PRAKTIKUM BIOKIMIA II OLEH: NURFITRI ARFANI, S.SI., M.SI Nama : SULAIHA Nim : B1D119066 Kelas : 2019 B
A. PRAKTIKUM ISOLASI PROTEIN
1. Apa yang dimaksud dengan isolasi protein? Jawab: isolasi protein adalah suatu cara memisahkan protein dari makromolekul yang lain atau memisakan protein dari protein lain yang tiak diinginkan. 2. Apa prinsip kerja dari isolasi protein? Jawab: Secara sederhana, proses dari isolasi protein konsepnya sama dengan isolasi DNA, hanya saja isolasi protein menggunakan buffer lysis untuk melisiskan sel. 3. Tulisakan fungsi alat dan bahan pada praktikum isolasi protein! Jawab: a. Alat 1) Lumping atau alu berfungsi untuk penggerusan 2) Sentrifuge untuk memisahkan substansi berdasarkan berat jenis molekulnya 3) Tabung reaksi sebagai tempat penyimpanan sampel b. Bahan 1) Larutan buffer berfungsi untuk mempertahankan agar kondisi komponen sel tetap optimu 2) Detergen berfungsi untuk memecah membrane sel yang penyusun utamanya fosfolipid sehingga akan terjadi reaksi antara fosfolipid dengan detergen pada sel 3) Kelotor berfungsi untuk menghilangkan ion-ion activator enzim protease 4) Inhibitor protease untuk mencegah pemutusan ikatanpeptida pada protein 5) Ammonium sulfat berfungsi untuk presipitas garam secara salting out, sehingga menyebabkan interaksi hidrophobik antar molekul protein. 4. Tuliskan cara kerja isolasi protein yang anda ketahu! Jawab: caranya yaitu a. Pertama sel dilisiskan atau digerus menggunakan lumping/alu b. Kemudian ditambahkan larutan buffer c. Lalu ditambhkan detergen d. Kemudian ditambhkan lagi dengan kelotor e. Lalu ditambhkan inhibitor protease f. Kemudian sebelum di sentrifuge ditambahkan dengan ammonium sulfat g. Sentrifuge sampel yang telah dipreparasi
B. PRAKTIKUM SDS PAGE
1. Apa yang anda ketahui tentang SDS PAGE? Jawab: SDS PAGE atau Elektroforesis Gel Poliakrilamida- Sodium Dodesil Sulfat adalah teknik elektroforesis gel yang menggunakan poliakrilamida untuk memisakan protein yang bermuatan berdasarkan berat molekulnya saja. 2. Bgaimana prinsip kerja dari SDS PAGE? Jawab: prinsipnya adalah ketka protein dipisahkan oleh elektroforesis melalui matriks gel dan arus listrik diberikan, protein dengan molekul yang lebih kecil bermigrasi lebih cepat sedangkan molekul yang lebih besar akan tertahan akibat pergerakan yang lebih lambat. 3. Tuliskan fungsi alat dan bahan pada prektikum SDS PAGE! Jawab: a. Preparasi gel 1) Alat a) Beker glas berfungsi sebagai wadah penampungan b) Mikro tube berfungsi sebagai tempat mereaksikan bahan kimia c) Sarung tangan berfungsi mencegah terjadinya infeksi dan kontaminasi d) Perangkat elektroforesis berfungsi membiarkan molekul dengan massa rendah yang tak dapat dilihat kasat mata melewati jaringan gel dan menangkap molekul dengan massa molekul tinggi e) Lemari asam berfungsi sebagai perantara untuk memindahkan bahan kimia asam konsentrasi tinggi f) Timbangan digital berfungsi sebagai alat untuk menimbang g) Spatula berfungsi sebagai alat untuk mengambil objek/ sampel h) Batang pengaduk berfungsi untuk mencampur larutan i) Mikropipet berfungsi untuk memindahkan cairan dengan skala kecil secara akrat j) Aluminium foil dan tissue sebagai alas ketia menimbang dan tissue digunakan untuk mengelap 2) Bahan a) SDS (sodium deoxy sulfat) merupakan derajat ionic yang dapat melarutkan molekul hidrofobik yang memberikan muatan negative pada keseluruhan struktur protein b) Akrilamid berfungsi untuk mencegah difusi akibat timbunya panas pada arus listrik c) Bisakrilamid berreaksi dengan gugus fungsi karoksil d) ddH2O adalah aqua bidestillata atau ultrapure water adalah air yang sangat murni, lebih murni dari aquadest e) akuadst sebagai pelarut f) gliserol adalah senyawa gliserida yang paling sedrhana dengan hodroksil yng besifat hidrofilik dan higroskopis g) NaCl mempengaruhi aktivitas air dari bahan h) Asam asetat berfungsi sebagai pereaksi kimia untuk mengasilkan senyawa kimia i) TEMED dan PAS berperan sebagai sumber radikal bebas yang akan menginisiasi pembentukan polymer j) Marker protein berfungsi sebagai standar untuk menentukan berat molekul dari sampel k) pH meter berfungsi untuk mengukur kadar pH atau keasaman C. PRAKTIKUM ELISA 1. Apa yang ana ketahui tentang ELISA? Jawab: ELISA atau Enzyme-linked immunososerbent assay adalah penentuan kadar imunosorben taut enzyme mrupakan uji serologis yang umum digunakan diberbagai laboratotium imunologi . 2. Bagaimana prinsip kerja dari ELISA? Jawab: prinsipnya yaitu menggunakan teknik yang menggabungkan spesifitas antibody dengan sensitivitas uji enzim secara sederhana, dengan mengguanakn antibody atau antigen yang digabungkan kesuatu enzim yang mudah diuji 3. Tuliskan fungsi dari alat dan bahan prktikum elisa! Jawab: a. Alat 1) Elisa reader berfungsi untuk membaca plate elisa 2) Mikropipet single dan tip, multichannel berfungsi memindahkan cairan dengan jumlah yang sangat akurat 3) Incubator berfungsi mengontrol kondisi lingkungan 4) Tabung ependof berfungsi sebagai wadah tempat penyimpanan larutan 5) Vortex berfungsi untuk mengocok enzim dan mengetes aktivitas reagen enzim b. Bahan 1) Pre coated ELISA plate, Standard solution dan diluent, Streptavidin- HRP ,Stop solution berfungsi sebagai reagen reagen dalam praktikum ELISA 2) Plate sealer sebagai tempat meletakkan sampel 3) Wash buffer concentrate sebagai larutan penyangga 4. Tuliskan cara kerja elisa yang anda ketahui! Jawab: a. Disiapkan alat dan bahan b. Disiapkan pengenceran standard an wash buffer c. Ditambahkan standar ke masing-masing wash plate d. Diinkubasi selama 60 menit pada suhu 37 derajat C e. Ditambhkan substrate solution f. Diinkubasi lagi selama 10 menit pada suhu 37 derajat c g. Ditambahkan stop solution ke masing-masing well hingga terjadi perubahan warna h. Ditentukan optical density dan dibaca dengan elisa reader i. Dibuat kurva standart