Nukleosida:

Basa purin / pirimidin +

ribosa/deoksiribosa
Nukleotida:
Basa purin / pirimidin +
ribosa/deoksiribosa + fosfat
Esterifikasi terjadi antara ggs OH
pada C-5 ribosa/deoksiribosa dengan
ggs fosfat
Nukleosida monofosfat contoh: AMP
= Adenosin 5monofosfat
Nukleosida difosfat contoh: ADP
Nukleosida trifosfat contoh: ATP

 Rangkaian nukleotida, contoh:

A

3
P

3
P

3
P

OH
5

Trinukleotida : 5 - A-C-G- 3
pApCpG
ACG
Urutan basa ditulis dari 5 -3

 Pembentukan asam nukleat

RNA
ATP, UTP, GTP, CTP
RNA polimerase

RNA
DNA

dATP, dTTP, dGTP, dCTP

DNA polimerase
DNA

 RNA
T.d. 1 utas rantai
polinukleotida

DNA
T.d. 2 utas rantai
polinukleotida yang
membentuk struktur
double-helix

3
A

5
antiparalel

 DNA
2 utas double helix

RNA
t.d. 1 utas rantai
polinukleotida

T
G C
A
pur pir pur pir

Rantai lebih panjang

Deoksiribosa
Ikatan Hidrogen
A
T

Rantai lebih pendek

Ribosa.

G
C
Hukum berpasangan

RNA dan DNA

RNA
mRNA = messenger RNA
berisi kodon-kodon asam amino yang akan
dirangkai
tRNA = transfer RNA
Berbentuk seperti daun semanggi
Mempunyai bagian yang disebut antikodon
yang berpasangan dengan kodon asam amino
yang dibawa
Bertugas membawa a.a yang akan dirangkai
rRNA = ribosomal RNA
Komponen ribosom

EKSPRESI GEN
.

 EKSPRESI GEN
GEN --- mRNA --- polipeptida/ protein
TRANSKRIPSI

TRANSLASI

Upstream
Downstream
DNA 5 ------ ACTGCC ------ 3 utas coding
3 ------ TGACGG ------ 5 utas cetakan
mRNA 5 --- ACUGCC --- 3
tRNA
3-- UGA -- 5 (bgn antikodon)
Thr
(a.a yg dibawa)

 Utas coding = utas sense

Urutan nt di sini menentukan urutan a.a pada
rantai polipeptida yang dibentuk.
Kode genetik: 1 a.a dikode oleh urutan 3 nt
Urutan basa N dibaca dari 5-3
Utas template = utas cetakan
Sebagai utas cetakan bagi pembentukan mRNA
mRNA
Sesuai hukum berpasangan apabila di utas
cetakan tertulis A maka pada utas mRNA
tertulis U, apabila tertulis G maka pada utas
mRNA tertulis C
Urutan basa N dibaca dari 5-3
Satu kodon t.d 3 nt 1 asam amino

 Gen: suatu segmen DNA yang berisi informasi/

kode genetik urutan asam amino dari suatu rantai
polipeptida / protein
Gen: terdapat pada rantai DNA
Peta gen: menunjukkan letak gen pd rantai DNA
mRNA:
Urutan kodon (kode genetik pada mRNA)
menentukan urutan a.a yg akan dirangkai
Satu kodon terdiri dari 3 nukleotida (triplet)
Kode genetik bersifat hampir universal
Universal berarti kodon yang sama berlaku
untuk asam amino yang sama pada semua mahluk
hidup

 Total ada 43 = 64 kodon

3 kodon (UAA, UAG, UGA) : kodon
terminasi
Kodon inisiasi: AUG
(sebagian kecil organisme GUG)
Jumlah asam amino dasar penyusun protein
: 20, jadi banyak asam amino yang punya
lebih dari 1 kodon
Kodon pada mRNA akan dikenali oleh
antikodon pd tRNA yang akan membawa
asam amino yang sesuai dengan kodon
tersebut untuk dirangkai

mRNA urutan kodon

.

Transfer RNA (tRNA)

.

Organisme dg materi genetik RNA

Terdiri dari beberapa macam virus
yang :

Tidak pernah mentranskripsikan materi

genetik ke molekul DNA
Dapat mentranskripsikan materi
genetik ke dsDNA (cDNA)
E.reverse transkriptase
Diintegrasikan ke genom inang

acuan ekspresi gen RNA virus yang baru

MUTASI
.

MUTASI PADA TINGKAT GEN

Substitusi
Insersi (1 atau lebih)
Delesi (1 atau lebih)

MOLEKUL DNA EUKARIOT

Sebagian besar di inti (dalam kromosom)
DNA terikat protein
kromatin
+ DNA
+ Histon
+ Protein non histon
+ RNA (sedikit)

Di dalam mitokhondria (mengandung sedikit

gen)

Tidak mengandung histon,

Berbentuk sirkuler

rRNA prokariota
3 spesies rRNA :
rRNA 23 S
sub unit ribosom 50 S
rRNA 5 S
rRNA 16 S sub unit ribosom 30S

S (Svedberg) : koefisien sedimentasi

PEMATANGAN mRNA (Eukariot)

hn RNA (Eukariot)

PEMATANGAN mRNA (Eukariot)

Capping

PEMATANGAN mRNA (Eukariot)

.

REKOMBINASI KROMOSOM
PERLU PENJAJARAN KROMOSOM HOMOLOG

Organisme dg materi genetik RNA

Terdiri dari beberapa macam virus
yang :

Tidak pernah mentranskripsikan materi

genetik ke molekul DNA
Dapat mentranskripsikan materi
genetik ke dsDNA (cDNA)
E.reverse transkriptase
Diintegrasikan ke genom inang

acuan ekspresi gen RNA virus yang baru

PEMATANGAN mRNA (Eukariot)

.

JENIS MOLEKUL RNA

Messenger RNA (mRNA)

Transfer RNA (tRNA)
Ribosomal RNA (rRNA)
Pada eukariota juga ada :
snRNA (small nuclear RNA)

berperan pada proses splicing

Messenger RNA (mRNA)

Acuan (template) untuk sintesis protein
Berfungsi meneruskan informasi genetik
dari gen (DNA).
Berisi instruksi dlm penyusunan asam
amino
mRNA eukariot :
Ujung 5 ada topi 7 mGTP
Ujung 3 ada ekor poli A (20 200 A),
kecuali mRNA histon

Transfer RNA (tRNA)

Membawa aa aktif ke ribosom untuk
dirangkai menjadi rantai polipeptida
sesuai urutan pada mRNA
Minimal ada 20 jenis tRNA

Adaptor, memp. tempat spesifik

untuk :
mengikat aa
Mengenal nukleotida pada mRNA

Transfer RNA (tRNA)

Terdiri dari 70 90 nukleotida

Berbentuk daun semanggi

Ujung 3 : CCA
Gugusan OH atom C-3 adenosil
berikatan ester dg gugusan
karboksil asam amino
Banyak mengandung basa yang tidak
umum pada RNA (inosin, ribotimin,
pseudourasil, dihidrourasil)

Transfer RNA (tRNA)

Lengkung dihidrourasil (DHU) :

Pengenalan thd enzim aminoasil-tRNA

transferase

Lengkung antikodon :

Pengikatan dengan kodon (pada mRNA)

Lengan ekstra
Lengkung ribotimin-pseudourasil-sitosin
(TC) :
Pengikatan tRNA dengan ribosom

Ujung 3 : CCA

EKSPRESI GEN
.

Aktivasi dan pengikatan asam

amino pada tRNA
Terjadi di sitosol
E.aminoasil-tRNA sintetase
2 tahap :
Pengaktifan asam amino
Perlu ATP

Pengikatan aminoasil AMP ke tRNA

Terbentuk aminoasil tRNA (charge tRNA)

TRANSLASI
Perubahan bahasa dari urutan
nukleotida dari mRNA menjadi urutan
asam amino polipeptida
Lokasi : ribosom
Cetakan / template : mRNA
Pembawa asam amino ke ribosom :
tRNA

TRANSLASI

Terdiri dari 3 tahap :

Tahap inisiasi
Tahap elongasi
Tahap terminasi

TRANSLASI

Tahap inisiasi translasi

Pengikatan faktor inisiasi
(IF1,IF2,IF3) ke ribosom sub unit
kecil
Pengikatan mol.charge tRNA dan
mRNA ke ribosom sub unit kecil
Pembentukan kompleks inisiasi 70S

Tahap elongasi translasi

Pengikatan aminoasil tRNA
Pembentukan ikatan
peptida
Translokasi

PEMBENTUKAN IKATAN PEPTIDA

.

TAHAP ELONGASI TRANSLASI

.

KODE GENETIK
Terdapat di mRNA
Mengkode spesifisitas asam amino
penyusun protein
Terdiri dari 3 nukleotida (triplet)
kodon
Total ada 64 kodon
3 kodon (UAA, UAG, UGA) : kodon
terminasi
Hampir universal
Akan dikenal oleh antikodon pd tRNA

TAHAP TERMINASI TRANSLASI

Situs A ditempati stop kodon
Tak ada tRNA yang mengenali stop
kodon
Situs A ditempati release factor
Memicu pelepasan polipeptida dari
peptidil tRNA, pemecahan secara
hidrolitik
Kompleks ribosom pecah menjadi
komponen semula

TAHAP TERMINASI TRANSLASI

.

POLISOM
.

PEMATANGAN PROTEIN
Dapat terjadi :
Pelepasan ggs N-formil pada ujung
amino
Pelepasan metionin
Pemutusan rantai polipeptida
Reaksi oksidasi
Reaksi hidroksilasi
Pembentukan ikatan disulfida
Dan lain-lain

INHIBITOR SINTESIS PROTEIN

PADA PROKARIOT

ANTIBIOTIK
A

CARA KERJA

Streptomisin

Berikatan dg subunit ribosom 30S

shg menghambat inisiasi dan
menyebabkan salah baca mRNA

Tetrasiklin

Berikatan dg subunit ribosom 30S

dan menghambat pengikatan
aminoasil tRNA

Kloramfenikol

Berikatan dg subunit ribosom 50S

dan menghambat aktivitas
peptidiltransferase

INHIBITOR SINTESIS PROTEIN

PADA PROKARIOT DAN EUKARIOT

INHIBITO
R
Puromisin

CARA KERJA
Analog aminoasil-tRNA, shg
terjadi terminasi dini

Actinomisin D Mengikat DNA dan

menghambat gerakan RNA
polimerase, shg mencegah
transkripsi
Mitomisin

Terjadi iktan kovalen antara 2

INHIBITOR SINTESIS PROTEIN

PADA EUKARIOT
Sikloheksimid

menghambat aktivitas
peptidil transferase
ribosom sub unit 60 S