TUGAS LEARNING JOURNAL BIOKIMIA BLOK BIOMEDIK 1 TA 2020/2021
NAMA : Muhammad Al-Jabar Mutokhir Asshagab
NIM : K1A120062 TOPIK : Enzim Dan Koenzim
Definisi dan hal-hal yang terkait dengan enzim
1. Definisi Enzim Enzim adalah protein yang berperan dalam meningkatakan laju reaksi dengan menurunkan energi aktivasi. Enzim mengkatalisis hampir semua reaksi kimia yang berlangsung dalam sel tubuh. Selama reaksi enzim tidak berubah atau dikonsumsi, dan dapat digunakan kembali. 2. Hal terkait lain 1. Sisi aktif, yaitu daerah pada enzim dimana substrat menempel 2. Apoenzim, yaitu enzim yang memerlukan kofaktor namun tidak terdapat kofaktor yang terikat dengannya 3. Holoenzim, yaitu apoenzim yang disertai dengan kofaktornya juga dikenal sebagai bentuk aktif dari enzim 4. Gugus prostetik, merupakan senyawa organik yang berikatan kuat dengan apoenzim, dan selama reaksi berlangsung tidak akan dilepaskan, sulit terurai. 5. Spesifisitas enzim,
Menjelaskan Aktivasi Energi
Energi aktivasi adalah energi yang diperlukan untuk melakukan suatu reaksi kimia. Sejumlah besar energi diperlukan untuk memecah ikatan, jumlah energi yang diperlukan ini sering disebut hambatan energi (energi barrier). Energi yang diperlukan ini jarang disediakan molekul yang melakukan reaksi, sehingga diperlukan beberapa faktor untuk menghilangkan penghalang tersebut. Beberapa faktor tersebut adalah panas dan enzim. Pada reaksi biologis panas tidak efektif digunakan karena dapat merusak sel, sehingga harus menggunakan enzim.
Mekanisme Aksi Enzim
1. Mekanisme Aksi Enzim Asetilkolin Esterase Mekanisme Aksi Asetilkolin Esterase (ACE) yang memiliki nokleofil serin berupa intermediet asetil pada situs esteratik, serta jembatan garam yang meningkatkan pengenalan dan ikatan region trimetil amonium dari asetilkolin. Nukleofilik serin menyerang ikatan ester sehingga kolin terlepas dan intermediet asil enzim terbentuk. Air melepas asetat dari intermediet asil. Acetylcholine Choline + Acetic acid 2. Mekanisme aksi enzim invertase dalam memecah sukrosa menjadi glukosa dan fruktosa Invertase adalah enzim yang menghidrolisis (memecah) sukrosa (gula meja). Campuran yang dihasilkan dari fruktosa dan glukosa disebut sirup gula terbalik. Invertase dan sukrase menghidrolisis sukrosa untuk memberikan campuran yang sama dari glukosa dan fruktosa Invertase membelah ikatan O-C (fruktosa), sedangkan sukrase membelah ikatan O-C (glukosa). Untuk keperluan industri, invertase biasanya diperoleh dari ragi. Invertase juga disintesis oleh lebah, yang digunakan untuk membuat madu dari nektar. Suhu optimum invertase di mana laju reaksi paling besar adalah 60°C dan pH optimum 4,5. Akan tetapi, harga invertase relatif mahal, alternatif yang lebih baik untuk membuat fruktosa adalah dari glukosa menggunakan glukosa isomerase.
Menjelaskan Klasifikasi Enzim
1. Klasifikasi enzim berdasarkan tipe reaksi KELAS KELAS ENZIM TIPE REAKSI 1 Oksidoreduktase Reaksi reduksi oksidasi (transfer elektron dari satu substrat ke substrat lainnya)
2 Tranferase Transfer atom atau gugus dari satu substrat ke substrat
lain
3 Hidrolase Reaksi hidrolisis (pemecahan ikatan karena adanya air)
4 Liase Penambahan gugus fungsi pada ikatan rangkap (adisi) atau pemutusan ikatan rangkap dengan pelepasan gugus fungsi 5 Isomerase Reaksi isomerisasi (penyusunan ulang atom-atom substrat) 6 Ligase Pembentukan ikatan C-C, C-S, C-O, dan C-N diikuti dengan pemutusan isofosfat dari ATP 2. Klasifikasi subkelas enzim KELAS SUBKELAS TIPE REAKSI YANG DIKATALISIS Oksidoreduktase Oksidase Oksidasi substrat Reduktase Reduksi substrat Dehidrogenase Pelepasan atom hidrogen (H2) sehingga terbentuknya ikatan rangkap Tranferase Transaminase Transfer gugus amino antara substrat Kinase Transfer gugus fosfat antara substrat Hidrolase Lipase Hidrolisis gugus ester dalam lipid Protease Hidrolisis gugus amida dalam protein Nuklease Hidrolisis gugus fosfat dalam asam nukleat Liase Dehidrase Kehilangan air Dekarboksilase Kehilangan karbondioksida rangkap Isomerase Epimerase Isomerisasi pada pusat kiral substra Ligase Sintetase Pembentukan ikatan baru dengan melibatkan ATP Karboksilase Pembentukan ikatan baru antara substrat dan CO2 dengan melibatkan ATP