Siklus Asam Sitrat

Machine Translated by Google
600 Bab 15 Prinsip Regulasi Metabolik: Glukosa dan Glikogen
11. Cacat Enzim pada Metabo Karbohidrat gejala lainnya. Biopsi otot menunjukkan konsentrasi gen gliko otot jauh lebih
lism Ringkasan dari empat studi kasus klinis mengikuti. tinggi dari biasanya. Mengapa gen gliko menumpuk?
Untuk setiap kasus, tentukan enzim mana yang rusak dan tentukan perlakuan
yang sesuai, dari daftar yang disediakan di akhir soal. Benarkan pilihan Anda. Kasus D Pasien lesu, hatinya membesar, dan biopsi hati menunjukkan
kelebihan glikogen dalam jumlah besar. Dia juga memiliki kadar glukosa
Jawablah pertanyaan-pertanyaan yang terdapat dalam setiap studi kasus.
darah yang lebih rendah dari normal.
(Anda mungkin perlu mengacu pada informasi di Bab 14.)
Apa penyebab glukosa darah rendah pada pasien ini?
Kasus A Pasien mengalami muntah dan diare segera setelah konsumsi Enzim yang Rusak (a)
susu. Tes toleransi laktosa diiklankan. (Pasien mencerna laktosa dalam Otot PFK-1 (b)
jumlah standar, dan konsentrasi glukosa dan galaktosa plasma darah diukur Fosfomanosa isomerase (c) Galaktosa 1-
pada interval. Pada individu normal, kadarnya meningkat hingga maksimum fosfat uridililtransferase (d) Fosforilase glikogen hati (e)
dalam waktu sekitar 1 jam, kemudian menurun.) Triose kinase (f) Laktase pada mukosa usus
(g) Maltase pada
Glukosa darah pasien dan konsentrasi galaktosa tidak meningkat selama tes. mukosa usus (h) Enzim pemecah cabang
Mengapa glukosa darah dan tosa galak meningkat dan kemudian menurun otot
selama tes normal pada individu? Mengapa mereka gagal bangkit pada
pasien? Perlakuan
Kasus B Pasien mengalami muntah dan diare setelah menelan susu. 1. Jogging 5 km setiap hari 2.
Darahnya ditemukan memiliki konsentrasi glukosa yang rendah tetapi Diet bebas lemak
konsentrasi gula pereduksi yang jauh lebih tinggi dari biasanya. Tes urin 3. Diet rendah laktosa
untuk galaktosa positif. Mengapa konsentrasi gula pereduksi dalam darah 4. Menghindari olahraga berat 5. Niasin
tinggi? Mengapa galaktosa muncul dalam urin? dosis besar (prekursor NAD)
6. Sering menyusu secara teratur
Kasus C Pasien mengeluh nyeri kram otot saat melakukan aktivitas fisik
berat tetapi tidak ada
bab 16
SIKLUS ASAM SITRAT
16.1 Produksi Acetyl-CoA (Activated tahap kedua, gugus asetil dimasukkan ke dalam siklus asam sitrat,
Acetate) 602 yang secara enzimatis mengoksidasinya menjadi CO2; energi
yang dilepaskan dilestarikan dalam pembawa elektron tereduksi
16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat 606 16.3 Regulasi
NADH dan FADH2. Pada tahap ketiga respirasi, koenzim tereduksi
Siklus Asam Sitrat 621 16.4 Siklus Glioksilat 623 ini sendiri teroksidasi, melepaskan proton (H) dan elektron. Elektron
ditransfer ke O2—akseptor elektron terakhir—melalui rantai molekul
pembawa elektron yang dikenal sebagai rantai pernapasan. Dalam
perjalanan transfer elektron, sejumlah besar energi yang dilepaskan
Jika sitrat ditambahkan laju respirasi sering disimpan dalam bentuk ATP, melalui proses yang disebut
meningkat. . . serapan oksigen ekstra jauh lebih besar fosforilasi oksidatif (Bab 19). Respirasi lebih kompleks daripada
glikolisis dan diyakini telah berkembang lama kemudian, setelah
daripada yang dapat dijelaskan oleh oksidasi sitrat secara
munculnya cyanobacteria. Aktivitas metabolisme cyanobacteria
lengkap. . . Karena asam sitrat bereaksi secara katalitik
bertanggung jawab atas peningkatan kadar oksigen di atmosfer
dalam jaringan, kemungkinan asam sitrat dihilangkan bumi, titik balik yang dramatis dalam sejarah evolusi.
melalui reaksi primer tetapi diregenerasi oleh reaksi berikutnya.
—HA Krebs dan WA Johnson, artikel di Enzymologia, 1937
Kami pertama-tama mempertimbangkan konversi piruvat

menjadi gugus asetil, kemudian masuknya gugus tersebut ke
Seperti yang
(ATP) kita lihat
dengan di Bab 14,
fermentasi, beberapa
memecah sel mendapatkan
glukosa energi
tanpa adanya dalam siklus asam sitrat, juga disebut siklus asam trikarboksilat
oksigen. Bagi sebagian besar sel eukariotik dan banyak bakteri, (TCA) atau siklus Krebs (setelah penemunya, Hans Krebs). Kami
yang hidup dalam kondisi aerobik dan mengoksidasi bahan bakar selanjutnya memeriksa reaksi siklus dan enzim yang
organiknya menjadi karbon dioksida dan air, kolisis glikolisis mengkatalisisnya. Karena zat antara dari siklus asam sitrat juga
hanyalah tahap pertama dalam oksidasi sempurna glukosa. Alih- disedot sebagai prekursor biosintetik, kita akan membahas
alih direduksi menjadi laktat, etanol, atau produk fermentasi beberapa cara di mana zat antara ini diisi kembali. Siklus asam
lainnya, piruvat yang dihasilkan oleh glikolisis selanjutnya sitrat adalah pusat metabolisme, dengan jalur degradatif yang
dioksidasi menjadi H2O dan CO2. Fase katabolisme aerobik ini mengarah ke dalam dan jalur anabolik yang mengarah ke luar, dan
disebut respirasi. Dalam arti fisiologis atau makroskopis yang diatur secara ketat dalam koordinasi dengan jalur lainnya. Bab ini
lebih luas, respirasi mengacu pada pengambilan O2 oleh organisme diakhiri dengan deskripsi jalur
multisel dan pelepasan CO2. Akan tetapi, ahli biokimia dan ahli oksalat gli, urutan metabolisme
biologi sel menggunakan istilah ini dalam arti yang lebih sempit pada beberapa organisme yang
untuk merujuk pada proses molekuler di mana sel mengonsumsi menggunakan beberapa enzim
O2 dan menghasilkan CO2—proses yang lebih tepat disebut dan reaksi yang sama yang
respirasi sel. digunakan dalam siklus asam sitrat,
menghasilkan sintesis bersih
Respirasi seluler terjadi dalam tiga tahap utama (Gbr. 16-1). glukosa dari triasilgliserol yang
Yang pertama, molekul bahan bakar organik — glukosa, asam disimpan.
lemak, dan beberapa asam amino — dioksidasi untuk menghasilkan
fragmen dua karbon dalam bentuk gugus asetil dari asetil-koenzim
A (asetil-KoA). Di detik Hans Krebs, 1900–1981
601
602 Bab 16 Siklus Asam Sitrat
GAMBAR 16–1 Katabolisme protein, lemak, dan karbohidrat dalam tiga

Tahap 1
tahap respirasi seluler. Tahap 1: oksidasi asam lemak, glukosa, dan
Asam Asam produksi
Glukosa asetil-CoA beberapa asam amino menghasilkan asetil-KoA. Tahap 2: oksidasi gugus
amino lemak
asetil dalam siklus asam sitrat mencakup empat langkah di mana elektron
diabstraksikan. Tahap 3: elektron yang dibawa oleh NADH dan FADH2
disalurkan ke rantai pembawa elektron mitokondria (atau, pada bakteri, terikat
Glikolisis
membran plasma)—rantai pernapasan—yang pada akhirnya mereduksi O2
menjadi H2O. Aliran elektron ini mendorong produksi ATP.
Dia
Piruvat
kompleks
piruvat
Dia dehidrogenase
Dia
dan gula lainnya melalui glikolisis, dioksidasi menjadi asetil-
CO2 KoA dan CO2 oleh kompleks piruvat dehidrogenase (PDH),
Dia
sekelompok enzim — beberapa salinan dari masing-masing
Asetil-KoA
tiga enzim — terletak di mitokondria sel kariotik eu dan di
Tahap 2 sitosol prokariota .
Oksidasi
asetil-KoA Pemeriksaan yang cermat terhadap kompleks enzim ini
bermanfaat dalam beberapa hal. Kompleks PDH adalah
contoh kompleks multienzim klasik yang banyak dipelajari di
Garam sitrat
Oksaloasetat mana serangkaian zat antara kimia tetap terikat pada molekul
enzim saat substrat diubah menjadi produk akhir. Lima
Dia
Siklus
kofaktor, empat berasal dari vitamin, berpartisipasi dalam
asam sitrat
Dia mekanisme reaksi. Regulasi kompleks enzim ini juga
menggambarkan bagaimana kombinasi modifikasi kovalen
Dia dan regulasi alosterik menghasilkan fluks yang diatur secara
CO2 tepat melalui langkah metabolisme. Akhirnya, kompleks PDH
Dia
CO2 adalah prototipe untuk dua kompleks enzim penting lainnya:

-ketoglutarate dehydrogenase, dari siklus asam sitrat, dan
rantai bercabang -keto acid dehydroge nase, dari jalur oksidatif
NADH,
beberapa asam amino (lihat Gambar 18). –28). Kesamaan
FADH2
(pembawa e tereduksi) Tahap 3 yang luar biasa dalam struktur protein, persyaratan kofaktor,
Transfer elektron dan dan mekanisme reaksi dari ketiga kompleks ini tidak diragukan
fosforilasi
Dia
lagi mencerminkan asal usul evolusi yang sama.
oksidatif
1
2H ++ 2O2
Rantai
pernapasan (transfer
elektron). Piruvat Dioksidasi menjadi Asetil-KoA dan CO2
H2O
Reaksi keseluruhan yang dikatalisis oleh kompleks piruvat
ADP + Pi ATP dehy drogenase adalah dekarboksilasi oksidatif, proses
oksidasi yang tidak dapat diubah di mana gugus karboksil
dihilangkan dari piruvat sebagai molekul CO2.
16.1 Produksi Acetyl-CoA CO2

CoA-SH
(Activated Acetate) HAI
M D
HAI
MEREKA
TPP,
NADH
C lipoat, HAI S-CoA
MD
Pada organisme aerob, glukosa dan gula lainnya, asam lemak, A
C
MODE
C HAI P
dan sebagian besar asam amino pada akhirnya dioksidasi kompleks piruvat A
dehidrogenase (E1 E2 E3)

A
CH3 CH3
menjadi CO2 dan H2O melalui siklus asam sitrat dan rantai
pernapasan. Sebelum memasuki siklus asam sitrat, rangka Piruvat Asetil-KoA
karbon dari gula dan asam lemak didegradasi menjadi gugus
G 33,4 kJ/mol
asetil dari asetil-KoA, bentuk di mana siklus tersebut menerima
sebagian besar input bahan bakarnya. Banyak karbon asam GAMBAR 16–2 Reaksi keseluruhan yang dikatalisis oleh kompleks
amino juga memasuki siklus dengan cara ini, meskipun piruvat dehidro genase. Lima koenzim yang berpartisipasi dalam reaksi ini,
beberapa asam amino terdegradasi menjadi intermediet siklus lainnya.
dan tiga enzim yang menyusun kompleks enzim, dibahas dalam teks.
Di sini kita fokus pada bagaimana piruvat, berasal dari glukosa
16.1 Produksi Acetyl-CoA (Activated Acetate) 603
Gugus
tiol reaktif
NH2
N
H H H N Adenin
CH3 HAI HAI
5
HS CH2 CH2 N C CH2 CH2 NC C C CH2 HAI P HAI P HAI CH2 N N
HAI
- Merkapto HAI HAI OH CH3 HAI HAI

4 1
HH
etilamina H H
Asam pantotenat
3 2
Ribosa 3-fosfat
HAI OH
PADA HAI
HAI
CH3 C HAI
S-Dengan
3-fosfoadenosin difosfat
Koenzim A
Asetil-KoA
GAMBAR 16-3 Koenzim A (CoA). Gugus hidroksil dari asam

pantotenat bergabung dengan bagian ADP yang dimodifikasi oleh lebih banyak dalam beberapa reaksi metabolisme. Gugus asil
ikatan ester fosfat, dan gugus karboksilnya melekat pada secara kovalen terkait dengan gugus tiol, membentuk tioester.
-mercaptoethylamine dalam ikatan amida. Gugus hidroksil pada posisi Karena energi bebas hidrolisis standarnya yang relatif tinggi
3 bagian ADP memiliki gugus fosforil yang tidak terdapat dalam ADP (lihat Gambar 13–6, 13–7), tioester memiliki potensi transfer
bebas. Gugus OSH dari gugus merkaptoetilamina membentuk tioester gugus asil yang tinggi dan dapat menyumbangkan gugus
dengan asetat dalam asetil koenzim A (asetil-KoA) (kiri bawah). asilnya ke berbagai molekul akseptor. Gugus asil yang melekat
pada koenzim A dapat dianggap sebagai "diaktifkan" untuk
transfer gugus.
dan dua karbon yang tersisa menjadi gugus asetil dari asetil- Kofaktor kelima dari kompleks PDH, lipoat (Gbr. 16-4),
KoA (Gbr. 16–2). NADH yang terbentuk dalam reaksi ini memiliki dua gugus tiol yang dapat mengalami oksidasi
melepaskan ion hidrida (:H) ke rantai pernapasan (Gbr. 16-1), reversibel menjadi ikatan disulfida (OSOSO), mirip dengan
yang membawa dua elektron ke oksigen atau, dalam oksidasi antara dua residu Cys dalam protein.
mikroorganisme anaerobik, ke akseptor elektron alternatif Karena kapasitasnya untuk menjalani reaksi oksidasi-reduksi,
seperti nitrat. atau sulfat. Transfer elektron dari NADH ke lipoat dapat berfungsi sebagai pembawa elektron hidrogen
oksigen pada akhirnya menghasilkan 2,5 molekul ATP per dan sebagai pembawa asil, seperti yang akan kita lihat.
pasang elektron.
Irreversibilitas reaksi kompleks PDH telah ditunjukkan oleh
Bentuk Bentuk yang Bentuk asetat
percobaan pelabelan isotop: kompleks tidak dapat memasang teroksidasi dikurangi HAI
kembali CO2 berlabel radioaktif ke asetil-KoA untuk

CH2 HS CH2 CH3 CS CH2
menghasilkan piruvat berlabel karboksil. S
CH2 CH2 CH2
S
CH HS CH HS CH
Kompleks Piruvat Dehidrogenase Membutuhkan
Asam CH2 CH2 CH2
Lima Koenzim lipoat
CH2
Gabungan dehidrogenasi dan dekarboksilasi piruvat menjadi CH2
gugus asetil dari asetil-KoA (Gbr. 16–2) memerlukan aksi CH2
berurutan dari tiga enzim berbeda dan lima koenzim berbeda C HAI
atau gugus prostetik—tiamina pirofosfat (TPP), flavin adenin HN

dinukleotida (FAD ), koenzim A (CoA, kadang-kadang disebut CH2
CoA-SH, untuk menekankan peran kelompok OSH), residu Lys CH2
nicotinamide adenine dinucleotide (NAD), dan lipoate. Empat dari E2
CH2
vitamin berbeda yang dibutuhkan dalam nutrisi manusia CH2
adalah komponen vital dari sistem ini: tiamin (dalam TPP), CH
riboflavin (dalam FAD), niacin (dalam NAD), dan pan tothenate N C Rantai polipeptida dari
H E2 (dihidrolipoil
(dalam CoA). Kami telah menjelaskan peran FAD dan NAD HAI
transasetilase)
sebagai pembawa elektron (Bab 13), dan kami telah
menemukan TPP sebagai koenzim piruvat dekarboksilase GAMBAR 16–4 Asam lipoat (lipoat) dalam ikatan amida dengan
(lihat Gambar 14-13). residu Lys. Bagian lipoyllysyl adalah kelompok prostetik dari
dihydrolipoyl transacetylase (E2 dari kompleks PDH). Gugus lipoil
Koenzim A (Gbr. 16–3) memiliki gugus tiol reaktif (OSH) terjadi dalam bentuk teroksidasi (disulfida) dan tereduksi (ditiol) dan
yang sangat penting untuk peran CoA sebagai mobil asil bertindak sebagai pembawa hidrogen dan gugus asetil (atau asil lainnya).
Kompleks Piruvat Dehidrogenase Terdiri koneksi untuk lipoat kelompok prostetik, melekat melalui
ikatan amida ke gugus -amino dari residu Lys (Gbr. 16-4).
dari Tiga Enzim Berbeda
E2 memiliki tiga induk do yang berbeda secara fungsional
Kompleks PDH mengandung tiga enzim—piruvat (Gbr. 16–5c): domain lipoil terminal amino , yang mengandung
dehidrogenase (E1), dihydrolipoyl transacetylase (E2), residu lipoil-Lys; domain pengikat E1- dan E3 pusat ; dan
dan dihydrolipoyl dehydrogenase (E3)—masing-masing domain acyltransferase inti dalam , yang berisi situs aktif
hadir dalam banyak salinan. Jumlah salinan dari setiap enzim acyltransferase.
dan oleh karena itu ukuran kompleks bervariasi antar Kompleks PDH ragi memiliki domain lipoyl tunggal dengan
spesies. Kompleks PDH yang diisolasi dari mamalia lipoat terpasang, tetapi kompleks mamalia memiliki dua, dan
berdiameter sekitar 50 nm—lebih dari lima kali ukuran E. coli memiliki tiga (Gbr. 16–5c). Domain E2 dipisahkan
seluruh ribosom dan cukup besar untuk dilihat dengan oleh linker, urutan 20 sampai 30 residu asam amino, kaya
mikroskop elektron (Gbr. 16–5a). Dalam enzim sapi, 60 akan Ala dan Pro dan diselingi dengan residu bermuatan;
salinan identik E2 membentuk pena tagonal dodecahedron penghubung ini cenderung mengambil bentuk yang
(inti) dengan diameter sekitar 25 nm (Gbr. 16–5b). (Inti enzim diperluas, memisahkan ketiga domain.
Escherichia coli mengandung 24 salinan E2.) E2 adalah Situs aktif E1 telah mengikat TPP, dan situs aktif E3
intinya telah mengikat FAD. Juga bagian dari kompleks adalah dua reg
50 nm
GAMBAR 16–5 Struktur kompleks piruvat dehidrogenase (a) Mikrograf

cryoelectron dari kompleks PDH yang diisolasi dari ginjal sapi. Dalam mikroskop
cryoelectron, sampel biologis dilihat pada suhu yang sangat rendah; ini
menghindari artefak potensial yang diperkenalkan oleh proses dehidrasi, fiksasi,
dan pewarnaan yang biasa. (b) Gambar tiga dimensi kompleks PDH,
memperlihatkan struktur subunit: E1, piruvat dehidrogenase; E2, dihydrolipoyl
transacetylase; dan E3, dihydrolipoyl dehydrogenase. Gambar ini direkonstruksi
dengan analisis sejumlah besar gambar seperti pada (a), dikombinasikan
dengan studi crys tallographic dari masing-masing subunit. Inti (hijau) terdiri
dari 60 molekul E2, disusun dalam 20 trimer untuk membentuk dodecahedron
pentagonal. Domain lipoil E2 (biru) menjangkau ke luar untuk menyentuh sisi
aktif molekul E1 (kuning) yang tersusun pada inti E2 .
Sejumlah subunit E3 (merah) juga terikat ke inti, di mana lengan ayun di E2

dapat mencapai tempat aktifnya. Tanda bintang menandai situs di mana
kelompok lipoil melekat pada domain lipoil E2. Untuk memperjelas strukturnya,
(A) sekitar setengah dari kompleks telah dipotong dari depan. Model ini disiapkan
oleh ZH Zhou et al. (2001); dalam model lain, yang diusulkan oleh JLS Milne et
al. (2002), subunit E3 terletak lebih ke arah pinggiran (lihat Bacaan Lebih
Lanjut). (c) E2 terdiri dari tiga jenis domain yang dihubungkan oleh penghubung
pasang polipep pendek: domain acyltransferase katalitik; domain pengikat,
E1 E1
terlibat dalam pengikatan E2 ke E1 dan E3; dan satu atau lebih domain lipoil
* (tergantung spesiesnya).
E3 E3
Jumlah domain lipoil

bervariasi berdasarkan spesies.
Penghubung
E2 E2 E.coli Mamalia (2) Ragi polipeptida yang
(3) (1) fleksibel
N C
Binding domain
(terlibat dalam
pengikatan
E2-E1 dan E2-E3 )
domain
lipoil
Domain
10 nm
asiltransferase (inti dalam)
(B) (C)
16.1 Produksi Acetyl-CoA (Activated Acetate) 605
protein pengatur, protein kinase dan fosfoprotein fosfatase, asam boxylic (asetat). Dua elektron yang dilepaskan dalam
dibahas di bawah. Struktur dasar E1-E2-E3 ini telah dilestarikan reaksi ini mereduksi OSOSO dari gugus lipoil pada E2 menjadi
selama evolusi dan digunakan dalam sejumlah reaksi dua gugus tiol (OSH). Gugus asetil yang dihasilkan dalam reaksi
metabolisme serupa, termasuk oksidasi -ketoglutarat dalam oksidasi-reduksi ini pertama-tama diesterifikasi menjadi salah
siklus asam sitrat (dijelaskan di bawah) dan oksidasi asam satu gugus lipoil OSH, kemudian ditransesterifikasi menjadi
-keto yang berasal dari penguraian. asam amino rantai cabang CoA untuk membentuk asetil-KoA (langkah 3). Dengan demikian
valin, isoleusin, dan leusin (lihat Gambar 18–28). Dalam spesies energi oksidasi mendorong pembentukan thioester asetat
tertentu, E3 dari PDH identik dengan E3 dari dua kompleks berenergi tinggi. Reaksi yang tersisa dikatalisis oleh kompleks
enzim lainnya. Penempelan lipoat ke ujung rantai samping Lys PDH (oleh E3, dalam langkah 4 dan 5) adalah transfer elektron
di E2 menghasilkan lengan yang panjang dan fleksibel yang yang diperlukan untuk meregenerasi bentuk teroksidasi
dapat berpindah dari situs aktif E1 ke situs aktif E2 dan E3, (disulfida) dari gugus lipoil E2 untuk menyiapkan kompleks
jarak mungkin 5 nm atau enzim untuk putaran oksidasi selanjutnya. Elektron yang
dilepaskan dari gugus hidroksi yetil yang berasal dari piruvat
lagi. melewati FAD ke NAD.
Dalam Penyaluran Substrat, Perantara Jangan Pernah Inti dari mekanisme kompleks PDH adalah lengan lipoililsil
E2 yang berayun, yang menerima dari E1 dua elektron dan
Meninggalkan Permukaan Enzim
gugus asetil yang diturunkan dari piruvat, meneruskannya ke
Gambar 16-6 menunjukkan secara skematis bagaimana E3. Semua enzim dan koenzim ini dikelompokkan, memungkinkan
kompleks piruvat de hidrogenase melakukan lima reaksi berturut- intermediet untuk bereaksi dengan cepat tanpa menyebar dari
turut dalam dekarboksilasi dan dehidrogenasi piruvat. Langkah permukaan kompleks enzim. Urutan lima reaksi yang
1 pada dasarnya identik dengan reaksi yang dikatalisis oleh ditunjukkan pada Gambar 16-6 dengan demikian merupakan
piruvat dekarboksilase (lihat Gambar 14–13c); C-1 piruvat contoh penyaluran substrat. Perantara dari urutan multilangkah
dilepaskan sebagai CO2, dan C-2, yang dalam piruvat memiliki tidak pernah meninggalkan kompleks, dan konsentrasi lokal
keadaan oksidasi aldehida, terikat pada TPP sebagai gugus substrat E2 dijaga sangat tinggi. Penyaluran juga mencegah
hidroksietil. Langkah pertama ini adalah yang paling lambat dan pencurian gugus asetil yang diaktifkan oleh enzim lain yang
karena itu membatasi laju reaksi keseluruhan. Ini juga menggunakan gugus ini sebagai substrat. Seperti yang akan
merupakan titik di mana kompleks PDH menggunakan kita lihat, mekanisme tethering serupa untuk penyaluran substrat
spesifisitas substratnya. Pada langkah 2 gugus hidroksietil antara yang aktif
dioksidasi ke tingkat mobil
HAI
CoA-SH CH3 C S-CoA

HAI CH3 HAI
HAI
C
C Asetil-KoA
CH3 C
HAI- 3
Piruvat TPP Dengan SH mengurangi lipoylysine
Asil
SH
1 2
lipoililsin SH
TPP S Lampu
CO2 CHOH S TIDAK + H+

MODE
Teroksidasi 4
CH3 lipoyllysine 5
Hidroksietil
TPP FADH2
NAD+
piruvat Dihydrolipoyl Dihidrolipoil

dehidrogenase, transacetylase, dehidrogenase,
E1 E2 E3
GAMBAR 16–6 Dekarboksilasi oksidatif piruvat menjadi asetil-KoA Gugus OSH dari CoA menggantikan gugus OSH dari E2 untuk menghasilkan
oleh kompleks PDH. Nasib piruvat dilacak dengan warna merah. Pada asetil-KoA dan bentuk gugus lipoil yang tereduksi penuh (dithiol). Pada
langkah 1 piruvat bereaksi dengan ikatan tiamin pirofosfat (TPP) dari langkah 4 di hydrolipoyl dehydrogenase (E3) mendorong transfer dua atom
piruvat dehidrogenase (E1), mengalami dekarboksilasi menjadi turunan hidrogen dari gugus lipoil tereduksi E2 ke gugus prostetik FAD dari E3,
hidroksietil (lihat Gambar 14-13). Piruvat dehidrogenase juga mentransfer mengembalikan bentuk teroksidasi dari gugus lipoyllysyl E2.
dari TPP ke bentuk , dua elektron dan gugus asetil melakukan langkah 2 Pada langkah 5 FADH2 tereduksi dari E3 mentransfer ion hidrida ke NAD,
teroksidasi gugus lipoililsil dari enzim inti, dihidrolipoil transasetilase ( E2), membentuk NADH. Kompleks enzim sekarang siap untuk siklus alitik
untuk membentuk asetil thioester dari gugus lipoil tereduksi. Langkah 3 kucing lainnya. (Warna subunit sesuai dengan yang ada di Gambar 16–5b.)
adalah transesterifikasi di mana
situs digunakan dalam beberapa enzim lain, dengan lipoat, bi otin, ÿ Organisasi kompleks PDH sangat mirip dengan kompleks
atau bagian mirip CoA yang berfungsi sebagai kofaktor. enzim yang mengkatalisis oksidasi -ketoglutarat dan
Seperti yang diperkirakan, mutasi pada gen untuk subunit rantai cabang -keto asam.
kompleks PDH, atau defisiensi tiamin dalam makanan,
dapat menimbulkan konsekuensi yang parah.
Hewan yang kekurangan tiamin tidak dapat mengoksidasi piruvat
secara normal. Ini sangat penting bagi otak, yang biasanya
memperoleh semua energinya dari oksidasi udara glukosa dalam 16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat
jalur yang mencakup oksidasi piruvat. Beri-beri, penyakit akibat Kami sekarang siap untuk melacak proses dimana asetil KoA
defisiensi tiamin, ditandai dengan hilangnya fungsi saraf. Penyakit mengalami oksidasi. Transformasi kimia ini dilakukan oleh siklus
ini terjadi terutama pada populasi yang bergantung pada makanan asam sitrat, jalur siklik pertama yang kita temui (Gbr. 16-7). Untuk
yang sebagian besar terdiri dari beras putih (dipoles), yang memulai pergantian siklus, asetil-KoA menyumbangkan gugus
kekurangan sekam di mana sebagian besar tiamin beras ditemukan. asetilnya ke senyawa oksaloasetat empat karbon untuk membentuk
Orang yang terbiasa mengonsumsi alkohol dalam jumlah besar sitrat enam karbon. Sitrat kemudian diubah menjadi isositrat, juga
juga dapat mengembangkan defisiensi tiamin, karena sebagian molekul enam karbon, yang mengalami dehidrasi dehidrasi dengan
besar asupan makanan mereka terdiri dari "kalori kosong" bebas hilangnya CO2 untuk menghasilkan senyawa lima karbon
vitamin dari minuman keras yang disuling. Peningkatan kadar -ketoglutarat (juga disebut oksoglutarat).
piruvat dalam darah seringkali merupakan indikator cacat pada
oksidasi piruvat karena salah satu penyebab ini. ÿ -Ketoglutarat mengalami kehilangan molekul CO2 kedua dan
akhirnya menghasilkan senyawa suksinat empat karbon. Suksinat
kemudian secara enzimatis diubah dalam tiga langkah menjadi
oksaloasetat berkarbon empat—yang kemudian siap bereaksi
RINGKASAN 16.1 Produksi Acetyl-CoA dengan molekul asetil-KoA lainnya.
(Activated Acetate) Pada setiap pergantian siklus, satu gugus asetil (dua karbon)
masuk sebagai asetil-KoA dan dua molekul CO2 keluar; satu
molekul oksaloasetat digunakan untuk membentuk sitrat dan satu
ÿ Piruvat, produk glikolisis, adalah
molekul oksaloasetat dibuat ulang. Tidak ada penghilangan bersih
diubah menjadi asetil-KoA, bahan awal untuk siklus
asam sitrat, oleh kompleks piruvat dehidrogenase. oksaloasetat yang terjadi; satu molekul oksalo asetat secara
teoritis dapat menyebabkan oksidasi sejumlah kecil gugus asetil,
dan faktanya, oksaloasetat terdapat dalam sel dalam konsentrasi
ÿ Kompleks PDH terdiri dari banyak salinan dari tiga yang sangat rendah. Empat dari delapan langkah dalam proses ini
enzim: piruvat dehidrogenase, E1 (dengan
adalah oksidasi, di mana energi oksidasi dilestarikan dengan sangat
TPP kofaktor terikatnya); dihydrolipoyl transacetylase, efisien dalam bentuk koenzim tereduksi NADH dan FADH2.
E2 (dengan gugus lipoil yang terikat secara kovalen);
dan dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 (dengan Seperti disebutkan sebelumnya, meskipun siklus asam sitrat
kofaktor FAD dan NAD). merupakan pusat metabolisme penghasil energi, perannya tidak
terbatas pada konservasi energi. Empat dan lima karbon di akhir
ÿ E1 pertama-tama mengkatalisis dekarboksilasi dari siklus berfungsi sebagai prekursor untuk berbagai macam produk.
piruvat, menghasilkan hidroksietil-TPP, dan kemudian Untuk mengganti perantara yang dihilangkan untuk tujuan ini, sel
oksidasi gugus hidroksietil menjadi gugus asetil. menggunakan reaksi anaplerotik (pengisian ulang), yang dijelaskan
Elektron dari oksidasi ini mereduksi disulfida lipoat di bawah ini.
yang terikat pada E2, dan gugus asetil dipindahkan ke Eugene Kennedy dan Albert Lehninger menunjukkan pada
ikatan thioester dengan satu gugus OSH dari lipoat tahun 1948 bahwa, pada eukariota, seluruh rangkaian reaksi siklus
tereduksi. asam sitrat terjadi di mitokondria. Mitokondria yang terisolasi
ditemukan tidak hanya mengandung semua enzim dan koenzim
yang diperlukan untuk siklus asam sitrat, tetapi juga semua enzim
ÿ E2 mengkatalisis pemindahan gugus asetil ke
koenzim A, membentuk asetil-KoA. dan protein yang diperlukan untuk tahap terakhir respirasi—transfer
elektron dan sintesis ATP melalui fosforilasi oksidatif. Seperti yang
ÿ E3 mengkatalisis regenerasi bentuk lipoat disulfida akan kita lihat di bab selanjutnya, mitokondria juga mengandung
(teroksidasi); elektron pertama-tama melewati FAD, enzim untuk oksidasi asam lemak dan beberapa asam amino
kemudian ke NAD. menjadi asetil-KoA, dan degradasi oksidatif asam amino lain
ÿ Lengan panjang lipoyllysine berayun dari situs aktif menjadi -ketoglutarat, suksinil-KoA, atau oksaloasetat. Jadi, pada
E1 ke E2 ke E3, menambatkan intermediet ke eukariota nonfotosintetik, mitokondria adalah tempat sebagian
kompleks enzim untuk memungkinkan penyaluran besar penghasil energi
substrat.
16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat 607
Asetil-KoA
HAI
1
Kondensasi
CH3 C S-CoA
H2O
CoA-SH
garam sitrat
sintase CH2COO _
HAI C COO ATAU COO

2a
8 CH2 MENDEKUT CH2 MENDEKUT
Dehidrasi
Dehidrogenasi Oksaloasetat Garam sitrat
malat Siklus asam H2O

dehidrogenase aconitase
sitrat
MENDEKUT
KE CH CH2COO _
Malat CH2 C MENDEKUT

cis-Aconitate
MENDEKUT C MENDEKUT
H
7
H2O
Hidrasi fumarase
NADH aconitase 2b
Hidrasi
H2O
MENDEKUT
CH2COO _
CH C COOH
Fumarat
HC FADH2 Isocitrate
KE C H
MENDEKUT
MENDEKUT
suksinat 3
isositrat
dehidrogenase
dehidrogenase
6 dekarboksilasi oksidatif
Dehidrogenasi
CH2 MENDEKUT CH2 MENDEKUT
CO2
-kompleks
CH2 suksinil-CoA CH2
dehidrogenase
sintetase
ketoglutarat
MENDEKUT C HAI
CH2 MENDEKUT
Suksinat MENDEKUT
CH2
CoA-SH -Ketoglutarat
C S-CoA CoA-SH
GTP
PDB HAI
(ATP) CO2
(ADP) Suksinil-CoA
Pi
5 4
Fosforilasi
tingkat substrat dekarboksilasi oksidatif
GAMBAR 16–7 Reaksi siklus asam sitrat. Atom karbon yang diarsir langkah reaksi sesuai dengan judul bernomor pada halaman 608–612.
dengan warna merah jambu berasal dari asetat asetil-KoA pada putaran Panah merah menunjukkan di mana energi dilestarikan oleh transfer elektron
pertama siklus; ini bukan karbon yang dilepaskan sebagai CO2 pada ke FAD atau NAD, membentuk FADH2 atau NADH H. Langkah 1 dan , 3 ,
putaran pertama. Perhatikan bahwa dalam suksinat dan fumarat, gugus 4 pada dasarnya tidak dapat diubah di dalam sel; semua langkah lainnya
dua karbon yang berasal dari asetat tidak dapat lagi dilambangkan dapat diubah kembali. Produk dari langkah 5 dapat berupa ATP atau GTP,
secara spesifik; karena suksinat dan fumarat adalah molekul simetris, bergantung pada isozim suksinil-KoA sintetase mana yang merupakan katalis.
C-1 dan C-2 tidak dapat dibedakan dari C-4 dan C-3. Nomor di samping masing-masing
reaksi oksidatif dan sintesis gabungan ATP.

Pada eukariota fotosintetik, mitokondria adalah tempat
utama produksi ATP dalam gelap, tetapi pada siang hari
kloroplas menghasilkan sebagian besar ATP organisme.
Pada kebanyakan prokariota, enzim siklus asam sitrat
berada di sitosol, dan membran plasma memainkan peran
yang analog dengan membran mitokondria bagian dalam
dalam sintesis ATP (Bab 19).
Siklus Asam Sitrat Memiliki Delapan Langkah
Dalam memeriksa delapan langkah reaksi berurutan dari

siklus asam sitrat, kami memberikan penekanan khusus
pada transformasi kimia yang terjadi ketika sitrat terbentuk
dari asetil-KoA dan oksaloasetat dioksidasi untuk (A)
menghasilkan CO2 dan energi oksidasi ini dilestarikan
dalam koenzim tereduksi . NADH dan FADH2.
1 Pembentukan Sitrat Reaksi pertama dari siklus ini

adalah kondensasi asetil-KoA dengan oksaloasetat untuk
membentuk sitrat, dikatalisis oleh sintase sitrat:
H2O CoA-SH
HAI
CH3 C OC COO
sitrat
S-CoA sintase
CH2 MENDEKUT
Asetil-KoA Oksaloasetat
HAI
CH2 C
HAI (B)
KE C COO
GAMBAR 16–8 Struktur sintase sitrat. Domain fleksibel dari setiap
CH2 MENDEKUT
subunit mengalami perubahan konformasi yang besar pada pengikatan
Garam sitrat G 32,2 kJ/mol
oksaloasetat yang menciptakan situs pengikatan untuk asetil-KoA. (a)
enzim bentuk terbuka saja (PDB ID 5CSC); (b) bentuk tertutup dengan
Dalam reaksi ini karbon metil dari gugus asetil bergabung
oksaloasetat terikat (kuning) dan analog stabil asetil-KoA (karboksimetil
dengan gugus karbonil (C-2) dari oksaloasetat.
KoA; merah) (berasal dari PDB ID 5CTS).
Citroyl-CoA adalah zat antara sementara yang terbentuk
pada sisi aktif enzim (lihat Gambar 16–9). Ini dengan cepat perubahan dalam domain fleksibel, membuat situs
mengalami hidrolisis untuk membebaskan CoA dan sitrat, pengikatan untuk substrat kedua, asetil-KoA. Ketika citroyl-
yang dilepaskan dari situs aktif. Hidrolisis zat antara CoA telah terbentuk di sisi aktif enzim, perubahan
thioester berenergi tinggi ini membuat reaksi maju menjadi konformasi lainnya menyebabkan hidrolisis thioester,
sangat eksergonik. Perubahan energi bebas standar yang melepaskan CoA-SH. Kecocokan enzim yang diinduksi ini
besar dan negatif dari reaksi sintase sitrat sangat penting pertama-tama ke substratnya dan kemudian ke perantara
untuk pengoperasian siklus karena, seperti disebutkan reaksinya mengurangi kemungkinan pembelahan ikatan
sebelumnya, konsentrasi oksaloasetat biasanya sangat tioester asetil-KoA yang prematur dan tidak produktif. Studi
rendah. CoA yang dibebaskan dalam reaksi ini didaur ulang kinetik enzim konsisten dengan mekanisme bisubstrat yang
untuk berpartisipasi dalam dekarboksilasi oksidatif molekul teratur ini (lihat Gambar 6-13). Reaksi yang dikatalisis oleh
piruvat lain oleh kompleks PDH. sintase sitrat pada dasarnya adalah kondensasi Claisen
Sitrat sintase dari mitokondria telah dihitung dan (hal. 485), yang melibatkan tioester (asetil-KoA) dan keton
divisualisasikan dengan difraksi sinar-X dengan kehadiran (oksaloasetat) (Gbr. 16–9).
dan ketiadaan substrat dan penghambatnya (Gbr. 1).
16–8). Setiap subunit dari enzim homodimer adalah 2 Pembentukan Isocitrate via cis-Aconitate Enzim
polipeptida tunggal dengan dua domain, satu besar dan aconitase (lebih formal, aconitate hydratase) mengkatalisis
kaku, yang lain lebih kecil dan lebih fleksibel, dengan situs transformasi reversibel sitrat menjadi isocitrate, melalui
aktif di antaranya. Oksaloasetat, substrat pertama yang pembentukan perantara asam trikarboksilat cis-aconitate,
berikatan dengan enzim, menginduksi konformasi besar yang biasanya tidak
tidak terpisah dari situs aktif. Aconitase dapat mendorong

H
N Nya274 penambahan reversibel H2O ke ikatan rangkap cis-aconitate
+ yang terikat enzim dalam dua cara berbeda, satu mengarah
N ke sitrat dan yang lainnya ke isositrat:
H H
N CH2COO _ H2O CH2COO _ H2O
+ HAI C COO– HAI
320
Miliknya N H H KE C COO C COO
H2C MENDEKUT-
HC CS Dengan aconitase aconitase
Oksaloasetat H C COO C COO
:
H Asetil-KoA
HAI HAI- H H
375 Garam sitrat cis-Aconitate

Sintase sitrat Asp
CH2COO _
Keterkaitan thioester dalam asetil-KoA mengaktifkan hidrogen H C COO

metil, dan Asp375 mengabstraksi proton dari gugus metil,
membentuk zat antara enolat. KE CH
MENDEKUT
1 Isocitrate
G 13,3 kJ/mol
Zat antara distabilkan oleh ikatan hidrogen ke dan/atau
protonasi oleh His274 (protonasi penuh ditunjukkan). Meskipun campuran kesetimbangan pada pH 7,4 dan 25 C
mengandung kurang dari 10% isositrat, di dalam sel reaksi
H
N Nya274 ditarik ke kanan karena isositrat dikonsumsi dengan cepat
pada langkah siklus berikutnya, sehingga menurunkan
N
:
konsentrasi tunaknya. Aconitase mengandung pusat
H H
belerang besi (Gbr. 16-10), yang bekerja baik dalam
N HAI pengikatan substrat di situs aktif maupun dalam
+ H
320 –
Miliknya N H O COO C HC CS Dengan penambahan atau penghilangan H2O secara katalitik .
perantara enol
H2C MENDEKUT-
H
HAI HAI
Asp375
Enol(at) mengatur ulang untuk menyerang karbon karbonil MEKANISME GAMBAR 16–9 Sitrat sintase. Dalam reaksi sintase laju
oksaloasetat, dengan posisi His274 untuk menarik proton yang sitrat mamalia, oksaloasetat berikatan terlebih dahulu, dalam urutan aksi
sebelumnya telah disumbangkannya. His320 bertindak sebagai asam umum. reaksi yang teratur. Pengikatan ini memicu perubahan konformasi yang
membuka situs pengikatan untuk asetil-KoA. Oksaloasetat secara khusus
berorientasi pada situs aktif sintase sitrat melalui interaksi dua karboksilatnya
2
dengan dua residu Arg bermuatan positif (tidak diperlihatkan di sini).
Detail mekanisme dijelaskan pada gambar.
Kondensasi yang dihasilkan menghasilkan citroyl-CoA. Mekanisme Sintase Sitrat
H
N Nya274
CoA-SH Nya274
N
H
H HAI
N H
H H2O
HC MENDEKUT-
320 HC CS Dengan
Miliknya
N Nya320
3 ATAU COO–
KE C MENDEKUT-
Citroyl-CoA CH2 MENDEKUT-

Garam sitrat
CH2 MENDEKUT-
Asp375 Asp375
Tioester selanjutnya dihidrolisis, meregenerasi CoA-SH dan

menghasilkan sitrat.
Garam sitrat
matriks mitokondria dan sitosol, mungkin merupakan
H H generasi NADPH, yang penting untuk reduksi dan reaksi
HAI
HAI MENDEKUT
abolik.
HAI C
S
Fe CH2 4 Oksidasi -Ketoglutarat menjadi Suksinil-KoA dan CO2
Cys S C
Fe S
HAI
Langkah selanjutnya adalah dekarboksilasi oksidatif lainnya,
S HC
Fe di mana -ketoglutarat diubah menjadi suksinil-KoA dan CO2
OOC H B
Cys S H oleh aksi kompleks -ketoglutarat dehy drogenase; NAD
S Fe
berfungsi sebagai penerima elektron dan CoA sebagai
S Cys pembawa gugus suksinil. Energi oksidasi -ketoglutarat
dilestarikan dalam pembentukan ikatan tioester suksinil-KoA:
GAMBAR 16–10 Pusat besi-sulfur di aconitase. Pusat besi-belerang CoA-SH
berwarna merah, molekul sitrat berwarna biru. Tiga residu Cys dari enzim MEREKA
CH2 MENDEKUT CH2 MENDEKUT
NADH
mengikat tiga atom besi; besi keempat terikat pada salah satu gugus karboksil
CH2 CH2 CO2
sitrat dan juga berinteraksi secara nonkovalen dengan gugus hidroksil sitrat
-kompleks
(ikatan putus-putus). Residu basa (:B) pada enzim membantu memposisikan BERSAMA C S-CoA
dehidrogenase
sitrat di tempat aktif. Pusat besi-sulfur bertindak baik dalam pengikatan substrat ketoglutarat
MENDEKUT HAI
maupun katalisis. Sifat umum protein besi-sulfur dibahas di Bab 19 (lihat

-Ketoglutarat Suksinil-CoA
Gambar 19–5).
G 33,5 kJ/mol
Reaksi ini sebenarnya identik dengan reaksi piruvat

3 Oksidasi Isocitrate menjadi -Ketoglutarate dan CO2 dehidrogenase yang dibahas di atas, dan kompleks
Pada langkah selanjutnya, isocitrate dehydrogenase -ketoglutarat dehidrogenase sangat mirip dengan kompleks
mengkatalisis dekarboksilasi oksidatif isocitrate untuk PDH baik dalam struktur maupun fungsi.
membentuk -ketoglu tarate (Gbr. 16–11). Mn2 di situs aktif Ini mencakup tiga enzim, homolog dengan E1, E2, dan E3
berinteraksi dengan gugus karbonil dari zat antara dari kompleks PDH, serta TPP yang terikat enzim, lipoat
oksalosuksinat, yang terbentuk secara sementara tetapi tidak terikat, FAD, NAD, dan koenzim A. Kedua kompleks tersebut
meninggalkan situs pengikatan sampai dekarboksilasi tentunya berasal dari nenek moyang evolusi bersama.
mengubahnya menjadi - ketoglutarat. Mn2 juga menstabilkan Meskipun komponen E1 dari kedua kompleks ini secara
enol yang terbentuk secara sementara melalui dekarboksilasi. struktural serupa, urutan asam aminonya berbeda dan,
Ada dua bentuk berbeda dari isocitrate dehy drogenase tentu saja, mereka memiliki spesifisitas pengikatan yang
di semua sel, yang satu membutuhkan NAD sebagai akseptor berbeda: E1 kompleks PDH mengikat piruvat, dan E1
elektron dan yang lainnya membutuhkan NADP. Reaksi kompleks -ketoglutarat dehidrogenase mengikat -ketoglutarat.
keseluruhan dinyatakan identik. Dalam sel eukariotik, enzim Komponen E2 dari kedua kompleks juga sangat mirip,
yang bergantung pada NAD terjadi dalam matriks mitokondria keduanya memiliki gugus lipoil yang terikat secara kovalen.
dan berfungsi dalam siklus asam sitrat. Fungsi utama dari Subunit E3 identik dalam dua kompleks enzim.
enzim yang bergantung pada NADP, ditemukan pada keduanya
MENDEKUT MENDEKUT MENDEKUT MENDEKUT
CH2 NAD(P)NAD(P)HH CH2 CH2 CH2

HAI HAI
CO2 H
H CC isositrat H CC HC H CH
HAI HAI 2 3
dehidrogenase
KE C H C HAI BERSAMA C HAI
1
C C Mn2 C Mn2 C
OO OO OO OO a-
Isocitrate Oksalosuksinat Ketoglutarat
MEKANISME GAMBAR 16–11 Isocitrate dehydrogenase. Dalam reaksi ini, gugus karbonil membentuk molekul untuk dekarboksilasi pada langkah 2 .
substrat, isositrat, kehilangan satu karbon melalui dekarboksilasi oksidatif. Interaksi oksigen karbonil dengan ion Mn2+ yang terikat meningkatkan kapasitas
,
Pada langkah 1 isositrat berikatan dengan enzim dan dioksidasi oleh transfer penarikan elektron dari gugus karbonil dan memfasilitasi langkah dekarboksilasi.
hidrida ke NAD+ atau NADP+ , bergantung pada isositrat dehidrogenase isozim. Reaksi selesai pada langkah 3 dengan penataan ulang zat antara enol untuk
(Lihat Gambar 14–12 untuk informasi lebih lanjut tentang reaksi transfer hidrida menghasilkan -ketoglu
yang melibatkan NAD+ dan NADP+ .) Hasilnya dedak.
(A) OO
5 Konversi Suksinil-KoA menjadi Suksinat Suksinil-
C
KoA, seperti asetil-KoA, memiliki ikatan thioester dengan
energi bebas hidrolisis standar negatif yang kuat (G ÿ 36 Miliknya CH2
Suksinil-CoA
kJ/mol). Pada langkah selanjutnya dari siklus asam CH2
sitrat, energi yang dilepaskan dalam pemutusan ikatan ini Suksinil-CoA C
digunakan untuk menggerakkan sintesis ikatan sintetase HAI S-CoA
fosfoanhidrida baik dalam GTP maupun ATP, dengan G bersih hanya 2,9 kJ/ mol .
Suksinat terbentuk dalam proses:
CH2 MENDEKUT MENDEKUT

PDB Pi GTP CoA-SH Pi
CH2 CH2
1
C S-CoA CH2
suksinil-CoA
HAI
sintetase MENDEKUT CoA-SH
Suksinil-CoA Suksinat
OO
C
G 2,9 kJ/mol
CH2
Enzim yang mengkatalisis reaksi reversibel ini disebut
Suksinil fosfat
suksinil-KoA sintetase atau suksinat thioki nase; CH2 yang
kedua nama menunjukkan partisipasi nukleosida trifosfat Miliknya terikat enzim
dalam reaksi (Kotak 16-1).
C
Reaksi penghematan energi ini melibatkan langkah HAI HAI P
perantara di mana molekul enzim itu sendiri terfosforilasi
pada residunya di situs aktif (Gbr. 16-12a). Gugus fosforil
2 HAI HAI
ini, yang memiliki potensi transfer gugus yang tinggi, C CH2 CH2 C
ditransfer ke ADP (atau GDP) untuk membentuk ATP (atau HAI HAI
Suksinat
GTP). Sel hewan memiliki dua isozim suksinil-CoA
sintetase, satu khusus untuk ADP dan yang lainnya untuk
PDB. Enzim memiliki dua subunit, (Mr 32.000), yang Miliknya P Enzim fosfohistidil
memiliki residu P-His (His246) dan tempat pengikatan
untuk CoA, dan (Mr 42.000), yang memberikan spesifisitas
PDB
baik untuk ADP atau GDP. Situs aktif berada di antarmuka 3
antara subunit. Struktur kristal suksinil-KoA sintetase GTP
mengungkapkan dua "heliks daya" (satu dari setiap
subunit), diorientasikan sehingga dipol listriknya
menempatkan muatan positif parsial dekat dengan muatan Miliknya
negatif P-His (Gbr. 16–12b), menstabilkan fosfoenzim

intermediat. (Ingat peran serupa dipol heliks dalam
menstabilkan ion K dalam saluran K (lihat Gambar 11–48).)
GAMBAR 16–12 Reaksi suksinil-KoA sintetase. (a) Pada langkah 1

(B)
gugus fosforil menggantikan CoA dari suksinil-KoA yang terikat pada
enzim, membentuk asil fosfat berenergi tinggi. Pada langkah 2 succinyl
phosphate menyumbangkan gugus fosforilnya ke residu-Nya pada
enzim, membentuk enzim fosfohistidil berenergi tinggi. Pada langkah 3
gugus fosforil ditransfer dari residunya ke fosfat terminal GDP (atau
ADP), membentuk GTP (atau ATP). (b) Succinyl CoA synthetase dari
E. coli (berasal dari PDB ID 1SCU). Enzim bakteri dan mamalia memiliki
urutan asam amino yang serupa dan diduga memiliki struktur tiga
dimensi yang sangat mirip. Situs aktif mencakup bagian dari subunit
(biru) dan (coklat). Heliks daya (biru cerah, coklat tua) menempatkan
muatan positif parsial dipol heliks di dekat gugus fosfat (oranye) pada
rantai His246 , menstabilkan enzim fosfohistidil. Koenzim A ditampilkan
di sini sebagai struktur tongkat merah. (Untuk meningkatkan visibilitas
kekuatan yang dia kutu, beberapa struktur sekunder di dekatnya telah
dibuat transparan.)
Pembentukan ATP (atau GTP) dengan mengorbankan (formalnya, fumarat hidratase). Keadaan transisi dalam
energi yang dilepaskan oleh dekarboksilasi oksidatif reaksi ini adalah karbanion:
-ketoglutarat adalah fosforilasi tingkat substrat, seperti
sintesis ATP dalam reaksi glikolitik yang dikatalisis oleh H COO H
MENDEKUT
OH
C C
gliseraldehida 3-fosfat dehidrogenase dan piruvat kinase
( lihat Gambar 14–2). GTP yang dibentuk oleh suksinil C fumarase C OH
OOC H OOC
CoA sintetase dapat menyumbangkan gugus fosforil H
terminalnya ke ADP untuk membentuk ATP, dalam reaksi Fumarat Keadaan
reversibel yang dikatalisis oleh nukleosida difosfat kinase (hal. 505): transisi karbanion
GTP ADP Pada PDB ATP G 0 kJ/mol

H
Jadi hasil bersih dari aktivitas salah satu isozim suksinil- fumarase
KoA sintetase adalah kekekalan energi sebagai ATP. Tidak
ada perubahan energi bebas untuk reaksi nu cleoside
diphosphate kinase; ATP dan GTP setara secara energetik. H
MENDEKUT
H C
6 Oksidasi Suksinat menjadi Fumarat Suksinat yang C OH

OOC
terbentuk dari suksinil-KoA dioksidasi menjadi fumarat oleh H
flavoprotein suksinat dehidrogenase: Malat
G 3,8 kJ/mol
MENDEKUT
MODE MODEH2 H MENDEKUT
CH2 C Enzim ini sangat stereospesifik; itu mengkatalisis hidrasi

ikatan rangkap trans fumarat tetapi bukan ikatan rangkap
CH2 suksinat C
dehidrogenase OOC H cis maleat (isomer cis fumarat). Dalam arah sebaliknya
MENDEKUT
(dari L-malat ke fumarat), fuma rase sama stereospesifiknya:
Suksinat Fumarat D-malat bukanlah substrat.
G 0 kJ/mol H COO H MENDEKUT
Pada eukariota, suksinat dehidrogenase terikat erat pada C C
membran mitokondria bagian dalam; pada prokariota, ke C C

membran plasma. Enzim tersebut mengandung tiga kluster OOC H H MENDEKUT
besi-sulfur yang berbeda dan satu molekul FAD yang terikat Fumarat Maleat
secara kovalen (lihat Gambar 19–xx). Elektron melewati
suksinat melalui FAD dan pusat besi-sulfur sebelum MENDEKUT MENDEKUT
memasuki rantai pembawa elektron di membran dalam

KE CH H C OH
drial mitokondria (atau membran plasma pada bakteri).
Aliran elektron dari suksinat melalui pembawa ini ke CH2 CH2
akseptor elektron terakhir, O2, digabungkan dengan MENDEKUT MENDEKUT
sintesis sekitar 1,5 molekul ATP per pasang elektron L-Malat D-Malat
(fosforilasi terkait-respirasi). Malonat, analog suksinat yang
biasanya tidak ada dalam sel, adalah penghambat kompetitif 8 Oksidasi Malat menjadi Oksaloasetat Pada reaksi
yang kuat dari suksinat dehidroge nase dan penambahannya terakhir siklus asam sitrat, L-malat dehy drogenase yang
ke mitokondria memblokir aktivitas siklus asam sitrat. berikatan dengan NAD mengkatalisis oksidasi L-malat
menjadi ox aloacetate:
HAI HAI
MENDEKUT MENDEKUT
MEREKA NADH H
C
HAI HAI
Batuk C HAI C
C CH2
CH2 CH2
malat
CH2 CH2
MENDEKUT dehidrogenase MENDEKUT
C C L-Malat Oksaloasetat
OO OO
Malonat Suksinat G 29,7 kJ/mol
7 Hidrasi Fumarat menjadi Malat Hidrasi reversibel Kesetimbangan reaksi ini terletak jauh ke kiri dalam kondisi
fumarat menjadi L-malat dikatalisis oleh fumarase termodinamika standar, tetapi dalam sel utuh
KOTAK 16–1 BEKERJA DALAM BIOKIMIA
Synthases dan Synthetase; Ligase dan fosforilasi, penghilangan gugus fosforil dari ester fosfat,
dikatalisis oleh fosfatase, dengan air sebagai spesies
Lyases; Kinases, Phosphatases, dan
penyerang. Fruktosa bis fosfatase-1 mengubah fruktosa
Phosphorylases: Ya, Namanya Membingungkan!
1,6-bifosfat menjadi fruktosa 6-fosfat dalam glukoneogenesis,
Sintase sitrat adalah salah satu dari banyak enzim yang dan fosforilase a fosfatase menghilangkan gugus fosforil
mengkatalisis reaksi kondensasi, menghasilkan produk dari fosfoserin dalam fosforilase glikogen terfosforilasi. Wah!
yang lebih kompleks secara kimia daripada prekursornya.
Sintase mengkatalisasi reaksi kondensasi di mana tidak
diperlukan nukleosida triphosphate (ATP, GTP, dan Sayangnya, deskripsi jenis enzim ini tumpang tindih,
sebagainya) sebagai sumber energi. Sintetase dan banyak enzim biasanya disebut dengan dua nama atau
mengkatalisasi kondensasi yang menggunakan ATP atau lebih. Suksinil-CoA sintetase, misalnya, juga disebut
nukleosida trifosfat lainnya sebagai sumber energi untuk suksinat tiokinase; Enzim tersebut merupakan sintetase
reaksi sintetik. Succinyl CoA synthetase adalah enzim dalam siklus asam sitrat dan ki nase ketika bertindak ke
semacam itu. Ligase (dari bahasa Latin ligare, "mengikat") arah tesis sintesis suksinil-KoA. Ini menimbulkan sumber
adalah enzim yang mengalisis reaksi kondensasi di mana kebingungan lain dalam penamaan enzim. Suatu enzim
dua atom digabungkan menggunakan ATP atau sumber mungkin telah ditemukan dengan menggunakan pengujian
energi lain. (Jadi syn thetase adalah ligase.) DNA ligase, di mana, katakanlah, A diubah menjadi B. Enzim tersebut
misalnya, menutup pemutusan pada molekul DNA, kemudian diberi nama untuk reaksi tersebut. Pekerjaan
menggunakan energi yang disuplai oleh ATP atau NAD; itu selanjutnya mungkin menunjukkan, bagaimanapun, bahwa
banyak digunakan dalam menggabungkan potongan DNA di dalam sel, enzim berfungsi terutama dalam mengubah B menjadi A.
untuk rekayasa genetika. Ligase jangan dikacaukan dengan Umumnya, nama depan terus digunakan, meskipun peran
lyases, enzim yang mengkatalisis pembelahan (atau, metabolisme enzim akan lebih baik dijelaskan dengan
dalam arah sebaliknya, penambahan) di mana penataan menamainya untuk reaksi sebaliknya.
ulang elektronik terjadi. Kompleks PDH, yang secara Enzim glikolitik piruvat kinase menggambarkan situasi ini
oksidatif memotong CO2 dari piruvat, adalah anggota kelas besar lyases.
(hal. 532). Bagi seorang pemula dalam biokimia, duplikasi
Nama kinase diterapkan pada enzim yang mentransfer nomenklatur ini bisa membingungkan. Dalam komite
gugus fosforil dari nukleosida triphosphate seperti ATP ke internasional telah melakukan upaya heroik untuk
molekul akseptor gula (seperti dalam heksokinase dan mensistematisasikan nomenklatur enzim (lihat Tabel 6-3
glukokinase), protein (seperti dalam glikogen fosforilase untuk ringkasan singkat sistem), tetapi beberapa nama
kinase), nukleotida lain (seperti dalam nukleosida difosfat sistematik terbukti terlalu panjang dan rumit dan tidak sering
kinase), atau zat antara metabolik seperti oksaloasetat digunakan dalam percakapan biokimia.
(seperti pada PEP car boxykinase). Reaksi yang dikatalisis
oleh kinase adalah fosforilasi. Di sisi lain, fosforolisis adalah Kami telah mencoba di sepanjang buku ini untuk
reaksi perpindahan di mana fosfat adalah spesies yang menggunakan nama enzim yang paling umum digunakan
menyerang dan menjadi terikat secara kovalen pada titik oleh ahli kimia bio dan untuk menunjukkan kasus di mana
pemutusan ikatan. Reaksi semacam itu dikatalisis oleh enzim memiliki lebih dari satu nama yang digunakan secara
fosforilase. Glycogen phos phorylase, misalnya, luas. Untuk informasi terkini tentang nomenklatur enzim,
mengkatalisis fosforolisis glikogen, menghasilkan glukosa lihat rekomendasi dari Komite Nomenklatur International
1-fosfat. Dephos Union of Biochemistry and Molecular Bi ology
(www.chem.qmw.ac.uk/iubmb/nomenclature/).
oksaloasetat terus-menerus dihilangkan dengan reaksi prekursor beled seperti [14C]piruvat dan [14C]asetat,
sintase gona sitrat yang sangat ekser (langkah 1 dari Gambar 16-7). peneliti telah menelusuri nasib atom karbon individu melalui
Hal ini menjaga konsentrasi oksaloasetat dalam sel sangat siklus asam sitrat. Beberapa percobaan paling awal dengan
rendah (106 M), menarik reaksi malat dehidrogenase menuju isotop menghasilkan hasil yang tidak terduga, yang
pembentukan oksaloasetat. menimbulkan kontroversi besar tentang jalur dan mekanisme
siklus asam sitrat. Nyatanya, percobaan ini pada awalnya
Meskipun reaksi individu dari siklus asam sitrat awalnya tampaknya menunjukkan bahwa sitrat bukanlah asam
dikerjakan secara in vitro, dengan menggunakan jaringan otot trikarboksilat pertama yang terbentuk. Kotak 16–2 memberikan
cincang, jalur dan pengaturannya juga telah dipelajari secara beberapa detail tentang episode ini dalam sejarah penelitian
ekstensif secara in vivo. Dengan menggunakan radioaktif la siklus asam sitrat. Fluks metabolik
melalui siklus sekarang dapat dipantau dalam jaringan hidup tion dari satu ATP atau GTP. Pada akhir siklus, molekul
dengan menggunakan prekursor berlabel 13C dan oksaloasetat dihasilkan kembali. Perhatikan bahwa dua atom
spektroskopi NMR seluruh jaringan. Karena sinyal NMR unik karbon yang muncul sebagai CO2 bukanlah dua atom karbon
untuk senyawa yang mengandung 13C, ahli biokimia dapat yang sama yang dimasukkan dalam bentuk gugus asetil;
melacak pergerakan karbon prekursor ke dalam setiap putaran tambahan di sekitar siklus diperlukan untuk
perantara siklus dan menjadi senyawa yang berasal dari melepaskan karbon ini sebagai CO2 (Gbr. 16–7).
perantara. Teknik ini sangat menjanjikan untuk mempelajari Meskipun siklus asam sitrat secara langsung menghasilkan
pengaturan siklus asam sitrat dan interkoneksinya dengan hanya satu ATP per giliran (dalam konversi suksinil KoA
jalur metabolisme lain seperti glikolisis. menjadi suksinat), empat langkah oksidasi dalam siklus
memberikan aliran besar elektron ke dalam rantai pernapasan
melalui NADH dan FADH2 dan dengan demikian menyebabkan
pembentukan asam sitrat . sejumlah besar molekul ATP
Energi Oksidasi dalam Siklus
selama fosforilasi oksidatif.
Efisien Dilestarikan Kita melihat di Bab 14 bahwa hasil energi dari produksi
Kita sekarang telah membahas satu putaran penuh dari siklus dua molekul piruvat dari satu molekul glukosa dalam glikolisis
asam sitrat (Gbr. 16–13). Gugus asetil dua karbon memasuki adalah 2 ATP dan 2 NADH.
siklus dengan bergabung dengan oksaloasetat. Dua atom Dalam fosforilasi oksidatif (Bab 19), lewatnya dua elektron
karbon muncul dari siklus sebagai CO2 dari oksidasi isositrat dari NADH ke O2 mendorong pembentukan sekitar 2,5 ATP,
dan -ketoglutarat. Energi yang dilepaskan oleh oksidasi ini dan lewatnya dua elektron dari FADH2 ke O2 menghasilkan
dilestarikan dalam reduksi tiga NAD dan satu FAD dan produk sekitar 1,5 ATP. Stoikiometri ini memungkinkan kita untuk
menghitung hasil keseluruhan ATP dari yang lengkap
Sitrat: Molekul Simetris yang Bereaksi Asimetris karbon karboksil berlabel dari gugus asetil dalam reaksi
Ketika senyawa siklus dengan demikian dapat dilacak. -Ketoglutarat diisolasi
yang diperkaya dengan isotop karbon berat 13C dan isotop dari jaringan setelah inkubasi, kemudian didegradasi oleh
karbon radioaktif 11C dan 14C tersedia sekitar 60 tahun reaksi kimia yang diketahui untuk menetapkan posisi karbon
yang lalu, mereka segera digunakan untuk melacak jalur isotop.
atom karbon melalui sitrat. siklus asam. Salah satu Kondensasi oksaloasetat tak berlabel dengan asetat
eksperimen semacam itu memicu kontroversi mengenai berlabel karboksil diharapkan menghasilkan sitrat berlabel
peran sitrat. Asetat berlabel dalam kelompok karboksil dalam salah satu dari dua gugus karboksil primer. Sitrat
(ditunjuk [1-14C] asetat) diinkubasi secara aerobik dengan adalah molekul simetris, dua gugus karboksil terminalnya
persiapan jaringan hewan. Asetat secara enzimatis diubah secara kimiawi tidak dapat dibedakan. Oleh karena itu,
menjadi asetil-KoA dalam jaringan hewan, dan jalur setengah molekul sitrat berlabel diharapkan menghasilkan
-ketoglutarat berlabel
CH2 14COO CH2 14COO
CH MENDEKUT CH2
CH3 14COO 1
asetat berlabel KE CH COO OC COO
CH2 14COO
KE C MENDEKUT
Hanya produk ini
yang dibentuk.
HAI C MENDEKUT CH2 MENDEKUT
Berlabel sitrat 2
CH2 MENDEKUT CH2COO _
CH2 MENDEKUT
Oksaloasetat CH MENDEKUT CH MENDEKUT
KE CH 14COO HAI C 14COO

Isocitrate
Bentuk label yang
kedua ini
GAMBAR 1 Penggabungan karbon isotop (14C) dari gugus asetil -ketoglutarat juga
berlabel menjadi -ketoglutarat melalui siklus asam sitrat. Atom karbon diharapkan, tetapi
dari gugus asetil yang masuk ditunjukkan dengan warna merah. tidak terbentuk.

Asetil-KoA
Garam sitrat
oksidasi glukosa. Ketika kedua molekul piruvat dioksidasi
menjadi 6 CO2 melalui kompleks piruvat dehidrogenase
dan siklus asam sitrat, dan elektron ditransfer ke O2
Oksaloasetat
Isocitrate melalui fosforilasi oksidatif, sebanyak 32 ATP diperoleh
NADH per glukosa (Tabel 16-1). Dalam bilangan bulat, ini mewakili
Siklus NADH konservasi 32 30,5 kJ/mol 976 kJ/mol, atau 34% dari
CO2
asam
maksimum teoretis sekitar 2.840 kJ/mol yang tersedia
Malat sitrat
A -Ketoglutarat dari oksidasi glukosa lengkap. Perhitungan ini
CO2 menggunakan perubahan energi bebas standar; ketika
Fumarat NADH dikoreksi untuk energi bebas aktual yang diperlukan untuk
membentuk ATP di dalam sel (lihat Kotak 13–1), efisiensi
Suksinil-CoA
FADH2 proses yang dihitung mendekati 65%.
Suksinat
GTP
(ATP)
Mengapa Oksidasi Asetat Begitu Rumit?

GAMBAR 16–13 Produk dari satu putaran siklus asam sitrat. Pada
setiap pergantian siklus, tiga NADH, satu FADH2, satu GTP (atau ATP),
Proses delapan langkah siklik untuk oksidasi dua gugus
dan dua CO2 dilepaskan dalam reaksi dekarboksilasi oksidatif. Di sini dan
asetil karbon sederhana menjadi CO2 mungkin tampak
dalam beberapa gambar berikut, semua reaksi siklus diperlihatkan berjalan tidak praktis dan tidak sesuai dengan prinsip biologis
dalam satu arah saja, tetapi perlu diingat bahwa sebagian besar reaksi ekonomi maksimum. Namun, peran siklus asam sitrat tidak
bersifat reversibel (lihat Gambar 16–7). terbatas pada oksidasi asetat.
gugus -karboksil dan separuh lainnya untuk menghasilkan Namun, pada tahun 1948, Alexander Ogston
- keto-glutarat berlabel dalam gugus -karboksil; yaitu, menunjukkan bahwa meskipun sitrat tidak memiliki pusat
-ketoglutarat yang diisolasi diharapkan merupakan kiral (lihat Gambar 1–19), sitrat memiliki potensi untuk
campuran dari dua jenis molekul berlabel (Gbr. 1, jalur 1 bereaksi secara asimetris jika enzim yang berinteraksi
dan 2). Berlawanan dengan harapan ini, label dengannya memiliki situs aktif yang asimetris. Dia
-ketoglutarat yang diisolasi dari suspensi jaringan menyarankan bahwa situs aktif aconitase mungkin
mengandung 14C hanya pada gugus -karboksil (Gbr. 1, memiliki tiga titik di mana tingkat sitrat harus diikat dan
jalur 1 ). Para peneliti menyimpulkan bahwa sitrat (atau bahwa sitrat harus mengalami perlekatan tiga titik spesifik
molekul simetris lainnya) tidak dapat menjadi perantara pada titik pengikatan ini. Seperti yang terlihat pada
dalam jalur dari asetat ke -ketoglutarat. Sebaliknya, Gambar 2, pengikatan sitrat ke tiga titik tersebut dapat
asam trikarboksilat asimetris, mungkin cis-aconitate atau terjadi hanya dengan satu cara, dan ini akan menjelaskan
isocitrate, harus menjadi produk pertama yang terbentuk pembentukan hanya satu jenis -ketoglutarat berlabel.
dari kondensasi asetat dan oksaloasetat. Molekul organik seperti sitrat yang tidak memiliki pusat
kiral tetapi berpotensi mampu bereaksi secara asimetris
dengan situs aktif asimetris sekarang disebut molekul prokiral .
CH2COO
Ikatan yang
C rentan Ikatan ini Ikatan ini dapat
tidak dapat diposisikan
KE CH2COO DENGAN
diposisikan dengan benar

DENGAN
MENDEKUT
C dengan
A
dan diserang.
C
benar dan EH 0
XZ
(A) DAN tidak diserang.XZ DAN
GAMBAR 2 Sifat prochiral sitrat. (a) Struktur sitrat; (b) representasi Situs aktif memiliki
(B) X DENGAN
skematis sitrat: X OOH; Y OCOO; Z OCH2COO. (c) Penyesuaian DAN titik pengikat yang
saling melengkapi.
komplementer sitrat yang benar ke tempat pengikatan aconitase. Hanya
ada satu cara di mana tiga kelompok sitrat tertentu dapat masuk ke tiga (C)
titik tempat pengikatan. Jadi hanya satu dari dua kelompok OCH2COO
yang terikat oleh aconitase.
Jalur ini adalah pusat metabolisme perantara. Komponen Siklus Asam Sitrat Penting
Produk akhir empat dan lima karbon dari banyak proses katabolik Perantara Biosintetik
dimasukkan ke dalam siklus untuk berfungsi sebagai bahan bakar.
Oksaloak etat dan -ketoglutarat, misalnya, masing-masing diproduksi dari Pada organisme aerobik, siklus asam sitrat adalah jalur amfibolik, jalur
aspartat dan glutamat, ketika protein terdegradasi. Dalam beberapa yang berfungsi dalam proses katabolik dan anabolik. Selain perannya
keadaan metabolisme, perantara ditarik keluar dari siklus untuk digunakan dalam katabolisme oksidatif karbohidrat, asam lemak, dan asam amino,
sebagai kursor awal dalam berbagai jalur biosintetik. siklus menyediakan prekursor untuk banyak jalur biosintetik (Gambar
16-15), melalui reaksi yang melayani tujuan yang sama pada nenek
Siklus asam sitrat, seperti semua jalur metabolisme lainnya, adalah moyang anaerobik. -Ketoglutarat dan oksaloasetat dapat, misalnya,
produk evolusi, dan sebagian besar evolusi ini terjadi sebelum munculnya berfungsi sebagai prekursor asam amino aspartat dan glutamat melalui
organisme aerob. transaminasi sederhana (Bab 22). Melalui aspartat dan glutamat, karbon
Itu tidak selalu mewakili jalur terpendek dari asetat ke CO2, tetapi itu oksaloasetat dan -ketoglutarat kemudian digunakan untuk membangun
adalah jalur yang, dari waktu ke waktu, memberikan keuntungan selektif asam amino lain, serta nukleotida purin dan pirimidin. Oksaloasetat
terbesar. Anaerob awal kemungkinan besar menggunakan beberapa diubah menjadi glukosa dalam glukoneogenesis (lihat Gambar 15–15).
reaksi siklus asam sitrat dalam proses biosintetik linier. Bahkan, beberapa Succinyl CoA adalah perantara sentral dalam sintesis cincin porfirin dari
mikroorganisme anaerob modern menggunakan siklus asam sitrat lengkap gugus heme, yang berfungsi sebagai pembawa oksigen (dalam hemoglobin
sebagai sumber, bukan energi, tetapi prekursor biosintetik (Gbr. 16-14). dan mioglobin) dan pembawa elektron (dalam sitokrom) (lihat Gambar
Organisme ini menggunakan tiga reaksi pertama dari siklus untuk 22-23). Dan kadar sit yang dihasilkan pada beberapa organisme digunakan
membuat - ketoglutarat tetapi, kekurangan -ketoglutarate dehydroge nase, secara komersial untuk berbagai tujuan (Kotak 16–3).
mereka tidak dapat melakukan rangkaian lengkap reaksi siklus asam

sitrat. Mereka memang memiliki empat enzim yang mengkatalisis
konversi reversibel oksaloasetat menjadi suksinil-KoA dan dapat
menghasilkan malat, fumarat, suksinat, dan suksinil-KoA dari oksaloasetat
dalam pembalikan arah aliran "normal" (oksidatif) melalui siklus. . Jalur ini
adalah fermentasi, dengan NADH yang dihasilkan oleh oksidasi isositrat
Reaksi Anaplerotik Mengisi Asam Sitrat
didaur ulang menjadi NAD melalui reduksi oksaloasetat menjadi suksinat.
Siklus Menengah
Sebagai intermediet dari siklus asam sitrat dihilangkan untuk melayani
sebagai prekursor biosintetik, mereka diisi ulang oleh reaksi anaplerotik
(Gambar 16-15; Tabel 16-2).
Dengan evolusi cyanobacteria yang menghasilkan O2 dari air, Dalam keadaan normal, reaksi di mana intermediet siklus disedot ke jalur
atmosfer bumi menjadi aerobik dan organisme berada di bawah tekanan lain dan yang diisi ulang berada dalam keseimbangan dinamis, sehingga
selektif untuk mengembangkan metabolisme aerobik, yang, seperti telah konsentrasi intermediet siklus asam sitrat tetap hampir konstan.
kita lihat, jauh lebih efisien daripada fermentasi anaerobik.
TABEL 16–1 Stoikiometri Reduksi Koenzim dan Pembentukan ATP dalam Oksidasi Aerobik Glukosa melalui
Glikolisis, Reaksi Kompleks Piruvat Dehidrogenase, Siklus Asam Sitrat, dan Fosforilasi Oksidatif
Jumlah ATP atau dikurangi Jumlah ATP
Reaksi koenzim langsung terbentuk akhirnya terbentuk*
Glukosa Pada glukosa 6-fosfat 1 ATP

Fruktosa 6-fosfat Pada fruktosa 1,6-bifosfat 1 ATP
2 Gliseraldehida 3-fosfat Pada 2 1,3-bifosfogliserat 2 NADH 1 1 3 atau
2 1,3-Bisfosfogliserat Pada 2 3-fosfogliserat 2 ATP

2 Phosphoenolpyruvate Pada 2 piruvat 2 ATP
2 Piruvat Pada 2 asetil-KoA 2 NADH
2 Isocitrate On 2 -ketoglutarate 2 NADH
2 -Ketoglutarat Pada 2 suksinil-KoA 2 NADH
2 Suksinil-CoA Pada 2 suksinat 2 ATP (atau 2 GTP)
2 Suksinat Pada 2 fumarat 2FADH2
2 Malat Pada 2 oksaloasetat 2 NADH
Total 5† 2 2 5 5 5 2 3 5 30–32
*Ini dihitung sebagai 2,5 ATP per NADH dan 1,5 ATP per FADH2. Nilai negatif menunjukkan konsumsi. †
Angka ini bisa 3 atau 5, tergantung pada mekanisme yang digunakan untuk mengangkut ekuivalen NADH dari sitosol ke matriks
mitokondria; lihat Gambar 19–27 dan 19–28.
Tabel 16-2 menunjukkan reaksi anaplerotik yang paling

Asetil-KoA umum, yang semuanya, di berbagai jaringan dan organisme,
SEMANGAT
mengubah piruvat atau fosfoenolpiruvat menjadi ox
atau
piruvat
aloacetate atau malate. Reaksi anaplerotik terpenting pada
hati dan ginjal mamalia adalah karboksilasi reversibel piruvat
CO2 oleh CO2 untuk membentuk oksaloasetat, yang dikatalisis
oleh piruvat karboksilase. Ketika siklus asam sitrat
kekurangan oksaloasetat atau perantara lainnya, piruvat
dikarboksilasi untuk menghasilkan lebih banyak oksalo
Oksaloasetat
Garam sitrat
asetat. Penambahan enzimatik gugus karboksil ke piruvat
membutuhkan energi, yang disuplai oleh ATP—energi bebas
Isocitrate yang diperlukan untuk mengikat gugus karboksil ke piruvat
kira-kira sama dengan energi bebas yang tersedia dari ATP.
Malat
Piruvat karboksilase adalah enzim pengatur dan hampir
A -Ketoglutarat tidak aktif tanpa adanya asetil-KoA, modulator alosterik
Fumarat positifnya. Setiap kali asetil-KoA, bahan bakar untuk siklus
asam sitrat, hadir secara berlebihan, ia merangsang reaksi
Produk
piruvat karboksilase untuk menghasilkan lebih banyak
Suksinat biosintetik
(asam amino, oksaloasetat, memungkinkan siklus untuk menggunakan
Suksinil-CoA nukleotida, lebih banyak asetil-KoA dalam reaksi sitrat sintase.
heme, dll.)
Reaksi anaplerotik lainnya yang ditunjukkan pada Tabel
16-2 juga diatur untuk menjaga tingkat intermediet cukup
tinggi untuk mendukung aktivitas siklus asam sitrat.
GAMBAR 16–14 Prekursor biosintetik diproduksi oleh siklus asam
sitrat yang tidak lengkap pada bakteri anaerob. Anaerob ini
Phosphoenolpyruvate (PEP) carboxylase, misalnya,
kekurangan - ketoglutarate dehydrogenase dan karenanya tidak dapat diaktifkan oleh intermediet glikolitik fruktosa 1,6-bifosfat,
melakukan siklus asam sitrat lengkap. -Ketoglutarat dan suksinil-CoA yang terakumulasi ketika siklus asam sitrat bekerja terlalu
berfungsi sebagai prekursor dalam berbagai jalur biosintetik. (Lihat lambat untuk memproses piruvat yang dihasilkan oleh
Gambar 16–13 untuk arah “normal” dari reaksi ini dalam siklus asam sitrat.) glikolisis.
Piruvat
Glukosa
Asam lemak,
piruvat sterol
karboksilase
Asetil-KoA
karboksikinase PEP
Glutamin
Phosphoenolpyruvate Oksaloasetat Garam sitrat
Prolin
(SEMANGAT)
PEP
karboksilase Arginin
Siklus
asam
Malat sitrat A -Ketoglutarat Glutamat
Serin Aspartat
Asparagin
Glisin malik
enzim
Sistein
Purin
Fenilalanin pirimidin Suksinil-CoA
Piruvat
Tirosin
Triptofan
GAMBAR 16–15 Peran siklus asam sitrat dalam anabolisme. Porfirin, heme
Perantara dari siklus asam sitrat diambil sebagai prekursor
di banyak jalur biosintetik. Ditampilkan dengan warna merah
adalah empat reaksi anaplerotik yang menggantikan intermediet
siklus yang habis (lihat Tabel 16–2).
KOTAK 16–3 DUNIA BIOKIMIA
Sitrat Sintase, Soda Pop, dan Pasokan Pangan

datang larut dan dengan demikian dapat diserap oleh akar tanaman.
Dunia Sitrat Tanah masam dan toksisitas Al3 paling umum terjadi di daerah tropis,
memiliki sejumlah aplikasi industri yang penting. di mana hasil jagung dapat ditekan sebanyak 80%. Di Meksiko,
Pemeriksaan cepat terhadap bahan-bahan di sebagian toksisitas Al3 membatasi produksi pa paya menjadi 20.000 hektar,
besar minuman ringan mengungkapkan penggunaan umum bukannya 3 juta hektar yang secara teoritis dapat ditanami.
asam sitrat untuk memberikan rasa asam atau buah. Asam
sitrat juga digunakan sebagai plasticizer dan penghambat Salah satu solusinya adalah menaikkan pH tanah dengan kapur,
busa dalam pembuatan resin tertentu, sebagai mordan untuk tetapi ini tidak sehat secara ekonomi dan lingkungan. Alternatifnya
mencerahkan warna, dan sebagai antioksidan untuk mengawetkanadalah
rasa makanan.
membiakkan tanaman yang tahan Al3.
Asam sitrat diproduksi secara industri dengan menumbuhkan jamur Tanaman yang resisten secara alami memang ada, dan ini
Aspergillus niger dengan adanya sumber gula yang murah, biasanya menyediakan sarana untuk solusi ketiga: mentransfer resistensi ke
molase bit. Kondisi kultur dirancang untuk menghambat reaksi siklus tanaman tanaman melalui rekayasa genetika.
asam sitrat sehingga sitrat terakumulasi. Sekelompok peneliti di Meksiko telah merekayasa tanaman
tembakau dan pepaya secara genetik untuk mengekspresikan
Dalam skala yang lebih besar, asam sitrat suatu hari nanti dapat peningkatan kadar sitrat sintase bakteri. Tumbuhan ini mengeluarkan
memainkan peran spektakuler dalam pengentasan kelaparan dunia. lima sampai enam kali jumlah normal asam sitrat pengkhelat Al3 dan
Dengan tiga gugus karboksilnya yang bermuatan negatif, laju sitrat dapat tumbuh di tanah dengan kadar Al3 sepuluh kali lipat dari yang
adalah pengkelat ion logam yang baik, dan beberapa tanaman dapat ditanam tanaman kontrol. Tingkat resistensi ini akan
mengeksploitasi sifat ini dengan melepaskan sitrat ke dalam tanah, memungkinkan Meksiko menanam pepaya di lahan seluas 3 juta
tempat sitrat mengikat ion logam dan mencegah penyerapannya hektar yang saat ini dianggap tidak cocok oleh Al3.
oleh tanaman. Yang sangat penting adalah ion aluminium (Al3),
yang beracun bagi banyak tanaman dan menyebabkan penurunan Mengingat tingkat pertumbuhan populasi yang diproyeksikan,
hasil panen pada 30% hingga 40% lahan pertanian dunia. Aluminium produksi pangan dunia harus lebih dari tiga kali lipat dalam 50 tahun
adalah logam yang paling melimpah di kerak bumi, namun kebanyakan ke depan untuk memberi makan 9,6 miliar orang secara memadai.
terdapat dalam senyawa kimia, seperti Al(OH)3, yang secara biologis Solusi jangka panjang dapat mengaktifkan peningkatan produktivitas
inert. Namun, ketika pH tanah kurang dari 5, Al3 menjadi tanaman di lahan subur yang terkena dampak toksisitas aluminium,
dan asam sitrat dapat memainkan peran penting dalam mencapai tujuan ini.
Gugus karboksil diaktifkan dalam reaksi yang memecah ATP dan

Biotin dalam Piruvat Karboksilase Membawa Kelompok CO2
bergabung dengan CO2 menjadi biotin yang terikat enzim. CO2 yang
Reaksi piruvat karboksilase membutuhkan vitamin biotin (Gbr. 16-16), “diaktifkan” ini kemudian diteruskan ke akseptor (dalam hal ini piruvat)
yang merupakan gugus prostetik dari enzim. Biotin memainkan peran dalam reaksi karboksilasi.
kunci dalam banyak reaksi karboksilasi. Ini adalah pembawa khusus Piruvat karboksilase memiliki empat subunit identik, masing-
dari gugus satu karbon dalam bentuknya yang paling teroksidasi: CO2. masing mengandung molekul biotin yang terikat secara kovalen melalui
(Transfer gugus satu-karbon dalam bentuk yang lebih tereduksi e
ikatan amida dengan gugus -amino dari residu Lys spesifik di situs aktif
diperantarai oleh kofaktor lain, terutama tetrahidrofolat dan S- enzim. Karboksilasi piruvat berlangsung dalam dua langkah (Gbr.
adenosilmetionin, seperti dijelaskan dalam Bab 18.) 16-16): pertama, gugus karboksil yang berasal dari HCO3 terikat pada
biotin,
TABEL 16–2 Reaksi Anaplerotik

Reaksi Jaringan/organisme
piruvat karboksilase
888888888888z y888888888888
Piruvat HCO3 ATP oksaloasetat ADP Pi Hati, ginjal

karboksikinase PEP
888888888888z y888888888888
PDB CO2 fosfoenolpiruvat oksaloasetat GTP Jantung, otot rangka

PEP karboksilase
888888888888z y888888888888
Fosfoenolpiruvat HCO3 oksaloasetat Pi Tumbuhan tingkat tinggi, ragi, bakteri

enzim malat
888888888888z y888888888888
Piruvat HCO3 NAD(P)H malat NAD(P) Didistribusikan secara luas di

eukariota dan prokariota
Tulang rusuk Adenin
HAI
C HAI-
P
P HANOI KECIL
HAI
ADP
HAI
C OP O–
HAI
Pi
HAI
: HAI
HANOI KECIL
KE 1 2
HAI
HAI- C
Bicar HAI
Biotinil H HAI
bonat
-HAI P HAI lisin
S Karboksifosfat S
HAI-
ATP
HAI HAI
Katalis Situs
situs NH NH
1 katalitik 2
Lampu
karboksilase piruvat
3
H+
HAI
HAI
C N KECIL
-HAI
-OO
C
HAI
C HAI
NH
CH2
Enzim karboksibiotinil
C Oksaloasetat
O– _
Transfer
karboksibiotin
4
-OO ( CO2 teraktivasi)
7 ke situs
C
katalitik kedua
C HAI
HAI
Enolat HAI- HAI
piruvat CH2
HAI
HN NH -OO HN N HN N C
C H
HAI-
Piruvat
C HAI-
6 5
S HAI S HAI S
CH2
C C
HAI HAI
HAI HAI HAI
NH NH NH
MEKANISME GAMBAR 16–16 Peran biotin dalam reaksi kucing bikarbonat didehidrasi melalui reaksinya dengan ATP, dan CO2 dapat
dianalisis oleh piruvat karboksilase. Biotin melekat pada enzim melalui bereaksi dengan biotin untuk membentuk karboksibiotin (langkah 3). Biotin
ikatan amida dengan gugus -amino dari residu Lys, membentuk enzim bertindak sebagai pembawa untuk mengangkut CO2 dari satu situs aktif ke
biotinil. Reaksi karboksilasi yang dimediasi biotin terjadi dalam dua fase, situs aktif lainnya pada enzim yang sama (langkah 4). Pada fase kedua dari
umumnya dikatalisis oleh situs aktif terpisah pada enzim seperti yang reaksi (langkah 5 sampai 7), dikatalisis di situs aktif kedua, CO2 bereaksi
dicontohkan oleh reaksi piruvat karboksilase. Pada fase pertama (langkah 1 dengan piruvat untuk membentuk oksaloasetat. CO2 dilepaskan di situs aktif
sampai 3), bikarbonat diubah menjadi CO2 yang lebih aktif, dan kemudian kedua (langkah 5). Piruvat diubah menjadi bentuk enolatnya secara bertahap,
digunakan untuk karboksilat biotin. Bikarbonat pertama kali diaktifkan melalui 6 mentransfer proton menjadi biotin. Enolat kemudian menyerang CO2
reaksi dengan ATP untuk membentuk karboksifosfat (langkah 1), yang terurai untuk menghasilkan oksaloasetat pada langkah akhir reaksi (langkah 7).
menjadi karbon dioksida (langkah 2). Akibatnya,
kemudian gugus karboksil dipindahkan ke piruvat untuk membentuk kromatografi (lihat Gambar 3–18c) berdasarkan afinitas kuat biotin
oksaloasetat. Kedua langkah ini terjadi pada situs aktif yang terpisah; terhadap avidin. Protein kemudian dielusi dari kolom dengan kelebihan
lengan panjang biotin yang fleksibel mentransfer gugus karboksil aktif biotin bebas. Afinitas biotin yang sangat tinggi untuk avidin juga
dari situs aktif pertama ke situs aktif kedua, berfungsi seperti lengan digunakan di laboratorium dalam bentuk lem molekuler yang dapat
panjang lipoyllysine E2 di kompleks PDH (Gbr. 16-6) dan lengan panjang menyatukan dua struktur (lihat Gambar 19–25).
gugus mirip-CoA dalam protein pembawa asil yang terlibat dalam
sintesis asam lemak (lihat Gambar 21–5); ini dibandingkan pada Gambar
16–17. Lipoate, biotin, dan pantothen memakan semua sel yang masuk
RINGKASAN 16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat
pada transporter yang sama; semuanya menjadi terikat secara kovalen
dengan protein melalui reaksi serupa; dan semuanya menyediakan
ÿ Siklus asam sitrat (siklus Krebs, siklus TCA) adalah jalur
tambatan fleksibel yang memungkinkan intermediet reaksi terikat untuk
katabolik pusat yang hampir universal di mana senyawa
berpindah dari satu situs aktif ke situs aktif lainnya dalam kompleks
yang berasal dari penguraian karbohidrat, lemak, dan
enzim, tanpa memisahkannya—semuanya, berpartisipasi dalam
protein dioksidasi menjadi CO2, dengan sebagian besar
penyaluran substrat.
energi oksidasi ditahan sementara di pembawa elektron
FADH2 dan NADH. Selama metabolisme aerobik,
Biotin adalah vitamin yang dibutuhkan dalam makanan manusia;
elektron-elektron ini ditransfer ke O2 dan energi aliran
itu berlimpah di banyak makanan dan disintesis oleh bakteri usus.
elektron terperangkap sebagai ATP.
Kekurangan biotin jarang terjadi, namun terkadang bisa disebabkan
oleh pola makan yang kaya akan telur mentah. Putih telur mengandung
sejumlah besar protein avidin (Mr 70.000), yang mengikat biotin dengan
ÿ Asetil-KoA memasuki siklus asam sitrat (dalam mitokondria
sangat erat dan mencegah penyerapannya di usus. Avidin putih telur
eukariota, sitosol prokariota) saat sintase sitrat
dapat menjadi mekanisme pertahanan bagi calon embrio ayam, dalam
mengkatalisis kondensasinya dengan oksaloasetat untuk
menghambat pertumbuhan bakteri. Saat telur dimasak, avidin
membentuk sitrat.
didenaturasi (dan dengan demikian dinonaktifkan) bersama dengan
semua protein putih telur lainnya. Avidin yang dimurnikan adalah reagen ÿ Dalam tujuh reaksi berurutan, termasuk dua
yang berguna dalam biokimia dan biologi sel. Suatu protein yang dekarboksilasi, siklus asam sitrat mengubah sitrat menjadi
mengandung biotin yang terikat secara kovalen (berasal dari percobaan oksaloasetat dan melepaskan dua CO2.
atau diproduksi in vivo) dapat diperoleh kembali dengan afinitas Jalurnya bersifat siklik karena perantara dari siklus tersebut
tidak habis digunakan; untuk setiap asetat oksalo
dikonsumsi di jalan, satu diproduksi.
Lipoat HAI
ÿ Untuk setiap asetil-KoA yang dioksidasi oleh sitrat

HAI
C Dihydrolipoyl siklus asam, perolehan energi terdiri dari tiga molekul
CH transacetylase
N N NADH, satu FADH2, dan satu nukleosida trifosfat (baik
(E2)
SS H ATP atau GTP).
residu Lys ÿ Selain asetil-KoA, setiap senyawa yang menimbulkan zat
Biotin
antara berkarbon empat atau lima dari siklus asam sitrat—
HAI
misalnya, produk penguraian dari banyak asam amino—

HANOI KECIL HAI
dapat dioksidasi oleh siklus tersebut.
C
CH
S N N karboksilase piruvat ÿ Siklus asam sitrat bersifat amfibolik, berfungsi dalam
HAI H katabolisme dan anabolisme; perantara siklus dapat
ditarik dan digunakan sebagai bahan awal untuk berbagai
produk biosintetik.
- Merkapto
etilamina Pantotenat
HAI
HAI
ÿ Ketika perantara dijauhkan dari
HAI
CH3 CH3
HS HAI P Protein pembawa siklus asam sitrat ke jalur lain, mereka diisi ulang oleh
N N O Ser
H H beberapa reaksi anaplerotik, yang menghasilkan zat
OH HAI
Asil
antara empat karbon melalui karboksilasi senyawa tiga
karbon; reaksi ini dikatalis oleh piruvat karboksilase, PEP
GAMBAR 16–17 Tambatan biologis. Kofaktor lipoat, biotin, dan kombinasi karboksilase, PEP karboksilase, dan enzim malat. Enzim yang
-mercaptoethylamine dan pantothenate membentuk lengan panjang dan mengkatalisasi karboksilasi biasanya menggunakan biotin
fleksibel dalam enzim yang terikat secara kovalen, bertindak sebagai untuk mengaktifkan CO2 dan membawanya ke akseptor
penambat yang memindahkan perantara dari satu situs aktif ke situs seperti piruvat atau fosfoenolpiruvat.
berikutnya. Kelompok yang diarsir merah jambu dalam setiap kasus
merupakan titik perlekatan zat antara yang diaktifkan ke penambat.
16.3 Pengaturan Siklus Asam Sitrat 621
16.3 Pengaturan Siklus Asam Sitrat asam lemak dan asetil-KoA dan ketika rasio [ATP]/[ADP]
dan [NADH]/[NAD] sel tinggi, dan diaktifkan kembali ketika
Seperti yang telah kita lihat di Bab 15, regulasi enzim kunci kebutuhan energi tinggi dan sel membutuhkan fluks asetil-
dalam jalur metabolisme, oleh efektor alosterik dan CoA ke dalam siklus asam sitrat.
modifikasi kovalen, memastikan produksi intermediet pada
tingkat yang diperlukan untuk menjaga sel dalam keadaan Pada mamalia, mekanisme pengaturan alosterik ini
tetap stabil sambil menghindari produksi berlebihan yang dilengkapi dengan pengaturan tingkat kedua: modifikasi
sia-sia. Aliran atom karbon dari piruvat ke dalam dan protein kovalen. Kompleks PDH dihambat oleh fosforilasi
melalui siklus asam sitrat diatur ketat pada dua tingkat: reversibel residu Ser spesifik pada salah satu dari dua
konversi piruvat menjadi asetil-KoA, bahan awal untuk subunit E1. Seperti disebutkan sebelumnya, selain enzim
siklus (reaksi kompleks piruvat dehidro genase), dan E1, E2, dan E3, kompleks PDH mam malian mengandung
masuknya asetil-KoA ke dalam siklus (reaksi sintase dua protein pengatur yang tujuan utamanya adalah
sitrat). Asetil KoA juga diproduksi oleh jalur selain reaksi mengatur aktivitas kompleks. Protein kinase spesifik
kompleks PDH—kebanyakan sel menghasilkan asetil-KoA memfosforilasi dan dengan demikian menonaktifkan E1,
dari oksidasi asam lemak dan asam amino tertentu—dan dan fosfoprotein fosfatase spesifik menghilangkan gugus
ketersediaan intermediet dari jalur lain ini penting dalam fosforil dengan hidrolisis dan dengan demikian
pengaturan oksidasi piruvat dan dari siklus asam sitrat. mengaktifkan E1. Kinase diaktifkan secara alosterik oleh
Siklus juga diatur pada reaksi isositrat dehidrogenase ATP: ketika [ATP] tinggi (mencerminkan suplai energi
dan -ketoglutarat dehidrogenase. yang cukup), kompleks PDH dinonaktifkan oleh fosforilasi
E1 . Ketika [ATP] menurun, aktivitas kinase menurun dan
aksi fosfatase menghilangkan gugus fosforil dari E1,
mengaktifkan kompleks.
Produksi Asetil-KoA oleh Piruvat Kompleks PDH tanaman, terletak di matriks
Kompleks Dehidrogenase Diatur oleh mitochondrial dan di plastida, dihambat oleh produknya,
Mekanisme Alosterik dan Kovalen NADH dan asetil-KoA. Mitokondria tanaman
Kompleks PDH mamalia sangat dihambat oleh ATP dan Piruvat

oleh asetil-KoA dan NADH, produk reaksi yang dikatalisis ATP, asetil-KoA,
kompleks
oleh kompleks (Gbr. 16-18). Penghambatan al losteric piruvat
NADH, asam lemak
oksidasi piruvat sangat ditingkatkan ketika asam lemak dehidrogenase AMP, KoA, NAD, Ca2
rantai panjang tersedia. AMP, CoA, dan NAD, yang
semuanya terakumulasi ketika asetat terlalu sedikit
Asetil-KoA
mengalir ke dalam siklus asam sitrat, mengaktifkan
kompleks PDH secara alosterik. Dengan demikian, NADH, suksinil-KoA, sitrat, ATP
aktivitas enzim ini dimatikan ketika bahan bakar tersedia dalam bentuk yang cukup ADP
sitrat
sintase Garam sitrat
GAMBAR 16–18 Regulasi aliran metabolit dari Oksaloasetat Siklus

Isocitrate
kompleks PDH melalui siklus asam sitrat. asam
sitrat isositrat ATP
Kompleks PDH dihambat secara alosterik ketika
rasio [ATP]/[ADP], [NADH]/[NAD], dan [asetil-KoA]/ dehidrogenase
malat Ca2, ADP
[CoA] tinggi, menunjukkan keadaan dehidrogenase NADH
metabolisme yang cukup energi.
Malat
Ketika rasio ini menurun, aktivasi alosterik hasil A -Ketoglutarat
oksidasi piruvat. Laju aliran melalui siklus asam FADH2 suksinil-KoA, NADH
-kompleks
sitrat dapat dibatasi oleh ketersediaan substrat
dehidrogenase Ca2
sintase sitrat, oksaloasetat dan asetil-KoA, atau ketoglutarat
NAD, yang terkuras oleh konversinya menjadi
suksinat
NADH, memperlambat tiga langkah oksidasi yang Suksinil-CoA
dehidrogenase
bergantung pada NAD. Penghambatan umpan
balik oleh suksinil-KoA, sitrat, dan ATP juga
memperlambat siklus dengan menghambat
langkah awal. Dalam jaringan otot, Ca2
menandakan kontraksi dan, seperti yang
GTP
ditunjukkan di sini, merangsang metabolisme (ATP)
penghasil energi untuk menggantikan ATP yang dikonsumsi oleh kontraksi.
enzim juga diatur oleh fosforilasi reversibel; piruvat tahap glikolitik dan pernapasan dari oksidasi glukosa,
menghambat kinase, sehingga mengaktifkan kompleks tetapi juga oleh konsentrasi sitrat. Sitrat, produk dari
PDH, dan NH4 merangsang kinase, menyebabkan langkah pertama siklus asam sitrat, merupakan penghambat
inaktivasi kompleks. Kompleks PDH E. coli berada di alosterik penting fosfofruktokinase-1 dalam jalur glikolitik
bawah regulasi alosterik yang mirip dengan enzim mam (lihat Gambar 15-18).
malian, tetapi tampaknya tidak diatur oleh fosforilasi.
Penyaluran Substrat melalui Multienzim
Kompleks Dapat Terjadi dalam Siklus Asam Sitrat
Siklus Asam Sitrat Diatur pada Ketiganya
Meskipun enzim dari siklus asam sitrat biasanya
Langkah Eksergonik
digambarkan sebagai komponen terlarut dari matriks drial
Aliran metabolit melalui siklus asam sitrat berada di bawah mitokondria (kecuali suksinat dehidrogenase, yang terikat
regulasi yang ketat. Tiga faktor mengatur laju fluks melalui membran), bukti yang berkembang menunjukkan bahwa
siklus: ketersediaan substrat, penghambatan dengan di dalam mitokondria enzim ini ada sebagai kompleks
mengumpulkan produk, dan penghambatan umpan balik multi-enzim. Pendekatan klasik enzymol ogy—pemurnian
alosterik dari enzim yang mengkatalisis langkah awal protein individu dari ekstrak sel yang rusak—diterapkan
dalam siklus. dengan sukses besar pada enzim siklus asam sitrat.
Masing-masing dari tiga langkah eksergonik yang kuat Namun, korban pertama kerusakan sel adalah tingkat
dalam siklus—yang dikatalisis oleh sintase sitrat, isositrat organisasi yang lebih tinggi di dalam sel—interaksi
dehidrogenase, dan -ketoglutarat dehidrogenase (Gbr. nonkovalen, reversibel dari satu protein dengan yang lain,
16-18)—dapat menjadi langkah pembatas laju dalam atau enzim dengan beberapa komponen struktural seperti
keadaan tertentu. Ketersediaan substrat untuk sintase membran, mikrotubulus, atau mikrofilamen.
sitrat (asetil-KoA dan oksaloasetat) bervariasi dengan Saat sel dipecah terbuka, isinya, termasuk enzim,
keadaan metabolisme sel dan terkadang membatasi laju diencerkan 100 atau 1.000 kali lipat (Gbr. 16–19).
pembentukan sitrat. NADH, produk oksidasi isositrat dan Beberapa jenis bukti menunjukkan bahwa, di dalam
-ketoglutarat, terakumulasi dalam beberapa kondisi, dan sel, kompleks multi-enzim memastikan pengaliran yang
pada [NADH]/[NAD] tinggi kedua reaksi dehidrogenase efisien dari produk dari satu reaksi enzim ke enzim
sangat dihambat oleh aksi massa. Demikian pula, di dalam berikutnya dalam jalur. Kompleks semacam itu disebut
sel, reaksi malat dehy drogenase pada dasarnya berada metabolon. Enzim tertentu dari siklus asam sitrat telah
pada kesetimbangan (yaitu, terbatas pada substrat, dan diisolasi bersama sebagai agregat supramolekul, atau
ketika [NADH]/[NAD] tinggi, konsentrasi oksaloasetat telah ditemukan terkait dengan membran mitokondria
rendah, memperlambat langkah pertama dalam siklus. bagian dalam, atau telah terbukti berdifusi dalam matriks
Akumulasi produk menghambat ketiga langkah yang drial mitokondria lebih lambat dari yang diharapkan untuk
membatasi siklus: suksinil-KoA menghambat - ketoglutarat masing-masing protein dalam larutan. . Ada bukti kuat
dehidrogenase (dan juga sitrat sintase); sitrat memblokir untuk penyaluran substrat melalui kompleks multienzim
sitrat sintase; dan produk akhir, ATP, menghambat sitrat
sintase dan isositrat dehy drogenase. sintase sitrat oleh
ATP dibebaskan oleh ADP, aktivator alosterik enzim ini.
Pada otot vertebrata, Ca2, sinyal untuk kontraksi dan

untuk peningkatan permintaan ATP secara bersamaan,
mengaktifkan isositrat dehidrogenase dan -ketoglutarat
dehidrogenase, serta kompleks PDH. Singkatnya,
konsentrasi substrat dan zat antara dalam siklus asam
sitrat mengatur fluks melalui jalur ini pada laju yang
memberikan konsentrasi ATP dan NADH yang optimal.
Dalam kondisi normal, laju glikolisis dan siklus asam

sitrat terintegrasi sehingga hanya glukosa yang Dalam sitosol, Dalam ekstrak sel
dimetabolisme menjadi piruvat sebanyak yang diperlukan konsentrasi enzim yang rusak, pengenceran
1, 2, dan 3 yang tinggi dengan penyangga mengurangi
untuk memasok siklus asam sitrat dengan bahan bakarnya, mendukung hubungan mereka.konsentrasi enzim 1, 2,
gugus asetil dari asetil-KoA. Piruvat, laktat, dan asetil-KoA dan 3, mendukung disosiasinya.
biasanya dipertahankan pada konsentrasi tunak.
Laju glikolisis disesuaikan dengan laju siklus asam sitrat GAMBAR 16–19 Pengenceran larutan yang mengandung kompleks
tidak hanya melalui penghambatannya oleh ATP dan protein nonkovalen—seperti larutan yang terdiri dari tiga enzim—
NADH tingkat tinggi, yang umum terjadi pada kedua membantu disosiasi kompleks menjadi konstituennya.
16.4 Siklus Glioksilat 623
jalur metabolisme lain, dan banyak enzim yang dianggap aloasetat; pada vertebrata, untuk setiap dua karbon yang
"larut" mungkin berfungsi di dalam sel sebagai kompleks memasuki siklus sebagai asetil-KoA, dua karbon keluar
yang sangat tinggi atau kompleks yang menyalurkan zat sebagai CO2. Pada banyak organisme selain vertebrata,
antara. Kita akan menjumpai contoh penyaluran lainnya siklus glioksilat berfungsi sebagai mekanisme untuk mengubah
ketika kita membahas biosintesis asam amino dan nukleotida asetat menjadi karbohidrat.
di Bab 22.
Siklus Glyoxylate Menghasilkan Empat Karbon
RINGKASAN 16.3 Pengaturan Siklus Asam Sitrat Senyawa dari Asetat
ÿ Laju keseluruhan siklus asam sitrat adalah Pada tanaman, invertebrata tertentu, dan beberapa
dikendalikan oleh laju konversi piruvat menjadi asetil- mikroorganisme (termasuk E. coli dan ragi) asetat dapat
KoA dan oleh fluks melalui sitrat sintase, isositrat berfungsi sebagai bahan bakar yang kaya energi dan sebagai
dehidrogenase, dan sumber fosfo enolpiruvat untuk sintesis karbohidrat. Dalam
-ketoglutarat dehidrogenase. Fluks ini sebagian ganisme ini, enzim dari siklus glioksilat mengkatalisis
konversi bersih asetat menjadi suksinat atau empat perantara
besar ditentukan oleh konsentrasi substrat dan
produk: produk akhir ATP dan NADH bersifat karbon lainnya dari siklus asam sitrat:
penghambatan, dan substrat NAD dan ADP 2 Asetil-KoA NAD 2H2O Pada
bersifat stimulasi. suksinat 2CoA NADH H
ÿ Produksi asetil-KoA untuk siklus asam sitrat oleh Dalam siklus glioksilat, asetil-KoA berkondensasi dengan ox
kompleks PDH dihambat secara alosterik oleh aloacetate untuk membentuk sitrat, dan sitrat diubah menjadi
metabolit yang menandakan kecukupan isositrat, persis seperti dalam siklus asam sitrat. Namun,
energi metabolik (ATP, asetil KoA, NADH, dan langkah selanjutnya bukanlah penguraian isositrat oleh
asam lemak) dan distimulasi oleh metabolit yang isositrat dehidrogenase, melainkan penguraian isositrat oleh
mengindikasikan berkurangnya pasokan energi isositrat lyase, membentuk suksinat dan glioksilat.
(AMP, NAD, CoA). Glioksilat kemudian mengembun dengan molekul kedua asetil-
KoA untuk menghasilkan malat, dalam reaksi yang dikatalisis
oleh sintase malat. Malat selanjutnya dioksidasi menjadi
oksaloasetat, yang dapat mengembun dengan molekul asetil-
16.4 Siklus Glioksilat KoA lain untuk memulai pergantian siklus lainnya (Gbr.
Vertebrata tidak dapat mengubah asam lemak, atau asetat 16-20). Setiap pergantian siklus glioksilat mengkonsumsi
yang diturunkan darinya, menjadi karbohidrat. Konversi dua molekul asetil-KoA dan menghasilkan satu molekul
fosfoenolpiruvat menjadi piruvat (hal. 532) dan piruvat suksinat, yang kemudian tersedia untuk keperluan biosintesis.
menjadi asetil-KoA (Gbr. 16–2) sangat eksergonik sehingga Suksinat dapat diubah melalui fumarat dan malat menjadi
pada dasarnya tidak dapat diubah. Jika sel tidak dapat oksaloasetat, yang kemudian dapat diubah menjadi
mengubah asetat menjadi fosfoenolpiruvat, asetat tidak dapat fosfoenolpiruvat oleh PEP karboksikinase, dan dengan
berfungsi sebagai bahan awal untuk jalur glukoneogenik, demikian menjadi glukosa melalui glukoneogenesis.
yang mengarah dari fosfoenolpiruvat menjadi glukosa (lihat Gambar.Vertebrata tidak memiliki enzim khusus untuk siklus gli-oksilat
15–15). Tanpa kapasitas ini, sel atau organisme tidak dapat (isositrat liase dan sintase malat) dan karena itu tidak dapat
mengubah bahan bakar atau metabolit yang terdegradasi menghasilkan sintesis bersih glukosa dari lipid.
menjadi asetat (asam lemak dan asam amino tertentu)
menjadi karbohidrat. Pada tumbuhan, enzim dari siklus glioksilat diasingkan
Seperti dicatat dalam pembahasan reaksi anaplerotik dalam organel yang dibatasi membran yang disebut
(Tabel 16-2), fosfoenolpiruvat dapat disintesis dari oksaloasetat glioksisom, yang merupakan peroksisom khusus (Gbr. 1).
dalam reaksi reversibel yang dikatalisis oleh karboksikinase 16–21). Enzim yang umum untuk asam sitrat dan siklus
PEP: glioksilat memiliki dua isozim, satu khusus untuk mitokondria,
yang lain untuk glioksisom. Glyoxysomes tidak hadir di semua
Oksaloasetat GTP 34
jaringan tanaman setiap saat. Mereka berkembang menjadi
PDB CO2 fosfoenolpiruvat
biji yang kaya lipid selama perkecambahan, sebelum tanaman
Karena atom karbon molekul asetat yang memasuki siklus yang sedang berkembang memperoleh kemampuan untuk
asam sitrat muncul delapan langkah kemudian dalam membuat glukosa melalui fotosintesis. Selain enzim siklus
oksaloasetat, tampaknya jalur ini dapat menghasilkan glioksilat, glioksisom mengandung semua enzim yang
oksaloasetat dari asetat dan dengan demikian menghasilkan diperlukan untuk degradasi asam lemak yang disimpan dalam
fosfoenolpiruvat untuk glukoneogenesis. Namun, seperti yang minyak biji (lihat Gambar 17–13). Acetyl-CoA yang terbentuk
ditunjukkan oleh pemeriksaan stoikiometri siklus asam sitrat, dari pemecahan lipid diubah menjadi suksinat melalui siklus
tidak ada konversi bersih asetat menjadi lembu. glioksilat, dan suksinat diekspor ke mitokondria, di mana sitrat
HAI
menjadi oksaloasetat, yang berkondensasi dengan asetil-KoA yang
berasal dari pemecahan asam lemak. Sitrat yang terbentuk diubah
CH3 C S-CoA
menjadi isocitrate oleh aconitase, kemudian dipecah menjadi glioksilat
Asetil-KoA dan suksinat oleh isocitrate lyase. Suksinat kembali ke mitokondria, di
mana ia kembali ke siklus asam sitrat dan diubah menjadi malat, yang
HAI C MENDEKUT
memasuki sitosol dan dioksidasi (oleh sitosolik malat dehidrogenase)
sitrat menjadi oksaloasetat. Oksaloasetat diubah melalui glukoneogenesis
CH2 MENDEKUT sintase
menjadi heksosa dan sukrosa, yang dapat diangkut ke akar dan pucuk
Oksaloasetat
yang sedang tumbuh. Empat jalur berbeda berpartisipasi dalam konversi
CH2COO _ ini: pemecahan asam lemak menjadi asetil-KoA (dalam gly oxysomes),
NADH
siklus glioksilat (dalam glioksisom), siklus asam sitrat (dalam mitokondria),
KE C MENDEKUT
dan glukoneogen sis (dalam sitosol).
malat dehidrogenase
CH2 MENDEKUT
MEREKA Garam sitrat
MENDEKUT Siklus aconitase

glioksilat Berbagi perantara umum mengharuskan jalur ini diatur secara
SUCI terkoordinasi. Isocitrate adalah zat antara yang penting, pada titik cabang
CH2 antara siklus glioksilat dan asam sitrat (Gbr. 16–23). Isocitrate
CH2COO _ dehydrogenase diatur oleh modifikasi kovalen: protein kinase spesifik
MENDEKUT
memfosforilasi dan dengan demikian mengaktifkan dehidrogenase.
Malat CH MENDEKUT
Inaktivasi ini mengalihkan isocitrate ke siklus glioksilat, di mana ia

sintase KE CH COO memulai rute sintetik menuju glukosa. Fosfoprotein phos phatase
malat
HAI Isocitrate menghilangkan gugus fosforil dari isocitrate dehydrogenase, mengaktifkan
isocitrate
BERSAMA lyase kembali enzim dan mengirimkan lebih banyak isocitrate melalui siklus
asam sitrat yang menghasilkan energi. Protein kinase pengatur dan
HAI
C HAI
fosfoprotein fosfatase adalah aktivitas enzimatik terpisah dari polipeptida
CH3 C S-CoA H tunggal.
Asetil-KoA Glioksilat CH2COO _
CH2COO _
Suksinat
Beberapa bakteri, termasuk E. coli, memiliki enzim lengkap untuk
siklus glioksilat dan asam sitrat dalam sitosol dan karena itu dapat
GAMBAR 16–20 Siklus glioksilat. Sitrat sintase, akonitase, dan
malat dehidrogenase dari siklus glioksilat adalah isozim dari enzim tumbuh pada asetat sebagai satu-satunya sumber karbon dan energi.
siklus asam sitrat; isocitrate lyase dan malate synthase unik untuk Fosfo protein fosfatase yang mengaktivasi isocitrate dehydroge nase
siklus glioksilat. Perhatikan bahwa dua gugus asetil (merah muda) distimulasi oleh intermediet dari siklus asam sitrat dan glikolisis dan
memasuki siklus dan empat karbon keluar sebagai suksinat (biru). oleh indikator suplai energi seluler yang berkurang (Gbr. 16-23). Metabolit
Siklus glioksilat dijelaskan oleh Hans Kornberg dan Neil Madsen di yang sama menghambat aktivitas protein kinase dari polipeptida
laboratorium Hans Krebs. bifungsional. Dengan demikian, akumulasi perantara dari
enzim siklus asam mengubahnya menjadi malat. Sebuah isozim sitosol

malat dehidrogenase mengoksidasi malat menjadi ox aloacetate,
Tubuh lipid
prekursor untuk glukoneogenesis. Oleh karena itu, benih yang
berkecambah dapat mengubah karbon dari lipid yang disimpan menjadi
glukosa.
Siklus Asam Sitrat dan Glioksilat

Diatur secara Koordinat
Pada benih yang berkecambah, transformasi enzimatik asam dikarboksilat
dan trikarboksilat terjadi di tiga kompartemen traselular: mitokondria,
glioksisom, dan sitosol. Terjadi pertukaran metabolit yang terus-menerus
di antara kompartemen-kompartemen ini (Gbr. 16-22).
Glioksisom Mitokondria
Kerangka karbon oksaloasetat dari sitrat
siklus asam (dalam mitokondria) dibawa ke gly oxysome dalam bentuk GAMBAR 16–21 Mikrograf elektron dari benih ketimun yang
aspartat. Aspartat dikonversi berkecambah, menunjukkan glioksisom, mitokondria, dan badan lipid di sekitarnya.
16.4 Siklus Glioksilat 625

Tubuh lipid
Triasilgliserol
Perantara yang sama dari glikolisis dan siklus asam
sitrat yang mengaktifkan isocitrate dehydrogenase adalah
Asam lemak penghambat alosterik dari isocitrate lyase. Ketika
metabolisme penghasil energi cukup cepat untuk menjaga
konsentrasi glikolitik dan siklus asam sitrat menengah
rendah, isocitrate dehydrogenase dinonaktifkan,
Asam lemak penghambatan isocitrate lyase dihilangkan, dan isocitrate
mengalir ke jalur glioksilat, untuk digunakan dalam
Asetil-KoA
biosintesis karbohidrat. asam amino, dan komponen
seluler lainnya.
Oksaloasetat
Asetil-KoA
Siklus
Malat glioksilat Garam sitrat
perantara perantara
Sukrosa siklus asam siklus asam
sitrat dan sitrat dan
glikolisis, glikolisis,
Glioksilat AMP, ADP AMP, ADP
Isocitrate Isocitrate
Asetil-KoA
Heksosa
Suksinat
glukoneogenesis protein
Glioksisom isocitrate kinase
Oksaloasetat lyase
isositrat
fosfatase
dehidrogenase
Sitosol Malat
Suksinat,
glioksilat A -Ketoglutarat
Siklus Siklus
Fumarat glioksilat asam sitrat
Malat
Asam
sitrat
Oksaloasetat siklus suksinat
Garam sitrat
Mitokondria Oksaloasetat NADH,

FADH2
glukoneogenesis fosforilasi
GAMBAR 16–22 Hubungan antara siklus glioksilat dan asam sitrat. oksidatif
Reaksi siklus glioksilat (dalam glioksisom) berlangsung secara bersamaan
Glukosa ATP
dengan, dan menyatu dengan, reaksi siklus asam sitrat (dalam
mitokondria), ketika perantara melewati antara kompartemen-kompartemen ini.
Konversi suksinat menjadi oksaloasetat dikatalisis oleh enzim siklus
asam sitrat. Oksidasi asam lemak menjadi asetil-KoA dijelaskan pada Asam amino,
nukleotida
Bab 17; sintesis heksosa dari oksaloasetat dijelaskan dalam Bab 20.
GAMBAR 16–23 Pengaturan terkoordinasi siklus glioksilat dan

asam sitrat. Regulasi aktivitas isositrat dehidrogenase menentukan
jalur penghasil energi sentral—menunjukkan penipisan
pembagian isositrat antara siklus glioksilat dan asam sitrat.
energi—menghasilkan aktivasi isositrat de hidrogenase. Ketika enzim diinaktivasi oleh fosforilasi (oleh protein kinase spesifik),
Ketika konsentrasi pengatur ini turun, menandakan fluks isocitrate diarahkan ke reaksi biosintetik melalui siklus glioksilat. Ketika
yang cukup melalui siklus asam sitrat yang menghasilkan enzim diaktifkan oleh defosforilasi (oleh fosfatase spesifik), isocitrate
energi, isocitrate dehydroge nase dinonaktifkan oleh memasuki siklus asam sitrat dan ATP diproduksi.
protein kinase.
RINGKASAN 16.4 Siklus Glioksilat siklus memungkinkan pembentukan bersih

suksinat, oksaloasetat, dan intermediet
ÿ Siklus glioksilat aktif dalam benih yang siklus lainnya dari asetil-KoA. Oksaloasetat yang
berkecambah dari beberapa tumbuhan dan terbentuk dapat digunakan untuk mensintesis
mikroorganisme tertentu yang dapat hidup dengan glukosa melalui glukoneogenesis.
asetat sebagai satu-satunya sumber karbon. ÿ Partisi isositrat antara siklus asam sitrat dan siklus
Pada tumbuhan, jalur berlangsung di glioksisom glioksilat dikendalikan pada tingkat isositrat
pada semai. Ini melibatkan beberapa enzim siklus dehidrogenase, yang diatur oleh fosforilasi reversibel.
asam sitrat dan dua enzim tambahan: isocitrate
lyase dan malate synthase.
ÿ Vertebrata tidak memiliki siklus glioksilat dan
ÿ Dalam siklus glioksilat, melewati dua langkah tidak dapat mensintesis glukosa dari asetat atau
dekarboksilasi asam sitrat asam lemak yang menimbulkan asetil-KoA.
Istilah Kunci
Istilah yang dicetak tebal didefinisikan dalam

glosarium. penyaluran substrat 605 fosforilase 613 fosfatase
respirasi 601 respirasi pusat besi-sulfur 609 613 molekul prokiral
seluler 601 siklus asam -ketoglutarat dehidrogenase 615 jalur amfibolik 616
sitrat 601 siklus asam trikarboksilat kompleks 610 reaksi anaplerotik 616 biotin
(TCA) 601 siklus nukleosida difosfat kinase 612 sintase 618 avidin 620 metabolon 622
Krebs 601 kompleks piruvat 613 sintetase siklus
dehidrogenase (PDH) 602 613 ligase 613 liase glioksilat
dekarboksilasi oksidatif 602 613 kinase 623
tioester 603 613
lipoat 603
Bacaan lebih lanjut
Umum mekanisme kompleks piruvat dehidrogenase icosahedral: mesin katalitik

Holmes, FL (1990, 1993) Hans Krebs, Vol 1: Pembentukan Kehidupan multifungsi. EMBO J.21 , 5587–5598.
Ilmiah, 1900–1933; Vol. 2: Arsitek Metabolisme Perantara, 1933–1937, Ilustrasi indah tentang kekuatan metodologi rekonstruksi gambar
Oxford University Press, Oxford. dengan mikroskop cryoelectron, di sini digunakan untuk
Biografi ilmiah dan pribadi Krebs oleh seorang torian sains terkemuka, mengembangkan model yang masuk akal untuk struktur kompleks
dengan deskripsi menyeluruh tentang karya yang mengungkap siklus PDH. Bandingkan model ini dengan yang ada di koran oleh Zhou et al.
urea dan asam sitrat. Perham, RN (2000) Lengan ayun dan domain ayun dalam enzim
Kay, J. & Weitzman, PDJ (eds) (1987) Siklus Asam Sitrat Krebs: multifungsi: mesin katalitik untuk reaksi multilangkah. Tahun.
Setengah Abad dan Masih Berputar, Simposium Masyarakat Biokimia 54, Pendeta Biokimia. 69, 961–1004.
Masyarakat Biokimia, London. Tinjau peran lengan ayun yang mengandung lipoat, biotin, dan pantotenat
Buku multipenulis tentang siklus asam sitrat, termasuk genetika molekuler, dalam penyaluran substrat melalui kompleks multienzim.
mekanisme pengaturan, variasi siklus mikroorganisme dari relung
ekologis yang tidak biasa, dan evolusi jalur. Yang sangat relevan adalah Zhou, ZH, McCarthy, DB, O'Conner, CM, Reed, LJ, & Stoops, JK (2001)
bab-bab oleh H. Gest (Akar Evolusi Siklus Asam Sitrat pada Prokariota), Organisasi struktural dan fungsional yang luar biasa dari kompleks piruvat
WH Holms (Kontrol Fluks melalui Siklus Asam Sitrat dan Bypass dehidrogenase eukariotik.
Glyoxylate pada Escherichia coli), dan RN Perham et al. (-Kompleks Proses Natl. Acad. Tahu AS 98, 14.802–14.807.
Dehidrogenase Asam Keto). Makalah mencolok lainnya di mana rekonstruksi gambar dengan
mikroskop cryoelectron menghasilkan model kompleks PDH.
Bandingkan model ini dengan yang ada di makalah oleh Milne et al.
Kompleks Piruvat Dehidrogenase
Harris, RA, Bowker-Kinley, MM, Huang, B., & Wu, P. Enzim Siklus Asam Sitrat
(2002) Regulasi aktivitas kompleks piruvat dehidrogenase. Lanjut Regulasi
Fraser, MD, James, MN, Bridger, WA, & Wolodko, WT
Enzim. 42, 249–259.
(1999) Sebuah deskripsi struktural rinci Escherichia coli succinyl-CoA
Milne, JLS, Shi, D., Rosenthal, PB, Sunshine, JS, Domingo, GJ, sintetase. J.Mol. Biol. 285, 1633–1653. (Lihat juga erratum dalam J. Mol.
Wu, X., Brooks, BR, Perham, RN, Hender son, R., & Subramaniam, S. Biol. 288, 501 (1999).)
(2002) Arsitektur Molekuler Dan
Bab 16 Masalah 627
Goward, CR & Nicholls, DJ (1994) Malate dehydrogenase: model untuk Weigand, G. & Remington, SJ (1986) Sitrat sintase: struktur, kontrol, dan
struktur, evolusi, dan katalisis. Ilmu Protein. 3, 1883–1888. mekanisme. Tahun. Pdt. Biophys. Biofisika.
kimia 15, 97–117.
Ulasan singkat yang bagus.
Wolodko, WT, Fraser, ME, James, MNG, & Bridger, WA
Hagerhall, C. (1997) Suksinat: kuinon oksidoreduktase: variasi pada tema (1994) Struktur kristal suksinil-CoA sintetase dari Es cherichia coli pada
yang dilestarikan. Biochim. Biofisika. UU 1320, 107–141. resolusi 2,5-Å. J.Biol. kimia 269, 10.883–10.890.
Tinjauan tentang struktur dan fungsi suksinat
dehidrogenase.
Regulasi Siklus Asam Sitrat Hansford, RG
Jitrapakdee, S. & Wallace, JC (1999) Struktur, fungsi, dan pengaturan (1980) Pengendalian oksidasi substrat mitokondria. Kur. Atas. Bioenerget.
piruvat karboksilase. Biokimia. J.340 , 1–16. 10, 217–278.
Knowles, J. (1989) Mekanisme enzim yang bergantung pada biotin. Tinjauan terperinci tentang pengaturan siklus asam sitrat.
Tahun. Pendeta Biokimia. 58, 195–221. Kaplan, NO (1985) Peran nukleotida piridin dalam mengatur metabolisme
Matte, A., Tari, LW, Goldie, H., & Delbaere, LTJ (1997) sel. Kur. Atas. Sel. Peraturan. 26, 371–381.
Struktur dan mekanisme phosphoenolpyruvate carboxykinase. Diskusi umum yang sangat baik tentang pentingnya rasio [NADH]/
J.Biol. kimia 272, 8105–8108. [NAD] dalam regulasi seluler.
Ovadi, J. & Srere, P. (2000) Kompartemen dan penyaluran makromolekul. Reed, LJ, Damuni, Z., & Merryfield, ML (1985) Regulasi piruvat mamalia
Int. Pendeta Cytol. 192, 255–280. dan kompleks dehidrogenase asam keto rantai cabang dengan fosforilasi-
Tinjauan lanjutan atas bukti penyaluran dan metabolisme. defosforilasi. Kur.
Atas. Sel. Peraturan. 27, 41–49.
Remington, SJ (1992) Struktur dan mekanisme sintase sitrat. Kur. Glyoxylate Cycle
Atas. Sel. Peraturan. 33, 209–229. Eastmond, PJ & Graham, IA (2001) Meneliti kembali peran siklus glioksilat
Tinjauan menyeluruh tentang enzim ini. dalam minyak biji. Tren Tumbuhan Sci. 6, 72–77.
Singer, TP & Johnson, MK (1985) Gugus prostetik dehidrogenase Tinjauan tingkat menengah tentang studi siklus glioksilat di Arabidopsis.
suksinat: 30 tahun dari penemuan hingga identifikasi.
FEB Lett. 190, 189–198. Holms, WH (1986) Jalur metabolisme sentral Es cherichia coli:
Deskripsi struktur dan peran pusat besi-sulfur dalam enzim ini. hubungan antara fluks dan kontrol pada titik cabang, efisiensi konversi
menjadi biomassa, dan ekskresi asetat.
Kur. Atas. Sel. Peraturan. 28, 69–106.
Masalah
1. Neraca Siklus Asam Sitrat Siklus asam sitrat memiliki delapan (d) Tulislah persamaan bersih seimbang untuk katabolisme
enzim: sitrat sintase, akonitase, isositrat dehidrogenase, -ketoglutarat asetil-KoA menjadi CO2.
dehidrogenase, suksinil-CoA sintetase, suksinat dehidrogenase,
2. Mengenali Reaksi Oksidasi dan Reduksi Salah satu strategi
fumarase, dan malat dehidrogenase.
biokimia dari banyak organisme hidup adalah oksidasi senyawa
organik secara bertahap menjadi CO2 dan H2O dan konservasi
(a) Tuliskan persamaan setimbang untuk reaksi yang dikatalis
sebagian besar energi yang dihasilkan dalam bentuk ATP. Penting
oleh masing-
untuk dapat mengenali proses oksidasi-reduksi dalam metabolisme.
masing enzim. (b) Sebutkan kofaktor yang dibutuhkan oleh
setiap Reduksi molekul organik dihasilkan dari hidrogenasi ikatan rangkap
(Persamaan 1, di bawah) atau ikatan tunggal dengan pembelahan
reaksi enzim. (c) Untuk setiap enzim, tentukan yang berikut ini
yang menyertainya (Persamaan 2). Sebaliknya, oksidasi dihasilkan
yang menjelaskan jenis reaksi yang dikatalisis: kondensasi
dari drogenasi dehidrasi. Dalam reaksi redoks biokimia, koenzim
(pembentukan ikatan karbon–karbon); dehidrasi (kehilangan air);
NAD dan FAD mendehidrogenat/hidrogenat molekul organik dengan
hidrasi (penambahan air); dekarboksilasi (kehilangan CO2); oksidasi-
adanya enzim yang tepat.
reduksi; fosforilasi tingkat substrat; isomerisasi.
HAI HAI H HAI OH

pengurangan pengurangan
B B A A
CH3 OO
C H H HAI
H oksidasi CH3 HAI
C H oksidasi CH3 HAI
C HAI
H (1)
G
H
A
H
Asetaldehida Etanol
HAI HAI HAI

pengurangan pengurangan
H
B B B D
CH3 HAI
C H H HAI
H oksidasi CH3 C HAI
oksidasi CH3 HAI
H
C OO (2)
G G A
HAI HAI
H H
G H
Asetat H Asetaldehida
Untuk setiap transformasi metabolik pada (a) sampai (h), tentukan substrat dengan adanya dehidrogenase yang sesuai.
apakah telah terjadi oksidasi atau reduksi. Bal Dalam reaksi ini, NADHH berfungsi sebagai sumber hidrogen,
Lacak setiap transformasi dengan memasukkan HOH dan, jika seperti dijelaskan pada Soal 2. Setiap kali koenzim dioksidasi,
perlu, H2O. substrat harus direduksi secara bersamaan:
HAI
Substrat NADH H 34 produk NAD
B Teroksidasi Dikurangi Direduksi Oksidasi
(A) CH3
HAI
OH H OHC HAI
Metanol Formaldehida Untuk setiap reaksi dalam (a) sampai (f), tentukan apakah
substrat telah teroksidasi atau tereduksi atau un
HAI HAI
berubah dalam keadaan oksidasi (lihat Soal 2). Jika terjadi
B B
(B) H
HCO HAI
H HAI
C H perubahan redoks, setarakan reaksi dengan jumlah NAD, NADH,

G
HAI
H, dan H2O yang diperlukan. Tujuannya adalah untuk mengenali
kapan koenzim redoks diperlukan dalam reaksi metabolisme.
Formaldehida FORMAT
HAI
HAI
B
J
(C) HAI P CP HAI HC HAI
H OH C
(A) CH3CH2 CH3
HAI
G G
HAI
H
Karbon dioksida FORMAT Etanol Asetaldehida
OH OH OH OH 2 2
HAI HAI OP3 OH OP3 OH
HAI HAI
A A
J A A
J
(D) CH2OC HAI
C H CH2
HAI
C OC
A A
J A A
J 2
G G (B) CH2O _ C C CH2 C HAI
C HPO4
A
HAI
A
H G 2
G
H H A
OP3
A
H
H H
Gliserat Gliseraldehida
1,3-Bifosfogliserat Gliseraldehida
OH OH OH OH O OH 3-fosfat
A A A A B A
(Dia) CH2OC OO
CH2 CH2O C DAN2 HAI

HAI HAI
A
B D J
H (C) CH3OCOC CH3 OC CO2
M G
Gliserin Dihidroksiaseton HAI H
Piruvat Asetaldehida
H
HAI
A
J
(F) C HAI
H C H HAI
HAI HAI
A
G B J
H
HAI
DD) CH3OCOC CH3 OC CO2
M G
Toluena Benzoat HAI HAI
Piruvat Asetat
HAI
B
H C HAI OH
HAI HAI
D G D G B
M
A
C CP C HAI (Dia) OOC OCOCH2

COO O DAN2OHAI
OOC C MENDEKUT
(G) C CH2 Dan CH2
HAI
D D G
M HAI OC H
A
HAI HAI H
M
HAI
Oksaloasetat Malat
Suksinat Fumarat
HAI HAI
HAI
HAI HAI B J B
B B CH2OC
(F ) CH3CO _
HAI
H CH3CO _
HAI
CH 3 CO2
(H) CH3
HAI
C CH3
HAI
C CO2 G
G G HAI
C HAI
HAI HAI
B
Acetoacetate Aseton
HAI
5. Stimulasi Konsumsi Oksigen oleh Oxaloac etate dan

Piruvat Asetat
Malate Pada awal tahun 1930-an, Albert Szent Györgyi
melaporkan pengamatan yang menarik bahwa penambahan
3. Hubungan Pelepasan Energi dan Keadaan Oksidasi
sejumlah kecil oksaloasetat atau malat pada suspensi otot dada
Karbon Sel eukariotik dapat menggunakan glukosa (C6H12O6)
merpati cincang merangsang konsumsi oksigen dari sediaan.
dan asam heksanoat (C6H14O2) sebagai bahan bakar untuk
Anehnya, jumlah oksigen yang dikonsumsi sekitar tujuh kali lebih
respirasi sel. Berdasarkan rumus strukturnya, zat manakah yang
banyak dari jumlah yang diperlukan untuk oksidasi sempurna
melepaskan lebih banyak energi per gram pada pembakaran
(menjadi CO2 dan H2O) dari oksaloak etat atau malat yang
sempurna menjadi CO2 dan H2O?
ditambahkan. Mengapa penambahan oksaloasetat atau malat
4. Koenzim Nikotinamida sebagai Pembawa Redoks merangsang konsumsi oksigen? Mengapa jumlah oksigen yang
Reversibel Koenzim nikotinamid (lihat Gambar 13-15) dapat dikonsumsi jauh lebih besar daripada jumlah yang diperlukan
melakukan reaksi reduksi oksidasi reversibel dengan untuk mengoksidasi sempurna oksaloasetat atau malat yang ditambahkan?
Bab 16 Masalah 629
6. Pembentukan Oksaloasetat dalam Mitokondria In (c) Fosfoenolpiruvat (d)

reaksi terakhir dari siklus asam sitrat, malat didehidrogenasi untuk Asetil-KoA (e)
meregenerasi oksaloasetat yang diperlukan untuk memasukkan Sitrat (f )
asetil-KoA ke dalam siklus: -Ketoglutarat (g)
Oksaloasetat
L-Malate NAD Pada oksaloasetat NADH H
G 30,0 kJ/mol
11. Peran Vitamin Tiamin Penderita beri-beri, penyakit
(a) Hitung tetapan kesetimbangan untuk reaksi ini pada 25 C. akibat kekurangan tiamin, mengalami peningkatan kadar
piruvat dan -ketoglutarat darah, terutama setelah mengonsumsi
(b) Karena G mengasumsikan pH standar 7, persamaannya makanan kaya glukosa. Bagaimana efek ini berhubungan dengan
konstanta librium dihitung dalam (a) sesuai dengan defisiensi tiamin?
[oksaloasetat][NADH] 12. Sintesis Oksaloasetat oleh Siklus Asam Sitrat Oksaloasetat

Buruk dibentuk pada langkah terakhir siklus asam sitrat oleh oksidasi L-
[L-malat][NAD]
malat yang bergantung pada NAD. Dapatkah sintesis bersih
Pengukuran konsentrasi L-malat dalam mito hati tikus oksaloasetat dari asetil-KoA terjadi hanya dengan menggunakan
chondria adalah sekitar 0,20 mM ketika [NAD]/[NADH] adalah 10. enzim dan kofaktor siklus asam sitrat, tanpa menghabiskan
Hitung konsentrasi oksaloasetat pada pH 7 dalam mitokondria ini. intermediet siklus? Menjelaskan. Bagaimana ox aloacetate yang
hilang dari siklus (untuk reaksi biosintetik) diisi kembali?
(c) Untuk menghargai besarnya konsentrasi oksaloasetat
mitokondria, hitung jumlah molekul oxaloacetate dalam satu
13. Cara Aksi Rodenticide Fluoroacetate
mitokondria hati tikus. Asumsikan mitokondria adalah bola dengan
diameter 2,0 m. Fluoroacetate, disiapkan secara komersial untuk pengendalian
hewan pengerat, juga diproduksi oleh tanaman Afrika Selatan.
7. Hasil Energi dari Siklus Asam Sitrat Reaksi yang dikatalis Setelah memasuki sel, fluoroacetate diubah menjadi fluoroacetyl-
oleh suksinil-KoA sintetase menghasilkan senyawa energi tinggi CoA dalam reaksi yang dikatalisis oleh enzim asetat thiokinase:
GTP. Bagaimana energi bebas yang terkandung dalam GTP
dimasukkan ke dalam kumpulan ATP seluler? F CH2COO KoA-SH ATP
F CH2C S-CoA AMP PPi
8. Studi Respirasi di Mitokondria Terisolasi Respirasi sel dapat
dipelajari di mitokondria terisolasi dengan mengukur konsumsi HAI
oksigen dalam kondisi yang berbeda. Jika 0,01 M sodium malonate

ditambahkan ke mitochondria yang aktif berespirasi yang Efek toksik fluoroasetat dipelajari dalam percobaan menggunakan
menggunakan piruvat sebagai sumber bahan bakar, respirasi segera jantung tikus yang diisolasi utuh. Setelah jantung dialiri dengan
berhenti dan perantara metabolik terakumulasi. (a) Bagaimana fluoroasetat 0,22 mM , tingkat penyerapan glukosa dan glikolisis
struktur perantara ini? (b) Jelaskan mengapa itu yang diukur menurun, dan glukosa 6-fosfat dan fruktosa 6-fosfat
terakumulasi. (c) Jelaskan mengapa terakumulasi. Pemeriksaan intermediet siklus asam sitrat
konsumsi oksigen berhenti. (d) Selain penghilangan mengungkapkan bahwa konsentrasinya di bawah normal, kecuali
malonat, bagaimana penghambatan respirasi ini dapat diatasi? sitrat, dengan konsentrasi 10 kali lebih tinggi dari normal. (a) Di
Menjelaskan. manakah blok dalam siklus asam sitrat
terjadi?
9. Studi Pelabelan pada Mitokondria Terisolasi Jalur metabolisme
Apa yang menyebabkan sitrat menumpuk dan perantaraan siklus
senyawa organik sering digambarkan dengan menggunakan substrat
lainnya habis? (b)
berlabel radioaktif dan mengikuti nasib label.
Fluoroacetyl-CoA ditransformasikan secara enzimatis dalam
siklus asam sitrat. Bagaimana struktur produk akhir metabolisme
(a) Bagaimana Anda menentukan apakah glukosa yang
fluoroasetat? Mengapa itu memblokir siklus asam sitrat? Bagaimana
ditambahkan ke suspensi mitokondria yang diisolasi dimetabolisme
hambatan itu dapat diatasi?
menjadi
(c) Dalam percobaan perfusi jantung, mengapa pengambilan
CO2 dan H2O? (b) Misalkan Anda menambahkan pulsa
glukosa dan glikolisis menurun? Mengapa hexose monophos
singkat [3-14C]piruvat (la beled pada posisi metil) ke mitokondria.
phates menumpuk?
Setelah satu putaran siklus asam sitrat, di manakah letak 14C dalam
(d) Mengapa keracunan fluoroasetat berakibat fatal?
oksaloasetat? Jelaskan dengan menelusuri label 14C melalui jalur.
Berapa putaran siklus yang diperlukan untuk melepaskan semua 14. Sintesis L-Malate dalam Pembuatan Anggur Rasa getir
[3-14C]piruvat sebagai CO2? beberapa wine disebabkan oleh konsentrasi L-malat yang tinggi.
Tuliskan urutan reaksi yang menunjukkan bagaimana sel ragi
10. Katabolisme Glukosa [1-14C] Kultur bakteri yang aktif bernapas
mensintesis L-malat dari glukosa dalam kondisi anaerob dengan
diinkubasi sebentar dengan glukosa [1-14C] , dan intermediet siklus
adanya CO2 (HCO3 ) terlarut. Perhatikan bahwa reaksi keseluruhan
asam glikolitik dan asam sitrat diisolasi.
untuk fermentasi ini tidak dapat melibatkan konsumsi koenzim
Di manakah 14C di setiap zat antara yang tercantum di bawah ini?
nikotinamid atau intermediet siklus asam sitrat.
Pertimbangkan hanya penggabungan awal 14C, pada lintasan
pertama glukosa berlabel melalui jalur. (a) 15. Sintesis Bersih -Ketoglutarat -Ketoglutarat memainkan peran
Fruktosa 1,6-bifosfat (b) sentral dalam biosintesis beberapa asam amino.
Gliseraldehida 3-fosfat Tuliskan rangkaian reaksi enzimatis yang dapat dihasilkan
sintesis bersih -ketoglutarat dari piruvat. Urutan yang Anda 100

usulkan tidak boleh melibatkan konsumsi bersih intermediet siklus
asam sitrat lainnya. Tulis persamaan untuk reaksi keseluruhan 80
Tidak ada suksinil-CoA
dan identifikasi sumber masing-masing reaktan.
60
16. Regulasi Kompleks Piruvat Dehidrogenase Pada jaringan
Aktivitas
Vmax)
dari
(%
Suksinil-CoA
hewan, laju konversi piruvat menjadi asetil-KoA diatur oleh rasio 40 ditambahkan
kompleks PDH aktif, terfosforilasi dengan kompleks PDH yang
tidak aktif dan tidak terfosforilasi. Tentukan apa yang terjadi pada 20
laju reaksi ini ketika preparat mitokondria otot kelinci yang
mengandung kompleks PDH diperlakukan dengan (a) piruvat 20 40 60 80 100 120
dehidrogenase kinase, ATP, dan NADH; (b) piruvat dehidrogenase
fosfatase dan Ca2; (c) malonat. [Asetil-KoA] ( M)
Atas dasar pengamatan ini, sarankan bagaimana suksinil-KoA

17. Sintesis Komersial Asam Sitrat Asam sitrat digunakan mengatur aktivitas sintase sitrat. (Petunjuk: Lihat Gambar 6–29.)
sebagai zat penyedap dalam minuman ringan, jus buah, dan Mengapa suksinil-KoA merupakan sinyal yang tepat untuk
banyak makanan lainnya. Di seluruh dunia, pasar asam sitrat pengaturan siklus asam sitrat? Bagaimana regulasi sintase sitrat
bernilai ratusan juta dolar per tahun. Produksi komersial mengontrol laju respirasi seluler pada jaringan jantung babi?
menggunakan kapang Aspergillus niger, yang memetabolisme
sukrosa dalam kondisi yang dikontrol dengan hati- 19. Regulasi Piruvat Karboksilase Reaksi karboksi piruvat
hati. (a) Hasil asam sitrat sangat bergantung pada oleh piruvat karboksilase terjadi pada laju yang sangat rendah
konsentrasi FeCl3 dalam media biakan, seperti ditunjukkan pada kecuali jika ada asetil-KoA, modulator alosterik positif. Jika Anda
grafik. Mengapa hasil menurun ketika konsentrasi Fe3 di atas baru saja makan makanan yang kaya akan asam lemak (tri
atau di bawah nilai optimal 0,5 mg/L? asilgliserol) tetapi rendah karbohidrat (glukosa), bagaimana sifat
pengatur ini menghentikan oksidasi glukosa menjadi CO2 dan
90 H2O tetapi meningkatkan oksidasi asetil-KoA yang diturunkan
dari lemak ? asam?
80
20. Hubungan antara Respirasi dan Siklus Asam Sitrat
Meskipun oksigen tidak berpartisipasi secara langsung dalam
70
asam
sitrat
Hasil
(%)
siklus asam sitrat, siklus tersebut hanya bekerja jika ada O2 .

Mengapa?
60
21. Termodinamika Reaksi Sintase Sitrat dalam Sel Sitrat
50 dibentuk oleh kondensasi asetil-KoA dengan oksaloasetat,
1 2 3 4 5 dikatalisis oleh sitrat sintase:
[FeCl3] (mg/L)
(b) Tuliskan urutan reaksi A. niger mensintesis asam sitrat
Oksaloasetat asetil-KoA H2O Pada sitrat KoA H
dari sukrosa. Tulis persamaan untuk reaksi keseluruhan. Dalam mitokondria jantung tikus pada pH 7,0 dan 25 C,
konsentrasi reaktan dan produk adalah: oksaloasetat, 1 M; asetil-
(c) Apakah proses komersial memerlukan media kultur untuk KoA, 1 M; sitrat, 220 M; dan CoA, 65 M. Perubahan energi bebas
diangin-anginkan—yaitu, apakah ini proses fermentasi atau standar untuk reaksi sintase sitrat adalah 32,2 kJ/mol. Apa arah
aerobik? Menjelaskan. aliran metabolit
reaksi sitrat sintase pada sel jantung tikus? Menjelaskan.
18. Regulasi Sintase Sitrat Di hadapan jumlah jenuh
oksaloasetat, aktivitas sitrat sintase dari jaringan jantung babi 22. Reaksi Kompleks Piruvat Dehidrogenase Dua langkah
menunjukkan ketergantungan sigmoid pada konsentrasi asetil- dalam dekarboksilasi oksidatif piruvat (langkah 4 dan 5 pada
KoA, seperti yang ditunjukkan pada grafik. Ketika suksinil-CoA Gambar 16-6) tidak melibatkan salah satu dari tiga karbon piruvat
ditambahkan, kurva bergeser ke kanan dan ketergantungan namun penting untuk pengoperasian kompleks PDH . Menjelaskan.
sigmoid lebih jelas.
bab 17
KATABOLISME ASAM LEMAK
17.1 Pencernaan, Mobilisasi, dan Transportasi yang membuatnya sangat cocok sebagai bahan bakar
Lemak 632 penyimpanan. Rantai alkil panjang dari asam lemak
17.2 Oksidasi Asam Lemak 637 17.3 penyusunnya pada dasarnya adalah hidrokarbon, struktur yang
sangat tereduksi dengan energi oksidasi sempurna (~38 kJ/g)
Badan Keton 650
lebih dari dua kali lipat untuk berat karbohidrat atau protein
yang sama. Keuntungan ini diperparah oleh ketidaklarutan lipid
yang ekstrim dalam air; triasilgliserol seluler beragregasi dalam
Jack Sprat tidak bisa makan lemak,
tetesan lipid, yang tidak meningkatkan osmolaritas sitosol, dan
Istrinya tidak bisa makan tanpa tidak larut. (Sebaliknya, dalam polisakarida penyimpanan, air
lemak, Jadi di antara mereka berdua Anda solvasi dapat mencapai dua pertiga dari berat keseluruhan
lihat, Mereka menjilat piring sampai bersih. molekul yang disimpan.) Dan karena kelembaman kimianya
yang relatif, triasilgliserol dapat disimpan dalam jumlah besar
—John Clarke, Paroemiologia Anglo-
Latina (Amsal Inggris dan Latin), 1639 di dalam sel tanpa risiko yang tidak diinginkan. reaksi kimia
dengan konstituen seluler lainnya.
Sifat-sifat yang membuat triasilgliserol menjadi senyawa

Oksidasi
adalahasam
jalur lemak rantai
penghasil panjang
energi menjadi
sentral asetil-KoA
di banyak organ dan penyimpanan yang baik, bagaimanapun, menghadirkan masalah
jaringan. Dalam hati dan hati mamalia, misalnya, menyediakan dalam perannya sebagai bahan bakar. Karena mereka tidak
sebanyak 80% kebutuhan energi dalam semua keadaan larut dalam air, triasilgliserol yang tertelan harus diemulsikan
fisiologis. Elektron yang dikeluarkan dari asam lemak selama sebelum dapat dicerna oleh enzim yang larut dalam air di usus,
oksidasi melewati rantai pernapasan, mendorong sintesis ATP; dan triasilgliserol yang diserap di usus atau dimobilisasi dari
asetil-KoA yang dihasilkan dari asam lemak dapat teroksidasi jaringan penyimpanan harus dibawa dalam darah yang terikat
sempurna menjadi CO2 dalam siklus asam sitrat, menghasilkan pada protein yang menetralkan ketidaklarutannya. . Untuk
konservasi energi lebih lanjut. Pada beberapa spesies dan mengatasi stabilitas relatif ikatan COC dalam asam lemak,
beberapa jaringan, asetil-KoA memiliki nasib alternatif. gugus karboksil pada C-1 diaktifkan dengan menempel pada
koenzim A, yang memungkinkan oksidasi bertahap gugus asil
Di hati, asetil-KoA dapat diubah menjadi badan keton—bahan lemak pada posisi C-3, atau , — maka nama oksidasi.
bakar larut air yang diekspor ke otak dan jaringan lain saat
glukosa tidak tersedia. Pada tanaman tingkat tinggi, asetil-KoA Kami memulai bab ini dengan diskusi singkat tentang
berfungsi terutama sebagai prekursor biosintetik, hanya sebagai sumber asam lemak dan rute perjalanannya ke tempat
bahan bakar sekunder. Meskipun peran biologis oksidasi asam oksidasinya, dengan penekanan khusus pada proses pada
lemak berbeda dari satu organisme ke organisme lainnya, vertebrata. Kami kemudian menjelaskan langkah kimia oksidasi
mekanismenya pada dasarnya sama. Proses empat langkah asam lemak di mitokondria. Oksidasi lengkap asam lemak
berulang, yang disebut oksidasi, dimana asam lemak diubah menjadi CO2 dan H2O terjadi dalam tiga tahap: oksidasi asam
menjadi asetil-KoA adalah topik utama bab ini. lemak rantai panjang menjadi fragmen dua karbon, dalam
bentuk asetil-KoA ( oksidasi); oksidasi asetil-KoA menjadi CO2
Dalam Bab 10 kami menjelaskan sifat tria cylglycerols dalam siklus asam sitrat (Bab 16); dan transfer dari
(juga disebut trigliserida atau lemak netral)
631
632 Bab 17 Katabolisme Asam Lemak
elektron dari pembawa elektron tereduksi ke rantai pernapasan Pembentukan misel sangat meningkatkan fraksi molekul lipid
drial mitokondria (Bab 19). Dalam bab ini kita fokus pada yang yang dapat diakses oleh aksi lipase yang larut dalam air di
pertama dari tahapan ini. Kita memulai diskusi kita tentang usus, dan aksi lipase mengubah triasilgliserol menjadi
oksidasi dengan kasus sederhana di mana asam lemak jenuh monoasilgliserol (monogliserida) dan diasilgliserol (digliserida),
penuh dengan jumlah atom karbon genap terdegradasi menjadi asam lemak bebas, dan gliserol (langkah 2 ) . Produk aksi
asetil-KoA. Kami kemudian melihat secara singkat transformasi lipase ini berdifusi ke dalam sel epitel yang melapisi permukaan
tambahan yang diperlukan untuk degradasi asam lemak tak usus (mukosa usus) (langkah 3), di mana mereka diubah
jenuh dan asam lemak dengan jumlah karbon ganjil. Terakhir, kembali menjadi triasilgliserol dan dikemas dengan kolesterol
kami membahas variasi tema -oksidasi dalam organel khusus— diet dan protein spesifik menjadi gerbang agregat lipoprotein
peroksisom dan glioksisom—dan dua jalur katabolisme asam yang disebut kilomikron (Gbr . 17– 2; lihat juga Gambar 17–1,
lemak yang kurang umum, dan oksidasi. Bab ini diakhiri dengan langkah 4 ).
deskripsi nasib alternatif untuk asetil-KoA yang dibentuk oleh
oksidasi di verte brates: produksi badan keton di hati. Apolipoprotein adalah protein pengikat lipid dalam darah,
bertanggung jawab untuk pengangkutan triasilgliserol, fosfolipid,
kolesterol, dan ester kolesterol menjadi tween organ.
Apolipoprotein ("apo" berarti "terpisah" atau "terpisah," menunjuk
protein dalam bentuk bebas lipidnya) bergabung dengan lipid
17.1 Pencernaan, Mobilisasi, dan
untuk membentuk beberapa kelas partikel lipoprotein, agregat
Pengangkutan Lemak bulat dengan lipid hidrofobik pada inti dan rantai samping
protein hidrofilik dan kelompok kepala lipid di permukaan.
Sel dapat memperoleh bahan bakar asam lemak dari tiga
Berbagai kombinasi lipid dan protein menghasilkan partikel
sumber: lemak yang dikonsumsi dalam makanan, lemak yang
dengan kepadatan berbeda, mulai dari kilomikron dan lipoprotein
disimpan dalam sel sebagai tetesan lipid, dan lemak yang
densitas sangat rendah (VLDL) hingga lipoprotein densitas
disintesis dalam satu organ untuk diekspor ke organ lain.
sangat tinggi (VHDL), yang dapat dipisahkan dengan sentrifugasi
Beberapa spesies menggunakan ketiga sumber dalam berbagai
ultra. Struktur partikel lipoprotein ini dan perannya dalam
keadaan, yang lain menggunakan satu atau dua. Verte brates,
transpor lipid dirinci dalam Bab 21.
misalnya, memperoleh lemak dalam makanan, memobilisasi
lemak yang disimpan dalam jaringan khusus (jaringan adiposa,
terdiri dari sel-sel yang disebut adiposit), dan, di hati, mengubah
Bagian protein dari lipoprotein dikenali oleh reseptor pada
kelebihan karbohidrat makanan menjadi lemak untuk diekspor
permukaan sel. Dalam pengambilan lipid dari usus, kilomikron,
ke jaringan lain. Rata-rata, 40% atau lebih dari kebutuhan
yang mengandung apolipoprotein C-II (apoC-II), bergerak dari
energi harian manusia di negara industri maju dipasok oleh diet
mukosa usus ke dalam sistem limfatik, dan kemudian masuk ke
triasilgliserol (walaupun sebagian besar panduan nutrisi
dalam darah, yang membawanya ke otot dan jaringan adiposa
merekomendasikan tidak lebih dari 30% asupan kalori harian
(Gbr. 17 –1, langkah 5 ). Di kapiler jaringan ini, enzim
dari lemak). Triasilgliserol menyediakan lebih dari separuh
lipoprotein lipase ekstraseluler, diaktifkan oleh apoC-II,
kebutuhan energi beberapa organ, terutama hati, jantung, dan otot rangka yang sedang beristirahat.
menghidrolisis triasilgliserol menjadi asam lemak dan gliserol
Triasilgliserol yang disimpan sebenarnya adalah satu-satunya sumber
(langkah 6), yang diambil oleh sel-sel di jaringan target (langkah
energi pada hewan yang berhibernasi dan burung yang bermigrasi.
7). Di otot, asam lemak dioksidasi menjadi energi; dalam
Protista memperoleh lemak dengan mengonsumsi organisme yang lebih
jaringan adiposa, mereka diesterifikasi ulang untuk disimpan
rendah dalam rantai makanan, dan beberapa juga menyimpan lemak
sebagai triasilgliserol (langkah 8).
sebagai tetesan lipid sitosol. Tumbuhan vaskular memobilisasi lemak yang
disimpan dalam biji selama perkecambahan, tetapi sebaliknya tidak
Sisa-sisa kilomikron, yang sebagian besar triasilgliserolnya
bergantung pada lemak untuk energi.
telah habis tetapi masih mengandung kolesterol dan
apolipoprotein, berjalan dalam darah ke hati, di mana mereka
Lemak Makanan Diserap di Usus Halus Pada
diambil melalui endositosis, dimediasi oleh reseptor untuk
vertebrata, sebelum triasilgliserol yang tertelan dapat diserap apolipoproteinnya. Triasilgliserol yang masuk ke hati melalui
melalui dinding usus, mereka harus diubah dari partikel lemak rute ini dapat dioksidasi untuk menyediakan energi atau
makroskopis yang tidak larut menjadi misel mikroskopis yang menyediakan prekursor untuk sintesis badan keton, seperti
tersebar halus. Pelarutan ini dilakukan oleh garam empedu, dijelaskan pada Bagian 17.3. Ketika makanan mengandung
seperti asam taurocholic (hal. 355), yang disintesis dari lebih banyak asam lemak daripada yang dibutuhkan segera
kolesterol di hati, disimpan di kantong empedu, dan dilepaskan untuk bahan bakar atau sebagai prekursor, hati mengubahnya
ke usus kecil setelah menelan makanan berlemak. Garam menjadi triasilgliserol, yang dikemas dengan apolipoprotein
empedu adalah senyawa amfipatik yang bertindak sebagai spesifik menjadi VLDL. VLDL diangkut dalam darah ke jaringan
detergen biologis, mengubah lemak makanan menjadi adiposa, di mana triasilgliserol dikeluarkan dan disimpan dalam
campuran misel garam empedu dan triasilgliserol (Gbr. 17–1, tetesan lipid di dalam adiposit.
langkah 1).
17.1 Pencernaan, Mobilisasi, dan Pengangkutan Lemak 633
Lemak yang tertelan

dalam makanan
8 Asam lemak dioksidasi sebagai

bahan bakar atau diesterifikasi
ulang untuk disimpan.
Kantong empedu
Miosit atau
adiposit
CO2
ATP
Usus
halus 7 Asam lemak masuk ke dalam sel.
1 Garam empedu
mengemulsi lemak
makanan di usus kecil, Lipoprotein lipase
membentuk misel campuran.
6 Lipoprotein lipase,
diaktifkan oleh
apoC-II di kapiler, mengubah
2 Lipase usus Kapiler triasilgliserol menjadi asam
mendegradasi triasilgliserol. lemak dan gliserol.
Usus
mukosa 5 Kilomikron bergerak
melalui sistem limfatik dan
aliran darah
ApoC-II ke tisu.
3 Asam lemak dan produk pemecahan
lainnya diambil oleh mukosa usus Kilomikron
dan diubah menjadi triasilgliserol.
4 Triasilgliserol tergabung, dengan
kolesterol dan apolipoprotein, menjadi
kilomikron.
GAMBAR 17–1 Pemrosesan lipid makanan pada vertebrata. Pencernaan

Apolipoprotein
dan penyerapan lipid makanan terjadi di usus kecil, dan asam lemak yang
dilepaskan dari triasilgliserol dikemas dan dikirim ke otot dan jaringan
adiposa. Delapan langkah dibahas dalam teks.
B-48
C-III
C-II
GAMBAR 17–2 Struktur molekul suatu kilomikron. Permukaannya
adalah lapisan fosfolipid, dengan kelompok kepala menghadap fase air.
Triasilgliserol yang diasingkan di bagian dalam (kuning) membentuk lebih
dari 80% massa. Beberapa apolipoprotein yang menonjol dari permukaan
(B-48, C-III, C-II) bertindak sebagai sinyal dalam penyerapan dan Kolesterol Fosfolipid
metabolisme isi kilomikron. Diameter kilomikron berkisar dari sekitar 100 triasilgliserol dan ester
hingga 500 nm. kolesterol
Hormon Memicu Mobilisasi asam dapat dioksidasi untuk produksi energi. Hormon epinefrin
Penyimpanan Triasilgliserol dan glukagon, disekresikan sebagai respons terhadap kadar
glukosa darah yang rendah, mengaktifkan enzim adenilat siklase
Lipid netral disimpan dalam adiposit (dan dalam sel sintesis dalam membran plasma adiposit (Gbr. 17–3), yang menghasilkan
steroid korteks adrenal, ovarium, dan testis) dalam bentuk AMP siklik messenger kedua intraseluler (cAMP; lihat Gbr. 12–
tetesan lipid, dengan inti sterol ester dan triasilgliserol yang 13). Cyclic AMP-dependent protein kinase (PKA) memfosforilasi
dikelilingi oleh lapisan tunggal fosfolipid. Permukaan tetesan ini perilipin A, dan perilipin terfosforilasi menyebabkan lipase peka-
dilapisi dengan perilipin, keluarga protein yang membatasi hormon dalam sitosol bergerak ke permukaan tetesan lipid, di
akses ke tetesan lipid, mencegah mobilisasi lipid sebelum mana ia dapat mulai menghidrolisis triasilgliserol menjadi asam
waktunya. lemak bebas dan gliserol. PKA juga memfosforilasi lipase peka-
Ketika hormon menandakan kebutuhan akan energi hormon, menggandakan atau melipatgandakan aktivitasnya,
metabolisme, triasilgliserol yang disimpan dalam jaringan tetapi peningkatan lebih dari 50 kali lipat dalam mobilisasi lemak
adiposa dimobilisasi (dibawa keluar dari penyimpanan) dan yang dipicu oleh epinefrin terutama disebabkan oleh fosforilasi
diangkut ke jaringan (otot rangka, jantung, dan korteks ginjal) di mana perilipin.
jaringan lemak
Sel dengan gen perilipin yang rusak hampir tidak
memiliki respons terhadap peningkatan konsentrasi cAMP;
lipase hormon-sensitif mereka tidak berhubungan dengan
Hormon Adenylyl
tetesan lipid.
cyclase
1
Karena lipase peka-hormon menghidrolisis triasilgliserol

Reseptor dalam adiposit, asam lemak yang dilepaskan (asam lemak
G5
2
bebas, FFA) berpindah dari adiposit ke dalam darah, di mana
ATP kamp
mereka berikatan dengan serum protein darah al bumin.
Protein ini (Mr 66.000), yang membentuk sekitar setengah dari
total protein serum, mengikat secara nonkovalen sebanyak 10
pengangkut asam lemak per monomer protein. Terikat pada protein larut ini,
4 asam lemak asam lemak yang tidak larut dibawa ke jaringan seperti otot
PKA
3
rangka, jantung, dan korteks ginjal. Dalam jaringan target ini,
P asam lemak dipisahkan dari albumin dan dipindahkan oleh
Lipase 7
P P sensitif transporter membran plasma ke dalam sel untuk dijadikan
P hormon b oksidasi, sebagai bahan bakar.
Perilipin P siklus asam
Sekitar 95% dari energi tri asilgliserol yang tersedia secara
sitrat, rantai pernapasan
P
P biologis berada dalam tiga asam lemak rantai panjangnya;
8
ATP hanya 5% yang disumbangkan oleh bagian gliserol. Gliserol
Tetesan lipid 6 yang dilepaskan oleh aksi lipase difosforilasi oleh gliserol
CO2
5 kinase (Gambar 17-4), dan gliserol 3-fosfat yang dihasilkan
Serum
dioksidasi menjadi dihidroksiaseton fosfat.
Asam lemak albumin
Enzim glikolitik triose fosfat isomerase mengubah senyawa ini
Triasil
gliserol Adiposit Miosit menjadi gliseraldehida 3-fosfat, yang dioksidasi melalui glikolisis.
Aliran darah
Asam Lemak Diaktifkan dan
GAMBAR 17–3 Mobilisasi triasilgliserol yang disimpan dalam
Diangkut ke Mitokondria
jaringan adiposa. Ketika kadar glukosa yang rendah dalam darah Enzim oksidasi asam lemak pada sel hewan terletak di matriks
memicu pelepasan glukagon, 1 hormon mengikat reseptornya di mitokondria, seperti yang ditunjukkan pada tahun 1948 oleh
membran adiposit dan dengan demikian 2 merangsang adenilil siklase,
Eugene P. Kennedy dan Albert Lehninger. Asam lemak dengan
melalui protein G, untuk menghasilkan cAMP. Ini mengaktifkan PKA,
panjang rantai 12 atau lebih sedikit karbon memasuki mitokondria
yang memfosforilasi 3 molekul lipase sensitif hormon dan 4 perilipin pada
tanpa bantuan trans porter membran. Mereka dengan 14 atau
permukaan tetesan lipid. Fosforilasi perilipin memungkinkan akses lipase
lebih karbon, yang merupakan mayoritas FFA yang diperoleh
sensitif hormon ke permukaan tetesan lipid, di mana ia menghidrolisis
dalam makanan atau dilepaskan dari jaringan adiposa, tidak
triasilgliserol menjadi asam lemak bebas. 6 Asam lemak meninggalkan
dapat melewati membran mitokondria secara langsung—mereka
adiposit, mengikat albumin serum di dalam darah, dan dibawa ke dalam
darah; mereka dilepaskan dari albumin dan 7 memasuki miosit melalui
pertama-tama harus menjalani tiga reaksi enzimatik dari antar-
transporter asam lemak spesifik. 8 Dalam miosit, asam lemak dioksidasi jemput karnitin . Reaksi pertama dikatalisis oleh keluarga isozim
menjadi CO2, dan energi oksidasi dilestarikan dalam ATP, yang memicu (isozim yang berbeda khusus untuk asam lemak yang memiliki
kontraksi otot dan energi lain yang membutuhkan metabolisme dalam rantai karbon pendek, menengah, atau panjang) hadir
miosit.
17.1 Pencernaan, Mobilisasi, dan Pengangkutan Lemak 635
CH2OH
SUCI di membran luar mitokondria, sintetase asil-KoA, yang mendorong
Gliserin
reaksi umum
CH2OH
Asam lemak CoA ATP y8 8z lemak asil–CoA AMP PPi
ATP
gliserol
kinase Dengan demikian, sintetase asil-KoA mengkatalisis pembentukan
ADP
ikatan thioester antara gugus karboksil asam lemak dan gugus tiol
koenzim A untuk menghasilkan asil -KoA berlemak, digabungkan
CH2OH
dengan pembelahan ATP menjadi AMP dan PPi . (Ingat deskripsi
KE C H HAI
L-Gliserol reaksi ini di Bab 13, untuk mengilustrasikan bagaimana energi
CH2 HAI P HAI 3-fosfat bebas yang dilepaskan oleh pemutusan ikatan fosfoanhidrida
HAI
dalam ATP dapat digabungkan dengan pembentukan senyawa
berenergi tinggi; hal.
MEREKA
gliserol 3-fosfat XXX.) Reaksi terjadi dalam dua langkah dan melibatkan perantara
dehidrogenase
NADH H lemak asil-adenilat (Gbr. 17–5).
Lemak asil-KoA, seperti asetil-KoA, adalah senyawa berenergi
CH2OH
tinggi; hidrolisisnya menjadi FFA dan CoA memiliki perubahan
HAI C HAI
Dihidroksiaseton energi bebas standar negatif yang besar (G ÿ 31 kJ/mol).
CH2 HAI P HAI fosfat Pembentukan lemak asil-KoA dibuat lebih menguntungkan dengan
hidrolisis dua ikatan energi tinggi di ATP; pirofosfat yang terbentuk
HAI
dalam reaksi aktivasi segera dihidrolisis oleh pirofosfatase anorganik
triosa fosfat
isomerase (sisi kiri Gambar 17-5), yang menarik reaksi aktivasi sebelumnya ke
arah pembentukan asil-KoA lemak.
H HAI
C Reaksi keseluruhannya adalah

H OH C HAI D-Gliseraldehida 3-
fosfat Asam lemak CoA ATP Pada lemak
CH2 HAI P HAI
asil–CoA AMP 2Pi (17–1)
HAI G 34 kJ/mol
Fatty acyl-CoA ester yang terbentuk di sisi sitosol membran

luar mitokondria dapat ditransportasikan ke dalam mitokondria dan
Glikolisis
dioksidasi untuk menghasilkan
GAMBAR 17–4 Masuknya gliserol ke jalur glikolitik. ATP, atau mereka dapat digunakan dalam sitosol untuk mensintesis
HAI HAI HAI
PADA HAI P OP Adenosin ATP

MEKANISME GAMBAR 17–
HAI HAI HAI
5 Konversi asam lemak menjadi asil-
HAI
KoA lemak. Konversi dikatalisis oleh
lemak asil-CoA sintetase dan RC Asam lemak
pirofosfatase anorganik. Aktivasi asam HAI
lemak dengan pembentukan turunan

lemak asil-CoA
asil-KoA lemak terjadi dalam dua 1
sintetase
karboksilat. , langkah ion
HAI
Pada langkah 1 menggantikan dua
( dan ) fosfat terluar dari ATP untuk HAI HAI
HAI P HAI adenosin
membentuk asil-adenilat lemak, HAI P HAI P HAI RC
anhidrida campuran dari asam karboksilat
HAI Lemak asil-adenilat
HAI HAI
HAI (terikat enzim)
dan asam fosfat. Produk lainnya
CoA-SH
adalah PPi, gugus pergi yang Pirofosfat
2
sangat baik yang segera dihidrolisis lemak asil-CoA
sintetase AMP
menjadi dua Pi, menarik reaksi ke pirofosfatase anorganik
arah depan. Pada , kelompok tiol dari
HAI
langkah 2 koenzim A melakukan R

2Pi C Lemak asil-CoA
serangan nukleofilik pada anhidrida
S-CoA
campuran yang terikat enzim,
menggantikan AMP dan G 19 kJ/mol G 15 kJ/mol (untuk
membentuk asil-KoA lemak thioester. Reaksi keseluruhan sangat eksergonik. proses dua langkah)
Membran luar Membran mitokondria

mitokondria bagian dalam
Sitosol Antarmembran Matriks

ruang angkasa
Karnitin
HAI
asiltransferase II
HAI
RC RC
S-CoA Karnitin
Karnitin S-CoA
HAI
RC HAI
Karnitin RC CoA-SH
CoA-SH Karnitin
Karnitin Pengangkut
asiltransferase I
GAMBAR 17–6 Masuknya asam lemak ke dalam mitokondria A, membebaskan karnitin untuk kembali ke ruang antarmembran
melalui transporter asil-karnitin/karnitin. Setelah lemak asil-karnitin melalui transporter yang sama. Asiltransferase I dihambat oleh malonil-
terbentuk di membran luar atau di ruang antar membran, ia bergerak KoA, perantara pertama dalam sintesis asam lemak (lihat Gambar
ke dalam matriks dengan difusi yang difasilitasi melalui transporter di membran21-1).
dalam.Penghambatan ini mencegah sintesis simultan dan degradasi asam lemak.
Dalam matriks, gugus asil ditransfer ke koenzim mitokondria
lipid membran. Asam lemak yang ditujukan untuk oksidasi Proses tiga langkah ini untuk mentransfer asam lemak
mitokondria secara sementara melekat pada gugus hidroksil ke dalam mitokondria—esterifikasi menjadi CoA, transes
karnitin untuk membentuk lemak asil-karnitin—reaksi terifikasi menjadi karnitin diikuti dengan transpor, dan
kedua dari shuttle. Transesterifikasi ini dianalisis dengan transesterifikasi kembali ke CoA—menghubungkan dua
cat oleh karnitin asiltransferase I (Mr 88.000), di membran kelompok terpisah dari koenzim A dan lemak asil-KoA,
luar. Baik asil-KoA melewati membran luar dan diubah satu di sitosol. , yang lain di mitokondria. Kolam ini memiliki
menjadi ester karnitin di ruang antarmembran (Gbr. 17–6), fungsi yang berbeda. Koenzim A dalam matriks mitokondria
atau ester karnitin terbentuk pada permukaan sitosolik sebagian besar digunakan dalam degradasi oksidatif
membran luar, kemudian bergerak melintasi membran luar. piruvat, asam lemak, dan beberapa asam amino,
bran ke ruang antarmembran — bukti saat ini tidak sedangkan koenzim A sitosol digunakan dalam biosintesis
mengungkapkan yang mana. Dalam kedua kasus, jalan asam lemak (lihat Gambar 21-10). Lemak asil-KoA di
masuk ke ruang antarmembran (ruang antara membran kumpulan sitosolik dapat digunakan untuk sintesis lipid
luar dan dalam) terjadi melalui pori-pori besar (dibentuk membran atau dapat dipindahkan ke matriks mitokondria
oleh protein porin) di membran luar. untuk oksidasi dan produksi ATP. Konversi ke ester karnitin
membuat gugus asil lemak menjadi nasib oksidatif.
Ester asil-karnitin berlemak kemudian memasuki matriks Proses masuk yang dimediasi karnitin adalah langkah
dengan difusi terfasilitasi melalui transporter asil-karnitin/ pembatas laju untuk oksidasi asam lemak di mitokondria
karnitin dari membran mitokondria bagian dalam (Gbr. dan, seperti yang dibahas nanti, merupakan titik regulasi.
17-6). Begitu berada di sisi mitokondria, lemak asil-KoA
ditindaklanjuti oleh satu set enzim dalam matriks.
CH3
CH3 N CH2 CH CH2 MENDEKUT
CH3 OH RINGKASAN 17.1 Pencernaan, Mobilisasi,

Karnitin dan Pengangkutan Lemak
Pada langkah ketiga dan terakhir dari antar-jemput
karnitin, gugus asil lemak ditransfer secara enzimatik dari ÿ Asam lemak triasilgliserol menyediakan sebagian besar
karnitin ke koenzim A intramitokondria oleh carnitine energi oksidatif pada hewan. Triasilgliserol makanan
acyltransferase II. Isozim ini, yang terletak di permukaan diemulsi di usus kecil oleh garam empedu, dihidrolisis oleh
dalam membran mitokondria bagian dalam, menghasilkan lipase usus, diserap oleh sel epitel usus, diubah menjadi
kembali asil-KoA lemak dan melepaskannya, bersama triasilgliserol, kemudian dibentuk menjadi kilomikron
dengan karnitin bebas, ke dalam matriks (Gbr. 17-6). dengan kombinasi dengan apolipoprotein
Carnitine memperbaharui ruang intermembran melalui spesifik.
transporter acyl-carnitine/car nitine.
17.2 Oksidasi Asam Lemak 637
ÿ Kilomikron mengirimkan triasilgliserol ke jaringan, tempat Tahap 1 Tahap 2

lipoprotein lipase melepaskan asam lemak bebas untuk CH3
masuk ke dalam sel. Triasilgliserol yang disimpan CH2
Oksidasi
dalam jaringan adiposa dimobilisasi oleh lipase CH2
8 Asetil-KoA
triasilgliserol yang peka terhadap hormon. Asam lemak CH2
yang dilepaskan mengikat albumin serum dan dibawa dalam CH2
darah ke jantung, otot rangka, dan jaringan lain yang CH2
menggunakan asam lemak sebagai bahan bakar. CH2
Dia
CH2
ÿ Begitu berada di dalam sel, asam lemak diaktifkan di CH2
membran luar mitokondria melalui konversi CH2 Siklus

CH2 asam sitrat
menjadi thioester asil-KoA lemak. Lemak asil-KoA yang
akan dioksidasi memasuki mitokondria dalam tiga langkah, CH2
melalui antar-jemput karnitin. CH2
CH2 64e
16CO2
CH2
17.2 Oksidasi Asam Lemak C HAI
Seperti disebutkan sebelumnya, oksidasi asam lemak mitokondria HAI
terjadi dalam tiga tahap (Gbr. 17-7). Pada tahap pertama—oksidasi—

asam lemak mengalami pemindahan oksidatif unit dua karbon berturut-
turut dalam bentuk asetil-KoA, dimulai dari ujung karboksil rantai asil NADH, FADH2
Tahap 3
lemak. Misalnya, asam palmitat 16-karbon (palmitat pada pH 7)
Dia
mengalami tujuh lintasan melalui urutan oksidatif, di setiap lintasan

1
2 jam
kehilangan dua karbon sebagai asetil-KoA. Pada akhir tujuh siklus, dua 2 O2
karbon terakhir dari palmitat (awalnya C-15 dan C-16) tetap sebagai Rantai
pernapasan
asetil-KoA. Hasil keseluruhannya adalah konversi rantai 16-karbon (transfer elektron).
H2O
palmitat menjadi delapan gugus asetil dua karbon dari molekul asetil-
KoA. Pembentukan setiap asetil-KoA membutuhkan penghilangan
empat atom hidrogen (dua pasang elektron dan empat H) dari gugus ADP Pi ATP
asil lemak oleh dehidrogenase.
GAMBAR 17–7 Tahapan oksidasi asam lemak. Tahap 1: Asam
lemak rantai panjang dioksidasi untuk menghasilkan residu asetil
dalam bentuk asetil KoA. Proses ini disebut oksidasi. Tahap 2: Gugus
Pada tahap kedua oksidasi asam lemak, gugus asetil dari asetil- asetil dioksidasi menjadi CO2 melalui siklus asam sitrat. Tahap 3:
KoA dioksidasi menjadi CO2 dalam siklus asam sitrat, yang juga Elektron yang berasal dari oksidasi tahap 1 dan 2 berpindah ke O2
berlangsung dalam matriks mitokondria. Asetil-KoA yang berasal dari melalui rantai pernapasan drial mitokondria, menyediakan energi untuk
asam lemak kemudian memasuki jalur akhir oksidasi bersama dengan sintesis ATP melalui fosforilasi oksidatif.
asetil-KoA yang berasal dari glukosa melalui glikolisis dan oksidasi
piruvat (lihat Gambar 16-1). Dua tahap pertama dari oksidasi asam
Oksidasi Asam Lemak Jenuh Memiliki Empat Langkah Dasar
lemak menghasilkan pembawa elektron tereduksi NADH dan FADH2,
Empat reaksi
yang pada tahap ketiga menyumbangkan elektron ke rantai pernapasan
mitokondria, melalui mana elektron berpindah ke oksigen bersamaan yang dikatalis oleh enzim membentuk tahap pertama oksidasi asam
dengan fosforilasi ADP menjadi ATP (Gbr. 1). lemak (Gbr. 17–8a). Pertama, dehidrogenasi lemak asil–KoA
menghasilkan ikatan rangkap antara atom karbon dan atom karbon
(C-2 dan C-3), menghasilkan trans -2- enoil-KoA (simbol menunjukkan
2
17–7). Energi yang dilepaskan oleh oksidasi asam lemak dengan posisi ikatan rangkap; Anda mungkin ingin meninjau kembali
demikian dilestarikan sebagai ATP. nomenklatur asam lemak, hal.343.) Perhatikan bahwa ikatan rangkap
Kita sekarang melihat lebih dekat pada tahap pertama oksidasi yang baru memiliki konfigurasi trans, sedangkan ikatan rangkap pada
asam lemak, dimulai dengan kasus sederhana rantai asil lemak jenuh asam lemak tak jenuh alami biasanya dalam konfigurasi cis. Kami
dengan jumlah karbon genap, kemudian beralih ke kasus rantai tak mempertimbangkan pentingnya perbedaan ini nanti.
jenuh dan bilangan ganjil yang sedikit lebih rumit. Kami juga
mempertimbangkan pengaturan oksidasi asam lemak, proses -oksidatif
seperti yang terjadi di organel selain mito chondria, dan, akhirnya, dua Langkah pertama ini dikatalisis oleh tiga isozim asil-KoA
mode katabolisme asam lemak yang kurang umum, oksidasi dan dehidrogenase, masing-masing spesifik untuk rentang panjang rantai
oksidasi. asil lemak: asil-KoA de hidrogenase rantai sangat panjang (VLCAD),
bekerja pada asam lemak 12 hingga 18
karbon; rantai menengah (MCAD), bekerja pada asam dalam siklus asam sitrat (hal. XXX); dalam kedua reaksi,
lemak dari 4 sampai 14 karbon; dan rantai pendek enzim terikat pada membran dalam, ikatan rangkap
(SCAD), bekerja pada asam lemak dari 4 sampai 8 dimasukkan ke dalam asam karboksilat antara karbon
karbon. Ketiga isozim tersebut adalah protein flavo dan, FAD adalah akseptor elektron, dan elektron dari
dengan FAD (lihat Gambar 13-18) sebagai gugus reaksi akhirnya memasuki rantai pernapasan dan
prostetik. Elektron yang dihilangkan dari lemak asil-KoA berpindah ke O2, bersamaan dengan itu . sintesis sekitar
ditransfer ke FAD, dan bentuk tereduksi dari de 1,5 molekul ATP per pasangan elektron.
hidrogenase segera menyumbangkan elektronnya ke Pada langkah kedua siklus -oksidasi (Gbr. 17–8a),
pembawa elektron dari rantai pernapasan mitokondria, air ditambahkan ke ikatan rangkap trans -2 -enoyl-CoA
flavoprotein pemindah elektron (ETF) (lihat Gambar 19– untuk membentuk stereoisomer L dari -hidroksiasil-KoA
8). Oksidasi yang dikatalisis oleh asil-KoA de hidrogenase analog(3-hidroksiasil-KoA)
dengan dehidrogenasi. Reaksi
suksinat
ini, dikatalisis oleh
enoyl-CoA hydratase, secara analog dengan reaksi
fumarase dalam siklus asam sitrat, di mana H2O
(A) menambahkan ikatan rangkap dua (hal. XXX).
(C16) R CH2 CH2 CH2 C S-CoA
Palmitoyl -CoA
Pada langkah ketiga, L--hidroksiasil-KoA
MODE didehidrogenasi menjadi -ketoasil-KoA, dengan aksi
asil-CoA
dehidrogenase -hidroksiasil-KoA dehidrogenase; NAD adalah
FADH2
akseptor elektron. Enzim ini sangat spesifik untuk
H stereoisomer L dari hidroksiasil-KoA. NADH yang
terbentuk dalam reaksi menyumbangkan elektronnya ke
R CH2 CCC S-CoA
trans-2 -
NADH dehydrogenase, pembawa elektron dari rantai
H HAI
pernapasan, dan ATP terbentuk dari ADP ketika elektron
Enoil-CoA
H2O berpindah ke O2. Reaksi yang dikatalisis oleh -hidroksiasil-
enoyl-CoA
hidratase KoA de hidrogenase sangat mirip dengan reaksi malat
dehi drogenase dari siklus asam sitrat (hal. XXX).
OH Langkah keempat dan terakhir dari siklus -oksidasi
dikatalisis oleh asil-KoA asetiltransferase, lebih sering
R CH2 C CH2 C S-CoA
disebut tiolase, yang mempromosikan reaksi -ketoasil -
H L--Hidroksi
HAI
KoA dengan molekul koenzim A bebas untuk memisahkan
asil-KoA
MEREKA
fragmen dua-karbon karboksil-terminal asam lemak asli
-hidroksiasil-CoA
dehidrogenase
sebagai asetil-KoA. Produk lainnya adalah koenzim A
NADH H thioester dari asam lemak, yang sekarang disingkat
menjadi dua atom karbon (Gbr. 17–8a). Reaksi ini disebut
R CH2 C CH2 C S-CoA
tiolisis, secara analogi dengan proses hidrolisis, karena
HAI HAI -Ketoasil-CoA -ketoasil -KoA dibelah oleh reaksi dengan gugus tiol
asil-KoA KoA-SH
koenzim A.
asetiltransferase Tiga langkah terakhir dari urutan empat langkah ini
(tiolase)
dikatalisis oleh salah satu dari dua set enzim, dengan
enzim yang digunakan bergantung pada panjang rantai
(C14) R CH2 C S-CoA CH3 C S-CoA
asil lemak. Untuk rantai asil lemak dari 12 atau lebih
HAI HAI karbon, reaksi dikatalisis oleh kompleks multienzim yang
(C14) Asil-CoA terkait dengan membran mitokondria bagian dalam,
Asetil -CoA
(myristoyl-CoA) protein trifungsional (TFP). TFP adalah heterooctamer
subunit.
44 Setiap subunit mengandung dua aktivitas, yaitu
enoyl-CoA hydratase dan -hydroxyacyl-CoA
dehydrogenase; subunit mengandung aktivitas tiolase.
(B)
C14
Hubungan yang erat dari tiga enzim ini memungkinkan
Asetil -CoA
penyaluran substrat yang efisien dari satu tempat aktif ke tempat lain
C12 Asetil -CoA
Q10 Asetil -CoA GAMBAR 17–8 Jalur -oksidasi. (a) Pada setiap lintasan melalui urutan
C8 Asetil -CoA empat langkah ini, satu residu asetil (diarsir dengan warna merah
jambu) dihilangkan dalam bentuk asetil-KoA dari ujung karboksil rantai
C6 Asetil -CoA asil lemak—dalam contoh ini palmitat (C16), yang memasuki sebagai
C4 Asetil -CoA palmitoyl-CoA. (b) Enam lintasan lagi melalui jalur tersebut menghasilkan
tujuh molekul asetil-KoA lagi, yang ketujuh muncul dari dua atom karbon
Asetil -Dengan
terakhir dari rantai 16-karbon. Delapan molekul asetil-KoA terbentuk semuanya.
selanjutnya, tanpa difusi intermediet dari permukaan enzim. proses. Transfer elektron dari NADH atau FADH2 ke O2
Ketika TFP memperpendek rantai asil lemak menjadi 12 atau menghasilkan satu H2O per pasangan elektron. Reduksi O2
lebih sedikit karbon, oksidasi lebih lanjut dikatalisis oleh satu oleh NADH juga mengkonsumsi satu H per molekul NADH:
set empat enzim larut dalam matriks. NADH H O2 On NAD 1
H2O. Pada hewan yang berhibernasi,
2
Seperti disebutkan sebelumnya, ikatan tunggal antara oksidasi asam lemak menyediakan energi metabolik, panas,
gugus metil ena (OCH2O) dalam asam lemak relatif stabil. dan air—semuanya penting untuk kelangsungan hidup hewan
Urutan -oksidasi adalah mekanisme elegan untuk yang tidak makan atau minum dalam waktu lama (Kotak 17–1).
mendestabilisasi dan memutus ikatan ini. Tiga reaksi oksidasi Unta mendapatkan air untuk melengkapi sedikit pasokan
pertama menciptakan ikatan COC yang jauh lebih tidak stabil, yang tersedia di lingkungan alaminya dengan oksidasi lemak
di mana karbon (C-2) terikat pada dua karbon bonil mobil yang disimpan di punuknya.
( perantara -ketoasil-KoA). Fungsi keton pada karbon (C-3) Persamaan keseluruhan untuk oksidasi palmitoil
menjadikannya target yang baik untuk serangan nukleofilik CoA menjadi delapan molekul asetil-KoA, termasuk transfer
oleh OSH koenzim A, yang dikatalisis oleh tiolase. Keasaman elektron dan fosforilasi oksidatif, adalah
hidrogen dan stabilisasi resonansi karbanion yang dihasilkan
Palmitoyl-CoA 7CoA 7O2 28Pi 28ADP Pada 8 asetil-
oleh pelepasan hidrogen ini menjadikan terminal
KoA 28ATP 7H2O (17–4)
OCH2OCOOS-CoA sebagai gugus pergi yang baik,
memfasilitasi pemutusan ikatan -.
Asetil-KoA Dapat Dioksidasi Lebih
Lanjut dalam Siklus
Empat Langkah Oksidasi Diulangi untuk Menghasilkan Asam Sitrat Asetil-KoA yang dihasilkan dari oksidasi asam
Asetil-KoA dan ATP lemak dapat dioksidasi menjadi CO2 dan H2O melalui siklus
asam sitrat. Persamaan berikut mewakili neraca untuk tahap
Dalam satu langkah melalui urutan -oksidasi, satu molekul kedua dalam oksidasi palmitoyl CoA, bersama dengan
asetil-KoA, dua pasang elektron, dan empat proton (H) fosforilasi berpasangan dari tahap ketiga:
dikeluarkan dari rantai panjang lemak asil-CoA,
memperpendeknya dengan dua atom karbon. Persamaan
untuk satu pass, dimulai dengan ester koenzim A dari contoh 8 Asetil-KoA 16O2 80Pi 80ADP Aktif
kita, palmitat, adalah 8CoA 80ATP 16CO2 16H2O (17–5)
Palmitoyl-CoA CoA FAD NAD H2O Aktif Menggabungkan Persamaan 17–4 dan 17–5, kita memperoleh
myristoyl-CoA acetyl-CoA FADH2 NADH H (17–2) persamaan keseluruhan untuk oksidasi lengkap palmitoil
CoA menjadi karbon dioksida dan air:
Setelah penghilangan satu unit asetil-KoA dari palmitoil KoA, Palmitoyl-CoA 23O2 108Pi 108ADP Aktif
koenzim A tioester dari asam lemak yang dipersingkat KoA 108ATP 16CO2 23H2O (17–6)
(sekarang miristat 14-karbon) tetap ada. Myristoyl-CoA Tabel 17-1 merangkum hasil NADH, FADH2, dan ATP dalam
sekarang dapat melalui rangkaian empat reaksi oksidasi langkah-langkah oksidasi palmitoyl-CoA yang berurutan.
lainnya, persis analog dengan yang pertama, untuk Perhatikan bahwa karena aktivasi palmitat menjadi palmitoyl-
menghasilkan molekul kedua asetil-KoA dan lauroyl-CoA, CoA memutus kedua ikatan fosfoanhidrida dalam ATP (Gbr.
koenzim A thioester dari laurat 12-karbon. 17-5), biaya energetik untuk mengaktifkan asam lemak setara
Secara keseluruhan, tujuh lintasan melalui urutan -oksidasi dengan dua ATP, dan keuntungan bersih per molekul
diperlukan untuk mengoksidasi satu molekul palmitoil-KoA palmitat adalah 106 ATP. Perubahan energi bebas standar
menjadi delapan molekul asetil-KoA (Gbr. 17–8b). Persamaan untuk oksidasi palmitat menjadi CO2 dan H2O adalah sekitar
keseluruhannya adalah 9.800 kJ/mol. Dalam kondisi standar, energi yang diperoleh
Palmitoyl-CoA 7CoA 7FAD 7NAD 7H2O Pada 8 asetil-KoA kembali sebagai energi ikatan fosfat ATP adalah 106 30,5 kJ/
7FADH2 7NADH 7H (17–3) mol 3.230 kJ/mol, sekitar 33% dari maksimum teoretis.
Namun, ketika perubahan energi bebas dihitung dari
Setiap molekul FADH2 yang terbentuk selama oksidasi asam konsentrasi aktual reaktan dan produk dalam kondisi
lemak menyumbangkan sepasang elektron ke ETF rantai intraseluler (lihat Kotak 13-1), pemulihan energi bebas lebih
pernapasan, dan sekitar 1,5 molekul ATP dihasilkan selama dari 60%; konservasi energi sangat efisien.
transfer berikutnya dari setiap pasangan elektron ke O2 .
Demikian pula, setiap molekul NADH yang terbentuk
mengirimkan sepasang elektron ke NADH de hidrogenase
Oksidasi Memerlukan Asam Lemak Tak Jenuh
mitokondria, dan transfer selanjutnya dari setiap pasang
Dua Reaksi Tambahan
elektron ke O2 menghasilkan pembentukan sekitar 2,5
molekul ATP. Jadi empat molekul ATP terbentuk untuk setiap Urutan oksidasi asam lemak yang baru saja dijelaskan
unit dua karbon yang dihilangkan dalam satu lintasan melalui adalah tipikal ketika asam lemak yang masuk jenuh (yaitu,
urutan. Perhatikan bahwa air juga diproduksi dalam hal ini hanya memiliki ikatan tunggal dalam rantai karbonnya). Namun,
KOTAK 17–1 DUNIA BIOKIMIA
Beruang Gemuk Melakukan Oksidasi Saat Tidur Banyak hewan nating) tingkat. Meskipun mengeluarkan sekitar 25.000 kJ/hari (6.000
kkal/hari), beruang tidak makan, minum, buang air kecil, atau buang
bergantung pada simpanan lemak untuk energi selama hibernasi,
air besar selama berbulan-bulan.
selama periode migrasi, dan dalam situasi lain yang melibatkan
Studi eksperimental menunjukkan bahwa beruang grizzly yang
penyesuaian metabolisme radikal. Salah satu penyesuaian
berhibernasi menggunakan lemak tubuh sebagai satu-satunya bahan
metabolisme lemak yang paling menonjol terjadi pada beruang grizzly
bakar. Oksidasi lemak menghasilkan energi yang cukup untuk
yang berhibernasi. Hewan-hewan ini tetap dalam keadaan dormansi
pemeliharaan suhu tubuh, sintesis aktif asam amino dan protein, dan
terus menerus selama tujuh bulan. Tidak seperti kebanyakan spesies
aktivitas lain yang membutuhkan energi, seperti transpor membran.
yang berhibernasi, beruang mempertahankan suhu tubuh antara 32
Oksidasi lemak juga melepaskan air dalam jumlah besar, seperti
dan 35 C, mendekati suhu normal (nonhiber
dijelaskan dalam teks, yang menggantikan air yang hilang saat
bernapas. Gliserol yang dilepaskan oleh degradasi triasilgliserol
diubah menjadi glukosa darah oleh glukoneogenesis. Urea yang
terbentuk selama pemecahan asam amino diserap kembali di ginjal
dan didaur ulang, gugus amino digunakan kembali untuk membuat
asam amino baru untuk menjaga protein tubuh.
Beruang menyimpan sejumlah besar lemak tubuh untuk

persiapan tidur panjang mereka. Seekor grizzly dewasa mengonsumsi
sekitar 38.000 kJ/hari selama akhir musim semi dan musim panas,
tetapi saat musim dingin mendekat, ia makan 20 jam sehari,
mengonsumsi hingga 84.000 kJ setiap hari. Perubahan pola makan
ini merupakan respons terhadap perubahan sekresi hormon musiman.
Sejumlah besar triasilgliserol terbentuk dari asupan karbohidrat yang
sangat banyak selama periode penggemukan. Spesies lain yang
berhibernasi, termasuk tikus kecil, juga menumpuk lemak tubuh
Seekor beruang grizzly menyiapkan sarang hibernasinya, di dekat Sungai dalam jumlah besar.
McNeil di Kanada.
sebagian besar asam lemak dalam triasilgliserol dan fosfolipid hewan ikatan rangkap trans dari -enoyl-CoA yang 2dihasilkan selama oksidasi.
dan tumbuhan tidak jenuh, memiliki satu atau lebih ikatan rangkap. Dua enzim tambahan diperlukan untuk oksidasi asam lemak tak jenuh
Ikatan ini berada dalam konfigurasi cis dan tidak dapat ditindaklanjuti umum: isomerase dan reduktase. Kami mengilustrasikan reaksi
oleh enoyl-CoA hydratase, enzim yang mengkatalisis penambahan H2O tambahan ini dengan dua contoh.
ke
TABEL 17–1 Hasil ATP selama Oksidasi Satu Molekul Palmitoyl-CoA menjadi CO2 dan H2O
Jumlah NADH atau Jumlah ATP
Enzim mengkatalisasi langkah oksidasi FADH2 yang terbentuk akhirnya terbentuk*
Asil-CoA dehidrogenase 7 FADH2 10,5

-Hydroxyacyl-CoA dehydrogenase 7 NADH 17,5
Isocitrate dehydrogenase 8 NADH 20
-Ketoglutarat dehidrogenase 8 NADH 20
Suksinil-CoA sintetase
Suksinat dehidrogenase 8 FADH2 8†
Malat dehidrogenase 8 NADH 12
Total 20 108
*
Perhitungan ini mengasumsikan bahwa fosforilasi oksidatif mitokondria menghasilkan 1,5 ATP per FADH2 teroksidasi dan 2,5 ATP per NADH teroksidasi.
†
GTP yang dihasilkan secara langsung pada langkah ini menghasilkan ATP dalam reaksi yang dikatalisis oleh nukleosida difosfat kinase (hal. XXX).
Oleat adalah asam lemak tak jenuh tunggal 18-karbon 12 9 HAI

1
yang melimpah dengan ikatan rangkap cis antara C-9 dan C
9 18 S-CoA
C-10 (dilambangkan ). Pada langkah pertama oksidasi, oleat
diubah menjadi oleoyl-CoA dan, seperti asam lemak jenuh, b oksidasi Linoleoyl-CoA
(tiga siklus) 3 Asetil Dengan cis-9 , cis-12
memasuki matriks mitokondria melalui penutup karnitin (Gbr.
17–6). Oleoyl-CoA kemudian mengalami tiga lintasan melalui 6 4 3(b) HAI
siklus oksidasi asam lemak untuk menghasilkan tiga molekul C

3
asetil-KoA dan ester koenzim A dari asam lemak tak , 12 5 2(a) S-CoA cis-3 , cis-6
jenuh 12-karbon, cis-3-dodecenoyl CoA (Gbr. 17–9). Produk 3

,
2
-enoyl-CoA
ini tidak dapat berfungsi sebagai substrat untuk enoyl-CoA isomerase
hydratase, yang hanya bekerja pada ikatan rangkap trans 3 6

4 2(a) S-CoA
Enzim tambahan isomerase ,2 -enoyl-CoA .
C
mengisomerisasi cis-3 -enoyl-CoA menjadi trans-2 -enoyl- 12 5 3(b)
trans-2
HAI , cis-6
CoA, yang diubah oleh enoyl-CoA hydratase menjadi L--
b oksidasi
hydroxyacyl-CoA yang sesuai (trans-2 -dodecenoyl-CoA).
(satu siklus, dan
Perantara ini sekarang ditindaklanjuti oleh sisa enzim oksidasi oksidasi pertama Asetil Dengan
siklus kedua)
untuk menghasilkan asetil-KoA dan koenzim A ester dari
asam lemak jenuh 10-karbon, dekanoil-KoA. Yang terakhir 5 4
2 S-CoA
mengalami empat lintasan lagi melalui jalur untuk menghasilkan 1
C
lima molekul asetil-KoA lagi. Secara keseluruhan, sembilan 10 3
HAI trans-2 cis-4
,
asetil-KoA dihasilkan dari satu molekul oleat 18-karbon.
NADPH H
2,4-dienoyl-CoA
reduktase
NADP
Enzim tambahan lainnya (reduktase) diperlukan untuk
HAI
oksidasi asam lemak tak jenuh ganda—untuk 5 3 1
C
10 4 2 S-CoA trans-3
HAI isomerase
9
1
enoyl-CoA
18
C
S-CoA HAI
3 1
Oleoyl-CoA C
10 4 2 S-CoA trans-2
oksidasi
(tiga siklus)
3 Asetil-KoA b oksidasi
(empat siklus)
H HO 5 Asetil-KoA
12
C GAMBAR 17–10 Oksidasi asam lemak tak jenuh ganda. Contoh di sini
S-CoA
adalah asam linoleat, seperti linoleoyl-CoA (9,12). Oksidasi membutuhkan
cis-3 - enzim tambahan kedua selain isomerase enoyl-CoA: reduktase 2,4-
Dodecenoyl-CoA dienoyl-CoA yang bergantung pada NADPH. Aksi gabungan dari kedua
3 2
, -enoyl-CoA isomerase enzim ini mengubah perantara trans-2 ,cis-4 -dienoyl-CoA menjadi
substrat trans-2- enoyl-CoA yang diperlukan untuk oksidasi.
H HAI
C
12 S-CoA
H
misalnya, linoleat 18-karbon, yang memiliki konfigurasi
trans-2 - 12
cis-9 ,cis- (Gbr. 17–10). Linoleoyl-CoA menjalani tiga
Dodecenoyl-CoA
b oksidasi
lintasan melalui urutan -oksidasi untuk menghasilkan tiga
(lima siklus) molekul asetil-KoA dan koenzim A ester dari asam lemak tak
jenuh 12-karbon dengan konfigurasi cis- , cis-6 . Perantara ini
3
tidak dapat digunakan oleh enzim jalur -oksidasi ; ikatan
6 Asetil-KoA rangkapnya berada pada posisi yang salah dan memiliki
GAMBAR 17–9 Oksidasi asam lemak tak jenuh tunggal. Asam oleat, konfigurasi yang salah (cis, bukan trans). Namun, aksi
seperti oleoyl-CoA (9 ), adalah contoh yang digunakan di sini. Oksidasi gabungan dari enoyl-CoA isomerase dan 2,4-dienoyl CoA
memerlukan enzim tambahan, enoyl-CoA isomerase, untuk memposisikan reductase, seperti yang ditunjukkan pada Gambar 17-10,
ulang ikatan rangkap, mengubah isomer cis menjadi isomer trans, memungkinkan percobaan ulang zat antara ini ke dalam jalur
perantara normal dalam oksidasi. -oksidasi .
dan degradasinya menjadi enam asetil-KoA. Hasil H

keseluruhannya adalah konversi linoleat menjadi sembilan
H C H
molekul asetil-KoA.
H CH
Propionil-CoA
Oksidasi Lengkap Asam Lemak Berbilangan C
Ganjil Memerlukan Tiga Reaksi CoA-SO
Ekstra Meskipun sebagian besar lipid yang terbentuk secara HCO3

alami mengandung asam lemak dengan jumlah atom karbon ATP
propionil-KoA
genap, asam lemak dengan jumlah karbon ganjil umum karboksilase biotin
ditemukan dalam lipid banyak tanaman dan beberapa ADP Pi

organisme laut. Sapi dan hewan ruminansia lainnya
membentuk tiga karbon propionat (CH3OCH2OCOO) H
dalam jumlah besar selama fermentasi karbohidrat dalam H C H
HAI
rumen. Propionat diserap ke dalam darah dan dioksidasi oleh
C CH
hati dan jaringan lain. Dan sejumlah kecil propionat D-Metilmalonil-CoA
ditambahkan sebagai penghambat jamur pada beberapa roti HAI
C
dan sereal, sehingga masuk ke dalam makanan manusia. CoA-S HAI
Asam lemak rantai panjang bilangan ganjil dioksidasi

dalam jalur yang sama dengan asam bilangan genap, dimulai metilmalonil-CoA
dari ujung karboksil rantai. Namun, substrat untuk lintasan epimerase
terakhir melalui urutan -oksidasi adalah asam lemak asil-KoA
dengan asam lemak lima karbon. Ketika ini dioksidasi dan
dibelah, produknya adalah asetil-KoA dan propionil-KoA. H H
HAI
Asetil-KoA dapat dioksidasi dalam siklus asam sitrat, tentu H C H koenzim

C C H
B12
saja, tetapi propionil-KoA memasuki jalur berbeda yang HAI CoA-S
melibatkan tiga enzim. metil
C CH malonil-CoA H CH
Propionil-KoA pertama kali dikarboksilasi untuk CoA-S bergerak
C C
membentuk stereoisomer D dari metilmalonil-KoA (Gbr.
O HAI HAI
17-11) oleh propionil-KoA karboksilase, yang mengandung
faktor co biotin. Dalam reaksi enzimatik ini, seperti dalam
L-Metilmalonil-CoA Suksinil-CoA
reaksi piruvat karboksilase (lihat Gambar 16-16), CO2 (atau
ion terhidrasinya, HCO3 ) diaktifkan dengan menempel pada GAMBAR 17–11 Oksidasi propionil-KoA yang dihasilkan oleh
biotin sebelum dipindahkan ke substrat, dalam hal ini gugus oksidasi asam lemak bilangan ganjil. Urutan melibatkan lasi
propionat. . Pembentukan karboksibiotin dalam jangka karboksi propionil-CoA menjadi D-methylmalonyl-CoA dan konversi
menengah membutuhkan energi, yang disediakan oleh yang terakhir menjadi suksinil-CoA. Konversi ini memerlukan
pembelahan ATP menjadi ADP dan Pi . D -methylmalonyl epimerisasi D- menjadi L-methylmalonyl-CoA, diikuti dengan reaksi
CoA yang terbentuk secara enzimatis diepimerisasi menjadi yang luar biasa di mana substituen pada posisi pertukaran atom
L stereoisomer oleh methylmalonyl-CoA epimerase (Gbr. 1). karbon yang berdekatan (lihat Kotak 17–2).
17–11). L -methylmalonyl-CoA kemudian mengalami
penataan ulang intramolekul untuk membentuk suksinil-KoA,
transfer lemak asil-CoA rantai panjang ke dalam mitokondria.
yang dapat memasuki siklus asam sitrat. Penataan ulang ini
Proses tiga langkah (carnitine shuttle) dimana kelompok asil
dikatalisis oleh methylmalonyl-CoA mutase, yang
lemak dibawa dari asil lemak sitosolik-KoA ke dalam matriks
membutuhkan koenzim 5-deoxyadenosyl cobalamin, atau
mitokondria (Gambar 17-6) membatasi laju oksidasi asam
koenzim B12, yang berasal dari vitamin B12 (cobalamin).
lemak dan merupakan poin regulasi yang penting. Begitu
Kotak 17-2 menjelaskan peran koenzim B12 dalam reaksi
gugus asil lemak memasuki mitokondria, gugus tersebut
pertukaran yang luar biasa ini.
terikat pada oksidasi menjadi asetil-KoA.
Oksidasi Asam Lemak Diatur dengan Ketat

Malonyl-CoA, zat antara pertama dalam biosintesis
Oksidasi asam lemak mengkonsumsi bahan bakar yang sitosolik dari asam lemak rantai panjang dari asetil-KoA (lihat
berharga, dan diatur agar terjadi hanya ketika kebutuhan Gambar 21-1), meningkat konsentrasinya setiap kali hewan
akan energi memerlukannya. Di hati, lemak asil-KoA yang disuplai dengan baik dengan karbohidrat; kelebihan glukosa
terbentuk di sitosol memiliki dua jalur utama yang terbuka yang tidak dapat dioksidasi atau disimpan sebagai glikogen
untuknya: (1) oksidasi oleh enzim di mitokondria atau (2) diubah dalam sitosol menjadi asam lemak untuk disimpan
konversi menjadi triasilgliserol dan fosfolipid oleh enzim di sebagai triasilgliserol. Penghambatan carnitine acyltrans
sitosol. Jalur yang diambil tergantung pada tingkat ferase I oleh malonyl-CoA memastikan oksidasi dari
asam lemak dihambat setiap kali hati disuplai dengan Frekuensi pembawa (individu dengan mutasi resesif pada
glukosa sebagai bahan bakar dan secara aktif membuat salah satu dari dua kromosom homolog) adalah sekitar 1
triasilgliserol dari kelebihan glukosa. dari 40, dan sekitar 1 dari 10.000 individu mengidap
penyakit ini—yaitu, memiliki dua salinan alel MCAD mutan
HAI
dan tidak dapat mengoksidasi lemak. asam dari 6 sampai
OOC CH2 C S-CoA 12 karbon. Penyakit ini ditandai dengan episode berulang
Malonil-CoA dari sindrom yang mencakup penumpukan lemak di hati,
Dua dari enzim oksidasi juga diatur oleh metabolit kadar asam oktanoat darah tinggi, glukosa darah rendah
yang menandakan kecukupan energi. (hipoglikemia), mengantuk, muntah, dan koma. Pola asam
Ketika rasio [NADH]/[NAD] tinggi, -hidroksiasil KoA organik dalam urin membantu diagnosis penyakit ini: urin
dehidrogenase dihambat; selain itu, konsentrasi asetil- umumnya mengandung asam dikarboksilat 6-karbon
KoA yang tinggi menghambat tiolase (Gbr. 17-12). hingga 10-karbon tingkat tinggi (dihasilkan oleh oksidasi)
dan tingkat badan keton urin yang rendah (kita membahas
oksidasi di bawah dan badan keton di Bagian 17.3).
Cacat Genetik pada Fatty Asyl-CoA Dehydrogenases
Menyebabkan Penyakit Serius
Meskipun individu mungkin tidak memiliki gejala di antara
episode-episode tersebut, episode-episode tersebut
Triasilgliserol yang disimpan biasanya merupakan sangat serius; kematian akibat penyakit ini adalah 25%
sumber energi utama untuk kontraksi otot, dan sampai 60% pada anak usia dini. Jika cacat genetik
ketidakmampuan untuk mengoksidasi asam lemak dari terdeteksi segera setelah lahir, bayi dapat dimulai dengan
triasilgliserol memiliki konsekuensi serius bagi kesehatan. diet rendah lemak dan tinggi karbohidrat. Dengan deteksi
Cacat genetik yang paling umum pada katabolisme asam dini dan pengaturan pola makan yang hati-hati—termasuk
lemak di populasi AS dan Eropa utara disebabkan oleh menghindari jarak waktu yang lama di antara waktu makan,
mutasi pada gen yang mengkode medium -chain acyl- untuk mencegah tubuh beralih ke cadangan lemaknya
CoA dehy drogenase (MCAD). Di antara orang Eropa utara, ituuntuk energi—prognosis untuk orang-orang ini baik.
Glukosa Glukosa
Karbohidrat diet darah tinggi darah rendah CoASH
Lemak asil-
1 Lemak karnitin
asil-CoA
Insulin P Glukagon karnitin
2 5 asil
Karnitin
transferase I
ACC
7
Tidak aktif 4
6 Lemak
fosfatase PKA Asil lemak– asil-CoA
karnitin
Pi ACC FADH
3
Glukosa Asetil–KoA Malonil-KoA 8b oksidasi
glikolisis,
kompleks NADH
multi langkah
piruvat
dehidrogenase
Asam lemak
Asetil-KoA
Sintesis Asam lemak

Mitokondria
asam lemak b oksidasi
GAMBAR 17–12 Regulasi terkoordinasi dari sintesis dan pemecahan (perantara pertama sintesis asam lemak), dan 4 malonyl-CoA in
asam lemak. Ketika diet menyediakan sumber karbohidrat siap pakai menghambat karnitin asiltransferase I, sehingga mencegah masuknya
sebagai bahan bakar, oksidasi asam lemak tidak diperlukan dan karena asam lemak ke dalam matriks mitokondria.
itu diatur ke bawah. Dua enzim adalah kunci koordinasi metabolisme Ketika kadar glukosa darah turun di antara waktu makan, 5 pelepasan
asam lemak: asetil-KoA karboksilase (ACC), enzim pertama dalam glukagon mengaktifkan cAMP-dependent protein kinase (PKA), yang 6
sintesis asam lemak (lihat Gambar 21–1 ), dan karnitin asil transferase I, phos phorylates dan menonaktifkan ACC. Konsentrasi malonyl-CoA
yang membatasi transpor asam lemak. asam ke dalam matriks mitokondria turun, penghambatan masuknya asam lemak ke dalam mitokondria
untuk oksidasi (lihat Gambar 17-6). Menelan makanan tinggi karbohidrat berkurang, dan 7 asam lemak memasuki matriks mitokondria dan 8
meningkatkan kadar glukosa darah dan dengan demikian memicu menjadi bahan bakar utama. Karena glukagon juga memicu mobilisasi
pelepasan sulin. 2 Protein fosfatase yang tergantung insulin asam lemak di jaringan adiposa, pasokan asam lemak mulai berdatangan
ke dalam darah.
mendefosforilasi ACC, mengaktifkannya. 3 ACC mengkatalisis pembentukan malonyl-CoA
Koenzim B12: Solusi Radikal untuk (A) H H HAI

H H HAI
koenzim B12
Masalah yang H CC C H CC C
Membingungkan Dalam reaksi mutase metilmalonil- H C HAI metilmalonil-CoA
C H HAI
mutase
KoA (lihat Gambar 17–11), gugus OCOOS-KoA pada
HAI S-CoA HAI S-CoA
C-2 dari posisi pertukaran propionat asli dengan atom
hidrogen pada C-3 propionat asli (Gbr. 1a). Koenzim L-Metilmalonil-CoA Suksinil-CoA
B12 adalah kofaktor untuk reaksi ini, karena untuk
(B) koenzim B12
hampir semua enzim yang mengkatalisasi reaksi jenis C C C C
umum ini (Gbr. 1b). Proses yang bergantung pada
H X HX
koenzim B12 ini adalah salah satu dari sedikit reaksi
enzimatik dalam biologi di mana terjadi pertukaran alkil GAMBAR 1
atau gugus alkil tersubstitusi (X) dengan atom hidrogen

pada karbon yang berdekatan, tanpa pencampuran grup syl (Gbr. 2). Ini adalah ikatan yang relatif lemah;
atom hidrogen yang ditransfer . dengan hidrogen energi disosiasi ikatannya sekitar 110 kJ/mol,
pelarut, H2O. Bagaimana atom hidrogen dapat bergerak dibandingkan dengan 348 kJ/mol untuk ikatan COC
di antara dua karbon tanpa bercampur dengan atom biasa atau 414 kJ/mol untuk ikatan COH. Hanya
hidrogen yang sangat berlebih dalam pelarut? menerangi senyawa dengan cahaya tampak sudah
Koenzim B12 adalah bentuk kofaktor vitamin B12, cukup untuk memutuskan ikatan CoOC ini. (Photolability
yang unik di antara semua vitamin karena tidak hanya ekstrim ini mungkin menjelaskan tidak adanya vitamin
mengandung molekul organik kompleks tetapi juga B12 pada tanaman.) Disosiasi menghasilkan radikal 5-deoxyadenosyl dan C
elemen penting, kobalt. Sistem cincin
H HAI
H
corrin kompleks vitamin B12 (berwarna biru
1 4
pada Gambar 2), yang dikoordinasikan oleh OH KE
kobalt (sebagai Co3) , secara kimia terkait 2 3
dengan sistem cincin porfirin dari protein 5-Deoksi H H
adenosin
heme dan heme (lihat Gambar 5–1) . Posisi NN
5
koordinasi kelima kobalt diisi oleh CH2 HAI
N
ribonukleotida dimetilbenzimidazol (diarsir N
C NH2
kuning), diikat secara kovalen oleh gugus 3- NH2
fosfatnya ke rantai samping cincin corrin, CH2 HAI
HAI
melalui aminoisopropanol. CH2 C
Pembentukan kofaktor kompleks ini terjadi H2N C H
CH3 CH2 NH2
pada salah satu dari hanya dua reaksi yang CH2 CH3
diketahui di mana trifosfat dibelah dari ATP CH3 HAI Sistem
(Gbr. 3); reaksi lainnya adalah pembentukan CH3 N C
H cincin Corrin
S-adenosilmetionin dari ATP dan metionin N H
Bersama
3 CH2 NH2
(lihat Gambar 18–18). CH2 N
HAI
CH3 H
Vitamin B12 seperti yang biasa diisolasi CH2 N
disebut cyanocobalamin, karena C
CH3
mengandung gugus siano (diambil selama NH2 H CH2
pemurnian) yang melekat pada kobalt pada CH3 CH3
CH2
posisi koordinasi keenam. Dalam 5- HAI
CH2
CH2 HAI C
deoxyadenosylcobalamin, kofaktor untuk
C NH
methylmalonyl-CoA mu tase, gugus siano
NH2
digantikan oleh gugus 5-deoksiadenosil CH2 Amino
(merah pada Gambar. 2), terikat secara kovalen melalui C-5 ke kobalt. isopropanol
CH3 N HC CH3
Struktur tiga dimensi dari faktor ko
HAI
ditentukan oleh Dorothy Crowfoot Hodgkin N
CH3
pada tahun 1956, menggunakan grafik Dimetil HAI SETELAH
kristal sinar-x. benzimidazol HAI

H HAI
ribonukleotida
Kunci untuk memahami bagaimana OH
koenzim B12 mengkatalisis pertukaran H CH2 OH
hidrogen terletak pada sifat ikatan kovalen
H H
antara kobalt dan C-5 dari deoksiadeno. GAMBAR 2
644
bentuk vitaminnya. Fungsi kimia radikal seperti produk, menghasilkan produk dan meregenerasi
5-de oxyadenosylcobalamin radikal bebas deoxyadenosyl. 5 Ikatan terbentuk kembali antara
adalah untuk menghasilkan kobalt dan gugus OCH2 dari radikal deoksiadenosil,
radikal bebas dengan cara ini, menghancurkan radikal bebas dan meregenerasi kofaktor dalam
sehingga memulai serangkaian bentuk Co3-nya, siap menjalani siklus katalitik lainnya. Dalam
transformasi seperti yang mekanisme yang didalilkan ini, atom hidrogen yang bermigrasi
diilustrasikan pada Gambar 4 — tidak pernah ada sebagai spesies bebas dan karenanya tidak
mekanisme yang dipostulasikan pernah bebas untuk bertukar dengan hidrogen dari molekul air
untuk reaksi yang dikatalisis oleh di sekitarnya.
methylmalonyl-CoA mutase dan Kekurangan vitamin B12 menyebabkan penyakit serius.
sejumlah koenzim lainnya. Vitamin ini tidak dibuat oleh tumbuhan atau hewan dan
Dorothy Crowfoot Hodgkin,
formasi trans yang bergantung hanya dapat disintesis oleh beberapa spesies mikroorganisme.
1910–1994 pada B12. Dibutuhkan oleh orang sehat hanya dalam jumlah kecil, sekitar
1 Enzim pertama-tama memutuskan ikatan CoOC dalam 3 g/hari. Anemia pernisiosa penyakit parah terjadi akibat
kofaktor, meninggalkan koenzim dalam bentuk Co2 dan kegagalan menyerap vitamin B12 secara efisien dari usus, di
menghasilkan radikal bebas 5-deoxyadenosyl. 2 Radikal ini mana ia disintesis oleh bakteri usus atau diperoleh dari
sekarang mengabstraksi atom hidrogen dari substrat, mengubah pencernaan daging. Individu dengan penyakit ini tidak
substrat menjadi radikal dan menghasilkan 5-deoxyadenosine. menghasilkan faktor intrinsik dalam jumlah yang cukup,
3 Penataan ulang radikal substrat menghasilkan radikal lain, di koprotein gli yang penting untuk penyerapan vitamin B12 .
mana kelompok migrasi X (OCOOS-CoA untuk methylmalonyl Patologi pada anemia pernisiosa meliputi penurunan produksi
CoA mutase) telah pindah ke karbon yang berdekatan untuk eritrosit, penurunan kadar hemoglobin, dan kerusakan sistem
membentuk radikal yang memiliki kerangka karbon dari produk saraf pusat yang parah dan progresif. Pemberian vitamin B12
akhirnya (straight empat karbon). rantai). Atom hidrogen yang dosis besar meringankan gejala ini setidaknya dalam beberapa
awalnya diabstraksikan dari substrat sekarang menjadi bagian kasus. ÿ
dari gugus OCH3 dari 5-deoxyadenosine. 4 Salah satu hidrogen
dari gugus OCH3 yang sama ini (bisa sama dengan yang
awalnya diabstraksikan) sekarang dikembalikan ke
Deoxyadenosine
Deoxyadenosine
HCH 5-Deoxyadenosyl
CH2 radikal bebas
Koenzim
B12 N N N N
H HAI
H
Co3 Co2
1 4 1
OH KE N N N N C C
2 3 H X
HAI HAI HAI
H H Substrat
2
NN CH2 PADA PADA PADA HAI
5
5
N HAI HAI HAI

N
ATP Deoxyadenosine
NH2 Bersama
Cobalamin Deoxyadenosine H CH CC
HCH 5-Deoksi H X
adenosil
N Substrat
HAI HAI HAI
N N radikal bebas N
radikal
HAI P PADA HAI P HAI Co2 Co2
HAI HAI HAI
N N N N
H HAI
H 3 radikal
4
penyusunan kembali
OH KE
Deoxyadenosine
H H
Koenzim B12 Produk seperti
NN C C H CHC C
CH2 radikal
X H H X
N
N Produk
Bersama
N N
NH2 Co2
GAMBAR 3 MEKANISME GAMBAR 4 N N
645
Lebih dari 20 cacat genetik manusia lainnya dalam Mitokondria Peroksisom/glioksisom

pengangkutan atau oksidasi asam lemak telah
didokumentasikan, yang paling jarang terjadi daripada cacat
pada MCAD. Salah satu gangguan yang paling parah HAI
R CH2 CH2 C
diakibatkan oleh hilangnya aktivitas rantai panjang S-CoA
-hidroksiasil-CoA dehidrogenase dari protein trifungsional,
TFP. Gangguan lain termasuk cacat pada atau subunit yang O2
Rantai
MODE MODE H2O2
mempengaruhi ketiga aktivitas TFP dan menyebabkan pernapasan

H2O FADH2 FADH2
O2
penyakit jantung yang serius dan otot rangka yang tidak normal. ÿ 1
ATP H2O 2O2
H
HAI
R C C C
Peroksisom Juga Melakukan Oksidasi S-CoA
H
Matriks mitokondria adalah tempat utama oksidasi asam
H2O H2O
lemak pada sel hewan, tetapi pada sel-sel tertentu bagian
lain juga mengandung enzim yang mampu mengoksidasi OH
HAI
asam lemak menjadi asetil-KoA, melalui jalur yang serupa, RC CH2 C

S-CoA
tetapi tidak identik dengan , yang ada di mitokondria. Pada H
sel tumbuhan, situs utama oksidasi bukanlah mitokondria
tetapi peroksisom. O2 NAD+ NAD+
Rantai NADH diekspor
Dalam peroksisom, organel sel hewan dan tumbuhan pernapasan untuk reoksidasi
H2O NADH NADH
yang diselimuti membran, intermediet untuk oksidasi asam
ATP HAI
lemak adalah turunan koenzim A, dan prosesnya terdiri dari HAI
R C CH2 C
empat langkah, seperti dalam oksidasi mitokondria (Gbr. 17– S-CoA
13): (1) dehidrogenasi , (2) penambahan air pada ikatan CoASH CoASH
rangkap yang dihasilkan, (3) oksidasi -hidroksiasil -KoA HAI
menjadi keton, dan (4) pembelahan tiolitik oleh koenzim A. R C

(Reaksi identik juga terjadi pada glioksisom, seperti dibahas S-CoA
di bawah. )
Siklus HAI
Satu perbedaan antara jalur peroxisomal dan mito asam Asetil-KoA

CH3 C
diekspor
sitrat S-CoA
chondrial adalah kimia pada langkah pertama.
Dalam peroksisom, flavoprotein asil-KoA oksidase yang
memperkenalkan ikatan rangkap melewati elektron langsung
ke O2, menghasilkan H2O2 (Gbr. 17–13). Oksidan yang
GAMBAR 17–13 Perbandingan oksidasi dalam mitokondria dan
kuat dan berpotensi merusak ini segera dipecah menjadi H2O
dalam peroksisom dan glioksisom. Sistem peroksisomal/glioksisomal
dan O2 oleh katalase. Ingatlah bahwa dalam mitokondria,
berbeda dari sistem mitokondria dalam dua hal: (1) pada langkah
elektron yang dilepaskan pada langkah oksidasi pertama
oksidatif pertama elektron langsung menuju O2, menghasilkan H2O2,
melewati rantai respirasi ke O2 untuk menghasilkan H2O,
dan (2) NADH yang terbentuk pada langkah oksidatif kedua tidak
dan proses ini disertai dengan sintesis ATP. Dalam
dapat dioksidasi ulang di peroksisom. atau glioksisom, sehingga
peroksisom, energi yang dilepaskan pada langkah oksidatif
ekuivalen pereduksi diekspor ke sitosol, akhirnya memasuki
pertama pemecahan asam lemak tidak disimpan sebagai mitokondria. Asetil KoA yang diproduksi oleh peroksisom dan glioksisom
ATP, tetapi hilang sebagai panas. juga diekspor; asetat dari glioksisom (organel yang hanya ditemukan
Perbedaan penting kedua antara mito chondrial dan pada biji berkecambah) berfungsi sebagai prekursor biosintetik (lihat
oksidasi peroxisomal pada mamalia adalah Gambar 17–14). Acetyl-CoA yang diproduksi di mitokondria selanjutnya dioksidasi dalam siklu
spesifisitas untuk fatty acyl-CoA; sistem peroksisom jauh
lebih aktif pada asam lemak rantai sangat panjang seperti
asam heksakosanoat (26:0) dan pada asam lemak rantai mengoksidasi asam lemak rantai sangat panjang, tampaknya
cabang seperti asam fitanat dan asam pristanat (lihat Gambar karena kurangnya transporter fungsional untuk asam lemak
17–17). Asam lemak yang kurang umum ini diperoleh dalam ini di membran peroksisom. Kedua cacat menyebabkan
makanan dari produk susu, lemak hewan ruminansia, daging, akumulasi dalam darah asam lemak rantai sangat panjang,
dan ikan. Katabolisme mereka di peroksisom melibatkan khususnya 26:0. XALD mempengaruhi anak laki-laki sebelum
beberapa enzim tambahan yang unik untuk organel ini. usia 10 tahun, menyebabkan kehilangan penglihatan,
Ketidakmampuan untuk mengoksidasi senyawa ini gangguan perilaku, dan kematian
bertanggung jawab atas beberapa penyakit manusia yang dalam beberapa tahun. ÿ Pada mamalia, konsentrasi
serius. Individu dengan sindrom Zellweger tidak dapat lemak yang tinggi dalam makanan menyebabkan peningkatan
membuat peroksisom dan karena itu kekurangan semua sintesis enzim oksidasi peroksi somal di hati. Peroksisom hati
metabolisme yang unik untuk organel tersebut. Pada X-linked tidak mengandung enzim siklus asam sitrat dan tidak dapat
adrenoleukodystrophy (XALD), peroksisom gagal mengkatalisis oksidasi asetil-KoA menjadi CO2. Alih-alih,
asam lemak rantai panjang atau bercabang dikatabolisme Biji triasilgliserol

menjadi produk rantai pendek, seperti hexanoyl-CoA, yang
lipase
diekspor ke mitokondria dan teroksidasi sempurna.
Asam lemak
Peroksisom Tumbuhan dan Glioksisom Menggunakan
oksidasi
Asetil-KoA dari Oksidasi sebagai Prekursor
Biosintetik Pada tanaman, oksidasi asam lemak tidak terjadi Asetil-KoA

terutama di mitokondria (seperti disebutkan sebelumnya)
siklus glioksilat
tetapi di peroksi beberapa jaringan daun dan di glioksisom
dari biji berkecambah. Peroksisom tanaman dan glioksisom Oksaloasetat
memiliki struktur dan fungsi yang serupa; glioksisom, yang
terjadi hanya pada benih berkecambah, dapat dianggap glukoneogenesis
sebagai peroksisom khusus. Peran biologis oksidasi dalam

Glukosa
organel ini adalah menggunakan lipid yang disimpan Sukrosa, Intermediet
terutama untuk menyediakan prekursor biosintetik, bukan energi. polisakarida metabolik
Selama perkecambahan biji, triasilgliserol yang disimpan
Asam amino Nukleotida
diubah menjadi glukosa, sukrosa, dan berbagai macam
metabolit esensial (Gbr. 17–14). Asam lemak yang dilepaskan Energi
dari triasilgliserol pertama-tama diaktifkan menjadi turunan
koenzim A dan dioksidasi dalam glioksisom melalui proses GAMBAR 17–14 Triasilgliserol sebagai sumber glukosa dalam biji. Oksidasi
adalah salah satu tahap dalam jalur yang mengubah triasilgliserol yang disimpan
empat langkah yang sama yang berlangsung dalam
menjadi glukosa dalam benih yang berkecambah. Untuk detail lebih lanjut, lihat Gambar 16–22.
peroksisom (Gbr. 17-13). Asetil-KoA yang dihasilkan diubah
melalui siklus glioksilat (lihat Gambar 16-20) menjadi
prekursor empat karbon untuk glukoneogenesis (lihat
- asam lemak (D-3-hidroksiasil-CoA epimerase dan 3 ,2
Gambar 14-18). Gly oxysomes, seperti peroksisom,
enoyl-CoA isomerase); enzim keempat, tiolase, adalah
mengandung konsentrasi katalase yang tinggi, yang
polipeptida
mengubah H2O2 yang dihasilkan oleh oksidasi menjadi H2O dan O2. larut yang terpisah.
Sangat menarik bahwa enzim yang mengkatalis pada
dasarnya pembalikan oksidasi dalam sintesis asam lemak
Enzim -Oksidasi dari Organel yang Berbeda Telah
juga diatur secara berbeda pada prokariota dan eukariota;
Berbeda Selama Evolusi pada bakteri, ketujuh enzim yang dibutuhkan untuk sintesis
Meskipun reaksi -oksidasi dalam mitokondria pada dasarnya asam lemak adalah polipeptida yang terpisah, tetapi pada
sama dengan yang terjadi pada peroksisom dan glisom mamalia, ketujuh aktivitas tersebut merupakan bagian dari
oksisom, enzim (isozim) berbeda secara signifikan antara satu rantai polipeptida besar (lihat Gambar 21–7). Salah satu
kedua jenis organel. Perbedaan tersebut tampaknya keuntungan sel memiliki beberapa enzim dari jalur yang
mencerminkan divergensi evolusioner yang terjadi sangat sama yang dikodekan dalam rantai polipeptida tunggal
awal, dengan pemisahan bakteri gram positif dan gram adalah bahwa ini memecahkan masalah pengaturan sintesis
negatif (lihat Gambar 1–6). enzim yang harus berinteraksi secara fungsional; regulasi
Dalam mitokondria, empat enzim oksidasi yang bekerja ekspresi satu gen memastikan produksi jumlah situs aktif
pada asil-KoA lemak rantai pendek terpisah, protein larut yang sama untuk semua enzim di jalur. Ketika setiap
(seperti disebutkan sebelumnya), serupa strukturnya dengan aktivitas enzim berada pada polipeptida yang terpisah,
enzim analog dari bakteri gram positif (Gbr. 17–15a). Bakteri beberapa mekanisme diperlukan untuk mengoordinasikan
gram negatif memiliki empat aktivitas dalam tiga subunit sintesis semua produk gen. Kerugian memiliki beberapa
yang dapat larut (Gbr. 17-15b), dan sistem enzim telinga aktivitas pada polipeptida yang sama adalah bahwa semakin
eukary yang bekerja pada asam lemak rantai panjang— panjang rantai polipeptida, semakin besar kemungkinan
protein trifungsional, TFP—memiliki tiga aktivitas enzim kesalahan dalam sintesisnya: satu asam amino yang salah
dalam dua subunit yang terkait dengan membran (Gbr. 17– dalam rantai dapat membuat semua aktivitas enzim dalam
15c). Enzim -oksidasi dari peroksisom tanaman dan rantai itu menjadi tidak berguna . . Perbandingan struktur
glioksisom, bagaimanapun, membentuk kompleks protein, gen untuk protein ini pada banyak spesies dapat menjelaskan
salah satunya mengandung empat aktivitas enzimatik dalam alasan pemilihan satu atau strategi lain dalam evolusi.
rantai polipeptida tunggal (Gbr. 17–15d). Enzim pertama,
asil-KoA oksidase, adalah rantai polipeptida tunggal; protein Oksidasi Asam Lemak Terjadi
multifungsional (MFP) mengandung aktivitas enzim kedua
dan ketiga (enoyl-CoA hydratase dan hydroxyacyl-CoA
di Retikulum Endoplasma
dehydrogenase) serta dua aktivitas tambahan yang Meskipun oksidasi mitokondria, di mana enzim bekerja pada
diperlukan untuk oksidasi tak jenuh. ujung karboksil asam lemak, adalah yang paling banyak
(a) Bakteri gram positif dan sistem spesifik rantai (b) Bakteri gram negatif
pendek mitokondria
Substrat
Enz1
Intermediat Substrat
Produk
Produk
Enz1
Enz2
Enz4 Enz4 Enz2
Intermediat
Enz3
Intermediat
Enz3
( c ) Sistem spesifik rantai ( D ) Sistem tumbuhan peroksisomal

mitokondria yang sangat panjang dan glioksisomal
Substrat
Substrat
Produk Enz1
Enz1
Matriks
Enz2
Enz3 MFP
Enz4 Enz2
Produk
Enz4
Enz6
Enz3
Enz5
Membran dalam
GAMBAR 17–15 Enzim oksidasi. Ditampilkan di sini adalah struktur aktivitas berada dalam tiga polipeptida; enzim 2 dan 3 adalah bagian
subunit yang berbeda dari enzim oksidasi pada bakteri gram positif dari rantai polipeptida tunggal. (c) Sistem mitokondria dengan rantai
dan gram negatif, mitokondria, dan peroksisom tanaman dan sangat panjang juga terdiri dari tiga polipeptida, salah satunya
glioksisom. Enz1 adalah asil-CoA dehidrogenase; Enz2, enoyl-CoA mencakup aktivitas enzim 2 dan 3; dalam hal ini, sistem terikat pada
hy dratase; Enz3, L--hidroksiasil-CoA dehidrogenase; Enz4, tiolase; membran mitokondria bagian dalam. (d) Dalam sistem oksidasi
iso Enz5, D-3-hydroxyacyl-CoA epimerase, dan 3 ,2 -enoyl-CoA peroksisomal dan glioksisomal tanaman, enzim 1 dan 4 adalah
Enz6, merase. (a) Empat enzim oksidasi pada bakteri gram positif polipeptida yang terpisah, tetapi enzim 2 dan 3, serta dua enzim
adalah entitas yang terpisah dan dapat larut, seperti halnya sistem tambahan, merupakan bagian dari rantai polipeptida tunggal, protein
multifungsi, MFP.
mitokondria spesifik rantai pendek. (b) Pada bakteri gram negatif, empat enzim
Nasib katabolik penting untuk asam lemak dalam sel Langkah pertama memasukkan gugus hidroksil ke
hewan, ada jalur lain pada beberapa spesies, termasuk karbon (Gbr. 17–16). Oksigen untuk golongan ini
vertebrata, yang melibatkan oksidasi karbon (omega)— berasal dari molekul oksigen (O2) dalam reaksi kompleks
karbon yang paling jauh dari gugus karboksil. yang melibatkan sitokrom P450 dan donor elektron
Enzim unik untuk oksidasi terletak (pada vertebrata) di NADPH. Reaksi jenis ini dikatalisis oleh oksidase
retikulum endoplasma hati dan ginjal, dan substrat yang fungsi campuran, dijelaskan dalam Kotak 21-1. Dua
disukai adalah asam lemak dari 10 atau 12 atom karbon. enzim lagi sekarang bekerja pada karbon: alkohol
Pada mamalia, oksidasi biasanya merupakan jalur kecil dehidro genase mengoksidasi gugus hidroksil menjadi
untuk degradasi asam lemak, tetapi ketika oksidasi rusak aldehida, dan aldehida dehidrogenase mengoksidasi
(karena mutasi atau defisiensi karnitin, misalnya) menjadi gugus aldehida menjadi asam karboksilat, menghasilkan
lebih penting. asam lemak dengan gugus karboksil di setiap ujungnya.
Pada titik ini, salah satu ujung dapat melekat pada koenzim A, dan moleku
HAI
COOH
CH3 (CH2)10 C Asam fitanat
HAI
ATP, KoA-SH
sintetase
NADPH, O2
oksidase fungsi fitanoil-CoA AMP, PPi
campuran
NADP
HAI
CO S-CoA
H2O CH2 (CH2)10 C Phytanoil-CoA
HAI
-Ketoglutarat, Askorbat
fitanoyl-CoA Fe2
MEREKA
alkohol hidroksilase CO2 , Suksinat
dehidrogenase
NADH
HAI HAI CO S-CoA

-Hydroxyphytanoyl
C (CH2)10 C Dengan
OH
H HAI
MEREKA
aldehida
dehidrogenase
NADH -hidroksifitanoil
CoA lyase Formil-CoA Asam format
HAI HAI
CO2
C (CH2)10 C HAI
HAI HAI Pristanal

C
H
oksidasi
HAI HAI HAI HAI

NAD(P)
C (CH2)2 C C (CH2)4 C aldehida
HAI HAI HAI HAI dehidrogenase NAD(P)H
Suksinat Adipat (asam adipat)
Asam pristanat
GAMBAR 17–16 Oksidasi asam lemak di retikulum endoplasma. COOH
Alternatif oksidasi ini dimulai dengan oksidasi karbon yang paling jauh dari
karbon—karbon (omega). Substrat biasanya berupa asam lemak rantai
sedang; ditunjukkan di sini adalah asam laurat (laurat). Jalur ini umumnya
oksidasi
bukan jalur utama untuk katabolisme oksidatif asam lemak.
HAI
C 4,8,12-Trimethyltri
decanoyl-CoA
S-CoA
ter mitokondria dan mengalami oksidasi dengan rute
normal. Pada setiap lintasan melalui jalur -oksidasi,
asam lemak “ujung ganda” menghasilkan asam dikar-
boksilat seperti asam suksinat, yang dapat memasuki HAI
siklus asam sitrat, dan asam adipat (Gbr. 17–16). CH 3CH2 C Propionil-CoA
S-CoA
Asam Phytanic Mengalami Oksidasi di Peroksisom
GAMBAR 17–17 Oksidasi asam lemak rantai cabang (asam phy
Kehadiran gugus metil pada karbon asam lemak
tanic) dalam peroksisom. Asam fitanat memiliki karbon tersubstitusi
membuat oksidasi menjadi tidak mungkin, dan metil dan karenanya tidak dapat mengalami oksidasi. Tindakan gabungan
asam lemak bercabang ini dikatabolisme dalam peroksi dari enzim yang ditunjukkan di sini menghilangkan karbon karboksil asam
beberapa sel hewan melalui oksidasi. Dalam oksidasi fitanat, untuk menghasilkan asam pristanat, di mana karbon tidak
asam phytanic, misalnya (Gbr. 17-17), phytanoyl CoA tersubstitusi, memungkinkan terjadinya oksidasi. Perhatikan bahwa
dihidroksilasi pada karbonnya, dalam reaksi yang oksidasi asam pristanat melepaskan propionil-KoA, bukan asetil-KoA. Ini
melibatkan molekul oksigen; dekarboksilasi untuk selanjutnya dikatabolisme seperti pada Gambar 17-11. (Rincian reaksi
membentuk aldehida satu karbon lebih pendek; kemudian dioksidasi menjadi pristanal tetap kontroversial.)
yang menghasilkan
asam karboksilat yang sesuai, yang sekarang tidak memiliki berspesialisasi dalam oksidasi asam lemak rantai
substituen pada karbon dan dapat dioksidasi lebih lanjut dengan sangat panjang dan asam lemak bercabang.
oksidasi. Penyakit Refsum, akibat cacat genetik pada Dalam glioksisom, dalam benih yang berkecambah,
hidroksilase fitanoyl-CoA, menyebabkan kadar asam fitanat oksidasi merupakan salah satu langkah dalam
dalam darah sangat tinggi dan masalah neurologis yang parah konversi lipid yang disimpan menjadi berbagai zat
termasuk kebutaan dan tuli. ÿ antara dan produk. ÿ Reaksi oksidasi, yang terjadi di
retikulum endoplasma, menghasilkan intermediet
RINGKASAN 17.2 Oksidasi Asam Lemak asil lemak dikarboksilat, yang dapat mengalami
oksidasi di kedua ujungnya untuk
ÿ Pada tahap pertama oksidasi, empat reaksi menghasilkan asam dikarboksilat pendek seperti suksinat.
menghilangkan setiap unit asetil-KoA dari ujung
karboksil asil-KoA lemak jenuh: (1)
dehidrogenasi atom dan karbon (C-2 dan C-3) oleh 17.3 Badan Keton
asil terkait-FAD -CoA dehydrogenases, (2)
hidrasi dari ikatan rangkap trans-2 yang dihasilkan Pada manusia dan sebagian besar mamalia lainnya, asetil-KoA
oleh enoyl-CoA hydratase, (3) dehidrogenasi dari L-- yang terbentuk di hati selama oksidasi asam lemak dapat
hydroxyacyl-CoA yang dihasilkan oleh memasuki siklus asam sitrat (tahap 2 dari Gambar 17-7) atau
NAD-linked - hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, di bawah konversi menjadi "badan keton", aseton , ace
dan (4) CoA -memerlukan pembelahan toacetate, dan D--hydroxybutyrate, untuk diekspor ke jaringan
lain. (Istilah "tubuh" adalah artefak sejarah; istilah ini kadang-
-ketoasil-KoA yang dihasilkan oleh tiolase, untuk
membentuk asetil-KoA dan lemak asil-KoA yang kadang diterapkan pada partikel yang tidak larut, tetapi senyawa
disingkat oleh dua karbon. Lemak asil-CoA ini cukup larut dalam darah dan urin.) Aseton, diproduksi dalam
yang dipersingkat kemudian masuk kembali ke jumlah yang lebih kecil daripada badan keton lainnya,
dihembuskan. Acetoacetate dan D--hydroxybutyrate diangkut
urutan. ÿ Pada tahap
oleh darah ke jaringan selain hati (jaringan ekstrahepatik), di
kedua oksidasi asam lemak, asetil-KoA dioksidasi menjadi mana mereka diubah menjadi asetil-KoA dan dioksidasi dalam
CO2 dalam siklus asam sitrat. Sebagian besar dari siklus asam sitrat, menyediakan banyak energi yang dibutuhkan
hasil teoretis energi bebas dari oksidasi asam lemak oleh jaringan seperti tulang. dan otot jantung dan korteks ginjal.
diperoleh kembali sebagai ATP melalui fosforilasi Otak, yang secara khusus menggunakan glukosa sebagai
oksidatif, tahap akhir dari jalur oksidatif. ÿ Malonyl-CoA, bahan bakar, dapat beradaptasi dengan penggunaan
perantara awal lemak asetoasetat atau D-hidroksibutirat dalam kondisi kelaparan,
saat glukosa tidak tersedia. Produksi dan ekspor badan nada
sintesis asam, menghambat karnitin asiltransferase I, ke dari hati ke jaringan ekstrahepatik memungkinkan oksidasi
mencegah masuknya asam lemak ke dalam mitokondria. lanjutan asam lemak di hati ketika asetil-KoA tidak teroksidasi
Ini menghalangi pemecahan asam lemak dalam siklus asam sitrat.
saat sintesis terjadi. ÿ
Cacat genetik pada asil-KoA dehidrogenase rantai
CH3 OC CH3
HAI
menengah mengakibatkan penyakit manusia yang B
HAI
serius, seperti halnya mutasi pada komponen lain
dari sistem -oksidasi. Aseton
ÿ Oksidasi asam lemak tak jenuh membutuhkan dua HAI

J
enzim tambahan: enoyl-CoA isomerase dan 2,4- CH3OC DAN2 HAI
C
B
G
dienoyl-CoA reduktase. Asam lemak bilangan ganjil HAI
HAI
dioksidasi oleh jalur -oksidasi untuk menghasilkan Acetoacetate

asetil-KoA dan molekul propionil-KoA. Ini
dikarboksilasi menjadi metilmalonil-KoA, yang OH HAI
A
J
diisomerisasi menjadi suksinil-KoA dalam reaksi CH3OC DAN2 HAI
C
G
yang dikatalisis oleh metilmalonil-KoA mutase, A
HAI
H
enzim yang membutuhkan koenzim B12. ÿ
D--Hidroksibutirat
Peroksisom tumbuhan dan
hewan, dan Badan Keton, Dibentuk di Hati, Diekspor ke Organ
glioksisom tanaman, melakukan oksidasi dalam empat
Lain sebagai Bahan Bakar
langkah yang mirip dengan jalur mitokondria pada
hewan. Namun, langkah oksidasi pertama Langkah pertama dalam pembentukan asetoasetat, terjadi di
mentransfer elektron langsung ke O2, hati (Gbr. 17–18), adalah kondensasi enzimatik dari dua molekul
menghasilkan H2O2. Peroksisom jaringan hewan asetil-KoA, dikatalisis oleh tiolase;
17.3 Badan Keton 651
HAI HAI D stereoisomer; ia tidak bekerja pada L--hidroksiasil-KoA

J J
CH3OCG CH3OCG dan jangan dikacaukan dengan L--hidroksiasil-KoA
S-CoA S-CoA dehidrogenase dari jalur -oksidasi.
2 Asetil-KoA Pada orang sehat, aseton terbentuk dalam jumlah
yang sangat kecil dari asetoasetat, yang mudah
tiolase terkarboksilasi, baik secara spontan maupun melalui aksi
CoA-SH
asetoasetat dekarboksilase ( Gbr. 17-18). Karena individu
HAI
HAI dengan diabetes yang tidak diobati menghasilkan
B J
CH3
HAI
C Dan CH2 C asetoasetat dalam jumlah besar, darah mereka mengandung

G aseton dalam jumlah yang signifikan, yang beracun. Aseton
S-CoA
Acetoacetyl-CoA
mudah menguap dan menimbulkan bau khas pada napas,
yang terkadang berguna dalam mendiagnosis diabetes. ÿ
sintase Asetil-KoA H2O
Pada jaringan ekstrahepatik, D--hidroksibutirat
HMG-CoA
CoA-SH dioksidasi menjadi asetoasetat oleh D--hidroksibutirat
dehy drogenase (Gbr. 17–19). Acetoacetate diaktifkan
OH
HAI
M A
J
HAI
menjadi ester koenzim A melalui transfer CoA dari succinyl-
C OCH2O COCH2
HAI
C CoA, zat antara siklus asam sitrat (lihat Gambar 16-7),

D G
S-CoA dalam reaksi yang dikatalisis oleh -ketoacyl-CoA
A
HAI
CH3
-Hidroksi- -metilglutaril-KoA
transferase . Acetoacetyl-CoA kemudian dibelah oleh
(HMG-CoA) tiolase untuk menghasilkan dua asetil-CoA, yang memasuki
siklus asam sitrat. Dengan demikian badan keton digunakan sebagai bah
liase HMG-
Produksi dan ekspor badan keton oleh hati
CoA
Asetil-KoA memungkinkan oksidasi lanjutan dari asam lemak dengan
HAI
hanya sedikit oksidasi asetil-KoA. Ketika perantara dari
HAI
M B siklus asam sitrat sedang disedot untuk glukosa
D
C HAI
CH2OC HAI
CH3
HAI
Acetoacetate OH HAI
CH3 C CH2 C D--Hidroksibutirat

D--hidroksibutirat
asetoasetat NADH H HAI
dehidrogenase
dekarboksilase H
MEREKA
CO2 D--hidroksibutirat
MEREKA
dehidrogenase
NADH H
HAI
HAI
OH
B M A
HAI
CH3OCOCCH3 C HAI
CH2
HAI
CH HAI
CH3 HAI
D
HAI CH3 C CH2 C Acetoacetate
Aseton D- -Hidroksibutirat HAI
Suksinil-CoA
GAMBAR 17–18 Pembentukan badan keton dari asetil-KoA. -ketoasil-CoA
transferase
Individu yang sehat dan bergizi baik menghasilkan badan keton Suksinat
dengan laju yang relatif rendah. Ketika asetil-KoA terakumulasi
HAI
(seperti pada kelaparan atau diabetes yang tidak diobati, misalnya), HAI
tiolase mengkatalisis kondensasi dua molekul asetil-KoA menjadi CH3 C CH2 C Acetoacetyl-CoA
asetoasetil-KoA, senyawa induk dari tiga badan keton. Reaksi S-CoA
pembentukan badan keton terjadi pada matriks mitokondria hati.
CoA-SH
Senyawa enam karbon -hidroksi-metilglutaril-CoA (HMG-CoA) juga tiolase
merupakan perantara biosintesis sterol, tetapi enzim yang membentuk
HMG-CoA di jalur itu adalah sitosolik. HMG-CoA lyase hanya ada di HAI HAI
matriks mitochondrial.
CH3 C CH3 C
S-CoA S-CoA
ini hanyalah pembalikan langkah terakhir oksidasi. 2 Asetil-KoA

Acetoacetyl-CoA kemudian mengembun dengan asetil-KoA GAMBAR 17–19 D--Hidroksibutirat sebagai bahan bakar. D--Hydroxybutyrate,
untuk membentuk -hidroksi-metilglutaril-KoA (HMG- disintesis di hati, masuk ke dalam darah dan dengan demikian ke jaringan lain,
CoA), yang dibelah menjadi asetoasetat bebas dan asetil-KoA. di mana ia diubah dalam tiga langkah menjadi asetil-KoA. Ini pertama-tama
Asetoasetat secara reversibel direduksi oleh D--hidroksi dioksidasi menjadi asetoasetat, yang diaktifkan dengan koenzim A yang
butirat dehidrogenase, suatu enzim mitokondria, menjadi disumbangkan dari suksinil-KoA, kemudian dipecah oleh tiolase. Asetil-KoA
D--hidroksibutirat. Enzim ini khusus untuk yang terbentuk digunakan untuk produksi energi.
sintesis oleh glukoneogenesis, misalnya, oksidasi intermediet siklus

melambat—dan begitu pula oksidasi asetil-KoA. Selain itu, hati hanya
Tetesan lipid
mengandung koenzim A dalam jumlah terbatas, dan ketika sebagian
besar terikat dalam asetil KoA, oksidasi melambat karena kekurangan
koenzim bebas. Hepatosit
Produksi dan ekspor badan keton bebas coen zyme A, memungkinkan asetoasetat,
oksidasi asam lemak lanjutan. D- -hidroksibutirat,
aseton asetoasetat dan
D--hidroksibutirat diekspor
Badan Keton Diproduksi Secara Berlebihan pada pembentukan sebagai sumber energi
Dengan
badan keton untuk jantung, otot
Diabetes dan Selama Kelaparan rangka, ginjal, dan
otak
Kelaparan dan diabetes mellitus yang tidak diobati menyebabkan
Asam
kelebihan produksi badan keton, dengan beberapa masalah lemak Asetil-KoA
medis yang terkait. Selama kelaparan, neogenesis gluko menghabiskan oksidasi
perantara siklus asam sitrat, mengalihkan asetil-KoA menjadi produksi Siklus asam sitrat
badan keton (Gbr. 1).

oksaloasetat
17–20). Pada diabetes yang tidak diobati, ketika kadar insulin tidak
glukoneogenesis
mencukupi, jaringan ekstrahepatik tidak dapat mengambil glukosa secara
Glukosa diekspor
efisien dari darah, baik untuk bahan bakar atau untuk diubah menjadi Glukosa sebagai bahan bakar
lemak. Dalam kondisi ini, kadar malonil KoA (bahan awal untuk sintesis untuk otak dan jaringan lain
asam lemak) turun, penghambatan karnitin asiltransferase I berkurang,

dan asam lemak memasuki mitokondria untuk didegradasi menjadi asetil
KoA—yang tidak dapat melewati siklus asam sitrat karena intermediet
siklus telah ditarik untuk digunakan sebagai substrat dalam
glukoneogenesis. Akumulasi asetil-KoA yang dihasilkan mempercepat
GAMBAR 17–20 Pembentukan dan pengeluaran badan keton dari hati.
pembentukan badan nada ke luar kapasitas jaringan ekstrahepatik untuk
Kondisi yang memicu glukoneogenesis (diabetes yang tidak diobati, asupan
mengoksidasi mereka. Peningkatan kadar acetoac etate dan D--
makanan yang sangat berkurang) memperlambat siklus asam sitrat (dengan
hydroxybutyrate dalam darah menurunkan pH darah, menyebabkan
menarik ox aloacetate) dan meningkatkan konversi asetil-KoA menjadi asetoasetat.
kondisi yang dikenal sebagai asidosis. Asidosis ekstrim dapat
Koenzim A yang dilepaskan memungkinkan oksidasi asam lemak yang berkelanjutan.
menyebabkan koma dan dalam beberapa kasus kematian.
Badan keton dalam darah dan urin penderita diabetes yang tidak diobati RINGKASAN 17.3 Badan Keton
dapat mencapai tingkat yang luar biasa—konsentrasi darah 90 mg/100
ÿ Badan keton—aseton, asetoasetat, dan D—hidroksibutirat—
mL (dibandingkan dengan tingkat normal 3 mg/100 mL) dan ekskresi urin
5.000 mg/24 jam (dibandingkan dengan kecepatan normal 125 mg/24 dibentuk di hati.
jam). Kondisi ini disebut ketosis. Dua senyawa terakhir berfungsi sebagai molekul
bahan bakar dalam jaringan ekstrahepatik, melalui
Individu dengan diet sangat rendah kalori, menggunakan lemak oksidasi menjadi asetil-KoA dan masuk ke dalam siklus
yang disimpan dalam jaringan adiposa sebagai sumber energi utama asam sitrat. ÿ
mereka, juga mengalami peningkatan kadar badan keton dalam darah Kelebihan produksi badan keton di
dan urin mereka. Kadar tersebut harus dipantau untuk menghindari diabetes yang tidak terkontrol atau asupan kalori yang
bahaya asidosis dan ketosis (ketoasidosis). ÿ sangat berkurang dapat menyebabkan asidosis atau ketosis.
Istilah Kunci
Istilah yang dicetak tebal didefinisikan dalam glosarium.

oksidasi XXX pesawat ulang-alik karnitin XXX metilmalonil-CoA protein multifungsi
kilomikron XXX karnitin asiltransferase mutase XXX (MFP) XXX
apolipoprotein XXX saya XXX koenzim B12 XXX oksidasi XXX
lipoprotein XXX transporter asil-karnitin/ anemia pernisiosa XXX fungsi campuran
perilipin XXX karnitin XXX karnitin faktor intrinsik XXX oksidase XXX
hormon-sensitif asiltransferase malonil-CoA XXX oksidasi XXX
lipase XXX II XXX rantai menengah asil- asidosis XXX
asam lemak bebas protein trifungsional KoA dehidrogenase ketosis XXX
XXX albumin serum XXX (TFP) XXX (MCAD) XXX
Bab 17 Masalah 653
Bacaan lebih lanjut

Jenderal metabolisme dan manajemen nutrisinya. Tahun. Pendeta Nutr. 18, 179–
Boyer, PD (1983) Enzim, edisi ke-3, Vol. 16: Enzim Lipid, Academic 206.
Press, Inc., San Diego, CA. Kerner, J. & Hoppel, C. (2000) Impor asam lemak ke mitokondria dria.
Ferry, G. (1998) Dorothy Hodgkin: A Life, Cold Spring Harbor Laboratory Biochim. Biofisika. Acta 1486, 1–17.
Press, Cold Spring Harbor, NY. Kunau, WH, Dommes, V., & Schulz, H. (1995) -Oksidasi asam lemak
Biografi yang menarik dari seorang wanita yang luar biasa. dalam mitokondria, peroksisom, dan bakteri: satu abad kemajuan yang
Gurr, MI, Harwood, JL, & Frayn; KN (2002) Lipid Biochem istry: An berkelanjutan. Prog. Res Lipid. 34, 267–342.
Introduction, edisi ke-5, Blackwell Science, Oxford, UK. Catatan sejarah yang bagus dan perbandingan oksidasi yang berguna
dalam sistem yang berbeda.
Langin, D., Holm, C., & Lafontan, M. (1996) Lipase sensitif hormon
adiposit: pengatur utama metabolisme lipid. Rinaldo, P., Matern, D., & Bennett, MJ (2002) Gangguan oksidasi
Proses Nutr. Soc. 55, 93–109. asam lemak. Tahun. Pendeta Physiol. 64, 477–502.
Tinjauan lanjutan cacat metabolik pada oksidasi lemak, termasuk mutasi
Ramsay, TG (1996) Sel lemak. Endokrinol. Metab. Klinik. N.Am. 25, 847– MCAD.
870.
Tinjauan semua aspek penyimpanan dan mobilisasi lemak dalam Sherratt, HS (1994) Pendahuluan: pengaturan oksidasi asam lemak
adiposit. dalam sel. Biokimia. Soc. Trans. 22, 421–422.
Pengantar ulasan (dalam edisi jurnal ini) dari berbagai aspek oksidasi
Scheffler, IE (1999) Mitokondria, Wiley-Liss, New York.
asam lemak dan pengaturannya.
Buku yang sangat bagus tentang struktur dan fungsi mitokondria.
Thorpe, C. & Kim, JJ (1995) Struktur dan mekanisme aksi
Wang, CS, Hartsuck, J., & McConathy, WJ (1992) Struktur dan sifat
dehidrogenase asil-CoA. FASEB J.9 , 718–725.
fungsional lipoprotein lipase. Biochim. Biofisika.
Deskripsi singkat dan jelas tentang struktur tiga dimensi dan mekanisme
Acta 1123, 1–17.
katalitik enzim ini.
Pembahasan tingkat lanjut tentang enzim yang melepaskan asam
lemak dari lipoprotein dalam kapiler otot dan jaringan adiposa. Oksidasi Peroxisomal Graham,
IA & Eastmond, PJ (2002) Jalur katabolisme asam lemak rantai lurus dan
bercabang pada tanaman tingkat tinggi. Prog. Res Lipid. 41, 156–181.
Oksidasi mitokondria Bannerjee,
R. (1997) The yin-yang biokimia kobalamin.
kimia Biol. 4, 175–186. Hashimoto, T. (1996) Oksidasi peroksisom : enzim dan biologi molekuler.
Tinjauan biokimia reaksi koenzim B12 , termasuk reaksi mutase Ann. NY Acad. Sains. 804, 86–98.
metilmalonil-CoA. Mannaerts, GP & van Veldhoven, PP (1996) Fungsi dan organisasi
Eaton, S., Bartlett, K., & Pourfarzam, M. (1996) Oksidasi mitokondria oksidasi peroxisomal . Ann. NY Acad. Sains. 804 , 99–115 .
mamalia. Biokimia. J. 320, 345–357.
Tinjauan enzim oksidasi, cacat bawaan pada jalur ini, dan pengaturan Mengembara, RJA, van Grunsven, EG, & Jansen, GA (2000)
proses dalam mitokondria. Metabolisme lipid dalam peroksisom: enzim, fungsi, dan fungsi disfungsi
Eaton, S., Bursby, T., Middleton, B., Pourfarzam, M., Mills, K., Johnson, sistem asam lemak - dan -oksidasi pada manusia.
AW, & Bartlett, K. ( 2000) Protein trifungsional mitokondria: pusat Biokimia. Soc. Trans. 28, 141–148.
metabolisme -oksidasi? Biokimia. Badan Keton

Soc. Trans. 28, 177–182.
Foster, DW & McGarry, JD (1983) Gangguan metabolisme dan
Tinjauan singkat, tingkat menengah.
pengobatan ketoasidosis diabetik. N.Engl. J.Med. 309, 159–169.
Harwood, JL (1988) Metabolisme asam lemak. Tahun. Pdt Physiol
Tumbuhan. Tanam Mol. Biol. 39, 101–138.
McGarry, JD & Foster, DW (1980) Regulasi oksidasi asam lemak hati dan
Jeukendrup, AE, Saris, WH, & Wagenmakers, AJ (1998) produksi badan keton. Tahun. Pendeta Biokimia. 49, 395–420.
Metabolisme lemak saat berolahraga: review. Bagian III: efek intervensi
gizi. Int. J. Olahraga Med. 19, 371–379.
Robinson, AM & Williamson, DH (1980) Peran fisiologis badan keton
Tulisan ini merupakan salah satu rangkaian yang mengulas faktor-faktor yang
sebagai substrat dan sinyal dalam jaringan mamalia.
mempengaruhi mobilisasi dan pemanfaatan lemak selama latihan.
Fisik. Wahyu 60, 143–187.
Kerner, J. & Hoppel, C. (1998) Gangguan genetik karnitin
Masalah
1. Energi dalam Triasilgliserol Berdasarkan per-karbon, di 2. Cadangan Bahan Bakar di Jaringan Adiposa Triasilgliserol,
manakah jumlah terbesar energi yang tersedia secara biologis dengan asam lemak mirip hidrokarbonnya, memiliki kandungan
dalam triasilgliserol berada: dalam bagian asam lemak atau bagian energi tertinggi dari nutrisi utama. (a)
gliserol? Tunjukkan bagaimana pengetahuan tentang struktur kimia Jika 15% massa tubuh orang dewasa dengan berat 70,0 kg
triasilgliserol memberikan jawabannya. terdiri dari triasilgliserol, berapa total cadangan bahan bakar yang tersedia, dalam
baik kilojoule dan kilokalori, dalam bentuk triacylglycerols? Ingat Jumlah berbagai jalur penghasil ATP adalah Vmax enzim tertentu dari
bahwa 1,00 kkal 4,18 kJ. (b) Jika kebutuhan jalur ini. Nilai Vmax beberapa enzim dari otot dada (otot dada yang
energi basal kira-kira 8.400 kJ/hari (2.000 kkal/hari), berapa lama digunakan untuk terbang) merpati dan burung pegar tercantum di
orang tersebut dapat bertahan hidup jika oksidasi asam lemak yang bawah ini.
disimpan sebagai triasilgliserol merupakan satu-satunya sumber
energi? (c) Berapa penurunan berat
Vmax (substrat mol/mnt/g jaringan)
badan dalam pound per hari
dalam kondisi kelaparan seperti itu (1 lb 0,454 kg)? Enzim Merpati Pegar
3. Langkah Reaksi Umum dalam Siklus Oksidasi Asam Lemak Heksokinase 3.0 2.3
dan Siklus Asam Sitrat Sel sering menggunakan pola reaksi enzim Glikogen fosforilase 18.0 120.0
yang sama untuk konversi metabolisme analog. Misalnya, langkah- Fosfofruktokinase-1 24.0 143.0
langkah oksidasi piruvat menjadi asetil-KoA dan -ketoglutarat menjadi Sintase sitrat 100.0 15.0
suksinil-KoA, meskipun dikatalisis oleh enzim yang berbeda, sangat triasilgliserol lipase 0,07 0,01
mirip. Tahap pertama oksidasi asam lemak mengikuti urutan reaksi
yang sangat mirip dengan urutan dalam siklus asam sitrat. Gunakan
persamaan untuk menunjukkan urutan reaksi analog di dua jalur. (a) Diskusikan kepentingan relatif dari metabolisme glikogen
dan metabolisme lemak dalam menghasilkan ATP pada otot dada
burung-burung ini. (b)
Bandingkan konsumsi oksigen pada kedua burung. (c)
4. Kimia Reaksi Asil-KoA Sintetase Asam lemak diubah menjadi Dilihat dari data pada tabel, burung mana yang merupakan
ester koenzim A dalam reaksi reversibel yang dikatalisis oleh asil-KoA penerbang jarak jauh? Benarkan jawaban
sintetase: Anda. (d) Mengapa enzim khusus ini dipilih untuk perbandingan?
Apakah aktivitas triosa fosfat iso merase dan malat dehidrogenase
R COO ATP KoA
menjadi basa yang sama baiknya untuk perbandingan? Menjelaskan.
HAI
RC CoA AMP PPi

8. Pengaruh Defisiensi Karnitin Seorang individu
(a) Perantara terikat-enzim dalam reaksi ini telah diidentifikasi mengembangkan suatu kondisi yang ditandai dengan
sebagai anhidrida campuran dari asam lemak dan adenosin monofosfat kelemahan otot progresif dan kram otot yang sakit. Gejala diperparah
(AMP), asil-AMP: dengan puasa, olahraga, dan diet tinggi lemak.
HAI HAI
Homogenat spesimen otot rangka dari pasien teroksidasi menambahkan
Adenin oleat lebih lambat daripada homogenat kontrol, yang terdiri dari
R BERSAMA P HAI CH2 HAI
spesimen otot dari individu sehat. Ketika karnitin ditambahkan ke
HAI HH homogenat otot pasien, laju oksidasi oleat sama dengan homogenat
H H kontrol. Pasien didiagnosis memiliki defisiensi karnitin. (a) Mengapa
OH OH menambahkan karnitin meningkatkan laju oksidasi oleat pada
homogenat otot pasien? (b)
Tulis dua persamaan yang sesuai dengan dua langkah reaksi
Mengapa gejala pasien diperparah dengan puasa, olahraga, dan
yang dikatalisis oleh asil-KoA sintetase. (b) Reaksi asil-
diet tinggi lemak? (c) Kemukakan dua kemungkinan
KoA sintetase mudah dibalik, dengan konstanta kesetimbangan
alasan kekurangan dari
mendekati 1. Bagaimana reaksi ini dibuat untuk mendukung
pembentukan lemak asil-KoA?
karnitin otot pada individu ini.
5. Oksidasi Tritiated Palmitate Palmitat yang diberi label seragam
dengan tritium (3 H) dengan aktivitas spesifik 2,48 108 hitungan per
9. Asam Lemak sebagai Sumber Air Bertentangan dengan legenda,
menit (cpm) per mikromol palmitat ditambahkan ke dalam sediaan
unta tidak menyimpan air di punuknya, yang sebenarnya terdiri dari
mitokondria yang mengoksidasinya menjadi asetil-KoA.
timbunan lemak yang besar. Bagaimana timbunan lemak ini bisa
Asetil-KoA diisolasi dan dihidrolisis menjadi asetat. Aktivitas spesifik berfungsi sebagai sumber air? Hitung jumlah air (dalam liter) yang
dari asetat yang diisolasi adalah 1,00 107 cpm/mol. Apakah hasil ini
dapat dihasilkan unta dari 1,0 kg lemak. Asumsikan untuk
konsisten dengan jalur -oksidasi? Menjelaskan. Apa nasib akhir dari
kesederhanaan bahwa lemak seluruhnya terdiri dari tripalmitoylglycerol.
tritium yang dihilangkan?
10. Minyak Bumi sebagai Sumber Makanan Mikroba Beberapa
6. Kompartemen dalam Oksidasi Palmitat bebas diaktifkan menjadi
mikroorganisme dari genus Nocardia dan Pseudomonas dapat tumbuh
turunan koenzim A-nya (palmitoyl-CoA) di sitosol sebelum dapat
di lingkungan yang sumber makanannya hanya hidrokarbon. Bakteri
dioksidasi di mitokondria. Jika palmitat dan koenzim A [14C]
ini mengoksidasi hidrokarbon alifatik rantai lurus, seperti oktan,
ditambahkan ke homogenat hati, palmitoil-KoA yang diisolasi dari
menjadi asam karboksilat yang sesuai:
fraksi sitosol bersifat radioaktif, tetapi yang diisolasi dari fraksi
mitokondria tidak. Menjelaskan.
CH3(CH2)6CH3 NAD O2 yz
CH3(CH2)6COOH NADH H
7. Biokimia Komparatif: Jalur Pembangkit Energi pada Burung
Salah satu indikasi relatif penting Bagaimana bakteri ini dapat digunakan untuk membersihkan tumpahan minyak? Apa
Bab 17 Masalah 655
akan menjadi beberapa faktor pembatas efisiensi proses ini? 15. Peran FAD sebagai Akseptor Elektron Asil-KoA dehy
drogenase menggunakan FAD yang terikat enzim sebagai gugus
prostetik untuk mendehidrogenasi dan karbon asil-KoA berlemak.
11. Metabolisme Asam Lemak Fenil Rantai Lurus Sebuah
Apa keuntungan menggunakan FAD sebagai akseptor elektron
metabolit kristal diisolasi dari urin kelinci yang diberi makan asam
daripada NAD? Jelaskan dalam kaitannya dengan potensi reduksi
lemak rantai lurus yang mengandung gugus fenil terminal:
standar untuk setengah reaksi Enz-FAD/FADH2 (E 0,219 V) dan
NAD/NADH (E 0,320 V).
16. Oksidasi Asam Arachidic Berapa putaran siklus oksidasi asam

CH2 (CH2)n MENDEKUT
lemak yang diperlukan untuk oksidasi sempurna asam arakidat

(lihat Tabel 10–1) menjadi asetil-KoA?
Sampel 302 mg metabolit dalam larutan air dinetralkan seluruhnya
dengan 22,2 mL NaOH 0,100 M. 17. Nasib Propionat Berlabel Jika [3-14C]propionat (14C dalam
(a) Berapa berat molekul dan struktur metabolit yang mungkin? gugus metil) ditambahkan ke homogenat hati, oksaloasetat berlabel
(b) Apakah asam 14C diproduksi dengan cepat. Gambarlah diagram alur untuk jalur di
lemak rantai lurus mengandung gugus metilena (OCH2O) mana propionat diubah menjadi oksaloasetat, dan tunjukkan lokasi
dalam jumlah genap atau ganjil (yakni, apakah n genap atau ganjil)? 14C dalam oksaloasetat.
Menjelaskan.
12. Oksidasi Asam Lemak pada Diabetes yang Tidak 18. Sumber H2O yang Dihasilkan dalam Oksidasi Oksidasi
Terkendali Ketika asetil-KoA yang diproduksi selama lengkap palmitoyl-CoA menjadi karbon dioksida dan air ditunjukkan
oksidasi di hati melebihi kapasitas siklus asam sitrat, kelebihan asetil- oleh persamaan keseluruhan
KoA membentuk badan keton—aseton, asetoasetat, dan D-
Palmitoyl-CoA 23O2 108Pi 108ADP Aktif
hidroksibutirat. Ini terjadi pada diabetes yang parah dan tidak
KoA 16CO2 108ATP 23H2O
terkontrol: karena jaringan tidak dapat menggunakan glukosa,
Air juga diproduksi dalam reaksi
mereka malah mengoksidasi asam lemak dalam jumlah besar.
Meskipun asetil-KoA tidak beracun, mitokondria harus mengalihkan ADP Pi Pada ATP H2O
asetil-KoA ke badan keton. Masalah apa yang akan muncul jika
tetapi tidak dimasukkan sebagai produk dalam persamaan keseluruhan. Mengapa?
asetil-KoA tidak diubah menjadi badan keton? Bagaimana pengalihan
ke badan keton memecahkan masalah? 19. Pentingnya Biologi Kobalt Pada sapi, rusa, domba, dan hewan
ruminansia lainnya, sejumlah besar propionat diproduksi dalam
13. Konsekuensi Diet Tinggi Lemak Tanpa Karbo Hidrat
rumen melalui fermentasi bakteri dari bahan tanaman yang tertelan.
Misalkan Anda harus menjalani diet lemak ikan paus dan lemak
Propionat adalah sumber utama glukosa untuk hewan ini, melalui
anjing laut, dengan sedikit atau tanpa karbohidrat.
jalur propionat n oksaloasetat n glukosa. Di beberapa wilayah di
(a) Apa efek kekurangan karbohidrat terhadap pemanfaatan
dunia, terutama Australia, hewan ruminansia terkadang menunjukkan
lemak untuk energi?
gejala anemia disertai hilangnya nafsu makan dan pertumbuhan
(b) Jika diet Anda benar-benar tanpa karbohidrat, apakah lebih
yang terhambat, akibat ketidakmampuan untuk mengubah propionat
baik mengkonsumsi asam lemak ganjil atau genap? Menjelaskan.
menjadi oksaloasetat. Kondisi ini disebabkan oleh defisiensi kobalt
yang disebabkan oleh kadar kobalt yang sangat rendah di tanah dan
14. Konsekuensi Metabolik dari Menelan -Fluoro oleate juga di tanaman. Menjelaskan.
Toxicarium semak Dichapetalum, asli Sierra Leone, menghasilkan
-fluorooleate, yang sangat beracun bagi hewan berdarah panas.
20. Kehilangan Lemak selama Hibernasi Beruang menghabiskan
sekitar 25 106 J/hari selama periode hibernasi, yang dapat
HH berlangsung selama tujuh bulan. Energi yang dibutuhkan untuk
mempertahankan hidup diperoleh dari oksidasi asam lemak. Berapa
F CH2 (CH2)7 CC (CH2)7 MENDEKUT
penurunan berat badan (dalam kilogram) yang terjadi setelah tujuh
-Fluorooleat
bulan? Bagaimana ketosis dapat diminimalkan selama hibernasi?
Zat ini telah digunakan sebagai racun panah, dan buah bubuk dari (Asumsikan oksidasi lemak menghasilkan 38 kJ/g.)
tanaman kadang-kadang digunakan sebagai racun tikus (maka nama
umum tanaman itu adalah ratsbane). Mengapa zat ini sangat
beracun? (Petunjuk: Tinjau Bab 16, Soal 13.)

Siklus Asam Sitrat

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

Siklus Asam Sitrat

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

Machine Translated by Google

600 Bab 15 Prinsip Regulasi Metabolik: Glukosa dan Glikogen

Kami pertama-tama mempertimbangkan konversi piruvat

602 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

GAMBAR 16–1 Katabolisme protein, lemak, dan karbohidrat dalam tiga

CO2 adalah prototipe untuk dua kompleks enzim penting lainnya:

16.1 Produksi Acetyl-CoA CO2

dehidrogenase (E1 E2 E3)

16.1 Produksi Acetyl-CoA (Activated Acetate) 603

- Merkapto HAI HAI OH CH3 HAI HAI

GAMBAR 16-3 Koenzim A (CoA). Gugus hidroksil dari asam

kembali CO2 berlabel radioaktif ke asetil-KoA untuk

atau gugus prostetik—tiamina pirofosfat (TPP), flavin adenin HN

604 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

GAMBAR 16–5 Struktur kompleks piruvat dehidrogenase (a) Mikrograf

Sejumlah subunit E3 (merah) juga terikat ke inti, di mana lengan ayun di E2

Jumlah domain lipoil

16.1 Produksi Acetyl-CoA (Activated Acetate) 605

CoA-SH CH3 C S-CoA

CO2 CHOH S TIDAK + H+

piruvat Dihydrolipoyl Dihidrolipoil

606 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat 607

HAI C COO ATAU COO

malat Siklus asam H2O

Malat CH2 C MENDEKUT

608 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

reaksi oksidatif dan sintesis gabungan ATP.

Siklus Asam Sitrat Memiliki Delapan Langkah

Dalam memeriksa delapan langkah reaksi berurutan dari

1 Pembentukan Sitrat Reaksi pertama dari siklus ini

16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat 609

tidak terpisah dari situs aktif. Aconitase dapat mendorong

375 Garam sitrat cis-Aconitate

Keterkaitan thioester dalam asetil-KoA mengaktifkan hidrogen H C COO

Citroyl-CoA CH2 MENDEKUT-

Tioester selanjutnya dihidrolisis, meregenerasi CoA-SH dan

610 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

GAMBAR 16–10 Pusat besi-sulfur di aconitase. Pusat besi-belerang CoA-SH

maupun katalisis. Sifat umum protein besi-sulfur dibahas di Bab 19 (lihat

Reaksi ini sebenarnya identik dengan reaksi piruvat

MENDEKUT MENDEKUT MENDEKUT MENDEKUT

CH2 NAD(P)NAD(P)HH CH2 CH2 CH2

16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat 611

CH2 MENDEKUT MENDEKUT

negatif P-His (Gbr. 16–12b), menstabilkan fosfoenzim

GAMBAR 16–12 Reaksi suksinil-KoA sintetase. (a) Pada langkah 1

612 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

GTP ADP Pada PDB ATP G 0 kJ/mol

6 Oksidasi Suksinat menjadi Fumarat Suksinat yang C OH

CH2 C Enzim ini sangat stereospesifik; itu mengkatalisis hidrasi

G 0 kJ/mol H COO H MENDEKUT

Pada eukariota, suksinat dehidrogenase terikat erat pada C C

membran mitokondria bagian dalam; pada prokariota, ke C C

memasuki rantai pembawa elektron di membran dalam

16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat 613

KOTAK 16–1 BEKERJA DALAM BIOKIMIA

614 Bab 16 Siklus Asam Sitrat

KOTAK 16–2 BEKERJA DALAM BIOKIMIA

CH2 14COO CH2 14COO

KE CH 14COO HAI C 14COO

16.2 Reaksi Siklus Asam Sitrat 615

Mengapa Oksidasi Asetat Begitu Rumit?

diposisikan dengan benar