EFSA Journal - 2021 - in Vivo and in Vitro Random Mutagenesis Techniques in Plants - En.id

Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.
com
PENDAPAT ILMIAH
DIADOPSI: 29 September 2021
doi: 10.2903/j.efsa.2021.6611
secara alamiDansecara in vitroteknik mutagenesis acak di

tanaman
Panel EFSA tentang Organisme Hasil Modifikasi Genetik (GMO), Ewen

Mullins, Jean-Louis Bresson, Tamas Dalmay, Ian Crawford Dewhurst, Michelle M
Epstein, Leslie George Firbank, Philippe Guerche, Jan Hejatko, Francisco Javier
Moreno, Hanspeter Naegeli, Fabien Nogue - , Jose Juan Sa- nchez Serrano,
Giovanni Savoini, Eve Veromann, Fabio Veronesi, Josep Casacuberta, Paolo Lenzi,
Irene Munoz Guajardo, Tommaso Raffaello dan Nils Rostoks
Abstrak
Mutasi adalah perubahan materi genetik yang dapat diturunkan ke generasi berikutnya. Mutasi muncul secara
spontan di alam dan merupakan salah satu kekuatan pendorong evolusi. Pada tumbuhan,secara alamiDansecara
in vitromutagenesis acak bergantung pada penerapan mutagen fisik dan kimia untuk meningkatkan frekuensi
mutasi sehingga mempercepat pemilihan varietas dengan ciri-ciri agronomi yang penting. Komisi Eropa telah
meminta EFSA untuk memberikan penjelasan lebih rinci mengenai hal inisecara alamiDansecara in vitroteknik
mutagenesis acak dan jenis mutasi serta mekanisme yang terlibat, untuk dapat menyimpulkan apakahsecara
alamiDansecara in vitroteknik mutagenesis acak harus dianggap sebagai teknik yang berbeda. Untuk menjawab
permintaan Komisi Eropa, pencarian literatur dilakukan untuk mengumpulkan informasi mengenai teknik
mutagenesis acak yang digunakan pada tanaman keduanyasecara alamiDansecara in vitro,pada jenis mutasi
yang dihasilkan oleh teknik tersebut dan pada mekanisme molekuler yang mendasari pembentukan mutasi
tersebut. Panel GMO menyimpulkan bahwa sebagian besar teknik mutagenesis fisik dan kimia telah menerapkan
keduanyasecara alamiDansecara in vitro;proses mutasi dan mekanisme perbaikan bekerja pada tingkat sel
sehingga tidak ada perbedaan antara penerapan mutagensecara alamiatausecara in vitro;dan jenis mutasi yang
disebabkan oleh mutagen tertentu diharapkan sama, terlepas dari apakah mutagen tersebut diterapkan atau
tidak.secara alamiatau secara in vitro.Memang benar, mutasi dan sifat turunan yang sama pada spesies tanaman
tertentu berpotensi diperoleh dengan menggunakan keduanyasecara alamiDansecara in vitromutagenesis acak
dan mutan yang dihasilkan tidak dapat dibedakan. Oleh karena itu, Panel GMO menyimpulkan bahwa
pembedaan tanaman diperoleh dari secara in vitroatausecara alamipendekatan ini tidak dibenarkan.
©Otoritas Keamanan Pangan Eropa 2021.Jurnal EFSAditerbitkan oleh John Wiley and Sons Ltd atas nama
Otoritas Keamanan Pangan Eropa.
Kata kunci:mutagenesis acak,in vivo, in vitro,mutagenesis kimia, mutagenesis fisik, mutagen, mutasi
Pemohon:Komisi Eropa Nomor pertanyaan:EFSA-

Q-2020-00445 Korespondensi:
GMO_applications@efsa.europa.eu
www.efsa.europa.eu/efsajournal Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

18314732, 2021, 11, Diunduh dari https://efsa.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.2903/j.efsa.2021.6611 oleh Nat Prov Indonesia, Wiley Online Library pada [16/10/2023]. Lihat Syarat dan Ketentuan (https://onlinelibrary.wiley.com/terms-and-conditions) di Perpustakaan Online Wiley untuk aturan penggunaan; Artikel OA diatur oleh Lisensi Creative Commons yang berlaku
Mutagenesis acak pada tumbuhan
Anggota panel:Ewen Mullins, Jean-Louis Bresson, Tamas Dalmay, Ian Crawford Dewhurst, Michelle M
Epstein, Leslie George Firbank, Philippe Guerche, Jan Hejatko, Francisco Javier Moreno, Hanspeter Naegeli,
Fabien Nogue - , Nils Rostoks, Jose Juan Sa - nchez Serrano, Giovanni Savoini, Eve Veromann dan
Fabio Veronesi.
Pernyataan minat:Pernyataan minat semua pakar ilmiah yang aktif dalam pekerjaan EFSA tersedia di
https://ess.efsa.europa.eu/doi/doiweb/doisearch.
Ucapan Terima Kasih:Panel GMO mengucapkan terima kasih kepada pihak-pihak berikut atas dukungan yang
diberikan terhadap hasil ilmiah ini: Kelompok Kerja Karakterisasi Molekuler Panel GMO dan staf EFSA Laura
Martino.
Kutipan yang disarankan:Panel GMO EFSA (Panel EFSA tentang Organisme Hasil Modifikasi Genetik), Mullins E,
Bresson JL, Dalmay T, Dewhurst IC, Epstein MM, Firbank LG, Guerche P, Hejatko J, Moreno FJ, Naegeli H, Nogue
- F, Sa- nchez Serrano JJ, Savoini G, Veromann E, Veronesi F, Casacuberta J, Lenzi P, Munoz
Guajardo I, Raffaello T dan Rostoks N, 2021.secara alamiDansecara in vitroteknik mutagenesis acak pada
tanaman. Jurnal EFSA 2021;19(11):6611, 30 hal.https://doi.org/10.2903/j.efsa.2021.6611
ISSN:1831-4732
©Otoritas Keamanan Pangan Eropa 2021.Jurnal EFSAditerbitkan oleh John Wiley and Sons Ltd atas nama
Otoritas Keamanan Pangan Eropa.
Ini adalah artikel akses terbuka berdasarkan ketentuanAtribusi Creative Commons-Tanpa TurunanLisensi, yang
mengizinkan penggunaan dan distribusi dalam media apa pun, asalkan karya asli dikutip dengan benar dan tidak ada
modifikasi atau adaptasi yang dilakukan.
Jurnal EFSA adalah publikasi Otoritas Keamanan Pangan

Eropa, sebuah badan Eropa yang didanai oleh Uni Eropa.
www.efsa.europa.eu/efsajournal 2 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

Ringkasan
Mutasi adalah perubahan materi genetik yang dapat diturunkan ke generasi berikutnya. Mutasi muncul
secara spontan di alam dan merupakan salah satu kekuatan mendasar yang mendorong evolusi dan
memungkinkan adaptasi terhadap lingkungan yang selalu berubah. Pada tumbuhan,secara alamiDansecara in
vitromutagenesis acak bergantung pada penerapan mutagen fisik dan kimia pada bahan tanaman untuk
meningkatkan jumlah mutasi secara artifisial dan memperluas variabilitas genetik yang dapat dimanfaatkan
dalam program pemuliaan.
Pendapat ini menjawab empat permintaan dari Komisi Eropa sebagaimana dijelaskan dalam kerangka
acuan:
1) Untuk memberikan gambaran yang lebih rinci tentang teknik mutagenesis acak yang diterapkansecara alami Dan
secara in vitro.
2) Untuk menilai apakah jenis modifikasi genetik yang disebabkan oleh teknik mutagenesis acak
berbeda tergantung pada apakah teknik tersebut diterapkansecara alamiatausecara in vitro.
3) Untuk menilai apakah mekanisme molekuler yang mendasari pembentukan mutasi baru yang
disebabkan oleh teknik mutagenesis acak berbeda jika teknik tersebut diterapkansecara alamiatau
secara in vitro.
4) Untuk menilai apakahsecara in vitroteknik mutagenesis acak harus dianggap sebagai teknik yang
berbeda dibandingkan dengansecara alamimutagenesis acak atau sebaliknya, jika dianggap
sebagai sebuah kontinum.
Sebuah protokol dikembangkan menyusul rendahnya perencanaan sesuai dengan 'Draf kerangka
pengembangan protokol untuk penilaian ilmiah EFSA' (EFSA, 2020). Setiap ToR diterjemahkan ke dalam
pertanyaan penilaian yang dapat dijawab secara ilmiah dan dilakukan penelusuran literatur. Mengingat
keterbatasan waktu untuk mengembangkan dokumen dan bahwa bidang mutagenesis acak tanaman tidak
berkembang dengan cepat, pencarian literatur terbatas pada makalah review dan buku/bab buku. Hasil
pencarian literatur dievaluasi secara independen oleh dua petugas ilmiah EFSA untuk menyimpan
dokumen yang mencakup informasi terkait jenis teknik mutagenesis acak yang digunakan pada tanaman
keduanya.secara alamiDansecara in vitro,jenis mutasi spesifik yang dihasilkan oleh teknik mutagenesis
acak dan mekanisme molekuler yang menyebabkan mutasi tertentu.
Berdasarkan tinjauan informasi yang diperoleh melalui penelusuran literatur dan pengetahuan para
ahli, Panel GMO menyimpulkan bahwa:
• teknik mutagenesis fisik dan kimia yang berbeda telah diterapkan keduanyasecara alamiDan secara in vitrodan
semuanya, pada prinsipnya, dapat diterapkan pada kedua situasi;
• proses dan mekanisme perbaikan yang dipicu oleh tindakan mutagen pada tingkat sel dan dengan
demikian tidak ada perbedaan dalam cara mutagen mempengaruhi DNA apakah mutagen diterapkan
secara alamiatausecara in vitro;
• jenis mutasi yang disebabkan oleh mutagen tertentu diharapkan sama terlepas dari apakah mutagen
tersebut diterapkansecara alamiatausecara in vitro.
Perbedaan tanaman yang diperoleh dengansecara in vitroatausecara alamiOleh karena itu, pendekatan ini tidak dapat
dibenarkan. Memang benar, mutasi dan sifat turunan yang sama pada spesies tanaman tertentu berpotensi diperoleh dengan
menggunakan keduanyasecara alamiDansecara in vitromutagenesis acak dan mutan yang dihasilkan tidak dapat dibedakan.

Daftar isi
Abstrak................................................. ................................................. ................................................... Ringkasan 1

................................................. ................................................. ................................................ 1. 3
Perkenalan................................................. ................................................. ........................ 5
1.1. Latar belakang sebagaimana diberikan kepada EFSA oleh Komisi Eropa................................................. .......... 5
1.2. Latar belakang seperti yang disediakan oleh EFSA................................................. ................................................ 5
1.3. Kerangka acuan................................................. ................................................. .................. 5
2. Data dan metodologi................................................. ................................................. .......... 6
3. Protokol................................................. ................................................. ................................. 6
3.1. Formulasi masalah................................................. ................................................. ................ Luasnya 6
3.2. perencanaan................................................. ................................................. ............... Definisi metode 6
3.3. ................................................. ................................................. .............. 7
3.3.1.Pencarian literatur................................................. ................................................. ............... 7
3.3.2.Penyaringan hasil pencarian literatur................................................. ............................... 7
3.3.3.Konsultasi................................................. ................................................. ........................ 7
4. Penilaian................................................. ................................................. ........................ 8
4.1. Perkenalan................................................. ................................................. ........................ 8
4.1.1.Mutasi spontan dan terinduksi dalam konteks pemuliaan tanaman........................................ 8
4.1.2.Pandangan sejarah tentang mutagenesis acak dalam pemuliaan mutasi................................................. ....... 9
4.2. Mengatasi ToR1: Untuk memberikan penjelasan lebih rinci tentang teknik mutagenesis acak yang diterapkan
secara alamiDansecara in vitro................................................. ................................................. ....... 10
4.2.1.Teknik mutagenesis acak apa yang digunakan untuk memperoleh tanaman mutan?........................................ 10
4.2.1.1.Pemuliaan mutasi: ringkasan langkah-langkah utama................................................. ........................... 10
4.2.1.2.Pertimbangan umum tentangsecara alamiDansecara in vitroteknik mutagenesis acak pada tanaman.................. 11
4.2.1.3.Teknik mutagenesis fisik diterapkan dalam pemuliaan mutasi................................................. ..... 12
4.2.1.4.Teknik mutagenesis kimia diterapkan dalam pemuliaan mutasi................................................. .... 13
4.2.1.5.Contoh darisecara alamiDansecara in vitroaplikasi mutagenesis acak pada tanaman................................... 14
4.2.2.Apakah semua teknik ini dapat diterapkan keduanyasecara alamiDansecara in vitro?................................................. ........16
4.3. Mengatasi ToR3: Untuk menilai apakah mekanisme molekuler yang mendasari teknik mutagenesis acak
berbeda jika teknik tersebut diterapkansecara alamiatausecara in vitro........................................16
4.3.1.Apa mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya mutasi?................................ 16
4.3.1.1.Mekanisme yang menyebabkan kerusakan DNA................................................. ........................................ 16
4.3.1.2.Mekanisme yang mengarah pada perbaikan................................................. ................................................. ... 17
4.3.2.Apakah ada perbedaan antara mekanisme molekuler ini apakah hal itu terjadisecara alamiatau
secara in vitro?................................................. ................................................. ................................ 19
4.4. Mengatasi ToR2: Untuk menilai apakah jenis modifikasi genetik yang disebabkan oleh teknik
mutagenesis acak berbeda tergantung pada apakah teknik tersebut diterapkansecara alamiatau
secara in vitro................................................. ................................................. ...................................19
4.4.1.Jenis perubahan apa pada tingkat DNA yang disebabkan oleh mutagenesis acak?................................ 19
4.4.1.1.Jenis mutasi................................................. ................................................. .................. 20
4.4.2.Apakah ada perbedaan antara mutasi yang didapatsecara alamiatausecara in vitro?............ 20
4.5. Mengatasi ToR4: Untuk menilai apakahsecara in vitroteknik mutagenesis acak harus dianggap sebagai
teknik yang berbeda dibandingkan dengansecara alamiteknik mutagenesis acak atau sebaliknya, jika
dianggap sebagai akontinum................................................. ................................... 20
4.5.1.Adalahsecara in vitroDansecara alamiteknik mutagenesis acak dianggap berbeda atau tidak?............ 20
5. Kesimpulan................................................. ................................................. ................................ 20
Referensi................................................. ................................................. ................................................... 21
Singkatan................................................. ................................................. ................................. 24
Glosarium................................................. ................................................. ............................................ 25
Lampiran A – Penelusuran literatur. Strategi pencarian................................................. ................................. 26

1. Perkenalan
1.1. Latar belakang sebagaimana diberikan kepada EFSA oleh Komisi Eropa
Keputusan Pengadilan Uni Eropa (CJEU) dalam Kasus C-528/161tentang mutagenesis menyatakan
bahwa Pasal 3(1) Petunjuk 2001/18 tentang pelepasan Organisme Hasil Rekayasa Genetik (OGM)
dengan sengaja2harus diartikan bahwa “hanya GMO yang diperoleh melalui teknik/metode
mutagenesis yang secara konvensional telah digunakan dalam sejumlah penerapan dan memiliki
catatan keamanan yang panjang” tidak termasuk dalam cakupan arahan tersebut. CJEU dalam
alasannya mengacu pada “penerapan metode konvensional mutagenesis acak” tanpa membedakan
lebih jauh antarasecara alamiDansecara in vitromutagenesis acak dan membedakannya dari “teknik/
metode mutagenesis baru yang telah muncul atau sebagian besar dikembangkan sejak Directive
2001/18 diadopsi”.3
Menyusul keputusan CJEU, Conseil d'Etat Perancis pada tanggal 7 Februari 2020 mengeluarkan
keputusan mengenai organisme yang diperoleh melalui mutagenesis. Dalam penilaiannya, Conseil d'Etat
menggambarkan mutagenesis konvensional atau acak sebagai teknik yang memicu mutasi acak dalam
rangkaian DNA melalui aksi mutagen kimia atau fisik. Conseil d'Etat Perancis membedakannya secara alami
Dansecara in vitroteknik mutagenesis acak.secara alamimutagenesis acak terdiri dari penerapan mutagen
kimia atau fisik pada seluruh tanaman atau bagian tanaman, yang kemudian harus melalui prosedur
seleksi untuk mengidentifikasi mutasi yang menarik.Secara in vitromutagenesis acak terdiri dari
menjadikan sel tumbuhan terkena agen mutagenik kimia atau fisik. Sel-sel yang dimodifikasi kemudian
akan dikenakan tekniksecara in vitrokultur sel untuk meregenerasi seluruh tanaman.
EFSA, dalam opini Ilmiahnya yang membahas penilaian keselamatan instalasi yang dikembangkan
menggunakan Zinc Finger Nuclease 3 dan Site-Directed Nuclease lainnya dengan fungsi serupa,4mengkaji
teknik pemuliaan tanaman konvensional yang relevan untuk dibandingkan dengan teknik Site Directed
Nuclease-3. Di antara teknik konvensional ini, EFSA menjelaskan pemuliaan mutasi melalui mutagenesis
kimia dan fisik. Meskipun EFSA menjelaskan berbagai cara tindakan tergantung pada mutagen kimia atau
jenis radiasi yang digunakan, Otoritas tidak membedakan penerapan teknik tersebut.secara in vitroatau
secara alami.
Negara-negara Anggota tidak pernah membuat perbedaan antara keduanyasecara in vitroDansecara alamibaik ketika
menerapkan undang-undang benih, undang-undang materi perbanyakan tanaman, atau undang-undang GMO.
Oleh karena itu, penting untuk memberikan pemahaman ilmiah yang kuat tentang teknik mutagenesis acak
dan analisis ilmiah yang kuat mengenai perbedaan antara keduanyasecara in vitroDansecara alamidibenarkan
secara ilmiah.
1.2. Latar belakang seperti yang disediakan oleh EFSA
Menindaklanjuti permintaan dari Komisi Eropa (Ref. Ares(2020)2651289 - 20/5/2020), EFSA

memberikan mandat kepada kelompok kerja karakterisasi molekuler (MC WG) Panel GMO pada bulan
Mei 2020 (Ref. BU/GdS /EW/svh - OC-2020-23489581).
1.3. Kerangka acuan

Dengan latar belakang ini, Komisi meminta EFSA, sesuai dengan Pasal 29 Regulasi (EC) No
178/2002:
A) Untuk memberikan gambaran yang lebih rinci tentang teknik mutagenesis acak yang diterapkansecara alami Dan
secara in vitro.
B) Untuk menilai apakah jenis modifikasi genetik yang disebabkan oleh teknik mutagenesis acak
C) Untuk menilai apakah mekanisme molekuler yang mendasari teknik mutagenesis acak berbeda jika
teknik tersebut diterapkansecara alamiatausecara in vitro.
1Kasus C-528/16,Mengakui- de
- ransum paysanne dan Lainnya,Keputusan tanggal 25 Juli 2018, EU:C:2018:583.
2Arahan 2001/18/EC dari Parlemen dan Dewan Eropa tentang pelepasan yang disengaja ke dalam lingkungan
organisme hasil rekayasa genetika dan mencabut Petunjuk Dewan 90/220/EEC. OJ L 106, 17.4.2001, hal. 1. Pasal 4.
- de
3Kasus C-528/16,Mengakui - ransum paysanne dan Lainnya,Keputusan tanggal 25 Juli 2018, EU:C:2018:583, poin 48 et 51.
4Panel GMO EFSA (Panel EFSA tentang organisme hasil rekayasa genetika), 2012. Pendapat ilmiah mengenai penilaian keamanan
tanaman dikembangkan menggunakan Zinc Finger Nuclease 3 dan Site-Directed Nuclease lainnya dengan fungsi serupa. Jurnal EFSA 2012;10
(10):2943, 31 hal.https://doi.org/10.2903/j.efsa.2012.2943. Tersedia daring:www.efsa.europa.eu/efsajournal

D) Untuk menilai apakahsecara in vitroteknik mutagenesis acak harus dianggap sebagai teknik
yang berbeda dibandingkan dengansecara alamiteknik mutagenesis acak atau sebaliknya,
jika dianggap sebagai akontinum.
2. Data dan metodologi

Untuk mengatasi empat kerangka acuan, MC WG mengikuti perencanaan tingkat rendah yang
dikembangkan sesuai dengan 'Draf kerangka pengembangan protokol untuk penilaian ilmiah EFSA' (EFSA,
2020) (Bagian3). Perlu dicatat bahwa berdasarkan informasi latar belakang dan ToR yang diberikan oleh
Komisi Eropa, MC WG tidak diberi mandat untuk memberikan pertimbangan penilaian risiko padasecara
alamiDansecara alamiteknik mutagenesis acak pada tanaman.
3. Protokol
3.1. Formulasi masalah

ToR diterjemahkan ke dalam pertanyaan penilaian yang dapat dijawab secara ilmiah sejalan dengan rancangan dokumen
EFSA tentang pengembangan protokol untuk mandat non-penerapan (Langkah 1.1 dan Langkah 1.2; EFSA, 2020). Setiap ToR
diterjemahkan ke dalam pertanyaan-pertanyaan seperti yang dirinci di bawah ini:
A) ToR1: Untuk memberikan penjelasan lebih rinci tentang teknik mutagenesis acak sebagaimana diterapkan secara alami
Dansecara in vitro.
a) Teknik mutagenesis acak apa yang digunakan untuk memperoleh tanaman mutan?
b) Apakah semua teknik ini dapat diterapkan keduanyasecara alamiDansecara in vitro?
B) ToR2: Untuk menilai apakah jenis modifikasi genetik yang disebabkan oleh teknik mutagenesis acak
a) Jenis perubahan apa pada tingkat DNA yang disebabkan oleh mutagenesis acak?
b) Apakah ada perbedaan antara jenis perubahan yang ditimbulkansecara alamiatausecara in vitro?
C) ToR3: Untuk menilai apakah mekanisme molekuler yang mendasari teknik mutagenesis acak
berbeda jika teknik tersebut diterapkansecara alamiatausecara in vitro.
a) Apa mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya mutasi?
b) Apakah ada perbedaan antara mekanisme molekuler ini apakah hal itu terjadisecara alami atau
secara in vitro?
D) ToR4: Untuk menilai apakahsecara in vitroteknik mutagenesis acak harus dianggap sebagai
teknik yang berbeda dibandingkan dengansecara alamiteknik mutagenesis acak atau
sebaliknya, jika dianggap sebagai akontinum.
a) Apakahsecara in vitroDansecara alamiteknik mutagenesis acak dianggap berbeda atau tidak?
Perlu dicatat bahwa Panel GMO tidak diberi mandat untuk mengembangkan definisi baru tentang '
secara alamiDan secara in vitromutagenesis acak'. Dalam konteks pendapat ilmiah ini, pengertian 'secara
alamiDan secara in vitromutagenesis acak' diberikan oleh Komisi Eropa sebagai informasi latar belakang
mandat tersebut (Bab1.1) dan dilaporkan di bawah ini:
'Dalam kehidupanmutagenesis acak terdiri dari penerapan mutagen kimia atau fisik pada seluruh
tanaman atau bagian tanaman, yang kemudian harus melalui prosedur seleksi untuk mengidentifikasi
mutasi yang menarik.Secara in vitromutagenesis acak terdiri dari menjadikan sel tumbuhan terkena agen
mutagenik kimia atau fisik. Sel-sel yang dimodifikasi kemudian akan dikenakan teknik secara in vitrokultur
sel untuk meregenerasi seluruh tanaman.
3.2. Luasnya perencanaan

Untuk menjawab pertanyaan penelitian yang dirumuskan (Bagian3.1), MC WG memutuskan untuk
mengikuti pendekatan kualitatif yang terdiri dari pencarian literatur (Langkah 1.3; EFSA, 2020). Mengingat
keterbatasan waktu untuk mengembangkan opini ilmiah dan mengingat teknik mutagenesis acak pada
tanaman tidak berkembang dengan cepat, pencarian literatur dibatasi pada tinjauan dan bab buku
(Langkah 2; EFSA, 2020).

3.3. Definisi metode
3.3.1. Pencarian literatur

MC WG dengan dukungan spesialis informasi merancang pencarian literatur untuk mengidentifikasi kemungkinan
buku, bab buku atau ulasan yang diterbitkan dengan teknik mutagenesis acak sebagaimana diterapkan secara alamiDan
secara in vitropada tumbuhan. Panel GMO menganggap bahwa dengan mempertimbangkan sejarah mutagenesis acak
yang sangat luas dan penelitian asli yang tersedia, maka masuk akal untuk membatasi pencarian hanya pada bab buku
dan ulasan. Pencarian tidak dibatasi oleh tahun penerbitan.
Basis data bibliografi tercantum dalam Tabel1dicari untuk mengidentifikasi studi yang relevan. Basis
data telah diidentifikasi sesuai dengan ruang lingkup tinjauan yang ditentukan.
Tabel 1: Basis data bibliografi mencari studi yang relevan
Sumber informasi Platform

PubMed Jaringan Sains
Scopus Scopus.com
Koleksi Inti Web Sains Jaringan Sains
• Indeks Kutipan Sains Diperluas (SCI-EXPANDED) – 1975–sekarang
• Indeks Kutipan Prosiding Konferensi- Sains (CPCI-S) – 1990–sekarang
• Indeks Kutipan Buku – Sains (BKCI-S) – 2005–sekarang
• Indeks Kutipan Sumber Berkembang (ESCI) – 2005–sekarang
• Reaksi Kimia Saat Ini (CCR-EXPANDED) – 1985–sekarang
• (Termasuk data struktur Institut National de la Propriete Industrielle sejak tahun 1840)
• Indeks Chemicus (IC) – 1993–sekarang
String pencarian yang dijalankan di sumber informasi tersedia di Lampiran. Mereka disusun sebagai
kombinasi dari tiga pencarian: pencarian 1 menggabungkan istilah untuk mutagenesis kimia atau fisik dan
tanaman; pencarian 2 menggabungkan istilah untuk mutagenesis acak dan tanaman; pencarian 3
menggabungkan istilah untuk mutagenesis pada tumbuhan dan istilah umum untuk teknik. Kata kunci
telah dipilih dengan bantuan anggota WG, konsultasi tesaurus (misalnya CAB Thesaurus) dan kamus.
Pencarian dibatasi pada dokumen yang diterbitkan dalam bahasa Inggris dan pada buku, bab
buku, atau resensi. Ketika database bibliografi tidak memiliki filter untuk tinjauan, yaitu Abstrak CAB,
string pencarian dirancang untuk mengidentifikasi jenis publikasi ini.
Pencarian dilakukan pada 22 Desember 2020: 344 dokumen diambil di CAB Abstrak, 215 di Scopus,
dan 202 di database Web of Science Core Collection. Output pencarian, yaitu catatan yang diambil
dari database bibliografi diekspor ke perpustakaan EndNote (Clarivate Analytics). Setelah menghapus
referensi duplikat di EndNote, 517 dokumen unik diidentifikasi oleh database.
3.3.2. Penyaringan hasil pencarian literatur

517 dokumen unik tersebut disaring secara independen oleh dua ilmuwan EFSA berdasarkan judul dan abstrak untuk
mempertahankan hanya makalah dan buku relevan yang memberikan informasi setidaknya pada salah satu aspek
berikut:
• jenis teknik mutagenesis acak yang digunakan pada tanaman keduanyasecara alamiDansecara in vitro;
• jenis mutasi spesifik yang dihasilkan oleh teknik mutagenesis acak;
• mekanisme molekuler yang menyebabkan mutasi tertentu.
Hasil dari dua pemeriksaan independen dibandingkan, dan ambiguitas diselesaikan. Daftar akhir terdiri
dari 294 dokumen terkait. Selama proses penulisan, para ahli memandang perlu menambahkan beberapa
referensi tambahan yang tidak terdapat dalam hasil penelusuran literatur awal, guna memberikan
dukungan lebih lanjut terhadap topik yang diuraikan dalam opini ilmiah.
3.3.3. Konsultasi
Sejalan dengan kebijakannya mengenai keterbukaan dan transparansi, EFSA berkonsultasi dengan Negara-negara Anggota
UE dan pemangku kepentingannya melalui konsultasi publik online. Antara Mei dan Juni 2021, ada peminatnya

diundang untuk menyampaikan komentarnya terhadap rancangan Opini Ilmiah Panel GMO.5Setelah
proses konsultasi ini, dokumen tersebut direvisi oleh Panel GMO dan para ahli dari MC WG.
Hasil konsultasi publik online dilaporkan dalam laporan Teknis EFSA yang akan dipublikasikan di
situs web EFSA bersamaan dengan Opini Ilmiah akhir.
4. Penilaian
4.1. Perkenalan
Semua organisme hidup mengkodekan instruksi pertumbuhan dan perkembangan dalam genomnya. Genom
mengakumulasi mutasi seiring berjalannya waktu, yang merupakan perubahan materi genetik yang dapat
diturunkan ke keturunannya. Hugo de Vries adalah ilmuwan pertama yang memperkenalkan konsep 'mutasi'
pada awal abad ke-20 (Till et al., 2018). Mutasi spontan, yang pada dasarnya acak, merupakan salah satu kekuatan
pendorong evolusi yang menghasilkan individu baru dan dapat menghasilkan genera dan spesies baru yang
membentuk seluruh kingdom kehidupan (Mba et al., 2010; Riaz dan Gul, 2015) . Di dunia tumbuhan, variasi
genetik ini memungkinkan tanaman beradaptasi dengan berbagai kondisi lingkungan, dan banyak manfaat
lainnya (Bado et al., 2015).
Molekul DNA terdiri dari dua untai yang saling berliku membentuk bentuk yang dikenal sebagai heliks
ganda. Setiap untai memiliki tulang punggung yang terbuat dari molekul gula (deoksiribosa) dan gugus
fosfat yang bergantian. Pada setiap gula melekat salah satu dari empat basa, adenin (A), sitosin (C), guanin
(G) dan timin (T). Mutasi pada DNA biasanya dipicu oleh modifikasi awal pada basa, pada ikatan antara basa
dan gula, atau pada ikatan fosfodiester antar nukleotida. Sel menerapkan serangkaian mekanisme
molekuler dalam upaya memperbaiki modifikasi tersebut. Ketika enzim khusus yang direkrut, yang terlibat
dalam mekanisme perbaikan, tidak mampu mengembalikan perubahan ke konformasi aslinya, perubahan
tersebut menjadi stabil dan disebut 'mutasi'.
4.1.1. Mutasi spontan dan terinduksi dalam konteks pemuliaan tanaman

Mutasi spontan adalah perubahan DNA yang bukan disebabkan oleh campur tangan manusia,
sedangkan mutasi terinduksi disebabkan oleh agen mutagenik yang dibawa oleh manusia. Sumber umum
mutasi spontan misalnya kesalahan dalam proses replikasi DNA atau spesies oksigen reaktif (ROS) yang
menyebabkan perubahan genetik. Kehadiran unsur genetik bergerak dalam genom seperti transposon
merupakan sumber mutasi lainnya, baik karena sifatnya yang berulang maupun karena kapasitas
geraknya. Paparan tanaman terhadap berbagai kondisi fisik, seperti sinar UV, atau agen kimia atau biologis
yang ada secara alami juga dapat memicu terjadinya mutasi. Mutasi adalah dasar dari variabilitas genetik
yang kita amati pada semua organisme hidup (Bado et al., 2015). Frekuensi mutasi spontan bergantung
pada lingkungan. Khususnya budidaya tanamansecara in vitrosering meningkatkan laju munculnya mutasi
spontan, sebuah fenomena yang sering dikenal sebagai 'variasi somaklonal' (Larkin dan Scowcroft, 1981).
Baik kondisi lingkungan tertentu darisecara in vitropengaturan kultur, dan pemrograman ulang jaringan,
dan pertumbuhan tidak terorganisir yang sering dikaitkan dengansecara in vitrobudaya, terutama ketika
pembentukan kalus terlibat, meningkatkan laju akumulasi mutasi spontan (Bairu et al., 2011). Sejak awal
mula pertanian, para petani telah menggunakan mutasi spontan sebagai sumber keragaman genetik.
Pemuliaan tanaman telah mengeksploitasi variabilitas genetik alami ini untuk memilih fenotipe dengan
karakteristik agronomi yang diinginkan, seperti hilangnya buah atau kepala yang pecah, hilangnya duri
pada rumput, hilangnya rasa pahit pada spesies seperti terong, kubis atau parthenocarpy pada pisang dan
anggur (Mba, 2013). Peningkatan laju mutasi terkait dengansecara in vitrobudaya juga telah digunakan
dalam program pemuliaan. Meregenerasi tanaman darisecara in vitrobudidaya telah memungkinkan
pemilihan beberapa varietas yang, misalnya, memiliki arsitektur tanaman yang lebih baik, ketahanan
terhadap patogen, dan toleransi terhadap cekaman abiotik (Bairu et al., 2011). Namun, terlepas dari
frekuensi mutasi, variabilitas yang ada dalam populasi alami untuk suatu sifat tertentu terbatas dan
fenotipe yang diinginkan, dalam banyak kasus, mungkin tidak ada.
Oleh karena itu, sejak awal abad ke-20, pemulia tanaman mulai menerapkan mutagenesis fisik dan kimia
untuk menginduksi mutasi, guna meningkatkan keanekaragaman genetik tanaman secara artifisial dalam
program pemuliaan, suatu proses yang disebut pemuliaan mutasi (Kharkwal, 2012). Dengan kata lain, pemuliaan
mutasi terdiri dari peningkatan variabilitas genetik spesies tanaman yang diminati secara agronomi dengan
menginduksi mutasi pada frekuensi yang lebih tinggi dibandingkan dengan proses spontan. Pemuliaan mutasi
telah berkontribusi dalam memasarkan ribuan varietas tanaman dengan fenotipik yang ditingkatkan
5Diterbitkan dihttps://connect.efsa.europa.eu/RM/s/publicconsultation2/a0l1v00000D7rSW/pc0011

ciri-ciri seperti kinerja agronomi, ciri gizi, ketahanan terhadap penyakit, toleransi terhadap tekanan
lingkungan, ketahanan terhadap herbisida dan lain-lain. Selain itu, perkembangan terkini dalam pemuliaan
tanaman telah menghasilkan teknik-teknik baru untuk mutagenesis yang ditargetkan pada tanaman.
Beberapa teknik ini telah dibahas dalam opini terbaru EFSA (EFSA GMO Panel, 2020).
4.1.2. Pandangan sejarah tentang mutagenesis acak dalam pemuliaan mutasi

Kemungkinan untuk menginduksi mutasi pada organisme secara artifisial ke frekuensi yang lebih tinggi
dibandingkan dengan tingkat mutasi spontan telah dijelaskan pada awal abad ke-20. Sudah pada akhir abad
ke-19, ditemukannya sinar-X pada tahun 1895 oleh Ro €entgen, radioaktivitas oleh Becquerel pada tahun 1896,
dan unsur radioaktif oleh Marie dan Pierre Curie pada tahun 1898 telah membuka jalan bagi penggunaan energi
atom dalam pemuliaan tanaman. Dalam hal ini, karya Hermann Muller, yang menjelaskan penggunaan sinar-X
untuk mutagenisasiDrosophila melanogaster,menjadi pionir sejak ia menunjukkan bahwa laju mutasi dapat
ditingkatkan dengan memperlakukan sperma lalat jantan dengan sinar-X (Muller, 1927; Kharkwal, 2012). Pada
tahun yang sama, Lewis John Stadler menerbitkan karyanya yang menunjukkan bahwa penerapan sinar-X juga
dapat menyebabkan mutasi pada tanaman penting seperti jagung (Zea mungkin)dan jelai (Hordeum vulgare) (
Stadler, 1928). Stadler menunjukkan bahwa iradiasi benih yang direndam tidak hanya dapat meningkatkan
jumlah mutasi dibandingkan dengan benih kering, tetapi juga bahwa laju mutasi bergantung secara linier pada
dosis mutagen fisik yang diterapkan (Kharkwal, 2012). Pada tahun 1940-an, lebih banyak bukti ilmiah
dikumpulkan mengenai efek mutagenik radiasi elektromagnetik pada tanaman. Perlu disebutkan bahwa varietas
tanaman komersial pertama yang dihasilkan melalui iradiasi adalah tembakau Klorina yang menunjukkan kualitas
daun yang lebih baik untuk meningkatkan produksi cerutu (Konzak, 1957).
Meskipun bukti ilmiah mengenai efek mutagen kimia mulai muncul pada awal abad ke-20,
penggunaan mutagenesis kimia untuk meningkatkan frekuensi mutasi genetik baru menjadi lebih
sistematis pada tahun 1940an (Gustafsson, 1960). Investigasi sistematis terhadap efek bahan kimia
dimulai oleh Baur dan Stubbe. Sedangkan Baur mengolah pucuk pucukAntirrhinum spp. dengan
berbagai bahan kimia untuk mempelajari kapasitasnya dalam menginduksi mutasi, Stubbe
mengeksplorasi efek mutagenik dari bahan kimia yang lebih luas dan menunjukkan bahwa beberapa
di antaranya memang dapat meningkatkan laju mutasi. Karya Auerbach dan Rapoport memberikan
pemahaman mendasar tentang efek mutagenik beberapa bahan kimiaD.melanogaster,terutama
bahan kimia alkilasi seperti 1,5-dikloro-3-tiapentana. Rapoport, khususnya, menyediakan data
mengenai efek mutagenik lebih dari 50 bahan kimia yang telah banyak digunakan dalam
mutagenesis tanaman (Sen, 1951; Kharkwal, 2012; Leitao, 2012). Penerapan mutagenesis kimia pada
tanaman pokok segera ditunjukkan oleh Gustafsson dan rekan kerjanya yang menyelidiki efek
mutagenik dari bahan alkilasi pada jelai (Gustafsson, 1960).
Di Eropa hingga tahun 1950-an, sebagian besar pekerjaan mutagenesis tanaman dilakukan di Swedia
dan Jerman dengan penelitian yang dilakukan oleh Gustafsson, Freisleben dan Lein pada jelai (Konzak,
1957). Penerapan teknik mutagenesis acak pada jelai menjadi sangat penting antara tahun 1950an dan
1970an berkat program mutasi Swedia yang dipimpin oleh Gustafsson. Pekerjaan ini memungkinkan
pemilihan varietas jelai yang menunjukkan ciri-ciri agronomi penting seperti karakter klorofil, perawakan
pendek, kekakuan jerami, dan telinga padat (Kharkwal, 2012; Lundqvist, 2014). Pada pertengahan abad
ke-20, mutagenesis tanaman sebagian besar dilakukan dengan menggunakan mutagen fisik, sedangkan
penerapan mutagenesis kimia masih terbatas. Pemuliaan mutasi belum dianggap sebagai metode yang
baik untuk perbaikan tanaman karena induksi mutasi buatan dengan agen fisik dan kimia dianggap
mempunyai efek merusak yang kuat pada bahan tanaman (Mac Key, 1956). Pada tahun-tahun tersebut,
para ilmuwan juga memikirkan apakah mutasi yang diinduksi secara artifisial berbeda dengan mutasi
spontan dan apakah prosesnya cukup ekonomis untuk dimanfaatkan dalam pemuliaan tanaman (Mac Key,
1956; Konzak, 1957). Pada tahun 1950an, sifat mutasi yang sebenarnya belum sepenuhnya dipahami.
Tahun-tahun ini lebih dikhususkan untuk meningkatkan penerapan teknik mutagenesis, khususnya
mengenai pilihan antara agen fisik atau kimia dan penentuan dosis optimal. Efek dari agen mutagenik yang
berbeda diselidiki hanya berdasarkan pengaruhnya terhadap struktur fisik kromosom (Konzak, 1957). Pada
tahun 1960an, mulai terlihat jelas bahwa mutagen kimia dan iradiasi fisik dapat menghasilkan berbagai
jenis perubahan kromosom (Gustafsson, 1960). Selain itu, data mulai bermunculan mengenai fakta bahwa
mutagen fisik dan kimia tidak memiliki kekuatan mutagenik yang sama, beberapa lokus gen bereaksi
dengan cara yang berbeda, dan kombinasi mutagen kimia dan fisik dapat meningkatkan kinerja
perkembangbiakan mutasi pada suatu lingkungan tertentu. spesies (Ehrenberg, 1960).

Pada periode 1950–1970, tidak hanya Amerika dan negara-negara Eropa tetapi juga Argentina, bekas Uni Soviet,
India, Tiongkok dan Jepang, memulai program pemuliaan mutasi yang ambisius pada tanaman. Misalnya, pada awal
tahun 1950-an di Jepang, padi merupakan tanaman pertama yang penting secara agronomis yang mengalami
pemuliaan mutasi dengan menggunakan sumber radiasi yang berbeda (Matsuo, 1962). Di Tiongkok, pembiakan mutasi
pada millet buntut rubah, yang merupakan sereal regional yang penting, dimulai pada tahun 1963 dengan
menggunakan radiasi gamma dan kemudian digunakan secara luas untuk menghasilkan mutasi pada millet buntut
rubah selama 20 tahun berikutnya (Diao dan Jia, 2017). Di AS, bukti bahwa kerusakan DNA yang disebabkan oleh radiasi
sinar-X dapat dimanfaatkan untuk mentransfer ketahanan terhadap penyakit dari varietas liar ke varietas yang
dibudidayakan muncul ketika beberapa percobaan menunjukkan bahwa ketahanan terhadap karat daun dari varietas
yang dibudidayakan muncul.Aegilops umbellulatadapat diperkenalkan pada gandum (Triticum aestivum) (Konzak, 1957).
Di Argentina, pendekatan serupa diterapkan untuk memisahkan sifat-sifat agronomi yang terkait erat dengan
menggunakan zat pengion yang mampu menginduksi kerusakan DNA. Misalnya saja resistensi terhadapPuccinia
mahkota avenaedan kerentanan terhadapKemenangan Helminthosporiumpatogen dalam oat telah dipisahkan dengan
menggunakan radiasi pengion (Favret, 1960). Tidak hanya tanaman pangan, tanaman hias juga mengalami mutasi
pemuliaan. Di Belanda, varietas tulip dengan mutan warna bunga yang dikembangkan melalui iradiasi sinar-X pada umbi
dilepaskan pada tahun 1949. Lebih banyak varietas dikembangkan pada tahun-tahun berikutnya, ketika varietas tulip
lain dilepaskan pada tahun 1954 dan varietas anyelir pada tahun 1962 (Ibrahim dkk., 2018).
Pada awal tahun 1960-an, pemuliaan mutasi mulai muncul sebagai alat yang ampuh untuk menginduksi
variasi genetik tidak hanya pada tanaman yang diperbanyak secara seksual tetapi juga pada tanaman yang
diperbanyak secara vegetatif dan data terakumulasi mengenai penerapan mutagen fisik untuk menginduksi
mutasi pada beberapa tanaman yang penting secara ekonomi. Misalnya percobaan yang menjelaskan penerapan
iradiasi sinar-X pada kentang,Krisandan umbi bunga mulai terakumulasi, serta eksperimen baru yang
menunjukkan penerapan mutagen fisik pada pohon buah-buahan yang diiradiasi menggunakan sumber60
Bersama (Nybom, 1961).
Dalam upaya mengoordinasikan upaya pembiakan mutasi di antara berbagai negara dan
lembaga, Pusat Teknik Nuklir Pangan dan Pertanian Gabungan FAO/IAEA didirikan pada tahun 1964.6
Sejak itu, jumlah varietas tanaman yang bermutasi terus meningkat setidaknya hingga tahun 1980-an
ketika teknologi baru dan lebih maju dalam biologi molekuler tersedia. Hingga saat ini, lebih dari
3.200 varietas tanaman yang dihasilkan melalui pendekatan mutagenesis terdaftar di database FAO/
IAEA dan lebih dari separuh varietas yang terdaftar berasal dari padi (Oryza sativa), jelai (H. vulgare),
Krisanspp., gandum (Tritikumspp.), kedelai (glisin maks)dan jagung (Zea may) (Jankowicz-Cieslak dan
Hingga, 2016b; Jankowicz-Cieslak dkk., 2016b; Spencer-Lopes dkk., 2018; FAO/IAEA, 2020).
4.2. Mengatasi ToR1: untuk memberikan penjelasan lebih rinci tentang teknik mutagenesis
acak sebagaimana diterapkansecara alamiDansecara in vitro
4.2.1. Teknik mutagenesis acak apa yang digunakan untuk memperoleh tanaman mutan?
4.2.1.1. Pemuliaan mutasi: ringkasan langkah-langkah utama
Penerapan teknik mutagenesis fisik dan kimia dalam pemuliaan mutasi terutama terdiri dari tiga langkah.
Langkah 1 adalah induksi mutasi acak pada genom tanaman, langkah 2 adalah penyaringan mutan yang
diperoleh untuk mengidentifikasi fenotipe yang diinginkan, dan terakhir, langkah 3 adalah seleksi karakteristik
yang diinginkan (Jankowicz-Cieslak et al., 2016a). Berbagai teknik mutagenesis yang diterapkan dalam pemuliaan
mutasi (Langkah 1) dijelaskan secara lebih rinci pada bagian di bawah ini. Mengenai langkah 2, penyaringan
mutan yang diperoleh dengan teknik tersebut dapat mengikuti pendekatan genetik 'maju' atau 'terbalik' (Lee et
al., 2014). Pendekatan genetika ke depan didorong oleh fenotipe karena pertama-tama terdiri dari evaluasi
langsung terhadap fenotipe tanaman yang mengalami mutagenisasi (misalnya kelainan klorofil dan daun, tinggi
batang, jumlah biji, dll.) yang diikuti dengan identifikasi mutasi yang menyebabkan fenotipe tersebut. yang dapat
dibantu dengan metode molekuler, seperti penanda berbasis reaksi berantai polimerase (PCR). Sebaliknya,
pendekatan genetika terbalik pertama-tama terdiri dari mengidentifikasi mutasi spesifik urutan dan kemudian
mengkarakterisasi fenotipe yang disebabkan oleh mutasi tersebut. Misalnya, identifikasi mutasi spesifik urutan
dapat dicapai dengan mengeksploitasi DNA heteroduplex yang terbentuk antara tipe liar dan fragmen DNA yang
bermutasi dalam prosedur yang disebut Targeting Induction Local Lesions in Genomes (TILLING) (Tadele et al.,
2010 ; Sampai
6http://www-naweb.iaea.org/nafa/about-nafa/Joint-FAO-IAEA-History.html

dkk., 2012; Lee dkk., 2014). Terakhir, setelah pemuliaan mutasi pada langkah 3, tanaman yang membawa mutasi yang
diinginkan memasuki program seleksi kompleks yang bertujuan untuk memasukkan mutasi tersebut ke dalam varietas
tanaman yang dibudidayakan/komersial dan menghilangkan mutasi lain yang tidak diinginkan (Spencer-Lopes dkk.,
2018).
4.2.1.2. Pertimbangan umum tentang teknik mutagenesis acak in vivo dan in vitro pada tanaman
Mutagenesis acak teknik, termasuk fisik (Bagian4.2.1.3) Dan bahan kimia

(Bagian4.2.1.4) mutagenesis, dapat diterapkan pada berbagai bahan tanaman. Teknik-teknik ini dapat
digunakan untuk mengolah bahan tanaman seperti tanaman utuh, biji, umbi, rimpang, batang, tunas,
umbi, serbuk sari, eksplan daun dan batang, antera, embrio, mikrospora, kalus, kultur sel dan propagul
tanaman lainnya (Suprasanna et al. ., 2014;Bado dkk., 2015). Benih merupakan bahan pilihan pada spesies
yang diperbanyak secara seksual karena mudah ditangani dalam jumlah banyak, mudah diangkut dan
disimpan, terutama setelah perlakuan (Bado et al., 2015). Menurut definisi yang diberikan di latar belakang
dokumen ini (Bab1.1),secara in vitropengobatan sel tumbuhan akan diikuti dengan regenerasi seluruh
tumbuhan.
Penerapan teknik mutagenesis acak pada bahan tanamansecara in vitromenawarkan beberapa keunggulan
dibandingkan dengan aplikasisecara alami,seperti keseragaman perlakuan dan kemungkinan penerapan agen selektif
dengan lebih mudah, menyaring populasi besar dalam ruang yang relatif kecil, dan menangani bahan tanaman bebas
penyakit (Suprasanna et al., 2012). Selain itu, variasi somaklonal, yang didefinisikan sebagai keragaman genetik yang
diamati pada keturunan tanaman yang diregenerasi dari kultur jaringan, juga dapat dimanfaatkan untuk meningkatkan
keragaman genetik dalam populasi sel. Variasi somaklonal dapat digabungkan dengan teknik mutagenesis acak bila
diterapkansecara in vitrountuk lebih meningkatkan frekuensi mutasi (Supasanna et al., 2014). Dibandingkan dengan
secara alamimutagenesis, mutagenesis acak dilakukansecara in vitropada kultur sel tanaman dapat memfasilitasi
pemilihan beberapa sifat agronomi seperti misalnya toleransi terhadap herbisida, garam, logam, banjir, dingin dan
kekeringan, atau pemilihan mutasi embriogametofit yang mematikan pada tanaman yang dapat direproduksi secara
aseksual (Suprasanna et al. , 2014).
Terlepas dari metode yang digunakan dalam mutagenesis acak, chimerisme dapat mempengaruhi tanaman yang
diperoleh dari jaringan tanaman yang dimutasi. Chimerisme didefinisikan sebagai 'perbedaan sektoral dalam suatu
mutan, dimana sel-sel dari genotipe berbeda berada berdampingan dalam jaringan tanaman individu yang sama' (Mba,
2013). Tanaman yang diperbanyak secara seksual dan aseksual (vegetatif) yang diregenerasi dari bahan yang diberi
mutagen kimia atau fisik atau kombinasi keduanya akan menunjukkan chimerisme. Namun, chimerisme dapat
dihilangkan pada tanaman yang diperbanyak secara seksual dengan melakukan selfing atau persilangan. Hal ini tidak
dapat dicapai pada tanaman yang diperbanyak secara vegetatif dimana keadaan chimerisme genetik jaringan tetap
berada pada latar belakang genetik pada langkah perbanyakan berikut. Namun, teknik telah dikembangkan untuk
mengatasi keterbatasan ini dan untuk meningkatkan homogenitas genetik dari bahan yang diolah. Memang,
chimerisme dapat diatasi dengan menggunakansecara in vitromutagenesis acak ketika seluruh tanaman diregenerasi
dimulai dari satu sel yang mengalami mutagenisasi, sehingga memanfaatkan karakteristik totipotensi sel tanaman.
Misalnya, pendekatan ini digunakan pada pisang danKrisan (Datta dan Chakrabarty, 2009; Christov dkk., 2014; Jankowicz-
Cieslak dan Hingga, 2016a). Dalam hal ini, chimerisme dapat dihilangkan.
Heterozigositas lokus yang bermutasi merupakan aspek penting lainnya dalam mutagenesis acak (Mba, 2013).
Memang benar, sebagian besar mutasi yang dihasilkan berada dalam keadaan heterozigot (yaitu untuk
organisme diploid, hanya satu salinan dari dua alel yang bermutasi). Hal ini dapat menimbulkan masalah ketika
fenotipe hanya muncul ketika mutasi berada dalam keadaan homozigot. Keterbatasan ini dapat diatasi dengan
melakukan selfing pada tanaman yang diperbanyak secara seksual. Selain itu, induksi haploid ganda (DH), ketika
seluruh tanaman diregenerasi dari penggandaan jumlah kromosom sel gamet, serbuk sari, dan sel telur, dapat
dimanfaatkan untuk mengatasi masalah heterozigositas lokus yang bermutasi setidaknya secara seksual.
tanaman yang diperbanyak (Mba, 2013). Kemungkinan untuk menggabungkan sistem DH dengan teknik
mutagenesis dapat mewakili keuntungan yang dapat menghemat waktu dan tenaga dalam memilih galur
pemuliaan murni yang mengandung mutasi pada tahap homozigot (Maluszynski et al., 2009). Namun,
penggunaan garis DH terbatas pada spesies tanaman yang telah menggunakan metode tersebut, seperti
manipulasi antera dan mikrospora.secara in vitro,penggunaan hibridisasi luas, dan kultur ovarium dan bakal biji
(Maluszynski et al., 2009). Dalam beberapa tahun terakhir, para peneliti telah mengembangkan mutagenesis
haploid untuk banyak spesies tanaman termasuk gandum, triticale, jagung,Brassica napus,lumut hati dan
tembakau (Shen et al., 2015). Namun, sifat mutasi yang resesif dan heterozigositas lokus yang bermutasi masih
menimbulkan masalah bagi tanaman yang diperbanyak secara vegetatif.

4.2.1.3. Teknik mutagenesis fisik diterapkan dalam pemuliaan mutasi

Mutagenesis fisik terdiri dari penerapan mutagen fisik termasuk radiasi pengion dan non-pengion
untuk menghasilkan mutasi pada bahan tanaman. Paparan terhadap mutagen fisik dapat bersifat kronis,
akut, atau terfraksinasi. Pada paparan kronis, bahan tanaman terkena radiasi dengan dosis yang relatif
rendah untuk jangka waktu yang lama (berminggu-minggu atau berbulan-bulan). Sebaliknya pada paparan
akut, bahan tanaman terkena radiasi dosis tinggi dalam waktu singkat (detik atau menit) (Mba et al., 2010).
Pendekatan fraksinasi terdiri dari penyinaran bahan tanaman pada interval waktu yang berbeda untuk
memungkinkan bahan pulih di antara perlakuan (Kodym et al., 2012; Bado et al., 2015). Meja2 merangkum
agen fisik yang biasa digunakan untuk mutagenesis acak pada tanaman.
X- danC-sinar adalah radiasi pengion yang paling banyak digunakan dalam mutagenesis acak. Sumber radiasi
yang digunakan untukC-sinar adalah60Bersama atau135Cs dan pada tingkat lebih rendah239Pu yang dapat
digunakan dalam peralatan yang terkandung dalam kondisi laboratorium (yaitu iradiator sel gamma) atau di
lapangan (yaitu ruang atau ruang gamma, lapangan, atau rumah kaca) (Mba, 2013; Riaz dan Gul, 2015). Untuk
radiasi non-pengion, penyinaran dengan sinar UV merupakan metode yang paling banyak digunakan. Namun,
penggunaan pengobatan UV dalam mutagenesis acak lebih terbatas dibandingkan dengan X- danC-sinar karena
sinar UV dapat menembus bahan tanaman pada tingkat yang lebih rendah dibandingkan dengan radiasi pengion
lainnya (Bado et al., 2015). Dalam spektrum radiasi UV, sinar UV-C adalah yang paling sering digunakan untuk
mengobati sel (Riaz dan Gul, 2015; Spencer-Lopes et al., 2018). Pengeboman neutron cepat (FNB) juga menjadi
mutagen fisik yang populer. FNB biasanya menyebabkan penghapusan kromosom yang lebih besar, hilangnya
kromosom dan translokasi pada genom tanaman dibandingkan dengan C-sinar yang biasanya menyebabkan
penghapusan lebih kecil (Riaz dan Gul, 2015). Berkas ion, terutama dihasilkan oleh akselerator partikel
menggunakan20Tidak,14N,12C,7Li,40Atau56Fe sebagai sumber radioisotop mulai mendapat perhatian pada awal
tahun 1990an di Tiongkok dan Jepang. Spektrum mutasi yang dihasilkan oleh berkas ion seharusnya berbeda
dengan yang disebabkan oleh X- danC-sinar karena yang pertama memiliki transfer energi linier yang tinggi
dibandingkan dengan yang terakhir (Magori et al., 2010; Mba, 2013; Suprasanna et al., 2014). Partikel alfa, yang
dianalogikan dengan inti helium, memiliki kemampuan penetrasi yang lebih terbatas dibandingkan denganB-
partikel yang dihasilkan oleh3H,32P dan35S. Iradiasi denganB-partikel dapat dicapai dengan pemberian32P dan35S
ke tanaman yang sedang tumbuh diikuti dengan penggabungan isotop radioaktif ini ke dalam inti sel. Namun
dosis iradiasi dariB- partikel sulit diperkirakan dibandingkan dengan X- danC-radiasi dan karenanya
penerapannya lebih terbatas (Mba, 2013; Spencer-Lopes et al., 2018). Radiasi kosmik juga telah digunakan untuk
membuat mutagenisasi tanaman tetapi hanya dalam kondisi vakum atau gayaberat mikro di luar angkasa.
Meskipun tidak mudah diakses, pendekatan ini digunakan untuk menghasilkan puluhan varietas komersial padi,
gandum, kapas, wijen, lada, tomat, wijen dan alfalfa (Tanaka dan Hase, 2010; Suprasanna et al., 2014).
Pemilihan bahan tanaman yang akan diiradiasi bervariasi tergantung pada spesies tanaman yang akan
dimutagenisasi. Benih umumnya digunakan untuk tanaman yang diperbanyak dengan benih (misalnya
padi) sedangkan propagul/eksplan tanaman (misalnya yang membawa jaringan meristematik) diperlukan
untuk tanaman yang diperbanyak secara vegetatif (misalnya singkong) (Mba dkk., 2010) (lihat Bagian4.2.1.2
). Dosis radiasi optimal bergantung pada spesies dan genotipe yang dipertimbangkan (Lee et al., 2014).
Dalam mutagenesis fisik, dosis serap saat ini diukur dalam warna abu-abu (Gy) yang setara dengan 1 Joule
per kg bahan yang diolah (1 Gy = 1 J kg-1) (Spencer-Lopes dkk., 2018). Aturan umumnya adalah menerapkan
dosis iradiasi yang menghasilkan dosis mematikan 50% bahan yang diolah (LD50) atau pengurangan
pertumbuhan sebesar 30–60% (GR30-60) dari materi perawatan di M1 (Mba, 2013; Bado et al., 2015).
Optimalisasi dosis dapat dicapai dengan menilai beberapa indikator kinerja tanaman seperti persentase
perkecambahan, kelangsungan hidup bibit, kejadian kelainan klorofil, laju pertumbuhan dan ukuran relatif
bagian tanaman tertentu (Lee et al., 2014). Secara umum, radiosensitivitas (yaitu kerentanan bahan yang
diolah terhadap radiasi pengion) dapat diperkirakan dengan mengukur beberapa parameter seperti
penurunan perkecambahan biji atau tinggi bibit, tingkat penyimpangan kromosom, tinggi, lebar dan
jumlah tunas atau daun. , sterilitas tanaman M1, dan frekuensi mutasi yang diinduksi (Datta, 2014).
Radiosensitivitas juga bergantung pada genotipe spesies (ploidi), ukuran benih, tahap perkembangan sel,
umur jaringan yang diiradiasi, metode penyimpanan setelah iradiasi, kadar oksigen, keberadaan bahan
kimia lain, suhu dan kandungan air. Kandungan air, khususnya, adalah salah satu aspek terpenting yang
mempengaruhi hasil mutagenesis fisik (Datta, 2014). Radiosensitivitas juga bergantung pada volume
kromosom interfase (ICV) yang 'didefinisikan sebagai volume inti dibagi dengan jumlah kromosom,
kandungan DNA, dan tingkat ploidi'; nilai ICV yang tinggi biasanya berkorelasi dengan peningkatan
sensitivitas terhadap mutagen fisik (Kodym et al., 2012).

4.2.1.4. Teknik mutagenesis kimia diterapkan dalam pemuliaan mutasi

Mutagenesis kimia terdiri dari penerapan bahan kimia untuk menghasilkan mutasi pada genom
tanaman. Daftar mutagen kimia antara lain meliputi zat alkilasi, zat interkalasi, dan analog basa (Mba
et al., 2010). Meja3merangkum agen kimia yang biasa digunakan untuk mutagenesis acak pada
tanaman.
Mutagen kimia yang paling banyak digunakan dalam pemuliaan mutasi adalah etil metanasulfonat
(EMS), metilnitrosourea (MNU), 1-etil-1-nitrosourea (ENU) dan natrium azida (SA). MNU dan SA sering
digunakan dalam kombinasi (Leitao, 2012; Riaz dan Gul, 2015). Sedangkan untuk mutagen fisik, juga untuk
mutagen kimia harus ditentukan dosisnya yang tepat. Dosis biasanya setara dengan konsentrasi bahan
kimia per durasi pengobatan (Spencer-Lopes et al., 2018). Konsentrasi bahan kimia dan waktu pemaparan
bervariasi tergantung pada bahan kimia itu sendiri dan bahan tanaman/spesies tanaman yang
dipertimbangkan. Evaluasi LD50pada generasi M1 dapat dianggap sebagai proksi terbaik untuk mengukur
jumlah mutagen yang akan digunakan (Lee et al., 2014). Juga, suhu (biasanya dalam kisaran 20–25°C)
merupakan parameter penting untuk dipertimbangkan dalam mutagenesis kimia (Mba et al., 2010;
Spencer-Lopes et al., 2018). PH larutan yang digunakan untuk melarutkan mutagen kimia harus netral atau
sedikit asam (pH 6–7) untuk mengurangi penguraian mutagen itu sendiri. Secara keseluruhan, konsentrasi
bahan kimia, waktu paparan dan pH harus disesuaikan tergantung pada bahan kimia dan jaringan
tanaman yang akan diberi perlakuan (Leitao, 2012).
Bahan tumbuhan yang berbeda dapat digunakan dalam mutagenesis kimia, mulai dari tumbuhan utuh hinggasecara
in vitro kultur sel. Benih mewakili bahan tanaman yang paling banyak digunakan untuk mutagenesis kimia (Leitao, 2012).
Namun, itusecara in vitroPenerapan mutagen pada eksplan menjadi lebih umum dalam beberapa tahun terakhir
sehingga memberikan beberapa alat yang berguna untuk mutagenesis pada tanaman yang diperbanyak secara
vegetatif, terutama untuk mengatasi chimerisme (Jankowicz-Cieslak dan Till, 2016a) (lihat bagian4.2.1.2). Bahan tanaman
sebaiknya berada dalam tahap pertumbuhan aktif. Bahan kayu atau bahan tanaman yang ditandai dengan lapisan tebal
mungkin tahan terhadap perlakuan kimia karena mutagen mungkin tidak dapat menembus jaringan secara efisien
(Spencer-Lopes dkk., 2018). Memang benar, tergantung pada bahan tanaman yang digunakan (benih, bibit tanaman,
tunas, dll.), mutagen kimia harus mencapai meristem apikal dan/atau ketiak untuk menginduksi mutasi agar dapat
diteruskan ke generasi berikutnya. Selain itu, mutagen kimia mungkin terpengaruh oleh degradasi selama waktu
inkubasi. Dalam hal ini untuk menghindari penurunan khasiat, pembaharuan larutan perendaman mungkin diperlukan
(Leitao, 2012).
Meja 2: Daftar agen fisik yang umum digunakan dalam mutagenesis fisik (Maluszynski et al.,
2009, 2016; Magori et al., 2010; Leitao, 2012; Bado et al., 2015; Suprasanna et al., 2015;
Spencer-Lopes et al. , 2018)
Agen fisik Singkatan Jenis Sumber

C-sinar – Ionisasi 60Bersama –137Cs
sinar X – Ionisasi Tabung sinar-X dengan anoda silinder

sinar UV – Non-pengion lampu UV
proton – Ionisasi Akselerator partikel
Radiasi kosmik
Neutron cepat FNB Ionisasi Reaktor nuklir/tumpukan atom
pengeboman
A-partikel – Ionisasi Radionuklida32P
B-partikel – Ionisasi Isotop radioaktif7Menjadi
berkas ion IBR Ionisasi 20Tidak,14N,12C,7Li,40Ar, Dia, H, Si atau56Fe sebagai sumber
radiasi radioisotop yang dipercepat oleh siklotron/sinkronisasi

Tabel 3: Daftar bahan kimia yang umum digunakan dalam mutagenesis kimia (Maluszynski et al., 2009,
2016; Magori et al., 2010; Leitao, 2012; Bado et al., 2015; Suprasanna et al., 2015; Spencer-
Lopes et al. , 2018)
Mutagenesis kimia
Bahan kimia Singkatan Jenis
Etil metanasulfonat EMS alkilasi
N-etil-N-nitrosourea ENU (ENH) alkilasi
N-metil-N-nitrosourea MNU (MNH) alkilasi
Etilenamin EI alkilasi
Dietil sulfat DES alkilasi
N-metil-N1-nitro-N- MNNG alkilasi
nitrosoguanidin
1-etil-2-nitro-1-nitrosoguanidin ENNG alkilasi
Dimetil sulfat DMS alkilasi
Metil metanasulfonat MMS alkilasi
T,T-Amida dietilnitro NDEA alkilasi
T,T-Amida dimetilnitrat NDMA alkilasi
Diepoksibutana DEB alkilasi
Natrium azida SA Mutagenesis dimediasi oleh zat antara organik (L-
azidoalanine)
Analog basa (misalnya 5- – Analog dasar
bromouracil, 5-bromo-deoxyuridine)
Agen interkalasi (misalnya etidium – Agen interkalasi DNA

bromida, acridines)
4.2.1.5. Contoh aplikasi mutagenesis acak in vivo dan in vitro pada tanaman
Ribuan varietas tanaman dengan sifat agronomi yang dimodifikasi telah diperoleh melalui
pemuliaan mutasi pada abad ke-20. Sebagian besar kultivar mutan dihasilkan melalui mutagenesis
fisik karena mutagen fisik adalah yang pertama dipelajari dan diterapkan dalam pemuliaan mutasi.
Namun, mutagenesis kimia telah banyak digunakan dalam beberapa tahun terakhir. Dalam bab ini
dijelaskan beberapa contoh yang diambil dari hasil penelusuran literatur.
Varietas tanaman pokok yang penting telah dikembangkan melalui program pemuliaan mutasi. Beras
(O.sativa)mutan diciptakan oleh mutagenesis fisik dan kimia selama beberapa dekade terakhir. Misalnya,secara in
vitromutagenesis kimia digunakan untuk mengolah kepala sari padi dengan EMS, varietas padi dengan aktivitas
amilase yang meningkat dihasilkan oleh aplikasi SA, dan perlakuan kalus padi dengan EI digunakan untuk
mengisolasi mutan tanaman yang meningkatkan ketahanan terhadap ledakan padi (Ryu et al., 2003; Riaz dan Gul,
2015). Penerapan mutagenesis fisik sepertiC-sinar dalam kisaran 50–350 Gy, radiasi berkas ion menggunakan
karbon dan neon dalam kisaran 20–50 Gy, dan bombardir neutron cepat pada 20 Gy memungkinkan pemilihan
mutan padi dalam perkembangan dan metabolisme tanaman, dalam kualitas industri dan nutrisi, dalam toleransi
stres biotik dan abiotik, dan toleransi herbisida (Mba et al., 2010; Viana et al., 2019). Menariknya,secara alami
mutagenesis acak benih padi juga dilakukan dengan kombinasi fisik (C-sinar) dan mutagen kimia (EI) untuk
meningkatkan persentase mutan klorofil pada padi (Ando, 1968; Riaz dan Gul, 2015). Di Jepang, puluhan varietas
padi mutan telah didaftarkan sejak kultivar padi mutan semi-kerdil pertama 'Reimei', yang dikembangkan dengan
radiasi gamma, dirilis pada tahun 1968. Varietas mutan padi penting lainnya termasuk padi 'LGC-1', yang
dikembangkan oleh mutagenesis kimia (EI), yang mengandung sedikit gluten yang dapat dicerna dan banyak
prolamin yang tidak dapat dicerna. Variasi nasi ini bermanfaat bagi pasien yang membutuhkan diet rendah
protein (Nakagawa, 2009). Mutan padi lainnya, termasuk warna daun, asam fitat rendah, embrio raksasa, dan
mutan pati resisten tinggi, juga telah dikembangkan melalui penerapan mutagen fisik (terutamaC-sinar dan
berkas ion) terkadang dikombinasikan dengansecara in vitroteknik budaya. Beberapa dari mutan padi ini telah
digunakan dalam program hibridisasi dengan varietas padi elit (Amano, 2006).
Jelai (H. vulgare)tidak hanya merupakan salah satu tanaman pertama yang mengalami perbaikan
sifat agronomi melalui pemuliaan mutasi, namun juga telah digunakan sebagai tanaman model
untuk menguji pengaruh mutagen fisik dan kimia sejak awal abad ke-20. Misalnya saja biji jelai

telah dikenaisecara alamimutagenesis acak untuk membandingkan efek fisik (C-sinar matahari dan FNB)
dan mutagen kimia (EMS) untuk menginduksi mutan yang kekurangan klorofil (Constantin, 1975). Penulis
menyimpulkan bahwa perbedaan yang diamati mungkin terkait dengan pemulihan dan deteksi, bukan
proses induksi mutasi. Pada jelai, penggunaan mutagen fisik seperti sinar-X berkontribusi pada
pengembangan dan seleksi varietas mutan dengan ciri-ciri agronomi yang penting, misalnya paku padat
(kultivar 'Pallas' dirilis pada tahun 1958) dan mutan berumur awal (kultivar 'Mari' dirilis pada tahun 1960)
(Lundqvist, 2009).
Selada (Laktuca sativa),yang merupakan salah satu sayuran segar yang paling banyak dikonsumsi, juga
terkena dampaknyasecara alamimutagenesis acak. Benih selada diberi perlakuan dengan mutagen kimia (EMS)
untuk menghasilkan mutasi ganda berbunga awal dan kerdil yang disilangkan dengan kultivar 'Salinas'. Kultivar
yang dihasilkan 'Ice Cube', 'Blush' dan 'Mini-Green' kini tersedia di pasaran. Biji selada juga dimutagenisasi
menggunakan agen fisik (C-sinar dan FNB) untuk mengidentifikasi gen yang terlibat dalam resistensi penyakit
embun tepung (Mou, 2011). Benih dari paprika (Capsicum tahunan)kultivar juga dimutagenisasi menggunakan
bahan kimia (EMS) dan fisik (C-sinar) mutagen untuk memperoleh varietas yang mempunyai kebiasaan tertentu,
kekurangan antosianin, perubahan bentuk dan posisi buah, serta mengembangkan hibrida dengan peningkatan
B-kandungan karoten (Tomlekova et al., 2009).
Meskipun tanaman yang mengalami mutagenesis acak kurang terwakili, tanaman yang diperbanyak secara vegetatif
juga mengalami program pemuliaan mutasi. Tebu (Sakarum spp.), misalnya, merupakan spesies yang sulit untuk
dibiakkan dan pengembangan varietas baru dengan sifat yang lebih baik mungkin memerlukan waktu hingga 12–15
tahun. Untuk alasan ini,secara in vitromutagenesis acak menggunakan bahan kimia (EMS) dan fisik (C-sinar) agen yang
diterapkan pada perbanyakan mikro jaringan meristematik dan kultur sel jaringan telah terbukti berhasil.Secara in vitro
mutagenesis tebu memungkinkan pengembangan varietas dengan sifat-sifat yang ditingkatkan seperti ketahanan
terhadap api, toleransi terhadap garam, peningkatan sifat-sifat agronomi seperti kadar gula, jumlah tebu yang dapat
digiling, ketebalan dan hasil (Suprasanna et al., 2011; Devarumath et al., 2015). Kentang (Solanum tuberosum)juga
merupakan tanaman yang diperbanyak secara vegetatif karena genetika dan biologinya yang membatasi program
persilangan.Secara in vitromutagenesis acak kentang membantu menciptakan varietas yang toleran terhadap garamC-
sinar (Kiunga et al., 2014).
Kacang-kacangan juga mengalami mutagenesis kimia dan fisik untuk meningkatkan sifat-sifat agronomi yang
penting. Misalnya saja biji kacang hijau (vigna radiata)diperlakukan dengan kimia (EMS dan SA) dan fisik (C-sinar) agen
untuk mendapatkan mutan pada sifat-sifat agronomi utama seperti tinggi tanaman, umur berbunga dan masak, hasil
benih dan morfologi daun. (Auti dan Apparao, 2009; Wani dkk., 2014). buncis (Cicer arietinum),tanaman yang melakukan
penyerbukan sendiri dengan kompatibilitas seksual yang sangat terbatas dengan sebagian besar genotipe liar, juga
diperlakukan dengan mutagen fisik dan kimia yang berbeda untuk memperbaiki susunan genetiknya dan untuk memilih
mutan dalam kandungan klorofil dan morfologi tanaman, dalam kandungan protein dan mineral benih, dan dalam
kandungan rendah. tingkat faktor anti nutrisi (Rafiq Wani et al., 2014). FNB digunakan dalam model kacang-kacangan
truncatula Medicagountuk membuat lebih dari 1.50.000 galur mutan untuk mempelajari aspek-aspek penting dalam
famili kacang-kacangan seperti fiksasi nitrogen secara simbiosis dan perkembangan bintil (Chen dan Chen, 2018).
Kedelai (G.maks)telah mengalami mutagenesis acak menggunakan EMS dan sinar-X untuk menghasilkan populasi mutan
untuk disaring menggunakan pendekatan TILLING yang membantu mengidentifikasi gen yang terlibat dalam kontrol
kematangan dan metabolisme asam lemak (Anai, 2011).
Mutagenesis acak juga telah diterapkan pada pohon buah-buahan yang penting secara agronomi sepertiJeruk
spp., tumbuhan tahunan yang mempunyai siklus reproduksi panjang dan perbanyakan utamanya secara
vegetatif. BerbedaJerukspp. bahan tanaman (biji, tunas, kalus, protoplas, bibit muda yang dipenggal, ruas epikotil,
ujung pucuk yang dicangkok mikro) telah mengalami keduanya.secara alamiDansecara in vitro mutagenesis acak
sebagian besar menggunakan mutagen fisik (X- danC-sinar, dan neutron termal). Ciri-ciri agronomi yang
diperoleh terutama berkaitan dengan berkurangnya jumlah biji buah, ketahanan terhadap penyakit, perbaikan
warna buah, perubahan waktu panen buah dan tinggi tanaman (Latado et al., 2012).
Secara in vitromutagenesis acak telah banyak digunakan juga pada tanaman hias seperti
Orchidaceae.Secara in vitrotubuh mirip protocorm yang dikultur terkena dosis radiasi gamma yang
berbeda tergantung pada spesies yang berbeda (Sheela dan Sheena, 2014).secara alamiDansecara in
vitromutagenesis acak juga diterapkan pada tanaman hias lain sepertianthuriummenggunakan fisik (
C-sinar) dan mutagen kimia (EMA) untuk mengolah benih dan planlet (Sheela dan Sheena, 2014).
Mutagenesis tanaman hias dalam jumlah besar diperoleh melalui mutagenesis acak, antara lain
mutan pada warna dan bentuk bunga, serta variegasi klorofil pada daun pada genus dan spesies
seperti Bougainvillea, Krisan, Gladiol, Hibiscus rosa-sinensisCV. Kecantikan Alipur,Portulaca abadi,
Polianthus tuberosus,mawar,Lantana depresidan banyak lainnya (Banerji, 2014; Christov dkk., 2014).
Spesies tanaman yang merupakan sumber penting produksi biofuel telah mengalami mutasi pembiakan.
Misalnya,Jarak pagarkeduanya telah dimutagenisasisecara alamiDansecara in vitromenggunakan

baik fisik (X- atauC-sinar) dan mutagen kimia (EMS) untuk mengolah benih dan stek batang (Maghuly et al., 2016).
BerbedaJ.curcasmutan diperoleh dengan teknik mutagenesis acak termasuk varian tinggi dan kerdil,
percabangan tinggi, hasil buah dan minyak tinggi, serta varian hasil biomassa tinggi (Christov et al., 2014).
Mutagenesis kimia dan fisik juga telah digunakan untuk menghasilkan tanaman yang akan digunakan dalam
fitoremediasi. Contohnya termasukBrassica junceatoleran dalam memimpin,H.vulgaretoleran terhadap
aluminium,Pisum sativumtoleran terhadap kadmium danHelianthus anusL. toleran terhadap seng dan kadmium
(Phang et al., 2012).
4.2.2. Apakah semua teknik ini dapat diterapkan keduanyasecara alamiDansecara in vitro?
Semua teknik ini dapat diterapkan pada keduanyasecara alamiDansecara in vitro.Informasi yang disediakan di
Bagian4.2.1menggambarkan bagaimana teknik mutagenesis acak, yang meliputi mutagen kimia dan fisik tercantum
dalam Tabel2Dan3, semuanya bisa diaplikasikan pada bahan tanaman keduanyasecara alamiDansecara in vitro
pengaturan meskipun dosis, waktu pemaparan, dan protokol eksperimental keseluruhan mungkin berbeda. Selain itu,
beberapa contoh juga diberikan di Bagian4.2.1.5untuk menunjukkan bahwa teknik mutagenesis kimia dan fisika
memang telah digunakan pada spesies tanaman yang berbedasecara alamiDansecara in vitro.
4.3. Mengatasi ToR3: untuk menilai apakah mekanisme molekuler yang

mendasari teknik mutagenesis acak berbeda jika teknik tersebut
diterapkansecara alamiatausecara in vitro
4.3.1. Apa mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya mutasi?
Semua organisme hidup, termasuk tumbuhan, harus menghadapi mutagen alami yang dapat menyebabkan
perubahan genom dengan memicu kerusakan atau perubahan DNA. Ketika perubahan terdeteksi oleh mesin
perbaikan sel, sel eukariotik memperlambat atau menghentikan siklus sel pada pos pemeriksaan yang tersedia
untuk memperbaiki DNA yang rusak. Memperbaiki kerusakan atau perubahan DNA merupakan proses penting
untuk menjaga stabilitas dan transmisi informasi genetik ke generasi berikutnya. Efisiensi proses perbaikan ini
bervariasi, dan dapat mengakibatkan perbaikan penuh terhadap urutan DNA asli (perbaikan konservatif), atau
lebih rawan kesalahan dan (non-konservatif) mengarah pada perbaikan dengan integrasi perubahan urutan DNA,
yaitu mutasi. Dalam paragraf ini, pertama-tama kita akan meninjau mekanisme dimana mutagen menghasilkan
lesi (pecahan) pada DNA dan kemudian berbagai mekanisme perbaikan sel yang dipicu oleh lesi pada bagian
kedua.
4.3.1.1. Mekanisme yang menyebabkan kerusakan DNA
Kerusakan DNA disebabkan oleh agen fisik
Radiasi pengion termasuk sinar-X,C-sinar, neutron, dan berkas ion berenergi tinggi. Radiasi pengion adalah
mutagen fisik yang paling umum digunakan (Mba, 2013; Navjot et al., 2018; Singer et al., 2021). Radiasi mampu
mengeluarkan elektron dari orbit atom yang terkena, mengubah atom tersebut menjadi ion. Sebagai
konsekuensi dari proses ionisasi, dihasilkan radikal positif bebas dan elektron bebas. Radikal bebas dalam larutan
akan bergabung kembali membentuk produk yang stabil (Spencer-Lopes et al., 2018). Radiasi pengion juga dapat
menyebabkan perubahan DNA secara tidak langsung, melalui radiolisis molekul air, yang menghasilkan radikal
hidroksil (•OH). Radikal ini dapat menyerang basa DNA dan residu gula dengan berbagai cara, sehingga
menimbulkan lesi basa. Selain itu, radikal bebas yang dihasilkan oleh radiasi pengion juga mampu merusak
ikatan fosfodiester, menginduksi pemutusan untai tunggal (SSB) dengan ujung 3' fosfat atau 3' fosfoglikolat,
dibandingkan ujung hidroksil 3' (Chatterjee dan Walker, 2017). Serangkaian SSB yang berdekatan dan pada kedua
untai dapat menimbulkan double stranded break (DSBs) (Barnard et al., 2013). Akibatnya, sinar gamma dapat
menyebabkan penghapusan kecil pada beberapa nukleotida, namun juga dilaporkan adanya penghapusan atau
inversi yang lebih besar (Herna - ndez-Mun~oz dkk.,
2019; Viana dkk., 2019).
Berkas ion menginduksi mutasi pada frekuensi tinggi dan memungkinkan seleksi fenotipe dalam spektrum besar
(Viana et al., 2019). Dibandingkan dengan sinar gamma, berkas ion memiliki transfer energi linier (LTE) yang lebih tinggi,
sehingga menyebabkan penghapusan yang lebih besar, lebih besar dari 1 kb, dan penataan ulang antargenik seperti
inversi, translokasi, dan penyisipan (Viana dkk., 2019).
Sinar UV (250–290 nm) memiliki daya tembus yang lebih rendah dibandingkan dengan radiasi pengion dan, untuk
karakteristik ini, sinar ini terutama digunakan untuk memutagenisasi sel tunggal atau jaringan berlapis tunggal, seperti
spora, kultur sel suspensi, dan butiran serbuk sari (Navjot et al. ., 2018;Spencer-Lopes dkk., 2018). Ada

tiga kelas radiasi UV, UV-C (190–290 nm), UV-B (290–320 nm), dan UV-A (320–400 nm). Sinar UV memicu
pembentukan ikatan kovalen antara dua pirimidin. Ada dua jenis lesi utama yang disebabkan oleh sinar UV:
dimer siklobutana pirimidin (CPD) dan fotoproduk pirimidin (6–4) pirimidon [(6–4) PPs] (Manova dan
Gruszka, 2015). CPD dicirikan dengan memiliki atom karbon C-5 dan C-6 dari dua pirimidin yang berdekatan
(biasanya TT) yang terikat secara kovalen; dalam 6-4 PP, dua posisi karbon yang terkait adalah C-6 dan C-4
dari dinukleotida TC. Dimerisasi menyebabkan distorsi pada geometri heliks, sering kali menyebabkan blok
transkripsi (Manova dan Gruszka, 2015) atau terhentinya replikasi yang harus diatasi dengan mekanisme
perbaikan khusus (lihat di bawah) (Chatterjee dan Walker, 2017 ). Perubahan ini dapat menyebabkan
perubahan nukleotida tunggal, atau mutasi lebih besar yang menyebabkan penataan ulang kromosom
(Shu et al., 2012).
Iradiasi neutron cepat (FN), atau pemboman neutron, juga telah digunakan untuk membuat tanaman menjadi
mutagen. Mutagenesis FN umumnya menghasilkan penghapusan dan translokasi. Neutron Cepat telah dilaporkan
menyebabkan lebih banyak lesi ganda yang tidak dapat diperbaiki dan frekuensi pemutusan DNA untai ganda yang lebih
tinggi, dibandingkan dengan sinar gamma, kemungkinan besar karena kepadatan ion yang lebih tinggi. Mutagenesis
oleh neutron cepat telah dilaporkan pada beberapa spesies. Lesi yang dilaporkan berkisar antara 1 bp hingga 18 Mb,
dengan penghapusan 1-4 kb menjadi yang paling sering (Kumawat et al., 2019).
Kerusakan DNA yang disebabkan oleh bahan kimia
Meskipun banyak senyawa kimia yang mempunyai efek mutagenik, hanya sedikit yang secara rutin digunakan
dalam pemuliaan tanaman.
Agen alkilasi adalah senyawa mutagenik dengan afinitas kuat terhadap basa dan fosfodiester molekul
DNA. Senyawa tersebut mampu mentransfer gugus alkilnya ke molekul DNA yang mengandung gugus
nukleofilik. Ada dua kelompok utama zat alkilasi: senyawa yang termasuk dalam kelompok pertama
menghasilkan zat antara yang reaktif, tidak bergantung pada substrat (DNA), dan mampu mentransfer
gugus alkil ke gugus nitrogen, oksigen, dan fosfat dari senyawa tersebut. molekul DNA. Kelompok kedua
mencakup senyawa yang bereaksi langsung dengan situs paling nukleofilik pada DNA, seperti nitrogen N7
dan N3 dari guanin dan N3 dari adenin.
Agen alkilasi menargetkan 11 lokasi pada empat basa dan gugus fosfodiester molekul DNA. Dari jumlah
tersebut, alkilguanin O6 sangat bersifat mutagenik karena menyebabkan ketidakcocokan dengan timin dan
menimbulkan transisi G:C – A:T. EMS merupakan agen yang paling umum digunakan yang mampu
mengalkilasi posisi O6 (Leitao, 2012). Karakterisasi mutan telah menunjukkan bahwa EMS memiliki bias
urutan residu guanin dalam konteks RGCG, dimana R adalah A atau G dan G yang bermutasi dicetak tebal
(Spencer-Lopes et al., 2018). O4 alkiltimin, lesi yang disebabkan oleh ENU, dapat salah berpasangan dengan
guanin dan menyebabkan transisi A:T – G:C. MMS, agen alkilasi penting lainnya, menginduksi pembentukan
alkilguanin N3 dan alkiladenin N3, yang mengarah pada transversi atau transisi (Leitao, 2012; Singer et al.,
2021).
Secara keseluruhan, agen alkilasi mampu menghasilkan transisi, transversi, penyisipan, penghapusan,
inversi, pemutusan untai tunggal dan ganda DNA, lesi yang serupa dengan yang disebabkan oleh radiasi
pengion (Leitao, 2012).
Natrium azida (NaN3; SA) merupakan senyawa anorganik yang sangat beracun, penghambat proses
pernapasan seluler pada sel hidup (Spencer-Lopes et al., 2018). Natrium azida juga dianggap sebagai pro-
mutagen, karena menghasilkan zat antara reaktif, yang tampaknya tidak berinteraksi langsung dengan DNA, dan
mutasi tersebut dimediasi oleh proses seluler tanaman inang yang terlibat dalam perbaikan eksisi DNA. SA
sebagian besar menyebabkan transisi dari G:C ke A:T, dengan bias konteks yang kuat untuk rangkaian GGR (Viana
et al., 2019).
4.3.1.2. Mekanisme yang mengarah pada perbaikan
Deteksi kerusakan DNA memicu mekanisme perbaikan sel yang dapat mengarah pada pemulihan
urutan aslinya. Namun, keakuratan perbaikan tidak selalu lengkap (100%) dan dapat menyebabkan
perubahan urutan DNA. Jika perubahan urutan tersebut diteruskan ke generasi berikutnya maka akan
terjadi mutasi. Penting untuk diperhatikan bahwa kerusakan DNA dan mekanisme perbaikan sel berturut-
turut yang dijelaskan di bawah ini adalah identik, baik kerusakan tersebut disebabkan oleh peristiwa yang
diinduksi atau spontan.
Pembalikan kerusakan DNA
Beberapa perubahan biasanya diperbaiki dengan jalur bebas kesalahan, yang tidak menyebabkan mutasi dan
dilaporkan di sini hanya untuk kelengkapan. Salah satunya adalah fotoreaktivasi berbasis fotolyase

enzim, digunakan untuk memperbaiki kerusakan akibat sinar UV (Tuteja et al., 2009; Shu et al., 2012; Manova dan
Gruszka, 2015).
Pada mamalia dan bakteri, kerusakan DNA yang disebabkan oleh agen alkilasi ditangani oleh enzim
alkiltransferarase (AGT), yang mentransfer gugus alkil dari oksigen teralkilasi dari basa DNA ke sistein di situs
aktifnya. Pabrik tidak memiliki ortolog AGT dan kemungkinan besar mereka telah mengembangkan mekanisme
alternatif untuk memperbaiki basa teralkilasi (Shu et al., 2012; Manova dan Gruszka, 2015), seperti mekanisme
yang didasarkan pada perbaikan eksisi (lihat di bawah).
Mekanisme perbaikan eksisi

Mekanisme perbaikan eksisi dasar (BER) memperbaiki alkilasi dan jenis kerusakan lainnya yang tidak
menyebabkan distorsi heliks. DNA glikosilase pertama-tama menyebabkan lengkungan pada heliks untuk
membalik basa target di situs katalitiknya. Mereka memutus ikatan N-glikosidik dan menghilangkan residu basa
dari situs tersebut. Perbaikan berlangsung pada langkah berikutnya, di mana situs a-basa dihilangkan dari residu
deoksiribosa-fosfat terminal 5', dan celah tersebut diisi dengan bantuan polimerase dan ligase (Shu et al., 2012).
Lesi besar yang menyebabkan blok transkripsi atau distorsi pada heliks ganda, seperti CPD, 6-4PPs, atau
ikatan silang antara basa komplementer teralkilasi, biasanya diperbaiki melalui jalur perbaikan eksisi
nukleotida (NER) (Shu et al., 2012) . Dua sub-jalur telah diidentifikasi, perbaikan genom global (GGR) dan
perbaikan berpasangan transkripsi (TCR), yang berbeda dalam enzim yang terlibat dalam pengenalan awal
lesi. NER biasanya menghilangkan 20-30 nukleotida yang mengandung lesi dan menggunakan untai asli
sebagai templat untuk menyalin dan mengisi celah tersebut. Enzim penting yang terlibat dalam proses ini
adalah TFIIH, yang juga merupakan komponen holoenzim RNA polimerase I–III, yang memainkan peran
utama dalam pelepasan heliks ganda. Proses berlanjut dengan endonuklease spesifik yang menghasilkan
nick, dan celah tersebut diisi oleh faktor replikasi dan DNA polimerase (Tuteja et al., 2009). Gen yang terlibat
dalam jalur NER telah terbukti aktif dalam fotoreaktivasi dan rekombinasi homolog (HR) (dijelaskan di
bawah).
Perbaikan pasca replikasi
Kerusakan DNA dapat menimbulkan konsekuensi berbeda pada fungsi sel. Perubahan yang mendistorsi geometri
heliks ganda dapat menyebabkan terhentinya proses replikasi. Lesi yang mempengaruhi untai terdepan dapat
menghambat garpu replikasi DNA, menyebabkan akumulasi ssDNA, yang dapat menyebabkan kerusakan DNA. Bahkan
jika replikasi dimulai dari titik asal replikasi yang jauh, hal ini akan menciptakan kesenjangan. Mekanisme perbaikan
pasca replikasi (PRR) tidak memperbaiki lesi, namun bertindak untuk memotongnya, dalam upaya untuk mengisi
kesenjangan dan memungkinkan replikasi terus berlanjut. Mekanisme yang dipelajari dengan baik adalah sintesis trans
lesion (TLS), berdasarkan TLS polimerase. Prosesnya bekerja dalam dua langkah berikutnya: ketika lesi terdeteksi, TLS
polimerase menggantikan replikasi polimerase dan menambahkan nukleotida di seberang lesi. Pada langkah kedua, TLS
polimerase lain menyisipkan nukleotida lain untuk memperluas primer melampaui lesi (Shu et al., 2012; Sakamoto,
2019). Beberapa TLS polimerase telah diidentifikasi pada tanaman. Semua nukleotida tersebut tidak memiliki aktivitas
pengoreksian 3'-5', yang membuatnya lebih rentan untuk memasukkan nukleotida yang belum diprioritaskan. Tanaman
dengan POL yang bermutasiG,POLF,Polimerase REV1 telah terbukti sensitif terhadap radiasi UV, yang menunjukkan
bagaimana polimerase ini diperlukan untuk menghindari efek radiasi UV, sehingga mendorong perkembangan jaringan
normal. Namun, pada saat yang sama, fidelitas yang rendah sering kali menjadi penyebab tingkat mutasi yang lebih
tinggi (Sakamoto, 2019).
Perbaikan ketidakcocokan (MMR)
Seperti dijelaskan di atas, ketidakcocokan yang disebabkan oleh replikasi DNA yang rusak lebih sering terjadi dibandingkan
ketidakcocokan yang terjadi secara spontan selama replikasi DNA yang tidak rusak. Perbaikan Ketidakcocokan (MMR) adalah
jalur PRR yang dilestarikan, digunakan untuk memperbaiki ketidakcocokan yang berasal dari replikasi dan loop yang dihasilkan
oleh penyisipan/penghapusan. Enzim MSH (MutS homolog) membentuk dimer yang terlibat dalam pengenalan lesi.
Eksonuklease menghidrolisis ikatan fosfodiester pada ketidakcocokan dan POLDmenambahkan nukleotida yang benar, diikuti
dengan ligase untuk menutup celah. MMR bertanggung jawab untuk mengurangi tingkat ketidakcocokan hingga 100 kali lipat
(Sakamoto, 2019).
Perbaikan DNA Double Strand Break

Lesi yang menyebabkan putusnya kedua untai DNA – DNA DSB – sangat penting karena berpotensi
menyebabkan hilangnya materi genetik, jika tidak diperbaiki dengan benar. Mutagen fisik, seperti pengion atau
Radiasi UV dapat menyebabkan DSB. Selain itu, mekanisme yang terlibat dalam perbaikan lesi yang disebabkan
oleh bahan kimia, seperti BER atau NER, membentuk zat antara single stand DNA break (SSB), yang dapat

akhirnya menyebabkan terbentuknya putusnya untai ganda. Sel telah mengembangkan mekanisme untuk
mendeteksi dan memperbaiki DSB. Tumbuhan menggunakan protein kinase untuk mengkomunikasikan
adanya kerusakan. Ataxia telangiectasia mutated (ATM) kinase adalah transduser utama untuk DSB,
sedangkan kinase bernama Ataxia telangiectasia dan terkait RAD3 (ATR) terlibat dalam sinyal transduksi
untuk keberadaan SSB. Setelah DSB dikenali, protein kinase diaktifkan yang memicu jalur transduksi sinyal,
yang mengarah pada penghentian siklus sel (Manova dan Gruszka, 2015). Empat mekanisme dapat terlibat
dalam perbaikan DSB: NHEJ klasik (cNHEJ), NHEJ alternatif (aNHEJ), single-strand annealing (SSA) dan HR
(Ceccaldi et al., 2016). Jika dengan cNHEJ DSB diperbaiki secara independen dari homologi urutan, tiga jalur
perbaikan lainnya memerlukan adanya urutan homolog untuk memperbaiki kerusakan.
cNHEJ dapat terjadi sepanjang siklus sel tetapi dominan pada G0/G1 dan G2. Dalam mekanisme ini, yang
melibatkan berbagai faktor seperti Ku70/80, DNA-PKcs, dan DNA ligase IV, DSB diperbaiki dengan ligasi ujung
tumpul dan tidak memerlukan atau minimal homologi (hingga 4 bp). cNHEJ bersifat konservatif namun mudah
beradaptasi, dan keakuratan perbaikan ditentukan oleh struktur ujung DNA. Sebagai konsekuensinya, dalam
beberapa kasus, pemrosesan ujung DNA yang tidak kompatibel secara kimia, yang tidak dapat diikat secara
langsung, menyebabkan penyisipan atau penghapusan kecil.
Sebagai alternatif, ujung DSB dapat direseksi, meninggalkan DNA untai tunggal (ssDNA) 3' yang
menggantung. Tergantung pada perluasan reseksi, DSB dapat diperbaiki dengan tiga mekanisme yang mungkin:
HR, SSA dan aNHEJ.
HR aktif selama fase mitosis S dan G2 di mana jumlah replikasi DNA tertinggi dan ketika cetakan saudara
tersedia. Invasi untai yang dimediasi RAD51 oleh ssDNA 3' yang menjorok ke dalam rangkaian homolog dari
saudara perempuannya atau kromatid homolog diikuti dengan sintesis DNA pada ujung yang menyerang. Hal ini
dianggap sebagai jalur konservatif dan tidak menyebabkan hilangnya genetik. Ini adalah mekanisme khas yang
terlibat dalam peristiwa pindah silang selama meiosis (Viana et al., 2019).
DSB yang direseksi juga dapat diperbaiki dengan jalur perbaikan mutagenik yaitu SSA atau aNHEJ.
Untuk diperbaiki oleh SSA, DSB perlu diapit oleh dua rangkaian berulang yang berorientasi pada arah
yang sama. Dalam mekanisme ini, setelah kedua untai dupleks DNA yang sama dipotong di sekitar
lokasi DSB, hasil 3' overhang sejajar, memungkinkan pemulihan kontinuitas molekul DNA. Perbaikan
melalui SSA akan berakhir dengan hilangnya urutan DNA antara pengulangan dan salah satu dari dua
pengulangan.
Dalam mekanisme aNHEJ yang kurang berkarakter, perbaikan DSB melibatkan anil mikrohomologi (4–25 bp)
sebelum bergabung. Hal ini bergantung pada aktivitas DNA polimerase theta yang mendorong anil ssDNA yang
mengandung mikro-homologi dan menyelesaikan sintesis DNA untuk mengisi celah yang direseksi, sebelum
ligasi menghentikan perbaikan. Mekanisme ini dikaitkan dengan penghapusan dan penyisipan berlebihan pada
lokasi persimpangan dan telah berimplikasi pada pembentukan penataan ulang genom skala besar, termasuk
translokasi kromosom. Fakta bahwa aNHEJ berfungsi sebagai cadangan untuk cNHEJ dan HR menunjukkan bahwa
ia mungkin aktif sepanjang siklus sel.
4.3.2. Apakah ada perbedaan antara mekanisme molekuler ini apakah hal itu terjadi
secara alamiatausecara in vitro?
Tidak ada perbedaan antara mekanisme molekuler ini apakah hal itu terjadisecara alamiatau secara in vitro.
Sebagaimana disebutkan dalam Bagian4.3.1.1, baik mutagen fisik maupun kimia menyebabkan perubahan pada tingkat
DNA. Proses-proses ini dan mekanisme perbaikan yang dipicu oleh mutagen bekerja pada tingkat sel dan oleh karena itu
tetap sama terlepas dari apakah sel tersebut merupakan bagian dari jaringan yang dibudidayakan. secara in vitroatau
organ tumbuhansecara alami.
4.4. Mengatasi ToR2: untuk menilai apakah jenis modifikasi genetik yang
disebabkan oleh teknik mutagenesis acak berbeda tergantung pada
apakah teknik tersebut diterapkansecara alamiatau secara in vitro
4.4.1. Jenis perubahan apa pada tingkat DNA yang disebabkan oleh mutagenesis
acak?
Mutagen yang terjadi secara spontan atau terinduksi menyebabkan perubahan DNA yang, meskipun ada mekanisme
perbaikan sel, dalam beberapa kasus menyebabkan mutasi.

4.4.1.1. Jenis mutasi

Mutasi secara garis besar dapat dibagi menjadi (a) perubahan lokal pada urutan asli DNA dan (b)
mutasi yang berdampak keseluruhan pada struktur kromosom.
Pada tingkat nukleotida, mutasi dapat dibedakan pada delesi, penyisipan, atau substitusi.
Substitusi merupakan penggantian satu nukleotida dengan nukleotida lain. Ketika basa purin
digantikan oleh purin lain (G oleh A atau A oleh G), atau pirimidin digantikan oleh pirimidin lain (C
oleh T atau T oleh C), maka mutasi disebut transisi. Penggantian purin dengan pirimidin atau
sebaliknya disebut transversi. Transisi, dan khususnya C ke T, adalah jenis mutasi yang paling umum
(Pathirana, 2011).
Efek substitusi dalam urutan pengkodean suatu gen dapat menyebabkan tiga skenario berbeda:
(1) perubahan asam amino (mutasi missense) yang tidak mempunyai pengaruh, kecil atau kuat pada
protein yang dikodekan tergantung pada sifat fisiknya. sifat kimia asam amino baru, (2) terbentuknya
kodon stop yang akan menyebabkan protein terpotong (mutasi non-akal), atau (3) tidak adanya efek
apa pun (mutasi diam) apabila substitusi tidak menghasilkan terhadap setiap perubahan asam amino
yang dihasilkan akibat degenerasi kode genetik (Pathirana, 2011; Bado et al., 2015).
Penyisipan dan penghapusan terjadi ketika satu atau lebih nukleotida dimasukkan ke dalam atau
dihapus dari urutan DNA asli. Ketika penyisipan/penghapusan (indels) terjadi dalam suatu urutan
pengkodean, hal ini dapat mengakibatkan pergeseran kerangka pembacaan, yang berakibat pada sintesis
protein, karena urutan asam amino dari protein yang baru terbentuk menjadi berbeda dari tipe liar (Mba ,
2013).
Perbaikan DSB juga dapat menyebabkan penataan ulang kromosom (duplikasi, inversi, atau translokasi).
Perubahan struktural ini dapat disertai dengan penyisipan atau penghapusan. (Pathirana, 2011). Perubahan ini
dapat bersifat intrachromosomal atau melibatkan kromosom yang berbeda.
4.4.2. Apakah ada perbedaan antara mutasi yang didapat secara alamiatausecara in vitro?
Tidak ada perbedaan antara mutasi yang diperolehsecara alamidan mutasi yang diperolehsecara in
vitro.Karena mutasi merupakan hasil akhir dari mekanisme molekuler yang menyebabkan perubahan pada
DNA dan mekanisme perbaikan yang samasecara alamiDansecara in vitro,seperti yang dirangkum dalam
Bagian4.3, jenis mutasinya juga diperkirakan sama. Hal ini didukung oleh informasi yang diberikan di
Bagian4.4.1Dan4.2.1.5, yang menunjukkan jenis mutasi yang diperolehsecara alamiDansecara in vitro
mutagenesis adalah sama.
4.5. Mengatasi ToR4: untuk menilai apakahsecara in vitroteknik mutagenesis acak

harus dianggap sebagai teknik yang berbeda dibandingkan dengan
secara alamiteknik mutagenesis acak atau sebaliknya, jika dianggap
sebagai akontinum
4.5.1. Adalahsecara in vitroDansecara alamiteknik mutagenesis acak dianggap berbeda

atau tidak?
Teknik mutagenesis acak (Bagian4.2) semuanya berlaku untuk keduanyasecara in vitroDansecara alami
kondisi. Di dalamsecara alamiDansecara in vitrometode mutagenesis acak, tersedia banyak variasi protokol
eksperimental, bergantung pada spesies tanaman dan biologinya, bahan yang digunakan untuk menginduksi
mutasi, dosis dan waktu pemaparan yang diperlukan untuk mencapai hasil yang diinginkan, proses seleksi, dll.
Sebagaimana dijelaskan dalam Bagian4.3Dan4.4, mekanisme molekuler yang ada di dalam sel dan
mendasari mutasi genetik yang dihasilkan oleh teknik tertentu tidak berbeda apakah teknik tersebut
diterapkan pada bahan tanaman.secara alamiatausecara in vitro.Oleh karena itu, hasil mutagenesis acak
tidak akan berbeda, dan jenis mutasi yang sama dapat dicapai dengan keduanyasecara alamiDansecara in
vitro pendekatan. Karena itu,secara alamiDansecara in vitroteknik mutagenesis acak tidak boleh dianggap
berbeda.
5. Kesimpulan
Panel GMO EFSA diminta (1) untuk memberikan penjelasan lebih rinci tentang teknik mutagenesis acak
yang diterapkansecara alamiDansecara in vitro, (2) untuk menilai apakah jenis-jenis modifikasi genetik

diinduksi oleh teknik mutagenesis acak berbeda-beda tergantung pada apakah teknik tersebut diterapkansecara
alamiatausecara in vitro, (3) untuk menilai apakah mekanisme molekuler yang mendasari pembentukan mutasi
baru yang disebabkan oleh teknik mutagenesis acak berbeda jika teknik tersebut diterapkan secara alamiatau
secara in vitro,dan (4) untuk menilai apakahsecara in vitroteknik mutagenesis acak harus dianggap sebagai teknik
yang berbeda dibandingkan dengansecara alamimutagenesis acak atau sebaliknya, jika dianggap sebagai sebuah
kontinum.
Panel GMO menyimpulkan bahwa teknik mutagenesis acak semuanya dapat diterapkan pada bahan tanaman
secara alamiDansecara in vitromeskipun dosis mutagen, waktu pemaparan, dan protokol eksperimental secara
keseluruhan mungkin berbeda. Mekanisme molekuler yang mendasari teknik mutagenesis terinduksi acak sama
dengan mekanisme yang terlibat dalam pembentukan mutasi spontan dan mencakup: (a) mekanisme yang
menyebabkan perubahan DNA, yang dipicu oleh mutagen, dan (b) mekanisme yang menyebabkan perubahan
DNA. untuk mendeteksi dan memperbaiki perubahan, yang bergantung pada beberapa faktor, seperti jenis sel,
tahap sel dalam siklus sel, dan sifat kerusakan. Proses-proses ini dan mekanisme perbaikan yang dipicu oleh
mutagen bekerja pada tingkat sel dan oleh karena itu tetap sama terlepas dari apakah sel tersebut merupakan
bagian dari sel yang terisolasi atau jaringan yang dibudidayakan.secara in vitroatau bagian mana pun dari
tanaman secara alami.Karena baik mekanisme molekuler yang menyebabkan kerusakan DNA maupun
mekanisme perbaikannya adalah samasecara alamiDansecara in vitro,jenis mutasinya juga diperkirakan sama.
Terakhir, Panel GMO menyimpulkan bahwa perbedaan tanaman diperolehsecara alamiDan secara in vitroOleh
karena itu, pendekatan ini tidak dapat dibenarkan. Memang benar, mutasi dan sifat turunan yang sama berpotensi
diperoleh dengan menggunakan keduanyasecara alamiDansecara in vitromutagenesis acak dan mutan yang dihasilkan
tidak dapat dibedakan.
Referensi
Amano E, 2006. Penggunaan mutan terinduksi pada pemuliaan padi di Jepang. Laporan Mutasi Tanaman, 1, 21–24.
Anai T, 2011. Potensi pendekatan genetik terbalik berbasis mutan untuk genomik fungsional dan molekuler
budidaya pada kedelai. Ilmu Pemuliaan, 61, 462–467.https://doi.org/10.1270/jsbbs.61.462
Ando A, 1968. Induksi mutasi pada padi melalui radiasi yang dipadukan dengan bahan kimia pelindung dan mutagen. Wina. Auti
SG dan Apparao BJ (Shu QY), 2009. Mutagenesis terinduksi pada kacang hijau (Vigna radiata (L.) Wilczek). Wina,
Austria, Divisi Teknik Nuklir Gabungan FAO/IAEA dalam Pangan dan Pertanian, Badan Energi Atom
Internasional.
Bado S, Forster BP, Nielen S, Ali AM, Lagoda PJL, Till BJ dan Laimer M, 2015. Pemuliaan mutasi tanaman: terkini
kemajuan dan penilaian masa depan. Ulasan Pemuliaan Tanaman, Oxford, Inggris, Wiley-Blackwell.
Bairu MW, Aremu AO dan Van Staden J, 2011. Variasi somaklonal pada tumbuhan: penyebab dan cara deteksi. Tanaman
Regulasi Pertumbuhan, 63, 147–173.https://doi.org/10.1007/s10725-010-9554-x
Banerji BK (Tomlekova NB, Kozgar MI dan Wani MR), 2014. Pemuliaan mutasi dan mutan tanaman hias :
Peran NBRI untuk keuntungan ekonomi. Wageningen Acad Publ, Wageningen.
Barnard S, Bouffler S dan Rothkamm K, 2013. Bentuk respon dosis radiasi DNA untai ganda
mematahkan induksi dan perbaikan. Integritas Genom, 4, 1.https://doi.org/10.1186/2041-9414-4-1
Ceccaldi R, Rondinelli B dan D'Andrea AD, 2016. Memperbaiki pilihan jalur dan konsekuensi pada rantai ganda
merusak. Tren Biologi Sel, 26, 52–64.https://doi.org/10.1016/j.tcb.2015.07.009
Chatterjee N dan Walker GC, 2017. Mekanisme kerusakan, perbaikan, dan mutagenesis DNA. Lingkungan dan
Mutagenesis Molekuler, 58, 235–263.https://doi.org/10.1002/em.22087
Chen Y dan Chen R, 2018. Mutagenesis fisik pada Medicago truncatula menggunakan fast neutron bombardment (FNB)
untuk studi simbiosis dan biologi perkembangan. Metode dalam Biologi Molekuler. Tempatkan Humana Press Inc.,
Humana Press Inc. hlm.61–69.
Christov NK, Ilchovska D dan Hristov KN (Tomlekova NB, Kozgar MI dan Wani MR), 2014. Mutagenesis kimia,
pemuliaan mutasi dan analisis genetik kuantitatif mutan jagung: dari teori ke praktik. Wageningen Acad Pub,
Wageningen.
Constantin MJ, 1975. Mutasi defisiensi klorofil pada jelai: efek komparatif fisik dan kimia
mutagen. Simposium Genetika Barley Internasional Ketiga, 7–12 Juli 1975. Penulis AG.: [Abstrak].15 Datta SK
(Tomlekova NB, Kozgar MI dan Wani MR), 2014. Mutagenesis terinduksi: pengetahuan dasar untuk
kesuksesan teknologi. Wageningen Acad Publ, Wageningen.
Datta SK dan Chakrabarty D (Shu QY), 2009. Pengelolaan chimera dan mutagenesis in vitro untuk pengembangan
warna/bentuk bunga baru dan mutan beraneka ragam klorofil pada tanaman Krisan. Wina, Austria, Divisi Teknik
Nuklir Gabungan FAO/IAEA dalam Pangan dan Pertanian, Badan Energi Atom Internasional.
Devarumath RM, Nerkar GA, Farsangi FJ, Nikam AA dan Harinath Babu K, 2015. Merangkul metode bioteknologi
untuk penelitian perbaikan tanaman tebu. Status Penelitian Tebu Saat Ini di India. Nova Science Publishers,
Inc. hlm.33–53.

Diao X dan Jia G (Doust A dan Diao X), 2017. Pembibitan millet buntut rubah di Tiongkok. Swiss, Springer Internasional
Penerbitan AG, Cham.
Panel GMO EFSA (Panel EFSA tentang Organisme Hasil Rekayasa Genetik), Naegeli H, Bresson JL, Dalmay T, Dewhurst IC,
Epstein MM, Firbank LG, Guerche P, Hejatko J, Moreno FJ, Mullins E, Nogue - F, Sa- nchez Serrano JJ, Savoini G,
Veromann E, Veronesi F, Casacuberta J, Gennaro A, Paraskevopoulos K, Raffaello T dan Rostoks N, 2020. Penerapan
Opini EFSA pada nuklease terarah lokasi tipe 3 untuk penilaian keamanan pembangkit listrik yang dikembangkan
menggunakan nuklease terarah lokasi tipe 1 dan 2 dan mutagenesis terarah oligonukleotida. Jurnal EFSA
2020;18(11):6299, 14 hal.https://doi.org/10.2903/j.efsa.2020.6299 EFSA (Otoritas Keamanan Pangan Eropa), Martino L,
Aiassa E, Halldo - rsson TI, Koutsoumanis PK; Naegeli H, Baert K,
Baldinelli F, Devos Y, Lodi F, Lostia A, Manini P, Merten C, Messens W, Rizzi V, Tarazona J, Titz A dan Vos S, 2020.
Draf kerangka kerja pengembangan protokol untuk penilaian ilmiah EFSA. Publikasi pendukung EFSA
2020;EN-1843, 46 hal.https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2020.EN-1843
Ehrenberg L, 1960. Mutasi yang diinduksi pada tanaman: mekanisme dan prinsip. Genetika Agraria, 12, 364–389. FAO/
IAEA, 2020. Basis data varietas mutan FAO/IAEA dari divisi teknik nuklir gabungan FAO/IAEA dalam pangan
dan pertanian.
Favret EA, 1960. Menginduksi mutasi untuk resistensi terhadap penyakit. Genetika Agraria, 13, 1–26.
Gustafsson A, 1960. Mutagenesis kimia pada tumbuhan tingkat tinggi. Mutagenesis kimia. Ceramah untuk mengenang Erwin
Baur I, 1959 diselenggarakan oleh Institut Penelitian Tanaman Budidaya, Gatersleben, dari Akademi Ilmu
Pengetahuan Jerman di Berlin 26-28 Juli 195:14–29.
Herna- ndez-Mun~oz S, Pedraza-Santos SAYA, Lo - pez PA, Ayo- mez-Sanabria JM dan Morales-Garc-Sayaa JL, 2019. Mutagenesis
dalam perbaikan tanaman hias. Revista Chapingo, Seri Horticultura, 25, 151–167.https://doi.org/ 10.5154/
r.rchsh.2018.12.022
Ibrahim R, Ahmad Z, Salleh S, Abu Hassan A dan Ariffin S (VanHuylenbroeck J), 2018. Pemuliaan mutasi pada
hiasan. Ag Penerbitan Internasional Springer, Cham.
Jankowicz-Cieslak J dan Hingga BJ, 2016a. Mutagenesis kimia dan pembubaran chimera diperbanyak secara vegetatif
pisang. Protokol, Penerbitan Internasional Springer, Bioteknologi untuk Pemuliaan Mutasi Tanaman. hlm.39–54. Jankowicz-Cieslak J
dan Hingga BJ, 2016b. Meneruskan dan membalikkan genetika dalam pemuliaan tanaman. Kemajuan dalam Pemuliaan Tanaman
Strategi: Pemuliaan, Bioteknologi dan Alat Molekuler. Penerbitan Internasional Springer. hal.215–240. Jankowicz-Cieslak J,
Mba C dan Hingga BJ, 2016a. Mutagenesis untuk pemuliaan tanaman dan genomik fungsional. Protokol,
Penerbitan Internasional Springer, Bioteknologi untuk Pemuliaan Mutasi Tanaman. hlm.3–18.
Jankowicz-Cieslak J, Tai TH, Kumlehn J dan Till BJ, 2016b. Bioteknologi untuk pemuliaan mutasi tanaman: Protokol.
Penerbitan Internasional Springer.
Kharkwal MC (Shu QY, Forster BP dan Nakagawa H), 2012. Sejarah singkat mutagenesis tanaman. Wallingford, Inggris,
taksi.
Kiunga FK, Kinyua M dan Kiplagat O, 2014. Pemuliaan mutasi pada kentang Irlandia. RUFORUM Dua Tahunan Keempat
Konferensi, Maputo, Mozambik, 19–25 Juli 2014:495–496.
Kodym A, Afza R, Forster BP, Ukai Y, Nakagawa H dan Mba C (Shu QY, Forster BP dan Nakagawa H), 2012.
Metodologi pengobatan mutagenik fisik dan kimia. Wallingford, Inggris, Cabi.
Konzak CF, 1957. Efek genetik radiasi pada tumbuhan tingkat tinggi. Tinjauan Biologi Triwulanan, 27–45.https://doi.org/
10.1086/401671
Kumawat S, Rana N, Bansal R, Vishwakarma G, Mehetre ST, Das BK, Kumar M, Kumar Yadav S, Sonah H, Raj
Sharma T dan Deshmukh R, 2019. Memperluas jalur mutagenesis yang dimediasi neutron cepat untuk perbaikan
tanaman. Tumbuhan, 8.https://doi.org/10.3390/plants8060164
Larkin PJ dan Scowcroft WR, 1981. Variasi somaklonal - sumber variabilitas baru dari kultur sel untuk tanaman
peningkatan. MENANDAI. Genetika Teoritis dan Terapan., 60, 197–214.https://doi.org/10.1007/bf02342540 Latado RR,
Tulmann Neto A dan Figueira A, 2012.secara alamiDansecara in vitropemuliaan mutasi jeruk. Bioremediasi,
Keanekaragaman Hayati dan Ketersediaan Hayati, 6, 40–45.
Lee LS, Till BJ, Hill H, Huynh OA dan Jankowicz-Cieslak J, 2014. Mutasi dan skrining mutasi. Di dalam: Henry RJ
dan Furtado A (eds.). Genomik Sereal: Metode dan Protokol. Humana Press Inc, Totowa. hlm.77–95. Leitao JM (Shu
QY, Forster BP dan Nakagawa H), 2012. Mutagenesis kimia. Wallingford, Inggris, Cabi. Lundqvist U (Shu QY), 2009.
Delapan puluh tahun genetika dan pemuliaan mutasi jelai Skandinavia. Wina, Austria,
Divisi Teknik Nuklir Gabungan FAO/IAEA dalam Pangan dan Pertanian, Badan Energi Atom Internasional. Lundqvist
U, 2014. Penelitian mutasi Skandinavia pada jelai - tinjauan sejarah. Keturunan (Lund), 151, 123–131.
https://doi.org/10.1111/hrd2.00077 Mac Key J,
1956. Perkembangbiakan mutasi di Eropa.
Maghuly F, Bado S, Jankowicz-Cieslak J dan Laimer M, 2016. Mutagenesis kimia dan fisika pada tanaman jarak pagar
curcas. Protokol, Penerbitan Internasional Springer, Bioteknologi untuk Pemuliaan Mutasi Tanaman. hlm.21–38.
Magori S, Tanaka A, Kawaguchi M (Meksem K dan Kahl G), 2010. Mutasi yang diinduksi secara fisik: berkas ion
mutagenesis. Wiley-Blackwell, Chichester, Inggris.
Maluszynski M, Szarejko I, Bhatia CR, Nichterlein K, Lagoda PJL (Ceccarelli S, Guimaraes EP dan Weltzien E), 2009.
Metodologi untuk menghasilkan variabilitas. Bagian 4: Teknik mutasi. Organisasi Pangan dan Pertanian Perserikatan Bangsa-
Bangsa (FAO), Roma, Italia.

Maluszynski M, Szarejko I, Maluszynska J dan Szurman-Zubrzycka M, 2016. Teknik Mutasi. Elsevier Inc,
Ensiklopedia Ilmu Tanaman Terapan. hal.215–228.
Manova V dan Gruszka D, 2015. Kerusakan dan perbaikan DNA pada tanaman – mulai dari model hingga tanaman. Perbatasan di Pabrik
Sains, 6.https://doi.org/10.3389/fpls.2015.00885
Matsuo T, 1962. Tinjauan penelitian tentang penggunaan mutasi akibat radiasi dalam pemuliaan tanaman dengan referensi khusus
untuk nasi di Jepang. Jurnal Internasional Radiasi dan Isotop Terapan, 13, 477–478.
Mba C, 2013. Mutasi terinduksi membuka potensi sumber daya genetik tanaman untuk pangan dan pertanian.
Agronomi-Basel, 3, 200–231.https://doi.org/10.3390/agronomy3010200
Mba C, Afza R, Bado S, Jain SM (Davey MR dan Anthony P), 2010. Mutagenesis terinduksi pada tanaman menggunakan metode fisik
dan bahan kimia. Wiley-Blackwell, Chichester, Inggris.
Mou B, 2011. Mutasi pada perbaikan selada. Jurnal Internasional Genomik Tumbuhan, 2011.https://doi.org/10.
1155/2011/723518
Muller HJ, 1927. Transmutasi gen buatan. Sains, 66, 84.https://doi.org/10.1126/science.66.1699.84 Nakagawa H
(Shu QY), 2009. Menginduksi mutasi pada pemuliaan tanaman dan penelitian biologi di Jepang. Wina,
Austria, Divisi Teknik Nuklir Gabungan FAO/IAEA dalam Pangan dan Pertanian, Badan Energi Atom
Internasional.
Navjot K, Satinder K, Kuljit K dan Vijay S, 2018. Tinjauan pemuliaan mutasi untuk perbaikan tanaman
tanaman: sekarang dan masa depan. Agriways, 6, 50–58.
Nybom N, 1961. Penggunaan mutasi terinduksi untuk perbaikan tanaman yang diperbanyak secara vegetatif. hal.252–294. Pathirana R,
2011. Pemuliaan mutasi tanaman di bidang pertanian. Ulasan CAB: Perspektif di bidang Pertanian, Kedokteran Hewan
Sains, Gizi dan Sumber Daya Alam, 6, 1–20.https://doi.org/10.1079/pavsnnr20116032
Phang I, Taylor HH dan Leung DWM, 2012. Mutagenesis kimia untuk meningkatkan potensi tanaman untuk remediasi
lingkungan dengan kontaminan logam berat. Tren Penelitian, Trivandrum, India.
Rafiq Wani M, Imran Kozgar M, Tomlekova N, Khan S, Gul Kazi A, Ahmad Sheikh S dan Ahmad P, 2014. Mutasi
pemuliaan: Sebuah teknik baru untuk perbaikan genetik tanaman palawija khususnya buncis (Cicer arietinum L.).
Springer, New York. hal.217–248.
Riaz A dan Gul A, 2015. Mutagenesis tanaman dan perbaikan tanaman. Penerbitan Internasional Springer, Pangkas
Masalah Produksi dan Lingkungan Global. hal.181–209.
Ryu JS, Choi JM, Kang YH dan Kim SY (Khush GS, Brar DS dan Hardy B), 2003. Mengembangkan jalur tahan ledakan di
padi melalui metode kultur jaringan. Singapura, Singapura, World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd Sakamoto AN, 2019. Sintesis
translesi pada tanaman: Ketahanan terhadap sinar ultraviolet dan seterusnya. Ilmu Pengetahuan Tanaman Depan, 10, 1208.
https://doi.org/10.3389/fpls.2019.01208
Sen NK, 1951. Bahan kimia mutagenik. Sains dan Budaya, 16, 480–481.
Sheela VL, Sheena A (Tomlekova NB, Kozgar MI dan Wani MR), 2014. Tren dan pencapaian baru dalam pemuliaan
tanaman hias tropis khususnya anggrek dan anthurium: pendekatan pemuliaan mutasi. Wageningen Acad
Publ, Wageningen.
Shen Y, Pan G dan Lu €bberstedt T, 2015. Strategi haploid untuk validasi fungsional gen tanaman. Tren di
Bioteknologi, 33, 611–620.https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2015.07.005
Shu QY, Forster BP dan Nakagawa H, 2012. Pemuliaan mutasi tanaman dan bioteknologi. Penerbitan CABI. Singer SD, Laurie JD,
Bilichak A, Kumar S dan Singh J, 2021. Variasi genetik dan risiko yang tidak diinginkan dalam konteksnya
teknik pemuliaan lama dan baru. Tinjauan Kritis dalam Ilmu Tanaman, 40, 68–108.https://doi.org/10.1080/
07352689.2021.1883826
Spencer-Lopes MM, Forster BP, Jankuloski L (Spencer-Lopes MM, Forster BP dan Jankuloski L), 2018. Manual tentang
perkembangbiakan mutasi. Italia, Organisasi Pangan dan Pertanian Perserikatan Bangsa-Bangsa (FAO), Roma.
Stadler LJ, 1928. Mutasi pada jelai disebabkan oleh sinar-X dan radium. Sains, 68, 186.https://doi.org/10.1126/
ilmu pengetahuan.68.1756.186
Suprasanna P, Patade VY, Desai NS, Devarumath RM, Kawar PG, Pagariya MC, Ganapathi A, Manickavasagam M
dan Babu KH, 2011. Perkembangan bioteknologi dalam perbaikan tebu: gambaran umum. Teknologi Gula, 13, 322–
335.https://doi.org/10.1007/s12355-011-0103-3
Suprasanna P, Vitthal SB dan Yadav PV, 2012.Secara in vitromutagenesis dan seleksi dalam kultur jaringan tanaman dan mereka
prospek perbaikan tanaman. Bioremediasi, Keanekaragaman Hayati dan Ketersediaan Hayati, 6, 6–14.
Suprasanna P, Mirajkar SJ, Patade VY, Jain SM (Tomlekova NB, Kozgar MI dan Wani MR), 2014. Diinduksi
mutagenesis untuk meningkatkan toleransi cekaman abiotik tanaman. Wageningen Acad Publ, Wageningen. Suprasanna P, Mirajkar
SJ dan Bhagwat SG, 2015. Menginduksi mutasi dan perbaikan tanaman. Keanekaragaman Tanaman,
Organisasi, Fungsi dan Peningkatan, Springer India, Biologi Tumbuhan dan Bioteknologi. hal.593–617. Tadele Z, Mba
C, Till BJ (Jain SM dan Brar DS), 2010. TILLING untuk mutasi pada tanaman model dan tanaman. Peloncat,
Dordrecht.
Tanaka A dan Hase Y, 2010. Penerapan bioteknologi: Pemuliaan tanaman berkas ion. Kemajuan terbaru,
Aplikasi, dan Antarmuka, CRC Press, Interaksi Partikel Bermuatan dan Foton dengan Materi. hal.943–957. Till BJ, Zerr
T, Comai L, Henikoff S (Shu QY, Forster BP dan Nakagawa H), 2012. Sebuah protokol untuk TILLING dan eco-
MENGHASILKAN. Cabi, Wallingford, Inggris.

Hingga BJ, Datta S dan Jankowicz-Cieslak J, 2018. TILLING: Generasi penerus bangsa. Kemajuan dalam Biokimia
Rekayasa/Bioteknologi. Tempatkan Springer Science dan Media Bisnis Deutschland GmbH, Springer Science
dan Media Bisnis Deutschland GmbH. hlm.139–160.
Tomlekova N, Todorova V, Petkova V, Yancheva S, Nikolova V, Panchev I dan Penchev E (Shu QY), 2009. Penciptaan
dan evaluasi mutan yang diinduksi dan alat yang berharga untuk program pemuliaan lada. Wina, Austria, Divisi
Teknik Nuklir Gabungan FAO/IAEA dalam Pangan dan Pertanian, Badan Energi Atom Internasional.
Tuteja N, Ahmad P, Panda BB dan Tuteja R, 2009. Stres genotoksik pada tanaman: menjelaskan kerusakan DNA,
perbaikan dan perbaikan DNA helikase. Penelitian Mutasi - Review dalam Penelitian Mutasi, 681, 134–149.https://doi. org/
10.1016/j.mrrev.2008.06.004
Viana VE, Pegoraro C, Busanello C dan Costa de Oliveira A, 2019. Mutagenesis pada padi: dasar pemuliaan a
pabrik super baru. Perbatasan dalam Ilmu Tanaman, 10.https://doi.org/10.3389/fpls.2019.01326
Wani MR, Kozgar MI, Tomlekova NB dan Khan S (Tomlekova NB, Kozgar MI dan Wani MR), 2014. Seleksi untuk
variabilitas poligenik pada kacang hijau generasi mutan awal (Vigna radiata (L.) Wilczek). Wageningen Acad Publ,
Wageningen.
Singkatan
BER perbaikan eksisi dasar
BPD dimer siklobutana pirimidin
DEB diepoksibutana
DES dietil sulfat
DH haploid ganda
DMS dimetil sulfat
DNA asam deoksiribonukleat
DSB putusnya untai ganda
EI etilenimina
EMS etil metanasulfonat
ENNG 1-etil-2-nitro-1-nitrosoguanidin
ENU (ENH) N-etil-N-nitrosourea
FAO Pengeboman neutron cepat Organisasi Pangan dan Pertanian
FNB Perserikatan Bangsa-Bangsa
transgenik organisme yang dimodifikasi secara genetik
GR30-60 pengurangan pertumbuhan antara 30 dan 60% bahan tanaman yang diolah pada generasi M1
Abu-abu (Gy) satuan SI saat ini untuk dosis serapan yang setara dengan 1 Joule per kg (1Gy = 1Jkg-1)
SDM rekombinasi homolog
IAEA Radiasi berkas ion Badan Energi
IBR Atom Internasional
LD50 dosis mematikan yang membunuh 50% bahan tanaman yang diolah.
LTE transfer energi linier
MC WG perbaikan ketidakcocokan kelompok kerja
MMR karakterisasi molekuler
MMS metil metanasulfonat
MNNG N-metil-N1-nitro-N-nitrosoguanidin
MNU (MNH) N-metil-N-nitrosourea
NDEA T,T-Amida dietilnitro
NDMA T,T-perbaikan eksisi nukleotida dimetilnitrous
Ner amide ujung non-homolog bergabung dengan
NHEJ reaksi berantai polimerase pirimidin (6–4)
PCR pirimidon [(6–4) PPs] asam ribonukleat
6-4 hal
RNA
SA Natrium azida
SSB putusnya untaian tunggal
MENGHASILKAN menargetkan Lesi Lokal yang Diinduksi pada Genom
UV ultraviolet

Glosarium
Adenin salah satu basa nitrogen yang menyusun struktur nukleotida
Mutagenesis kimia penggunaan mutagen kimia dalam mutagenesis acak.
Chimerisme perbedaan sektoral dalam suatu mutan di mana sel-sel dari genotipe yang berbeda berada
berdampingan dalam jaringan dari individu tanaman yang sama.
genom satu set lengkap informasi genetik dalam suatu organisme
Genotip susunan genetik lengkap suatu organisme. Kumpulan lengkap gen
suatu organisme
Guanin salah satu basa nitrogen yang menyusun struktur nukleotida dengan
Heterozigositas kondisi memiliki dua alel berbeda pada satu lokus.
Homozigositas kondisi memiliki dua alel identik pada satu lokus
Secara in vitro suatu proses yang dilakukan atau berlangsung di luar organisme hidup,
misalnya dalam tabung reaksi atau cawan petri.
secara alami suatu proses yang dilakukan atau terjadi pada organisme hidup, perubahan DNA yang
Mutasi yang diinduksi disebabkan oleh agen mutagenik yang dibawa oleh manusia, proses meningkatkan
Pemuliaan mutasi variabilitas genetik spesies tanaman yang memiliki kepentingan agronomi dengan
menginduksi mutasi pada frekuensi yang lebih tinggi dibandingkan dengan proses
spontan, secara berurutan untuk mengidentifikasi dan memilih sifat-sifat agronomi yang
berharga.
Mutasi perubahan materi genetik suatu organisme yang dapat diturunkan kepada
keturunannya
Nukleotida bahan penyusun dasar asam nukleat
Fenotipe sifat fisik suatu organisme yang dapat diamati. Fenotipe ditentukan oleh
genotipe pada lingkungan tertentu.
Mutagenesis fisik penggunaan mutagen fisik dalam mutagenesis acak
Ploidi jumlah set lengkap kromosom dalam sel atau individu senyawa organik
purin aromatik heterosiklik yang membentuk tulang punggung basa guanin
dan adenin
pirimidin senyawa organik aromatik heterosiklik yang membentuk struktur sitosin
dan timin.
Mutagenesis acak sebuah teknik yang menghasilkan pengenalan mutasi pada genom dengan cara yang
teknik tidak ditargetkan
Replikasi mekanisme molekuler dimana molekul DNA beruntai ganda disalin untuk
menghasilkan dua molekul DNA yang identik
Variasi somaklonal keragaman genetik yang diamati pada keturunan tanaman yang diregenerasi dari
kultur jaringan
Mutasi spontan perubahan DNA yang bukan disebabkan oleh campur tangan manusia
Transkripsi mekanisme molekuler dimana informasi dalam untai DNA disalin ke
dalam molekul messenger RNA (mRNA) baru
Transposon urutan DNA seluler yang mampu mengubah posisinya dalam genom

Lampiran A – Penelusuran literatur. Strategi pencarian

Abstrak TAKSI
Tanggal pencarian 22/12/2020
Batasannya: resensi atau buku dan bahasa Inggris
Mengatur Pertanyaan Hasil Komentar

# 19 #18 ATAU #12 ATAU #9 334 Cari 1 ATAU Cari 2 ATAU Cari 3
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun
# 18 #17 ATAU #16 33 Pencarian 3: Mutagenesis pada tumbuhan
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun spesifik DAN Teknik DAN (Ulasan ATAU
Buku)
# 17 #14 DAN #13 12 Mutagenesis pada tumbuhan spesifik
Disempurnakan oleh: JENIS DOKUMEN: (BAB BUKU) DAN Teknik DAN Buku
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun DAN Teknik DAN Tinjauan
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun DAN Teknik
# 14 ((TS=(teknik* ATAU metode* ATAU “in vivo” ATAU “in 3.195.661 Teknik
vitro” ATAU alat ATAU alat)))DANBAHASA: (Bahasa
Inggris ATAU Tidak Ditentukan)
# 13 ((TI=(mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN 431 Mutagenesis pada tumbuhan spesifik [hanya judul]
mutasi*)) AND TI=(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman
ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih ATAU buah ATAU
buah ATAU pohon ATAU pohon)))DAN BAHASA: (Bahasa
Inggris ATAU Tidak Ditentukan) Indeks=Jangka Waktu Abstrak
CAB=Semua tahun
# 12 #11 DAN #6 3 Pencarian 2: Mutagenesis acak spesifik

Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun DAN tanaman DAN Ulasan
# 11 #10 DAN #1 63 Mutagenesis acak spesifik DAN
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun tanaman
# 10 ((TI=((acak ATAU konvensional) AND (mutagen* 148 Spesifik mutagenesis acak [judul saja]
OR ((gen OR gen OR genetik) AND
mutasi*)))))DANBAHASA: (Bahasa Inggris ATAU Tidak
Ditentukan)
#9 #8 ATAU #7 309 Pencarian 1: Mutagenesis kimia atau fisik
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun 1 ATAU 2 DAN tumbuhan DAN (Buku
ATAU Ulasan)
#8 #4 DAN #1 118 Mutagenesis kimia atau fisik 1 ATAU 2 DAN
Disempurnakan berdasarkan: JENIS DOKUMEN: (BAB ATAU tumbuhan DAN Buku
BUKU BUKU)
#7 #6 DAN #5 215 Mutagenesis kimia atau fisik 1 ATAU 2 DAN
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun tumbuhan DAN Ulasan
#6 (TS=(ulasan* ATAU ikhtisar ATAU ikhtisar ATAU “meta 656.890 Ulasan
analys*” ATAU metanalys*))DAN BAHASA: (Bahasa
Inggris ATAU Tidak Ditentukan) Indeks=Jangka Waktu
Abstrak CAB=Semua tahun
#5 #4 DAN #1 2.682 Mutagenesis kimia atau fisik 1 ATAU 2 DAN
Indeks=Jangka Waktu Abstrak CAB=Semua tahun tanaman
#4 #3 ATAU #2 3.278 Mutagenesis kimia atau fisik 1 ATAU 2


#3 (TS=((Kimia* ATAU fisik*) DEKAT/3 (mutagen ATAU 2.871 Mutagenesis kimia atau fisik2
mutagen ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU
mutasi)))DANBAHASA: (Bahasa Inggris ATAU Tidak
Ditentukan)
#2 (TS=(((kimia* ATAU fisik*) DEKAT/3 (agen ATAU agen 751 Mutagenesis kimia atau fisik 1
ATAU pengobatan*)) DAN (mutagen ATAU mutagen
ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi)))DAN
BAHASA: (Bahasa Inggris ATAU Tidak Ditentukan)
#1 (TS=(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU 5.361.889 Tanaman
benih ATAU biji ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon))
DANBAHASA: (Bahasa Inggris ATAU Tidak Ditentukan)
Scopus
Mengatur Istilah Pencarian Hasil Komentar

15 ((JUDUL ((mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*)) DAN 215 dokumen Cari 1 ATAU
(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih hasil Cari 2 ATAU
ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon))) DAN (JUDUL-ABS- KUNCI Pencarian 3
(teknik* ATAU metode* ATAU “in vivo” ATAU “in vitro” ATAU alat ATAU alat))) OR
((JUDUL ((acak ATAU konvensional) DAN (mutagen ATAU mutagen ATAU
mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) AND mutasi*)))) AND (TITLE-
ABS-KEY (tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih
ATAU biji ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon))) ATAU ((TITLE-ABS-
KEY (tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU
benih ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon)) DAN ((TITLE-ABS-KEY
((kimia* ATAU fisik*) W/3 (mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis ATAU
mutasi ATAU mutasi))) ATAU (JUDUL-ABS-
KUNCI (((kimia* ATAU fisik*) W/3 (agen ATAU agen ATAU pengobatan*))
DAN (mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU
mutasi))))) DAN (LIMIT-TO (BAHASA, “Bahasa Inggris”) ) DAN (LIMIT-TO
(DOCTYPE, “re”) ATAU LIMIT-TO (DOCTYPE, “ch”) ATAU LIMIT-TO
(DOCTYPE, “bk”))
14 (JUDUL ((mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*)) DAN 33 dokumen Pencarian 3:
(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih hasil Mutagenesis di
ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon))) DAN (JUDUL-ABS-KEY (teknik* spesifik tanaman
ATAU metode* ATAU “in vivo” ATAU “in vitro” ATAU alat ATAU alat)) DAN (LIMIT- DAN Teknik
TO (DOCTYPE, “re”) OR LIMIT-TO (DOCTYPE, “ch”) ATAU LIMIT-TO ( DOCTYPE, “bk”)) DAN (Buku ATAU
AND (LIMIT-TO (BAHASA, “Bahasa Inggris”)) Ulasan) DAN
batas bahasa
13 (JUDUL ((mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*)) DAN 164 dokumen Mutagenesis di
(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih hasil spesifik tanaman
ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon))) DAN (JUDUL-ABS-KEY (teknik* DAN Teknik
ATAU metode* ATAU “in vivo” ATAU “in vitro” ATAU alat ATAU alat))
12 TITLE-ABS-KEY (teknik* ATAU metode* ATAU “in vivo” ATAU “in vitro” ATAU 26.103.275 Teknik
alat ATAU alat) dokumen
hasil
11 JUDUL ((mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*)) DAN 407 dokumen Mutagenesis di
(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih hasil spesifik tanaman
ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon)) [hanya judul]

Mengatur Istilah Pencarian Hasil Komentar

10 (JUDUL ((acak ATAU konvensional) DAN (mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis 3 dokumen Pencarian 2:
ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*)))) DAN (TITLE-ABS-KEY (tanaman hasil Acak
ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih ATAU buah ATAU mutagenesis
buah-buahan ATAU pohon ATAU pohon)) DAN (BATAS- spesifik DAN
TO (DOCTYPE, “re”) ATAU LIMIT-TO (DOCTYPE, “ch”)) AND (LIMIT-TO tanaman DAN
(LANGUAGE, “English”)) (Buku ATAU
Ulasan) DAN
batas bahasa
9 (JUDUL ((acak ATAU konvensional) DAN (mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis 44 dokumen Acak
ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*)))) DAN (TITLE-ABS-KEY (tanaman hasil mutagenesis
ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih ATAU buah ATAU spesifik DAN
buah-buahan ATAU pohon ATAU pohon)) tanaman
8 JUDUL ((acak ATAU konvensional) DAN (mutagen ATAU mutagen ATAU 721 dokumen Acak
mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*))) hasil mutagenesis
spesifik [hanya
judul]
7 (TITLE-ABS-KEY (tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman 191 dokumen Pencarian 1:
ATAU benih ATAU biji ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon)) hasil Kimia ATAU
DAN ((TITLE-ABS-KEY ((kimia* ATAU fisik*) W/3 (mutagen ATAU mutagen fisik
ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi))) ATAU (TITLE-ABS-KEY mutagen ATAU
(((kimia* ATAU fisik*) W/3 (agen ATAU agen ATAU pengobatan*)) DAN agen mutagen
(mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU DAN tanaman DAN
mutasi) ))) AND (LIMIT-TO (DOCTYPE, “re”) ATAU LIMIT-TO (DOCTYPE, (Buku ATAU
“ch”) ATAU LIMIT-TO (DOCTYPE, “bk”)) AND (LIMIT-TO (LANGUAGE, Ulasan) DAN
“English”) ) batas bahasa
6 (TITLE-ABS-KEY (tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman 206 dokumen Kimia ATAU
ATAU benih ATAU biji ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon)) hasil fisik
DAN ((TITLE-ABS-KEY ((kimia* ATAU fisik*) W/3 (mutagen ATAU mutagen mutagen ATAU
ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi))) ATAU (TITLE-ABS-KEY agen mutagen
(((kimia* ATAU fisik*) W/3 (agen ATAU agen ATAU pengobatan*)) DAN DAN tanaman DAN
(mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU (Buku ATAU
mutasi) ))) DAN (LIMIT-TO (DOCTYPE, “re”) ATAU LIMIT-TO (DOCTYPE, Ulasan)
“ch”) ATAU LIMIT-TO (DOCTYPE, “bk”))
5 (TITLE-ABS-KEY (tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman 1.679 dokumen Kimia ATAU
ATAU benih ATAU biji ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon)) hasil fisik
DAN ((TITLE-ABS-KEY ((kimia* ATAU fisik*) W/3 (mutagen ATAU mutagen mutagen ATAU
ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi))) ATAU (TITLE-ABS-KEY agen mutagen
(((kimia* ATAU fisik*) W/3 (agen ATAU agen ATAU pengobatan*)) DAN DAN tanaman
(mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU
mutasi) )))
4 (TITLE-ABS-KEY ((kimia* ATAU fisik*) W/3 (mutagen ATAU mutagen ATAU 13.529 Kimia ATAU
mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi))) ATAU (TITLE-ABS-KEY (((kimia* dokumen fisik
ATAU fisik*) W/3 ( agen ATAU agen ATAU pengobatan*)) DAN (mutagen hasil mutagen ATAU
ATAU mutagen ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi))) agen mutagen
3 TITLE-ABS-KEY ((kimia* ATAU fisik*) W/3 (mutagen ATAU 11.813 Kimia ATAU
mutagen ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi)) dokumen fisik
hasil mutagen
2 TITLE-ABS-KEY (((kimia* ATAU fisik*) W/3 (agen ATAU agen ATAU 2.174 dokumen Kimia ATAU
pengobatan*)) DAN (mutagen ATAU mutagen ATAU mutagenesis hasil agen fisik
ATAU mutasi ATAU mutasi)) mutagen
1 JUDUL-ABS-KEY (tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih 3.776.442 Tanaman
ATAU benih ATAU buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon) dokumen
hasil

Jaringan Sains. Koleksi Inti


# 17 #16 ATAU #11 ATAU #7 202 Cari 1 ATAU Cari 2
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- ATAU Cari 3
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun
# 16 #13 DAN #12 18 Pencarian 3: Mutagenesis
Disempurnakan oleh: JENIS DOKUMEN: (BAB REVIEW pada tumbuhan spesifik
ATAU BUKU) DAN BAHASA: (BAHASA INGGRIS) DAN Teknik DAN (Buku
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- ATAU Ulasan) DAN
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun batas bahasa
# 15 #13 DAN #12 18 Mutagenesis pada tumbuhan
Disempurnakan oleh: JENIS DOKUMEN: (BAB REVIEW spesifik DAN Teknik
ATAU BUKU) DAN (Buku OR
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- Ulasan)
# 14 #13 DAN #12 119 Mutagenesis pada tumbuhan
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- spesifik DAN
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun Teknik
# 13 TS=(teknik* ATAU metode* ATAU ”in vivo” ATAU ”in vitro” ATAU 16.095.539 Teknik
alat ATAU alat)
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR-
# 12 (TI=(mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN mutasi*)) AND 393 Mutagenesis pada tumbuhan
TI=(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU spesifik [hanya judul]
benih ATAU buah ATAU buah-buahan ATAU pohon ATAU pohon))
Indeks=DIPERLUAS SCI, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR-EXPANDED, IC
Timespan=Semua tahun
# 11 #8 DAN #1 4 Pencarian 2: Acak
Disempurnakan oleh: JENIS DOKUMEN: (BAB ATAU REVIEW spesifik mutagenesis
BUKU) DAN BAHASA: (BAHASA INGGRIS) DAN tanaman DAN (Buku
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- ATAU Ulasan) DAN
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun batas bahasa
# 10 #8 DAN #1 4 Mutagenesis acak
Disempurnakan oleh: JENIS DOKUMEN: (BAB ATAU REVIEW spesifik DAN tanaman DAN
BUKU) (Buku ATAU Review)
#9 #8 DAN #1 40 Mutagenesis acak
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- spesifik DAN tanaman
#8 (TI=((acak ATAU konvensional) DAN (mutagen ATAU mutagen 804 Mutagenesis acak
ATAU mutagenesis ATAU ((gen ATAU gen ATAU genetik) DAN spesifik [hanya judul]
mutasi*))))
#7 #4 DAN #1 111 Pencarian 1: Mutagen
Disempurnakan oleh: JENIS DOKUMEN: (BAB ATAU REVIEW kimia ATAU fisik ATAU
BUKU) DAN BAHASA: (BAHASA INGGRIS) agen mutagen DAN
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- tanaman DAN (Buku ATAU
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun Ulasan) DAN bahasa
membatasi
#6 #4 DAN #1 112 Kimia ATAU fisik

Disempurnakan oleh: JENIS DOKUMEN: (BAB ATAU REVIEW mutagen ATAU agen
BUKU) mutagen DAN tanaman
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- DAN (Buku ATAU
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun Ulasan)


#5 #4 DAN #1 842 Kimia ATAU fisik
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- mutagen ATAU agen
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun mutagen DAN tanaman
#4 #3 ATAU #2 5.214 Kimia ATAU fisik
Indeks=SCI-EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR- mutagen ATAU agen
EXPANDED, IC Timespan=Semua tahun mutagen
#3 TS=((Kimia* ATAU fisik*) DEKAT/3 (mutagen ATAU mutagen 4.432 Kimia ATAU fisik
ATAU mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi)) Indeks=SCI- mutagen
EXPANDED, CPCI-S, BKCI-S, ESCI, CCR-EXPANDED, IC
Timespan=Semua tahun
#2 TS=(((kimia* ATAU fisik*) DEKAT/3 (agen ATAU agen ATAU 964 Kimia ATAU fisik
pengobatan*)) DAN (mutagen ATAU mutagen ATAU agen mutagen
mutagenesis ATAU mutasi ATAU mutasi))
#1 TS=(tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU tanaman ATAU benih ATAU benih ATAU 2.558.688 Tanaman
buah ATAU buah ATAU pohon ATAU pohon)


EFSA Journal - 2021 - in Vivo and in Vitro Random Mutagenesis Techniques in Plants - En.id

Diunggah oleh

Informasi Dokumen

Judul Asli

Hak Cipta

Format Tersedia

Bagikan dokumen Ini

Bagikan atau Tanam Dokumen

Opsi Berbagi

Apakah menurut Anda dokumen ini bermanfaat?

Apakah konten ini tidak pantas?

Hak Cipta:

Format Tersedia

EFSA Journal - 2021 - in Vivo and in Vitro Random Mutagenesis Techniques in Plants - En.id

Diunggah oleh

Hak Cipta:

Format Tersedia

Diterjemahkan dari bahasa Inggris ke bahasa Indonesia - www.onlinedoctranslator.

DIADOPSI: 29 September 2021

secara alamiDansecara in vitroteknik mutagenesis acak di

Panel EFSA tentang Organisme Hasil Modifikasi Genetik (GMO), Ewen

Pemohon:Komisi Eropa Nomor pertanyaan:EFSA-

www.efsa.europa.eu/efsajournal Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

Jurnal EFSA adalah publikasi Otoritas Keamanan Pangan

www.efsa.europa.eu/efsajournal 2 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 3 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

Abstrak................................................. ................................................. ................................................... Ringkasan 1

www.efsa.europa.eu/efsajournal 4 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

1.2. Latar belakang seperti yang disediakan oleh EFSA

Menindaklanjuti permintaan dari Komisi Eropa (Ref. Ares(2020)2651289 - 20/5/2020), EFSA

1.3. Kerangka acuan

www.efsa.europa.eu/efsajournal 5 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

2. Data dan metodologi

3.1. Formulasi masalah

3.2. Luasnya perencanaan

www.efsa.europa.eu/efsajournal 6 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

3.3. Definisi metode

3.3.1. Pencarian literatur

Tabel 1: Basis data bibliografi mencari studi yang relevan

Sumber informasi Platform

3.3.2. Penyaringan hasil pencarian literatur

www.efsa.europa.eu/efsajournal 7 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

4.1.1. Mutasi spontan dan terinduksi dalam konteks pemuliaan tanaman

www.efsa.europa.eu/efsajournal 8 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

4.1.2. Pandangan sejarah tentang mutagenesis acak dalam pemuliaan mutasi

www.efsa.europa.eu/efsajournal 9 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 10 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

Mutagenesis acak teknik, termasuk fisik (Bagian4.2.1.3) Dan bahan kimia

www.efsa.europa.eu/efsajournal 11 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

4.2.1.3. Teknik mutagenesis fisik diterapkan dalam pemuliaan mutasi

www.efsa.europa.eu/efsajournal 12 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

4.2.1.4. Teknik mutagenesis kimia diterapkan dalam pemuliaan mutasi

Agen fisik Singkatan Jenis Sumber

sinar X – Ionisasi Tabung sinar-X dengan anoda silinder

www.efsa.europa.eu/efsajournal 13 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

Agen interkalasi (misalnya etidium – Agen interkalasi DNA

www.efsa.europa.eu/efsajournal 14 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 15 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

4.3. Mengatasi ToR3: untuk menilai apakah mekanisme molekuler yang

4.3.1. Apa mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya mutasi?

4.3.1.1. Mekanisme yang menyebabkan kerusakan DNA

Kerusakan DNA disebabkan oleh agen fisik

www.efsa.europa.eu/efsajournal 16 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

Kerusakan DNA yang disebabkan oleh bahan kimia

4.3.1.2. Mekanisme yang mengarah pada perbaikan

www.efsa.europa.eu/efsajournal 17 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

Mekanisme perbaikan eksisi

Perbaikan ketidakcocokan (MMR)

Perbaikan DNA Double Strand Break

www.efsa.europa.eu/efsajournal 18 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 19 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

4.4.1.1. Jenis mutasi

4.5. Mengatasi ToR4: untuk menilai apakahsecara in vitroteknik mutagenesis acak

4.5.1. Adalahsecara in vitroDansecara alamiteknik mutagenesis acak dianggap berbeda

www.efsa.europa.eu/efsajournal 20 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 21 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 22 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 23 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 24 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611

www.efsa.europa.eu/efsajournal 25 Jurnal EFSA 2021;19(11):6611