+H N C COOH
3
R
Ikatan Peptida Polypeptida
STRUKTUR PROTEIN
OH
(Lactate)
CH3 C COO - + NADH + H+
O
(Pyruvate)
Enzim : Lactate dehydrogenase
2. Transferase : mengkatalisir transfer dari
gugus yang mengandung C, N, P.
CH2 CH COO + THF
OH NH3+
(Serine)
CH2 COO + THFCH2
NH3+
(Glycine)
Enzim : Serine hydroxymethyl transferase.
3. Hydrolase : mengkatalisir pemecahan
ikatan dengan penambahan air.
Enzim : Urease
(Kebanyakan enzim pencernaan adalah
golongan Hydroxylase)
4. Lyase : addisi dari suatu gugus pada suatu
ikatan rangkap atau sebaliknya tanpa
menggunakan air
H
O O
(Pyruvate) (Acetaldehyde)
3 5 7 9 11
pH
Pengaruh pH terhadap kecepatan reaksi enzim
Suhu
% aktifitas enzim
maksimum
0 suhu 70C
konsentrasi enzim
Konsentrasi substrat
Enzyme activity
Increase the substrate
concentration,
observe the change of
enzyme activity
0 1 2 3 4
Substrate concentration
Succinate Dehydrogenase
Enzyme Inhibition (Mechanism)
S S E I
S
E S I I
I
Compete for S I
Inhibitor active site Different site
E + S
ES E + P E + S ES E + P E + S
ES E + P
Equation and Description
+ + + +
I I I I
EI EI + S EIS EIS
[I] binds to free [E] only, [I] binds to free [E] or [ES] [I] binds to [ES] complex
and competes with [S]; complex; Increasing [S] can only, increasing [S] favors
increasing [S] overcomes
not overcome [I] inhibition. the inhibition by [I].
Inhibition by [I].
dr. OK.MHD.SYAHPUTRA,M.Kes
PENGERTIAN FUNGSI DAN SIFAT UMUM
1. OKSIDOREDUKTASE
- mengkatalisis reaksi oksidasi reduksi
- sering menggunakan koenzim seperti: NAD, NADP,
FAD atau lipoat sebagai aseptor hidrogen
- Aseptor lainnya : koenzim Q atau molekul Oksigen
- Nama umum : dehidrogenase,oksidase,peroksidase
3. HIDROLASE
- mengkatalisis reaksi hidrolisa
H
|
CH3CCOO Piruvat dekarboksilase CH3-CH + CO2
|| ||
O O
PIRUVAT ASETALDEHID
5. ISOMERASE
- mengkatalisis interkonversi isomer-isomer optik,
geometri atau posisi (keseimbangan antara dua
isomer)
D ALANIL ALANIN+ADP+HPO42+
MOLEKUL NON PROTEIN PENDUKUNG ENZIM
NAD
3 5 7 9 11
pH
Pengaruh pH terhadap kecepatan reaksi enzim
Suhu
% aktifitas enzim
maksimum
0 suhu 70C
laju
reaksi
konsentrasi enzim
Konsentrasi substrat
jika konsentrasi substrat meningkat, kondisi lain konstan,
percepatan reaksi akan meningkat hingga mencapai
keadaan dimana enzim dikatakan jenuh oleh substrat
Vmaks
C
Vmaks/2
V B
A Vmaks/2
Km (S)
1 1
Km Vmaks
0 1
(S)
+inhibitor
1
Km tanpa inhibitor
1 1
Km Vmaks
0 1
(S)
Grafik Inhibitor kompetitif Lineweaver Burk
Dalam inhibisi non kompetitif Vmaks berkurang menjadi
Vmaks sehingga titik potong sumbu bergeser ke atas
Km tidak berubah dengan penghambatan
Inbisi kompetitif tidak bisa diatasi dengan penambahan
konsentrasi substrat
1
V
+inhibitor
1
Vmaks tanpa inhibitor
1
Km 1
Vmaks
0 1
(S)
A B C D Z
- (NO2 )/dt
Laju reaksi yang dinyatakan dalam produk selalu bertanda (+) dan laju yang dinyatakan dalam
reaktan diberi tanda (-)
Koefisien Reaksi
Koefisien dalam persamaan menunjukkan : untuk
setiap pembentukan 1 mol O2, 2 mol NO dikonsumsi
2 mol NO2
2NO2 2NO + O2
Laju pembentukan NO = 2 x laju pembentukan O2
Laju pembentukan NO = - laju pengurangan NO2
dan dapat ditulis
Contoh :
2NO2(g) 2NO(g) + O2
Laju rata-rata suatu interval waktu adalah sama
dengan perubahan konsentrasi dibagi dengan
perubahan waktu.
Contoh : Pada interval waktu 20 s dan 40 s
perubahan konsentrasi (NO) adalah dari 0,0116
menjadi 0,0882 mol/L.
(NO2)= 0,0882 mol/L 0,0116 mol/L
= - 0,0034 mol/L
t = 40 s 20 s = 20 s
Data percobaan reaksi dekomposisi NO2
= 1,7 x 10 -4 mol/L.s
E + S E S E +P
In steady state, the production and consumption of
the transition state proceed at the same rate. So the
concentration of transition state keeps a constant.
Constant ES Concentration at Steady State
S
P
Concentration
ES
E
Reaction Time
Juang RH (2004) BCbasics
V, kecepatan pembentukan produk dapat di hitung oleh
persamaan Michaeles Menten
V= Vmaks (S)
(E)+(Km)
Vmaks adalah kecepatan reaksi bila semua enzim jenuh
dengan substrat
Km adalah ketetapan Michaeles Menten yi konsentrasi
substrat yang menyebabkan kecepatan reaksi tepat dari
kecepatan maksimum
Nilai Km berbagai enzim sangat beragam,sebagian besar
antara 10 10M
Nilai Km enzim tergantung pada jenis substrat,juga
keadaan lingkungan seperti pH, suhu dan kekutan ion
Vmaks dapat ditentukan dengan mengubah konsentrasi substrat
Ketetapan ini lebih mudah lagi dihitung dengan mengubah persamaan
Michaeles Menten menjadi suatu persamaan garis lurus
1 1 Km 1
V Vmaks Vmaks . (S)
Inhibition
min
Non-competitive
Specific Activity
unit Activity
mg
Uncompetitive
Inhibisi kompetitif dapat dibedakan secara kinetika
dari inhibisi non kompetitif
Inhibisi kompetitif menaikkan Km tanpa
mengubahVmaks
Vmaks tidak berubah dengan adanya inhibisi
kompetitif
Inhibisi kompetitif yang reversibel dapat diatasi
dengan meninggikan konsentrasi substrat
1
V
+inhibitor
1
Km tanpa inhibitor
1 1
Km Vmaks
0 1
(S)
Grafik Inhibitor kompetitif Lineweaver Burk
Dalam inhibisi non kompetitif Vmaks berkurang
menjadi Vmaks sehingga titik potong sumbu
bergeser ke atas
Km tidak berubah dengan penghambatan non
kompetitif.
Inhibisi non kompetitif tidak bisa diatasi dengan
penambahan konsentrasi substrat
1
V
+inhibitor
1
Vmaks tanpa inhibitor
1
Km 1
Vmaks
0 1
(S)
Vmax Vmax
I I I
Covalent modification
A A
T T
P
GP kinase P
P
P
A GP phosphatase 1 P
P
A
AA A
P
R R
P P
P
P
P
A
A A
C.Pengaktifan enzim pada saat dan tempat enzim
diperlukan
- Sejumlah enzim diproduksi dalam bentuk
belum aktif (zimogen)
- Cara pengaktifan dilakukan oleh enzim
proteolitik
- Hal sama terjadi pada serangkaian reaksi
pembekuan darah
D. Hambatan umpan balik
- Enzim yang mengkatalisis reaksi langkah pertama suatu jalur
biosintesis biasanya dihambat oleh produk akhirnya
inhibisi enzim
oleh Z
A B C D Z
- - -
- - -
O CH2 O CH2
+
=
=
-
HH HH
Quaternary structure ATP
Feedback
CCC Catalytic subunits inhibition
CTP CTP CTP
R R R
CTP
Regulatory subunits CTP CTP CTP
R R R
CCC Catalytic subunits Nucleic acid
Inactive tense form
Juang RH (2004) BCbasics
metabolism
Regulation of Enzyme Activity
Inhibitor Proteolysis
or proteolysis
o I I x x o
S I I S
inhibitor
+
x o cAMP or
Regulatory S
subunit calmodulin
(-)
Enzim yang aktifitasnya diatur oleh effektor
allosterik(inhibitor umpan balik) akan mengikat
effektor pada tempat allosterik yang berbeda dengan
tempat aktif enzim allosterik
Jika kecepatan reaksi enzim allosterik digambarkan sbg
fungsi substrat akan didapat kurva sigmoid
Kurva pengikatan O2 pada mioglobin berbentuk
hiperbola tapi pada haemoglobin berbentuk sigmoid
Enzim dalam plasma darah
1. Enzim fungsional
- Melakukan fungsi fisiologis dalam darah
- Terdapat dalam darah dalam konsentrasi sama atau
lebih tinggi dari dalam jaringan
C/Enzim pembekuan darahTrombin
Kriobiologi:
Efek Patologis: Krio adhesia, krio nekrosis,
efek hemostasis, efek anastesia. Bahan yang
dipakai : - cairan N2 : - 196C
CO2 padat : - 79C, N2O cair : - 89,5C
Freon 22 : - 41C
CONTOH :
Termografi
Alat diagnostik yang menggunakan
energi panas (mendeteksi suhu
permukaan kulit) yang memberikan
gambaran thermogram
Kulit : radiator infra merah yang efisien,
dipengaruhi : proses panas dibawahnya,
peradangan, gangguan sirkulasi darah,
tumor aktif
Termografi dengan keseimbangan panas
Lempeng tipis nitrat selulosa yang
dilapisi minyak tipis pengabsorbsi
panas
Kulit normal : warna hijau, suhu -->
perubahan warna film selulosa dari
coklat --> kemerahan
Termogafi dengan fotokonduktivitas
Reaksi :
Penyelesaian :
H2SO3 SO4=
HNO2 NO
HNO2 NO + H2O
b. Menambahkan H+ untuk menyeimbangkan H
H2SO3 + H2O 4 H+ + SO4=
HNO2 + H + NO + H2O
c. Menambahkan elektron untuk menyeimbangkan
muatan
H2SO3 + H2O 4 H+ + SO4= + 2e
HNO2 + H + + e NO + H2O
3. Menjumlahkan kedua setengah reaksi
H2SO3 + H2O 4 H+ + SO4= + 2e
(HNO2 + H + + e NO + H2O) x 2
Tahap 5.
5Fe2+ + MnO4- 5 Fe3+ + Mn2+
Tahap 6
5Fe2+ + MnO4- + 8H+ 5Fe3+ + Mn2+
Tahap 7
5Fe2+ + MnO4- + 8H+ 5 Fe3+ + Mn2+ + 4H 2O
Dalam Suasana Basa
Contoh :
Al + NO3- AlO2- + NH3
Tahap 1 :
Al + NO3- AlO2- + NH3
Tahap 2,3
Al + NO3- AlO2- + NH3
0 +5 +3 -3
Tahap 4 -8
+3
Tahap 5
8Al + 3 NO3- 8AlO2- + 3NH3
Tahap 6
8 Al + 3 NO3- + 5OH- 8AlO2- + 3NH3
Tahap 7
8Al + 3 NO3- + 5OH- + 2H2O 8AlO2- + 3NH3
Ekivalen Redoks
Suatu ekivalen oksidator adalah sejumlah oksidator
yang dapat menerima satu mol elektron
Suatu ekivalen reduktor adalah sejumlah reduktor
yang dapat menerima satu mol elektron
Contoh : KMnO4 berubah jadi Mn2+
2,3 RT (Oksidasi )
EE 0
log
nF ( reduksi)
E
D
B C
Chemical
energy
C B
A + C B + D + Heat
1 Syntheses
2
Muscular
contraksion
Exergonic
reactions E
Nervous
3 excitation
Active
transport
4
BIOENERGETIKA
ATP nukleotida , mengandung adenin , ribosa dan
tiga gugus phosfat
Dua dari tiga phosphatnya adalah an hidrida phosfat
Berfungsi seb agai kompleks dengan Mg
Depot ATP /ADP kecildikonsumsi terus menerus
dibentuk dengan kecepatan tinggi
Sumber utama gugus phosfat energi tinggi :
1. Fosforilasi oksidatif
2. Glikolisis
3. Siklus krebs
Table. Standard free energy of hydrolysis of some
organophospates of biocemical importance.
GO
COMPOUND
kJ/mol Kcal/mol
Phosphoenolpyruvate -61.9 -14.8
Carbomoyl phosphate -51.4 -12.3
1,3-Bisphophoglycerate -49.3 -11.8
(to 3-phosphoglycerate) -43.1 -10.3
Creatine phosphate
ATP ADP + Pi -30.5 -7.3
ADP AMP + Pi -27.6 -6.6
Pyrophosphate -27.6 -6.6
Glucose 1-phosphate -20.9 -5.0
Fructose 6-phosphate -15.9 -3.8
AMP -14.2 -3.4
Glucose 6-phosphate -13.8 -3.3
Glycerol 3-phosphate -9.2 -2.2
OKSIDASI BIOLOGI
OXIDA OXIDA
SE SE
A H2O A H2O2
(OX A B
)
Tidak menggunakan O2
Punya 2 fungsi utama :
1. Pemindah ion H dalam reaksi oks-red
spesifik untuk substratnya, tapi menggunakan
ko-enzym bersama reversibel
pada reaksi oksidasi fase an-aerob
2. Komponen rantai respirasi
Dehidrogenase
Dehidrogenase dengan ko-enzym NAD
-enzym spesifik dengan ko-enzym NAD atau
NADP (dibentuk dari niacin)
-ko-enzym dapat berdissosiasi bebas dari
apoenzym
-umumnya mengkatalisa reaksi oks-red dalam
metabolisme oksidatif ( glikolisis , TCA cycle , rantai
respirasi )
-enzym-NADP untuk sintesa reduktif (
sintesa asam lemak dan steroid ) dan PMP-
shunt
Dehidrogenase
A Carrier-H2 B
(OX) (Red (OX)
)
DEHYDROGENASE DEHYDROGENASE
SPECIFIC FOR A SPECIFIC FOR B
Peroksidase
Mereduksi peroksida menjadi air butuh akseptor
elektron lain (vit c, quinon, sit c):
H2O2 + AH2 2H2O + A
Terdapat pada tumbuhan, susu, eritrosit leukosit,
trombosit dan jaringan yang aktif dalam
metabolisme eikosanoid
Glutathion peroksidase dengan Se
menghancurkan H2O2 dan hidroperoksida lipid
melindungi membran dan Hb
Katalase
Menggunakan H2O2 sebagai donor dan
akseptor elektron:
2 H2O2 2H2O + O2
Selain sebagai peroksidase, Katalase dapat
menggunakan satu molekul H2O2 sebagai donor
elektron dan satunya lagi sebagai akseptor
elektron
Menetralisir produk oksidase (terdapat bersama di
banyak jaringan: darah, sst, mukosa, ginjal, liver)
AH2 A
AH2
A
H2O2 O2
MATRIX
Sonication
Cristae
INNER
MEMBRANE
OUTER
MEMBRANE
Submitochondrial particel
Formed from fragments of
the inner membrance
Rantai pernapasan
Inhibitor phosforilasi
contoh : oligomycin , atraktilosida
Un-couplers ( pemutus rangkaian oksidasi dan
phosforilasi )
contoh : dinitrophenol , dinitrokressol ,
pentachlorophenol , chloro carbonil cianida
phenilhidrazon ( cccp )
FAD
Succinate
FeS
H2S
BAL CO
Antimycin A CN -
Piericidin A
Amobarbital
Rotenone Uncouplers
Uncouplers
Oligomycin
Oligomycin
MITOCHONDRION
CYTOSOL
NAD+
Glycerol 3- Glycerol 3-
phosphate phosphate
FAD
GLYCEROL-3- GLYCEROL-3-
PHOSPHATE PHOSPHATE
DEHYDROGENASE DEHYDROGENASE
(CYTOSOLIC) (MITHOCONDRIAL)
Dehydroxyacetone Dehydroxyacetone
NADH + phosphate FDH2
phosphate
H+
Respiratory Chain
MALATE MALATE
DEHYDROGENASE DEHYDROGENASE
NADH NADH
+H+ Oxaloacetat -KG -KG Oxaloacetat +H+
e e
TRANSAMI TRANSAMI
NASE NASE
Glutamate Asp Asp Glutamate
H+ H+
P N CREATINE H2N
KINASE
C NH C NH
N H3C N
GO = 12.6
COO- kJ/mol COO-
Creatine
Creatine
phosphate
Siklus asam sitrat
Siklus krebs atau siklus asam trikarboksilat
Rangkaian reaksi di mitokondria mengoksidasi
asetil ko-A ko-enzym tereduksi substrat bagi
rantai respirasi
Berfungsi: lintasan akhir oksidasi aerobik untuk
karbohidrat, lipid dan protein
Berperan penting: glukoneogenesis, lipogenesis
dan transaminasi asam amino
Berlangsung di semua jaringan (fungsi
oksidasi), paling sempurna pada liver
Siklus asam sitrat
Melalui 8 tahapan reaksi: Asetil ko-A dan
oksaloasetat sitrat, pembentukan kembali
oksaloasetat pada akhir reaksi
Oksaloasetat berperan sebagai katalitik
Enzym: citrat synthase, aconitase, isocitrat d-ase,
ketoglutarate d-ase, succinate thiokinase,
succinate d-ase, fumarase, malat d-ase
Enzym siklus krebs juga ada di sitosol, kecuali:
ketoglutarate d-ase dan succinate d-ase
(membran dalam mt)
Citric acid cycle
Siklus asam sitrat
1. Asetil ko-A + OA + H2O sitrat + co-A + H+
(citrate synthase, irreversibel)
2. Sitrat cis aconitat + H2O isositrat
(aconitase)
3. Isositrat + NAD+ ketoglutarat + CO2 + NADH
(isositrat d-ase, Mg, Mn)
4. ketoglutarat + NAD+ + co-A succinyl co-A +
NADH + CO2 ( ketoglutarat d-ase)
5. Succinyl co-A + Pi + GDP succinate + co-A +
GTP (succinate thiokinase)
Siklus asam sitrat
6. Succinate + FAD fumarate + FADH2 (succinate
d-ase)
7. Fumarate + H2O malate (fumarate hidratase /
fumarase)
8. Malate + NAD oksaloasetat + H+ + NADH
(malat d-ase)
Dua CO2 dibebaskan
Terbentuk 3 NADH dan 1 FADH2 11 ATP
Satu ATP / GTP dihasilkan dari fosforilasi tingkat
substrat
Siklus asam sitrat
Diregulasi: O2, NAD, FAD, ADP, Ca++
Peran vitamin B:
riboflavin: FAD ketoglutarat d-ase, succinate d-
ase
Niacin: NAD isositrat d-ase, ketoglutarat d-ase,
malate d-ase
thiamin: thiamin difosfat ketoglutarat d-ase
asam pantotenat: struktur co-A
Peran dalam metabolisme
Amfibolik oksidatif (katabolik) dan sintesa
(anabolik)
Glukoneogenesis: senyawa antara siklus berpotensi
glukogenik (dari oksaloasetat glukosa)
fosfoenolpiruvat karboksikinase
Substrat glukoneogenesis:
Laktat
Glycerol
Asam amino glukogenik
propionat
Peran dalam metabolisme
Transaminasi oleh aminotransferase:
- Senyawa antara siklus sumber rangka karbon
sintesa asam amino non essensial (reversible
membentuk senyawa antara siklus)
Piruvat alanin, Oksaloasetat aspartat,
ketoglutarat glutamat
Transaminasi melibatkan 2 asam amino
dan 2 asam karboksilat :
aspartat + piruvat OA + alanin
glutamat + piruvat ketoglutarat + alanin
Peran dalam metabolisme
Asetil ko-A bahan baku utama sintesa asam
lemak rantai panjang (lipogenesis)
Berlangsung diluar mitokondria lebih dulu
membentuk sitrat di sitosol kembali menjadi
asetil ko-A oleh ATP citrate lyase
Enzym kunci siklus krebs:
Citrate synthase
Isocitrate d-ase
ketoglutarat d-ase
General Principles of
Pharmacology
Cases
Discussion/Questions
Pharmacokinetics (PK) &
pharmacodynamics (PD)
Plasma Site
Dose Concen- of Effects
tration Action
PK PD
Pharmacokinetics vs
Pharmacodynamicsconcept
Fluoxetine increases plasma concentrations of
amitriptyline. This is a pharmacokinetic drug
interaction.
Volume 100 L
Clearance
10 L/hr
Volume of Distribution, Clearance and
Elimination Rate Constant
V
V2
Cardiac and
Skeletal Muscle
Clearance
10 L/hr
V2
Cardiac and
Skeletal Muscle
V
Volume 100 L (Vi)
Clearance
10 L/hr
Volume of Distribution =
Dose_______
Plasma Concentration
V2
Cardiac and
Skeletal Muscle
V
Volume 100 L (Vi)
Clearance
10 L/hr
Clearance =
Volume of blood cleared of drug per unit time
V2
Cardiac and
Skeletal Muscle
V
Volume 100 L (Vi)
Clearance
10 L/hr
Clearance = 10 L/hr
Volume of Distribution = 100 L
What is the Elimination Rate Constant (k) ?
CL = kV
k = 10 Lhr -1 = 0.1 hr -1
100 L
Dose = Cp(Target) x VD
Question
What Is the is the loading dose required fro drug A
if;
Target concentration is 10 mg/L
VD is 0.75 L/kg
Patients weight is 75 kg
Exponential decay
dC/dt C
= -k.C
C2
Time
Log Concn.
C0
C0/2
t1/2
t1/2
t1/2
Time
Time to eliminate ~ 4 t1/2
Integrating:
Cp2 = Cp1.e-kt
Logarithmic transform:
lnC2= lnC1 - kt
logC2 = logC1 - kt/2.303
Elimination Half-Life:
t1/2 = ln2/k
t1/2 = 0.693/k
Steady-State
Steady-state occurs after a drug has been given for
approximately five elimination half-lives.
At steady-state the rate of drug administration
equals the rate of elimination and plasma
concentration - time curves found after each dose
should be approximately superimposable.
Accumulation to Steady State
100 mg given every half-life
194 200
187.5
175
150
100
97 100
87.5 94
75
50
C
Cpav