ASAM AMINO DAN PROTEIN

TIM BIOKIMIA
JURUSAN BIOLOGI
UNESA
2008
CIRI-CIRI ASAM AMINO

1. Gugus karboksil dan

gugus amino diikat pd
atom C yg sama

2. Merupakan atom C
asimetrik kecuali
GLISIN

3. Struktur semua asam

amino sama kecuali
rantai samping
 KLASIFIKASI
ASAM AMINO
BERDASARKAN GUGUS R
 REAKSI KIMIA SPESIFIK AA
• Reaksi kimia AA bercirikan pd gugus
fungsionalnya:
- Ggs Amino  reaksi asetil
- Ggs Karboksil  reaksi esterifikasi
• Dua reaksi penting untuk mendeteksi,
mengukur dan mengidentifikasi AA
- Reaksi Ninhidrin
- Reaksi dg pereaksi FDNB
(1-Fluoro-2,4-dinitrobenzen)
 ASAM AMINO ESENSIAL
• FAT HILL MET VALIN
 PEPTIDA
• Rantai pendek dr 2/lebih AA yg
dihubungkan oleh ikatan kovalen
• Ikatan peptida  ikatan yg terjadi
antara ggs karboksil AA pertama dg ggs
amino dari AA yg lain  dipeptida + H20

• Polipeptida  tdr atas beberapa AA

(>100) yg berikatan peptida

• Protein  tdr atas 1 atau lebih

polipeptida
SATUAN MONOMER PENYUSUN
• PROTEIN SEDERHANA
Hanya mengandung AA, contoh enzim
RIBONUKLEASE
• PROTEIN GABUNGAN (KONYUGASI)
Mengandung senyawa lain selain AA
Digolongkan berdasar ggs prostetik,
contoh: nukleoprotein, glikoprotein,
lipoprotein, metaloprotein
STRUKTUR PROTEIN

Primer
Sekunder
Tersier
Kuartener
Struktur Primer:
Ikatan peptida bentuk rantai panjang
A diagram showing a generic amino acid structure. All amino acids have
an alpha carbon, an amino group, and a carboxyl group, but each of the
20 amino acids has a different side chain or R group. Amino acids are
linked together to form a polypeptide chain, like beads on a string, the
primary level of protein structure.
Struktur
Primer

Struktur
Sekunder
 Globular

Beberapa protein tersier

mjd satu
 DENATURASI
• Bila susunan ruang/rantai polipeptida
suatu molekul protein berubah.
• Penyebab: panas, pH, mekanik, bahan
kimia
A figure showing the process of denaturation. The
polypeptide chain has lost its higher order structure and is
now a random coil.
 PEMBAGIAN PROTEIN
BERDASARKAN FUNGSI
• ENZIM
Protein yg memiliki aktivitas katalisator.
Contoh: ribonuklease, tripsin
• PROTEIN NUTRIEN DAN PENYIMPAN
Contoh: ovalbumin, kasein, ferritin
• PROTEIN TRANSPORT
Contoh: hemoglobin
• PROTEIN KONTRAKTIL
Utk berkontraksi mengubah bentuk 
bergerak. Contoh: aktin, miosin
• PROTEIN STRUKTURAL
Contoh: kolagen, elastin, keratin

• PROTEIN PERTAHANAN
Contoh: antibodi (imunoglobulin)

• PROTEIN PENGATUR
Contoh: hormon insulin

• PROTEIN GENETIK
Contih: nukleoprotein, histon
PEMBAGIAN PROTEIN BERDASAR
BENTUK/KONFORMASI

• PROTEIN SERABUT
- Molekul serabut dg rantai polipeptida
yg memanjang pd 1 sumbu  tdk
berlipat
- Sifat tdk larut dlm pelarut2 encer
- Hampir semua berperan sbg struktural
dan pelindung
- Contoh: α-Keratin, Kolagen
• PROTEIN GLOBULAR
- Rantai polipeptida berlipat rapat 
bentuk globular
- Sifat: larut dlm sistem larutan
- Hampir semua mempunyai fungsi gerak
- Mudah terdenaturasi
- Contoh: antibodi, protein penyimpan,
protein transpor, susu atau telur (dlm
bhn makanan)
 PEMBAGIAN PROTEIN
BERDASAR KELARUTAN
• ALBUMIN
- Larut dlm air, terkoagulasi
olh panas
- Penambahan (NH4)2SO4
jenuh  mengendap
- Contoh: laktabumin, serum
albumin, albumin telur dll
• GLOBULIN
- Tdk larut dlm air, larut
dlm lrt garam encer
- Terkoagulasi olh panas
- Contoh: globulin
• GLUTELIN
- Tdk larut dlm pelarut
netral, larut dlm asam/basa
encer
- Contoh: glutemin (gandum),
Oryzenin (beras)
PROLAMIN/GLIADIN
- Larut dlm alkohol 70% - 80%.
- Contoh: gliadin (gandum)
HISTON
- Larut dlm air, tdk larut dlm
amonia encer
- Contoh: Globin dlm hemoglobin
PROTAMIN
- Larut dlm air
- Tdk terkoagulasi olh panas
- Dgn asam pekat membentuk
garam
 MOLEKUL HIBRID
• GLIKOPROTEIN
- Molekul gabungan antr KH (1-30%) dgn protein
(70%)
- Mempy 1-beberapa gol KH, mempy sejumlah rantai
samping oligosakarida linier/bercabang
- Protein pd permukaan sebelah luar hewan  plasma
darah
• PROTEOGLIKAN
- Molekul gabungan/hibrida antara polisakarida/KH
(95%) dgn protein (5%)
- Tdr atas unit2 disakarida berulang
• PEPTIDOGLIKAN
- Molekul hibrid antara peptida dgn polisakarida
METABOLISME
ASAM AMINO
BIOSINTESIS ASAM AMINO

A A NON ESENSIAL:
 Senyawa antara: piruvat, glutamat,
oksaloasetat, α-ketoglutarat, aspartat
 Dari asam amino non essensial
 Dari asam amino esensial
• Sintesis AA non essensial dr AA non
essensial lain.
• Contoh:
Prolin  pd mammalia dan beberapa
organisme lain, prolin dpt disintesa dr
glutamat melalui jalur sebaliknya dr
katabolik
• Sintesis AA non essensial dr AA
essensial
Contoh:
Tirosin  dr fenilalanin oleh
hidroksilase. Fenilalanin yg berfungsi
sbg monooksidase (irreversible). Reaksi
ini membutuhkan tetrahidrobiopterin
sbg reduktor yg berasal dr reduksi
dihidrobiopterin oleh NADPH.
 AA ESSENSIAL
• Arginin
• Lisin, metionin, treonin, isoleusin  dr
asam aspartat
amino acid made from degraded to glyco / keto comments
alanine pyruvate pyruvate glycogenic large amount in cells
arginine glutamate glutamate glycogenic strongly basic, urea cycle
asparagine aspartate aspartate glycogenic glycoproteins
acidic, large amount in
aspartate oxaloacetate oxaloacetate glycogenic
cells
cysteine (methionine)* pyruvate glycogenic -SH group
acidic, very large amount
glutamate oxoglutarate oxoglutarate glycogenic
in cells
glutamine glutamate glutamate glycogenic large amount in cells
glycine serine one-carbon pool*** glycogenic no side chain, collagen
histidine essential glutamate glycogenic weak base
acetyl-CoA + propionyl-
isoleucine essential mixed branched side-chain
CoA
leucine essential acetyl-CoA ketogenic branched side-chain
lysine essential not known mixed long side chain, basic
contains sulphur, methyl
methionine essential propionyl-CoA glycogenic
donor
phenylalanine essential tyrosine mixed aromatic, phenylketonuria
proline glutamate glutamate glycogenic imino acid
serine phosphoglycerate pyruvate glycogenic -OH group
threonine essential disputed**** glycogenic -OH group
tryptophan essential not known mixed aromatic
tyrosine (phenylalanine)** fumarate + acetoacetate mixed aromatic, phenolic
valine essential propionyl-CoA glycogenic branched side-chain
KATABOLISME ASAM AMINO
• Katabolisme gugus amino
• Ureolitik: ekskresi urea (mammalia)
• Urikotelik: ekskresi asam urat (Reptil
dan Aves)
• Ammonotelik: ekskresi ammonia (ikan
bertulang belakang)
TAHAPAN KATABOLISME
GUGUS AMINO
• TRANSAMINASI
• DEAMINASI OKSIDATIF
• TRANSPORT AMMONIA
• SIKLUS UREA
(hanya pd mammalia/manusia)
 REAKSI TRANSAMINASI
• Kebanyakan asam amino dpt diubah
mjd asam keto dgn reaksi transaminasi
• Reaksi ini mjdkan gugus amino dr asam
amino satu berpindah menuju asam
koto yg lain.
• Melalui reaksi ini tdk ada kehilangan
atau tambahan N dr sistem.
REAKSI UMUM REAKSI
TRANSAMINASI
 DUA MACAM TRANSAMINASE
(semua jaringan mammalia)

• Alanin transaminase
Mengkatalisa pemindahan gugus amino dr hampir
semua AA ke piruvat  alanin

• Glutamat transaminase (Glu-α-ketoglutarat

transaminase)
Memindah gugus amino dr hampir semua asam
amino ke α-ketoglutarat  asam glutamat.
BIOSINTESIS RANTAI
SAMPING ASAM AMINO
Asam amino asam aspartat dan alanin dpt disintesis oleh
reaksi transaminasi dr oksaloasetat dan piruvat.

a-Keto Acid a + a-Amino Donor b ---> a-Amino Acid a + a-

Keto Acid b 
Pyruvate + Glutamate ---> Alanine + a-Ketoglutarate 

alanine transaminase (ALT), or 

Glutamate-pyruvate transaminase GPT
Oxaloacetate + Glutamate ---> Aspartate + a-
Ketoglutarate 
aspartate transaminase (AST), or 
Glutamate-oxaloacetate transaminase GOT

Oksaloasetat dan piruvat menyumbang sintesis rantai

samping asam amino spt isoleucine, leucine and valine.
 TRANS-DEAMINASI

Kebanyakan transaminase menyumbang substrat dan produk

yang umum yaitu glutamat dan oksoglutarat dgn glutamat
dehydrogenase. Hal ini memungkinkan jalur pengeluaran N
untuk asam amino. Proses ini disebut trans-deaminasi.
 DEAMINASI OKSIDATIF
• Perubahan AA menjadi bentuk α-keto
secara oksidasi

• Oksidase asam amino, enzim yg tdp di

hati dan ginjal mammalia adalah:
Oksidase L-asam amino  FMN
Oksidase D-asam amino  FAD
 SINTESIS UREA
• Diperlukan: 1 molekul ammonia, 2
molekul CO2, 1 molekul aspartat.
• Ggs amino pertama yg masuk siklus adl
NH3 bebas (dr deaminasi oksidatif
glutamat di motokondria hati)
• Ggs amino kedua berasal dr aspartat
(dr transaminasi glutamat o/
transaminase aspartat sitosol). Ggs
amino berkondensasi dg atom C karbamil
dr sitrulin membentuk arginosuksinat.
 KATABOLISME
KERANGKA KARBON AA
• Kerangka karbon AA dpt diubah mjd 7 mcm senyawa
amfibolik  piruvat, asetil-KoA, aetoasetil KoA, α-
ketoglutarat, suksinil Ko-A, fumarat, oksaloasetat

• AA glikogenik  Ala, Arg, Asp, Sis, Glu, Gli, His, Met,

Pro, Ser, Tre, Val, Hidroksiprolin

• AA ketogenik murni  leusin

• AA glikogenik & ketogenik  Ileu, Lis, Tir, Trip,

Fenilalanin
 AA PEMBENTUK SENYAWA
AMFIBOLIK
• AA pembentuk oksaloasetat  aspartat,
asparagin
• AA pembentuk α-ketoglutarat  glutamat,
glutamin, prolin, Arginin, Histidin
• AA pembentuk piruvat  Alanin, Serin,
Glisin, Sistein, Treonin, Hidroksiprolin
• AA pembentuk Asetil-KoA  Fenilalanin,
Tir, Tryp, Lis, Leu
• AA pembentuk suksinil-KoA  Met, Isoleu,
Val