Roga F.

Kembaren
 PEPTIDA
Peptida: Polimer asam amino yang dihubungkan oleh
ikatan peptida
Ikatan peptida dibentuk melalui reaksi kondensasi
antara ujung -karboksil dengan salah satu asam
amino pada ujung -amino dari asam amino lainnya
Ikatan peptida merupakan ikatan kovalen

Lehninger Principles of Biochemstry,Fifth Edition

2008 W.H.Freeman and Company
 PEPTIDA
Peptida yang disusun oleh 2 sampai 20 asam
amino disebut juga oligopeptida
Peptida yang terdiri dari lebih 20 asam amino
disebut polipeptida.

Contoh Peptida:
- Antibodi
- Antibiotik antimicrobial peptide (AMP)
- Toxin racun pada jamur (amanitin)
- Hormon contoh: oksitokin (9 aa)
 PEPTIDA

Asam -amino yang bebas pada ujung rantai

disebut sebagai amino-terminal (N-terminal)
Ujung yang lain yang mengandung gugus
karboksil bebas disebut sebagai karboksil-
terminal (C-terminal)

Lehninger Principles of Biochemstry,Fifth Edition2008 W.H.Freeman and Company

 PEPTIDA
Ikatan peptida dapat diputuskan
dengan pereaksi kimia
hidrolisis oleh enzim

Enzim: memutuskan ikatan peptida pada urutan

asam amino tertentu
 PEMUTUSAN IKATAN PEPTIDA
Ikatan peptida dapat diputuskan
dengan pereaksi kimia
hidrolisis oleh enzim

Pereaksi Kimia - Cyanogen bromide

Memotong pada C-terminal dari internal
metionin .
Menghasilkan homoserin lakton pada ujung
C fragmen peptida.
Pemotongan oleh CnBr
 PEMUTUSAN IKATAN PEPTIDA
Enzim memutuskan ikatan peptida pada urutan
asam amino tertentu.
Trypsin- memotong pada C-terminal dari asam
amino dengan rantai samping bermuatan positif
Chymotrypsin- memotong pada C-terminal
asam amino dengan rantai samping gugus
aromatik.
Pepsin - memotong pada N-terminal dari asam
amino dengan rantai samping aromatik Phe,
Trp, dan Tyr.
 Setelah pemotongan dihasilkan campuran
fragmen-fragmen peptida
fragmen dapat dipisahkan dengan metoda
kromatografi
digunakan pereaksi berbeda untuk menentukan
struktur primer
 MUATAN TOTAL PEPTIDA

Yang memberikan sumbangan kepada muatan

total suatu peptida adalah:
gugus amino bebas
gugus karboksil bebas dan
rantai samping (R) asam amino yang dapat
diionisasi (gugus R bermuatan positif, negatif,
polar tidak bermuatan)
 MUATAN TOTAL PEPTIDA
Gugus amino bebas: pada N-terminal : +NH3
pK
+NH NH2
3
+1 0
pH < pK pH > pK

Gugus karboksil bebas : pada C-terminal: COOH

pK
COOH COO-
0 -1
pH < pK pH > pK
 MUATAN TOTAL PEPTIDA
Gugus R yang bermuatan positif: Lys, Arg, His

NHx+ NHx-1 +1 0

Lys: +NH NH2

3
+ pK
Arg : -C=NH2 NH +1 0
pH < pK pH > pK
His : NH+ N
 MUATAN TOTAL PEPTIDA
Gugus R bermuatan negatif

XH X-

Sistein: SH S-

Tirosin, Treonin, Serin, Glutamin : OH O-

pK
0 -1
pH < pK pH > pK