Mikroba tanah menghasilkan metabolit yang mempunyai efek sebagai zat pengatur tumbuh. Bakteri Azotobacter selain dapat menambat N juga menghasilkan thiamin, riboflavin, nicotin indol acetic acid dan giberelin yang dapat mempercepat perkecambahan bila diaplikasikan pada benih dan merangsang regenerasi bulu-bulu akar sehingga penyerapan unsur hara melalui akar menjadi optimal. Untuk memenuhi kebutuhan hidupnya mikroba tanah melakukan immobilisasi berbagai unsur hara sehingga dapat mengurangi hilangnya unsur hara melalui pencucian. Unsur hara yang diimobilisasi diubah sebagai massa sel mikroba dan akan kembali lagi tersedia untuk tanaman setelah terjadi mineralisasi yaitu apabila mikroba mati.
Pencucian bijih logam
Bakteri Thiobacillus ferrooxidans merupakan mikroorgisme yang berperan dalan bidang industri sebagai pemisah logam berat. Bakteri ini dapat memperoleh energinya dari oksidasi zat anorganik, yaitu besi dan belerang. Bakteri ini juga dapat tumbuh dengan subur dalam lingkungan tanpa adanya zat organik karena mampu mengekstrak karbon secara langsung dari karbon dioksida di atmosfer. Pemanfaatan mikrorganisme ini untuk memisahkan logam dari bijih logam yang diterapkan di tambang logam karena logam tidak bisa dimanfaatkan jika terikat dengan bijihnya.
Peranan bakteri dalam bidang pangan
Berikut beberapa peranan bakteri dalam bidang pangan: 1. rhizopus oryzae berperan dalampembuatan tempe. 2. aspergillus wentii/ aspergillus sojae berperan dalam pembuatan kecap. 3. lactobacillus sp berperan dalam pembuatan terasi. 4. pediococcus cerevisiae berperan dalampembuatan sosis. 5. neurospora sithopila berperan dalam pembuatan oncomkarena menghasilkan !arna merah dan orange. 6. saccaromyces cerevisiae berperan dalampembuatan roti dan tape. 7. accetobacter xylinum berperan dalam pembuatan nata de koko. 8. saccaromyces tuac berperan dalam pembuatan tuak. 9. saccaromyces ellipsoideus berperandalam fermentasi buah anggur menjadi minuman anggur. 10. aspergillus oryzae/ aspergillusniger berperan dalam merombak 'at pati dalam pembuatan minuman beralkohol.
Peranan bakteri dalam industri
1. Clostridium thermocellus berperan dalam pembuatan kertas. 2. Thermus aquaticus berperan menghilangkan rambut kulit dalam industri kulit. 3. Rhizobium radicicola dan Nitrosococcus berperan mengikat nitrogen pada industri pertanian. 4. Methanobacterium dan Methanobacillus berperan dalam pembuatan biogas.
Peranan bakteri dalam Kesehatan (probiotik)
1. Memperkuat sistem kekebalam tubuh 2. Mengurangi efek antibiotic 3. Mencegah peradangan 4. Mencegah eksim 5. Meredakan masalah pencernaan 6. Membersihkan saluran usus.