ACARA 1 ENERGI INTERAKSI ION LOGAM DENGAN AIR 1. Tujuan Menghitung energi interaksi ion loga Na!

a! "engan air

Mengga #arkan kur$a energi interaksi terha"a% $ariasi jarak ion loga & air

'.

Dasar teori enggunakan hasil ki ia enghitung si*at&si*at elakukan si ulasi %rogra ko %uter untuk

Ki ia ko %utasi a"alah (a#ang il u ki ia )ang teori )ang "iterje ahkan ke "ala terha"a% siste &siste kristal (air- "an

olekul "an %eru#ahann)a. Ki ia ko %utasi "a%at %ula #esar +atau #an)ak enera%kan %rogra terse#ut %a"a siste

olekul %rotein gas, %a"atan, (airan, "an ki ia n)ata. Contoh si*at& uatan, #esar

si*at )ang "ihitung antara lain struktur aato , energi "an selisih energi, Si ulasi terha"a% #isa akro olekul +se%erti %rotein "an asa nukleat- "an s)ste

o en "i%ole, kereakti*an, *rekuensi getaran, "an #esaran s%ektrosko%i lainn)a. en(aku% kajian kon*or asi olekul "an %eru#ahann)a + isaln)a %roses akrosko%ik +se%erti "an olekul. Istilah ki ia ko %utasi e aha i ki ia + self

"enaturasi %rotein-, %eru#ahan

assa, serta %era alan si*at&si*at

kalor jenis- #er"asarkan %erilaku tingkat ato Interaksi antar olekul #agai ana ato "an organization- +Karlstro

sering "igunakan juga se#agai il u ko %uter "an ki ia. +.rianto, '//0eru%akan lan"asan %enting "ala suatu siste olekul #erorganisasi "ala

an" 1onsson, '//23 Sokalski an" Les4(4)nski, '//5-. enentukan si*at&si*at gas, (airan, %a"atan "an siste #iologi. .otensial antar olekul olekul +Sokalski an" e #entuk geo etri

Interaksi antar olekul #er%eran "ala #ergantung %a"a koor"inat internal )ang Les4(4)nski, '//5-.

olekul %en)usun +self asembly- "ala

.otensial Lennar"&1ones "i#erikan %ersa aan se#agai #erikut6 78957+:r-1';+:r-<=

"i

ana 8 a"alah %otensi antar olekul antara "ua ato

atau

olekul. >

a"alah ke"ala an "an ukuran se#era%a kuat "ua %artikel a"alah jarak "i

enarik satu sa a lain. : en"a%atkan

ana %otensi antar olekul antara "ua %artikel a"alah nol. :

e #erikan %engukuran se#era%a "ekat "ua %artikel non#on"ing #isa

"an "engan "e ikian "ise#ut se#agai ra"ius 8an "er ?alls. @al ini sa a "engan satu&setengah "ari jarak antara %artikel antar inti non#on"ing. Dan terakhir, r a"alah jarak %e isahan antara ke"ua %artikel +"iukur "ari %usat satu %artikel ke %usat %artikel lain-+Ro)er,1A<BC. Masuk Cara kerja ke %rogra @)%er(he . Cursor "iteta%kan se#agai "raD enu,lalu klik "ua kali %a"a hingga enu "raD hingga un(ul kotak

+ engga #ar- %a"a

susunan #erkala unsur "an %ilih ato %a"a (an$as ga #ar @)%er(he "ala #entuk lingkaran o"el #uil",hingga air terse#ut. 1ika %a"a %osisi Na

oksigen se#agai (ursor. Cursor "iklik satu kali un(ul satu ato oksigen %a"a kan$as enu #uil",lalu klik a"" @ an"

erah. Masuk ke "ala

un(ul sen)aDa air. .eriksa ke #ali ke#enaran ga #ar sen)aDa asih salah ulangi engga #ar. 1ika #enar, si %an ga #ar %a"a loga Na,lalu te %atkan ato Na engatur

*ol"er kerja an"a. Cursor "iganti se#agai ato en"ekati ato jarak Na&air %a"a ga #ar. Ke u"ian Masuk ke o%tion "an )ang "ihitung. S%in asukkan

oksigen "engan jarak 1 angstro ,"enngan en)i %an ga #ar

o"el s)ste . Masuk ke

enu setu%, lau klik %a"a a# initio. Mini u

#asis set "i%ilih se#agai %erhitungan. ulti%li(it) sesuai "engan s)ste en)i %an

uatan "an s%in

ulti%li(it) 9 's ! 1,"engan harga s E untuk satu ele(tron tak enu *ile lalu klik %a"a start log "an *ol"er an"a untuk e ilih single %oint %a"a en(atat se ua %erhitungan an"a. enu (o %ute, "engan

#er%asangan. Masuk ke"ala "engan na a *ile tertentu "ala

Energ) ko %leks "ihitung "engan +angstro . ol-, ke aksi u

%ara eter #erikut6 algorit a 9 %olka&ri#iere, RMS gra"ient 9 /,/1 kkalF siklus 9 1//,in $a(uo. Setelah %erhitungan selesai )ang asuk ke #ali "i(atat "ari *ile hasil start log )ang "itan"ai "engan a"a "ata energ) %a"a #agian kiri #aDah kan$as, lalu enu *ile lalu klik sto% log. Energ) s)ste

an"a #uat. Energ) single %oint "ihitung untuk "engan (ara engha%us

asing G

asing ion Na! "an

olekul

air %a"a koor"inat struktur ko %leks ion Na! "engan air. Energ) ion Na! "ihitung olekul air %a"a struktur ko %leks Na&air, lalu enghitung single %oint. Energ) air "a%at "ihitung "engan (ara ko %leks Na&air,lalu engha%us ion Na! %a"a struktur engga #ar

enghitung single %oint. .erhtungan "iulangi untuk jarak

antara ion Na! "engan air a"alah ',23<3 "an 1/ angstro ,ke u"ian kunr$a energ) interaksi terha"a% jarak ion Na! "engan air. 5. 5.1. a. @asil "an %e #ahasan Data %enga atan Struktur ion ko %leks Na&air %a"a jarak 1 angstro

#. Struktur ion ko %leks Na&air %a"a jarak ',2 angstro

(. Struktur ion ko %leks Na&air %a"a jarak < angstro

". Struktur ko %leks ion Na&air %a"a jarak 1/ angstro

5.'.

.erhitungan Einteraksi 9 7Eko

%leks Na&air

= G 7ENa! = G 7Eair=

1arak 1 angstro 7Eko

%leks Na&air

= 9 &15<2/1.A15'

7ENa! = 9 &1//'<<.C<01 7Eair= 9 &50/CB.2<0'B Einteraksi 9 B/C./'/'C<C 1arak ',2 angstro 7Eko
%leks Na&air

=9 &150CC/.<C<<

7ENa!=9 &1//'<<.C<01 7Eair=9 &50/CB.2<0'B Einteraksi 9 &'2.0/''15< 1arak < angstro 7Eko
%leks Na&air

=9 &150C/0.A0'B

7ENa!=9 &1//'<<.C<0' 7Eair=9 &50/CB.2<0'B02 Einteraksi 9 &C./CBC0/C 1arak 1/ angstro

7Eko

%leks Na&air

=9 &150C/<./2<

7ENa!=9 &1//'<<.C<0' 7Eair=9 &50/CB.2<0C Einteraksi 9 &1.1'12C<C

5.C.

.e #ahasan ialah suatu %rogra si ulasi "an %e o"elan olekular )ang a(a o"el, "an

@)%erChe untuk stu") ekanika "ina ika

e ungkinkan %erhitungan ki iaDi )ang ko %leks. So*tDare ini "a%at "igunakan engga #ar struktur ki ia, o%ti asi geo etri "engan #er#agai ole(ular "ina ik "asar, stu") HSAR, "an lain&lain. @)%erChe ekanika kuantu olekuler "engan *asilitas ani%ulasi "an $isualisasi struktur. si ulasi u"ah.

engko #inasikan ke a %uan o%ti asi untuk teknik

olekul "an %engaturan )ang sesuai kehen"ak %engguna, "engan %rogra enentukan struktur sta#il "engan (ara )ang olekul eru%akan langkah %erhitungan )ang

@)%erChe , kita "a%at %aling u u

.enentuan struktur )ang sta#il "ari terja"i %a"a %e o"elan )ang #er#e"a akan .raktiku "an h)%er(he

olekul. Energi relati* "ari struktur tero%ti asi

enentukan kesta#ilan kon*or asi, kesei #angan iso erisasi, enentukan energ) interaksi antara ion loga asing energ) "ari ko %leks Na&air, Na!, "an

%anas reaksi, %ro"uk reaksi, "an #an)ak as%ek lain "ari ki ia+Sha#rina, '/11ini "ilakukan untuk asing G enentukan kur$a %otensial Lennar&1ones. Setelah "iga #ar %a"a a%likasi "an "itentukan

air,akhirn)a "a%at "ihitung energ) interaksi "an "i #uat kur$a %otensial Lennar" G 1ones. Ierikut ta#el )ang su"ah "i#uat6
jarak 1.02491 2.56539 6.1784 Energi Naair -146501.9142 -147330.6366 -147307.9728 Energi Natrium -100266.3671 -100266.3671 -100266.3672 Energi air Energi interaksi 803.0202 -47038.56728 363 25.70221 -47038.56728 46 3.038370 -47038.56729 3

10.1842

-147306.056

-100266.3672

-47038.5673

1.121536 3

Iisa "ilihat %erhitungan energ) interaksi "ilakukan "ala antara ion loga "i#uat6 Na! "engan air. setelah "a%at energ) interaksi,

#er#agai jarak aka selanjutn)a

e #uat kur$a %otensial Lennar" G 1ones. Ierikut kur$a Lennar" G 1ones )ang telah

Gra*ik Lennar" G1ones "i atas

engga #arkan hu#ungan antara jarak enggunakan $ariasi jarak enggunakan selisih ' sta#il.

interaksi "engan energi interaksi geo etri "engan titik. Se akin "ekat interaksi engaki#atkan energi interaksi

interaksi. .erhitungan $ariasi jarak interaksi "ilakukan "engan en(a%ai aksi u

aka akan terja"i ga)a tolak& enolak )ang )ang #erarti #elu engurangi ga)a tolak antarinti engenai interaksi

Dengan a"an)a %ena #ahan jarak interaksi akan

au%un antarelektron hingga "i(a%ai kesta#ilan %a"a jarak interaksi tertentu "engan energi #ernilai negati$e sesuai "engan gra*ik Lennar"&1ones antar olekul+ikatan hi"rogen "an $an "er ?aals-, "i ana %a"a jarak)ang jauh #elu terja"i interaksi, ke u"ian terja"i tarik& enarik "ari interaksi $an "er ?aals, "an %a"a jarak )ang "ekat terja"i tolak& enolak )ang kuat+@asanah, N., et al, '/1C-. .otensial Lennar" & 1ones eru%akan *ungsi "ari jarak %usat antara "ua %artikel . Ketika "ua %artikel non#on"ing ter%isah "engan jarak )ang tak ter#atas ,

ke ungkinan

ereka "atang #ersa a&sa a "an #erinteraksi a"alah engatakan #ahDa energi %otensial ikatan enurun, ke ungkinan interaksi ereka ereka

ini al. Oleh

karena itu, kita "a%at

ereka a"alah nol. eningkat. .artikel

Na un, karena jarak %e isahan en"ekat #ersa a&sa a sa %ai %artikel terus

en(a%ai "aerah %e isahan "i ana "ua enurun "ari nol untuk

enja"i terikat "an energi %otensial ikatan enurun sa %ai %artikel ana energi %otensial ereka, en(a%ai ekuili#riu ini u

enja"i #ernilai negati* . Se entara %artikel terikat , jarak antara #agian %usat akan , )ang "itentukan oleh jarak eleDati jarak %e isah "i ter(a%ai + JCDa$is, '//2-.

1ika kita terus kesei #angan "ekat satu sa a lain untuk

en"orong "ua %artikel terikat #ersa a&sa a aka tolakan aka elektron ereka akan "i%aksa untuk or#ital

ulai terja"i , se#agai %artikel )ang #era"a ene %ati or#ital en(o#a

asing& asing . Oleh karena itu , tolakan terja"i karena setia% %artikel e %ertahankan ruang "ala antara ke"ua %artikel , energi %otensial ikatan %e isahan antara %artikel akan '//2-. .a"a energi %otensial ikatan, sta#ilitas suatu susunan ato *ungsi "ari jarak %e isahan Lennar"&1ones. 1arak %e isahan ekuili#riu sehingga energi %otensial %otensial )ang #esar se(ara energi ti"ak "isukai karena negati* "an ter#atas +ga)a ato atau %artikel ini u juga ereka

asing& asing . Meski%un ga)a tolak eningkat %esat se#agai jarak

enurun "i #aDah jarak kesei #angan+ JCDa$is, eru%akan

enurun "i #aDah

enja"i se akin %ositi* +ga)a tolak-. Energi enunjukkan tu %ang tin"ih eningkat hingga tak

or#ital ato . Na un, %a"a jarak %e isahan )ang %anjang, energ) %otensial a"alah en"ekati nol se#agai jarak %e isahan )ang enarik-. @al ini olekul enunjukkan #ahDa %a"a jarak )ang jauh, se%asang en(a%ai nilai

engala i ga)a %ensta#ilan )ang ke(il. .e isahan antara "ua

en(a%ai jarak se"ikit le#ih #esar "ari K, energi %otensial

+ga)a a"alah nol-. .a"a titik ini, %asangan %artikel )ang %aling sta#il "an orientasi itu sa %ai kekuatan eksternal )ang "i#erikan ke%a"a

akan teta% "ala

ereka+JCDa$is, '//2-.

2.

Kesi %ulan 1. Energ) interaksi ion loga ko %leks Na&air "ala angstro Na! "engan air "a%at "ihitung "engan Na!,air "an enentukan terle#ih "ahulu energ) "ari ion loga energ) interaksi ion loga C/CBC0/C "an &1,1'12C<C. '. Kur$a energ) interaksi terha"a% $ariasi jarak ion loga &air "a%at "i#uat setelah "i"a%atkan energ) interaksi ion loga "ala #er#agai jarak. "engan air

jarak 13',23< "an 1/ angstro . Di"a%atkan "engan air %a"a jarak 13',23< "an 1/

#erturut G turut se#esar B/C,/'/'C<C3&'5,0/''15<3&

<.

Da*tar %ustaka

@asanah, N., et al. '/1C. Studi Interaksi Segmen Trimer Kitosan dengan Asam Askorbat secara Komputasi Ab Initio dan Eksperimen. Che In*o6 8ol 1,No 1, @al '1/&'1A Karlstro , G., an" 1onsson, I., '//2, Intermolecular Interaction, Theoreti(al Che istr), Lun" Jni$ersit). .rianto, Ia)u, '//0, Pemodelan Kimia Komputasi, Ierita Dirgantara, 8ol.B, @ala an 1&'. Ro)er, Donal" 1., 1A<B, Bonding Theory, NeD Lork, NL.6M(GraD&@ill, In( Sha#rina, '/11, O%ti asi Struktur Molekul 7@)%erChe =, htt%6FFsha#rina& (he ist.#logs%ot.(o F'/11F1'Fo%ti asi&struktur& olekul.ht l +"iakses %a"a tanggal '/ Dese #er '/1CSokalski, ?. A., an" Les4(4)nski, 1., '//5, Molecular Material Interactions !Modelling and "esign#, %u#lishe" #) S%ringer ith Specific

JCDa$is.

'//2.

Lennar"&1ones

.otential.

A$aila#le

online

at6

htt%6FF(he Diki.u("a$is.e"uF.h)si(alMChe istr)FHuantu MMe(hani(sFAto i (MTheor)FInter ole(ularMNor(esFLennar"&1onesM.otential +Diakses tanggal '/ Dese #er '/1C-