Kuliah 5 - 6
Protein
Pendahuluan : Gen
6
Protein
Pendahuluan: Kromosom, DNA dan Gen
7
Gene expression?
- Transkripsi: sintesis
RNA dari DNA
template
- Translasi: formasi
sebuah protein
(rangkaian asam
amino) dari RNA
Dogma molekuler: Gene expression dari Gen ke
Protein (Gen – mRNA - Protein)
11
Berlaku di
semua sel baik
prokariot
maupun
eukariot
12
Ekspresi Gen di Prokariot vs Eukariot
13
Operan lac merupakan salah satu organisasi gen pada prokariot untuk
menghasilkan enzim β-galaktosidase.
Operon lac terdiri dari 3 gen struktural: lac Z, lac Y, lac A.
Proses transkripsi pada prokariot akan menghasilkan satu mRNA yang
membawa kode genetik untuk polipeptida yang berbeda beda,
disebut mRNA polisistik.
Ekspresi gen pada Prokariot (Cont.)
17
31
a.
(Capping)
Penambahan Cap pada ujung 5’ (Capping)
b. Penambahan
b. Penambahan basa Adenin basa Adenine
(Polyadenilation)
Pemotongan intron (Splicing)
c.
(Polyadenilation)
c. Pemotongan intron (Splicing)
a c b
a. Penambahan Cap pada ujung 5’
a. Penambahan
(Capping)Cap pada ujung 5’ (Capping)
33
A A A AA A
c. Pemotongan intron (Splicing)
Pada tahap ini intron
c. Pemotongan enzim(Splicing)
restriksi
35
memotong bagian intron, selanjutnya
bagian exonini
Pada tahap disatukan dengan
enzim restriksi enzim
memotong bagian
ligasi menjadi
intron, messenger
selanjutnya bagian exon RNA. Intron
disatukan dengan
enzim
yang ligasi menjadi
sudah dipotongmessenger
diurai RNA.
lagi
menjadi basa,
Intron yang dan
sudah digunakan
dipotong diurai untuk
lagi menjadi basa,
pembentukan
dan digunakanRNA untuk berikutnya.
pembentukan RNA berikutnya.
Pemrosesan RNA Overview
36 Coding Strand
Template Strand
Exon Intron Exon
hnRNA Strand
a. Capping
mGppp
b. Polyadenilation
mGppp AAAAAA
c. Splicing
mGppp AAAAAA mRNA Strand
Sintesis Protein/Translasi
37
MWNDCEQHKFYIAGPTVRLS
Ujung awal rantai asam amino (M) disebut ujung Nitrogen (N-terminal),
Ujung
sedangkan awal
ujung rantai
asam amino asam
oleh stop kodon amino
(S) disebut ujung
(M) (C-terminal).
karboksil disebut ujung Nitrogen
sedangkan ujung asam amino
sebelum terhenti oleh stop
codon disebut ujung carboxyl
40
41
Regulasi transkripsi
Jika suatu protein (yang dikodekan oleh gen) diperlukan, maka
gen akan ditranskripsi
Jika suatu protein (yang dikodekan oleh gen) Tidak diperlukan,
maka gen akan Tidak akan ditranskripsi
Unit Transkripsi pada Bakteri
45
Operon
promoter
operator
-35 TTGACA
-10 TATAAT (Pribnow box)
Regulasi Gen pada Bakteri
46
Regulasi transkripsi
Regulasi translasi
Regulasi transkripsi
Jika suatu protein (yang dikodekan oleh gen)
diperlukan, maka gen akan ditranskripsi
Jika suatu protein (yang dikodekan oleh gen) Tidak
diperlukan, maka gen Tidak akan ditranskripsi
Regulasi pada Transkripsi
47
(allolactose)
(lac repressor) (can’t bind)
o
Regulasi Lac operon
50
Biosynthetic
complex Operons
(Trp Operon)
Aktivasi & Deaktivasi Operon
52
effector
inactive
Activator
complex
Lac Operon
53
Regulation
Regulation Gene
Operon Lac
Trp Operon
54
55
Regulasi Eukariot
Regulasi Transkripsi Eukariotik
56
Sifat unik dari sel itu disebabkan oleh ekspresi gen-gen spesifik yang
terkandung dalam sel tersebut
cell-specific expression
tissue-specific expression
Levels of Control of Gene Expression in
Eukaryotes
65
mRNA
Cells can control the
rate of translation of
particular mRNAs.
Cells can 3 translation
activity of
protein
Cells can regulate
enzymes.
4 modification a protein’s activity
substrate
active
by modifying it.
protein
product 5 degradation Cells can regulate
amino a protein’s activity
acids
70
by degrading it.
Figure 10-11 Biology: Life on Earth 8/e ©2008 Pearson Prentice Hall, Inc.
How are genes controlled in eukaryotes?
71
• Histone
Acetylation
Methylation – neutralizes
Promotes (+) charges on tails,
condensation
• which prevents binding
Phosphorylation cantoprevent
adjacent nucleosome if
condensation,
loose chromatin structure
phosphorylation results,
is adjacent allowing
to methyl for
group
increased transcription
Pre-Transcriptional Regulation
75
RNA Processing
– differential/alternative splicing can produce different 20 mRNA
transcript
Initiation of Translation
- can be blocked by regulatory proteins that prevent ribosome
binding
- shortened polyA tails in mRNA prevents translation (polyA tails can
be added during appropriate time)
- global regulatory control of all mRNAs in cell
Post-Translational Regulation
80