Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

com

Analisis Genetik Perkembangan Vertebrata 575

Namun, hewan yang dihasilkan oleh kloning reproduksi terkadang memiliki

kelainan perkembangan dan rentang hidup yang lebih pendek. Seringkali,
mereka gagal berkembang. Kurangnya kekuatan ini menunjukkan bahwa inti
somatik yang digunakan dalam kloning reproduksi berbeda dari inti zigotik yang
dihasilkan oleh pembuahan biasa. Mungkin inti somatik telah mengalami
akumulasi mutasi, atau mungkin mereka telah mengalami perubahan yang
terkait dengan pencetakan genetik atau inaktivasi kromosom—metilasi
beberapa nukleotida, asetilasi histon, dan seterusnya. Perubahan seperti itu
harus dibalik agar inti somatik berfungsi sebagai inti zigotik. Karena masalah
yang dihadapi dalam kloning reproduksi hewan, komunitas ilmiah internasional
tidak menganggap kloning reproduksi manusia aman. Akibatnya,

PERUBAHAN GENETIK DALAM DIFERENSIASI

SEL KEKEBALAN VERTEBRAT
Meskipun bukti dari kloning reproduktif menunjukkan bahwa sel yang berdiferensiasi mungkin
memiliki kandungan DNA yang sama dengan sel telur yang dibuahi, kita mengetahui beberapa jenis
sel vertebrata yang berbeda yang tidak memiliki kandungan DNA. Sel-sel ini adalah komponen sistem
yang melindungi hewan dari infeksi virus, bakteri, jamur, dan protista—sistem kekebalan.

Pada mamalia, di mana sebagian besar penelitian telah difokuskan, sistem kekebalan
terdiri dari beberapa jenis sel yang berbeda, semuanya berasal dari sel induk yang berada di
sumsum tulang. Sel-sel induk ini membelah untuk menghasilkan lebih banyak jenisnya sendiri,
serta prekursor sel-sel kekebalan khusus. Dua kelas penting dari sel imun khusus berpartisipasi
langsung dalam perang melawan patogen yang menyerang. Itu sel B plasmamenghasilkan dan
mensekresi protein yang disebutimunoglobulin,juga dikenal sebagai
antibodi,dansel T pembunuhmenghasilkan protein yang menonjol dari
permukaannya dan bertindak sebagai reseptor untuk berbagai zat. Baik antibodi sel
B maupun reseptor sel T mampu mengenali molekul lain—misalnya, bahan asing
yang dimasukkan oleh patogen—melalui mekanisme kunci-dan-kunci. Molekul asing,
yang disebut anantigen,adalah kunci yang pas dengan kunci yang dibentuk oleh
antibodi sel-B atau reseptor sel-T (-Gambar 20.15). Spesifisitas fit ini adalah dasar dari
kemampuan hewan untuk mempertahankan diri terhadap patogen. Namun, karena
ada banyak patogen potensial yang berbeda, hewan harus mampu menghasilkan
berbagai jenis antibodi dan reseptor sel T untuk menangkal infeksi.

- GAMBAR 20.15Struktur tiga dimensi kompleks

antigen-antibodi. Hanya satu dari dua situs
pengikatan antigen dari antibodi khas yang
ditampilkan. Antigen (hijau) adalah enzim
lisozim. Situs pengikatan antigen antibodi
dibentuk oleh bagian aminoterminal dari rantai
ringan (kuning) dan rantai berat (biru). Residu
glutamin yang menonjol dari lisozim tempat
antibodi mengikat ditunjukkan dengan warna
merah. Strukturnya didasarkan pada data
difraksi sinar-X.
576 Bab 20 Kontrol Genetik Perkembangan Hewan

Rantai berat Antibodi dan reseptor sel T adalah protein, dan protein
Pengikatan antigen
lokasi
rantai ringan dikodekan oleh gen. Oleh karena itu, untuk menghasilkan
H2N NH2
sejumlah besar antibodi dan reseptor sel-T yang diperlukan

at
H2N NH2
untuk melawan semua kemungkinan patogen, tampaknya

er
antigen

b
ai
seekor hewan harus memiliki sejumlah besar gen—terlalu

nt
Ra
Variabel Variabel banyak untuk muat bahkan dalam genom besar seperti gen

n
ga
in
daerah daerah

r
ai
kita sendiri. . Kesulitan ini membingungkan para ahli genetika

nt
ra
S S SS
SS SS selama bertahun-tahun. Namun, pada kuartal terakhir abad
Konstan COOH HOOC Konstan kedua puluh, para peneliti menemukan bagaimana seekor
daerah daerah hewan dapat menghasilkan sejumlah besar antibodi dan
reseptor sel-T yang berbeda dengan menggabungkan kembali
elemen-elemen genetik kecil menjadi gen-gen fungsional.
Potensi pengkodean yang dicapai oleh pengocokan
COOH COOH
kombinatorial segmen gen ini benar-benar mencengangkan.
- GAMBAR 20.16Struktur molekul antibodi. Sisipan menunjukkan Dengan jumlah DNA sederhana yang didedikasikan untuk
interaksi kunci-dan-kunci antara antibodi dan antigen yang fungsi sistem kekebalan, seekor hewan dapat menghasilkan
dikenalinya. ratusan ribu, jika bukan jutaan,
Untuk melihat bagaimana sistem rekombinasi ini bekerja, kita akan fokus pada
produksi antibodi. Setiap antibodi adalah tetramer yang terdiri dari empat polipeptida,
duarantai ringandan dua identikrantai berat, bergabung dengan ikatan disulfida (-Gambar
20.16). Rantai ringan memiliki panjang sekitar 220 asam amino, dan rantai berat memiliki
panjang sekitar 445 asam amino. Setiap rantai, ringan atau berat, memiliki terminal amino
wilayah variabel,di mana urutan asam amino bervariasi di antara berbagai jenis antibodi
yang dihasilkan hewan, dan terminal karboksiwilayah konstan,di mana urutan asam
amino adalah sama untuk semua antibodi dari kelas tertentu.

40 fungsionalLκ Vκ segmen gen

5Jκ segmen gen 1Cκ
segmen gen

DNA genom Lκ1 Vκ1 Lκ2 Vκ2 Lκ3 V κ3 Lκ40Vκ40 Jκ1 Jκ2 Jκ3 Jκ4 Jκ5 Cκ
dalam embrio
sel induk
Noncoding panjang
urutan STE
P
1 Rekombinasi somatik untuk bergabung
denganLκ3Vκ3segmen gen ke Jκ4
segmen gen dengan menghapus DNA
Diatur ulang di antara mereka.
DNA dewasa
sel plasma STE
P

2 Transkripsi

RNA primer
5' 3'
salinan
STE
P

3 Pemrosesan RNA

Dewasa
mRNA 5' AAA 3'
SEBUAH

STE
P

4 Terjemahan
Utama
polipeptida H2N COOH
produk STE
P

5 Penghapusan peptida pemimpin

Dewasa
cahaya kappa H2N COOH
rantai

Variabel Konstan
wilayah wilayah

- GAMBAR 20.17Kontrol genetik rantai ringan kappa antibodi manusia. Setiap rantai ringan kappa
dikodekan oleh gen yang dirakit dari berbagai jenis segmen gen dalam lokus kappa imunoglobulin (IGK)
pada kromosom 2. Perakitan ini terjadi selama diferensiasi sel B plasma sistem imun.
 Analisis Genetik Perkembangan Vertebrata 577

Rantai ringan dan berat dari antibodi dikodekan oleh lokus yang berbeda Urutan sinyal rekombinasi Urutan sinyal rekombinasi
dalam genom. Pada manusia terdapat dua lokus rantai ringan, yaitu lokus dengan spacer 12-nukleotida dengan spacer 23-nukleotida

kappa ( ) pada kromosom 2 dan lokus lambda ( ) pada kromosom.

Vκ2 RSS Vκn RSS RSS Jκ2 RSS Jκ3
22, dan ada satu lokus rantai berat, yang terletak di kromosom 14. Masing-masing lokus
ini terdiri dari serangkaian segmen gen yang panjang. Kami akan fokus pada lokus kappa STE

P
untuk melihat bagaimana segmen ini diatur dan bagaimana mereka digabungkan 1 Pengikatan RAG1 dan kemudian RAG2.

kembali menjadi urutan pengkodean yang koheren untuk menghasilkan polipeptida

yang berbeda.
Sebuah polipeptida kappa dikodekan oleh tiga jenis segmen gen: Vκ2 RSS Vκn RSS RSS Jκ2 RSS Jκ3

RAG1/RAG2
1.SebuahLVsegmen gen, yang mengkode aakupeptida eader dan 95 asam
Kompleks
amino aminoterminal darivdaerah subur dari rantai ringan kappa; peptida STE

P
pemimpin dikeluarkan dari rantai ringan kappa melalui pembelahan 2 Pasangan kompleks RAG1/RAG2.

setelah ia memandu polipeptida yang baru lahir melalui membran

retikulum endoplasma dalam sel plasma yang mensintesis antibodi.
2.SEBUAHJsegmen gen, yang mengkodekan 13 asam amino terakhir dari Vκ2 RSS Vκn RSS
wilayah variabel rantai ringan kappa; simbolJdigunakan untuk segmen gen
ini karena peptida yang dikodekannyajoins peptida terminal amino yang Jκ3 RSS Jκ2 RSS
dikodekan olehLVsegmen ke peptida terminal karboksi yang dikodekan
oleh jenis segmen gen berikutnya.
STE
3.SEBUAHCsegmen gen, yang mengkodekan wilayah konstan rantai

P
3 Pembelahan DNA berdekatan
ringan kappa. dengan urutan sinyal rekombinasi.

Pada manusia, lokus kappa berisi 76LVsegmen gen (walaupun

hanya 40 yang berfungsi), limaJsegmen gen, dan satuC ment.segmen
ItuJ gen- Vκ2 RSS Vκn RSS
Segmen gen terletak di antaraLV danCsegmen gen. Dalam segmen
sel germ-
gen
line, limaJ segmen adalah
Jκ3 RSS Jκ2 RSS
terpisah dariLVsegmen dengan urutan noncoding yang panjang, dan dariC
Kompleks RAG1/RAG2
segmen gen oleh urutan noncoding lain sekitar 2 kb panjang (-Gambar 20.17).
dan beberapa protein lainnya.
Selama perkembangan sel B tertentu, gen rantai ringan kappa yang akan
STE
diekspresikan dirakit dari satu LVsegmen, satuJsegmen, dan tunggalCsegmen

P
4 Pemrosesan DNA berakhir dan bergabung.
oleh proses rekombinasi somatik. Salah satu dari 40 fungsionalLVsegmen gen
dapat bergabung dengan salah satu dari limaJsegmen dalam proses ini; DNA
di antara segmen yang bergabung dihapus begitu saja (-Gambar 20.18). Vκ2 RSS Vκn JK3 +
Peristiwa bergabung dimediasi oleh situs yang disebut sekuens sinyal TergabungVKnJK3 RSS RSS Jκ2 RSS
rekombinasi (RSS), yang berdekatan dengan masing-masing segmen gen. segmen gen
DNA yang dipotong
Situs-situs ini terdiri dari pengulangan panjang pasangan 7 atau 9 basa yang
dipisahkan oleh spacer panjang pasangan 12 atau 23 basa. Pengulangan - GAMBAR 20.18Model sederhana dariV-Jbergabung. Proses
dalam RSS segera ke hilir dari sebuahLV segmen gen komplementer dengan penggabungan dimediasi oleh pengikatan spesifik RAG1 dan
pengulangan dalam RSS segera di hulu aJsegmen gen. Ketika pasangan RAG2 ke urutan sinyal rekombinasi (RSS) yang berdekatan
berulang ini, kompleks protein dapat mengkatalisis rekombinasi di antara denganV dan J gsegmen en. RSS berdekatan dengan masing-
masingVsegmen berisi spacer 12-nukleotida; yang
mereka, bergabung denganLVsegmen keJsegmen. Iturkombinasisebuah
bersebelahan denganJsegmen berisi spacer 23-nukleotida.
mengaktifkangene protein 1 dan 2 (RAG1 dan RAG2) adalah komponen
Kompleks RAG1/RAG2 mengkatalisis rekombinasi hanya jika
penting dari kompleks ini; bersama-sama, mereka mengontrol kekhususan
satu RSS berisi spacer 12-nukleotida dan RSS lainnya berisi
acara rekombinasi. spacer 23-nukleotida.
ItuLVJfusi yang dihasilkan oleh peristiwa rekombinasi ini mengkodekan bagian
variabel dari rantai ringan kappa. Seluruh urutan DNA—LVJ-peregangan noncoding-C
—di lokus kappa yang diatur ulang kemudian ditranskripsikan. Urutan noncoding
antara yang menyatuLVJsegmen dan Csegmen dihapus selama pemrosesan RNA,
seperti halnya intron dari gen lain, dan mRNA yang dihasilkan diterjemahkan ke
dalam polipeptida. Peptida pemimpin terminal amino dibelah dari polipeptida ini
untuk membuat rantai ringan kappa yang sudah jadi. Jumlah total rantai ringan
kappa fungsional yang dapat dihasilkan oleh mekanisme ini adalah 40 (jumlah
fungsional)LVsegmen gen) - 5 (jumlah Jsegmen gen) - 1 (jumlahCsegmen gen) 200.
Dengan cara yang sama, rekombinasi segmen gen dapat membuat 120 rantai ringan
lambda yang berbeda dan 6600 rantai berat yang berbeda. Perakitan kombinatorial
dari semua rantai ini kemudian memungkinkan manusia untuk menghasilkan 320
(200 - 120) - 6600 2.112.000
578 Bab 20Kontrol Genetik Perkembangan Hewan

antibodi yang berbeda. Namun, jumlah sebenarnya dari antibodi yang berbeda bahkan
lebih besar karena sedikit variasi di tempat di mana peristiwa rekombinasi terjadi, dan
karena hipermutabilitas dalam urutan yang mengkodekan daerah variabel dari rantai
antibodi. Semua peristiwa ini terjadi secara independen dalam prekursor sel B plasma.
Jadi, saat sel-sel ini berdiferensiasi, masing-masing sel memperoleh kemampuan untuk
menghasilkan antibodi yang berbeda.

POIN UTAMA Banyak gen vertebrata—misalnya,hoksgen — telah diidentifikasi oleh homologi dengan gen yang
diisolasi dari organisme model seperti:DrosophiladanC. elegan.

Di antara vertebrata, tikus memberikan kesempatan untuk mempelajari mutasi yang mempengaruhi
perkembangan.

Sel induk mamalia, terutama yang berasal dari embrio, dapat dibiakkanin vitrountuk mempelajari
mekanisme yang mendasari diferensiasi.

Hewan yang dihasilkan oleh kloning reproduksi menunjukkan bahwa sel-sel yang berdiferensiasi memiliki potensi
genetik yang sama dengan zigot.

Rekombinasi antara segmen gen selama diferensiasi sel imun menciptakan urutan yang
mengkodekan rantai antibodi ringan dan berat.

Latihan Dasar
Ilustrasikan Analisis Genetika Dasar

1. Susunlah tahapan perkembangan berikut dalamDrosophila
melanogasterdalam urutan kronologis dari awal hingga terbaru:
pupa, blastoderm, zigot, telur yang tidak dibuahi, larva, dewasa.
Menjawab:telur yang tidak dibuahi, zigot, blastoderm, larva, pupa, dewasa.
2. Drosophilabetina homozigot untuk resesif yang baru
ditemukan, mutasi autosomal bertelur yang tidak menetas
menjadi larva, terlepas dari genotipe pasangannya. Namun,
betina itu sendiri tidak menunjukkan kelainan yang jelas. Jenis
gen apa yang didefinisikan oleh mutasi baru ini?
Menjawab:Mutasi baru mendefinisikan gen efek ibu.
3. Prediksi fenotipe mata lalat homozigot untuk mutasi kehilangan
fungsi resesif padatanpa tujuhgen. Akankah seekor lalat
Menjawab:Seekor lalat homozigot untuktanpa tujuhmutasi akan
tidak mengembangkan fotoreseptor R7 di masing-masing
ommatidia di mata majemuknya. Itutanpa tujuhgen
mengkode reseptor terikat membran untuk ligan
ekstraseluler yang memicu sel R7 untuk berdiferensiasi; ligan
dikodekan olehpengantin tanpa tujuhgen. Seekor lalat
homozigot untukpengantin tanpa tujuhmutasi akan memiliki
fenotipe yang sama.
4. Misalkan gen rantai ringan antibodi dirakit dari tiga
segmen gen yang berbeda. Berapa banyak rantai
berbeda yang dapat dihasilkan jika genom berisi 5, 20,
dan 200 salinan dari tiga segmen gen?
Menjawab:Jika setiap gen dirakit menggunakan satu salinan masing-masing

homozigot untuk mutasi kehilangan fungsi resesif dipengantin segmen gen, 5 - 20 - 200 20.000 gen yang berbeda
tanpa tujuhgen memiliki fenotipe yang sama? dimungkinkan.

Menguji Pengetahuan Anda

Integrasikan Konsep dan Teknik yang Berbeda

1. Produk protein daripunggung(dl) gen dalamDrosophila
telah disebut morfogen ventral—yaitu, zat yang
menyebabkan pembentukan struktur ventral dalam
embrio karena konsentrasinya yang tinggi dalam nuklei di
sisi ventral blastoderm. Namun, protein punggung
dapat memasuki nukleus ventral ini hanya jika reseptor pada
permukaan ventral embrio telah diaktifkan. Reseptor ini
dikodekan olehKorban(Tl)gen. Ligan ekstraseluler untuk
reseptor Toll dikodekan olehspätzle(spz) gen. Ligan ini dapat
berada dalam dua keadaan, "asli" dan "dimodifikasi," dan