Laporan Resmi Praktikum Genetika

PENIRUAN PINDAH SILANG DAN PETA JARAK GEN

Disusun Oleh :
Partner 6B

Nama NIM
Windy Shafitri 180805015
Silvia Khairunnisa Syafriani 190805016
Muhammad faldhy Maliki 190805079
Anisyah Nasution 200805003
Devi Putricia Br. Purba 200805010
Lamriati Siringo-Ringo 200805017
Shafrida Hanim 200805032
Fernandes Antonius Simangunsong 200805062
Sevenris Tunggul Palentino Silaban 200805083
Siti Rahmayuni 200805085
Rafiqah Fitria Nasution 200805111
Laila Wulandari 200805115

LABORATORIUM GENETIKA DAN BIOLOGI MOLEKULER

PROGRAM STUDI BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SUMATERA UTARA
MEDAN
2022
Lembar Pengesahan

PENIRUAN PINDAH SILANG DAN PETA JARAK GEN

Disusun Oleh :
Partner 6B

Nama NIM
Windy Shafitri 180805015
Silvia Khairunnisa Syafriani 190805016
Muhammad faldhy Maliki 190805079
Anisyah Nasution 200805003
Devi Putricia Br. Purba 200805010
Lamriati Siringo-Ringo 200805017
Shafrida Hanim 200805032
Fernandes Antonius Simangunsong 200805062
Sevenris Tunggul Palentino Silaban 200805083
Siti Rahmayuni 200805085
Rafiqah Fitria Nasution 200805111
Laila Wulandari 200805115

Medan, Februari 2022

Asisten,

( Rinaldi Aripin )
 BAB 1
PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang

Semua organisme hidup secara fundamental memiliki kapasitas reproduksi.
Reproduksi adalah produksi generasi baru dari keturunan yang menyerupai generasi
orangtua. Ini melibatkan transfer informasi biologis dari generasi ke generasi baru
melalui telur dan sperma. Genetika adalah ilmu hayati yang berkaitan dan mendasari
penyebab kemiripan dan keakuratan reproduksi. Prinsip transmisi herediter adalah
prinsip utama kehidupan di bumi. Semua organisme mewarisi organisasi struktural
dan fungsional dari nenek moyang mereka. Apa yang diwarisi oleh keturunan belum
tentu merupakan salinan yang tepat dari induk. Gen adalah entitas unit warisan, basis
germinal untuk setiap karasteristik yang muncul dalam suatu organisme. Studi tentang
gen dan bagaimana mereka bekerja disebut ilmu genetika. Genetika telah
menunjukkan bahwa semua bentuk hidup menggunakan penyimpanan informasi yang
sama, transfer dan sistem penerjemahan. Dengan demikian ia telah memberikan
penjelasan untuk stabilitas semua kehidupan, dan kemungkinan keturunan dari bentuk
leluhur yang sama. Ini adalah salah satu konsep pemersatu yang paling penting di
biologi dan kehidupan genetik manusia (Verma, 2014).
Keterkaitan gen dalam kromosom dapat diwakili dalam bentuk peta genetik,
yang menunjukkan urutan linier gen di sepanjang kromosom berjarak sehingga jarak
antara gen yang berdekatan sebanding dengan frekuensi rekombinasi di antara mereka.
Peta genetik juga disebut peta keterkaitan atau peta kromosom. Konsep pemetaan
genetik pertama kali dikembangkan oleh mahasiswa Morgan Alfred H. Sturtevant pada
tahun 1913. Para ahli genetika awal memahami bahwa rekombinasi antara gen terjadi
dengan pertukaran segmen antara kromosom homolog dalam proses yang sekarang
disebut crossing-over. Setiap crossover dimanifestasikan secara fisik sebagai chiasma
atau konfigurasi berbentuk silang. Chiasma diamati dalam profase I meiosis. Setiap
chiasma hasil dari pemecahan dan bergabung kembali ke kromatid selama meiosis,
dengan hasil bahwa ada pertukaran segmen yang sesuai di antara mereka. Teori
crossing-over menjelaskan bahwa pada setiap chiasma dapat menghasilkan asosiasi
baru sebagai penanda genetik (Hartl, 2020).
1.2 Tujuan Praktikum
Adapun tujuan praktikum ini adalah :

a. Untuk memahami dasar genetika pindah silang (crossing over) sebagai

mekanisme penting dalam kombinasi baru gen.
b. Untuk melakukan simulasi berbagai bentuk pindah silang .

1.3 Manfaat Praktikum

Adapun manfaat dari praktikum ini adalah :

a. Dapat memahami dasar genetika pindah silang (Crossing over) sebagai

mekanisme dalam kombinasi baru gen.
b. Dapat melakukan simulasi berbagai bentuk pindah silang.
 BAB 2
TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Pindah Silang

Proses pindah silang mempunyai beberapa cara diantaranya dengan cara
menentukan titik poin, biasanya titik poin tersebut adalah banyaknya gen dalam satu
individu (orang tua) dibagi menjadi dua bagian sama panjang dan saling di tukarkan
antara dua orang tua tersebut, sedangkan pada program kali ini, pindah silang yang
dilakukan adalah dengan cara memilih titik (gen) secara acak dari kedua orang tua
yang nantinya nilai tersebut akan di tukarkan dengan batasan 4 buah titik atau gen
dari setiap orang tua, akan tetapi ada kemungkinan ketika selesai melakukan pindah
silang nilai fitness dari dua anak (hasil pindah silang) memiliki nilai fitness yang lebih
buruk dari kedua orang tuanya, maka dari itu jika dalam program kali ini, jika nilai
fitness dari kedua anak hasil pindah silang memiliki nilai fitness yang lebih buruk,
maka kedua anak sama dengan kedua orang tua. Hal ini dilakukan agar tidak terjadi
looping yang sia-sia untuk menemukan nilai paling optimal atau dengan kata lain
setiap looping yang dilakukan bernilai lebih baik atau sama dengan sebelumnya
hingga program ini menemukan nilai yang konstan atau tidak berubah setelah
melakukan banyaknya looping sesuasi dengan yang diinginkan (Otong, 2019).

Pindah silang adalah pertukaran segmen antara dua kromosom homolog.

Peristiwa ini berlangsung pada saat kromosom homolog berpasangan dalam profase
I meiosis, yaitu pada saat pakiten. Pakiten merupakan saat seluruh bagian kromosom
berpasangan pada jarak yang paling dekat. Titik kontak dari kromosom-kromosom
yang bersentuhan dinamakan Kiasma . Tempat persilang dari kromosom tersebut
disebut dengan kiasma. Sinapsis adalah pasangan kromosom homolog sebelum
pemisahannya menjadi sel anak. Pindah silang akan menghasilkan kromosom
rekombinan yang merupakan hasil dari penyeberangan fragmen-fragmen kromosom
ke kromosom homolog tetangganya. Perpindahan ini dapat terjadi sepanjang
pasangan kromosom. Proses ini disebut pindah silang (Crossing over). Pada proses
meiosis, pindah silang terjadi di kiasma, oleh karena itu materi serta susunan gen nya
dapat berubah akibat terjadinya pindah silang (Nusantari, 2015).
2.2 Pemetaan gen
Pemetaan kromosom manusia adalah tugas yang sulit. Diagram, representasi
grafis dari jarak relatif antara gen kromosom yang terkait disebut peta genetik.
Manusia tidak mungkin memiliki pra-genotif orangtua dan mengatur persilangan yang
dirancang khusus untuk keperluan pemetaan, sebaliknya data untuk perhitungan
frekuensi rekombinasi harus diperoleh dengan memeriksa genotipe anggota generasi
berturut turut dari keluarga yang ada. Ini berarti hanya data yang terbatas yang tersedia
dan interprestasinya seringkali sulit karena pernikahaan manusia jarang menghasilkan
persilangan yang nyaman. Seringkali Genotipe dari satu atau lebih anggota keluarga
tidak dapat digunakan di karenakan sebuah kematian mereka atau ketidakmauan
mereka untuk bekerja sama (Verma, 2014).

Pemetaan genetik berarti menentukan kerabat posisi gen di sepanjang

kromosom. Ini adalah salah satu dari alat eksperimental utama dalam genetika. Ini
mungkin tampak aneh pada organisme dimana urutan DNA genom telah ditentukan.
Jika setiap gen dalam suatu organisme, urutan gen tidak selalu mengungkapkan
fungsinya dan juga urutan DNA genom tidak mengungkapkan gen mana yang
berinteraksi dalam proses biologis yang kompleks. Langkah pertama dalam analisis
genetik untuk menentukan posisinya dalam genom. Pada titik inilah genomik urutan
menjadi berguna karena dalam beberapa kasus posisi gen mutasi bertepatan dengan
gen yang urutannya menunjukkan peran dalam proses biologis yang sedang diselidiki.
Misalnya ; kasus mutasi warna bunga dapat di petakan ke wilayah yang mengandung
gen yang urutannya menunjukkan pengkodean enzim dalam sintesis antosianin tetapi
fungsi gen tidak selalu diungkapkan oleh urutan DNA. Keterkaitan gen dalam suatu
kromosom dapat dipresentasekan dalam bentuk peta genetik yang menunjukkan urutan
linear gen di sepanjang jarak kromosom sehingga jarak kromosom dan juga jarak
antara gen yang berdekatan sebanding dengan frekuensi rekombinasi antara mereka.
Peta genetik disebut juga peta keterkaitan atau peta kromosom. Dalam genetika
manusia terdapat pemetaan genetik yang penting karena memungkinkan gen yang
terkait peta genetik dapat diperluas dengan jenis penalaran untuk memasukkan semua
gen yang diketahui dalam kromosom terkait dan penyakit keturunan menjadi
terlokalisasi dan berkorelasi dengan urutan genom (Hartl, 2020).
2.3 Algoritma Genetika
Algoritma genetika merupakan algoritma pencarian pada masalah optimasi
yang didasarkan pada prinsip evolusi biologi seperti mekanisme seleksi alam dan
genetik. Tujuannya untuk menentukan struktur - struktur yang disebut individu yang
berkualitas tinggi di dalam suatu domain yang disebut populasi untuk mendapatkan
solusi dari suatu persoalan. Dalam membuat program algoritma genetika di sini kita
menggunakan beberapa proses diantaranya : proses representasi gen, membuat sebuah
populasi yang terdiri dari beberapa kromosom yang di dalam kromosom tersebut
terdapat beberapa gen, proses seleksi untuk mendapatkan dua buah kromosom secara
acak yang akan menjadi orang tua, proses pindah silang atau crossover antara orang
tua yang nantinya akan menjadi dua anak, proses mutasi gen dengan mengubah nilai
dari gen secara acak, dan yang terakhir adalah regenerasi gen atau mengembalikan
kromosom ke dalam populasi awal (Otong, 2019).

Konsep dasar algoritma genetika relatif mudah dipahami, karena komponen-

komponen pembentuk algoritma ini mencerminkan kehidupan di alam. Algoritma
genetika umumnya terdiri dari tiga operasi yaitu : operasi reproduksi, operasi crossover
(persilangan), dan operasi mutasi dimana rekombinasi dari ketiga aspek tersebut
merupakan aspek yang memiliki peranan penting. Crossover (persilangan) yang
merupakan operator dari algoritma genetika yang melibatkan dua induk untuk
membentuk kromosom baru. Proses ini dilakukan dengan menukar sebagian informasi
pada kromosom induk pertama dengan informasi dari kromosom induk kedua. Proses
crossover dilakukan pada setiap individu dengan probabilitas crossover yang
ditentukan. Jika tidak terjadi crossover, satu induk dipilih secara random dengan
probabilitas yang sama dan di duplikasi menjadi anak. Jika terjadi crossover, keturunan
didapatkan dari bagian-bagian kromosom induk. Jika probabilitas crossover 100%
maka keseluruhan keturunan didapatkan dengan Parameter genetika yang sering
digunakan meliputi ukuran populasi (N), probabilitas pindah silang (Pc), dan
probabilitas mutasi (Pm). Algoritma Genetika sebagai cabang dari Algoritma dan
Evolusi merupakan metode yang bisa di gunakan untuk memecahkan suatu pencarian
nilai dalam sebuah masalah optimasi yaitu permasalahan-permasalahan yang tak linier.
Untuk masalah lebih yang kompleks biasanya memerlukan ukuran populasi yang lebih
besar dan untuk mencegah konvergensi yang prematur (Hardi, 2014).
2.4 Mutasi Gen
Istilah mutasi mengacu pada setiap perubahan yang diwariskan dalam gen
(atau, lebih umum, dalam materi genetik). Istilah ini juga mengacu pada proses di mana
perubahan tersebut terjadi. Salah satu jenis mutasi menghasilkan perubahan dalam
urutan basa dalam DNA. Perubahannya mungkin sederhana, seperti substitusi satu
pasang basa dalam molekul dupleks untuk pasangan basa yang berbeda. Misalnya,
pasangan C-G dalam molekul dupleks dapat bermutasi menjadi T—A, A—T, atau G—
C. Perubahan urutan dasar mungkin juga menjadi lebih kompleks, seperti penghapusan
atau penambahan dari pasangan basa. Ahli genetika juga menggunakan istilah mutan,
yang mengacu pada hasil mutasi. Sebuah mutasi menghasilkan gen mutan, yang pada
gilirannya menghasilkan mRNA mutan, protein mutan, dan akhirnya organisme
mutan. DNA yang mengkode PAH berfungsi sebagai cetakan untuk produksi RNA
messenger, dan mRNA. Pada gilirannya, berfungsi untuk menentukan urutan amino
asam dalam rantai polipeptida PAH melalui interaksi dengan molekul tRNA.
Pengganti dari pasangan basa G-C untuk pasangan basa A-T normal pada posisi
pertama dalam urutan pengkodean berubah kodon normal AUG (Met) yang digunakan
untuk inisiasi terjemahan ke dalam kodon GUG, yang biasanya menentukan valin
(Val) dan tidak dapat digunakan sebagai kodon awal. Hasilnya adalah translasi mRNA
PAH tidak dapat terjadi, jadi tidak ada polipeptida PAH yang dibuat. Mutan ini
dinamakan M1V karena kodon untuk M (methi onine) pada posisi asam amino 1 dalam
polipeptida PAH telah diubah menjadi kodon untuk V (valin). Meskipun mutan M1V
cukup langka di seluruh dunia, itu umum di beberapa daerah, seperti di provinsi
Québec di Kanada. Salah satu mutan PAH yang cukup umum adalah designated
R408W, artinya kodon 408 in rantai polipeptida PAH telah diubah dari satu
pengkodean untuk arginin (R) menjadi satu pengkodean untuk triptofan (Hartl, 2020).

Operator mutasi dioperasikan sebagai cara untuk mengembalikan materi

genetic yang hilang. Melalui mutasi, individu baru diciptakan dengan melakukan
modifikasi terhadap satu atau lebih nilai gen pada individu yang sama. Mutasi
mencegah kehilangan materi genetika setelah reproduksi dan pindah silang. Mutasi
dapat menyebabkan perubahan protein, dimana membuat kerusakan pada beberapa
fungsi tubuh. Mutasi berperan menggantikan gen yang hilang sebagai akibat seleksi
memunculkan kembali gen yang muncul pada inisialisasi populasi (Hardi, 2014).
2.5 Meiosis
Meiosis (Pembelahan Reduksi) adalah reproduksi sel melalui tahap-tahap
pembelahan seperti pada mitosis, tetapi dalam prosesnya terjadi pengurangan (reduksi)
jumlah kromosom. Meiosis terbagi menjadi dua tahap yaitu Meiosis I dan Meiosis II.
Tahap Meiosis I dan Meiosis II terbagi lagi menjadi tahap-tahap seperti pada mitosis.
Pembelahan meiosis pertama (meiosis I) adalah pembelahan reduksional yang
menghasilkan dua sel haploid dari satu sel diploid tunggal. Pembelahan meiosis kedua
(meiosis II) adalah pembelahan berimbang (mirip dengan mitosis, dalam arti terjadi
pemisahan kromatid-kromatid dari sel-sel haploid). Bagaimana hubungan pembelahan
meiosis dengaan pindah silang?. Pada fase profase 1, kromosom-kromosom homolog
membentuk pasangan-pasangan yang dinamakan bivalen. Proses berpasangan
kromosom homolog disebut Sinapsis. Kemudian setiap anggota bivalen membelah
memanjang sehingga terbentuk 4 kromatid. Keempat kromatid pada satu bivalen
dinamakan tetrad. Selama sinapsis inilah dapat terjadi pindah silang (crossing over).
Pindah silang merupakan peristiwa penukaran segmen dari kromatid dalam sebuah
tetrad dan pindah silang terjadi antara kromatid-kromatid yang tidak berpasangan.
Proses terakhir ini meliputi pemecahan dan penggabungan kembali hanya dua dari
keempat benang pada titik mana saja pada kromosom tersebut. Adanya pindah silang
dapat memperbesar variasi genetic keturunan yakni bila 2 gen atau lebih berada dalam
satu kromosom, maka pindah silang dapat menghasilkan gamet yang memiliki gen
yang pada awalnya tidak ada, karena terjadi pindah silang maka menghasilkan gamet
yang memiliki kromosom dari tipe rekombinan (Nusantari, 2019).

Periode akhir profase I adalah diakinesis, yang tampaknya kromosom homolog

saling menolak satu sama lain dan segmen yang tidak dihubungkan oleh chiasma
bergerak terpisah. Diakinesis berarti (―bergerak terpisah.‖). Pada tahap inilah
kromosom mencapai kondensasi maksimum. Homolog kromosom bivalen tetap
terhubung oleh setidaknya satu chiasma yang bertahan sampai anafase meiosis
pertama. Pembelahan meiosis kedua (meiosis II) kadang disebut pembelahan
persamaan karena jumlah kromosom tetap sama di setiap sel sebelum dan setelah
pembagian kedua . Pada beberapa spesies, kromosom yang berpindah langsung dari
telofase I ke profase II tanpa kehilangan kondensasi. Menjelang akhir diakinesis
pembentukan spindel dimulai dari selubung nukleus yang telah rusak (Hartl. 2019).
 BAB 3
BAHAN DAN METODE

3.1 Waktu dan Tempat

Praktikum ini dilaksanakan pada hari Rabu, 23 Februari 2022 pada pukul
13.45 WIB sampai dengan selesai di rumah praktikan masing masing.

3.2 Alat dan Bahan

Alat dan bahan yang digunakan pada praktikum ini adalah kawat bewarna merah
sepanjang 45 cm, kawat bewarna hijau sepanjang 45 cm, kawat bewarna biru
sepanjang 45 cm, kawat kuning sepanjang 45 cm, Pulpen bewarna sesuai dengan
warna kawat, rol besi, kertas Hvs putih dan Format tabel data.

3.3 Metode Kerja

3.3.1 Peniruan Pindah Silang
Kawat dipotong memanjang,lalu diletakkan di atas kertas.Tandai dengan jarak
tertentu menggunakan pulpen warna, kemudian ditentukan pindah silang :
a. Khiasma tunggal 2 strand 1 (1 dan 4)
b. Double Khiasma 4 strand (2 dan 3), (3 dan 4)
c. Double Khiasma 4 strand (2 dan 3), (1 dan 4)
d. Double Khiasma 3 strand (2 dan 3),(1 dan 2)
e. Triple Khiasma 4 strand (1 dan 3), (2 dan 4), (2 dan 3)
Tentukan mana gamet parental dan mana gamet kombinasi , gunakan pulpen
bewarna untuk menggambarkan kejadian pindah silang dalam laporan.
3.3.2 Menghitung NPS dan Membuat Peta Jarak Gen
Tanaman kacang kapri ( Pistum Sativa) dipengaruhi oleh beberapa gen antara
lain gen T (batang tinggi) dengan alelnya t (batang pendek ), gen U (bunga ungu)
dengan alelnya u (bunga putih) dan gen B (biji bulat) dengan alelnya b (biji
keriput).Test cross antara kapri dengan genotip TtUuBb x ttuubb menhasilkan
keturunan sebagai berikut :
 TUB =235 individu TuB = 7 Individu
Tub = 40 Individu tUb = 62 Individu
TuB = 60 Individu tuB = 48 Individu
Tub = 4 Individu tub = 270 Individu

Tentukanlah :
a. Hitunglah nilai pindah silang
b. Buatlah peta jarak gen T,U,B
 BAB 4

HASIL DAN PEMBAHASAN

4.1 Peniruan Pindah Silang

Tabel 4.1 Tabel Peniruan Pindah Silang

Berdasarkan 4.1 didapatkan hasil dari percobaan peniruan pindah silang berupa
khiasma dan khiasmata. Khiasma merupakan tempat persilangan dua kromatid yang
membentuk titik temu sedangkan, khiasmata merupakan persilangan dua kromatid yang
membentuk lebih dari satu titik temu.Maka hasil yang diperoleh dari percobaan peniruan
pindah silang : 1. Khiasma tunggal 2 strand (1 dan 4), 2. Double khiasmata 4 strand (2
dan 3), (2 dan 3), 3. Double khiasmata 4 strand (2 dan 3), (1 dan 4), 4. Double khiasmata
3 strand (2 dan 3), (1 dan 2), 5.Triple khiasmata 4 strand (1 dan 3), (2 dan 4), (2 dan 3).
Pindah silang menyebabkan pergantian alel antara kromosom homolog dan
menghasilkan kombinasi genetik yang baru dan dapat meningkatkan keanekaragaman
hayati genetik.
 Menurut Mustafi (2013) Pada waktu kromosom hendak memisah yaitu pada
anafase 1, Kromatid yang bersilang itu melekat dan putus dibagian khiasma kemudian
tiap potongan itu melekat pada kromatid sebelahnya secara timbal balik. Berhubung
dengan itu gen-gen yang terletak pada bagian yang pindah itu akan berpindah pula
tempatnya kromatid sebelah. Sebagai konsekuensi dari pemilihan kromosom secara
independen selama meiosis, kita masing-masing menghasilkan koleksi games yang
kombinasi kromosomnya berbeda sekali dengan kromosom yang kita warisi dari
orangtua kita tetapi dari apa yang teah anda pelajari sejauh ini, mungkin akan terlihat
bahwa masing-masing krosom didalam sebuah gamet memiliki asal–usul maternal dan
paternal yang eksklusif artinya kromosom tersendiri dari DNAS yang berasal dari ibu
atau bapak kita, tetapi bukan dari keduanya. Dalam kenyataan hal ini bukanlah suatu
masalah. Suatu proses yang dinamakan pindah silang (crossing over) menghasilkan
kromosom.
Menurut Hakimi (2016) Dalam GA operator Crossover digunakan untuk
membagi pasangan kromosom terpilih menjadi dua atau lebih bagian. Dia terdiri dari
penggabungan dua kromosom induk untuk menghasilkan keturunan baru (anak). Itu
alasan di balik penggunaan crossover adalah karena yang baru kromosom yang sedang
dibentuk (anak) mungkin lebih baik dari kedua orang tua, jika itu mengambil yang
terbaik kromosom dari kedua orang tuanya. Untuk tujuan dari pekerjaan ini, Crossover
berikut akan digunakan: Crossover titik tunggal (SP) Crossover titik tunggal melibatkan
dua perkawinan kromosom (induk) dipotong sekali pada saat yang sesuai poin dan
seleksi setelah pemotongan dipertukarkan. Crossover dua titik seringkali melibatkan
lebih dari satu titik potong. Dua kromosom kawin (induk) dapat memotong lebih dari
ujung titik dan seleksi setelah pemotongan dapat bertukar. Crossover scatter (SC)
menciptakan kromosom biner acak dan memilih gen .

4.2 Perhitungan Nilai Pindah Silang (NPS) dan Peta Jarak Gen
Tanaman kacang kapri (Pisum sativa) dipengaruhi oleh beberapa gen antara
lain gen T (batang tinggi) dengan alelnya t (batang pendek), gen U (bunga ungu)
dengan alelnya u (bunga putih) dan gen B (biji bulat) dengan alelnya b (biji keriput).
Testcross antara kapri dengan genotip TtUuBb x ttuubb menghasilkan keturunan
sebagai berikut :
TUB = 235 individu tUB = 7 individu
TUb = 40 individu tUb = 62 individu
TuB = 60 individu tuB = 48 individu
Tub = 4 individu tub = 270 individu

Tentukanlah :
a. Hitunglah nilai pindah silangnya
b. Buatlah peta jarak gen diantara gen T, U, dan B.
Jawaban:

a. NPS (Nilai Pindah Silang = 𝑁𝑖𝑙𝑎𝑖 𝑅𝑒𝑘𝑜𝑚𝑏𝑖𝑛𝑎𝑛

𝑁𝑖𝑙𝑎𝑖 𝑇𝑜𝑡𝑎𝑙 𝐼𝑛𝑑𝑖𝑣𝑖𝑑𝑢
𝑇𝑢𝑏+𝑡𝑈𝐵
= x 100 %
726

= 4+7 x 100 %
726

= 1,5 %
b. Peta jarak gen diantara gen T, U dan B
Testcross antara kacang kapri dengan Genotipe TtUuBb x ttuubb Akan
menghasilkan keturunan sebagai berikut :

tub : 270 individu

TUB : 235 individu

Tub : 62 individu

TuB : 60 individu

tuB : 48 individu

TUb : 40 individu

TuB :7 individu

Tub :4 individu +

= 726 individu
Jarak pada gen dengan nilai NPS

Rumus : 𝑅𝑒𝑘𝑜𝑚𝑏𝑖𝑛𝑎𝑛 x 100 %

𝑇𝑜𝑡𝑎𝑙
A. Skema Peta Jarak Gen U – T

U T B

u t b

Untuk mencari peta jarak gen U – T

u t B : 48

U t b : 62

u T B : 60

u T b : 40

= (62+7+60+40)
726
= 10,53 %

B. Skema Peta Jarak Gen B – T

u T B

u t b

Untuk mencari Peta Jarak Gen B – T

U t B : 48

U t B : 7

U T b : 40
 u T b 48

= 48+7+4+40
726
= 13,5 %

Jadi, jarak antara gen U – T = 10,53 %

Jarak antara gen B – T = 13,5 %

U 10,53% T 13,5 % B
Berdasarkan skema 4.2 didapatkan nilai pindah silang 1,5% dan peta jarak
gen didapatkan hasil bahwa jarak antara gen U  T = 10,53 % dan jarak antara gen
B T = 13,5 %.
Menurut Reflinur ( 2015) Peta genetik (linkage maps) menunjukkan posisi
dan jarak genetik relatif antara marka-marka DNA di sepanjang kromosom suatu
spesies. Pada prinsipnya, susunan atau urutan marka dalam suatu peta keterpautan
dihitung berdasarkan konsep segregasi dan rekombinasi, seperti yang dipaparkan
dalam teori pewarisan pada hukum Mendel. Ketersediaan peta genetik dengan
tingkat resolusi tinggi akan mempermudah penentuan lokus suatu gen dalam
kromosom, jumlah gen, dan kekuatan gen yang bertanggung jawab terhadap
karakter tertentu. Gen yang bertanggung jawab terhadap karakter kualitatif
maupun kuantitatif dikenal sebagai quantitative trait loci Makin banyak jumlah
marka DNA yang digunakan dalam analisis segregasi, peluang untuk mendapatkan
peta genetik yang lebih lengkap akan makin tinggi. Peta genetik juga dapat
memfasilitasi pemulia tanaman dalam mengintrogresikan gen atau QTLs yang
diinginkan melalui program MAS dan membantu para peneliti dalam studi
komparatif kemiripan susunan dan fungsi suatu gen dalam mengekspresikan
fenotipe dari spesies spesies yang berbeda Bahkan, ketersediaan peta genetik
menjadi dasar dalam kloning suatu gen yang bertanggung jawab terhadap karakter
yang memiliki nilai ekonomis tinggi atau yang dikenal sebagai positional or map-
based cloning. Dalam pembentukan peta genetik, metode dan teknik yang
digunakan harus sederhana, tetapi tingkat akurasinya tinggi, mudah diadopsi oleh
pengguna, cepat dalam pengerjaannya, dan efektif dalam biayanya. Pada dasarnya
pemetaan genetik didasarkan pada prinsip bahwa gen (marka atau lokus)
bersegregasi melalui rekombinasi kromosom selama proses meiosis sehingga
memungkinkan para pemulia melakukan analisis segregasi gen tersebut pada
individu-individu Gen atau marka DNA yang saling berdekatan (tightly-linked
markers) diwariskan secara bersama-sama dari tetua kepada progeninya dengan
frekuensi yang lebih tinggi dibandingkan dengan gen atau marka yang letaknya
berjauhan satu dengan lainnya ada suatu populasi yang bersegregasi, genotipe
tetua maupun genotipe heterozigot (rekombinan) akan diwariskan pada generasi
berikutnya sebagai hasil persilangan dari kedua tetua. Dengan demikian dapat
dihitung fraksi rekombinasi yang menjadi dasar dalam menghitung jarak
genetik diantara marka DNA yang dipetakan. Selanjutnya, nilai fraksi
rekombinasi tersebut dikonversi menggunakan suatu fungsi (mapping function)
ke dalam satuan peta map yang dikenal dengan istilah centi Morgan (cM).
Menurut Efendi (2020) Pemetaan genetik (genetik mapping) berguna untuk
menunjukkan posisi gen dan fitur urutan lain pada genom. Pautan genetik (genetik
linkage) yaitu kecenderungan alel-alel pada dua atau lebih lokus suatu berkas
kromosom yang sama (kromatin) untuk bersegregasi bersama. Pautan genetik dapat
dideteksi secara statistik dengan analisis asosiasi antara dua atau lebih sifat yang
menjadi ekspresi gen pada lokus yang terlibat. ada dua fase yang terjadi antara dua
lokus yang terpaut Pemetaan fisik (physical mapping) yaitu teknik biologi molekuler
untuk memeriksa molekul DNA secara langsung dengan rangka untuk mengontruksi
peta yang menunjukan posisi urutan termasuk gen. pemetaan genetik biasa memiliki
resolusi yang relatif buruk dan cenderung tidak akurat. untuk menyempurnakannya
dibutuhkan pemetaan fisik jika peta tersebut akan digunakan dalam pengurutan
genom. pemetaan fisik dihasilkan oleh metode yang menemukan posisi urutan
tertentu pada molekul DNA kromosom
 BAB 5
KESIMPULAN DAN SARAN

5.1 Kesimpulan
Kesimpulan dari praktikum ini adalah:
a. Pindah silang merupakan peristiwa bertukarnya bagian kromatid dengan
bagian berkas kromatid lain yang menyebabkan pergantian alel diantara
kromosom yang homolog. Pindah silang meningkatkan keanekaragaman hayati
genetik selain yang dihasilkan oleh pengelompokkan gen secara bebas.
Pristiwa pindah silang diikuti oleh patah dan melekatnya kromatid pada waktu
profase dalam pembelahan meiosis.
b. Pada simulasi peniruan brbagai bentuk kromosom hendak memisah maka
kromatid yang bersilang itu melekat dan putus dibagian khiasma sehingga titik
temu persilangan antara dua kromatid akan menghasilkan kombinasi yang
berbeda yaitu kombinasi parental dan rekombinasi pada fenotipenya.

5.2 Saran
Saran dari praktikum ini adalah:
a. Sebaiknya praktikan lebih menguasai materi yang diberikan
b. Sebaiknya praktikan lebih semangat dalam praktikum
c. Sebaiknya lebih aktif bertanya dan ceria dalam menjalani praktikum
 DAFTAR PUSTAKA

Efendi Y. 2020. Buku Ajar genetika Dasar.Pustaka Rumah C1nta. Mungkid

Halaman : 112
Hakimi D, Oyewola DO,Yahaha Y, Bolarin G. 2016. Comparative Analysis of
Genetic Crossover Operators in Knapsack Problem. Department of
Mathematics, Federal University of Technology. 20(2) : 593-596
Hardi SM, Zarlis M, Budiarti E. 2014. Analisis Mapping Pada Partially Mapped
Crossover Dalam Algoritma Genetika Pada Travelling Salesman Problem.
Jurnal Penelitian Teknik Informatika, 4(1) : 128-144
Hartl DL. 2020. Essential Genetics and Genomics 7th Edition. Jones and Bartlett
Learning. Burlington.
Pages : 24-25,110

Mustafi KM, 2013. Genetika.Universitas Islam Negeri Allaudin. Makassar.

Halaman : 139

Nusantari E. 2015. Genetika, Belajar genetika Dengan Mudah dan Komprehensif.

Deepublish. Sleman
Halaman : 80, 203-207
Otong M, Nurrohman A.2019. Rekonfigurasi Jaringan Distribusi Menggunakan
Algoritma Genetika di Interkoneksi Penyulang Pakupatan dan Palima pada
Beban Prioritas untuk Mengurangi Rugi Daya dan Jatuh Tegangan. Jurnal
Ilmiah Setrum, 8(2) : 158-165
Reflinur, Lestari P. 2015. Penentuan Lokus Gen Dalam Kromosom Tanaman Dengan
Bantuan Marka DNA.Jurnal Balai Besar dan Pengembangan Bioteknologi
dan Sumberdaya Genetik Pertanian. 34(4) : 177 – 186
Verma PS, Agarwal VK. 2014.Genetics. S. Chand & Company PVT. LTD.New Delhi.
Pages : 1, 386
Lampiran 1. Alat dan Bahan

Pulpen Warna
Kawat berwarna

Rol Besi Format Tabel Data

Kertas HVS
Lampiran 2. Foto Kerja

Menarik Garis Menghitung Data

Melakukan Pindah Silang

dengan Kawat
LAMPIRAN