TRANSPOSISI DAN RETROPOSISI

• Transposisi didefinisikan sebagai perpindahan materi genetik dari satu

lokasi kromosom, lokasi donor, ke lokasi target lainnya
• dua jenis transposi dibedakan oleh apakah elemen transposable
direplikasi atau tidak
Transporsable element
• TRANSPOSABLE ELEMENTS
• Menurut mode transposisi dan jumlah serta jenis gen yang
dikandungnya, elemen transposable dapat diklasifikasikan menjadi
tiga jenis:
1. urutan penyisipan,
2. transposon, dan
3. elemen retro
Urutan penyisipan

• Urutan penyisipan adalah elemen transposable yang paling

sederhana. Mereka tidak membawa informasi genetik kecuali yang
diperlukan untuk transposisi. Urutan penyisipan biasanya panjang
700-2.500 bp dan telah ditemukan pada bakteri, bakteriofag, plasmid,
dan tanaman.
Representasi skematis dari empat elemen
transposable pada bakteri
Transposons

• Transposon adalah elemen bergerak, biasanya sekitar 2.500-7.000 bp,

yang sebagian besar ada sebagai keluarga sekuens berulang yang
tersebar dalam genom. Transposon dibedakan dari urutan penyisipan
dengan juga membawa apa yang disebut gen eksogen, yaitu gen yang
menyandikan fungsi selain yang terkait dengan transposisi
Taksonomi, perkembangan, dan kekhususan target
transposisi
• Beberapa elemen seluler dapat mengubah posisi dirinya dalam semua sel;
yang lain sangat spesifik. Sebagai contoh, unsur-unsur THc dalam
nematoda Caenorhabditis elegans dan unsur-unsur P dalam D.
melanogaster biasanya hanya bergerak dalam sel-sel benih. Pada jagung,
transposisi banyak elemen ditemukan diatur oleh tahap perkembangan
inang. Dari sudut pandang evolusi, waktu perkembangan transposisi sangat
penting, karena ini mempengaruhi penyebaran elemen transposable ke
generasi mendatang. Salah satu contoh terkait melibatkan elemen
transposable LINE-1 (LI) pada mamalia. Branciforte dan Martin (1994)
menemukan bahwa unsur-unsur ini sangat aktif selama dua tahap meiosis
(leptotene dan zygotene), di mana terjadi kerusakan untai DNA. Ini
menawarkan peluang bagi elemen transposable untuk memasukkan diri ke
situs baru.
Otonomi transposisi

• Urutan penyisipan dan transposon adalah elemen seluler otonom

dalam arti mengandung gen untuk transposase yang diperlukan
dalam proses transposisi. Beberapa elemen transposable adalah non-
otonom, yaitu, mereka tidak menyandikan transposase, dan bergerak
berdasarkan kemampuan mereka untuk menggunakan transposase
dari elemen seluler otonom. Sebagai contoh, elemen Ac (Activator)
otonom dalam jagung dapat ditransposisikan terlepas dari latar
belakang genetik. Sebaliknya, elemen Ds (Dissociation) yang tidak
otonom tidak dapat ditransformasikan kecuali satu atau lebih salinan
Ac juga ada dalam genom jagung
RETROELEMENTS

• Retroelemen adalah urutan DNA atau RNA yang mengandung gen

untuk enzim reverse transcriptase, yang mengkatalisis sintesis
molekul DNA dari cetakan RNA. Molekul DNA yang dihasilkan disebut
DNA komplementer (cDNA
Retroviruses

• Retrovirus adalah virus RNA yang memiliki struktur yang mirip dengan
transposon. Meskipun mereka adalah yang paling kompleks dari
semua elemen retro
• Retroposon dan retrotransposon
• Retroposon dan retrotransposon adalah elemen transposabel yang
tidak membangun partikel virion: mereka tidak memiliki gen env, dan
karenanya, tidak seperti retrovirus, tidak dapat secara mandiri
memindahkan diri melintasi sel
Siklus hidup retrovirus
Perbandingan struktural retroelemen
transposabel
Struktur lokus retron dan sintesis multicopy
single-stranded DNA (msDNA).
Retrons

• Retron adalah retroelements yang paling sederhana Mereka tidak

memiliki kemampuan untuk berubah. Retron telah ditemukan di
beberapa genom bakteri serta dalam genom mitokondria dan plastid.
Retron muncul sebagai salinan tunggal gen dalam genom banyak
bakteri
• Pararetroviruse
• Pararetrovirus, seperti virus hepatitis-B (virus hepaDNA) dan virus
mosaik kembang kol (caulimovirus), adalah virus DNA sirkular
beruntai ganda atau sebagian beruntai ganda.
Representasi skematik dari genom
pararetrovirus hepatitis-B untai ganda
Asal usul evolusi retroelements

• Fakta bahwa transkriptase balik dari semua elemen memiliki identitas

asam amino satu sama lain menunjukkan asal evolusi yang sama.
Karena kesederhanaan reton sebagai kebalikan dari kompleksitas
retrovirus, menyarankan bahwa jalur evolusi beralih dari reton ke
retroposon ke retrotransposisi ke retrovirus ke pararetrovirus. skema
evolusi ini sebagian besar ditandai oleh peningkatan progresif dalam
struktur kompleksitas tural dari elemen-elemen retro.
Representasi skematis afinitas filogenetik di
antara retroelements.