi melintasi parasegmen.
Namun, mekanisme yang digunakan untuk mencapai spesifikasi ini tidak jelas. Entah sinyal-
sinyal ini bertindak secara bertahap, sebagai morfogen, atau mereka bertindak secara lokal untuk
memulai rangkaian peristiwa sinyal lokal, di mana setiap interaksi menggunakan ligan dan reseptor
yang berbeda (Gambar 9.26). Pola nasib sel yang dihasilkan juga mengubah fokus pola dari
parasegmen ke segmen. Sekarang ada penanda eksternal, karena sel-sel yang mengekspresikan
terukir menjadi sel paling posterior dari setiap segmen.
Setelah batas-batas
segmental ditetapkan, struktur
karakteristik setiap segmen
ditentukan. Spesifikasi ini dicapai oleh gen
penyeleksi homeotik (Lewis
1978).
Karena gen-gen ini bertanggung jawab atas spesifikasi bagian-bagian tubuh lalat, mutasi pada
bagian-bagian tersebut menyebabkan fenotipe yang aneh. Pada tahun 1894, William Bateson menyebut
organisme ini sebagai "mutan homeotik", dan mereka telah memesona para ahli biologi perkembangan
selama beberapa dekade. Misalnya, tubuh lalat dewasa normal mempunyai tiga segmen toraks, yang
semuanya menghasilkan sepasang kaki. Segmen toraks pertama tidak menghasilkan pelengkap lebih lanjut,
namun segmen toraks kedua menghasilkan satu set kaki dan satu set sayap. Segmen toraks ketiga
menghasilkan satu set sayap dan satu set penyeimbang yang dikenal sebagai halter. Dalam mutan homeotik, identitas segmental sp
Machine Translated by Google
Ekspresi gen homeotik merupakan proses yang dinamis. Gen Antennapedia (Antp),
misalnya, meskipun awalnya diekspresikan dalam parasegmen dugaan 4, segera muncul dalam
parasegmen 5. Ketika pita germinal meluas, ekspresi Antp terlihat dalam tabung saraf dugaan
sejauh posterior parasegmen 12. Selama pengembangan lebih lanjut, domain ekspresi Antp
berkontraksi lagi, dan transkrip Antp terlokalisasi dengan kuat ke parasegmen 4 dan 5. Seperti
gen homeotik lainnya, ekspresi Antp diatur secara negatif oleh semua produk gen homeotik
yang diekspresikan di belakangnya (Harding dan Levine 1989; González- Reyes dan Morata
1990). Dengan kata lain, masing-masing gen kompleks bithorax menekan ekspresi Antennapedia.
Jika gen Ultrabithorax dihapus, aktivitas Antp meluas melalui wilayah yang biasanya
mengekspresikan Ubx dan berhenti di tempat dimulainya wilayah Abd . (Hal ini memungkinkan
segmen toraks ketiga membentuk sayap seperti segmen toraks kedua, seperti pada Gambar
9.29.) Jika seluruh kompleks bithorax dihilangkan, ekspresi Antp meluas ke seluruh perut. (Larva
seperti itu tidak dapat bertahan hidup, tetapi pola kutikula di seluruh perut adalah pola segmen toraks kedua.)
Machine Translated by Google
Seperti yang kita lihat di atas, gen gap dan protein gen aturan berpasangan bersifat sementara,
namun identitas segmen harus distabilkan agar diferensiasi dapat terjadi. Jadi, setelah pola transkripsi
gen homeotik menjadi stabil, pola tersebut "terkunci" pada tempatnya melalui perubahan konformasi
kromatin pada gen tersebut. Represi gen homeotik tampaknya dipertahankan oleh keluarga protein
Polycomb, sedangkan konformasi kromatin aktif tampaknya dipertahankan oleh protein Trithorax
(Ingham dan Whittle 1980; McKeon dan Brock 1991; Simon et al. 1992).
Gen realisator
Pencarian sekarang untuk "gen realisator", yaitu gen yang menjadi target protein gen homeotik
dan berfungsi untuk membentuk primordia jaringan atau organ tertentu. Dalam pembentukan segmen
toraks kedua, misalnya, Antennapedia diungkapkan. Casares dan Mann (1998) telah menunjukkan
bahwa protein Antennapedia berikatan dengan penambah gen homothorax dan
mencegah ekspresinya. Homothorax diperlukan untuk menghasilkan faktor
transkripsi yang penting untuk pembentukan antena. Oleh karena itu, salah
satu fungsi Antennapedia adalah menekan gen-gen yang diperlukan untuk
pengembangan antena.
Target lain dari protein homeotik, gen tanpa distal (yang merupakan gen yang mengandung
homeobox: lihat Sidelights dan Spekulasi), diperlukan untuk perkembangan anggota tubuh dan hanya
aktif di dada. Ekspresi distal-less ditekan di perut, mungkin oleh kombinasi protein Ubx dan AbdA yang
dapat mengikat penambahnya dan memblokir transkripsi (Vachon et al. 1992; Castelli-Gair dan Akam
1995). Hal ini menghadirkan sebuah paradoks, karena parasegmen 5 (seluruhnya memproduksi
toraks dan tungkai) dan parasegmen 6 (yang mencakup sebagian besar segmen perut pertama tanpa
kaki) keduanya mengekspresikanUbx. Bagaimana dua segmen yang sangat berbeda ini dapat
ditentukan oleh gen yang sama? Castelli-Gair dan Akam (1995) telah menunjukkan bahwa keberadaan
protein Ubx dalam sekelompok sel saja tidak cukup untuk spesifikasi. Sebaliknya, waktu dan tempat
pengungkapannya dalam parasegmen dapat menjadi sangat penting. Sebelum ekspresi Ubx ,
parasegmen 4 6 memiliki potensi serupa. Pada siklus pembelahan 10, ekspresi Ubx di bagian anterior
parasegmen 5 dan 6 mencegah parasegmen tersebut membentuk struktur (seperti spirakel anterior)
yang merupakan karakteristik parasegmen 4. Selain itu, di kompartemen posterior parasegmen 6
(tetapi bukan parasegmen 5), Protein Ubx memblokir pembentukan primordium ekstremitas dengan menekan gen tanpa dis
Pada siklus pembelahan 11, saat Ubx telah menyebar ke seluruh parasegmen 6, gen tanpa distal
telah menjadi pengatur mandiri dan tidak dapat ditekan oleh Ubx (Gambar 9.31).
Machine Translated by Google
*Seperti penempatan pesan bicoid , lokasi pesan nanos ditentukan oleh wilayah 3´ yang belum diterjemahkan. Jika bicoid 3´
UTR secara eksperimental ditempatkan pada wilayah pengkode
protein nanos RNA, pesan nanos ditempatkan di bagian anterior
telur. Ketika RNA diterjemahkan, protein Nanos menghambat
translasi mRNA bungkuk dan bikoid , dan embrio membentuk dua
perut, satu di anterior embrio dan satu lagi di posterior (Gavis dan
Lehmann 1992). Lokalisasi nanos RNA pada akhirnya bergantung
pada interaksi antara oosit dan sel folikel tetangga yang melokalisasi
pesan oskar ke kutub posterior.
Interaksi antara gen dan produk gen difasilitasi oleh fakta bahwa
reaksi ini terjadi di dalam sinsitium, yang membran selnya belum
terbentuk.
Homeo berarti "serupa." Mutan homeotik adalah mutan di mana satu struktur digantikan oleh yang lain (seperti antena
diganti dengan kaki). Gen homeotik adalah gen yang mutasinya dapat menyebabkan transformasi tersebut; dengan demikian,
mereka adalah gen yang menentukan identitas segmen tubuh tertentu. Homeobox adalah rangkaian DNA yang dilestarikan
dari sekitar 180 pasangan basa yang dimiliki bersama oleh banyak gen homeotik . Urutan ini mengkodekan homeodomain 60
asam amino , yang mengenali urutan DNA tertentu. Homeodomain adalah wilayah penting dari faktor transkripsi yang
dikodekan oleh gen homeotik (lihat Sidelights & Spekulasi). Namun, tidak semua gen dengan homeobox merupakan gen homeotik.
Dipteran (serangga bersayap dua seperti lalat) diperkirakan berevolusi dari serangga bersayap empat; ada kemungkinan
bahwa perubahan ini muncul melalui perubahan pada kompleks bithorax. Bab 22 memuat lebih banyak spekulasi mengenai
hubungan antara kompleks homeotik dan evolusi.
Protein Homeodomain
Protein homeodomain adalah keluarga faktor transkripsi yang dicirikan oleh domain asam
amino 60 (homeodomain ) yang berikatan dengan wilayah DNA tertentu. Homeodomain pertama kali
ditemukan pada protein yang ketidakhadiran atau kesalahan pengaturannya menyebabkan transformasi
homeotik pada segmen Drosophila . Diperkirakan bahwa protein homeodomain mengaktifkan baterai
gen yang menentukan sifat tertentu dari setiap segmen. Protein homeodomain mencakup produk dari
delapan gen kompleks homeotik, serta protein lain seperti Fushi tarazu, Caudal, Distal-less, dan Bicoid.
Protein homeodomain penting dalam menentukan sumbu anterior-posterior invertebrata dan vertebrata.
Pada Drosophila, keberadaan protein homeodomain tertentu juga diperlukan untuk penentuan neuron
tertentu. Tanpa faktor transkripsi ini, nasib sel-sel saraf ini akan berubah (Doe dkk. 1988).
Homeodomain dikodekan oleh urutan DNA 180 pasangan basa yang dikenal sebagai
homeobox. Homeodomain tampaknya merupakan tempat protein-protein ini mengikat DNA, dan
mereka sangat penting dalam menentukan nasib sel. Misalnya, jika protein chimeric sebagian besar
dibuat dari Antennapedia tetapi dengan ujung karboksil (termasuk homeodomain) dari Ultrabithorax, maka protein tersebut
Machine Translated by Google
dapat menggantikan Ultrabithorax dan menentukan sel yang sesuai sebagai parasegmen 6 (Mann dan
Hogness 1990). Homeodomain Antennapedia yang terisolasi akan berikatan dengan promotor yang sama
dengan keseluruhan protein Antennapedia, yang menunjukkan bahwa pengikatan protein ini bergantung
pada homeodomainnya (Müller et al. 1988).
Homeodomain terlipat menjadi tiga heliks, dua heliks terlipat menjadi konformasi heliks-turn-heliks
yang merupakan karakteristik faktor transkripsi yang mengikat DNA dalam alur utama heliks ganda (Otting
dkk. 1990; Percival-Smith dkk. 1990 ). Heliks ketiga adalah heliks pengenalan, dan di sinilah asam amino
melakukan kontak dengan basa DNA. Motif empat dasar, TAAT, dilestarikan di hampir semua situs yang
dikenali oleh homeodomain; ini mungkin membedakan situs-situs yang dapat diikat oleh protein
homeodomain. Terminal 5´ T tampaknya sangat penting dalam pengenalan ini, karena mutasinya akan
menghancurkan semua ikatan homeodomain. Pasangan basa yang mengikuti motif TAAT penting dalam
membedakan situs pengenalan serupa. Misalnya, pasangan basa berikutnya dikenali oleh asam amino 9
dari heliks pengenalan. Studi mutasi menunjukkan bahwa protein homeodomain Bicoid dan Antennapedia
masing-masing menggunakan lisin dan glutamin, pada posisi 9 untuk membedakan situs pengenalan
terkait. Lisin dari homeodomain Bicoid mengenali G dari pasangan CG, sedangkan glutamin dari
homeodomain Antennapedia mengenali A dari pasangan AT (Gambar 9.32; Hanes dan Brent 1991). Jika
lisin dalam Bicoid digantikan oleh glutamin, protein yang dihasilkan akan mengenali situs pengikatan
Antennapedia (Hanes dan Brent 1989, 1991). Protein homeodomain lainnya menunjukkan pola serupa, di
mana satu bagian dari homeodomain mengenali urutan TAAT yang umum, sementara bagian lainnya
mengenali struktur spesifik yang berdekatan dengannya.
Gen-gen kompleks homeotik Drosophila menentukan nasib segmental, namun mereka mungkin
memerlukan bantuan dalam melakukannya. Situs pengikatan DNA yang dikenali oleh homeodomain
protein Hom-C sangat mirip, dan terdapat beberapa tumpang tindih dalam spesifisitas pengikatannya.
Pada tahun 1990, Peifer dan Wieschaus menemukan bahwa produk gen Extradenticle (Exd) berinteraksi
dengan beberapa protein Hom-C dan dapat membantu menentukan identitas segmental. Misalnya, protein
Ubx bertanggung jawab untuk menentukan identitas segmen perut pertama (A1). Tanpa protein
Extradenticle, segmen ini akan diubah menjadi A3. Selain itu, protein Exd dan Ubx keduanya dibutuhkan
untuk regulasi gen decapentaplegic , dan struktur gen
Machine Translated by Google
Promotor decapentaplegic menyarankan bahwa protein Extradenticle dapat dimerisasi dengan protein Ubx
pada penambah gen target ini (Raskolb dan Wieschaus 1994; van Dyke dan Murre 1994). Protein Extradenticle
merangkumi homeodomain, dan protein manusia PBX1, yang menyerupai protein Extradenticle, mungkin
memainkan peranan yang sama sebagai kofaktor untuk gen homeotik manusia.
Produk gen pembuat teh mungkin juga merupakan kofaktor yang penting. Faktor transkripsi jari seng
ini diperlukan agar protein tereduksi sisir seks berfungsi, yang membedakan antara segmen labial dan toraks
pertama. Hal ini penting untuk spesifikasi identitas prothoracic anterior (parasegmen 3), dan mungkin merupakan
gen yang menentukan "kondisi dasar" dari kompleks homeotik. Jika kompleks bithorax dan Antenapedia
gen dihilangkan, semua segmen menjadi prothorax anterior. Produk dari gen teashirt tampaknya bekerja
dengan protein Scr untuk membedakan dada dari kepala dan bekerja di seluruh batang tubuh untuk mencegah
pembentukan struktur kepala (Roder et al. 1992).
Pada tahun 1936, ahli embriologi EE Just mengkritik para ahli genetika yang berusaha menjelaskan
perkembangan Drosophila dengan melihat mutasi spesifik yang mempengaruhi warna mata, jumlah bulu, dan
bentuk sayap. Dia berkata bahwa dia tidak tertarik dengan perkembangan bulu punggung lalat; sebaliknya, dia
ingin tahu bagaimana embrio lalat membuat punggungnya sendiri. Lima puluh tahun kemudian, ahli embriologi
dan genetika akhirnya menjawab pertanyaan tersebut.*
Polaritas dorsal-ventral ditentukan oleh gradien faktor transkripsi yang disebut Dorsal. Tidak seperti
Bicoid, yang gradiennya terbentuk dalam syncytium, Dorsal membentuk gradien pada bidang sel yang terbentuk
sebagai konsekuensi dari peristiwa pensinyalan sel ke sel.
Protein yang membedakan dorsum (punggung) dengan ventrum (perut) adalah produk
dari gen dorsal . Transkrip RNA dari gen punggung ibu ditempatkan di oosit oleh sel ovariumnya.
Namun, protein punggung tidak disintesis dari pesan ibu ini sampai sekitar 90 menit setelah
pembuahan. Ketika protein ini diterjemahkan, protein ini ditemukan di seluruh embrio, tidak hanya
di sisi perut atau punggung. Lalu, bagaimana protein ini dapat bertindak sebagai morfogen jika ia
terdapat di mana-mana di dalam embrio?
Pada tahun 1989, jawaban yang mengejutkan ditemukan (Roth et al. 1989; Rushlow et al. 1989;
Steward 1989). Meskipun protein punggung dapat ditemukan di seluruh blastoderm syncytial embrio
Drosophila awal, protein tersebut ditranslokasi ke dalam inti hanya di bagian ventral embrio (Gambar
9.34A, B). Di dalam inti, Dorsal berikatan dengan gen tertentu untuk mengaktifkan atau menekan transkripsi mereka.
Jika Dorsal tidak masuk ke dalam nukleus, gen yang bertanggung jawab untuk menentukan tipe sel ventral (siput
dan twist) tidak ditranskripsi, gen yang bertanggung jawab untuk menentukan tipe sel dorsal
(decapentaplegic dan zerknüllt) tidak ditekan, dan semua sel embrio menjadi spesifik sebagai sel
dorsal.
Model pembentukan sumbu dorsal-ventral pada Drosophila didukung oleh analisis mutasi
yang menghasilkan fenotip yang sepenuhnya terdorsalisasi atau sepenuhnya ventral (lihat
Gambar 9.33A dan 9.34). Pada mutan yang semua selnya terdorsalisasi (seperti terlihat pada
kutikula dorsalnya), protein dorsal tidak masuk ke dalam nukleus di sel mana pun. Sebaliknya,
pada mutan yang semua selnya mempunyai fenotip ventral, protein dorsal ditemukan di setiap inti sel.
Aliran sinyal
Jika protein dorsal ditemukan di seluruh embrio, namun ditranslokasi ke dalam inti sel
ventral saja, maka ada hal lain yang memberikan isyarat asimetris (Gambar 9.35).
Tampaknya sinyal ini dimediasi melalui interaksi kompleks antara oosit dan sel-sel folikel di
sekitarnya.
Epitel folikel yang mengelilingi oosit yang sedang berkembang pada awalnya simetris,
tetapi simetri ini dirusak oleh sinyal dari inti oosit. Inti oosit awalnya terletak di ujung posterior
oosit, jauh dari sel perawat. Kemudian bergerak ke posisi dorsal anterior dan memberi sinyal pada
sel-sel folikel di atasnya untuk menjadi sel-sel folikel dorsal yang lebih kolumnar (Montell dkk.
1991; Schüpbach dkk. 1991). Sinyal dorsalisasi dari inti oosit tampaknya merupakan produk gen
gurken (Schüpbach 1987; Forlani dkk. 1993).
Pesan gurken menjadi terlokalisasi dalam bentuk bulan sabit antara inti oosit dan membran
plasma oosit, dan produk proteinnya membentuk gradien anterior-posterior sepanjang permukaan
dorsal oosit (Neuman-Silberberg dan Schüpbach 1993; Gambar 9.36).
Machine Translated by Google
Gambar 9.35
Gambar 9.36
Machine Translated by Google
Sinyal Gurken diterima oleh sel folikel melalui reseptor yang dikodekan oleh gen torpedo .
Analisis molekuler kini telah menetapkan bahwa gurken mengkode homolog faktor pertumbuhan
epidermal vertebrata (EGF), sedangkan torpedo mengkodekan homolog reseptor EGF vertebrata
(Price et al. 1989; Neuman-Silberberg dan Schüpbach 1993). Kekurangan torpedo pada ibu
menyebabkan ventralisasi embrio. Apalagi gen torpedo aktif di sel folikel ovarium, bukan di embrio.
Hal ini ditemukan dengan membuat garis kuman/chimera somatik. Schüpbach (1987)
mentransplantasikan prekursor sel germinal dari embrio tipe liar ke embrio yang ibunya membawa
mutasi torpedo. Sebaliknya, dia mentransplantasikan sel germinal embrio mutan torpedo ke embrio
tipe liar (Gambar 9.37). Ketika dikawinkan dengan pejantan tipe liar, telur tipe liar menghasilkan
embrio yang berventral ketika berkembang di dalam folikel induk mutan torpedo. Telur mutan torpedo
mampu menghasilkan embrio normal jika berkembang di dalam ovarium tipe liar. Jadi, berbeda
dengan produk gen gurken , torpedo tipe liar
gen dibutuhkan di sel folikel, bukan di sel telur itu sendiri.
Protein reseptor Torpedo yang diaktifkan menghambat ekspresi gen pipa . Akibatnya, protein
Pipa hanya dibuat di sel folikel ventral (Sen et al. 1998). Protein Pipa (dalam beberapa cara yang
belum diketahui) mengaktifkan protein Nudel, yang disekresikan ke membran sel sel embrionik
ventral. Beberapa jam kemudian dalam perkembangannya, protein Nudel yang teraktivasi memulai
aktivasi tiga protease serin yang disekresikan oleh embrio ke dalam cairan perivitelline (lihat Gambar
9.35C; Hong dan Hashimoto 1995). Ketiga protease serin ini merupakan produk gen gastrulasi cacat
(gd), ular (snk), dan paskah (ea) . Seperti kebanyakan protease ekstraseluler, mereka disekresikan
dalam bentuk tidak aktif dan diaktifkan oleh pembelahan peptida. Diperkirakan bahwa protein Nudel
yang diaktifkan pertama-tama menambatkan dan mengaktifkan protein yang rusak pada Gastrulasi.
Protease ini membelah protein Ular. Pembelahan ini mengaktifkan protease Ular, yang selanjutnya
membelah protein Paskah. Pembelahan ini mengaktifkan protein Paskah, yang membelah protein
Spätzle (Chasan dkk. 1992; Hong dan Hashimoto 1995).
Protein Spätzle yang dibelah sekarang mampu berikatan dengan reseptornya di membran
sel oosit, produk dari gen Toll . Protein tol adalah produk induk yang didistribusikan secara merata ke
seluruh membran sel telur (Hashimoto et al. 1988, 1991), namun menjadi aktif hanya dengan mengikat
protein Spätzle, yang hanya diproduksi di sisi perut telur. Oleh karena itu, protein Tol di sisi perut telur
mentransduksi sinyal ke dalam telur, sedangkan reseptor Tol di sisi punggung telur tidak.
Machine Translated by Google
Hasil penting dari pensinyalan melalui protein Toll adalah pembentukan gradien protein Dorsal di inti
sel ventral. Bagaimana gradien ini terbentuk? Tampaknya protein Kaktus menghalangi bagian protein Dorsal
yang memungkinkan protein Dorsal masuk ke dalam inti. Selama protein Kaktus ini terikat padanya, protein
punggung tetap berada di sitoplasma. Dengan demikian, seluruh sistem sinyal kompleks ini diatur untuk
memisahkan protein Kaktus dari protein Dorsal di daerah ventral telur. Ketika Spätzle mengikat dan mengaktifkan
protein Toll, protein Toll dapat mengaktifkan protein kinase Pelle. (Protein Tube mungkin diperlukan untuk
membawa Pelle ke membran sel, di mana ia dapat diaktifkan: Galindo dkk. 1995.)
Protein kinase Pelle yang diaktifkan dapat (mungkin melalui perantara) memfosforilasi protein Kaktus. Setelah
terfosforilasi, protein Kaktus terdegradasi, dan protein Dorsal dapat memasuki nukleus (Kidd 1992; Shelton dan
Wasserman 1993; Whalen dan Steward 1993; Reach et al. 1996).
Apa yang dilakukan protein punggung setelah berada di inti sel ventral? Melihat peta nasib penampang
embrio Drosophila pada siklus pembelahan keempat belas (lihat Gambar 9.35B) memperjelas bahwa 16 sel
dengan konsentrasi protein Dorsal tertinggi adalah sel yang menghasilkan mesoderm. Sel berikutnya dari wilayah
ini menghasilkan sel glial dan saraf khusus di garis tengah. Dua sel berikutnya adalah sel yang menghasilkan
epidermis ventral dan tali saraf ventral, sedangkan sembilan sel di atasnya menghasilkan epidermis dorsal.
Kelompok enam sel paling punggung menghasilkan lapisan amnioserosal embrio (Ferguson dan Anderson 1991).
Machine Translated by Google
Peta nasib ini dihasilkan oleh gradien protein punggung di dalam inti. Dorsal dalam jumlah besar
memerintahkan sel untuk menjadi mesoderm, sementara jumlah yang lebih kecil memerintahkan sel untuk
menjadi jaringan glial atau ektodermal (Jiang dan Levine 1993). Peristiwa morfogenetik pertama pada gastrulasi
Drosophila adalah invaginasi 16 sel paling ventral embrio (Gambar 9.39). Semua otot tubuh, lemak, dan gonad
berasal dari sel mesodermal ini (Foe 1989). Protein punggung menentukan sel-sel ini menjadi mesoderm dalam
dua cara.
Pertama, Dorsal mengaktifkan gen spesifik yang menciptakan fenotip mesodermal. Tiga gen target untuk Dorsal
adalah twist,snail, dan rhomboid (Gambar 9.40). Gen-gen ini ditranskripsi hanya dalam inti yang telah menerima
protein Dorsal konsentrasi tinggi, karena peningkatnya tidak mengikat Dorsal dengan afinitas yang sangat tinggi
(Thisse et al. 1988, 1991; Jiang et al. 1991; Pan et al. 1991).
Protein Twist mengaktifkan gen mesodermal, sedangkan protein Siput
menekan gen nonmesodermal tertentu yang mungkin aktif. Gen belah
ketupat menarik karena diaktifkan oleh Dorsal tetapi ditekan oleh Siput.
Jadi, pada embrio tipe liar, prekursor mesodermal mengekspresikan twist dan siput (tetapi bukan zen
atau dpp); prekursor epidermis punggung dan amnioserosa mengekspresikan zen dan dpp tetapi tidak memutar
atau siput. Prekursor glial (mesectoderm) hanya mengekspresikan siput, sedangkan prekursor saraf lateral
ektodermal tidak mengekspresikan satu pun dari keempat gen ini (Kosman dkk. 1991; Ray dkk. 1991). Jadi,
sebagai konsekuensi respons terhadap gradien protein punggung, sumbu menjadi terbagi lagi menjadi
mesoderm, mesektoderm, ektoderm neurogenik, epidermis, dan amnioserosa.
Sumbu anterior-posterior dan dorsal-ventral embrio Drosophila membentuk sistem koordinat yang
dapat digunakan untuk menentukan posisi di dalam embrio. Secara teoritis, sel-sel yang awalnya memiliki
potensi perkembangan yang setara dapat merespons posisinya dengan mengekspresikan kumpulan gen yang
berbeda. Jenis spesifikasi ini telah ditunjukkan dalam pembentukan dasar kelenjar ludah (Panzer et al. 1992).
Pertama, kelenjar ludah hanya terbentuk pada potongan sel yang ditentukan oleh aktivitas gen sisir seks
tereduksi (scr) di sepanjang sumbu anterior-posterior (parasegmen 2). Tidak ada kelenjar ludah yang terbentuk
pada mutan yang kekurangan scr. Terlebih lagi, jika scr diekspresikan secara eksperimental di seluruh embrio,
primordia kelenjar ludah terbentuk dalam garis ventrolateral di sepanjang
sebagian besar embrio. Pembentukan kelenjar ludah di sepanjang sumbu
ventral dorsal ditekan oleh Decapentaplegic dan Dorsal.
Situasi serupa terlihat pada jaringan yang ditemukan di setiap segmen lalat.
Neuroblas muncul dari sepuluh kelompok yang masing-masing terdiri dari empat hingga enam sel yang
terbentuk di setiap sisi di setiap segmen pada strip ektoderm saraf di garis tengah embrio (Skeath dan Carroll 1992).
Potensi untuk membentuk sel-sel saraf diberikan pada sel-sel ini melalui ekspresi gen-gen rawan dari kompleks
gen achaete-scute: achaete (ac), scute (sc), dan lethal of scute (l'sc). Sel-sel di setiap cluster berinteraksi
(dengan cara yang dibahas di Bab 8 dan 12) untuk menghasilkan sel saraf tunggal dari cluster. Skeath dan
rekannya (1993) telah menunjukkan bahwa pola achaete
dan transkripsi scute diterapkan oleh sistem koordinat. Ekspresi mereka ditekan oleh protein Decapentaplegic
dan Siput di sepanjang sumbu dorsal-ventral, sementara peningkatan positif oleh gen aturan berpasangan di
sepanjang sumbu anterior-posterior menyebabkan pengulangannya di setiap setengah segmen. Peningkat
yang dikenali oleh protein penentu sumbu ini terletak di antara gen achaete dan scute dan tampaknya mengatur
keduanya. Maka, kemungkinan besar posisi primordia organ ditentukan sepanjang lalat melalui sistem koordinat
dua dimensi berdasarkan perpotongan sumbu anterior-posterior dan dorsal-ventral.
kode
Studi genetik pada embrio Drosophila telah mengungkap banyak gen yang bertanggung jawab atas
spesifikasi sumbu anterior-posterior dan dorsal-ventral. Pemahaman kita mengenai pembentukan pola
Drosophila masih jauh dari sempurna , namun kita lebih menyadari kompleksitasnya dibandingkan lima tahun
yang lalu. Mutasi gen Drosophila telah memberi kita kemampuan kita
Machine Translated by Google
untuk pertama kalinya melihat sekilas berbagai tingkat regulasi pola dalam organisme kompleks dan
memungkinkan isolasi gen-gen ini serta produk-produknya. Terlebih lagi, seperti yang akan kita lihat di bab-bab
selanjutnya, gen-gen ini memberikan petunjuk mengenai mekanisme umum pembentukan pola yang digunakan
di seluruh dunia hewan.
Ada tatanan temporal di mana berbagai kelas gen ditranskripsi, dan produk darinya
satu gen sering kali mengatur ekspresi gen lain.
Di Drosophila, batasan ekspresi gen dapat diciptakan oleh interaksi antara faktor transkripsi dan
target gennya. Di sini, faktor transkripsi yang ditranskripsi sebelumnya mengatur ekspresi set gen
berikutnya.
Kontrol translasi sangat penting pada embrio awal, dan mRNA yang terlokalisasi sangat penting dalam
membentuk pola embrio.
Nasib sel individu tidak dapat ditentukan dengan segera. Sebaliknya, ada spesifikasi bertahap dimana
bidang tertentu dibagi dan dibagi lagi, yang pada akhirnya mengatur nasib sel individu.
1. Belahan Drosophila bersifat dangkal. Inti membelah 13 kali sebelum membentuk sel. Sebelum pembentukan
sel, inti berada dalam blastoderm syncytial. Setiap nukleus dikelilingi oleh sitoplasma yang berisi aktin.
2. Ketika sel terbentuk, embrio Drosophila mengalami transisi midblastula, dimana pembelahan menjadi tidak
sinkron dan mRNA baru dibuat. Jumlah kromatin menentukan waktu transisi ini.
3. Gastrulasi dimulai dengan invaginasi daerah paling ventral, yaitu dugaan mesoderm. Hal ini
menyebabkan terbentuknya alur ventral. Pita germinal melebar sehingga segmen posterior di masa depan
melengkung tepat di belakang kepala dugaan.
4. Gen efek ibu bertanggung jawab atas permulaan polaritas anterior-posterior. Bikoid
mRNA diasingkan oleh 3´ UTR-nya di anterior masa depan oleh sitoskeleton; nanos mRNA diasingkan oleh 3
´ UTR di kutub posterior masa depan. Pesan bungkuk dan ekor terlihat di seluruh embrio.
5. Saat pembuahan, pesan bicoid dan nanos diterjemahkan. Gradien protein Bicoid mengaktifkan lebih
banyak transkripsi si bungkuk di anterior. Selain itu, Bicoid menghambat terjemahan mRNA ekor. Gradien
Nano di posterior menghambat translasi mRNA si bungkuk. Protein ekor dibuat di posterior.
6. Protein Bicoid dan Bongkok mengaktifkan gen yang bertanggung jawab pada bagian anterior lalat; Kaudal
mengaktifkan gen yang bertanggung jawab untuk perkembangan posterior.
Machine Translated by Google
7. Bagian anterior dan posterior yang tidak tersegmentasi diatur oleh aktivasi protein Torso di kutub anterior dan
posterior sel telur.
8. Gen kesenjangan merespons konsentrasi protein gen efek ibu. Produk protein mereka berinteraksi satu sama lain
sedemikian rupa sehingga setiap protein gen celah menentukan wilayah spesifik embrio.
9. Protein gen gap mengaktifkan dan menekan gen aturan berpasangan. Gen aturan berpasangan mempunyai
promotor modular sehingga gen tersebut menjadi aktif dalam tujuh "garis". Batasan mereka ditentukan oleh gen
kesenjangan. Gen-gen ini membentuk tujuh pita transkripsi sepanjang sumbu anterior-posterior, masing-masing
terdiri dari dua parasegmen.
10. Produk gen aturan berpasangan mengaktifkan ekspresi terukir dan tak bersayap di sel yang berdekatan. Sel -sel
pengekspres yang terukir membentuk batas anterior setiap parasegmen. Sel-sel ini membentuk pusat sinyal yang
mengatur pembentukan kutikula dan struktur segmental embrio.
11. Gen pemilih homeotik ditemukan pada dua kompleks pada kromosom 3 Drosophila. Bersama-sama, gen-gen ini
disebut Hom-C, kompleks gen homeotik. Gen-gen tersebut disusun dalam urutan yang sama dengan ekspresi
transkripsionalnya. Gen-gen ini menentukan setiap segmen, dan mutasi pada gen-gen ini mampu mengubah satu segmen
menjadi segmen lainnya.
12. Ekspresi setiap gen penyeleksi homeotik diatur oleh gen gap dan pair-rule. Ekspresi mereka disempurnakan
dan dipertahankan melalui interaksi dimana produk protein berinteraksi dengan gen, mencegah transkripsi gen Hom-
C yang berdekatan.
13. Pada mutasi Ultrabithorax, segmen toraks ketiga ditetapkan sebagai segmen toraks kedua. Ini mengubah
halter menjadi sayap. Ketika Antennapedia diekspresikan di kepala dan juga di dada, ia menekan pembentukan antena,
memungkinkan kaki terbentuk di tempat antena seharusnya berada.
14. Target protein Hom-C adalah gen realisator. Ini termasuk Tanpa Distal dan Tanpa Sayap
gen (di segmen toraks).
15. Polaritas dorsal-ventral diatur oleh masuknya protein dorsal ke dalam nukleus. Polaritas dorsal-ventral dimulai dengan
penempatan nukleus di dorsal-anterior oosit dan menyalin pesan gurken . Pesan ini diangkut ke wilayah di atas nukleus dan
berdekatan dengan sel folikel.
16. MRNA gurken diterjemahkan menjadi protein Gurken, yang disekresikan dari oosit dan berikatan dengan reseptornya,
Torpedo, pada sel folikel. Ini membuat sel-sel folikel menjadi dorsal, mencegahnya mensintesis pipa.
17. Protein pipa dalam sel folikel ventral memodifikasi faktor yang belum diketahui yang memodifikasi protein Nudel. Hal ini
memungkinkan protein Nudel untuk mengaktifkan kaskade proteolisis di ruang antara sel folikel ventral dan sel ventral
embrio.
18. Sebagai hasil dari kaskade, protein Spätzle diaktifkan dan berikatan dengan protein Toll pada sel embrio ventral.
19. Protein Toll yang teraktivasi mengaktifkan Pelle dan Tube untuk memfosforilasi protein Kaktus yang telah terikat pada
protein Dorsal. Protein Kaktus terfosforilasi terdegradasi, memungkinkan protein Dorsal memasuki nukleus.
20. Begitu berada di dalam nukleus, protein dorsal mengaktifkan gen-gen yang bertanggung jawab atas nasib sel
ventral dan menekan gen-gen yang proteinnya akan menentukan nasib sel dorsal. Karena gradien protein punggung
memasuki berbagai inti, inti yang berada pada permukaan paling ventral menjadi mesoderm, dan inti yang lebih lateral
menjadi ektoderm neurogenik.
21. Organ terbentuk di persimpangan daerah ekspresi gen dorsal-ventral dan anterior-posterior.